3AHVA

Semi-active e176q mutant of rice bglu1 covalent complex with 2-deoxy-2-fluoroglucoside
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNQPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The structural basis of oligosaccharide binding by rice BGlu1 beta-glucosidase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase 7
molecule tags Hydrolase
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 197
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ahvA00
1OINA 4UCFA 3GXIA 4U2YA 1GW1A 3WY1A 4FLSA 4PMXA 4X9YA 1VFOA 1VF8A 3E1F1 3VDCA 1QNPA 1EO5A 4M81A 1KXVA 1AQHA 3HJEA 3WF1A 5DF0A 4PUEA 1WNOA 1JNEA 3AZTA 1O6IA 3EDFA 1RP8A 3OLIA 3WQ4A 1XYFA 1E1FA 2DT0A 4EAMA 1CXFA 2CXGA 1UR9A 5C70A 3WL0A 1X6LA 1OD0A 3MMWA 4BQ4A 3BH4A 1C8XA 3KE0A 3APGA 3CMGA 3CO4A 3MSDA 1HL8A 3AIRA 1SYTA 1UR2A 4OIFA 4ZEPA 1SMAA 1V6UA 1HNYA 4LYRA 4CVWA 3K8MA 5CGTA 1J0HA 4IM4A 3WD0A 1OWQA 3UR7A 3RM4A 4YHEA 4PTMA 3WNPA 4H04A 4MTVA 4XUYA 4FLRA 3WENA 1R87A 3A3HA 3UESA 2Y4SA 5DMYA 3VO0A 1OB0A 3B8SA 4AD0A 5CZKA 2J25A 1VFUA 2UY5A 3FY1A 3SUWA 1XGZA 4BZYA 3IAPA 1HIZA 2JIEA 1DWHM 3GH5A 4XV0A 2G3MA 2O9TA 2O92A 3L4ZA 1UKSA 3KL5A 4PMDA 2GVYA 5D8ZA 2J7GA 3VKKA 2WMIB 2X2YA 4P7QA 3WEZA 2YJQA 3LPGA 3W6MA 4A3YA 3AHTA 5A3HA 4QLLA 1CGXA 1QI4A 2YL5A 1HKIA 3AMDA 1W9PA 1UUQA 1KFWA 2VC9A 1XHGA 3DYMA 1CNVA 3FN9A 3ARSA 2WAGA 4OOZA 1J0YA 3VX0A 1UR1A 3WDHA 3BAXA 4JKLA 1H41A 2Y8KA 1CPUA 1MXGA 4BQ5A 3AZRA 4DM2A 2FHCA 2DSUA 3HN3A 3EMQA 4Q22A 3G6MA 4PMOA 5GPRA 1CECA 1CYGA 4LGXA 5D9PA 3EDEA 1V3MA 1J0IA 2J7BA 3VGDA 2DEPA 3MKKA 1ISYA 1PAMA 2WKLA 4CKQA 2JEPA 1DWIM 1E4IA 3MU7A 2A3EA 4LPCA 3U5UA 4OUEA 3W24A 3AIWA 2D22A 4K68A 4JAWA 5CXPA 1EXPA 4DWSD 1HJQA 3THDA 3AS1A 3SCVA 3L2MA 2PF0A 3CZKA 2HISA 1R7AA 1QNOA 1W2VA 1E5JA 2OYMA 4ML4A 1UQYA 2QHAA 1DWGM 