3AIBA

Crystal structure of glucansucrase
Total Genus 291
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
291
sequence length
842
structure length
842
Chain Sequence
AQYNQVYSTDAANFEHVDHYLTAESWYRPKYILKDGKTWTQSTEKDFRPLLMTWWPDQETQRQYVNYMNAQLGIHQTYNTATSPLQLNLAAQTIQTKIEEKITAEKNTNWLRQTISAFVKTQSAWNSDSEKPFDDHLQKGALLYSNNSKLTSQANSNYRILNRTPTNQTGKKDPRYTADRTIGGYEFLLANDVDNSNPVVQAEQLNWLHFLMNFGNIYANDPDANFDSIRVDAVDNVDADLLQIAGDYLKAAKGIHKNDKAANDHLSILEAWSYNDTPYLHDDGDNMINMDNRLRLSLLYSLAKPLNQRSGMNPLITNSLVNRTDDNAETAAVPSYSFIRAHDSEVQDLIRDIIKAEINPNVVGYSFTMEEIKKAFEIYNKDLLATEKKYTHYNTALSYALLLTNKSSVPRVYYGDMFTDDGQYMAHKTINYEAIETLLKARIKYVSGGQAMRNQQVGNSEIITSVRYGKGALKATDTGDRITRTSGVVVIEGNNPSLRLKASDRVVVNMGAAHKNQAYRPLLLTTDNGIKAYHSDQEAAGLVRYTNDRGELIFTAADIKGYANPQVSGYLGVWVPVGAAADQDVRVAASTAPSTDGKSVHQNAALDSRVMFEGFSNFQAFATKKEEYTNVVIAKNVDKFAEWGVTDFEMAPQYVSSTDGSFLDSVIQNGYAFTDRYDLGISKPNKYGTADDLVKAIKALHSKGIKVMADWVPDQMYALPEKEVVTATRVDKYGTPVAGSQIKNTLYVVDGKSSGKDQQAKYGGAFLEELQAKYPELFARKQISTGVPMDPSVKIKQWSAKYFNGTNILGRGAGYVLKDQATNTYFSLVSDNTFLPKSLVNP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of glucansucrase from the dental caries pathogen Streptococcus mutans.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucosyltransferase-SI
molecule tags Transferase
source organism Streptococcus mutans
total genus 291
structure length 842
sequence length 842
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2010-05-12
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aibA02
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 3aibA03
5D9PA 4D6DA 5A2AA 5A6BA 2O9PA 2G3IA 4GI9A 1OM0A 1GVIA 2UY4A 3APGA 1JZ2A 2E3ZA 2PB1A 4OOZA 1BSIA 2DDXA 2BFGA 5A8QA 1V02E 2YIHA 2XTKA 3WMBA 1GUVA 1UKTA 4M24A 4MNMA 2C8NA 4MAZA 3AFBA 1W1PA 2YDQA 1Y7VA 2J74A 5A6SA 5BYWA 4C7DA 5D9MA 3J7HA 3WDRA 4CD8A 3AS1A 3OB8A 1EHNA 4PN2A 1CDGA 1MW0A 2XWEA 4JL2A 1RD6A 1H3GA 1CGVA 2WHJA 2WZHA 3EDDA 1PJ9A 3W38A 1WO2A 3ZJKA 1V3HA 1Q6FA 4MNLA 1BYCA 1DHKA 2ZUWA 3T2QA 5M5DA 2XIIA 2J7BA 