3A9IA

Crystal structure of homocitrate synthase from thermus thermophilus complexed with lys
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
375
structure length
347
Chain Sequence
REWKIIDSTLREGEQFEKANFSTQDKVEIAKALDEFGIEYIEVTTPVASPQSRKDAEVLASLGLKAKVVTHIQCRLDAAKVAVETGVQGIDLLFGTSKYLDIPRIIEEAKEVIAYIREAAPHVEVRFSAEDTFRSEEQDLLAVYEAVAPYVDRVGLADTVGVATPRQVYALVREVRRVVGPRVDIEFHGHNDTGCAIANAYEAIEAGATHVDTTILGIGERNGITPLGGFLARMYTLQPEYVRRKYKLEMLPELDRMVARMVGVEIPFNNYITGETAFSHKAGMHLKAIYINPEAYEPYPPEVFGVKGLHYGEEELHRVTQHIKALADRGQLTLEELDRILREWITA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mechanism of substrate recognition and insight into feedback inhibition of homocitrate synthase from Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
molecule keywords Homocitrate synthase
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Thermus thermophilus
total genus 129
structure length 347
sequence length 375
ec nomenclature ec 2.3.3.14: Homocitrate synthase.
pdb deposition date 2009-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3a9iA01
1W3IA 1M6JA 1RR2A 4LVFA 3PR2A 1OJXA 4Z0JA 1KLYA 2GQ8A 1ZNNA 3FKKA 2GVLA 4IWWA 5CPNA 4N4QA 3OIXA 3N3MA 3VE7A 2FPVA 1OFDA 2PE4A 2V82A 2V81A 2Z6JA 8TIMA 3W07A 1XUZA 4JTSA 4O14A 3QSTA 1SW0A 3TXZA 4JY8A 2NX9A 1WXJA 3BLIA 4KFPA 3JS3A 3QYQA 4FX6M 1LLZA 3MO7A 5EMUA 1DORA 4LUIA 4JTHA 3WJZA 1WBJA 4JY9A 3GYEA 3W7CA 2G95A 2R14A 1GVFA 2CZDA 4HKPA 3W83A 4A22A 1EEPA 1GOXA 4ZMGA 1SSGA 3LRLA 4C1KA 3KX6A 3E96A 6TIMA 3TR2A 3S1VA 3GAKA 2O7QA 4YWIA 4TR9A 1SZFA 3RU6A 4WZHA 1I2OA 2VOMA 3LERA 3LV6A 1DJQA 3FS2A 1KV5A 2WNQA 4N9EA 3P81A 4UFMA 5IBXA 4KWVA 1QFEA 5LNUA 4K37A 1WA3A 1MEWA 4UCGA 2G5WA 1RZMA 4UTMA 3G0UA 4R53A 3LGEA 4ZQPA 1ICQA 4XTIA 3C2FA 3Q94A 3BG9A 5TQLA 3BLFA 5KTLA 3EX1A 3VCRA 1I2QA 2WPBA 3EKZA 1Q6RA 1DV7A 3LTYA 4OGZA 4JTTA 5BW6A 2QJIA 3ELFA 5C5YA 1TB3A 1P0NA 4XWUA 2WSRA 1KM4A 1FDJA 2ISVA 3W7EA 1KFCA 4O54A 1SZEA 3B4UA 4FX8A 3NR0A 4LS0A 1OVDA 2EAWA 3C56A 1VPXA 4O13A 3LCWA 3TJXA 2TPSA 4FX7A 2QF7A 3RF9A 5FEZA 4QNWA 2QJHA 2TYSA 4MIMA 1W1ZA 2Z0IA 5HNRA 4IJBA 2FIQA 1W37A 2QCNA 2TSYA 1OHLA 