3AHZA

Crystal structure of beta-glucosidase from termite neotermes koshunensis in complex with tris
Total Genus 196
50100150200250300350400450050100150200
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
TVYTFPDEFKLGAATASYQIEGAWDENGKGPNIWDTLTHEHPDYVVDGATGDIADDSYHLYKEDVKILKELGAQVYRFSISWARVLPEGHDNIVNQDGIDYYNNLINELLANGIEPMVTMYHWDLPQALQDLGGWPNLVLAKYSENYARVLFKNFGDRVKLWLTFNEPLTFMDGYASEIGMAPSINTPGIGDYLAAHTVIHAHARIYHLYDQEFRAEQGGKVGISLNINWCEPATNSAEDRASCENYQQFNLGLYAHPIFTEEGDYPAVLKDRVSRNSADEGYTDSRLPQFTAEEVEYIRGTHDFLGINFYTALLGKSGVEGYEPSRYRDSGVILTQDAAWPISASSWLKVVPWGFRKELNWIKNEYNNPPVFITENGFSDYGGLNDTGRVHYYTEHLKEMLKAIHEDGVNVIGYTAWSLMDNFEWLRGYSEKFGIYAVDFEDPARPRIPKESAKVLAEIMNTRKIPERFRD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Neotermes koshunensis
publication title Structural and functional analysis of three beta-glucosidases from bacterium Clostridium cellulovorans, fungus Trichoderma reesei and termite Neotermes koshunensis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
total genus 196
structure length 472
sequence length 472
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ahzA00
2QPUA 3M7SA 3MV11 5I0DA 2ZWYA 2O9RA 4MPKA 5CPSA 1LF1A 4GZEA 1J0KA 1IZJA 3WDQA 1E4NA 1WO2A 3BAIA 2W67A 1V3KA 2WMGA 3I3BA 1C8XA 1UR9A 3QHNA 5I24A 4P7RA 5A94A 4N42A 3N9KA 6CGTA 3CUGA 2XWEA 4PYSA 1CIUA 1UD2A 4HA4A 2D3NA 3JUGA 3GNRA 4AY1A 4CUCA 1MW1A 1JYWA 2WMIB 4ZENA 3O2LA 2E8ZA 2ZX6A 1W3LA 4PMYA 1GVYA 3WUBA 1E9LA 2YL8A 2WSPA 1XSKA 1E0VA 2DT3A 3K8LA 4J7RA 1W1PA 2YBUA 3AIUA 1UKQA 1UR4A 3RO8A 2ZUWA 3AHYA 3GH4A 4MAZA 4HU8A 4UTFA 5JBFA 2VQTA 3ARSA 3WF2A 4CD5A 1RPKA 1UH2A 2PBOA 2VX7A 1B3VA 4HOXA 2YIHA 3MMDA 1VB9A 3SCOA 3AS0A 1C8QA 3CBWA 1CYGA 3I3EA 1Q6EA 1LQ0A 4WF7A 3TOPA 3WF3A 1UG6A 3NIYA 2QF8A 1CGWA 3PZOA 3VIOA 2BY0A 2J7CA 3BSGA 1CXLA 1B0IA 1JYNA 1NWSA 3AHTA 3CZ8A 2EBNA 3WH9A 3AIEA 2ZUTA 4PMXA 4GXPA 4X9YA 1V6UA 4QLKA 4PMOA 4FLRA 5FKYA 