3AIRA

Crystal structure of beta-glucosidase in wheat complexed with 2-deoxy-2-fluoroglucoside and dinitrophenol
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
491
structure length
491
Chain Sequence
GPVFTKLKPWQIPKRDWFDKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDMTNGDVAANSYHLYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPDGTGKVNQAGIDYYNKLINSLIDNDIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLNRQIVDDYKQFAEVCFKNFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGMDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVQLFKARYNMHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDMSPDFTPTLNTDDAYASSETTGSDGNDIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPVFITENGIADVEGDESMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWSLGYSSRFGLVYIDKNDGNKRKLKKSAKWFSKFNSVPKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Triticum aestivum
total genus 185
structure length 491
sequence length 491
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3airA00
5FCZA 5JIWA 3EMZA 3CHCA 1PIGA 1B30A 2ZUNA 3WH6A 5EFFA 3T2QA 1C90A 1K6AA 5HPOA 3EDFA 5ABHA 1QHOA 4DUWA 1TMQA 2VL4A 2D0HA 2WWDA 5A2AA 1XH2A 3SCRA 2J4GA 4CD6A 2XSBA 3WUBA 5E0CA 1UOKA 5DO8A 1QBAA 4GIAA 2DSKA 3OGRA 4TVCA 5ABFB 5A8NA 3B8SA 1EDGA 1JD7A 1E6NA 2Z1KA 4M81A 4XZBA 2XFYA 3NSMA 3OG2A 2D20A 4ZE5A 2FDMA 1W3HA 4AIOA 1TFVA 3ZT7A 1ZBVA 2EPLX 1KCLA 5HDRA 1OGGA 3ALFA 4P7RA 1CWYA 3EMQA 2WXDM 1EOMA 1OB0A 1ODUA 2X0YA 2G4FA 2X09A 5I23A 2CESA 2OSYA 3N17A 4L4PA 3FNDA 3GH7A 4U2YA 1QNOA 3BLKA 1JZ4A 2BVTA 4TX6A 3POCA 1VB9A 1WZMA 1CZ1A 1C93A 4QP0A 2BHZA 3ARRA 5A2CA 1US3A 3FAXA 3WF1A 3VGHA 2W62A 4H2CA 1VENA 3KE0A 5IFPA 3W6MA 2XIBA 3VGFA 3MV11 1E1FA 2J79A 1A47A 3CMGA 5EFDA 2CITA 2J75A 2PBGA 2GUYA 1Q6EA 3F5KA 3ARQA 1LQ0A 4UOZA 4EAMA 4IUGA 1R7OA 2C7FA 3IK2A 4J3XA 3N04A 3TONA 4AD3A 1H0GA 3LPFA 2WHLA 1H5VA 4W84A 4JKKA 3W81A 5A8PA 1E73M 