4A3HA 1XRVA 3NDZA 4D71A 4MTVA 2V38A 2V5CA 4XX6A 8A3HA 3CZLA 4WJXA 2G8ZA 3VGBA 3BGAA 4UFKA 7TAAA 3T0AA 1SMDA 2XM2A 5IHRA 4PCSA 4UQ9A 1AQHA 2ZWYA 2W5FA 4CU6A 2CERA 5A6BD 3LPGA 1BYAA 5A8NA 2PF0A 2VZOA 2BNJA 1W3HA 1TA3B 3WF0A 1B9ZA 4ATWA 4J3TA 4PMOA 3W6MA 3I3EA 4QDMA 2WKLA 1ZB5A 1OGBA 3QOKA 2WNWA 2W63A 4MJ2A 5BRPA 1DWGM 3LPPA 4JFVA 1ITCA 1C8XA 2WHLA 1WDSA 4WIWA 2UY5A 2Y8KA 1CGWA 3AMLA 1QBBA 3WQ6A 3WMSA 4JFSA 2EEXA 2WBKA 1FH8A 4PCTA 5C71A 3AIWA 3W26A 4MNJA 1MQRA 2Z1SA 3D5HA 3ZOAA 3BAJA 3L4UA 1K6AA 5A8MA 5HXMA 1XSJA 2OSYA 2VCBA 1QBAA 4UFJA 4URIA 4AIOA 3MMWA 3SIMA 4CVWA 2V5DA 3SCSA 1XYZA 3RM8A 1FHDA 1J0KA 2J79A 2HVMA 1JD7A 2ZXDA 5AC4A 4P7RA 4AW7A 1SYTA 4V27A 3WFLA 3T0BA 3WQVA 3W82A 1FFRA 2DIEA 1UWUA 1CTNA 2ZX5A 1I1XA 2XPKA 4HTYA 4KRUA 1EXPA 3VDHA 1NWUA 3T08A 3G6MA 3AS0A 4OBRA 4UQDA 1F4AA 2YLLA 4P7QA 3L4VA 3L4WA 1LF1A 3AZRA 1E6QM 1E3XA 4XB3A 7CGTA 1E6SM 3MS8A 1H41A 3POHA 2ZICA 3NSNA 3PZIA 2QMJA 3B9DA 2DQXA 1G9HA 3NCOA 3WFZA 1HN1A 3RJYA 4ATDA 4MAVA 4P7NA 1M7XA 5ABGA 4AD0A 4PTWA 2J75A 2WCAA 3PZGA 5DT7A 4PTVA 1W91A 1DTUA 3WSUA 4QFUA 2EPKX 2OSXA 2C0HA 4PMYA 4TTUA 3TP4A 3WNOA 4BA0A 1P6WA 1Q6EA 1ODUA 1B3VA 3AISA 5DF0A 3NDYA 2WMFA 5AYIA 4DWSC 4YPJA 3CZEA 2J77A 3ZJ6A 1G5AA 1B3WA 3D3AA 1HJXA 3N13A 4UTFA 2VZTA 1GOOA 4U2ZA 3SUSA 2D0HA 4D6IA 1EO7A 4A3YA 5LYRA 2VOTA 3QHOA 2BHYA 3WNNA 2FGLA 2AAAA 1ECEA 5I6SA 3VIFA 2YL5A 4UFIA 3ALGA 3N17A 5ABFB 4JKLA 2CYGA 3PZUA 5HNNA 5GNXA 2D0GA 4LXFA 4HU8A 2CCRA 4W5ZA 2YA2A 1VEOA 4OUEA 3ARRA 2W61A 3WY1A 4BF7A 1DWHM 4WSKA 1PIFA 1E6ZA 3N11A 6TAAA 3LMYA 2VO5A 2VX5A 1XYFA 1HF6A 4WKHA 4R5EA 4HZ8A 3W25A 5E6YA 3EDJA 1CBGA 1EH9A 1E70M 3I3BA 3IAQA 2WCGA 4PMQA 4HP5A 1ZS2A 5E0CA 4H8HA 1V3IA 1MYRA 1W1YA 1UH4A 3W37A 4HOWA 2J25A 4OOUA 1KWGA 2E9BA 4Z2GA 1MXGA 2W91A 4QAWA 2WCSA 3O2LA 4UFHA 2O9TA 3OLEA 4FLRA 3E1F1 3B9EA 1FHLA 4C7GA 1OSEA 3W24A 5HOSA 3VNYA 1UH2A 5I77A 1MVYA 1GZJA 3BAIA 3VMNA 2WHKA 2J7CA 2ZWZA 2A3EA 5IFTA 2BY2A 3WD0A 3VD9A 1E9LA 4FLQA 1UWQA 4J3VA 4AWEA 4A4AA 3MANA 1BF2A 5HDRA 3VNZA 1K9TA 