3AIBA

Crystal structure of glucansucrase
Total Genus 291
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
291
sequence length
842
structure length
842
Chain Sequence
AQYNQVYSTDAANFEHVDHYLTAESWYRPKYILKDGKTWTQSTEKDFRPLLMTWWPDQETQRQYVNYMNAQLGIHQTYNTATSPLQLNLAAQTIQTKIEEKITAEKNTNWLRQTISAFVKTQSAWNSDSEKPFDDHLQKGALLYSNNSKLTSQANSNYRILNRTPTNQTGKKDPRYTADRTIGGYEFLLANDVDNSNPVVQAEQLNWLHFLMNFGNIYANDPDANFDSIRVDAVDNVDADLLQIAGDYLKAAKGIHKNDKAANDHLSILEAWSYNDTPYLHDDGDNMINMDNRLRLSLLYSLAKPLNQRSGMNPLITNSLVNRTDDNAETAAVPSYSFIRAHDSEVQDLIRDIIKAEINPNVVGYSFTMEEIKKAFEIYNKDLLATEKKYTHYNTALSYALLLTNKSSVPRVYYGDMFTDDGQYMAHKTINYEAIETLLKARIKYVSGGQAMRNQQVGNSEIITSVRYGKGALKATDTGDRITRTSGVVVIEGNNPSLRLKASDRVVVNMGAAHKNQAYRPLLLTTDNGIKAYHSDQEAAGLVRYTNDRGELIFTAADIKGYANPQVSGYLGVWVPVGAAADQDVRVAASTAPSTDGKSVHQNAALDSRVMFEGFSNFQAFATKKEEYTNVVIAKNVDKFAEWGVTDFEMAPQYVSSTDGSFLDSVIQNGYAFTDRYDLGISKPNKYGTADDLVKAIKALHSKGIKVMADWVPDQMYALPEKEVVTATRVDKYGTPVAGSQIKNTLYVVDGKSSGKDQQAKYGGAFLEELQAKYPELFARKQISTGVPMDPSVKIKQWSAKYFNGTNILGRGAGYVLKDQATNTYFSLVSDNTFLPKSLVNP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of glucansucrase from the dental caries pathogen Streptococcus mutans.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Streptococcus mutans
molecule keywords Glucosyltransferase-SI
total genus 291
structure length 842
sequence length 842
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2010-05-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aibA02
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 3aibA03
3VIMA 1F4HA 1YHTA 3AIUA 1E43A 4PTWA 4BA0A 3RO8A 1TVPA 1EDQA 2DH3A 1OWQA 6A3HA 1B2YA 2JIEA 5CSUA 4N0RA 1UKSA 1MW2A 1NP2A 2FGZA 1H3GA 4BQ2A 5EB8A 3WBEA 1PZ3A 3O2LA 4AZHA 1XC6A 4BZYA 1GOKA 1LG2A 4AIUA 4CN6A 5F7UA 1X6NA 4JFSA 4HOZA 4E4PA 1PIGA 1NM9A 1W1YA 1OD0A 2FH6A 2PF0A 1QI4A 3A47A 3BMVA 4ATDA 1W9VA 4U5KA 1AQMA 1E4MM 2AOSA 2WXDM 4JKLA 1UR0A 1HJQA 2VZUA 2J8GA 1B31A 3CZLA 4CD8A 3IANA 3SCNA 2DIJA 3OZPA 1C90A 4U3CA 2W4XA 3BSHA 5GQBA 