3AHZA

Crystal structure of beta-glucosidase from termite neotermes koshunensis in complex with tris
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
TVYTFPDEFKLGAATASYQIEGAWDENGKGPNIWDTLTHEHPDYVVDGATGDIADDSYHLYKEDVKILKELGAQVYRFSISWARVLPEGHDNIVNQDGIDYYNNLINELLANGIEPMVTMYHWDLPQALQDLGGWPNLVLAKYSENYARVLFKNFGDRVKLWLTFNEPLTFMDGYASEIGMAPSINTPGIGDYLAAHTVIHAHARIYHLYDQEFRAEQGGKVGISLNINWCEPATNSAEDRASCENYQQFNLGLYAHPIFTEEGDYPAVLKDRVSRNSADEGYTDSRLPQFTAEEVEYIRGTHDFLGINFYTALLGKSGVEGYEPSRYRDSGVILTQDAAWPISASSWLKVVPWGFRKELNWIKNEYNNPPVFITENGFSDYGGLNDTGRVHYYTEHLKEMLKAIHEDGVNVIGYTAWSLMDNFEWLRGYSEKFGIYAVDFEDPARPRIPKESAKVLAEIMNTRKIPERFRD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and functional analysis of three beta-glucosidases from bacterium Clostridium cellulovorans, fungus Trichoderma reesei and termite Neotermes koshunensis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Neotermes koshunensis
total genus 196
structure length 472
sequence length 472
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ahzA00
2WAGA 3FW6A 2XVKA 5BXPA 4HU0A 4QLJA 2XFYA 4UOJA 1NOFA 3ARSA 5TD4A 1D2KA 1E15A 5JIWA 3QGVA 4HZ6A 2J7EA 2UY3A 1EO5A 1ZBWA 4MADA 1MW0A 3WQ5A 5FKYA 2DSWA 1B90A 1J10A 3D5HA 1B3YA 1HF6A 2DGAA 4P8UA 2WXDM 3FHQA 4U33A 1MWOA 5BRPA 3O9NA 5EMYA 3AS0A 3VX0A 4OOZA 4HMDA 1B3WA 3U5YA 3ZJ7A 5IXEA 2YBTA 4PMRA 4LXFA 1UWTA 1X6LA 3VIMA 1IZKA 4QLKA 1V6UA 4W84A 1UA7A 3B9EA 3AMLA 3BAWA 2YA1A 1GVIA 1Q6GA 1OIFA 3T08A 2WMGA 1J18A 3N13A 4Z2KA 3ARYA 3AFBA 3OGVA 4D6IA 2PWEA 4A3YA 4U2ZA 1KXHA 2JF7A 4FLSA 1BGAA 3WF1A 2A3EA 4AD5A 5JBDA 2DT3A 3AIEA 1H0IA 4LYPA 4UFKA 1XCXA 2J25A 1GOWA 4Q7NA 3VTRA 3CHEA 3SUTA 2XHYA 2OWCA 3VDHA 3LPFA 1CPUA 1R87A 4B15A 1MXDA 5GNXA 3EDDA 1W1VA 3WNPA 3NSXA 1E6QM 4IISA 2QPUA 5A6MA 4CU7A 3MMUA 2X8RA 2YA2A 1QHZA 3BAIA 1UWUA 2XWEA 3WUEA 1ESWA 1MVYA 4AZIA 2VR4A 4KWUA 2WVTA 2J75A 2D24A 3PZQA 4JFSA 3OG2A 5LYRA 