2Y7FA 5AYYA 5HR7A 5U4NA 1ZFJA 3HIJA 4H4IA 1KTNA 3CWOX 2Q3OA 3RFAA 3B0PA 1XBVA 1HO1A 3NYZA 3O6DA 3U8GA 1TCDA 5DBTA 3T44A 1TTJA 1OX4A 1D9EA 1VCFA 4UR8A 1QR7A 5CZ0A 1PE1A 4AVFA 2DZUA 5AN7A 2Q8LA 5F2MA 1O5XA 5FF7A 1QO2A 5AHIA 3CEUA 1W8SA 3I7SA 3PY2A 5K7JA 2H90A 1Y0EA 3GLCA 4K8HA 5DY2A 4FF7A 1VS1A 1TPC1 2A5HA 1VLWA 3W1LA 3ZS4A 4JTEA 4CNPA 1SO6A 3TW7A 3AO0A 1AL7A 3E02A 2J9YA 5D38A 2CZFA 3IIZA 4O57A 1GPWA 4OV4A 3UY8A 4Y8FA 3P74A 3N2XA 1LTDA 1MO0A 2YDAA 3EWWA 4POCA 2H8XA 4ZZ9A 3S5OA 3LLDA 3EWXA 1ADOA 1ONRA 4HT3A 3S5ZA 3B0UX 3LCIA 4M7SA 3HGSA 3IVUA 1W3TA 3W1AA 4AMAA 3TA6A 4GFSA 1Q6LA 3L0NA 1AW5A 4M6PA 3P82A 3LLFA 1EP1A 1W5OA 2VKZG 3LHTA 3UPBA 3TC6A 4S2BA 1S5WA 3HOJA 3TMLA 1H7PA 3O6CA 2F84A 2YW3A 3UWUA 1EB3A 3GKFA 2PRHA 4ZQRA 4NUWA 3E12A 5G5IA 3W7RA 5F2GA 3H55A 4QJ1A 5D2VA 4IXHA 3HG4A 3B03A 4JGDA 1NEYA 3P7YA 4NZJA 3LHVA 3THQA 3JRKA 4KFOA 3PVFA 3W7KA 3WJXA 5AHNA 5CPOA 2ZRYA 3WK1A 2CLMA 4AWUA 1KA9F 2JGYA 1VQTA 1I2RA 4QM1A 3L5LA 3MI6A 4FHAA 4ZQOA 2A7PA 3G1SA 1I2PA 5C2XA 1AG1O 5LZLA 4GUIA 2J9XA 3G22A 3MHFA 1HFBA 3W1NA 3PBUA 2Z1BA 3DH7A 2QAFA 5A8GA 2KZHA 2YPIA 3E0IA 1IXOA 2ISSA 1ZCOA 5BMXA 4AXKA 3BVJA 1KFJA 4OE7A 1KV8A 4N2YA 2FLIA 4CQAA 3HPSA 1GYLA 5D2WA 4DBEA 3T4CA 3VNDA 4MY8A 2CLIA 3NQCA 1QPQA 1NVMA 1TV8A 4QAIA 3SY5A 3OHIA 1N55A 4YCOA 4DO5A 3FEMA 4JIPA 3CB8A 1J2WA 2VFDA 1SO3A 2WO5A 2DORA 2GUUA 4S2CA 1ALDA 4LU0A 3A23A 1FWSA 3QMRA 3DZ1A 3C2RA 3TQVA 2ABBA 5K9DA 3SW6A 4KWWA 2QAPA 1F6KA 1JUKA 4CCEA 4CQ9A 4X3ZA 3UXDA 1TRDA 3VFLA 3I68A 4UIOA 2DZWA 1XM3A 2ZZ2A 3KRSA 4OHQA 3STGA 4WXZA 2ISWA 4AH7A 1AW2A 4RZ4A 4AAJA 4UFLA 3PB0A 1O60A 3GXNA 3O6YX 1ME7A 2ZRXA 4DELA 1GEQA 5KMYA 3EX2A 3N9SA 4BI7A 3UQNA 2FTPA 1FCQA 1RV8A 2QDGA 3DKJA 2ZDRA 2WV8A 4RJEA 3I7QA 4ZVJA 1EP2A 3P5ZA 4FIQA 5FEPA 4O16A 5GVJA 1ZJIA 4GUJA 1LORA 2OZ0A 3R2GA 4Z1DA 2CW6A 1I8JA 4N4PA 1JVNA 4D2JA 1P0KA 3W2JA 1JULA 3IIPA 3L5MA 1ME8A 3W7NA 4NJGA 1G7VA 1DHPA 3W2NA 3NPWA 4UTHA 2BSLA 1H7RA 2GPTA 2RKXA 5BOOA 1GG0A 3EWBX 1G7UA 3SGZA 2EKCA 4MLJA 3LCXA 5G4EA 4JS3A 3WK0A 4IPIA 5CSSA 4NJKA 1C8VA 5DXXA 4ZQMA 3G0XA 3G1FA 2X1UA 4JTLA 4DO6A 1G4TA 3DFQA 2A6NA 2E6DA 2C3ZA 