1W2PA 1E3XA 5D9NA 2VURA 4AY1A 1VFFA 4JFUA 2YDSA 3ALGA 3EDKA 4U31A 3MMUA 3WDJA 3CTTA 1E6QM 5C71A 4M56A 3EDJA 4W93A 3WQ5A 4JKKA 3MANA 4H2CA 3GXIA 2WPGA 1KGXA 1KXVA 3MMWA 5D9OA 4NI3A 4W7UA 4MAVA 3VINA 1UKOA 5A6MA 4AYGA 4UQDA 2YLLA 2WCAA 2E3ZA 2EEXA 3AIWA 3AZTA 4P8UA 3VIGA 1R86A 5IXEA 1KBBA 1ODZA 3THDA 4CCCA 3OLEA 1VFMA 3WDHA 2YA1A 2G3IA 3NIYA 3SCQA 1JZ5A 4HMCA 3WENA 3G6MA 1OINA 1J0YA 5I5RA 2WCGA 4PMZA 1BTCA 3GDBA 1HT6A 1LF1A 4FLOA 4V28A 1NWUA 4U5IA 2CPUA 1US3A 3QHOA 1JIBA 4H04A 3VOCA 1R85A 3WNLA 4HU8A 2W63A 3MS8A 3RMEA 2WZEA 3NYDA 3AHVA 1Q4NX 2QPSA 3WNMA 1TE1A 5A6KA 4HZ8A 1KXHA 4CCDA 3RPMA 1BG9A 5E6ZA 2J7HA 2VQUA 3A4WA 3O6AA 2A3CA 2J7DA 2XHYA 4D6GA 4ATWA 5JBDA 4GI6A 3B9DA 2D24A 1ZBVA 1ITCA 1PX4A 3CUFA 4KGJA 1H2JA 1C93A 4LYPA 2WWDA 1E73M 1OGSA 1V6YA 2D1ZA 2WHLA 5I24A 4W85A 4QAWA 3VD3A 1HKIA 1JF6A 4DUWA 2E9MA 3NCOA 1TUXA 1UWUA 1KWKA 3M7SA 1FP8A 1W9DM 1CTNA 2WVVB 1XSJA 3N13A 2DT0A 1GPFA 1SR0A 1QI2A 1EA9C 3HZ3A 4M24A 3GM8A 5FL1A 1NQ6A 1XYFA 2E0PA 1C3FA 3SIMA 2WZIA 4PTMA 4TX6A 5ABEA 5FCZA 1VRXA 1AQHA 3TTYA 1XH1A 2GVYA 1HVQA 3KZSA 5A6SA 3VGEA 4D6DA 1KGUA 2JFEX 3WNOA 1QBAA 2G41A 1UZ1A 3MUY1 1HL9A 3AZSA 1H09A 5HNNA 3U5YA 1UWIA 3GYCA 1MQPA 3GXDA 1E6SM 2C8NA 2CIPA 1V02A 5GNXA 4D1IA 3CUHA 4HPGA 1EO7A 1UD3A 1V3HA 1DHKA 1GQIA 2Z1KA 4JFWA 4UQCA 1CGUA 1UKPA 2ZXAA 3VU2A 3KWXA 1ISXA 2VZTA 3VM7A 2XYLA 4IPNB 3WD0A 1JFHA 1FH7A 2CHOA 4CD7A 1DWJM 3VDCA 3ARQA 4J27A 5BROA 1BF2A 2FGLA 4AEEA 4D6FA 2W67A 3ARUA 4WJXA 4PMOA 1GCYA 3OG2A 1CENA 2J74A 2OSYA 1W1TA 4F66A 2BHYA 2VTFA 3PN8A 3WQVA 5HPOA 2ESCA 4UQBA 1V0KA 3VNZA 3AIQA 3N12A 3W37A 1BPLB 2WHJA 1W3LA 3PZTA 2BNJA 1E6NA 2ZE0A 2VOTA 4PSRA 1VFOA 1E6ZA 4W89A 3U57A 5A6JA 3AMKA 4L4PA 2O9TA 1CZ1A 4GINA 4WSJA 1UOKA 3GNPA 4YN5A 1W3KA 2J7FA 4AD5A 3SCRA 1WKYA 3WL0A 1V6VA 1ISWA 2FH8A 3BAIA 3CHDA 1NARA 3K8MA 1RD6A 1M04A 3BC9A 4X9YA 2YL9A 1V0LA 4UFHA 4QDMA 5I79A 1FH8A 4H8HA 1D7FA 1I1XA 3ZIZA 3SEPA 3WF4A 3VNYA 4W5ZA 3DYOA 3WY1A 3NUKA 3AS0A 2D0GA 3ARYA 3HN3A 1B9ZA 3T0BA 3WUFA 3FXYA 3UERA 