3AIBA

Crystal structure of glucansucrase
Total Genus 291
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
291
sequence length
842
structure length
842
Chain Sequence
AQYNQVYSTDAANFEHVDHYLTAESWYRPKYILKDGKTWTQSTEKDFRPLLMTWWPDQETQRQYVNYMNAQLGIHQTYNTATSPLQLNLAAQTIQTKIEEKITAEKNTNWLRQTISAFVKTQSAWNSDSEKPFDDHLQKGALLYSNNSKLTSQANSNYRILNRTPTNQTGKKDPRYTADRTIGGYEFLLANDVDNSNPVVQAEQLNWLHFLMNFGNIYANDPDANFDSIRVDAVDNVDADLLQIAGDYLKAAKGIHKNDKAANDHLSILEAWSYNDTPYLHDDGDNMINMDNRLRLSLLYSLAKPLNQRSGMNPLITNSLVNRTDDNAETAAVPSYSFIRAHDSEVQDLIRDIIKAEINPNVVGYSFTMEEIKKAFEIYNKDLLATEKKYTHYNTALSYALLLTNKSSVPRVYYGDMFTDDGQYMAHKTINYEAIETLLKARIKYVSGGQAMRNQQVGNSEIITSVRYGKGALKATDTGDRITRTSGVVVIEGNNPSLRLKASDRVVVNMGAAHKNQAYRPLLLTTDNGIKAYHSDQEAAGLVRYTNDRGELIFTAADIKGYANPQVSGYLGVWVPVGAAADQDVRVAASTAPSTDGKSVHQNAALDSRVMFEGFSNFQAFATKKEEYTNVVIAKNVDKFAEWGVTDFEMAPQYVSSTDGSFLDSVIQNGYAFTDRYDLGISKPNKYGTADDLVKAIKALHSKGIKVMADWVPDQMYALPEKEVVTATRVDKYGTPVAGSQIKNTLYVVDGKSSGKDQQAKYGGAFLEELQAKYPELFARKQISTGVPMDPSVKIKQWSAKYFNGTNILGRGAGYVLKDQATNTYFSLVSDNTFLPKSLVNP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of glucansucrase from the dental caries pathogen Streptococcus mutans.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Streptococcus mutans
molecule keywords Glucosyltransferase-SI
total genus 291
structure length 842
sequence length 842
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2010-05-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aibA02
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 3aibA03
2OWWA 4W93A 3EDKA 2WZIA 5I79A 1E0WA 3W37A 4Z2LA 3ARZA 3AXHA 1DWAM 1UYQA 2WVVA 1KGUA 2UY5A 2WC3A 1NP0A 5DT5A 9CGTA 1QHZA 3VO0A 3AHTA 4JHZA 1V6WA 4F9JA 3GXMA 2VRQA 1W32A 2NW0A 1RD6A 1EO7A 1W1PA 2O9RA 1ITXA 4UQDA 4AIEA 1V03A 4UFJA 1JZ5A 1P6WA 3EMQA 2W63A 2ZWZA 2EPOA 4HMCA 1QI0A 2VNCA 4GI6A 3B9AA 1QHOA 1ODZA 1HL9A 4LQ1A 2WPGA 1GQLA 2A3BA 3FW6A 4JKMA 1GNXA 4HOWA 2DSUA 4MNLA 1KWGA 3VD4A 2BNJA 2WLYA 3CMJA 3MKKA 1KQYA 4OJYA 5AY7A 1EHNA 