3AS3A 2D23A 1WDPA 1FP9A 3O6AA 4W84A 1NP2A 4AD2A 2JF7A 2O92A 4W5UA 2A3CA 3T2OA 2FDMA 3PZOA 2VTFA 1OT2A 1R7OA 4P8VA 3VVGA 4ATLA 5FCZA 1ZJAA 1BG9A 1YHTA 2W4XA 3CH9A 1HNYA 3CIVA 3VINA 2DSUA 1AVAA 2E4TA 2BS9A 1JGIA 4L4PA 2V3GA 3N12A 4B16A 4Z2HA 3II1A 5BXSA 1QVBA 2YL9A 5M03A 2VJXA 2C7FA 3VGHA 2G3JA 1WB0A 1UQYA 4DUWA 1JYXA 4UQEA 3CUHA 2G3NA 4UQBA 4BZYA 4AD1A 3VIOA 3SUWA 3VIKA 5CPQA 3WD1A 4K68A 4N42A 1TFVA 1UR1A 2OSWA 3EMCA 5HPCA 3KL5A 2ZUUA 4W7VA 4MJ4A 1UR8A 2BV9A 2D3NA 5EFDA 1Q4NX 4LX4A 4IPLA 1VEMA 2PI6A 3AQUA 4Q22A 1UYQA 4YN5A 1XSIA 3HU7A 3SCWA 3WENA 1JAEA 5A2CA 1AQMA 4ZENA 3LPFA 3MSGA 3RCNA 4UQCA 1E40A 1PEZA 4E2OA 9CGTA 2D3LA 5BRQA 3EDEA 2WC3A 2X0HA 5JIWA 1IT0A 2VL4A 4JHZA 6CGTA 1LLOA 3UERA 1U33A 3CHEA 1JD9A 3AXIA 4OIFA 4B3LA 4HOZA 1JYWA 2WVUA 4NF7A 4U3CA 2QF8A 3SCPA 1XHGA 2WVTA 2E8YA 4KH2A 5A95A 1DWJM 1BVZA 2IUZA 4F9DA 2WC7A 3MO4A 4H41A 3WF4A 4UR9A 4CU7A 4WKFA 1N82A 4Z2KA 2CHOA 1HP4A 3AJ7A 4HMCA 4HA3A 5I78A 4DWSD 1EO5A 1V3JA 2OWWA 1UKOA 3POCA 2Z1KA 2J7DA 1VFMA 5A6MA 2WM0A 1UD6A 3N1AA 3CPUA 2QPUA 2JFEX 2PC8A 1W32A 1UUQA 2JIEA 3IJ7A 3AYSA 1V3KA 4NRRA 4WSJA 2DT0A 3ZT6A 1WDRA 1OWQA 4U5KA 1BYBA 4PUDA 2WWDA 1H2JA 3WF2A 3BC9A 1HJWA 2WLYA 5BXPA 4JKKA 4BQ3A 1CXKA 1R86A 2WK2A 1JIBA 4DUVA 4QCFA 1E56A 2VQTA 3DYOA 1J0YA 4AZ6A 2VUYA 1W9UA 2RGMA 3SUTA 2VCCA 1NWSA 2CHNA 1M04A 2WBGA 1EA9C 2ZUMA 1TVNA 4JZ5A 3WIJA 3TTYA 3FHAA 3CTTA 1R7AA 1J01A 1ZBWA 4GQQA 2TAAA 1SFSA 4W8BA 5A8OA 1NARA 1OGGA 2A3BA 5JBEA 3CMGA 5CPSA 4C7FA 3OG2A 3DHUA 1XD1A 3IAPA 4D6JA 2J62A 1PZ2A 3T0DA 1VIWA 4W93A 2UWFA 1VJZA 2DH2A 5IFPA 3WUEA 2BHUA 3BAWA 3VDAA 5CLWA 3B9AA 3PZVA 3WD4A 1QW8A 3W29A 3KL3A 4F79A 3L4ZA 4W87A 4KWUA 1PAMA 3EYPA 1V0MA 1W9BM 2WW5A 1WZAA 4PUEA 1JYNA 1E73M 3VGDA 1JYVA 1V02A 2FGZA 1CIUA 4D1IA 1AQ0A 1UHVA 1QPKA 4X0NA 1W9VA 1ZBKA 2CIPA 4AEEA 1GQJA 2WMGA 4GI6A 4F8XA 1HVXA 2VC9A 2VMFA 1BLIA 3W27A 3CUFA 2XVPA 2QLYA 1CECA 4BS0A 1E4IA 2ZUVA 1C8QA 1QI4A 1UKQA 1KXHA 3ZIZA 1B30A 4RL3A 1KXVA 5E09A 1HKJA 4LYQA 3WBEA 1B0IA 1V6VA 1W2PA 1QHOA 