1UH2A 2G3MA 5A6LA 1U33A 1UUQA 3CUGA 1ZL1A 3CZKA 2DGAA 1CXEA 4ZXOA 2XTKA 3GTNA 2EPKX 4CUCA 5BXSA 3AHXA 1DWAM 4DM2A 4A3HA 3WEOA 3T09A 1LWHA 2WM0A 3GXMA 3CMJA 3MSDA 3VIJA 3VIFA 1E5JA 1MFVA 3G6LA 1ISYA 2WMGA 4QP0A 2PI6A 2V3FA 3JUGA 1E15A 2BHUA 1Z32X 1L0PA 2V5CA 3BLKA 1Q6CA 2CHNA 2J4GA 2WC3A 3APGA 3BCDA 3UG4A 3WD4A 5A8QA 1KB3A 1CEOA 3II1A 1R8LA 5FKYA 4LYQA 1E56A 3GNRA 1LL4A 1W91A 4MB3A 1QNSA 3N17A 5IHSA 1CGXA 3VDHA 2W5FA 1KCLA 1TR1A 1KGWA 2ZOXA 4AIEA 2XGIA 2OYLA 2W62A 5BRPA 3QGVA 4KWUA 2BS9A 4JCLA 3EMQA 2GUYA 1OD8A 2XG9A 1VFUA 2OYMA 1LG1A 4PMUA 5E0CA 3EDEA 4MNJA 4KRUA 2CITA 2VT0A 2ZXDA 1JYVA 3W27A 1UR9A 3SCVA 2CCRA 1HN1A 2QMKA 2UY4A 4W87A 5E6YA 3F5LA 2XFRA 3AMLA 4DM1A 1H5VA 5D8WA 3SCTA 8A3HA 4HU0A 2VRQA 1I75A 3WH7A 1P6WA 2XPKA 2JF7A 2FHBA 1ZBWA 4ACZA 1JZ6A 3VX1A 1OIMA 5DT7A 2CBVA 3CUIA 1E1EA 2BV9A 4OIFA 1WZKA 3M46A 5ECUA 4MJ4A 4UFKA 1Y7VA 1Q6DA 1EO5A 2VO5A 4ZFMA 5D4YA 4AMCA 4UQ9A 1PPIA 1E72M 1BLIA 1IZJA 3ZSTA 2E9BA 5JBEA 1WO2A 1JFXA 2YA2A 4TVUA 3VDAA 4BF7A 3ZT5A 3OZOA 3VGFA 1NP0A 2E8ZA 4GO8A 5LYRA 1ISZA 3WMSA 1CNVA 4FLQA 4M82A 2BHZA 2WLZA 5E70A 1AQ0A 4WSKA 7CGTA 4IPLA 1RH9A 3IAQA 3DHPA 4V2XA 2O9PA 4GQRA 4AIOA 3CUJA 3ZOAA 2C7FA 5EMYA 4P7RA 1PBGA 3FW6A 4GKLA 4D71A 4CCEA 4NRSA 2W91A 3VGHA 3AIEA 1ISVA 6TAAA 3EMCA 3ALFA 4ZXLA 3AHTA 4PMRA 1FHDA 3K1DA 4P8XA 2W66A 3K8LA 2EPOA 1J9YA 1Q6EA 1UWRA 4X0VA 4XV0A 1E3ZA 4ACYA 3AHZA 1EHNA 4J28A 2VL4A 1XYZA 5FOOA 3ZJ7A 3WD3A 3ZJ8A 1XD1A 3WBAA 1OM0A 5I23A 3DYPA 3D5HA 1IV8A 3AS3A 4UCFA 3CH9A 2O92A 2PBGA 3KE0A 2OYKA 5JUVA 1NOFA 1E0XA 4AD3A 1SFSA 3IK2A 5HPCA 4YHGA 4Z2GA 3T0AA 4ML4A 4F9JA 3ARVA 1FOBA 3AI0A 4Z2KA 1J18A 3DHUA 3L2MA 4MJ2A 4EAMA 3AYSA 2ZUSA 2WANA 5TD4A 1WP6A 4WF7A 2YJQA 4M29A 1CGYA 3CGTA 3WNPA 1UG6A 3D3AA 3RIKA 4D6IA 4HMDA 3W29A 1DP0A 4UZSA 1W32A 1M03A 1GOOA 3GH5A 4AXNA 2ZIDA 3LPPA 1VAHA 4DWSA 5I78A 1MFUA 2JALA 4Z2IA 3KL5A 4OOZA 2JF6A 3EMZA 4V27A 1PIFA 2F61A 3QHMA 1H1NA 3RJYA 2QLYA 4S3JA 2YKKA 1QHPA 3VIKA 3S2CA 4PTXA 1C7TA 3ARTA 2HISA 2J25A 1W3JA 2VX5A 1GJUA 