3VGBA 1JZ2A 5DMYA 1FFQA 4UQ9A 3TTYA 2AOSA 2J7GA 3A4WA 5C70A 1OWQA 3M46A 1CXKA 4GIAA 4B9ZA 4CN1A 3ZJKA 1Q6FA 4MNKA 1UR0A 4MB3A 4CU8A 4ZE5A 1UR1A 1GOKA 1W9XA 3IJ9A 5TD4A 5JIPA 2XFRA 3IJ7A 2JEPA 4UOQA 3T2QA 5JBDA 4M29A 2EJ1A 1UYQA 3FN9A 3J7HA 1W9VA 4JAWA 2EPKX 1E3XA 2ZXQA 5M03A 1HVQA 2D2OA 1HNYA 4W5ZA 3BCFA 3KEHA 1CENA 1WE5A 3OIHA 3QHMA 4C7FA 3WELA 1IZKA 1PX8A 2JF7A 3WIJA 4TTGA 1VBRA 1KWKA 4X0VA 4WKAA 4XX6A 3W82A 4UQAA 4DWSD 4J3WA 2TAAA 5ABEA 2YDRA 4ZEPA 1GJUA 4FLQA 2YJQA 1PEZA 1J12A 2PC8A 1PIGA 1UHVA 3F4VA 1RH9A 5A6LA 1E4MM 3OGVA 4M81A 3WQVA 4AISA 4M80A 4GKLA 4V27A 4OUEA 1PBGA 4W7VA 1JZ6A 4PTVA 2A3HA 2WCAA 4U3AA 1H41A 2VR5A 3T0DA 1LL6A 4W7UA 1UOKA 3FAWA 2UY4A 4DUVA 1V0NA 5CJ5A 3U5UA 2XIIA 3QR3A 3WL1A 2MANA 3O6AA 1U30A 3AMKA 4HMEA 3W28A 3CZEA 2W91A 3EDKA 1US3A 4AIUA 5HNNA 3OBAA 4CD4A 3W25A 4F66A 4CGTA 3DHUA 1CXHA 4AXNA 4CD7A 4GI6A 3QOKA 2BNJA 2J7DA 3VKKA 4MJ2A 4YHEA 1EO5A 2QMJA 4LQ1A 2CHOA 5A6MA 1JNDA 2WZHA 3VNZA 1X1NA 1MW0A 4R27A 1V0KA 2FHBA 1BPLB 4PTMA 1L8NA 5CGTA 2DH2A 4TX8A 1JDAA 2DT1A 3WENA 3L2LA 1FHDA 2VTFA 3FHAA 5BXPA 2J62A 2GJPA 2JF6A 2ZIDA 4PMNA 2UY3A 5BROA 4TVUA 2GVYA 3PZIA 1XCXA 1R87A 1PAMA 1JD9A 1B30A 2J77A 2VO5A 4UFMA 1EA9C 3AIVA 2E40A 2B31A 4V2XA 1WPCA 3THDA 1Q6DA 1TCMA 1SR0A 1V03A 2XVNA 1BQCA 2FDMA 2ZOXA 5D8ZA 2CCRA 1XD0A 1TUXA 3AIRA 2OYKA 5IHSA 1LG1A 1J9YA 1OINA 2Y4SA 2D24A 4H04A 3AICA 4P8UA 3VGHA 5EMYA 1EHAA 1JI2A 1HL8A 3N11A 5GPRA 5BRPA 1DWFM 5IDIA 5CLTA 3SUVA 1OIFA 1CZ1A 4UFKA 1E73M 1QHPA 4W5UA 3T09A 1V08A 4J3TA 3WD1A 4MAVA 2YL9A 3ZJ7A 1BLIA 1WZKA 1UD4A 3LMYA 3VMPA 2FH8A 2ZX7A 4A3HA 5DO8A 2OLHA 2ZE0A 4E8DA 2CETA 1H5VA 3GXFA 3RMEA 1HKJA 1PZ2A 1JDDA 3PZTA 3W6LA 4UR9A 2PWEA 3WDRA 1WCGA 4WSJA 3WD4A 3S6TA 1J18A 3WUGA 3UEQA 5BRQA 3AXIA 5CXPA 1OD8A 3TONA 4CVWA 3WFZA 2PI6A 4P8WA 4MB5A 2VRJA 3PN8A 1ZB5A 2XM1A 1E0XA 3WNNA 6TAAA 1E70M 4LYQA 1HJUA 4JFUA 1QI0A 2XSAA 3F5JA 1ZJAA 5EFDA 5HPCA 2VJXA 3ARWA 1HN1A 3BSHA 