2DDXA 1ISWA 5ABEA 2W91A 3OA5A 1N82A 4J3WA 1ZL1A 3O6AA 3F4VA 2D3LA 4TOQA 3CH9A 1K9FA 5HOSA 1PZ2A 4WSJA 4CD8A 1DWIM 4M81A 1TZ7A 1HP5A 1UWSA 4K68A 4MB4A 3L4ZA 1W9PA 3OB8A 2GDVA 3AZRA 5AC5A 1Q6CA 1EQPA 2VR5A 3A6OA 3IJ8A 4AW7A 1W1TA 1XRVA 1TVNA 5HDRA 1QHOA 2J74A 1EIBA 3VU2A 1BGGA 4UTFA 3WL0A 3ZR5A 5I78A 4GQQA 3VO0A 3O2LA 2Z1KA 3G6MA 5CQ1A 4DUWA 1JXKA 1KWGA 1QW9A 4DM2A 5ECUA 1XGZA 4UFLA 3UG4A 1J0IA 1VFMA 2VQUA 5A8PA 3VMPA 4PMNA 5DT5A 5EFFA 2QF8A 4AZHA 2G3MA 4HP5A 1H2JA 4LYQA 1V3HA 2CBVA 4JCMA 1VJSA 1LWJA 2CEQA 4BQ2A 1W1PA 2E9LA 1CXKA 2EPMX 3ARRA 3B9DA 1BYBA 3PZUA 2WMKA 4CN4A 1SYTA 4PTWA 3SIMA 1ZU8A 1CGXA 4AIOA 3IK2A 2GJRA 2PBGA 3JUGA 4AXNA 1LL7A 4P7QA 4CCEA 3T0BA 3AI0A 2VZUA 1OWQA 3HJEA 5BCAA 3AS3A 4NRRA 1Z32X 1KGXA 3VGBA 1TG7A 3N17A 4J7RA 1OT2A 4ATLA 7TAAA 1PIGA 1EDTA 1AMYA 2VX6A 2VVSA 2VZOA 2X0YA 2WHKA 3QHNA 3PZOA 5D9MA 4D1JA 1GOQA 3ARVA 5A8MA 1MYRA 4UQCA 2VZVA 2XVLA 4UQDA 5C71A 1VEOA 1ISXA 1E5NA 1WCGA 2ZX8A 3WEZA 3EMCA 2GJXA 5CSYA 1E40A 2NSXA 2CIPA 2WHMA 3CMGA 3AMCA 3PTMA 2GDUA 1TVPA 1FA2A 1E70M 1U2YA 5FD0A 1UHVA 3MKKA 4Q22A 1LG1A 3WD1A 5DMYA 1WO2A 3WDQA 3WDHA 5CPQA 1BVNP 1RPKA 1ITXA 2CNCA 3GM8A 4A3HA 1QNOA 4W7UA 3VIOA 1NQ6A 4ACZB 3ARZA 5M5DA 1C7TA 1U30A 3OLGA 2XGIA 2BVDA 2TAAA 3F5LA 3N18A 3SCPA 1HNYA 1GJWA 4PEEA 3ALFA 1GUVA 1ISYA 3CBWA 2FGZA 5E09A 4C7FA 4KGJA 3L4YA 2BY0A 2YA0A 1JNDA 3F5KA 2OSXA 3BSGA 3N9KA 4XUYA 2BFGA 3BMWA 4MDOA 3QOMA 1MQQA 1HJVA 2GSJA 4WJXA 1P6WA 2EPKX 2Z1SA 5CPTA 1GHSA 5ABFB 3SCNA 1PEZA 4PCTA 1HL9A 2X05A 3WUGA 3K4DA 2BXYA 3WY1A 1EOKA 3NCOA 3QR3A 5KZ6A 5CGMA 6TAAA 4MJ2A 1KFWA 2V5CA 4AIEA 4U5IA 4P7LA 4M80A 1Q6FA 1A3HA 2UY5A 4WKHA 1HXJA 1R85A 2DIJA 3KEHA 2V5DA 1EQCA 1OCQA 1JDCA 3OZOA 2BS9A 1FP8A 3WENA 1JZ2A 1V03A 1E1EA 1WPCA 4WK9A 4FLRA 3N11A 3L4VA 5D9OA 1E71M 4IUGA 3L4WA 4D6GA 1BLIA 1TCMA 4DUXA 4TTUA 2W92A 3MMDA 4J3TA 4IPLA 3AISA 1B9ZA 5BXRA 4MB1A 4CN6A 2FH6A 1BYCA 1QNQA 2BHUA 2XVGA 