3AIVA

Crystal structure of beta-glucosidase in rye complexed with an aglycone dimboa
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
486
structure length
486
Chain Sequence
VFTKLKPWQIPKRDWFSKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDGTNGDVAANSYHMYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPNGTGKPNQKGIDYYNNLINSLIRHGIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLDKQIVNDYKYFAELCFQSFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGLDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVELFKAHYNKHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDISSDYTPTLNTDDAYASSETTGSDGNEIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPIFITENGIADVEGDPEMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWGSGYSSRFGLVYIDKEDGNKRKLKKSAKWFAKFNSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Secale cereale
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
total genus 186
structure length 486
sequence length 486
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aivA00
6TAAA 3ALFA 2E8ZA 4HMCA 1EQPA 3N12A 3GXMA 1JF6A 1JI1A 2EQDA 1R85A 3W6LA 4YN5A 3CBWA 1XHGA 1UR9A 1A3HA 4C7DA 1BAGA 3MUY1 1VF8A 3VIMA 3WD1A 2YKKA 4MAVA 2Z1SA 1TCMA 1OWQA 4F9JA 5A8PA 3L4XA 1NQ6A 1PPIA 5ABGA 2C8NA 3WNMA 3SCTA 4PTVA 3FY1A 1KGWA 2VOTA 3EMCA 4AD4A 1FFRA 1UWSA 1WNOA 2X1IA 1I1XA 3AHYA 4F66A 1NWRA 1E56A 1UR8A 3FW6A 2EXOA 5I6SA 1WZLA 5A8OA 3MSDA 1FFQA 2BXYA 4GZJA 3UESA 3T0AA 4J3WA 2VURA 4DM1A 4X0NA 1GVIA 1ZL1A 4PSPA 1FH9A 4Z2KA 2VX7A 4UFLA 2XFFA 2J7CA 3VD7A 2VX4A 2WMIB 4F9DA 3WL0A 3ARQA 3VD3A 3WH6A 4PTMA 4P8UA 1NARA 3UETA 1PBGA 1HIZA 2ZUSA 3BGAA 4CD7A 1W1PA 4ML4A 3WQVA 4ZENA 1JXKA 4HZ7A 4M82A 3VPLA 3WBEA 1KXQA 1EH9A 4AZHA 3MUAA 4MNLA 1F4AA 3AOFA 1EDGA 3OZOA 3SCRA 1E6QM 3G6MA 2VC9A 2WMHA 3L4YA 1H4PA 3W53A 6CGTA 9CGTA 1VFMA 3K4DA 4CU7A 3MANA 2DH2A 3UERA 5A8NA 5AY7A 3AIVA 5EBAA 3PHAA 2PI6A 1JYVA 