3AHXA

Crystal structure of beta-glucosidase a from bacterium clostridium cellulovorans
Total Genus 183
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
183
sequence length
444
structure length
444
Chain Sequence
MEKLRFPKDFIFGTATAAYQIEGAYKEDEKGESIWDRFSHIPGNVAKMHNGDIACDHYHRYKEDVQLLKSLGIKSYRFSIAWPRIFPKGFGEINQKGIQFYRDLIDELIKNDIEPAITIYHWDLPQKLQDIGGWANPQVADYYVDYANLLFREFGDRVKTWITHNEPWVASYLGYALGVHAPGIKDMKMALLAAHNILLSHFKAVKAYRELEQDGQIGITLNLSTCYSNSADEEDIAAAHRSDGWNNRWFLDAALKGTYPEDMIKIFSDTNIMPELPKELFTEVFETSDFLGINYYTRQVVKNNSEAFIGAESVAMDNPKTEMGWEIYPQGLYDLLTRIHRDYGNIDLYITENGAAFNDMVNRDGKVEDENRLDYLYTHFAAALSAIEAGVPLKGYYIWSFMDNFEWAEGYEKRFGIVHVNYKTQERTIKKSAYWYKELIERSN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and functional analysis of three beta-glucosidases from bacterium Clostridium cellulovorans, fungus Trichoderma reesei and termite Neotermes koshunensis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase A
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium cellulovorans
total genus 183
structure length 444
sequence length 444
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ahxA00
1EA9C 3OGRA 4UR9A 3AROA 4GO8A 1MW2A 2W61A 2WC4A 9CGTA 1JZ8A 3RM8A 4OBSA 3SUUA 1ISZA 1AQMA 2WC7A 4W93A 1L8NA 4CD6A 3K1DA 1UD4A 1XD0A 1ZS2A 1KCKA 2A3EA 3AMCA 5HDRA 5I6SA 1HKMA 1JZ6A 3CTTA 2GFTA 2OYMA 3BAKA 1VBRA 5I5RA 3THDA 1OGGA 3ZT6A 4J3VA 2VZOA 2EPMX 2XVPA 3MMUA 4PSRA 1US3A 1CNVA 4LXFA 1EH9A 2XUCA 3VPLA 1ISYA 2CBJA 3CUGA 1E6QM 3EDFA 1AQHA 3CUIA 1PIGA 3N15A 2OLHA 1KBBA 1MFUA 1W91A 3VIHA 2WBGA 3T09A 1OD8A 3WD1A 1UR0A 5ABHA 1WCGA 2V3EA 1H4PA 1DEDA 3WDHA 1B3WA 1EXPA 3BMWA 1EOMA 2VX6A 5M5DA 3GTNA 4PTWA 3CO4A 4P7NA 1E0VA 4LYRA 1C8QA 3EDEA 1V0NA 4AW7A 4PTVA 5A8MA 1PEZA 2XFRA 1UWTA 1GHRA 1W3HA 4JFSA 5BRQA 2YIHA 2GK1B 2CEQA 2DIJA 4CD8A 2ESCA 1WZKA 3W6LA 1E6RA 1KGWA 1Q6FA 4H2CA 3VOCA 4F9DA 3M46A 2FHBA 3N1AA 1GOMA 2DH2A 1E0WA 1E4NA 4PMQA 1KFWA 2EEXA 2WK2A 2VUYA 4DUXA 2DDXA 4KRTA 2DEPA 1W2PA 2J79A 1EOKA 4C7DA 3LPOA 1VJZA 3NYDA 4A3YA 4LX4A 3VIMA 1A47A 2ZXAA 3KE0A 2CXGA 4W7UA 4AZBA 2VQUA 3W38A 1AVAA 3QHNA 5BYWA 2WANA 1E72M 4NF7A 5A8PA 