2XM2A 2Y4SA 4CGTA 4RL3A 1V6YA 3BAKA 4GZJA 3VDBA 7A3HA 4HA1A 3TP4A 3CUIA 3NDYA 5AY7A 1KQYA 2OYMA 2OSYA 3AQUA 3GDBA 4A4AA 3ZSSA 2XIIA 3IJ7A 1IV8A 4AZGA 4KMQA 3BAXA 4HU8A 3NUKA 3AICA 2DSZA 5A6SA 1HJQA 1WB0A 3HN3A 2FHFA 4GINA 5EFDA 1Y7VA 1W3LA 2ZUTA 2WMHA 2XFRA 1JG9A 2ZUMA 3VGDA 1I1XA 5A8NA 4HZ8A 4PCSA 3WNKA 1XD1A 1JFHA 3ARQA 1WKYA 4CD6A 4JKMA 4HZ7A 2ZX5A 1FHLA 1WZMA 4H41A 1E3ZA 1BPLB 3AMKA 5A2AA 5A6JA 4B9YA 4MAVA 3VGGA 4AZCA 2CYGA 4PMZA 3PTQA 2WCGA 1CNVA 1FH7A 2WMIA 4AYSA 3CZKA 2BVTA 1CENA 1WNOA 3OIHA 1VFFA 3PZNA 1EDQA 4X0VA 1E55A 1CIUA 4M24A 4UZSA 3EBVA 2VX4A 2E9BA 3EYPA 3VD4A 1V0LA 2FDMA 3AZSA 4AD1A 1HP4A 3WSUA 4QFUA 4W85A 4MDPA 3K1DA 5A6LA 4CKQA 4EE9A 1JD7A 1FH9A 4NI3A 3ZT7A 4JAWA 3NJ3A 2WWCA 1O6IA 3CLWA 3I3EA 2J7GA 2WLZA 5JIPA 2EJ1A 5I24A 1W3JA 2QHAA 1MXGA 3ZSTA 3RO8A 2Y2WA 3T2QA 2PWFA 4DWSD 1NM9A 4RE2A 4W89A 2YL9A 2CHOA 4UOQA 3APGA 2ZIDA 2VO5A 2WMJA 3NSNA 3WDPP 3WFZA 4D6JA 3ZMRA 2W67A 2DSVA 1OGSA 4FMVA 4QAWA 2OYLA 3WDIA 1WDPA 4F9JA 4U2YA 1KCLA 3ZT6A 4J3VA 4BCEA 4MTVA 2ZUUA 3CHFA 4NZCA 4AD0A 2VURA 4PMQA 2DIEA 5A69A 1QI5A 1UR4A 3SCSA 1R7OA 5AYBA 1XH1A 2QMJA 4PMUA 1GOMA 1GOKA 4E8DA 3VGEA 1VJZA 2Y5EA 5DF0A 1W32A 2OYKA 4OBSA 2ZE0A 1XC6A 3NIYA 1CGTA 2FHCA 2C0HA 2V3EA 4R27A 1E4LA 3PZVA 4MPKA 1CECA 5A2BA 5D9NA 3WIJA 1J0ZA 3FXYA 4F79A 5FCZA 2EO7A 1BQCA 3ARXA 3WEOA 1B1YA 1C3FA 2WZHA 1JYVA 2RGMA 2EXOA 1LF1A 1PPIA 4W86A 4C7GA 1H49A 3CUFA 2A3AA 3PZ9A 4BQ3A 4ATWA 5I6SA 1ZBCA 3VGFA 4P8VA 4UFMA 2E4TA 1C8XA 3WF3A 1SFSA 3DC0A 3UESA 1A47A 1WAWA 4JHZA 3VIIA 3VIHA 1FHDA 1E6ZA 4Z2HA 3FNDA 1CZ1A 1GQKA 2WCAA 3D3AA 3ARPA 2XM1A 3KE0A 1HL8A 1CGWA 6CGTA 2CERA 2JFEX 2D0GA 1R7AA 1QNRA 4HOWA 3BC9A 1BFNA 3W28A 2YL6A 1NWUA 3VIKA 3ZOAA 2EQDA 3VDCA 4MNJA 3BMVA 1JNEA 2WMFA 2DSUA 2ZUWA 1ZBKA 5HBFA 1ZB5A 4KGLA 5LA0A 2X0HA 3THDA 3MUZ1 3MSDA 1GORA 2O9TA 4W8BA 1DWHM 1KCKA 2ZWZA 5D8ZA 3F5JA 4XB3A 2XWDA 3CO4A 1QVBA 1US2A 2QPSA 1JZ6A 2QLYA 