3AIRA

Crystal structure of beta-glucosidase in wheat complexed with 2-deoxy-2-fluoroglucoside and dinitrophenol
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
491
structure length
491
Chain Sequence
GPVFTKLKPWQIPKRDWFDKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDMTNGDVAANSYHLYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPDGTGKVNQAGIDYYNKLINSLIDNDIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLNRQIVDDYKQFAEVCFKNFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGMDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVQLFKARYNMHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDMSPDFTPTLNTDDAYASSETTGSDGNDIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPVFITENGIADVEGDESMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWSLGYSSRFGLVYIDKNDGNKRKLKKSAKWFSKFNSVPKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Triticum aestivum
total genus 185
structure length 491
sequence length 491
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3airA00
2PC8A 4E8CA 1MW2A 3WUGA 1J0IA 1VB9A 1KWKA 1UWUA 5CQ1A 2XVPA 2O92A 1VJSA 2YKKA 3VINA 1ITCA 1EDQA 1KGWA 2WC7A 3THDA 3AS2A 5CXPA 4CN4A 1JDDA 1J9YA 1M53A 1SMDA 2WVTA 1HJXA 1E1FA 1CGUA 3VMPA 1UKTA 3AXIA 3TTOA 3ZMRA 4L4PA 5JBEA 1WZKA 3THCA 3FNDA 3L4WA 4J3VA 1VFFA 4AZHA 4Z2LA 1RD6A 3L4UA 2CEQA 4P7LA 4AD3A 2WKGA 4BCEA 3N11A 1PX4A 5D9NA 4HOWA 2JEPA 3DECA 4CCCA 4P8WA 1LLOA 3GNRA 4UFHA 4K68A 2XVGA 1VEOA 4QAWA 4PN2A 4AZGA 3AHVA 2Z1KA 5HXMA 1H0IA 4PMOA 4UFJA 4PUDA 1P6WA 2BY0A 4J27A 3VIKA 3M46A 3SUVA 3WDRA 1Q6FA 1BPLB 1KB3A 2OLHA 1WCGA 5I24A 2VZVA 2VO5A 4B15A 2UY5A 4M81A 4HMCA 1GOMA 2E40A 2BNJA 4AEEA 4WJXA 1LWJA 2J8GA 2VX6A 2JIEA 3NSMA 3OGSA 1Q4NX 4Q7NA 3U7BA 2JALA 4MB4A 2G3JA 4LQ1A 4KH2A 1NP2A 4TTUA 2WVVA 2DSZA 2J7FA 4M29A 1UUQA 2D1ZA 3N04A 5CZKA 1OSEA 3W6MA 3SUWA 2PBGA 3KL3A 1E6SM 3WQVA 2AOSA 2OWWA 4BQ4A 1CTNA 1MVYA 3BSHA 4A4AA 