4DM2A 1UWQA 4TVUA 3WH9A 3WQ6A 5AC4A 2G4FA 1V6WA 3VOCA 4RE3A 5IXEA 5A6KA 4W8BA 5AYBA 4OOUA 4B3LA 4OZOA 3OGRA 4K68A 3HU7A 1B1YA 1MW1A 1OGSA 4FK9A 4UQDA 3O6AA 3AI0A 4D1IA 4MJ4A 1JZ5A 4D6HA 2Y8VA 3VD5A 1Z32X 1C7TA 1FHDA 5IHRA 2VJXA 1WCGA 4PCSA 4PRWA 1CGWA 3NSNA 3SCWA 1UD2A 1GHSA 3AICA 1IZKA 2DSUA 1ISVA 1ZBWA 1UWTA 4UTFA 3TOPA 4M81A 3FHQA 2BV9A 4NZCA 3KL5A 3BCFA 3T2PA 3OG2A 4FLOA 2GJXB 1VFUA 1KGUA 2V5CA 1W9XA 3VM7A 2E8YA 1JAEA 3OLDA 2DSKA 3PTQA 4W89A 4ATWA 1J11A 5GPRA 3AZSA 1UOKA 2FHBA 2ZXAA 2BHYA 3NYDA 1G01A 4UNIA 3CPUA 3VNYA 1NWUA 1R8LA 1W3KA 3VGBA 4ZXOA 4GQRA 2BHZA 3CIVA 3FXYA 1E15A 2W91A 1ISZA 3JUGA 4XUYA 1SFSA 4YHEA 2BNJA 3BSGA 2ZUVA 4ZE5A 2Y4SA 4V2XA 5A69A 3VGHA 3WF4A 4AZBA 2VVNA 2WK2A 5KEZA 3F4VA 3L4ZA 5D9PA 3KEHA 2D0GA 3BCDA 2UY5A 3WEZA 2E9BA 4ACYA 1NOUA 4IM4A 4AZ6A 1KBBA 2OSXA 1C91A 1BF2A 3EDEA 3WUGA 2WANA 1HJXA 2VTFA 3EMZA 2EPMX 1E4MM 4GQQA 1GOWA 1JXJA 2CPUA 5I77A 4EANA 2VRQA 3M46A 2OSWA 1WZKA 2VO5A 1V6XA 2VVSA 4BQ3A 1E43A 4KRTA 3WMSA 1X1NA 1NOWA 2PB1A 1CLXA 4JFUA 1E6ZA 2BY0A 1E1FA 4W7WA 1E4LA 4KMQA 2J7FA 2XIIA 2E9MA 3AMKA 3VIOA 2ZUUA 3K1DA 3GH5A 4RE2A 3GTNA 1MW0A 4CD8A 3DHUA 1V0LA 1WPCA 5EFDA 2GUYA 4GINA 4CU8A 4GI6A 3ARZA 1KFWA 4WKHA 2GFTA 1JG9A 5M5DA 4AIUA 3ZJ7A 1ECEA 3N15A 4MTVA 2A3EA 4YHGA 3AISA 2ZX8A 1E9LA 4HOXA 4EK7A 4J3UA 1PAMA 2VQUA 4OOZA 2F61A 4J3SA 3VILA 3CZGA 3F5JA 4UFIA 3EDKA 1W9VA 5GNYA 4XZBA 4LPCA 4WLCA 3RMEA 3L2MA 3BH4A 5DO8A 4OBSA 3S6TA 1FP8A 4W8AA 3WUFA 1H0GA 2FDMA 4AIEA 2ZWZA 4D72A 1VAHA 2ZUNA 2QPUA 2VRJA 1V02A 1J10A 3OLGA 7CGTA 3LPFA 2AMGA 4D1JA 1AQHA 3WF3A 4J3TA 2ZUMA 4AD1A 4CCCA 4PMVA 5LA0A 3AMLA 1AVAA 3SCNA 1CPUA 3VX1A 3I3EA 5ABFB 1GVYA 4CKQA 3LPGA 3CGTA 3NDYA 5BWFA 4Z2IA 1XSJA 3WEOA 4AEEA 2WYSA 5HNNA 2WMKA 3G6LA 3KWXA 4AYSA 3UCQA 1UUQA 1C92A 1BLIA 2WLZA 4HA1A 2OWXA 2DIEA 1M7XA 5I0DA 3WH5A 2E3ZA 4TTGA 1JDDA 1OCQA 1VIWA 3AS1A 3VMPA 2UWFA 4MNMA 1UH2A 1ZBCA 2VZVA 3UEQA 3AZRA 