3AHZA

Crystal structure of beta-glucosidase from termite neotermes koshunensis in complex with tris
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
TVYTFPDEFKLGAATASYQIEGAWDENGKGPNIWDTLTHEHPDYVVDGATGDIADDSYHLYKEDVKILKELGAQVYRFSISWARVLPEGHDNIVNQDGIDYYNNLINELLANGIEPMVTMYHWDLPQALQDLGGWPNLVLAKYSENYARVLFKNFGDRVKLWLTFNEPLTFMDGYASEIGMAPSINTPGIGDYLAAHTVIHAHARIYHLYDQEFRAEQGGKVGISLNINWCEPATNSAEDRASCENYQQFNLGLYAHPIFTEEGDYPAVLKDRVSRNSADEGYTDSRLPQFTAEEVEYIRGTHDFLGINFYTALLGKSGVEGYEPSRYRDSGVILTQDAAWPISASSWLKVVPWGFRKELNWIKNEYNNPPVFITENGFSDYGGLNDTGRVHYYTEHLKEMLKAIHEDGVNVIGYTAWSLMDNFEWLRGYSEKFGIYAVDFEDPARPRIPKESAKVLAEIMNTRKIPERFRD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural and functional analysis of three beta-glucosidases from bacterium Clostridium cellulovorans, fungus Trichoderma reesei and termite Neotermes koshunensis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Neotermes koshunensis
total genus 196
structure length 472
sequence length 472
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ahzA00
1HJWA 2XWDA 2IXUA 4Z2HA 2CNCA 3VGHA 3VU2A 1V3JA 2WLYA 5A8OA 4CCCA 2EPMX 4UQDA 4CVUA 4M8UA 3NDZA 1H3GA 4AY1A 5A6SA 1CEOA 3WUFA 1EHAA 3BLKA 3VDCA 4OZOA 2CBJA 2WHMA 3SIMA 4QCFA 4R5EA 1UKTA 4F66A 3F5KA 3LPFA 4UFMA 2WZEA 3A4WA 5JIWA 1RH9A 1JD9A 1U30A 2V5CA 1UWRA 2XVLA 1QNSA 1UYQA 3T09A 4ATWA 1C7TA 2Z1SA 1W32A 3AHXA 1KCLA 4JFTA 4CN4A 3VM5A 4PMXA 1V6YA 1QW9A 5EBAA 1BG9A 1CGTA 3VD4A 2VX4A 1JF6A 2Y24A 3OGRA 1DEDA 3WEZA 2FHFA 4NZCA 3S6TA 1EGZA 4GZEA 1AQHA 3J7HA 1EXPA 1Y7VA 1Q6CA 2VMFA 4PSPA 4UFJA 1ZBWA 1CWYA 4ACZB 2O9RA 3CLWA 3VINA 5A3HA 4HP5A 3CBWA 1ECEA 2QV4A 3EBVA 1OCQA 4ACZA 1XH1A 2J77A 1DWJM 1R7OA 2JE8A 2DIJA 1RPKA 5CQ1A 4FLSA 5GNZA 3TTSA 1OD0A 3VIMA 4BQ3A 1K9EA 2EPNA 3AHTA 3WH8A 2J4GA 3CHFA 3NSMA 3VDBA 1US2A 4H2CA 4UQ9A 5A1AA 2V5DA 4UFIA 3PTQA 4ZFMA 1C92A 4KH2A 2OYKA 1KQZA 7TAAA 1OT1A 1KXQA 1UKSA 