2GK1B 2WC7A 1QPKA 3DHPA 4AEFA 1WP6A 4RE3A 1W9VA 3DYMA 3UG5A 1NWTA 3BCDA 3WQ6A 1JZ5A 1UKPA 4D1IA 3K4AA 5BRQA 2V38A 1LJYA 4N0RA 4E2OA 1VAHA 1J01A 1QI2A 2J7HA 1G01A 2ZX6A 4UQBA 2W62A 2VJXA 4JKLA 3AMGA 4CD7A 3ARUA 1U33A 3AIQA 4Z2IA 2DH2A 2ZICA 1I1WA 2VT0A 3K8MA 5A1AA 2WZEA 1YQ2A 3CUGA 3CZ8A 1JAEA 4AZ6A 4D6HA 3B9AA 2VL4A 1K9EA 2XYLA 3I3DA 3VGHA 1H5VA 3AJ7A 3AIUA 3OGRA 3AHZA 1DWGM 3M46A 5CGTA 5A6BA 4HMEA 4J3SA 5IDIA 3U57A 4PMDA 1V6VA 5GPRA 2GUYA 2XFFA 1WDRA 1JYWA 1GZJA 1PIFA 1HJUA 4Z2GA 4LYRA 1FFRA 2XSAA 3VIJA 1LQ0A 5E70A 2CHNA 3POCA 3WKZA 3MMWA 1CGYA 3VINA 1W2VA 1SMAA 5I77A 3THCA 2D2OA 4UCFA 2J7BA 2NT0A 2E40A 2DH3A 3CUHA 3WDJA 2E0PA 4C7DA 2D23A 3BLPX 3EMQA 2ZXDA 4GIAA 1UR1A 4YN5A 5C8BB 3OGSA 3MV11 4U5KA 1CXIA 1UR9A 1G1YA 4TUFA 1ZJBA 4PMVA 5EB8A 4M29A 3SCTA 2DPEA 2O9PA 1TA3B 2ZUSA 1JIBA 2WANA 2WBGA 3FY1A 1WZLA 1HKJA 1V6XA 5DFAA 4HTYA 4E8CA 4D6EA 4D72A 3A4XA 1UA3A 3S6TA 1CXFA 5ABHA 1UKTA 1W9BM 4L4PA 3RILA 4JIEA 1V02E 1BSIA 2OSWA 2FGLA 1ODZA 1EXPA 1KR1A 2XJ7A 1WE5A 1XYFA 4CD5A 4AWEA 1F4AA 3AOFA 5HXMA 1JDDA 3M6DA 5CJ5A 3WNNA 4TXEA 5IHRA 1XH0A 2ZXQA 2W61A 1XYZA 4M82A 4ACZA 1OM0A 1R8LA 4CU6A 3W26A 2G4FA 2E9MA 2A3HA 4F8XA 1HT6A 3CUJA 1VFUA 4N42A 2IXVA 2DT0A 4S3KA 3U5UA 4NRSA 1FOBA 1RP8A 3WNMA 4V27A 1V3MA 2OWWA 4QLLA 3U7VA 1PJ9A 1EHAA 3ZQ9A 3CTTA 1C92A 1UD5A 1E0VA 2D22A 3BLKA 2JEPA 4EKJA 3CZEA 4TX8A 2CETA 4FLOA 1BYDA 5ABFA 1I75A 3PZGA 2BVYA 2X1IA 1QBBA 5AYIA 3K46A 4LGXA 3ZM8A 4BQ4A 1UZ4A 3WUFA 1CDGA 5LA1A 1E43A 4FK9A 3II1A 3WD3A 1CXLA 1HN1A 3W29A 4DUVA 1OINA 4ZE4A 4X9YA 3AXIA 2DT1A 1CXEA 2WVUA 3LMYA 3MS8A 1J0YA 4UQ9A 2PBOA 3KL5A 2J7CA 3SCWA 3QOKA 3PHAA 4AMCA 3N04A 2YLLA 2X2YA 2ZX7A 3ARWA 4V28A 1V3LA 1WDSA 3POHA 4D6DA 2CKSA 2DEPA 2YOCA 3N1AA 3CPUA 1GNXA 2JIWA 1E6NA 2J79A 4GZIA 1VB9A 1O7AA 2VMFA 4Z2LA 4WSKA 1CXHA 4J28A 4HMCA 5BWFA 1OIMA 1ISZA 3NSMA 1X6NA 1GONA 1RH9A 2ZOXA 1HIZA 4D6FA 2WSKA 4LPCA 1DWFM 1UR8A 1JL8A 