2XFYA 4AZIA 1W2PA 7CGTA 3WNKA 2DSWA 2JE8A 1CLVA 4EE9A 4PSPA 1NM9A 3L4ZA 3L4WA 3WH6A 3PBGA 1LWHA 1CEOA 4GO8A 2O9PA 2J47A 4JL2A 3E1F1 3N13A 3W37A 1W1YA 4Y7EA 3UG4A 1EIBA 1JXJA 3CH9A 4JZ5A 3WNOA 1PIFA 2WW5A 4D6EA 3VGFA 4Z2LA 1AMYA 2XVKA 2EPNA 1FP9A 2GUYA 4CD6A 4U5KA 4AD3A 1R8LA 4WIWA 3AHVA 3CHFA 4AIOA 1RP8A 1VEPA 3BLKA 1CECA 1R7AA 1GJWA 1J0JA 1CGUA 4HZ6A 5A8MA 1XGZA 3II1A 1BGAA 1E6XM 2UY2A 2JIEA 3AFBA 1E6PA 1XC6A 3L4TA 1G01A 1OBAA 4A4AA 3WUEA 2G4FA 3VDCA 2YA1A 5A6AA 1WAWA 1RD6A 3NSXA 4QLLA 3K4DA 1G94A 3VIIA 1BVZA 1AQMA 3CO4A 2GDVA 4QDMA 1HJSA 3AIBA 2ZUSA 2XG9A 5F7UA 4B15A 2VURA 4FLOA 3N15A 3OB8A 3GXMA 1UQZA 4W8BA 1OCQA 1ZBKA 3WBEA 2J8GA 1HT6A 4NRSA 1G0CA 4W89A 2VR4A 2E9MA 3MV01 3B8SA 1WZLA 4KH2A 4N0RA 1VIWA 4WKFA 4MJ4A 3WQWA 1HJXA 1UR8A 1G9HA 1IT0A 1H2JA 2J7EA 1ZS2A 1M03A 3UETA 4PMUA 5HXMA 4H8UA 2JALA 5DT5A 5A3HA 3EBVA 3ZR5A 2Y24A 3WKZA 3SEPA 1DP0A 1V3HA 2NT0A 1WKYA 2GK1A 3A3HA 1JZ8A 4AZHA 1PJ9A 3CZKA 3AQUA 2D3LA 4S3JA 2ZXAA 1BVNP 2DEPA 4V28A 1M04A 2WWDA 4NF7A 1NOUA 1UD6A 1J0YA 1WB0A 1W9BM 2PF0A 1B31A 1OT2A 1BTCA 4XUYA 3LPPA 2WANA 3BXWA 4D6FA 1W3JA 3ARTA 4AD2A 3AS1A 1K9EA 3BCDA 2VZUA 1E72M 4OZOA 2XM2A 1Q6CA 3GH5A 5A2CA 4UFLA 3DHPA 3F5KA 3CZGA 1AVAA 2EEXA 5HOSA 3VGDA 3B9EA 3EMZA 2HVMA 4GZIA 4ACYA 2PWHA 1FH7A 1MXDA 2E9BA 1S46A 2W92A 1D2KA 3UG3A 3WF4A 3ALGA 5A6SA 1N82A 3AIWA 3FHQA 4PSRA 3T2PA 4C7GA 1UR2A 2YDSA 4UQBA 2XJ7A 4CN6A 1SFSA 2F2HA 2PWDA 1BF2A 1VJZA 1UKSA 2YBTA 3MUAA 4M56A 4MNLA 5EB8A 1KR1A 1FP8A 1C7SA 3L4UA 3SCVA 3WQ4A 3ZJ6A 5KZ6A 7A3HA 2ZX8A 2BY1A 1NP2A 3ARUA 1CXIA 1JF5A 1B3YA 2OSXA 5E6YA 3VINA 3K8MA 1OIMA 3BC9A 1FOBA 1GONA 4WJXA 3WDJA 4P8XA 4CCDA 4F9DA 3GBDA 2X0HA 4AYSA 4UOZA 2Y5EA 4GZJA 2Y8KA 1DWHM 1B3XA 2OWCA 1TG7A 2VX4A 4PMVA 2YL5A 2J8FA 4AEEA 3GDBA 1EOMA 1C90A 3HU7A 1QNOA 3KWXA 3PZQA 3B9AA 1OD0A 1QOXA 4BF7A 1KXTA 4GPNA 1V3JA 3N18A 1EXPA 4L4PA 1OGGA 2ZUUA 2WBGA 4QCFA 3NUKA 3NDZA 4H41A 3L4XA 5CGMA 1GQLA 5ABFB 