1DTUA 4D1IA 3L4UA 3DHPA 4E8DA 1CXIA 4UZUA 2PC8A 1C93A 2J7BA 1YHTA 4OJYA 2GJXB 1FH7A 1E71M 1HL8A 1TA3A 4TVUA 1LWHA 1EDGA 1DWIM 2GJXA 5BCAA 2EPLX 2UY4A 2Y4SA 3AIEA 3WENA 1UQYA 1CGUA 1TZ7A 4LGXA 2WXDM 1W9UA 5DFAA 1QI2A 3AIUA 3KL0A 2C8NA 4F9JA 1QW8A 1M01A 4DUVA 4EKJA 3POHA 1PJ9A 1JDDA 2VVNA 3KL5A 2UWFA 4J28A 1WP6A 4D6CA 1VRXA 2AMGA 5I77A 3ZMRA 1JI2A 1VB9A 1UD2A 4HOWA 1SYTA 2XTKA 1KBKA 4D6FA 2OSWA 1KWKA 2ZX9A 5GPRA 3RM4A 1VFOA 2VNCA 3PZNA 1UR9A 4DM2A 4XZWA 3FN9A 5A6BD 1M04A 1CTNA 4TVDA 2WMHA 5EFFA 3ZJKA 3A4AA 4M81A 3VGFA 1G5AA 3VUPA 3N17A 2VT0A 1HJUA 1MW0A 2CKSA 2G3IA 3IK2A 4OIFA 1IZJA 4X9YA 3VD5A 1MQPA 3CZEA 5FOOA 2ZUSA 4HZ7A 2JALA 5CLTA 5FL0A 4QCEA 2D3NA 4BQ2A 3SURA 3WH5A 1WZMA 1XYZA 1GPFA 3SEPA 1CBGA 1Q4NX 5LYRA 1UR4A 5A6AA 2VZVA 2CKRA 3BXWA 3DYMA 3CUFA 1K9TA 2PWDA 4GO9A 1CXFA 5A6LA 3LPPA 2FDMA 2WKGA 3M07A 2DH3A 3WNKA 4KMQA 1K9DA 3N13A 2YL8A 3VDAA 1FHDA 1VEMA 2YLLA 2OSXA 4AZ5A 1JZ6A 3AMDA 3T0AA 3K8LA 4H41A 5FL1A 3WIJA 1WO2A 4ZE5A 1UWUA 3ZOAA 8A3HA 5I5RA 4PSRA 4GQQA 3VIPA 3VTRA 1E6RA 5A95A 3VMOA 5M5DA 3WH9A 3AMLA 4UNIA 2D0GA 4YPJA 2WSPA 3GTNA 3UG4A 3L4ZA 1QOXA 1H11A 5I0DA 1PX3A 1TUXA 3MS8A 2WMJA 4QLJA 1EOKA 4AEEA 1ITXA 3FXYA 3QHOA 3WF4A 4D6JA 3PZGA 2UY3A 1BFNA 1GQLA 1W2PA 2JIEA 5D8WA 4GXPA 3A47A 3CZLA 3GNRA 4P7LA 4FLQA 4TXEA 4UOZA 1W2VA 1OBAA 3WSUA 3GXDA 3GM8A 4DWSD 3BAIA 2Z1KA 1BVNP 1TVNA 3WDRA 3W82A 1JL8A 3RDKA 2G4FA 3EMCA 3WQ4A 3BSGA 2QMKA 3M7SA 2D1ZA 2XM1A 1GOMA 3WUGA 1GOKA 1UKQA 4D6EA 4W85A 4AD4A 4UR9A 1SMDA 2F8QA 2W62A 2YJQA 2BHUA 1JZ8A 1EDQA 3BAYA 4J3UA 5IXEA 5CXPA 3TTYA 1UWQA 1E6SM 1X1NA 2WMFA 3NYDA 1GVIA 3KZSA 1YQ2A 2WMIB 3SUUA 3I3BA 2DSZA 1NH6A 2CBUA 3K4DA 1VIWA 2VQTA 4GO8A 5IFPA 1WE5A 1W9VA 3BSHA 2WMIA 5I6SA 4CU7A 3WNLA 4HOXA 3FNDA 2HVMA 1VEOA 1LQ0A 4PBGA 3MO4A 4U3AA 1VBUA 1BYBA 1GOIA 2ZX7A 3WQVA 3WQ8A 1OGBA 5A6MA 3OLIA 2J74A 2VRQA 1WAWA 1GOWA 3AYSA 2ZUWA 3CTTA 4MB4A 2YBUA 4PMDA 2BNJA 4CD4A 