1E55A 4KRUA 3ALGA 3ZIZA 1JZ4A 3OLDA 1XGZA 2CPUA 2O9PA 1QHPA 1UD6A 3BGAA 3WEMA 2XIBA 1J12A 4D6CA 1QNSA 2G41A 1D3CA 2IUZA 4JCMA 2C8NA 2WSKA 3VILA 4PCSA 4AYSA 2GJRA 3PZOA 2PBOA 3WDJA 1QOXA 4AZ5A 5A6SA 3DYMA 3WF4A 3WQ4A 2OSXA 3BH4A 1QPKA 5FL1A 1BYDA 3SCQA 3ECQA 4PMNA 3WBAA 2EPKX 4DWSC 1UKOA 3WH7A 1V3HA 1MW1A 4ZEPA 3AIUA 4J27A 4B9YA 2DPEA 4TOQA 3WEOA 4AEFA 2YIHA 4DM1A 4UFKA 2ZXAA 2VCBA 1ZJAA 1EDGA 3TTYA 1UR2A 4D6EA 4XZWA 2G3IA 4D6FA 1G01A 1B3XA 1DWJM 3WN6A 2MANA 3MUIA 5BYWA 1CTNA 3FAWA 5FD0A 4A3HA 4AZ7A 1KXTA 2ZUSA 4WSKA 4BS0A 5D4YA 1GONA 3AYRA 1ODUA 3KL3A 4FLQA 4C7GA 1ECEA 1VIWA 4U33A 1E6RA 2J79A 4AZ6A 3WNNA 2RGMA 3A4XA 1UA3A 3FY1A 4UZUA 3KL0A 2OSWA 3VMPA 3VDCA 3T0BA 1CNVA 3N15A 2GK1B 4AZHA 2QMJA 3ZR5A 4YPJA 4P7QA 4TTGA 4OBSA 1JDDA 3QOMA 1OSEA 4B9ZA 1QBAA 2G3NA 2FHCA 3K1DA 1NARA 4NRRA 3VMNA 1U33A 1Q6EA 5A6AA 2J78A 3PBGA 1EO5A 3GXFA 3GNPA 2XVKA 5EFDA 1PX8A 3AHZA 4OBRA 1O7AA 3THCA 1MQPA 5I78A 3ZSSA 3QGVA 2DEPA 3WDRA 2J62A 2JALA 3GH7A 1H1NA 4PMVA 4UQBA 2ZX5A 5BXPA 2PWHA 5HPOA 4W8BA 5FOOA 4H8UA 1ZBCA 4M8UA 1V02E 2J7DA 1WAWA 1WDPA 4W86A 2E8ZA 1A47A 4Z2JA 1RP8A 1E1EA 2VX6A 1ISXA 1HJXA 3AZTA 3I3DA 4X0VA 1C7SA 3UG4A 1NOFA 2AMGA 3WIJA 3OZPA 2ZWYA 2CEQA 4MNMA 3BAIA 2V38A 5GPRA 4H04A 5CLTA 3AJ7A 1LL6A 1C8XA 4AZBA 3VX0A 2PWFA 2YDQA 2HVMA 1LG1A 5I77A 3HMCA 1G0CA 2VC9A 3AMLA 3AIEA 3F4VA 3PZIA 2QF8A 3L4TA 1B3WA 3CZGA 4J28A 2YLAA 3WF2A 5A95A 1XH0A 4D1JA 3BSHA 1DWHM 1K6AA 4MPKA 3B9EA 1SMAA 2E40A 2O92A 7A3HA 1WO2A 1OGGA 3SCVA 1TR1A 3VIOA 1VEOA 5BRQA 1FHLA 1NWTA 4CVUA 1GHSA 4DWSA 4UQ9A 2ZICA 1UR4A 1DP0A 4MNKA 4HZ7A 1G94A 3L4YA 5CGMA 2WWDA 4ATWA 1YHTA 5E0CA 4AY1A 1GHRA 5D8WA 1UKQA 3MMUA 3VGBA 2OLHA 3W29A 1UD4A 4TXEA 3EMZA 4WKFA 1KB3A 4HMDA 3CGTA 2CESA 4J3TA 2VRJA 2XSAA 5C8BB 4P8UA 5CPQA 2GVYA 4CGTA 4YHEA 3A4WA 3VIHA 4FF5A 2E9BA 5HDRA 1NOUA 2CHOA 1BAGA 4AZGA 3WNMA 1JL8A 2EJ1A 3SCTA 3FXYA 2WZHA 1G5AA 3MMDA 3WQVA 3VDBA 1E6PA 1UD2A 5JUVA 3AIRA 3BMWA 3NIYA 3AS0A 1V6YA 4HU8A 1EDQA 3KL5A 5I23A 2W62A 1TVNA 3ALFA 1V0KA 1V0NA 