1HX0A 4PTMA 1G94A 2J47A 1BYAA 2VCBA 3RM4A 4TTGA 3ZIZA 2A3CA 1JZ3A 4P8XA 1E1FA 3SCQA 5I2UA 1E0WA 4PUEA 3KL0A 3VM7A 1UKOA 3LPOA 1V3KA 3AIRA 3WF4A 1CEOA 1V3JA 3L4UA 1EO7A 2BXZA 2V3FA 2ZX9A 3SUWA 2ZXBA 3DECA 4P8WA 4UR9A 3BCFA 1PAMA 4JKKA 1KR0A 1PX4A 4ZEPA 5A94A 2GJPA 2W66A 3WH7A 3UR8A 3MV01 4M8UA 4D6CA 3BGAA 5CG0A 3WD4A 3EDEA 1KB3A 1CBGA 1C7SA 1XHGA 2ZUVA 1HKIA 3WBEA 1GQLA 3OLEA 1UD4A 3VNZA 3J7HA 3WUBA 5I79A 2WW5A 2Y8VA 3EDFA 4ATDA 1F4HA 1H41A 1QW8A 1VENA 3WFLA 4B3LA 1ECEA 5IFTA 4JFTA 2YLAA 4CCCA 2EPOA 1WDQA 1YHTA 4P7OA 1E4NA 1OGBA 3VM5A 5KEZA 4J3XA 1AQ0A 1LLOA 2BY3A 3GXFA 4KH2A 3PZMA 4P7NA 1MQPA 4PN2A 5FL0A 2XIBA 3IAPA 4LX4A 3E1F1 3BH4A 5A3HA 4J27A 4AZ7A 2Q8XA 5A6AA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2WAG A;  3FW6 A;  2XVK A;  5BXP A;  4HU0 A;  4QLJ A;  2XFY A;  4UOJ A;  1NOF A;  3ARS A;  5TD4 A;  1D2K A;  1E15 A;  5JIW A;  3QGV A;  4HZ6 A;  2J7E A;  2UY3 A;  1EO5 A;  1ZBW A;  4MAD A;  1MW0 A;  3WQ5 A;  5FKY A;  2DSW A;  1B90 A;  1J10 A;  3D5H A;  1B3Y A;  1HF6 A;  2DGA A;  4P8U A;  2WXD M;  3FHQ A;  4U33 A;  1MWO A;  5BRP A;  3O9N A;  5EMY A;  3AS0 A;  3VX0 A;  4OOZ A;  4HMD A;  1B3W A;  3U5Y A;  3ZJ7 A;  5IXE A;  2YBT A;  4PMR A;  4LXF A;  1UWT A;  1X6L A;  3VIM A;  1IZK A;  4QLK A;  1V6U A;  4W84 A;  1UA7 A;  3B9E A;  3AML A;  3BAW A;  2YA1 A;  1GVI A;  1Q6G A;  1OIF A;  3T08 A;  2WMG A;  1J18 A;  3N13 A;  4Z2K A;  3ARY A;  3AFB A;  3OGV A;  4D6I A;  2PWE A;  4A3Y A;  4U2Z A;  1KXH A;  2JF7 A;  4FLS A;  1BGA A;  3WF1 A;  2A3E A;  4AD5 A;  5JBD A;  2DT3 A;  3AIE A;  1H0I A;  4LYP A;  4UFK A;  1XCX A;  2J25 A;  1GOW A;  4Q7N A;  3VTR A;  3CHE A;  3SUT A;  2XHY A;  2OWC A;  3VDH A;  3LPF A;  1CPU A;  1R87 A;  4B15 A;  1MXD A;  5GNX A;  3EDD A;  1W1V A;  3WNP A;  3NSX A;  1E6Q M;  4IIS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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