1JG9A 3AXXA 1V3HA 1JNEA 5D9PA 1B3YA 1HXJA 3CUGA 3VX0A 3MKKA 5HNNA 2CETA 4UFHA 2VL4A 1ZBCA 3T2PA 2JFEX 3UERA 5A8PA 5A69A 4XZBA 2ZXQA 2XFYA 5HXMA 3W6MA 5JBFA 1TCMA 2CCRA 3WELA 4HTYA 1ZJAA 4ATDA 3ZT7A 3BLPX 5C70A 2PB1A 3MANA 1G94A 4CD6A 4CCDA 4GQRA 6CGTA 1CXLA 3KWXA 3KE0A 4L4OA 2V3GA 1G0CA 1FP9A 4QFUA 4CD8A 3GNOA 4K68A 3PZUA 3O9NA 2WK2A 1B3XA 5HPCA 1K9FA 3ZJ8A 4HMEA 2WWDA 4WK9A 4HA3A 1QI5A 2VURA 4MNMA 3WH6A 1ODZA 2VCBA 1E4IA 3EDFA 1WDQA 3THDA 1OGSA 1KXTA 3CZKA 4FF5A 1Q6EA 1BYCA 1R7AA 1V6VA 3OZOA 3WBEA 4PTVA 4GIAA 5HBFA 4NRSA 1CENA 4ZEPA 1FFRA 1H2JA 3T2QA 4WSKA 5LA1A 4D1JA 1FA2A 4TVCA 2J7CA 3VIOA 1VJSA 2XYLA 1BLIA 4UZSA 1UH2A 3WN6A 2C7FA 4B9ZA 5BRPA 4BS0A 2WAGA 2YA0A 3VDHA 3UEQA 1E6PA 5CG0A 2WM0A 1CYGA 4PN2A 2B31A 1J0KA 1JAKA 1ISYA 1QNRA 2W4XA 2WWCA 1DP0A 2DEPA 3GH5A 4TX6A 3OGVA 4LPCA 1EIBA 4J3TA 2BFGA 4PMYA 3SCVA 3VNZA 1MW2A 2CBIA 2WCSA 2UY5A 2DQXA 3NUKA 3CHCA 1PBGA 2BVTA 4OOZA 4C7FA 3EDEA 2VX6A 5F7UA 3ECQA 1JYWA 5M3WA 1TVPA 1H0GA 2ZUTA 1VEPA 1DWGM 1NOFA 1UR2A 3RO8A 5FIPA 4J27A 4AMCA 4ACYA 1O6IA 2WMKA 1WCGA 4QLLA 1B3WA 3MU7A 1XRVA 3UG5A 2QLYA 4GI6A 3ARZA 3AYRA 1Q6FA 1AVAA 4X0VA 3AMCA 5CZKA 4FK9A 1NWRA 4B3KA 4DWSC 1HJXA 5A6KA 4N42A 2CIPA 4AZGA 1G1YA 2XJ7A 1QVBA 5FCZA 3L4XA 1LLOA 1VENA 3WF0A 3PZ9A 4PUDA 3MV01 4Z2JA 3VM7A 2WVVA 4AZBA 2DSWA 4NRRA 3CUHA 3PZTA 2XIIA 1W1YA 4TX8A 3VIFA 3VD7A 1GUVA 1CXHA 1NWTA 2ZWZA 3AZTA 1V0KA 1UWTA 3EDKA 2EO7A 5CGMA 2ZUUA 1C7SA 4OUEA 1KXHA 3N04A 4C7GA 2BS9A 1W3LA 2BV9A 1JYVA 2TAAA 3DHUA 5DO8A 5ABEA 1LJYA 2D0HA 4TTGA 1SFSA 1E6ZA 2GDUA 1AQ0A 2X05A 4EANA 3MUAA 3B9AA 4UFLA 4Z2KA 3SUSA 4B15A 1TE1A 4AIEA 3WDJA 1CLVA 5M17A 2D20A 4JL2A 3VGEA 4AYSA 1XHGA 1CIUA 2ZUVA 2JEQA 3BMVA 4MDOA 1IZKA 3BCDA 1BSIA 2J25A 2D2OA 1ITCA 3AS1A 2A3HA 4AW7A 8CGTA 1ZS2A 3NSXA 2MANA 1UKPA 4MNKA 4KWUA 1V3IA 2GDVA 3BCFA 3THCA 1V02E 2PWFA 3VMPA 3WMBA 1NARA 3NIYA 2ZX5A 5C8BB 6A3HA 2CPUA 3OGSA 3WF1A 2FGZA 2J79A 1CDGA 