1AMYA 4C7DA 2X1IA 1E4MM 1W9PA 2QMKA 2XFFA 1KBBA 2UY3A 1FFQA 3VDAA 3PZUA 2ESCA 1CXLA 2B31A 5FIPA 1X6NA 4W89A 1W9XA 2W66A 3QHNA 5D9OA 4BQ4A 1MW0A 5KEZA 4MDOA 4NI3A 1XCWA 4XUYA 2VTFA 3ARSA 1J01A 3VKKA 1Q6FA 1H4PA 1EHAA 3WNOA 2C0HA 1DWFM 3WMBA 3WSUA 3PZQA 2WVVB 1UKSA 1W3LA 1PPIA 2QHAA 3VU2A 2VR4A 4H7VA 3FAXA 3VIGA 5JIWA 2NT0A 3UCQA 3ZJKA 2YDSA 3SUTA 1GCYA 5LYRA 2W4XA 3WF1A 3ZQ9A 1NH6A 5EFFA 3GDBA 2JEQA 1GVYA 3AFBA 4MADA 1ZB5A 1HVQA 2EPNA 4MJ2A 4HMEA 2GJXB 1JDAA 4U5IA 1BG4A 3FN9A 3SCRA 4CKQA 4QLKA 4CN4A 1W1VA 2YOCA 2J77A 4KMQA 1CZ1A 2J7BA 4WKHA 4ACZB 1ZBVA 5M5DA 2HISA 1PEZA 1FP9A 2XGIA 3CUFA 3OLEA 2WB5A 1Q6DA 3EDJA 1Q4NX 2WMHA 3FHQA 3AHVA 1V3KA 5E0FA 4J7RA 4BQ5A 3PZNA 1JNDA 2W91A 4QP0A 2YL6A 3QHOA 1HX0A 2VX7A 3IANA 1JZ8A 4QDMA 1JYWA 2D0FA 2PWGA 1E40A 2VJXA 1W1YA 2Y24A 5EB8A 2XFYA 4UQAA 4PMYA 4F66A 3LMYA 2YA2A 4U2YA 1VFUA 2Q8XA 2OYKA 4H8VA 1HKJA 4MAZA 3WNLA 1LQ0A 4PEEA 1JNEA 2XJ7A 1NQ6A 5A6MA 3ARWA 5CSUA 3W6LA 5EBAA 2QPUA 4U2ZA 3HZ3A 3BCFA 1M01A 4F9DA 2NSXA 1AQMA 2VX5A 1WKYA 1HXJA 3TTQA 3VOCA 3ZR6A 1HJSA 1S46A 4TVDA 4CD5A 1NOWA 1BFNA 4B3LA 4WJXA 1E0VA 3AQUA 1GQIA 1FHDA 4NZCA 3EBVA 2DDXA 2ZX9A 4UFHA 1UZ1A 1JF6A 2YDRA 1BGGA 1HJWA 2XGBA 2XVNA 3LPPA 3RPMA 2WZEA 2CXGA 1CXFA 3I3EA 3VTRA 5DT7A 3CHDA 3L4WA 4FLOA 4WSJA 2XUCA 1OB0A 3L2MA 3SCSA 2XHYA 3GH5A 2WHMA 3A47A 4JL2A 4CCEA 1XYFA 2X0HA 1Z32X 4HPHA 4ZXLA 1VBUA 3A4AA 1HF6A 1XHGA 5F7UA 5IXEA 3WFZA 1D2KA 1J9YA 4W7WA 4XB3A 1OT2A 4MJ4A 4HA4A 4UQCA 1O6IA 3W4RA 5DMYA 2WLZA 2CNCA 5D9MA 2DT0A 4M24A 2CKRA 4AD0A 2Y4SA 2D0GA 4PMOA 5A69A 5ABFB 1U2YA 4KH2A 1LWHA 2FHBA 4ZFMA 3VDHA 1H3GA 1VJZA 4P7OA 1V3LA 1KGWA 3K8MA 4EE9A 4OOUA 4AEEA 3S2CA 3K4AA 4RE2A 1GQJA 1TCMA 3APGA 3FNDA 5A6LA 5E6ZA 1ZS2A 1JZ3A 1UD5A 2F8QA 3W81A 2UY2A 4K68A 3AMGA 4PN2A 4M56A 1JFHA 2Y8KA 1K9FA 4P8WA 4P7LA 1ZL1A 2QPSA 4U5KA 3ZT7A 1RPKA 2X09A 2OYMA 4AMCA 2ZX6A 1EQPA 1QW8A 3AZSA 4AD5A 4EK7A 4D6IA 5IFTA 5CPSA 2DSVA 1BF2A 3GBDA 3AIQA 4LYPA 4NF7A 2BY3A 2E4TA 1ISVA 2YJQA 3CBWA 2D3LA 2X2YA 2ZXDA 1UOKA 4P8XA 