1NFBA 1F74A 1OK6A 3TW6A 2I9EA 1UCWA 4LTSA 5E0KA 2ZRWA 1YTEA 2Z2UA 3WJYA 1IXNA 4O19A 4S1FA 3FYPA 2V5LA 3NNTA 2QCCA 3GDMA 5F4XA 1XC4A 4MYAA 4G1KA 1QCWA 1H50A 3A21A 1I2NA 1VCVA 3UWVA 4IX0A 4UNLA 3C52A 5G1TA 2VELA 4DEFA 2OJPA 4MY9A 3W1RA 1UUOA 3NQFA 4IQLA 3HGOA 4TMBA 4BR1A 3PAJA 2PURA 1D3HA 2RFGA 1I45A 5K9XA 4XBKA 3TAOA 4QISA 4OWGA 2HS6A 1P5BA 1DVJA 4WY0F 5FF3A 3M43A 2BXVA 1NF7A 2ABAA 4O1AA 4X9SA 1EWDA 4TMCA 2CLHA 4AB4A 1EWEA 4PTNA 3KVMA 3MYPA 1PHWA 4JTIA 5FESA 1OYCA 1GVRA 3GR7A 3CQ0A 1F2JA 1ZENA 1FUYA 3L66A 2A1YA 5DLCA 5I3GA 3BARA 1YADA 3TROA 1VCGA 1IXQA 2C13A 3M0ZA 1OFOA 1QOQA 2GJLA 2R8WA 3GDRA 3TK7A 3WFAA 3NXFA 4UC5A 4UTUA 3B05A 3U2OA 1A5AA 1YDOA 2E68A 3S42A 4EWND 1EX5A 3MBDA 3W3OA 3D0CA 4UMCA 3F03K 1IF2A 5AYZA 1H7OA 5IM51 4PFMA 4WJEA 4P2VA 3TIMA 3KFTA 3EX3A 4HNVA 2H6RA 2E09A 4GWEA 4JYFA 4Y6GA 4JTGA 4O10A 3STFA 1KBIA 4LC8A 3U6WA 5BNKA 3TCEA 2E6AA 3P60A 3IRDA 5F2IA 1SU5A 3W74A 2A4AA 4CCCA 2NUWA 3K30A 4W9TA 1HUVA 4AF0B 1I4NA 3LM7A 4A29A 3G1YA 1S5TA 5F4SA 4Q4KA 4GXMA 4TIMA 4Y96A 2V9DA 3C2OA 2DJXA 4Z08A 2GQAA 2E5BA 4WX2A 4FNRA 5J5DA 4ZL1A 1HL2A 1EIXA 4JICA 3BW3A 4MYXA 2ALDA 3G1VA 2ZTKA 4YXGA 3O05A 2B7OA 2Y85A 3CPRA 2QEZA 4JN6A 3LRMA 3TX9A 3UWWA 3QQ0A 1W56A 3ATZA 1FWWA 4WY0A 4XBSA 2QJGA 4NNAA 1BWKA 3P62A 5I3IA 3B8DA 1OYBA 2DZVA 1YXDA 4JDYA 1JR1A 1TSIA 3MI3A 2YYTA 3W22A 1YLVA 3UYCA 3HB9A 1LBFA 2P0OA 3NM1A 2CLEA 2XFWA 2ZZ7A 5LGXA 4NU7A 3ZWTA 4ADTA 1JUBA 3IEBA 5D37A 3RLVA 1VHNA 3NZ1A 1KM0A 5F1VA 3QFEA 3UZ5A 3QF0A 5L6UA 2DJLA 2UV8G 2CFFA 3JR2A 2ZA3A 3W2LA 4MUZA 3T40A 1M5WA 3R12A 3CIWA 5D33A 3HG3A 3QH2A 2YGYA 4R34A 3I7RA 4UTTC 1TJRA 4J9JA 1SUXA 2JKAA 3M6YA 3KVKA 5LHEA 3BV4A 4JTKA 4XKYA 1R46A 2QCDB 4RZ6A 4RR4A 1AW1A 2FPTA 4ADUA 1VYSX 3DXIA 2X16A 1PIIA 3LXAA 3GK0A 4O4VA 1JCJA 1WV2A 3LI0A 4O4WA 1LLWA 6ALDA 1F7BA 3CC1A 3GIYA 5DCDA 1DJNA 1D3GA 3FA5A 3HGJA 4JYEA 2ZQ0A 1Q6QA 4QIUA 2W0UA 1GVSA 1UASA 4XQ6A 1TPUA 1L2UA 4UTIA 1PCWA 2C18A 2JK2A 1H7XA 1SZNA 3GX9A 1OX6A 3IIXA 1DBTA 2VEIA 4PCFA 3W1PA 5FI8A 3O07A 3O63A 3MP3A 3NEVA 4FNQA 4JDBA 3NQ8A 2X1SA 5D04C 1OFEA 3GKAA 4PA8A 5HWNA 2QUTA 4PC8A 1VHCA 2A85A 3SJ3A 5LSMA 3GB6A 