2J25A 3EDEA 2G4FA 1CZ1A 2BS9A 4CD6A 3RM4A 2PF0A 5AC5A 2BVDA 3WENA 1W3JA 3VM7A 2WHJA 3UERA 3AMLA 3QR3A 3M6DA 1XHGA 1OCQA 5M3WA 2QPUA 1UQYA 3K4AA 1FH7A 5A2CA 1QI2A 1CGWA 3GH7A 4GKLA 1UR4A 2CPUA 4LYPA 1HT6A 4H2CA 3WNLA 1SR0A 1UKPA 3WDPP 4OBSA 3N13A 2OWCA 3AZTA 1CENA 1E6RA 3SUSA 1NH6A 4AIOA 1HN1A 4CCDA 2QMJA 2E3ZA 3DHUA 1OD8A 1EQCA 4GQRA 3PZ9A 1K9FA 2ZXAA 2WHKA 2J7HA 1XCXA 1W1VA 4BF7A 1GQLA 4F9JA 1BVZA 1XD1A 4HMEA 4W85A 3VGGA 1JZ5A 1BYCA 3UG4A 3WQ4A 1F4AA 4DM1A 3CUFA 1OBAA 4PMXA 4URIA 3MV11 3VOCA 4N0RA 5GNYA 2X1IA 4PMDA 1JG9A 4U2YA 4HU8A 1TZ7A 2XYLA 3T09A 3IANA 1WZMA 3SCSA 2NSXA 5CG0A 2VVNA 3SEPA 1LWHA 1GW1A 5FL0A 3SURA 3LMYA 5HDRA 1K9DA 4JIEA 1EGZA 3VDBA 3K4DA 4TVCA 2W92A 1V02A 4LX4A 1VFUA 2HVMA 1UH4A 2PWHA 5E70A 3MMUA 4C7FA 3NJ3A 3KL5A 2VJXA 3QOMA 3VM5A 2D3NA 1J01A 4P8UA 1JDAA 1U33A 3KWXA 5M17A 5BWFA 2D3LA 1W9PA 1QNPA 4A3HA 2WMJA 4RE3A 2VZTA 1E0VA 2PBOA 2BV9A 4PEEA 1JIBA 1ZBKA 4B9YA 1E3ZA 1G94A 3ZSSA 4D1IA 2ZX6A 2DT1A 5C71A 3AIWA 5IFTA 1QHZA 4UFMA 2GJPA 3ALFA 1UR1A 4ACZB 3BAWA 2V3FA 5D9MA 1TVNA 3PZTA 3RPMA 4PTXA 4UZSA 4D6DA 4PUEA 3WSUA 1E15A 1FH9A 1ZB5A 4D6IA 3S2CA 3DHPA 1A47A 1HNYA 1K9EA 1JZ3A 1EDTA 3UR8A 2WW5A 3WIJA 4ZE4A 2EPKX 3VDCA 1ISVA 4AZCA 1C90A 3TOPA 1EA9C 2WZIA 3BCFA 2J74A 3ALGA 1AQ0A 1Y7VA 1A3HA 2CKRA 1GZJA 3AHTA 3ARUA 4IPLA 2XFFA 4F79A 2FDMA 3A3HA 5DO8A 2O9TA 2VNCA 2G3IA 3ZJ7A 2D0GA 1K6AA 5JIPA 1V6XA 4UQCA 2A3AA 4MAZA 3WBAA 3AZSA 5E6ZA 2WMIB 3BAJA 2YBTA 3QHOA 4ATDA 4WF7A 2VT0A 1C3FA 4W89A 2WK2A 1BSIA 4V27A 1TE1A 1E56A 3B9AA 1DWGM 4Z2HA 1TG7A 1UR8A 4U5KA 1BQCA 3WNNA 1UOKA 2VRJA 2XM2A 4UOQA 1V3MA 1E40A 2VR4A 4MNLA 1CGYA 1GVYA 2D22A 5GNXA 4JFSA 3EBVA 4HP5A 1E5NA 3IJ8A 4S3JA 4B9ZA 5AY7A 3II1A 1FFQA 4MAVA 2X0HA 4HU0A 3WFLA 9CGTA 4FMVA 1W32A 3F5LA 2BFGA 2XPKA 1E6ZA 1J0ZA 3RM9A 3VILA 3ZR5A 4E2OA 5I78A 1UD3A 2PI6A 3SCOA 1ZU8A 2W62A 1KCLA 4BZYA 3B8SA 1BGAA 3WMSA 3U5YA 1H1NA 4UQBA 4UNIA 5C8BB 