1CEOA 2F61A 4W8AA 1UR0A 2XSBA 2DT2A 5I24A 3IAPA 4UR9A 4HOZA 3AZRA 2GJXA 1B1YA 3CZKA 5E09A 2GFTA 1ZBKA 3N9KA 3CUGA 4ACZA 3T0DA 1CLXA 2YA1A 1KXHA 4PCTA 1PAMA 4UOZA 1JD9A 1OGSA 1NWRA 1FOBA 2VZOA 3PN8A 4FK9A 4GPNA 4DWSB 5A2AA 3VX1A 3SUSA 5FCZA 1VENA 4GO8A 2VMFA 5IFPA 2WMKA 2OYLA 3DHUA 1VEMA 1UWSA 3WH6A 2EBNA 1UWRA 2WSPA 3VINA 5A8QA 3BLPX 3WEZA 4TUFA 4HOXA 2PB1A 1W3JA 1WZKA 2D24A 5GNXA 3K8KA 2YL8A 2WWCA 3SUVA 2D0HA 3U5YA 2ZOXA 4AXNA 4P7RA 1LJYA 3QHMA 4PYSA 4MNJA 2BXYA 4GO9A 1V0MA 5M03A 2VZTA 4MDPA 4CCCA 1BTCA 1MW2A 1HVXA 1KWKA 1C8YA 4J3XA 1JZ7A 1AVAA 1UD3A 1UD8A 4XV0A 3BAXA 4GI8A 3RIKA 4F79A 4Z2HA 3BAYA 1C93A 1GOWA 1CGVA 3QR3A 3M6DA 3S6TA 4W5UA 4D71A 1Q6GA 1B0IA 3GH4A 1WDSA 6A3HA 1MYRA 3CHCA 1OCQA 1IZKA 5AC5A 1HP4A 1UR8A 1E73M 4AIUA 3VGEA 1RP9A 2RGLA 2ZXBA 3TP4A 4V27A 5D9PA 3ZMRA 3U5UA 2XVLA 3L4ZA 1R86A 5DFAA 2V5DA 4HP5A 3PTMA 3ARUA 3VGHA 2XM1A 3DHPA 4JZ5A 3WNKA 3M46A 1MQQA 1QI4A 3WUGA 3VIKA 3WMSA 3WUBA 3PZ9A 1BVNP 5BWFA 4PMZA 2ZE0A 2UY4A 1FH8A 1AQHA 1KGXA 3D5HA 1B3VA 1FFRA 2W61A 4AD2A 3WD2A 1JZ6A 3IAQA 1E3XA 2G4FA 5BRPA 5ABFA 3WH8A 2QV4A 1OT1A 4P7NA 4ATDA 1J0JA 1H0GA 1X6LA 1Y7VA 2VURA 1W9UA 4IISA 3OGRA 4HTYA 1OINA 1W3HA 1V0LA 3O2LA 4LGXA 3W53A 4RL3A 5KZ6A 1H0IA 5GNYA 4DM2A 4BZYA 2BVDA 2WMIB 3PZVA 2PC8A 1XH1A 2E3ZA 1HIZA 1XCXA 3RMEA 3N18A 3TTOA 1NWSA 3WUEA 3SCNA 2TAAA 4UFIA 4CU8A 2ZX8A 3KWXA 3VM7A 3CTTA 4UZSA 2DIEA 1ISZA 3U57A 2D20A 2VO5A 3W27A 4DUXA 1JYVA 2PI6A 1UH3A 3NCOA 4ZE4A 3WFLA 2CITA 5A94A 2GUYA 1CGXA 4UFLA 2CBIA 1B2YA 3EDFA 2W67A 4DWSD 3EYPA 4H2CA 3KLLA 1JFXA 3POCA 4W85A 4UOQA 4GXPA 2BV9A 2J74A 4WF7A 2WYSA 4IPLA 4JFUA 2FH6A 4CD8A 2WBGA 2DGAA 4JFTA 1W9BM 1XSKA 3VGGA 5EMYA 1PJ9A 3CUHA 4V2XA 2BVTA 4GQRA 4F8XA 2G3JA 1JGIA 1YQ2A 3MSDA 4PBGA 2GDVA 3OLGA 3ZSTA 1PIGA 3MU7A 3CHEA 3NDYA 2D3NA 5A1AA 2YBTA 4OZOA 2AOSA 2YLLA 3A3HA 3IJ7A 4H41A 1V3MA 1CXEA 3WL1A 1MQRA 1OWQA 2CIPA 2YL9A 4E4PA 4JFWA 1C3FA 4YHGA 2VOTA 4X9YA 2DIJA 1B3ZA 4IM4A 3SCUA 3WF0A 2J47A 3WY1A 1AQ0A 5FL0A 4E2OA 4BQ3A 2GDUA 4GZJA 1E4IA 