3ZO9A 4AEFA 3W38A 3VIGA 1UD8A 1CGYA 2WANA 4ZXLA 4AZIA 3ALFA 3SUVA 1VJZA 1QHZA 2ZIDA 1J0YA 3VILA 1B30A 1JZ2A 3ARYA 2WZIA 1JZ5A 1NM9A 3GDBA 5GQBA 3WD1A 4W88A 4W7VA 4URIA 1V6UA 4GI8A 1XH0A 2J7HA 2J8GA 4W5UA 1UG6A 4AIOA 4P7OA 1PAMA 3VIIA 2VO5A 2J62A 1C8YA 1CNVA 3VIHA 3WDHA 3AOFA 4F79A 2VOTA 1B2YA 2QHAA 2G3MA 1BHGA 2VUYA 4U2YA 3VMNA 1QHPA 1UQZA 3MUZ1 3WL0A 4QP0A 2WHKA 1KGUA 1XC6A 4OBRA 4AD2A 3NJ3A 4PTMA 4C7DA 3CZJA 4CD7A 1QNQA 1MQRA 1XYFA 2JF6A 1TA3B 4P8VA 3WDPP 2X09A 2BHZA 1TG7A 1AQMA 1UR8A 4CN6A 2YLAA 2XWEA 1JZ3A 2YL6A 3BH4A 4GKLA 4HOZA 4DM1A 1M7XA 1V02A 3GBDA 3GBEA 5AC5A 2XPKA 3BGAA 4QAWA 4FLOA 3F4VA 4W8LA 1JGIA 5A8NA 3UG3A 3T08A 1H4PA 2ZUMA 4AZ7A 3ARRA 1ODUA 2NT0A 3PTMA 1F4HA 1HJVA 1D2KA 1UWIA 2YL5A 5A6BA 2W61A 3ARSA 3IJ9A 4Z2LA 2V38A 1HP4A 3UESA 4RL3A 3CUJA 5DMYA 1KR1A 5ABHA 4BZYA 3W24A 5GNXA 3CIVA 4M24A 4IPLA 1WB0A 2VCAA 1RP8A 2DT3A 2W92A 4PEEA 1WDPA 2CXGA 5I2UA 2BY0A 3RM8A 2WCGA 3CHDA 1HT6A 5E70A 1C90A 1HKKA 3OG2A 1LG1A 4PTWA 2YIHA 4FLRA 1A47A 3RJYA 3WMSA 1JZ7A 4AZCB 3K8MA 3AZRA 4AC1X 1J12A 3L4YA 4JFSA 3PN8A 1XSJA 4WIWA 2PWEA 6TAAA 4U2ZA 1IT0A 1JF5A 2J7GA 2Y8VA 4AZCA 1VFFA 1HP5A 3CUIA 1H1NA 1J10A 3F5JA 1MFVA 1RD6A 1DHKA 1WZKA 3PZVA 1B1YA 1SMAA 4NF7A 4ATLA 3ZQ9A 4MB1A 1L0PA 1JD7A 2XG9A 1BQCA 2WBGA 4MJ2A 5DF0A 3WF3A 1U33A 2WPGA 1E73M 1J0ZA 2WYSA 1P6WA 1GW1A 1GQKA 1QHOA 2EBNA 4JFUA 3TTOA 3ARWA 4EK7A 2A3AA 4HA4A 5CJ5A 1DWHM 4L4PA 2J47A 2FHCA 3W25A 2CYGA 1E43A 3PZIA 4AISA 1GHSA 1LL4A 4J7RA 1FH8A 3UCQA 4X0NA 3WKZA 5KZ6A 2VQUA 2PF0A 2EXOA 3VX1A 2OWWA 4E4PA 2DT1A 3A4XA 1JFXA 5JBEA 1BVZA 3AXHA 3BAKA 2WZHA 4WKFA 3WUBA 4IPNB 3UR7A 2UY2A 3QGVA 5CPTA 4DWSA 1U2YA 3IJ8A 3PZOA 5I23A 1ISVA 3E1F1 1CGVA 3ZJ6A 4KGJA 1E0WA 3VD9A 1I1WA 3QR3A 4LX4A 1H41A 1WKYA 2EQDA 4CKQA 4IM4A 1V0MA 2J7DA 2CHNA 1DWFM 3AISA 4QDMA 5GNYA 4HPHA 4U33A 4HMCA 1KCKA 3PBGA 2VZOA 1W9XA 5JUVA 5BXRA 4JIEA 3FY1A 3WD3A 3SCQA 1UHVA 3QHMA 5M03A 4AXNA 