4HA1A 3MSGA 3T09A 2JE8A 3OGRA 2G4FA 1H5VA 4ACZA 3NDZA 1MQQA 4MPKA 1LQ0A 5AYIA 1D2KA 1CGYA 2WCSA 5M17A 3TP4A 2CHNA 5IHRA 1HKJA 1E6SM 3S6TA 1C93A 1NM9A 2DT2A 3ARUA 4W84A 3TOPA 2XHYA 1GVIA 4HMDA 3GTNA 5IDIA 1PJ9A 2PWHA 2D0HA 2WHMA 4GPNA 1QNQA 2UWFA 2OSXA 5AY7A 1XD0A 3LMYA 3ARZA 1GQKA 3WF3A 2PWGA 3KZSA 3VTRA 3WMBA 4WSKA 1VBRA 2WCAA 3CZEA 3F5KA 2DH2A 4PTVA 1QBAA 4IPNB 1J10A 1XSIA 2VRJA 1BG9A 5A8OA 4XZBA 1IZJA 4P7NA 3WD2A 2EPNA 3AROA 1V08A 3SCPA 4H8HA 1KGXA 3PHAA 2VZOA 1JI1A 3ARPA 2JEQA 1M01A 1RP9A 3WNOA 1GOQA 4AW7A 4GZIA 5ABGA 4C7DA 2XWDA 1ISZA 4MDOA 2OWWA 1HJUA 3FW6A 5LA2A 4S3JA 6TAAA 3A4WA 4AMCA 4AY1A 4WSJA 1VIWA 3OBAA 2W67A 5CQ1A 1HJWA 1N82A 2XVPA 4JCLA 2GFTA 1OT2A 3WL1A 3CZ8A 5E70A 4E4PA 1UH4A 3WDQA 2WWCA 3SCQA 2AMGA 1DWFM 3UEQA 5BRQA 3LPFA 3M6DA 2D1ZA 2ZUTA 3VPLA 1KCKA 1OIFA 1H3GA 2O9OA 5GNYA 3PZUA 2FGZA 3FNDA 3MANA 3VVGA 1MQRA 5CSUA 1Q6EA 1W1YA 4NSBA 1E3ZA 3NYDA 4AZ6A 1JL8A 1YQ2A 1G0CA 4TVUA 2WC7A 3N17A 2PWFA 3K4AA 5DT5A 1FH7A 1EDQA 2YDRA 1SFSA 5E6YA 3PTMA 1US2A 1W1TA 4UQBA 5CLWA 5HOSA 2WNWA 5JBDA 1V3HA 5C8BB 3AISA 4AD1A 1JDCA 2W5FA 2VCCA 1R86A 3CHFA 3AXXA 1JG9A 3VGHA 1QHOA 1JAEA 4HZ6A 2WMIA 3DHPA 5A2AA 4QLJA 1UKQA 2A3AA 5A6SA 1AMYA 2WVVB 2V3DA 4KRTA 2GJRA 2V5CA 2A3CA 3PBGA 4UR9A 4E8DA 2BXZA 3VOCA 2DT3A 1HF6A 4FMVA 2W92A 5I78A 1ITCA 1U30A 2UY4A 5A6MA 2DDXA 1E0XA 1E56A 1GOIA 5A1AA 2WZHA 2J47A 1CBGA 3AYSA 4UOZA 5CLTA 1E40A 3GBDA 2VOTA 4U5IA 4J3WA 3NJ3A 3U57A 1B1YA 1A47A 1K9FA 3T0DA 4AZBA 1WDSA 2NT0A 3SCRA 1ZJBA 5AYBA 2VURA 3EBVA 1UWTA 2VX5A 3EDDA 1L0PA 1QW9A 3D3AA 5GQBA 3WQ6A 4D6GA 2WC3A 1I75A 3ZM8A 3WF0A 1VJZA 3N18A 4J3XA 2DIEA 1FFRA 3WD1A 1JZ4A 4FLOA 4Q7NA 3UCQA 1TVPA 1QW8A 1Q6GA 1RD6A 1ZBKA 2VQTA 3OA5A 4PMRA 4MJ2A 1NQ6A 2CPUA 2W91A 2YA0A 5D4YA 2VR5A 4OOUA 1JZ3A 2BVTA 3AZSA 3OLGA 4XZWA 1JDDA 