2ZUUA 1EO5A 3WDPP 4WKHA 5JBDA 3DYPA 1KWGA 4XZWA 3MS8A 4LQ1A 2PC8A 2PWDA 1GOWA 1GQJA 1C90A 3WDIA 2GSJA 5BXRA 2VX7A 2VZTA 1SR0A 4P8UA 4UQBA 4CN4A 1VBUA 5C8BB 1V3LA 1LL7A 1ODUA 1LLOA 4GI6A 1H1NA 1W1TA 1SMDA 2WMFA 3AHXA 5EB8A 1VEPA 4CVUA 1QI5A 3VD3A 1CXIA 1JF5A 4AZ7A 3ARPA 4CD5A 3L4VA 1CYGA 2WXDM 5KEZA 4AEEA 3POCA 3WY1A 4MADA 1VEOA 3ARYA 3VD5A 3VIOA 3WQWA 5FCZA 4MB5A 1PIFA 1W1VA 1QNPA 3WQ5A 3NJ3A 3FNDA 1KGUA 3CH9A 3MSDA 4CCCA 3AHVA 3A4AA 1LG2A 3SCNA 1UA7A 2D3LA 1WB0A 1IZKA 2PB1A 3CHEA 3QOMA 2XVKA 3L4YA 1CZ1A 4QP0A 3OLEA 3N17A 2QPSA 3SURA 3SCQA 5CZKA 5GQBA 1E55A 5KZ6A 4HZ6A 4URIA 2J47A 2WSKA 3GH4A 1VEMA 4MPKA 3MO4A 1UH2A 3W29A 1JZ7A 4AZ6A 2WKLA 1WO2A 2HISA 1JNDA 4FK9A 1PJ9A 3PTMA 3BCDA 2XG9A 3GNPA 4ZENA 2WPGA 3VX1A 3W37A 5TD4A 2WVTA 3ARSA 5M03A 1NQ6A 1R7AA 1GNXA 4U3AA 1XC6A 3T08A 1XV8A 3PZIA 4D6CA 1QI2A 5E9AA 3WDQA 1WP6A 1KR0A 3OGSA 1MVYA 3B8SA 4AZHA 3AXXA 3GNRA 3DHPA 2W63A 3MMDA 1K9DA 1E56A 3CUJA 3OG2A 2VZVA 4GZEA 1HJXA 2WW5A 3AMDA 3UETA 3AHYA 2DSZA 3A47A 4PMOA 3T2QA 3BAXA 2VCAA 4S3JA 3AZSA 4AEFA 4UQ9A 2W67A 1XH0A 5CLTA 2DSWA 2D3NA 1JDCA 2W66A 3CIVA 3F5JA 4P8WA 4PMYA 2WHKA 1FA2A 3QR3A 3NDYA 3VGDA 2WMIA 1NOFA 4CN1A 4E8CA 4MB4A 2Y5EA 4N42A 4CU7A 3VIPA 1G1YA 3AIQA 4ATLA 1QNSA 4AZGA 1F4HA 4ACZA 1WZLA 5GPRA 2GJXB 3BC9A 1J0IA 2E40A 1EO7A 3J7HA 1GJUA 1VFUA 3DC0A 5HNNA 4AZ5A 4QCEA 2DT3A 5I77A 1Q6DA 2A3CA 3BAYA 2XSBA 1MW0A 2XFFA 3PZUA 4N0RA 3GH5A 3WKZA 4YPJA 1M53A 3OGVA 3FW6A 4P8VA 5BXTA 3U57A 4B3LA 4AY1A 1VFFA 1V6VA 4YN5A 3E1F1 5A2CA 1UR9A 3VGBA 4BQ2A 2YL5A 4DUWA 1QI0A 4EANA 4YHEA 5LA1A 2BHUA 1CTNA 4WKAA 1IV8A 1I75A 1WDSA 1UKOA 4WSJA 5E70A 1JDAA 2NT0A 1UKTA 5E0CA 3WD2A 4W87A 4H8VA 2E9LA 1FP8A 1CDGA 5CGMA 5BROA 5I79A 3RDKA 1XHGA 2IXUA 3MSGA 1HL8A 3WNLA 4TXEA 2ZWYA 2EXOA 3BH4A 2BY0A 3VINA 2CITA 2DIEA 3VIIA 1QHPA 1E0XA 2G3NA 1QPKA 1QI3A 4EKJA 1E5NA 2J77A 2PWHA 4J7RA 3WELA 1U2YA 3AIEA 3WDRA 4OOUA 1DTUA 5A6SA 1TFVA 1DWIM 1V6YA 3CZ8A 1HVXA 5E6YA 4D6DA 1JAEA 1UWUA 4FLQA 4AD0A 3IAPA 4QFUA 4BF7A 3QHMA 1B30A 2V5CA 1V3HA 4RE2A 2PI6A 3WMBA 2CPUA 4UNIA 3EMQA 4PUEA 4AZIA 3BGAA 1XSIA 3HMCA 4UFIA 2Y8KA 4YHGA 4U2YA 2Y24A 4LPCA 2JIWA 1EDQA 1JZ4A 