3F5LA 4JZ5A 5E70A 3WSUA 1OD0A 4IPLA 3WUEA 2OWWA 1QHPA 1W1TA 2XYLA 5M17A 1VRXA 1XYFA 2BS9A 4MAZA 4KGLA 2BXZA 3D3AA 4PMQA 1UKTA 4QLJA 2D20A 5IFPA 4B3KA 4Q7NA 3LMYA 3MMWA 5A2BA 1MXGA 2J75A 3MSGA 3M07A 1Q6EA 4JCLA 4J3VA 1OBAA 4P7RA 3GM8A 4MADA 4WIWA 3DC0A 1HP4A 1KR1A 1PJ9A 4QDMA 4AD0A 1BFNA 5E6ZA 5LA2A 2QHAA 2XSAA 2VUYA 2EO7A 3OZPA 3VU2A 3WD4A 4HU8A 5E6YA 1C7SA 2CNCA 4H8VA 4MB1A 1QI0A 3OLIA 5CQ1A 2CBVA 3T09A 3ZJKA 2WZEA 4AXNA 4A4AA 4D6IA 4M80A 4KWUA 3E1F1 2XWEA 1BVZA 3WD2A 2XG9A 1HJUA 3VDAA 3BAXA 3WIJA 1XCXA 2WCSA 2VRKA 1CGTA 2BVDA 1EQCA 2Y24A 1J0YA 1HT6A 1UG6A 1PX3A 2O9RA 4GI9A 2EPNA 3MKKA 5LYRA 3VNZA 3T08A 3WMBA 3VGEA 2IXUA 2WBKA 3GBDA 2PWDA 3ZMRA 3W37A 2UY4A 4UZUA 4OJYA 1VFOA 3EDDA 1HJSA 5FKYA 2DGAA 4HOWA 1ZJAA 3MV11 2CBUA 1E5JA 4CN1A 3AYSA 1JZ8A 1H11A 1HVXA 2NW0A 4AEFA 2ZXBA 2D0FA 2DSWA 4GPNA 4H41A 4RE4A 1UD3A 3VINA 3PZMA 1J18A 3VDHA 1X6LA 3GH4A 1Y7VA 1QOXA 1JZ4A 2VX6A 2YLLA 1H3GA 1CXKA 3BAIA 1W9BM 1W91A 3AIQA 4CN4A 1GJUA 3L4WA 4JCMA 4QLLA 3HN3A 3ARXA 4AIOA 4ZFMA 5HPOA 4L4PA 4EE9A 1EGZA 2CIPA 2F2HA 1V0MA 1WP6A 2W62A 3B8SA 5A2AA 1O6IA 4OKDA 1KQYA 3ALGA 1YQ2A 4UQEA 4JAWA 1LWJA 1ZJBA 3AMGA 1B0IA 4H2CA 4BQ5A 2WWCA 4TX6A 3TP4A 1V6YA 3EBVA 1GONA 4HPGA 1GOKA 4UQBA 1OT1A 1HKIA 3MS8A 4M29A 4URIA 2V3FA 1GHRA 4MB3A 1M03A 1WZMA 1KXVA 3ARTA 1XH1A 4N42A 3VUPA 5FL1A 1AQMA 3O2LA 1BG4A 2FHCA 3VIIA 3WFZA 3RM9A 1AQ0A 1VB9A 3VDCA 1SR0A 1MFVA 4AZCA 3BXWA 4YPJA 1KGXA 1G1YA 3W38A 4XZWA 5IHSA 2CKSA 1C93A 3VM5A 5I24A 3CZ8A 1QPKA 2ZXQA 2D22A 1VBRA 2DPEA 1WDPA 1Q4NX 3SUVA 3WNOA 3VIGA 4BA0A 1PIGA 2W67A 2XM2A 3W24A 4XX6A 1VEOA 4U3AA 5BXPA 4GZIA 2RGLA 1RP9A 2VT0A 1U30A 1TMQA 5DMYA 1GPFA 1B3ZA 1SYTA 4X9YA 4NSBA 2GVYA 5IFTA 4Q22A 3UG4A 3CMGA 4Y7EA 5CG0A 4MNKA 5M03A 4HA3A 2O9OA 1GQLA 3OGSA 4D6DA 3SCPA 1L0PA 3QR3A 1H49A 4Z2LA 2DT3A 1DWAM 1VEPA 3WF2A 3QOMA 1WDSA 2XWDA 3TTYA 3K8LA 2YL8A 1VJZA 4BZYA 2WBGA 2XVKA 5BRPA 1JYNA 2G3IA 3AJ7A 