1CGTA 1TCMA 3ZJ6A 3MUY1 2GSJA 3BSHA 2VVSA 2J75A 1HP4A 4AZCA 5A6LA 4R27A 4UFLA 3N04A 2Q8XA 3K8LA 1OCQA 1CGWA 3BC9A 4FF5A 4CCEA 3L4TA 1V0KA 1HX0A 1SR0A 1E6QM 2WKGA 3PZOA 3GDBA 4RE2A 1BVNP 4WKAA 1PPIA 4X0NA 4DUVA 1UZ4A 3WNMA 1GHRA 2VTFA 3CMJA 1H11A 3RJXA 2XVNA 1Q6DA 2YL9A 3ZMRA 3WUGA 5FL0A 1HXJA 4KWUA 1Z32X 3K4DA 2XVKA 3WMSA 2FH6A 3ZJ8A 1KWGA 2WVTA 3HU7A 4H8VA 1H0GA 5DEZA 2XUCA 1V0LA 1C7SA 3BAJA 3F5JA 4CD7A 1HKKA 4CUCA 1LWJA 3WDJA 4FK9A 1NP0A 3TA9A 4W86A 3ARXA 3NDYA 4PCSA 4BF7A 4D6IA 3GNRA 5C71A 5A95A 3ARTA 1B3XA 3B9DA 4W8LA 3AIVA 3THCA 3A4XA 1C90A 3ZJKA 3AS0A 1I1XA 3AMKA 1Y7VA 2NSXA 3VMPA 3VMNA 4D6FA 3KWXA 3QHOA 4QLKA 2VO5A 1GVYA 1XSKA 4B15A 2J7HA 3AIQA 2XSBA 1ZBWA 2RGMA 1US3A 2MANA 4PN2A 2CCRA 3WQWA 1H2JA 4M24A 1FA2A 2AAAA 1WZLA 3CHDA 3N9KA 1W9DM 1KBBA 4UZUA 3MUIA 1NARA 5FL1A 5HPOA 1GZJA 4PYSA 3OIHA 4E2OA 1BG4A 4JIEA 4MDPA 1JAKA 3ECQA 1NOUA 3F5LA 1XYZA 4MAZA 1V3IA 5M3WA 1OT1A 1PEZA 3QOKA 2X8RA 3CUFA 4MNJA 2EXOA 1HN1A 2YOCA 2VZVA 3W25A 1UR8A 1XV8A 1MW1A 1NOWA 1JFXA 4ATDA 5GNZA 4AC1X 1E70M 3EDKA 4LYPA 2WHJA 1J0KA 3BGAA 9CGTA 1F4HA 4J28A 2G3NA 4ZXLA 4CGTA 1UWIA 1QI5A 1MW2A 4PRWA 4H7VA 1PIGA 4PCTA 1ITXA 4MADA 3AI0A 3CZLA 2CKSA 2J78A 4U33A 2JALA 4PMNA 2ZXBA 4CN1A 1O7AA 1UZ1A 1DTUA 4UTFA 2WLYA 3L4VA 1H4PA 2E4TA 1CXLA 4URIA 3W6LA 1GPFA 2V5DA 5ABFA 4Z2LA 4F66A 2GK1B 2QV4A 4BCEA 1VEPA 3PZQA 4IISA 2Y8VA 1W1PA 1R85A 1E4LA 3LPPA 3PN8A 1HL9A 1XCXA 4JHOA 1HVQA 4UOQA 1QVBA 2CITA 3IJ9A 3L4YA 5GNXA 1V6YA 2D2OA 2WHKA 2BV9A 3WNNA 2C8NA 5BXRA 3RO8A 4A4AA 4MJ4A 3PZGA 1UOKA 2E9LA 2O9RA 1TMQA 2PB1A 4YHGA 3WQVA 4TTUA 3DHUA 2OWCA 5LYRA 1UWSA 1MFVA 1K9EA 2D3LA 4BA0A 3ARWA 4CD8A 1K6AA 1NWUA 4PMVA 4GZEA 3WMCA 1VEOA 3W28A 3FAXA 3GBEA 2WMHA 3M46A 2WW5A 4V27A 1WZKA 2XIIA 4EANA 3UR8A 1E4MM 3ZSSA 3BAWA 4D6HA 2D3NA 1GNXA 3G6LA 