4NRRA 3IJ8A 1CPUA 3N04A 1Q4NX 3TTSA 1HKKA 3SUTA 2FHCA 1US2A 1R86A 2D0FA 1PPIA 4LYQA 5DMYA 2QHAA 5DEZA 4MNJA 1V6XA 1MW3A 2D20A 1TVPA 1OB0A 3WBEA 4D72A 2XJ7A 4KGLA 2BV9A 2YLAA 1BGAA 3W28A 4UZSA 1WPCA 1FP9A 4ATWA 1TUXA 3VIGA 1B3XA 1NP2A 3ARQA 2QV4A 4MNKA 3WFLA 4DM2A 3WIJA 1UOKA 3I3EA 4JHOA 3DHUA 4AD2A 1ZJBA 2CYGA 4WJXA 1TA3A 4PCSA 4V27A 2IUZA 3ALGA 1W9PA 1JIBA 4U5IA 5A8OA 3II1A 4UFMA 4ZE4A 1WZMA 4X9YA 1X6NA 5HOSA 4P7LA 1J18A 2UWFA 1E70M 3VM7A 4QCFA 1H49A 4GZJA 1XGZA 3RM4A 2VRJA 3BMVA 1E43A 3NSMA 4J3UA 3AYRA 3O6AA 3OIHA 2D0GA 1NOWA 1QW8A 4BQ3A 4CU8A 4UOZA 5A8NA 1W9BM 1G94A 4DWSA 4J27A 5D9OA 2W91A 1XCXA 4U2ZA 2CHOA 2J8GA 3TA9A 1XYZA 5LYRA 2OYLA 4NRSA 3U5YA 1NP0A 2CKSA 3O2LA 4WLCA 4NI3A 2FHFA 5HBFA 3CHFA 3CZKA 3VDBA 5A1AA 1QBAA 4GIAA 3LPFA 2GUYA 1G01A 1ISVA 4OZOA 2WWCA 2NW0A 1HJSA 2XIIA 4UFKA 2CBVA 3O9NA 3AS0A 1H3GA 2J62A 3W6MA 1DHKA 3VU2A 3KZSA 1BAGA 1B1YA 1BFNA 1DWJM 3QHOA 4Z2GA 4PBGA 5DO8A 2VTFA 2YDSA 4AC1X 1CXHA 1GQLA 3VD4A 1GOKA 5C70A 4JL2A 3VD7A 3NSNA 3UEQA 4GI8A 3CLWA 3WQ6A 1U30A 3HN3A 2WMKA 3FY1A 1JD9A 1NWSA 3VNZA 1GW1A 4B3KA 2WBKA 4H41A 3WENA 3RJYA 2EQDA 1NOUA 4JIEA 4PMDA 1CLXA 1M04A 4U33A 3OLIA 2MANA 4F8XA 2NT1A 1GQIA 1UKQA 2XTKA 1HT6A 1LWHA 3A4WA 1I1XA 2DQXA 2PF0A 1B2YA 1JFHA 4CN6A 2ZE0A 3T2OA 3GNOA 3VDHA 1O7AA 1E6SM 4Z2KA 3SCRA 3BCFA 2ZXQA 8CGTA 4QAWA 4QLLA 4DWSD 2VX5A 3L4XA 4R27A 3AIRA 4B16A 3WUBA 1OT2A 3KWXA 3GXMA 3POHA 4CGTA 3GXIA 1P6WA 4IISA 2D1ZA 3AMLA 4ZXOA 1HIZA 4MAVA 1GOOA 1ZBVA 4HPHA 2OSYA 3T0BA 3G6LA 1GONA 2D0HA 1E73M 4X0VA 1Q6EA 5M17A 3BAJA 3GH7A 2XHYA 4PYSA 3WF4A 1EHAA 1AMYA 1UD8A 4P7QA 2J8FA 3WF3A 1FOBA 1BYCA 2D22A 2J4GA 4EE9A 1EDTA 1K9EA 1ZB5A 1DP0A 2VI0A 4CKQA 3THCA 2J7DA 2VZSA 3BSHA 5IDIA 4E4PA 3ZIZA 4OUEA 2JEQA 1JI1A 2VCBA 1HN1A 1QNRA 1WE5A 2WC3A 3BLPX 4Z2JA 1L0PA 1OD0A 2DH3A 2V3DA 4WIWA 2PBGA 1SMAA 4QLKA 2XIBA 2BFGA 1K9FA 4J3XA 1UR2A 1UUQA 1E4LA 1VRXA 3UESA 1E40A 1JXKA 4TVDA 3RILA 1C8XA 3AS3A 4UFLA 1H41A 1WNOA 4TX8A 3ZQ9A 2G3IA 4HU0A 5AY7A 3N9KA 1EGZA 4GZIA 2BVDA 1HKIA 1MFVA 4M81A 2BVTA 1GQKA 1XRVA 1KR1A 1HKJA 1FFQA 1ITXA 5LA0A 5FOOA 3RM9A 2FGLA 4ZXLA 3WBAA 2J7HA 3VD9A 3MMWA 1KXHA 4OKDA 2ZWZA 