1TE1A 2W63A 4LGXA 1HJSA 4A3YA 3T2PA 2ZE0A 3VUPA 1QNRA 3U5UA 1GQJA 1Q4NX 4AEFA 1BVZA 3M7SA 3VO0A 3BAIA 3VIFA 4JZ5A 3CHEA 3GH5A 1E43A 1P6WA 1EOKA 2E8ZA 2JE8A 2NT0A 5A94A 4HU0A 4CCEA 2ESCA 6A3HA 1JF6A 2IUZA 1IV8A 1HKIA 2BHYA 4JL2A 4S3JA 5IXEA 1XV8A 3WDQA 5D8ZA 4D6DA 1WE5A 1BYCA 4HPGA 1CIUA 4M24A 4PSRA 1GOOA 1XSKA 1X1NA 2XVLA 4M82A 4W85A 3EMCA 4AD2A 3J7HA 3WEOA 1LL6A 2B31A 1V6VA 1X6LA 2CKSA 3BH4A 1VJSA 4E2OA 3WENA 4W87A 1H0IA 4PMYA 4A4AA 1R86A 2W4XA 1E6ZA 1E4MM 3MMWA 1JYXA 1ISYA 1HKJA 1SR0A 1LWJA 3SUTA 1CECA 3FAWA 5CLWA 4AY1A 4V27A 1GZJA 1MXGA 5EMYA 3U7VA 1AQMA 1V3MA 5BXRA 1QI4A 3KL3A 2VR5A 2YDSA 2ZX6A 3PHAA 2DT3A 3MUIA 1E6PA 2VRQA 2QPSA 3FY1A 3M46A 3W26A 5DT5A 3ZT6A 2WPGA 2D1ZA 2GJXA 1GJUA 2WZHA 3ARYA 1GHRA 1CLXA 2XGBA 3AROA 1ZBCA 3T08A 1CGUA 4H8VA 4HZ6A 4KMQA 4HPHA 5CGTA 3OZPA 2VX5A 2WZEA 3CO4A 2X05A 3WUEA 5BWFA 1V3LA 4PUEA 2UY4A 3TP4A 5A6LA 2XGIA 4EKJA 1HL8A 2DH3A 1US2A 1XHGA 1C91A 1WDSA 1UWQA 3G6LA 3NDZA 3I3BA 5A2BA 1BFNA 1E70M 3RCNA 3VVGA 3I3EA 2WC7A 1IT0A 2NT1A 2ZWZA 1KWKA 3RJYA 1MW0A 1LLOA 1WDPA 4KH2A 4HOWA 3VPLA 4AZ7A 2YA0A 2BFGA 4W8LA 3POHA 2JIWA 3M6DA 1BPLB 1VFUA 1Y7VA 3D5HA 1J9YA 1W9DM 4E8CA 4D6FA 1YQ2A 3VD7A 3WUGA 3W29A 5JUVA 1EA9C 4X0VA 4RE3A 4PCSA 3VIGA 1C8YA 1EHNA 1JYVA 1E56A 3OLDA 1N82A 3QGVA 4GO9A 5A6MA 4JAWA 1JXKA 2V3DA 4BF7A 4DWSA 3BSGA 1BYBA 2D23A 1KBBA 3WNOA 4AZCB 2GSJA 1I1WA 2DIJA 4FMVA 4MNLA 2WKGA 1W9VA 4RE4A 1A3HA 1HIZA 4MTVA 1DWFM 3FHAA 2BY0A 3WSUA 3AISA 1VBRA 1LG2A 1UWTA 2VCCA 3FXYA 3WEZA 4QAWA 1RPKA 3ARWA 2ZIDA 1U33A 4KGJA 3KZSA 1LWHA 5CZKA 4P7QA 3VDCA 2VUYA 1WP6A 3VIOA 1TUXA 1KCKA 2OLHA 2V3EA 2E3ZA 2J7GA 1OT1A 3K4AA 3WQVA 5A6JA 3W4RA 3CZJA 2PWDA 3TTYA 4PMXA 2WVTA 2ZXQA 2Y8VA 3NYDA 1E6XM 3SUWA 4PRWA 1V3KA 3WIJA 2YIHA 1ISVA 1DWAM 1RD6A 3MANA 1JIBA 4PCTA 3VIKA 2WANA 3MUY1 4DM2A 1GQKA 4ATLA 3IJ7A 1WZAA 5DEZA 1CYGA 3K8LA 1NOFA 1E4IA 4D6IA 3T0DA 3WKZA 4FLOA 2VC9A 2O9RA 4MDPA 