3PTKA 1NWSA 2PWEA 2WSKA 3WELA 2GUYA 2FHBA 3VDAA 1TA3B 5M5DA 1JZ5A 4HP5A 3T2QA 1G94A 2JF7A 5BWFA 4L4OA 3AIUA 5JIWA 3WQ5A 1JYWA 4LX4A 2OWXA 4GZJA 4MNLA 5I0DA 3VD7A 3ZSTA 1CGUA 5CJ5A 3II1A 4ACYA 1J0JA 2YBTA 1EQCA 2J79A 3O6AA 3WDIA 3W82A 1DHKA 1UA7A 3WNKA 2OSYA 4ATWA 2NT1A 4U2ZA 2PBOA 4AD3A 4AISA 1E6PA 1UWRA 2E0PA 3BAKA 4DUXA 1CXIA 1G5AA 3AICA 1K9TA 2D23A 1TVNA 1XH0A 2PBGA 2GDUA 1E9LA 4H2CA 2TAAA 1OIMA 2XVLA 4W8AA 4V2XA 3CIVA 2DSKA 1E3XA 3WH7A 4UFHA 1KCLA 1UD5A 3IANA 4HMEA 3AS2A 5I79A 3AXIA 2X09A 1BQCA 3MUZ1 2OLHA 1G9HA 4AZGA 4CD5A 3W27A 5IHSA 4B9YA 4ZFMA 3GH4A 1E6ZA 1KBKA 1UH2A 2JIWA 2WMKA 4MAVA 3WN6A 1GQJA 1XCWA 3BCFA 3OGVA 1V6VA 1OD8A 3W0KA 4CVUA 1WDQA 3T2PA 5A69A 1BAGA 1C8QA 3T0AA 5ABEA 3IJ7A 3L4XA 4GO8A 2Z1KA 4M80A 1XC6A 3VNYA 4DWSB 2X05A 2EPMX 1UKTA 3CZJA 1GOWA 3VGBA 3POHA 3VGGA 4JFVA 1I1WA 3K8KA 4U3AA 1ZBVA 1JYNA 1JZ7A 4PMQA 3UG3A 3UERA 3HMCA 4XX6A 2BY2A 1GUVA 3WIJA 5HPCA 1WPCA 4TX8A 4JFWA 4TVDA 3SCWA 2O9PA 5LA1A 2XM1A 1E71M 3O2LA 1JF6A 3OGSA 1G01A 1FH8A 1LL6A 3VIJA 3WF2A 3MV01 3WH6A 3WSUA 1FFQA 2JF6A 3A47A 1UQZA 5E9AA 4L4PA 6A3HA 3VD9A 5TD4A 3O9NA 4RL3A 4ZXOA 4W7UA 3T0BA 4W88A 4MNMA 1PZ2A 2E8YA 1KXQA 2VX6A 4EKJA 7TAAA 3ARVA 4J27A 1TG7A 2WCGA 3SCTA 2QLYA 4V28A 2OYKA 1UG6A 3MMDA 5BYWA 4JFTA 1EDTA 1CXEA 1UWUA 2WXDM 4HU8A 4B3KA 3OZPA 2Y2WA 2YKKA 1CZ1A 3TTYA 3CHCA 4B9ZA 5A6KA 3BSGA 1TFVA 3VIMA 1KWKA 2EBNA 4BQ2A 2J74A 4B16A 3MV11 1EHAA 2J8GA 5I77A 3RMEA 1C7TA 2Y5EA 3VILA 4A3HA 3SCSA 3DC0A 2OSWA 4JL1A 2CESA 1UR4A 1J0ZA 1EOKA 1OGGA 3TONA 1WP6A 3IJ8A 2EPLX 2XIBA 4YPJA 2QMJA 2V38A 3GXMA 3AFBA 1UD4A 4W7VA 2WBKA 1LL4A 4MB4A 3B9AA 4ZENA 1GORA 4MB3A 1JIBA 3NSMA 3W4RA 4D1IA 4NZCA 4DM1A 2YL6A 2XM2A 5CPQA 1OSEA 1ODZA 1W3KA 1JYXA 1TUXA 1H0IA 2WLZA 1TA3A 1B3WA 3BAYA 2VX7A 4WKHA 1J9YA 2UY3A 2CBVA 5F7UA 1WDPA 2XJ7A 