3WH6A 1UD5A 2F8QA 2OSWA 1OGBA 2CBJA 1KXTA 2UWFA 2A3EA 1X6LA 1SYTA 2BY0A 2Y8KA 1JZ8A 2G3NA 5A8OA 4PEEA 5CGMA 3TTSA 2ZXQA 4WIWA 1R87A 1ZB5A 4W84A 1CGVA 4CU8A 3AMDA 3W24A 2X1IA 4CN4A 1W9XA 3VD4A 1C7SA 4J3VA 4CD5A 1YQ2A 4TTUA 4JAWA 2DIEA 2Z1SA 1GJWA 3WELA 1E40A 1UA3A 3GBEA 5AYBA 2BXZA 5EFFA 3UETA 1GHRA 1FH9A 3NSNA 2DH2A 1CGTA 4HA3A 1VBUA 4C7DA 3SCPA 3WIJA 5IFTA 1W1PA 2ZUUA 3W26A 3RILA 2EBNA 2CKRA 3TA9A 3FAWA 2D23A 2EPLX 4AZGA 2VR5A 1V08A 3AYRA 1QW9A 4OOUA 1BHGA 5CJ5A 2VZSA 5M3WA 3POHA 1TCMA 3DC0A 5HDRA 2CXGA 2WC4A 3UG5A 4RE2A 1K9FA 5A3HA 3WQ6A 5I77A 3BAWA 1EGZA 3WD1A 2D0FA 4GZIA 3HMCA 1KQYA 4ACZB 1E0WA 3N18A 4KMQA 3CMGA 4F8XA 5GNYA 2BVDA 3PTQA 3OLDA 4LQ1A 1B90A 2JEQA 2CEQA 2YBTA 2V38A 1K9TA 4QLLA 3VUPA 4A3YA 3VTRA 4ZE4A 2PWEA 2ZWYA 2E4TA 3OA5A 3WF1A 1GQJA 3WH5A 2VZOA 4PCSA 4W8LA 4QLJA 4UOJA 5FL0A 1JYXA 2WK2A 4MAZA 3AQUA 1V03A 1VJZA 2D2OA 1EHAA 4H8VA 2VVNA 5ABHA 1A3HA 3K4DA 2EQDA 1EDTA 3CZGA 4AD0A 1DWFM 5D9MA 2FHFA 2IXVA 3VMNA 1VEOA 5A6BD 3WF2A 3WQ8A 4TXEA 3HJEA 4UFIA 1J12A 3L2LA 3WF0A 3BXWA 2E40A 1UWTA 2IXUA 2O9OA 4AISA 4JL2A 2PWDA 2WCSA 1XH2A 1E6RA 4MNKA 2A3HA 3WDPP 1G1YA 2XM1A 3T2QA 2CYGA 3M6DA 1E4NA 3W38A 3ZMRA 2DT3A 4AW7A 1WPCA 1XRVA 4JHOA 1GVYA 2J7BA 3W28A 4P7QA 4HZ7A 1HF6A 1CXLA 4JIEA 4EE9A 1KFWA 3W53A 1VIWA 2EJ1A 1BYCA 4M80A 5D9PA 1LQ0A 3S6TA 4D6CA 2XIBA 2FDMA 4EANA 2XSBA 1NWSA 3LPGA 2AAAA 1UQYA 2VNCA 3CO4A 3ZQ9A 1OGGA 5I6SA 1QHOA 4OZOA 3KL0A 3TP4A 2J8FA 4U2YA 2ZUNA 4UOQA 4F79A 1GVIA 5DT5A 4ATLA 4DUVA 4JHZA 1VEPA 4U3AA 4H7VA 2VX4A 1V02E 2WB5A 4MB5A 3WN6A 5BXRA 2YOCA 4PMQA 1KXQA 1UH4A 3PZ9A 4DWSB 2WHMA 1OBAA 4L4OA 2GFTA 1HJUA 2DSWA 3A4AA 2GSJA 1SMDA 1BGGA 1UKTA 2CERA 1G0CA 5GNZA 3W6LA 1KBKA 3FN9A 3WKZA 1C8XA 9CGTA 4PYSA 4CGTA 2DQXA 3MUIA 4FK9A 3QR3A 4QCEA 3TTOA 3B8SA 1X1NA 2WC7A 3AS1A 5GPRA 3MV01 5CPTA 3W4RA 3MKKA 4D6JA 4WK9A 3FHAA 4S3KA 1PJ9A 3BAKA 4WKFA 1WNOA 2WAGA 1H49A 4NZCA 2J75A 2VX7A 1G01A 3MU7A 3VD9A 1UH3A 3VGBA 2WVUA 3L4TA 4B3KA 1BYAA 3AXXA 4OKDA 2PBOA 3DECA 3VO0A 1MQQA 3WDRA 3MUZ1 