3AHVA 1FHLA 4CVWA 4Z2KA 2CHNA 1K9DA 1V0MA 2FH8A 4PMOA 3D3AA 5KZ6A 3TTQA 1MFUA 7CGTA 4F66A 4ACZB 1QI3A 4CD7A 5DMYA 1M03A 1GUVA 2W91A 3VD5A 2J62A 3ZSTA 4PTWA 2VRJA 1UWRA 1HN1A 1ZBWA 2DT0A 4AC1X 1JNEA 1TVPA 3WBAA 3GNRA 1CXKA 4J3WA 3VDHA 3VMOA 3WQ5A 3L2LA 2VOTA 2WMKA 4OKDA 5I79A 4IPLA 3CZGA 4F79A 3CTTA 2OSWA 5E0FA 2A3EA 5FIPA 2BV9A 4AYSA 5IHRA 3NSNA 1ISXA 1DP0A 1HL9A 4M1RA 3APGA 3OA5A 3W0KA 4N42A 3W27A 3MMDA 3ZJ7A 1QVBA 2WAGA 3EYPA 2YBUA 4BQ2A 1UH2A 2EJ1A 1GOMA 3CGTA 3WNPA 5FKYA 4QFUA 1QBBA 1HXJA 2J25A 1WB0A 3PZQA 1OSEA 2UY5A 3G6MA 1E5NA 1E72M 2CERA 4MPKA 4UOQA 8CGTA 4MB1A 1Q6CA 3E1F1 1I75A 4FF5A 5LA1A 3MV01 3VGGA 2ZUMA 2E8YA 5CPSA 2G8ZA 2G3JA 5M03A 1M53A 1HNYA 1KGXA 3WDIA 2VQUA 4D71A 1JYWA 2F2HA 3N12A 1AQHA 3ZJ8A 4LX4A 3ARTA 4CGTA 5E70A 2F61A 2WSKA 4J3SA 2XVNA 1K9FA 2WCAA 3MUZ1 4FLQA 3RMEA 2WM0A 5A3HA 3BAKA 1BTCA 1SMAA 2YLLA 5E6ZA 2DQXA 3L4WA 4PTMA 5GNZA 3WF2A 2EPMX 4OUEA 3WNNA 4WSKA 2UWFA 5FD0A 4D6JA 1EQCA 4KGLA 1EQPA 1BYDA 1TZ7A 2CETA 3AMDA 3GH4A 1XSIA 1UZ1A 1C8XA 3VGDA 3L4ZA 1J18A 4Y7EA 2G3NA 5D9NA 2XTKA 2EBNA 1R85A 4GZJA 3THDA 1J0ZA 1ZL1A 4DWSB 5F7UA 2CNCA 1BLIA 4RL3A 3WNLA 5A95A 2XYLA 2WMGA 3GZAA 4QLLA 1J0KA 1HJWA 4ATWA 2XJ7A 4OJYA 2Y8KA 3WQ6A 1BGAA 2FHFA 1HF6A 2WHMA 2FGZA 3WH8A 1X6NA 3SCTA 3VMPA 1UWSA 2ZXDA 4HU8A 4N0RA 1ZJBA 3QHOA 3K8MA 4CU8A 1ITXA 1UQYA 3CH9A 5E09A 3II1A 1LF1A 2A3BA 5AY7A 2VJXA 1OINA 1QHPA 2VZUA 3T2OA 1CDGA 1ODZA 2CBVA 1UKOA 1E0VA 4H04A 3VIHA 2BHUA 2G3MA 1UQZA 4WIWA 1QW8A 1QI0A 2WHJA 1OD0A 2VX4A 2YBTA 3AYSA 4CCCA 2VCBA 4F8XA 1BAGA 1OBAA 1H41A 1UR9A 5ABGA 5GQBA 2OYKA 3VINA 3WDHA 4DM1A 5LYRA 2ZX9A 4GI6A 1W1YA 5CQ1A 3MKKA 3AIQA 3UEQA 1W1PA 4CU7A 2DGAA 3PZ9A 3BLPX 4LXFA 2Y2WA 5FL0A 5A6AA 1GQLA 4JCLA 3CUIA 4U5KA 1EDTA 4PBGA 4J3UA 2RGMA 3PTKA 3UCQA 1Q6GA 2W92A 4UZSA 3AMKA 3DYMA 4OOZA 4TOQA 3F4VA 2WHKA 3DC0A 1KGWA 3MU7A 1EO5A 3UG3A 4GKLA 4UFJA 1V6UA 3OLEA 3IJ8A 1WAWA 1JL8A 1KXQA 1RP8A 