2XUCA 1KB3A 4MDPA 1MFVA 3IANA 4BQ5A 1VBUA 2ZE0A 5I79A 2V3EA 4AD3A 1KGWA 5EBAA 3RILA 3RIKA 3VIGA 2CESA 1DEDA 2GJXA 1US2A 2XVLA 3WEOA 4V28A 3EMQA 5FIPA 4XZWA 4GPNA 3TOPA 1G0CA 3THDA 2GVYA 3KLKA 4PBGA 1WE5A 3KZSA 3ZO9A 3AIEA 2J8GA 2Q8XA 1WKYA 3DHPA 1JI1A 3GM8A 4J3UA 4CKQA 1E0VA 3ARXA 3GZAA 3A6OA 1LWJA 1G94A 1NOFA 3KE0A 4AYGA 3OIHA 3MUAA 2ZXAA 2RGLA 4AZ5A 3MU7A 1B3XA 1J0JA 1LL7A 3WDJA 1PX4A 1CNVA 1GQKA 4N0RA 4H8UA 1HL8A 1LL4A 3UG5A 1W3LA 2FHBA 3WDQA 2X1IA 2YOCA 4PSRA 2XGIA 1VF8A 5BXTA 1OB0A 1KWKA 2XVKA 4MNKA 2DT3A 3AIUA 2J7HA 3ARUA 5HBFA 2G4FA 1TR1A 2CPUA 1E4LA 1TVPA 3WNPA 1ZBCA 3GXMA 1MFUA 3THCA 4HMDA 2XFRA 4HZ6A 3S6TA 3GDBA 4HA1A 1SMAA 3VMOA 4EK7A 1V6XA 1LJYA 3BAKA 4NSBA 1CYGA 1RH9A 4QLKA 2XVGA 2CBVA 3GXIA 1GHRA 1E6RA 1QHZA 3HJEA 2ZX8A 1MW3A 3ARWA 5CGMA 3F5KA 1J0IA 3IJ8A 4AZCA 5D8WA 3SCTA 3CZGA 4H2CA 2BXYA 1E55A 1CGUA 2WMKA 1UWTA 4J7RA 4U31A 1BGAA 3OGRA 3EDKA 3GH5A 3AYRA 4S3KA 1BYDA 4X0VA 3PZ9A 1EDTA 3FAXA 1S46A 4OKDA 3HN3A 4QP0A 2GJXB 1GVYA 2VZSA 3L2LA 3U5UA 2DPEA 1B31A 1HJVA 3QOMA 3VUPA 1WCGA 5D8ZA 1JZ4A 5CLTA 4GQRA 4JIEA 2V3FA 1OIFA 4U2YA 1C93A 3FHQA 2WXDM 4R27A 1B3ZA 1XCXA 4P8UA 2FH8A 4JCMA 4M80A 1DWAM 5BXRA 4HOXA 4TVDA 1IZJA 2NW0A 1IV8A 2XHYA 1QI3A 4KRTA 5EB8A 4LYRA 2XWDA 5A6KA 4ZXLA 4UQAA 4CN6A 2JE8A 3ARYA 5DFAA 4P8XA 4JFTA 3RM4A 3S2CA 1UWSA 1F4HA 2PBGA 4B9YA 3PZNA 2BHZA 1G1YA 1VB9A 4J3XA 3BAXA 2ZOXA 3WH7A 2WVVA 3VOCA 1GORA 2PBOA 3VX1A 1IZKA 2O9OA 4PMUA 1WNOA 3L2MA 3QR3A 4JFUA 2X0YA 1ISVA 1R87A 2VX6A 1CGXA 1C8YA 1XSKA 3VD5A 2VRQA 4EKJA 3M46A 4UZSA 2WLZA 4AD5A 1I1WA 3ZT7A 4JFWA 1PX3A 3QHMA 1V08A 3F5LA 3ARSA 1E3ZA 3IJ9A 1KGXA 3GH4A 3OGSA 1JDCA 3QGVA 1CENA 1E43A 4CCDA 4PYSA 2XGBA 2FHCA 3ZT5A 2EJ1A 2X05A 2WSKA 4AXNA 2VT0A 4WK9A 2YDRA 3W0KA 4AZIA 2PWHA 1KCLA 2PWDA 4RE3A 1CXFA 1KXTA 3I3DA 3DYMA 2EQDA 1Q6CA 3KEHA 2CBUA 1CXEA 1UD2A 2XVNA 4BCEA 1KCKA 3EBVA 3NUKA 3K4DA 1JZ8A 3L4YA 5DO8A 3AIQA 2EBNA 4NI3A 3PHAA 4D1JA 3SCUA 4GZJA 2Y2WA 1UR2A 4EE9A 2DSVA 1CLVA 4GINA 1MXDA 2CITA 2GDUA 1CXHA 4IPNB 5IDIA 2MANA 