3TOPA 2GJXA 1JNDA 4PCTA 3RM4A 2GJRA 4WLCA 4E8DA 4TTGA 3MUAA 2ZUTA 3WL1A 4M8UA 1G94A 2GDUA 1HIZA 2X0YA 3VX0A 1J0KA 3NSMA 4PUDA 4F9DA 4J3TA 5BYWA 2VCBA 2CKSA 1MYRA 2WHKA 2BY1A 1AVAA 1HXJA 1C92A 1DTUA 1WZLA 4N42A 3W81A 2XFFA 3WD2A 2XVLA 3POCA 3WMCA 2XVPA 3AISA 4B3LA 3NDZA 1U2YA 4GQQA 1CPUA 3UG3A 3BCFA 3VKKA 1DWIM 1QHZA 3OB8A 3O9NA 4AC1X 1EIBA 4Y7EA 1V3JA 1ITXA 2BFGA 1E4LA 1NWRA 4CU6A 4M1RA 1JZ4A 1J10A 3HU7A 4WKAA 4AZ7A 3BGAA 3CHCA 4JL1A 2YLAA 4GZJA 3OGRA 1V6UA 2YDRA 5BXPA 1GW1A 1MVYA 1PX3A 2QF8A 3CLWA 1Q6GA 1W3HA 3OGVA 4Z2JA 1B1YA 3IJ7A 3DYMA 5ABGA 1VEMA 2ZX8A 2BY2A 3FAXA 5AC4A 3BSGA 1W9UA 1HJWA 3AXHA 5CPSA 2V3EA 2WMFA 2YA0A 3GH4A 4JCMA 4A4AA 1XCXA 2G3JA 5CXPA 3VIPA 2DT1A 3UR8A 3ZSSA 1E71M 8CGTA 2VUYA 4P7NA 3I3BA 2OSXA 1JF5A 3PBGA 5CGTA 4JZ5A 4HPHA 4TUFA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3VIM A;  1F4H A;  1YHT A;  3AIU A;  1E43 A;  4PTW A;  4BA0 A;  3RO8 A;  1TVP A;  1EDQ A;  2DH3 A;  1OWQ A;  6A3H A;  1B2Y A;  2JIE A;  5CSU A;  4N0R A;  1UKS A;  1MW2 A;  1NP2 A;  2FGZ A;  1H3G A;  4BQ2 A;  5EB8 A;  3WBE A;  1PZ3 A;  3O2L A;  4AZH A;  1XC6 A;  4BZY A;  1GOK A;  1LG2 A;  4AIU A;  4CN6 A;  5F7U A;  1X6N A;  4JFS A;  4HOZ A;  4E4P A;  1PIG A;  1NM9 A;  1W1Y A;  1OD0 A;  2FH6 A;  2PF0 A;  1QI4 A;  3A47 A;  3BMV A;  4ATD A;  1W9V A;  4U5K A;  1AQM A;  1E4M M;  2AOS A;  2WXD M;  4JKL A;  1UR0 A;  1HJQ A;  2VZU A;  2J8G A;  1B31 A;  3CZL A;  4CD8 A;  3IAN A;  3SCN A;  2DIJ A;  3OZP A;  1C90 A;  4U3C A;  2W4X A;  3BSH A;  5GQB A;  1W2P A;  1E3X A;  5D9N A;  2VUR A;  4AY1 A;  1VFF A;  4JFU A;  2YDS A;  3ALG A;  3EDK A;  4U31 A;  3MMU A;  3WDJ A;  3CTT A;  1E6Q M;  5C71 A;  4M56 A;  3EDJ A;  4W93 A;  3WQ5 A;  4JKK A;  3MAN A;  4H2C A;  3GXI A;  2WPG A;  1KGX A;  1KXV A;  3MMW A;  5D9O A;  4NI3 A;  4W7U A;  4MAV A;  3VIN A;  1UKO A;  5A6M A;  4AYG A;  4UQD A;  2YLL A;  2WCA A;  2E3Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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