1GONA 3TONA 1GJUA 4E8DA 4XV0A 3AXHA 1E43A 4HZ6A 3WH7A 3W82A 3ARZA 3QOKA 1EXPA 3WUFA 3CTTA 4JFTA 1G0CA 5D4YA 4AXNA 3VIGA 4PYSA 3D5HA 2VZSA 3AXXA 1E4LA 1OD0A 4MNJA 2J79A 1ITXA 1BYAA 3VGDA 3A4XA 2DGAA 2DPEA 2FH8A 3MUY1 4H8UA 2F2HA 4W93A 5A6KA 4UCFA 1UR9A 1B2YA 1HL9A 3QHNA 4P8VA 4ML4A 5A6AA 3DYOA 3CLWA 1UH2A 3N9KA 3GBDA 4NZCA 2ZOXA 3FHAA 4MPKA 3GZAA 3CUHA 5IFPA 2QF8A 4UQAA 4D6JA 1GHRA 2W63A 4NI3A 3BXWA 3AS0A 4YN5A 4MB5A 2ZUUA 2EPLX 3HJEA 3CUGA 4EANA 3BMVA 1E0XA 1NM9A 1UD2A 5A69A 2V5DA 1XSIA 2VRKA 3L4XA 3CGTA 1J0HA 1W2PA 4WSJA 4WSKA 4TTGA 5A8QA 1DWAM 3CZKA 1H0GA 1VRXA 3W26A 2ZX9A 1ISXA 3AYSA 1W2VA 3PN8A 1F4HA 2WXDM 3PTQA 5CGTA 5IXEA 1KXQA 1C91A 4IISA 1MFUA 1PIFA 1I1WA 3IJ9A 1BGGA 3SCQA 2DSKA 2GJXA 2F61A 4FK9A 3EYPA 1KCKA 3W4RA 1BFNA 4PMRA 3OLDA 4AZIA 3WL1A 3SCVA 2X05A 1CXFA 1HVQA 3MU7A 3BH4A 4NRSA 1IV8A 5A6BD 3WH6A 3POHA 1PJ9A 2Y8VA 2VMFA 2X0YA 2MANA 2UY4A 4MDPA 1HVXA 3AQUA 2CETA 2ZUMA 3CHFA 1DTUA 2V3EA 1GCYA 3W6LA 3WNPA 3N15A 2IXUA 4AEFA 2VCAA 5I0DA 4FLRA 4CU6A 1XV8A 1DWFM 2YDQA 4GZIA 5ABEA 1J11A 1NWRA 1PEZA 1XH1A 3SCTA 1M03A 2G8ZA 7A3HA 4F8XA 1IT0A 4LYQA 3CPUA 3L2LA 1JDCA 3T2PA 1V08A 1GQJA 1DP0A 4U2ZA 1V03A 2VURA 5CPQA 3AI0A 3CH9A 2BY1A 1AQMA 2DT0A 4GI6A 1V6UA 1R8LA 2WLZA 3OGVA 1CNVA 1NP0A 5BRQA 2JE8A 1JYVA 1JF6A 1N82A 4AD1A 1CGXA 4QLJA 5A6LA 3MKKA 1UA3A 2O9OA 2WVSA 5DT5A 4YHEA 2NW0A 3CZ8A 4TUFA 1E71M 3TTYA 2FGZA 3T0AA 1TFVA 3ARRA 3WY1A 1E73M 4J7RA 3PZGA 4JAWA 1LG2A 4LPCA 2BY3A 3BAIA 5HPCA 3EDJA 3VDAA 2A3HA 4DWSD 4GI9A 2GK1B 2V38A 1VFOA 4Y7EA 4PMYA 4HPHA 5BYWA 1WZAA 2VUYA 3PZQA 1CPUA 4NSBA 4P7OA 3W28A 1FHLA 4WKFA 3WDIA 1E6QM 1FHDA 3ZSTA 4DUWA 1Z32X 5I3DA 5CLWA 3F4VA 3AYRA 3UR7A 4LGXA 5FIPA 2V3DA 2A3EA 1VBUA 4AMCA 3ECQA 4CCEA 1W9UA 4UOJA 2QPSA 4F66A 1KXHA 3LPOA 4EK7A 2QLYA 2CYGA 3WF4A 1JZ8A 1E6XM 1TUXA 5EMYA 4PMQA 3FN9A 1CECA 3GH4A 1XCWA 3MO4A 3HMCA 3HU7A 4D6FA 3NUKA 3ARYA 4XX6A 2VRQA 4RE2A 2AAAA 2WLYA 