4LYRA 3OGVA 1QI2A 2WMGA 5CGMA 2XVNA 2OYKA 3F5KA 5JBFA 1J0JA 1NM9A 3OB8A 4UQCA 1XSKA 4NI3A 1DHKA 1JI2A 1ISYA 3CHDA 4PMNA 2E4TA 3IJ9A 3U5YA 4H8UA 2C0HA 1E3ZA 3N1AA 3VO0A 2WNWA 4WSKA 1LG1A 3AIEA 3AMCA 4P7QA 1HN1A 3WFLA 3N04A 4U33A 2BY3A 3GNPA 5F7UA 1DWHM 1H0IA 3RILA 4AWEA 4P7NA 2XTKA 1XC6A 2DT1A 4S3KA 1E4IA 2XPKA 1KXTA 2VQTA 5HBFA 2UY2A 1LL6A 5A6BA 2CESA 1KCLA 2WSPA 2BVTA 2CETA 5D4YA 1XYZA 1UR1A 3RCNA 1WZAA 4L4OA 1EIBA 3WDQA 1ODZA 2X0YA 1WKYA 2XM1A 1G94A 1OM0A 4AY1A 1V0NA 4AD2A 3WDRA 1UD6A 1OINA 1UKSA 3WN6A 5LA1A 1KCKA 5CPTA 5EFFA 3VIPA 2BVYA 4CD6A 1LL4A 1UA7A 1BGAA 1MFUA 1RD6A 1PX4A 2WM0A 1E0WA 4AD5A 1XCWA 4J28A 3HMCA 1H09A 2JIEA 1N82A 2ZUWA 3SUUA 4JFVA 2PWGA 3BC9A 2Y8KA 5C8BB 4NRSA 1QBAA 3AIWA 3RJXA 2NT0A 2UY3A 4PBGA 3ZSTA 4HOZA 4JKLA 2JF6A 1GQIA 3QHMA 2YJQA 2ZOXA 4HZ6A 2G8ZA 3CO4A 4TVDA 1K6AA 4QCFA 1UH4A 4JFTA 2A3HA 4DWSC 2PF0A 2QPSA 4PEEA 5JUVA 4TVCA 2YBTA 3QHNA 5ECUA 2OYLA 4PMRA 1B3XA 5IDIA 1H2JA 3AZTA 1J0ZA 2ZX9A 4D6FA 2D24A 2WKLA 4HZ8A 4U2ZA 5TD4A 3VMOA 1NP2A 1H1NA 1DP0A 1OSEA 2W61A 3WNPA 3WH7A 2NT1A 4AISA 1DWFM 4WKAA 5E0FA 2D3NA 1KXHA 5D8ZA 5FIPA 3T0BA 4PTWA 1FH7A 2FGLA 4R27A 3ARUA 1LLOA 3L4UA 1UWUA 1BG9A 1GZJA 2V3EA 1D2KA 3WQ4A 8A3HA 1WB0A 3FHAA 3AIBA 2GDUA 1EDTA 1EOKA 1CGVA 1B3YA 1J0KA 2CHNA 1JZ6A 4NRRA 2XGIA 5DT7A 5GNXA 3WKZA 4DUWA 1E1EA 5D9OA 1B3WA 3GH7A 5A2CA 1HKJA 1GOIA 3TA9A 1I75A 4QLKA 4CU6A 3AHVA 1NP0A 1PX8A 1W9UA 3GNOA 2NSXA 3IAQA 3ZT7A 5A6BD 3IK2A 1GCYA 3PZIA 2Y5EA 1HNYA 3ZSSA 1CLVA 3GXFA 2VCAA 3W81A 1ZS2A 3WDHA 1OIFA 3ZT5A 4P8VA 2V3DA 4E8DA 1EO5A 3K4AA 1MWOA 5A8MA 1LJYA 5HXMA 4HP5A 3SCSA 3GBEA 1BTCA 1B3VA 3FNDA 3CUHA 3WL1A 3A4WA 4Z2HA 2J8FA 4AZ5A 2FHFA 3B9EA 5DF0A 5BXTA 1YHTA 2JF7A 1UKOA 2JEQA 4U2YA 3VIJA 3NUKA 1TA3A 1BGGA 4DUXA 1FOBA 1C3FA 1JDAA 3IAPA 1TG7A 4UOQA 5C70A 1BPLB 1XV8A 1J0HA 2WVVA 5I79A 1TE1A 1DEDA 2ZX5A 1TUXA 4H7VA 1QNSA 5GNZA 1CYGA 3PZQA 3EMQA 4UOJA 2WHJA 3WF1A 3CZJA 