5AYBA 1EGZA 4JL1A 2XFFA 3RILA 4J7RA 2ZICA 1WKYA 3AIWA 2J7EA 3EBVA 1XCWA 5HPCA 2WC4A 3UR8A 4Z2LA 1DWHM 1OD8A 4AZCA 4IPNB 3WUFA 5C71A 4PMDA 1JZ7A 1VIWA 1ZB5A 2DPEA 2WLZA 1BYAA 1CXHA 2PI6A 3KL0A 1V03A 1B3XA 3OIHA 1EDQA 2VI0A 3W53A 1WO2A 3W82A 3W28A 3SURA 3ZJKA 1JZ8A 4UQAA 4B9ZA 1CBGA 3SCOA 1JDCA 2PBOA 4PTVA 2YDQA 3WNMA 1XYFA 4HA1A 3QOKA 3W25A 4GQRA 1MXDA 4NI3A 3WF3A 1J11A 3OLIA 1VBUA 2XHYA 1G1YA 1SYTA 4X9YA 3B9EA 2X8RA 4J3TA 3VIJA 1GOQA 4AZ5A 2ZWYA 1J12A 3WF4A 1UH4A 6TAAA 1W91A 1GQIA 3CZKA 2J77A 3O6AA 1NWRA 1HT6A 4MDOA 3DECA 3KWXA 4PMNA 4CD8A 1ESWA 1XH1A 1JDAA 4EK7A 4FLSA 3KL5A 3VIPA 5HNNA 4FLRA 4JKLA 3VTRA 3ARPA 3CUHA 4EANA 1JI2A 1B3ZA 4ACZA 2V5DA 1GVYA 3TTOA 4M8UA 1FH7A 3GBEA 4PUDA 4MAZA 4GZEA 2VX6A 2CBJA 4TVDA 4QCEA 4BQ3A 2GJPA 3WMSA 1O6IA 2QMKA 3ZR5A 4XUYA 4HZ8A 2YDRA 4AXNA 2BXZA 2Q8XA 3VGEA 2CHOA 2EPKX 2F8QA 2CEQA 1WZKA 3WFLA 4AD4A 2DH2A 2X0HA 3BAYA 3VOCA 3WH5A 1PPIA 2FGLA 4NRSA 4Q22A 3WDJA 2FH6A 4U33A 2YA1A 4TTUA 4B15A 1L8NA 1WNOA 4H8HA 5IFTA 1O7AA 4WKFA 3W37A 4W88A 3BAXA 3MSGA 2IXUA 4L4OA 3W6LA 2X1IA 1VRXA 2VR4A 3WQWA 4JHOA 3PZVA 1E4NA 1V6XA 2DSWA 2VNCA 2WCGA 2D0FA 1MW2A 2WB5A 3OLGA 1R7AA 4R27A 4UFMA 1FH8A 4IM4A 2PWHA 2YKKA 4LYQA 2FHCA 2XFRA 1JG9A 1LJYA 2WSPA 4NZCA 3CHFA 4AZHA 1MYRA 2WVVA 3S2CA 2OWWA 3DHUA 2WMFA 2PWEA 5A8MA 4D6EA 3A6OA 2VZOA 3A3HA 3AYRA 3GNOA 4A3HA 3GYCA 1UR8A 2GFTA 4AW7A 3NSXA 4JFWA 4CD4A 3T0BA 1CTNA 3L2MA 1EXPA 3SCNA 1OIFA 1XGZA 2W5FA 3BC9A 2NW0A 4NRRA 2GDVA 2CCRA 2ZUUA 1NP0A 3FHQA 1GVIA 3WH9A 1V02A 4KRTA 3GXDA 2ZOXA 1W9PA 1B0IA 3VGBA 4UQDA 5E9AA 4MADA 2XWEA 2DT2A 2G3IA 1QPKA 2J7HA 1I1XA 4P8UA 2ZX5A 4PTXA 4GI8A 4FK9A 1JDDA 1KWGA 1MQQA 1Z32X 4AIUA 3TA9A 5E6YA 4IISA 3S6TA 1KXVA 2WLYA 1R8LA 4JFTA 1EIBA 1CXIA 1HP5A 2BY1A 3L4UA 4MNKA 1M01A 5A1AA 3SUSA 3ZOAA 5ABEA 3T0AA 5D9OA 3SCSA 2D22A 3MMUA 3GBDA 5M17A 5I77A 4MB4A 1JD9A 1SMDA 1V3HA 3THCA 4MNJA 1OT2A 2XVPA 3CZEA 2WVUA 4B3LA 