1H11A 2CITA 3CBWA 4JCMA 1PX3A 3SCUA 3T2OA 1X6LA 2X09A 1JGIA 4Z2JA 3GM8A 2VZUA 4FLQA 1OGGA 5CSYA 3W27A 3NSNA 3ARPA 2WBGA 1WKYA 4J3XA 1BF2A 1JI1A 3I3DA 2ZUVA 3TTQA 4HA4A 2W5FA 2J47A 4M56A 4W87A 1G5AA 1MXGA 2J75A 2YOCA 1E6PA 3MANA 3VMNA 1V02E 3BCDA 3OG2A 1EIBA 1JAKA 2E8YA 4CD8A 2GSJA 1U30A 4JKKA 4PTMA 1NWUA 4GPNA 1FH8A 3WQ5A 2YDRA 1ZBWA 1JFXA 1B1YA 4FLOA 1OGSA 4JFWA 2VQUA 1XYZA 5ABFA 4R5EA 3T2QA 3CIVA 3G6MA 2XVNA 5A95A 1UZ4A 1CEOA 5LYRA 1OIFA 1ESWA 4GO8A 3WF3A 1GORA 2DSWA 3N12A 1C93A 4AW7A 1JYNA 3UETA 2DSVA 3ZIZA 1W1TA 4W8LA 3ARVA 1V0MA 4FF5A 5E09A 6TAAA 2AMGA 2ZUNA 1GJWA 1UWIA 2CHNA 3DYMA 2GJRA 2VX7A 2VR5A 4M8UA 3RDKA 1OIMA 1PX8A 1VEMA 3AISA 3SUTA 2WZHA 3OZPA 2QMKA 1IZJA 2XIIA 4PRWA 4AD0A 3K1DA 1UKSA 3OGRA 1CGVA 4H41A 2ESCA 3VD9A 2PWFA 2ZXDA 3ARSA 4W5UA 1UWQA 4RE4A 2CHOA 4LXFA 3WD2A 5CSUA 1GPFA 4W88A 1FFRA 4HPGA 1H41A 1UG6A 5E0CA 1J0YA 1CXEA 1H09A 3VD5A 3FAWA 1AMYA 5AC4A 3AIUA 5I77A 5KZ6A 3CZLA 1NQ6A 2YDSA 4AC1X 5A2BA 5TD4A 3PZVA 3IAPA 4GINA 1E4IA 1BAGA 1V3JA 4DWSB 4D6CA 1VJZA 2YBUA 3GNPA 3NDZA 5FD0A 3BC9A 3AZRA 1E5JA 1LL7A 3AIVA 1EOKA 2J62A 4JHOA 3WELA 3KL0A 4JZ5A 2BHUA 3OBAA 4PMZA 5EFFA 2E0PA 3MUIA 2DIEA 4CU8A 1ODZA 1WDSA 3MSGA 1QW8A 1G9HA 3AHXA 1C7SA 4HZ8A 4JFUA 2EPNA 3TTSA 4AD5A 4UQDA 1ZBVA 4CUCA 1HJSA 4IUGA 1HKKA 3AMDA 3BAKA 2C7FA 4H8VA 4ZE5A 4CD7A 4PTWA 3BAYA 3WQ6A 1GNXA 4MJ4A 3ZT7A 1M04A 2OSWA 4C7GA 3WNOA 2OWXA 5JBDA 3BLPX 4EAMA 1KGUA 5GQBA 2EO7A 1GQKA 2YA2A 2G41A 3MV01 1CYGA 2ZXQA 3ZO9A 2W66A 2EXOA 2XWEA 4MNMA 4D72A 1B90A 1UD6A 4GZEA 4X0VA 3ZJKA 4HTYA 1EO5A 2NT1A 3LPPA 2DT2A 1QW9A 2NT0A 4JL1A 3WDHA 1UR0A 2QV4A 1JZ2A 1LG1A 5AYBA 1B0IA 1VFMA 3CHDA 1QHPA 1B3YA 4TX8A 3NCOA 3U5UA 5M03A 1EQPA 3AROA 2IUZA 1ZBCA 3K8MA 4KRUA 4UQEA 2WSKA 2WVVB 3SUUA 6CGTA 3PZIA 2FHBA 1Q6EA 1VAHA 3RILA 2DEPA 1V3LA 3MMDA 3K8LA 1J0KA 1JI2A 2XUCA 3AIEA 5BXSA 4ATWA 5LA2A 3KEHA 1H5VA 2XHYA 3VIJA 1M01A 4KWUA 1E6NA 2YIHA 