1L0PA 3GH7A 1C3FA 3UR7A 1M7XA 1MW2A 2VZVA 2BV9A 1IV8A 4PBGA 5FCZA 2XVLA 3IAQA 4YN5A 2XIBA 2A3EA 5A6BA 3MS8A 3VGEA 2XUCA 3ZMRA 3QHOA 1J11A 2WKGA 1J01A 1RP9A 1LL4A 1ISZA 1QPKA 2D0GA 2A3AA 5ABGA 4BZYA 3NSNA 4H8VA 5I6SA 4LYPA 8CGTA 2OWWA 2W5FA 1ISWA 3BAJA 1TR1A 4FK9A 1LJYA 4E2OA 5A8QA 1E56A 3MU7A 3TTSA 1ISVA 2X1IA 2NT1A 4FF5A 4JFSA 4YPJA 2Q8XA 4UQCA 4ATDA 2GK1B 5A69A 2WAGA 2WXDM 4ACZA 1BFNA 5CPQA 2WBKA 4AD5A 3ARYA 3EDDA 2VI0A 4M8UA 4XB3A 1GQJA 4JIEA 3CTTA 4HU0A 3VDAA 1JL8A 2WZEA 1K9DA 1W91A 4J3SA 6A3HA 1I1WA 1CTNA 1BYDA 2OYLA 3WH8A 1MFUA 1LG2A 4C7DA 5ABHA 4AZGA 4MNJA 2W66A 2YKKA 3SCRA 3PZGA 1QW8A 4GI9A 1FH8A 1H0GA 2Y2WA 1V6WA 2WSKA 4RL3A 4QFUA 2WHLA 4JFVA 3IAPA 3ZT5A 2NW0A 4QAWA 1CGYA 5CSUA 3BLPX 4J28A 1FFRA 2X0YA 4UOJA 1E15A 2WB5A 1ISYA 3G6MA 4JKLA 1GZJA 2WLYA 4WSKA 2X2YA 4AC1X 1X6LA 4RE4A 1ZJBA 4D6JA 3VMNA 3WD2A 4JHZA 1TA3A 3CHEA 3WF1A 1NWUA 3U7VA 2WNWA 1MQRA 2WYSA 4OBRA 4CU7A 3UG5A 4PUEA 4D1IA 1EQPA 1GVIA 2CITA 2DPEA 1V02E 4HOWA 3WUFA 3PZMA 2YLLA 2WMJA 4AD4A 3PZNA 1NOWA 3S2CA 4IUGA 3N04A 2YL6A 5E9AA 1VJSA 3ZM8A 2VL4A 1E43A 3I3DA 3VILA 1OSEA 1JZ5A 5CPTA 3VD3A 5CSYA 2Z1SA 1NWTA 2OSWA 1B2YA 1GOMA 3VPLA 4AD0A 5A8OA 1JZ4A 1OGBA 5E0FA 4EAMA 2E3ZA 2XVGA 2BXZA 2V5CA 2UWFA 3PHAA 1KCKA 2D0HA 1H49A 4PCSA 5DFAA 3VM5A 1M01A 2E0PA 3WEMA 5AYIA 1W32A 2E9LA 4B16A 1H09A 4WK9A 1LWJA 3WMCA 2IXVA 2JEQA 3AMDA 1SYTA 1DWGM 3DYPA 3OGSA 3UCQA 3QGVA 1KXQA 1VRXA 1BAGA 5M3WA 2FHFA 2VOTA 1BGGA 1CWYA 2YA0A 5HBFA 4JKMA 3W29A 4KGLA 1V6VA 2VZSA 2J78A 2JFEX 5BCAA 1TFVA 3CHCA 1PPIA 4A3YA 4U2YA 4B3LA 1R85A 3POCA 1UZ1A 3AMGA 3OLEA 3VUPA 1DTUA 2VCAA 5IFPA 3VIHA 1MVYA 1CGXA 2J7FA 1ODZA 4LXFA 2DGAA 2EQDA 4E8CA 1KGWA 2QV4A 1VFMA 1M53A 1JG9A 3EDEA 1BYCA 3TTOA 1C92A 1FHLA 3SUTA 1E5NA 1PX3A 3ZSTA 2E8YA 4EANA 1MW3A 1E4IA 1NH6A 4ACZB 4HZ8A 3EDFA 5FOOA 1UA3A 5AC5A 3AZRA 1UWIA 2O9TA 4TXEA 3WD3A 3SCQA 3MO4A 3DYMA 5GNYA 1BSIA 1XH0A 1V3IA 1KWGA 4EKJA 1W9PA 2D1ZA 2WHJA 