1GQIA 1TFVA 4H7VA 2WSKA 1CPUA 3VD3A 1G9HA 1I75A 1HIZA 1B3ZA 1ZB5A 1WZAA 1WNOA 1HVQA 4GZIA 3LPGA 5BWFA 4LXFA 2WBKA 5I3DA 2FH8A 3NDYA 2CEQA 1VFUA 4CVWA 2VR4A 1TR1A 3FAXA 3AZSA 3HMCA 3AHZA 3ZR6A 1HX0A 4RE4A 2HISA 1UR1A 4M1RA 4CCEA 3WD0A 5CSYA 3WBAA 1BGGA 2JIWA 4GINA 1FFQA 1UD4A 3WL1A 1V08A 4W86A 2YKKA 4U5IA 1EQPA 5CPSA 3WEOA 3U57A 5D9MA 3VKKA 4MAVA 5BXPA 4MTVA 5LA2A 3AHYA 5I24A 1EOMA 3K4AA 3AMKA 4PMOA 3VIKA 5EB8A 1CLXA 1HJQA 3WY1A 2FGLA 4UCFA 4P8WA 3OB8A 3G6LA 3WNPA 1US3A 4GI9A 1VAHA 3FW6A 2VRKA 3WDIA 1E5JA 5A2CA 1J0HA 4RE2A 4ZXOA 4W5ZA 1C3FA 5DT7A 4JAWA 4HPGA 3PTKA 3VGBA 1QPKA 1WDRA 2V3EA 4AD3A 1JFHA 1F4AA 3TA9A 3K46A 4J3WA 3W27A 3GNPA 2DDXA 1HF6A 4GZJA 3ZSSA 2GJPA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HJW A;  2XWD A;  2IXU A;  4Z2H A;  2CNC A;  3VGH A;  3VU2 A;  1V3J A;  2WLY A;  5A8O A;  4CCC A;  2EPM X;  4UQD A;  4CVU A;  4M8U A;  3NDZ A;  1H3G A;  4AY1 A;  5A6S A;  1CEO A;  3WUF A;  1EHA A;  3BLK A;  3VDC A;  4OZO A;  2CBJ A;  2WHM A;  3SIM A;  4QCF A;  4R5E A;  1UKT A;  4F66 A;  3F5K A;  3LPF A;  4UFM A;  2WZE A;  3A4W A;  5JIW A;  1RH9 A;  1JD9 A;  1U30 A;  2V5C A;  1UWR A;  2XVL A;  1QNS A;  1UYQ A;  3T09 A;  4ATW A;  1C7T A;  2Z1S A;  1W32 A;  3AHX A;  1KCL A;  4JFT A;  4CN4 A;  3VM5 A;  4PMX A;  1V6Y A;  1QW9 A;  5EBA A;  1BG9 A;  1CGT A;  3VD4 A;  2VX4 A;  1JF6 A;  2Y24 A;  3OGR A;  1DED A;  3WEZ A;  2FHF A;  4NZC A;  3S6T A;  1EGZ A;  4GZE A;  1AQH A;  3J7H A;  1EXP A;  1Y7V A;  1Q6C A;  2VMF A;  4PSP A;  4UFJ A;  1ZBW A;  1CWY A;  4ACZ B;  2O9R A;  3CLW A;  3VIN A;  5A3H A;  4HP5 A;  3CBW A;  1ECE A;  2QV4 A;  3EBV A;  1OCQ A;  4ACZ A;  1XH1 A;  2J77 A;  1DWJ M;  1R7O A;  2JE8 A;  2DIJ A;  1RPK A;  5CQ1 A;  4FLS A;  5GNZ A;  3TTS A;  1OD0 A;  3VIM A;  4BQ3 A;  1K9E A;  2EPN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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