3G1HA 4EF9A 5AHFA 4HNNA 2VC6A 5FF4A 3UWYA 1QWGA 2WSQA 1F76A 1T0OA 3MP4A 4X22A 3FOKA 3L0GA 2NZLA 3L0KA 3LOTA 5D30A 3T7VA 3DKLA 3TV8A 2Y88A 4B5NA 3QQ1A 3QM3A 4BWLC 1FX6A 5AHMA 3W87A 4L4MA 1HO4A 3EXTA 4N6EA 1ZHAA 5HUOA 2ZTJA 3PBYA 4NZFA 2CLOA 1LZOA 4K6AA 3LHYA 2OT0A 2WNNA 3LI1A 1TTIA 3L2IA 2C14A 5I3KA 3TJLA 3V75A 1FWNA 4AEOA 1G6CA 3QMSA 5D09A 4NJJA 3GNDA 4E38A 1H1YA 1XFBA 3I65A 3DFSA 4HHPA 1SFJA 3ZWSA 4FNSA 1GT8A 4X2RA 1MSSA 1XCFA 3W1TA 4GUFA 4NXKA 2O7SA 3YPIA 3P61A 1ZY9A 2RDTA 1P4CA 3NOEA 1JCMP 4LVGA 1G4PA 2Z6IA 1JQVA 5DCBA 2NUYA 2Y89A 4JYDA 4CCDA 3FJ6A 4O1DA 5L9FA 3ATYA 5G4WA 3W7MA 4EOUA 2G97A 5SWUA 1G67A 3C2EA 2V2CA 3MMTA 4JEQA 1R2TA 1DL3A 2ZFAA 4GJ1A 2VXNA 3B0VC 1SSDA 3P5YA 3R89A 4RXFA 3M5VA 3PG8A 1WDWA 5H2ZA 3NPVA 4QNEA 2QUVA 1XI3A 4BFAA 4AHQA 4UTLA 2WSYA 3C2VA 3MHUA 3M41A 5EA9A 2E6YA 3P8IA 5BRBA 1PS9A 1M7OA 3NL3A 3IGSA 2CLKA 4FNUA 1A5CA 3CU2A 4FB7A 2V8ZA 5DBUA 5FEXA 5D02A 4OBTA 2V2HA 3LCGA 5MHBA 3VE9A 1IXPA 3LCHA 3E9AA 3MHGA 5T26A 3ABSA 3LXBA 4JX4A 3IVTA 5C55A 5F2LA 2B0MA 4HIBA 1UUMA 1SPQA 3S8HA 3N9RA 1OABA 3DFTA 2NWSA 3MWAA 1YXCA 4WOZA 2ZYFA 3PULA 3NAVA 3ABRA 1LRTA 2J27A 3L67A 3QMTA 5DXYA 5CG7A 3PS7A 1KFLA 3UPWA 5K2ZA 5LNVA 5AHLA 3DU0A 2E1DA 1FXQA 4GBUA 2GQ9A 1O5KA 1PL9A 4MZ1A 4M6QA 1ZAHA 4CNOA 4I7VA 4HNTA 3S0CA 5IBXC 4YCPA 2EHHA 1LRQA 4MVAA 4GC4A 3O16A 4FXSA 4QSHA 4Y9AA 1X1ZA 2CU0A 2NX3A 1GQNA 1KLZA 1B4KA 2OX1A 1AK5A 1AL8A 1XUUA 4LRSA 1P1XA 3M44A 2E77A 1W5PA 5DN1A 1H51A 1FDYA 3HPZA 2R94A 5DCEA 3TXVA 2W79A 2HTMA 2G96A 1W5QA 2HSAA 2YFOA 1K7EA 3LRKA 4GRSA 2I1OA 1KM6A 4YLWA 4O53A 5J5RA 4K39A 4PL1A 4HPXA 3DHDA 3G8EA 3EWYA 1B4EA 3S6DA 1DKWA 3C61A 4IXXA 4HPJA 3PM6A 4U28A 1J5TA 3TFCA 1HTIA 1XDLA 4AHPA 5LHFA 4JTFA 1G4SA 2ZBTA 2RDWA 1UB3A 2X1RA 4CLMA 1W31A 5K3VA 4DPPA 1LBLA 2Q3RA 4DO4A 2YR1A 2E5CA 2P1FA 1XL9A 5G2IA 4JXCA 3TQKA 3KVJA 2DZTA 3W1XA 1TPEA 1K8ZA 4UFHA 3S1UA 2CWNA 2NXHA 1PCKA 4UTWA 4Z0SA 4FNTA 1X7FA 2QR6A 4LC6A 4FEZA 5U7SA 4N9DA 4UNKA 1ZALA 2A7RA 2TRSA 2A6LA 4O11A 1XBYA 3KAOA 3A5FA 3NQMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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