4DUXA 4TUFA 3K1DA 1GOWA 2EPMX 2CNCA 4Z2HA 3B9DA 3U7BA 1XH1A 3WMSA 4JCLA 3FXYA 1GCYA 1ZBWA 3W0KA 4D6CA 5I3DA 1GPFA 3TA9A 4X0NA 4AZCA 3PZUA 5LA2A 1KB3A 2VMFA 2WVSA 5E6ZA 3SUWA 2EO7A 3ZSSA 3WDHA 4JFWA 2OSYA 3BAKA 2G3NA 4MDOA 1QNSA 3MMWA 4W88A 1VFOA 2J79A 3TTQA 2IXUA 5CG0A 1EDQA 5FL1A 4M1RA 3VNYA 4TOQA 5HDRA 2FGZA 4GI8A 4F8XA 1WZAA 1E3ZA 1UWRA 4XZWA 1ODUA 3AI0A 5BYWA 1TA3B 4TTUA 2J74A 2C0HA 4PRWA 2A3CA 3ECQA 3UESA 3BMVA 1CNVA 1XD1A 1H11A 2GJXB 4HPHA 2DIJA 1JXKA 3N12A 1NARA 2FH6A 2J4GA 1CDGA 1NQ6A 3MSGA 2YOCA 4KRUA 1HL9A 1DWAM 5E70A 5ABFA 4HP5A 4Q7NA 1C7TA 1H0IA 4QP0A 4UZUA 3KE0A 2JIWA 3FAXA 2YA2A 2UY5A 5FIPA 2WVUA 2Z1KA 3VD4A 4CN4A 2BVDA 1H3GA 4ATWA 2EXOA 5IHRA 4AZBA 2QPSA 5AYBA 2QMKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2QPU A;  3M7S A;  3MV1 1;  5I0D A;  2ZWY A;  2O9R A;  4MPK A;  5CPS A;  1LF1 A;  4GZE A;  1J0K A;  1IZJ A;  3WDQ A;  1E4N A;  1WO2 A;  3BAI A;  2W67 A;  1V3K A;  2WMG A;  3I3B A;  1C8X A;  1UR9 A;  3QHN A;  5I24 A;  4P7R A;  5A94 A;  4N42 A;  3N9K A;  6CGT A;  3CUG A;  2XWE A;  4PYS A;  1CIU A;  1UD2 A;  4HA4 A;  2D3N A;  3JUG A;  3GNR A;  4AY1 A;  4CUC A;  1MW1 A;  1JYW A;  2WMI B;  4ZEN A;  3O2L A;  2E8Z A;  2ZX6 A;  1W3L A;  4PMY A;  1GVY A;  3WUB A;  1E9L A;  2YL8 A;  2WSP A;  1XSK A;  1E0V A;  2DT3 A;  3K8L A;  4J7R A;  1W1P A;  2YBU A;  3AIU A;  1UKQ A;  1UR4 A;  3RO8 A;  2ZUW A;  3AHY A;  3GH4 A;  4MAZ A;  4HU8 A;  4UTF A;  5JBF A;  2VQT A;  3ARS A;  3WF2 A;  4CD5 A;  1RPK A;  1UH2 A;  2PBO A;  2VX7 A;  1B3V A;  4HOX A;  2YIH A;  3MMD A;  1VB9 A;  3SCO A;  3AS0 A;  1C8Q A;  3CBW A;  1CYG A;  3I3E A;  1Q6E A;  1LQ0 A;  4WF7 A;  3TOP A;  3WF3 A;  1UG6 A;  3NIY A;  2QF8 A;  1CGW A;  3PZO A;  3VIO A;  2BY0 A;  2J7C A;  3BSG A;  1CXL A;  1B0I A;  1JYN A;  1NWS A;  3AHT A;  3CZ8 A;  2EBN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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