2YDRA 4ZFMA 2WWDA 5DT7A 3VMNA 1LF1A 4JFVA 2VNCA 2FH6A 1HP5A 1TZ7A 2VVNA 1PBGA 1B3YA 4PMUA 4WSKA 1QVBA 2O9RA 4AZCA 1H0GA 2ZX7A 4E2OA 4MJ4A 2OWCA 1MW1A 2YA2A 1Q6GA 1CEOA 5CJ5A 3ZT5A 4D6JA 4BZYA 3GBDA 4UFHA 7CGTA 2WZHA 5EBAA 3CHDA 1JYNA 3CZEA 5EFDA 3FHQA 1W9UA 3FAXA 1JYWA 2A3AA 2G3JA 2XSAA 3VMPA 1O6IA 1V3IA 5A2AA 1J01A 3VNYA 3VGFA 1UZ4A 4ZE5A 1ODZA 4LYPA 4P8XA 3LPPA 4IM4A 1JDDA 5BWFA 4FMVA 3GBEA 1OGBA 2ZUVA 4BQ4A 1C8YA 1TR1A 3MV01 3WD4A 1SYTA 4PMRA 1E71M 3WUFA 2YL6A 5CG0A 1GPFA 4QDMA 4D1IA 2DT0A 3AQUA 4J3WA 1U33A 4PTMA 3AZTA 4LGXA 4AD5A 4F9JA 1JF6A 2XWDA 1E6ZA 4MTVA 2WVUA 2G8ZA 2BY2A 2CIPA 4GQQA 4K68A 1CXEA 3A4XA 3AHZA 3ZOAA 4W84A 2J74A 3IAQA 2X2YA 3SEPA 3PZOA 5JBFA 4MNMA 2WCAA 1NARA 2VT0A 5A6MA 1YQ2A 2O9OA 4AYSA 3UG3A 4H7VA 4W5ZA 3WSUA 1I1WA 5C71A 5BXSA 1X6LA 2VO5A 1JAKA 3GYCA 4IPNB 3T0DA 2VMFA 4HP5A 1EIBA 3GDBA 2G3MA 5JIPA 5I0DA 2J7EA 3PZMA 3AI0A 4BCEA 4PMVA 4H8HA 1CGUA 1EDGA 2WMIB 4P7OA 3PZQA 4Y7EA 4PSPA 3L4WA 5FKYA 4L4PA 1JI2A 1JFXA 2X0YA 1GOIA 4R5EA 5E0FA 2FH8A 1XYFA 1CLVA 4OIFA 1V0MA 3WMCA 4ACZB 1B3VA 1BSIA 3U7VA 5CLWA 4XZBA 3WNOA 1VJSA 3RCNA 4PUDA 3K8MA 1V3JA 1W2VA 3OZPA 1K6AA 1ZBWA 3U5UA 2BY3A 4HOWA 2XYLA 5A95A 2YL9A 4JCMA 1QHOA 3K4DA 1R7OA 2JIEA 2WSPA 3U7BA 1FH8A 3WUEA 1CGVA 3NCOA 5BCAA 3ZO9A 7TAAA 3W82A 5E09A 4FLOA 3PTKA 4ACYA 1OM0A 4GO9A 1PX3A 2WKGA 4TOQA 1JZ5A 4CD7A 5HXMA 2ZIDA 2E9BA 4CVWA 2E8ZA 1E6NA 2WVSA 4E8DA 1BGGA 2XFYA 4DM1A 2D23A 4MDOA 1GHSA 3ARRA 3WQ8A 1CGWA 3WH6A 1H09A 3WNPA 4L4OA 1E4IA 2J78A 4J3SA 1B31A 3UCQA 1RP8A 3UG4A 1LL6A 3K8KA 1GORA 1LJYA 4Q7NA 4W88A 3SIMA 5BXPA 1FHDA 3WEZA 1N82A 2BNJA 4UOQA 4W85A 4TVCA 2BXYA 3VUPA 2PWEA 4UQAA 4HZ7A 1UWQA 5BRPA 3AZRA 2D24A 1RPKA 1E5JA 1RH9A 3CZGA 1QNOA 3A3HA 2WZIA 4HMEA 2CCRA 1V6UA 3CUFA 2HVMA 3HJEA 2B31A 4GKLA 1LQ0A 3F5LA 1BVZA 1QNQA 1TMQA 3OBAA 4UOJA 1BG4A 2GDUA 3BAIA 4CU6A 1JZ2A 1KWKA 1JZ3A 4BA0A 1M03A 3HU7A 2Z1KA 1CIUA 1CWYA 5D9PA 1CGTA 4RE4A 2UY3A 1NWRA 4Z2HA 1JYXA 2YOCA 3ZMRA 1H11A 1A3HA 2ZUWA 1MQQA 4HZ8A 1ZBCA 2EO7A 2JFEX 2OWWA 3CBWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1EA9 C;  3OGR A;  4UR9 A;  3ARO A;  4GO8 A;  1MW2 A;  2W61 A;  2WC4 