4M8UA 3BLPX 5CLTA 5ABHA 2E40A 3N9KA 3THCA 4KRUA 5FD0A 3ZR6A 3KE0A 2QF8A 2W92A 1NOFA 2WPGA 2FGZA 4TX8A 3CHCA 3MU7A 4ZE4A 1BHGA 1UR4A 4UCFA 1UKPA 1JD9A 3MUIA 4N0RA 2BHUA 4ATDA 3L4TA 5HPCA 1KWKA 3APGA 1E72M 4W88A 1OD8A 3IANA 2W63A 1JFXA 4JFSA 3WQ5A 5I78A 1HL9A 3WNNA 5AC5A 2Z1KA 4FLRA 4TUFA 2VNCA 3VIKA 4BF7A 4JFWA 1XH2A 3ARYA 1H5VA 1W9DM 1PIFA 1AMYA 1BQCA 3K46A 1UR2A 1V3HA 3K8MA 2BFGA 2E9LA 1UA3A 1UH3A 1IV8A 2XVGA 1UWIA 3UG3A 3ARPA 2GK1B 2J7GA 1HF6A 2EPLX 5JBDA 1M01A 4W87A 4W8LA 4J7RA 4FLSA 3GNRA 4F79A 1ITXA 1GW1A 1CXFA 2HVMA 5DFAA 2A3AA 3THDA 1SMAA 1CGYA 1C8QA 1JGIA 3WDPP 2VMFA 2PWFA 3MO4A 1XGZA 4CN6A 2WVTA 2D0HA 1LQ0A 1E0VA 3K8KA 2GJRA 2YL6A 4W86A 1PEZA 3WY1A 4BS0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 6TAA A;  3ALF A;  2E8Z A;  4HMC A;  1EQP A;  3N12 A;  3GXM A;  1JF6 A;  1JI1 A;  2EQD A;  1R85 A;  3W6L A;  4YN5 A;  3CBW A;  1XHG A;  1UR9 A;  1A3H A;  4C7D A;  1BAG A;  3MUY 1;  1VF8 A;  3VIM A;  3WD1 A;  2YKK A;  4MAV A;  2Z1S A;  1TCM A;  1OWQ A;  4F9J A;  5A8P A;  3L4X A;  1NQ6 A;  1PPI A;  5ABG A;  2C8N A;  3WNM A;  3SCT A;  4PTV A;  3FY1 A;  1KGW A;  2VOT A;  3EMC A;  4AD4 A;  1FFR A;  1UWS A;  1WNO A;  2X1I A;  1I1X A;  3AHY A;  4F66 A;  1NWR A;  1E56 A;  1UR8 A;  3FW6 A;  2EXO A;  5I6S A;  1WZL A;  5A8O A;  3MSD A;  1FFQ A;  2BXY A;  4GZJ A;  3UES A;  3T0A A;  4J3W A;  2VUR A;  4DM1 A;  4X0N A;  1GVI A;  1ZL1 A;  4PSP A;  1FH9 A;  4Z2K A;  2VX7 A;  4UFL A;  2XFF A;  2J7C A;  3VD7 A;  2VX4 A;  2WMI B;  4F9D A;  3WL0 A;  3ARQ A;  3VD3 A;  3WH6 A;  4PTM A;  4P8U A;  1NAR A;  3UET A;  1PBG A;  1HIZ A;  2ZUS A;  3BGA A;  4CD7 A;  1W1P A;  4ML4 A;  3WQV A;  4ZEN A;  1JXK A;  4HZ7 A;  4M82 A;  3VPL A;  3WBE A;  1KXQ A;  1EH9 A;  4AZH A;  3MUA A;  4MNL A;  1F4A A;  3AOF A;  1EDG A;  3OZO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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