1ZJBA 4H04A 3K46A 1CXHA 3WEMA 3CMJA 4CN1A 1DHKA 1AVAA 3UCQA 1JD7A 5IHRA 1NARA 2VZOA 2RGLA 3CUIA 3WDJA 1XSJA 4J28A 1V3HA 3GBEA 2Z1SA 3GH5A 1WNOA 4AD4A 4B3LA 2GVYA 4QCEA 3U7VA 5JBFA 3GXIA 4KMQA 4JHZA 2PB1A 2WHLA 5I79A 3G6LA 5BCAA 1E9LA 1TA3A 4UFLA 1US3A 3VD7A 3EMQA 5A8NA 2VC9A 2ZX7A 2Y24A 3VX0A 4B3KA 3VDHA 2CXGA 3L4VA 3WD1A 4PTVA 5DMYA 3L2MA 2XFRA 2BXYA 1XD0A 5BXRA 2Q8XA 3OLEA 5HNNA 3DC0A 1HXJA 2WYSA 4KGJA 2E9MA 2ZX8A 1ISZA 2WMHA 4JKMA 2CBVA 1QBAA 3EDKA 4P7QA 3J7HA 3WNMA 1YHTA 4DUXA 2JFEX 3WF2A 1QVBA 1PZ2A 3T0BA 3MMWA 3TP4A 2ZICA 2WSPA 4W8AA 5FCZA 4MB3A 1YQ2A 4Z2GA 3GYCA 4PMVA 1J0JA 3B9EA 4P8XA 4X0NA 5A3HA 3AICA 5CPTA 3VGEA 2J7DA 4YHGA 2Y4SA 3VVGA 1HKMA 1QOXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2PC8 A;  4E8C A;  1MW2 A;  3WUG A;  1J0I A;  1VB9 A;  1KWK A;  1UWU A;  5CQ1 A;  2XVP A;  2O92 A;  1VJS A;  2YKK A;  3VIN A;  1ITC A;  1EDQ A;  1KGW A;  2WC7 A;  3THD A;  3AS2 A;  5CXP A;  4CN4 A;  1JDD A;  1J9Y A;  1M53 A;  1SMD A;  2WVT A;  1HJX A;  1E1F A;  1CGU A;  3VMP A;  1UKT A;  3AXI A;  3TTO A;  3ZMR A;  4L4P A;  5JBE A;  1WZK A;  3THC A;  3FND A;  3L4W A;  4J3V A;  1VFF A;  4AZH A;  4Z2L A;  1RD6 A;  3L4U A;  2CEQ A;  4P7L A;  4AD3 A;  2WKG A;  4BCE A;  3N11 A;  1PX4 A;  5D9N A;  4HOW A;  2JEP A;  3DEC A;  4CCC A;  4P8W A;  1LLO A;  3GNR A;  4UFH A;  4K68 A;  2XVG A;  1VEO A;  4QAW A;  4PN2 A;  4AZG A;  3AHV A;  2Z1K A;  5HXM A;  1H0I A;  4PMO A;  4UFJ A;  4PUD A;  1P6W A;  2BY0 A;  4J27 A;  3VIK A;  3M46 A;  3SUV A;  3WDR A;  1Q6F A;  1BPL B;  1KB3 A;  2OLH A;  1WCG A;  5I24 A;  2VZV A;  2VO5 A;  4B15 A;  2UY5 A;  4M81 A;  4HMC A;  1GOM A;  2E40 A;  2BNJ A;  4AEE A;  4WJX A;  1LWJ A;  2J8G A;  2VX6 A;  2JIE A;  3NSM A;  3OGS A;  1Q4N X;  4Q7N A;  3U7B A;  2JAL A;  4MB4 A;  2G3J A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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