4M8UA 3AMDA 4MB1A 1PIGA 1TG7A 3FAWA 3VD3A 4HMEA 4M29A 3WNKA 3SCVA 4D6GA 5D4YA 2PWEA 3RO8A 1V0LA 1CZ1A 2DH3A 3BXWA 5CG0A 3AXHA 3WDIA 5I0DA 2FHFA 3CO4A 2OYKA 1ZJBA 1DP0A 2XFFA 4HPHA 4IUGA 3RJXA 1J0HA 4XUYA 1W9PA 4LQ1A 4JCLA 2YL8A 3WH6A 2J7EA 2IXUA 3CUJA 5A8PA 2NT0A 4DWSA 1V6YA 3CMJA 3WDHA 1QI0A 1OT1A 1H0GA 1V0NA 1VFFA 5LA1A 3KWXA 1O6IA 2BY3A 2EXOA 2J47A 2WPGA 2ZUSA 2VCAA 3UG4A 4GZIA 4TUFA 3MUIA 5GQBA 3VIPA 1VFUA 2WKGA 2XG9A 3OLDA 3VMPA 4PMXA 5LA0A 3N18A 3A4AA 1HX0A 1KBBA 3NJ3A 1OD0A 1TMQA 3RM9A 1UD5A 2OWXA 1K9FA 1C90A 3M6DA 5BROA 3WMCA 3U7VA 1GPFA 4E8CA 3GH7A 1C7TA 4Z2JA 2WMHA 1JAKA 5DT5A 1JI2A 2OWCA 1J18A 3TTSA 4D6FA 5A1AA 1NP0A 1UD8A 5A6AA 1GOMA 1UH3A 3CLWA 3NSMA 4H7VA 3VIMA 3WDPP 4M81A 1UKPA 1ODZA 3VM5A 4AZBA 4KGLA 4CD5A 3FY1A 4HZ7A 1CGYA 1V3MA 2ZXBA 2NSXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5D9P A;  4D6D A;  5A2A A;  5A6B A;  2O9P A;  2G3I A;  4GI9 A;  1OM0 A;  1GVI A;  2UY4 A;  3APG A;  1JZ2 A;  2E3Z A;  2PB1 A;  4OOZ A;  1BSI A;  2DDX A;  2BFG A;  5A8Q A;  1V02 E;  2YIH A;  2XTK A;  3WMB A;  1GUV A;  1UKT A;  4M24 A;  4MNM A;  2C8N A;  4MAZ A;  3AFB A;  1W1P A;  2YDQ A;  1Y7V A;  2J74 A;  5A6S A;  5BYW A;  4C7D A;  5D9M A;  3J7H A;  3WDR A;  4CD8 A;  3AS1 A;  3OB8 A;  1EHN A;  4PN2 A;  1CDG A;  1MW0 A;  2XWE A;  4JL2 A;  1RD6 A;  1H3G A;  1CGV A;  2WHJ A;  2WZH A;  3EDD A;  1PJ9 A;  3W38 A;  1WO2 A;  3ZJK A;  1V3H A;  1Q6F A;  4MNL A;  1BYC A;  1DHK A;  2ZUW A;  3T2Q A;  5M5D A;  2XII A;  2J7B A;  4A3H A;  1XRV A;  3NDZ A;  4D71 A;  4MTV A;  2V38 A;  2V5C A;  4XX6 A;  8A3H A;  3CZL A;  4WJX A;  2G8Z A;  3VGB A;  3BGA A;  4UFK A;  7TAA A;  3T0A A;  1SMD A;  2XM2 A;  5IHR A;  4PCS A;  4UQ9 A;  1AQH A;  2ZWY A;  2W5F A;  4CU6 A;  2CER A;  5A6B D;  3LPG A;  1BYA A;  5A8N A;  2PF0 A;  2VZO A;  2BNJ A;  1W3H A;  1TA3 B;  3WF0 A;  1B9Z A;  4ATW A;  4J3T A;  4PMO A;  3W6M A;  3I3E A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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