3A6OA 1E73M 4U3CA 1JNDA 4W89A 4TTGA 3ZOAA 3ARQA 1WZMA 1EOMA 2J7DA 3RDKA 2ZX5A 2BNJA 1W3HA 4MB1A 1VEMA 3CTTA 3CLWA 3ARRA 2EO7A 2J62A 4P8WA 4D6CA 1ZB5A 1M03A 2DIJA 3PZTA 4UNIA 5KZ6A 2PI6A 2D20A 3TTQA 5BROA 4OBSA 5JBEA 1HP5A 1IT0A 2HVMA 1GJWA 2W63A 1KQZA 2XGBA 4PSPA 5HBFA 1GONA 1MYRA 4QCEA 3QHMA 2VRKA 1JZ8A 2CHOA 2GJPA 1FHDA 3PZVA 1ISXA 5EFFA 2Z1SA 4MB5A 1A3HA 1XH1A 2IUZA 3AHXA 4M8UA 3SCUA 2XFFA 3AXHA 1LG1A 2ESCA 4GIAA 4P8VA 4YN5A 1Q6CA 3ZO9A 2Y24A 4N42A 1JZ2A 4GI6A 4EK7A 4NF7A 2WB5A 3EDJA 3ZQ9A 1VAHA 2ZE0A 5IXEA 1EO7A 3SEPA 2XTKA 2YDQA 1G1YA 2C0HA 1KQYA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1OIN A;  4UCF A;  3GXI A;  4U2Y A;  1GW1 A;  3WY1 A;  4FLS A;  4PMX A;  4X9Y A;  1VFO A;  1VF8 A;  3E1F 1;  3VDC A;  1QNP A;  1EO5 A;  4M81 A;  1KXV A;  1AQH A;  3HJE A;  3WF1 A;  5DF0 A;  4PUE A;  1WNO A;  1JNE A;  3AZT A;  1O6I A;  3EDF A;  1RP8 A;  3OLI A;  3WQ4 A;  1XYF A;  1E1F A;  2DT0 A;  4EAM A;  1CXF A;  2CXG A;  1UR9 A;  5C70 A;  3WL0 A;  1X6L A;  1OD0 A;  3MMW A;  4BQ4 A;  3BH4 A;  1C8X A;  3KE0 A;  3APG A;  3CMG A;  3CO4 A;  3MSD A;  1HL8 A;  3AIR A;  1SYT A;  1UR2 A;  4OIF A;  4ZEP A;  1SMA A;  1V6U A;  1HNY A;  4LYR A;  4CVW A;  3K8M A;  5CGT A;  1J0H A;  4IM4 A;  3WD0 A;  1OWQ A;  3UR7 A;  3RM4 A;  4YHE A;  4PTM A;  3WNP A;  4H04 A;  4MTV A;  4XUY A;  4FLR A;  3WEN A;  1R87 A;  3A3H A;  3UES A;  2Y4S A;  5DMY A;  3VO0 A;  1OB0 A;  3B8S A;  4AD0 A;  5CZK A;  2J25 A;  1VFU A;  2UY5 A;  3FY1 A;  3SUW A;  1XGZ A;  4BZY A;  3IAP A;  1HIZ A;  2JIE A;  1DWH M;  3GH5 A;  4XV0 A;  2G3M A;  2O9T A;  2O92 A;  3L4Z A;  1UKS A;  3KL5 A;  4PMD A;  2GVY A;  5D8Z A;  2J7G A;  3VKK A;  2WMI B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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