2VO5A 2VMFA 3AHXA 2YL5A 1UUQA 1TVNA 3QHMA 4UOJA 2BXYA 3OGVA 1GCYA 1JXJA 3ARSA 3A47A 5FL1A 2E9BA 4TVUA 2D0GA 2VURA 2XUCA 3AMGA 4W5UA 3QHNA 3UERA 1NP2A 2ZUSA 4GXPA 4P8WA 2VVNA 2C8NA 2OWXA 5AC5A 1JAKA 5BROA 1W9BM 2WCSA 3WDRA 3WMCA 3AOFA 1E71M 3M07A 4HOXA 5HBFA 1DWGM 5BYWA 4LPCA 4B9YA 3MUAA 1JNDA 5I0DA 4JFVA 3IJ9A 4EE9A 1JGIA 1OIMA 3RPMA 3WD4A 3IAQA 3WELA 2CKRA 1J0JA 1HVXA 2MANA 3OZOA 3VMNA 4JFUA 4JKMA 3VM7A 4CKQA 2O92A 3VIIA 4CN6A 1BSIA 1Q6DA 1M04A 4HA3A 5TD4A 3AMLA 1OGBA 3N1AA 3FN9A 2VT0A 3ZQ9A 3TTSA 2QF8A 1NWTA 3WN6A 2WKLA 2WYSA 4WK9A 1MFVA 1IZKA 1CXFA 1AQ0A 5GPRA 1UHVA 1CXLA 2DT1A 2UY3A 4WKHA 2ZUVA 3AHYA 4UQCA 3DHPA 1UD8A 1DHKA 1FP8A 3BAJA 2GDUA 4MB3A 3WDPP 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5FCZ A;  5JIW A;  3EMZ A;  3CHC A;  1PIG A;  1B30 A;  2ZUN A;  3WH6 A;  5EFF A;  3T2Q A;  1C90 A;  1K6A A;  5HPO A;  3EDF A;  5ABH A;  1QHO A;  4DUW A;  1TMQ A;  2VL4 A;  2D0H A;  2WWD A;  5A2A A;  1XH2 A;  3SCR A;  2J4G A;  4CD6 A;  2XSB A;  3WUB A;  5E0C A;  1UOK A;  5DO8 A;  1QBA A;  4GIA A;  2DSK A;  3OGR A;  4TVC A;  5ABF B;  5A8N A;  3B8S A;  1EDG A;  1JD7 A;  1E6N A;  2Z1K A;  4M81 A;  4XZB A;  2XFY A;  3NSM A;  3OG2 A;  2D20 A;  4ZE5 A;  2FDM A;  1W3H A;  4AIO A;  1TFV A;  3ZT7 A;  1ZBV A;  2EPL X;  1KCL A;  5HDR A;  1OGG A;  3ALF A;  4P7R A;  1CWY A;  3EMQ A;  2WXD M;  1EOM A;  1OB0 A;  1ODU A;  2X0Y A;  2G4F A;  2X09 A;  5I23 A;  2CES A;  2OSY A;  3N17 A;  4L4P A;  3FND A;  3GH7 A;  4U2Y A;  1QNO A;  3BLK A;  1JZ4 A;  2BVT A;  4TX6 A;  3POC A;  1VB9 A;  1WZM A;  1CZ1 A;  1C93 A;  4QP0 A;  2BHZ A;  3ARR A;  5A2C A;  1US3 A;  3FAX A;  3WF1 A;  3VGH A;  2W62 A;  4H2C A;  1VEN A;  3KE0 A;  5IFP A;  3W6M A;  2XIB A;  3VGF A;  3MV1 1;  1E1F A;  2J79 A;  1A47 A;  3CMG A;  5EFD A;  2CIT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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