2ZUMA 4Z2GA 1R7AA 5BCAA 4UQEA 2FDMA 2JF7A 3SURA 2NT1A 5A6JA 2CERA 4D6GA 3A6OA 3CZLA 3SUWA 1WDQA 4IUGA 3VD3A 3W26A 2J7GA 3DECA 1KBKA 2VX4A 3RILA 3EMCA 3HU7A 1UUQA 1I75A 4RE3A 2BXZA 3VGDA 2VCAA 1F4HA 3WD3A 3SUUA 1J0IA 1US2A 1XD1A 1UKTA 4GZIA 4J3UA 1GQKA 4PMRA 3AIVA 4EKJA 2CETA 4Z2KA 5A2CA 5CLWA 1JYXA 1W9DM 2Y5EA 2X8RA 4GIAA 4B15A 4IPNB 4MB5A 1QNPA 1WP6A 4LYQA 4S3JA 2XPKA 3W24A 1N82A 4BCEA 3ARYA 2PBGA 1V08A 2D23A 2WKGA 4HZ6A 2CBVA 4JAWA 1UQZA 1ISWA 3UR7A 5E9AA 2ZUVA 2J7EA 2WHKA 3KEHA 1V3JA 3VIJA 2DSKA 5HOSA 4LPCA 4ZE5A 4CD7A 3AHYA 3OGVA 4M29A 3BAJA 2J8FA 1V6UA 5ECUA 6CGTA 4PSPA 4W87A 1CPUA 1JXKA 2BVYA 1H11A 4GINA 2JE8A 2GSJA 1PX3A 3G6LA 3UG3A 3W0KA 4WK9A 4PMXA 3CZJA 3DYPA 3WNPA 5DO8A 1XSJA 4FLSA 3RJXA 1TZ7A 5CSYA 2WMIA 3VIPA 1V6VA 2VI0A 1K9DA 5BROA 3RDKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2OWW A;  4W93 A;  3EDK A;  2WZI A;  5I79 A;  1E0W A;  3W37 A;  4Z2L A;  3ARZ A;  3AXH A;  1DWA M;  1UYQ A;  2WVV A;  1KGU A;  2UY5 A;  2WC3 A;  1NP0 A;  5DT5 A;  9CGT A;  1QHZ A;  3VO0 A;  3AHT A;  4JHZ A;  1V6W A;  4F9J A;  3GXM A;  2VRQ A;  1W32 A;  2NW0 A;  1RD6 A;  1EO7 A;  1W1P A;  2O9R A;  1ITX A;  4UQD A;  4AIE A;  1V03 A;  4UFJ A;  1JZ5 A;  1P6W A;  3EMQ A;  2W63 A;  2ZWZ A;  2EPO A;  4HMC A;  1QI0 A;  2VNC A;  4GI6 A;  3B9A A;  1QHO A;  1ODZ A;  1HL9 A;  4LQ1 A;  2WPG A;  1GQL A;  2A3B A;  3FW6 A;  4JKM A;  1GNX A;  4HOW A;  2DSU A;  4MNL A;  1KWG A;  3VD4 A;  2BNJ A;  2WLY A;  3CMJ A;  3MKK A;  1KQY A;  4OJY A;  5AY7 A;  1EHN A;  1E55 A;  4KRU A;  3ALG A;  3ZIZ A;  1JZ4 A;  3OLD A;  1XGZ A;  2CPU A;  2O9P A;  1QHP A;  1UD6 A;  3BGA A;  3WEM A;  2XIB A;  1J12 A;  4D6C A;  1QNS A;  2G41 A;  1D3C A;  2IUZ A;  4JCM A;  2C8N A;  2WSK A;  3VIL A;  4PCS A;  4AYS A;  2GJR A;  3PZO A;  2PBO A;  3WDJ A;  1QOX A;  4AZ5 A;  5A6S A;  3DYM A;  3WF4 A;  3WQ4 A;  2OSX A;  3BH4 A;  1QPK A;  5FL1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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