A;  9CGT A;  1JZ8 A;  3RM8 A;  4OBS A;  3SUU A;  1ISZ A;  1AQM A;  2WC7 A;  4W93 A;  1L8N A;  4CD6 A;  3K1D A;  1UD4 A;  1XD0 A;  1ZS2 A;  1KCK A;  2A3E A;  3AMC A;  5HDR A;  5I6S A;  1HKM A;  1JZ6 A;  3CTT A;  2GFT A;  2OYM A;  3BAK A;  1VBR A;  5I5R A;  3THD A;  1OGG A;  3ZT6 A;  4J3V A;  2VZO A;  2EPM X;  2XVP A;  3MMU A;  4PSR A;  1US3 A;  1CNV A;  4LXF A;  1EH9 A;  2XUC A;  3VPL A;  1ISY A;  2CBJ A;  3CUG A;  1E6Q M;  3EDF A;  1AQH A;  3CUI A;  1PIG A;  3N15 A;  2OLH A;  1KBB A;  1MFU A;  1W91 A;  3VIH A;  2WBG A;  3T09 A;  1OD8 A;  3WD1 A;  1UR0 A;  5ABH A;  1WCG A;  2V3E A;  1H4P A;  1DED A;  3WDH A;  1B3W A;  1EXP A;  3BMW A;  1EOM A;  2VX6 A;  5M5D A;  3GTN A;  4PTW A;  3CO4 A;  4P7N A;  1E0V A;  4LYR A;  1C8Q A;  3EDE A;  1V0N A;  4AW7 A;  4PTV A;  5A8M A;  1PEZ A;  2XFR A;  1UWT A;  1GHR A;  1W3H A;  4JFS A;  5BRQ A;  2YIH A;  2GK1 B;  2CEQ A;  2DIJ A;  4CD8 A;  2ESC A;  1WZK A;  3W6L A;  1E6R A;  1KGW A;  1Q6F A;  4H2C A;  3VOC A;  4F9D A;  3M46 A;  2FHB A;  3N1A A;  1GOM A;  2DH2 A;  1E0W A;  1E4N A;  4PMQ A;  1KFW A;  2EEX A;  2WK2 A;  2VUY A;  4DUX A;  2DDX A;  4KRT A;  2DEP A;  1W2P A;  2J79 A;  1EOK A;  4C7D A;  3LPO A;  1VJZ A;  3NYD A;  4A3Y A;  4LX4 A;  3VIM A;  1A47 A;  2ZXA A;  3KE0 A;  2CXG A;  4W7U A;  4AZB A;  2VQU A;  3W38 A;  1AVA A;  3QHN A;  5BYW A;  2WAN A;  1E72 M;  4NF7 A;  5A8P A;  2ZUU A;  1EO5 A;  3WDP P;  4WKH A;  5JBD A;  3DYP A;  1KWG A;  4XZW A;  3MS8 A;  4LQ1 A;  2PC8 A;  2PWD A;  1GOW A;  1GQJ A;  1C90 A;  3WDI A;  2GSJ A;  5BXR A;  2VX7 A;  2VZT A;  1SR0 A;  4P8U A;  4UQB A;  4CN4 A;  1VBU A;  5C8B B;  1V3L A;  1LL7 A;  1ODU A;  1LLO A;  4GI6 A;  1H1N A;  1W1T A;  1SMD A;  2WMF A;  3AHX A;  5EB8 A;  1VEP A;  4CVU A;  1QI5 A;  3VD3 A;  1CXI A;  1JF5 A;  4AZ7 A;  3ARP A;  4CD5 A;  3L4V A;  1CYG A;  2WXD M;  5KEZ A;  4AEE A;  3POC A;  3WY1 A;  4MAD A;  1VEO A;  3ARY A;  3VD5 A;  3VIO A;  3WQW A;  5FCZ A;  4MB5 A;  1PIF A;  1W1V A;  1QNP A;  3WQ5 A;  3NJ3 A;  3FND A;  1KGU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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