3AMGA

Crystal structures of thermotoga maritima cel5a in complex with cellobiose substrate, mutant form
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
GVDPFERNKILGRGINIGNALEAPNEGDWGVVIKDEFFDIIKEAGFSHVRIPIRWSTHAYAFPPYKIMDRFFKRVDEVINGALKRGLAVVINIHHYEELMNDPEEHKERFLALWKQIADRYKDYPETLFFEILNAPHGNLTPEKWNELLEEALKVIRSIDKKHTIIIGTAEWGGISALEKLSVPKWEKNSIVTIHYYNPFEFTHQGAEWVEGSEKWLGRKWGSPDDQKHLIEEFNFIEEWSKKNKRPIYIGEFGAYRKADLESRIKWTSFVVREMEKRRWSWAYWEFCSGFGVYDTLRKTWNKDLLEALIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Diverse substrate recognition mechanism revealed by Thermotoga maritima Cel5A structures in complex with cellotetraose, cellobiose and mannotriose
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 120
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2010-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3amgA00
1VB9A 1KR1A 4ACZA 1J11A 3DHPA 4CVUA 2GFTA 3RJXA 1HJUA 2CKRA 4OBRA 2E40A 3FHAA 3RJYA 1A47A 1XV8A 1OSEA 1KGUA 1UR2A 4DUVA 3BH4A 3K46A 3ZJKA 2WHMA 1ISWA 4LYQA 1LG2A 2EPKX 2QPSA 1E4MM 1MW2A 4PMNA 1H0IA 1MYRA 1UZ1A 2ZUWA 3WY1A 4MB3A 3CZKA 5A94A 2VTFA 2G8ZA 3ZJ8A 1OBAA 2PB1A 3OLGA 3MSGA 4P7QA 3MMWA 4AXNA 3UR8A 3AIVA 4W7VA 1PX4A 1JZ4A 1EDTA 3N11A 3AMCA 2Z1KA 2YLLA 1OD8A 1M01A 2HISA 3N9KA 1ESWA 2XIBA 2J7HA 3WUBA 1B3YA 1EGZA 2CHOA 2EBNA 3SCUA 5I0DA 3OBAA 4HA1A 4DWSD 1OGBA 8A3HA 2G3NA 2G3JA 4QLKA 1H1NA 2VI0A 3CUGA 1XD1A 1HXJA 2WHKA 2PWEA 1CEOA 4GZJA 5D9MA 1ITCA 4RE3A 3AZSA 1VJZA 4TXEA 3SIMA 2BV9A 4H41A 2MANA 4CD5A 3CGTA 4LX4A 1JYWA 5JIPA 3WNOA 1K9DA 5A1AA 1E43A 1XH2A 3VVGA 3SUTA 3AXHA 4TX6A 2ESCA 2QLYA 4MAZA 3VIOA 2A3BA 2D23A 1EO5A 5A2CA 1Q6DA 1CXHA 2YBUA 5A8OA 2YKKA 3WNNA 3AOFA 3TONA 3WNKA 4Q22A 1VFMA 1BVNP 3CO4A 1CLXA 3BGAA 1LWJA 5A2BA 2VT0A 1E0VA 4Z2IA 1NQ6A 4MDPA 1R85A 2VX7A 5A95A 4BCEA 2IUZA 3AJ7A 3ZT5A 3DYMA 4UQDA 2WSKA 2ZXBA 1OIFA 2X8RA 3AQUA 1GW1A 3MANA 5CXPA 1ISXA 2GJPA 4HPGA 3GNPA 3OGVA 3W26A 3CPUA 4AD4A 3WMCA 1FHDA 4CN1A 2J8FA 1XSJA 4PMRA 1UH2A 2ZUSA 4P7OA 4W7UA 4X9YA 5FOOA 5ABFB 1JDAA 2EQDA 2JIEA 3BCFA 2XFFA 1LWHA 1V3HA 3ARPA 2OSXA 2D0HA 2WMGA 2NT1A 2XIIA 5C8BB 2WZHA 2TAAA 1V0NA 3VIMA 5DT5A 4PUDA 1W1YA 4CD7A 1V08A 2V5DA 4U2ZA 4E8DA 4BQ3A 1EHNA 3ALFA 3GNOA 3HMCA 1W1VA 3WF1A 3D3AA 5FCZA 1QNRA 2JE8A 1J0JA 4M56A 3NJ3A 1Z32X 5A6JA 2JF7A 3WH7A 3PZOA 2WHLA 3O9NA 2CETA 1FFRA 2CBJA 4WSJA 4QP0A 4JFVA 2PC8A 3WH6A 2BHZA 1BPLB 1JZ2A 2W62A 4DWSC 3CZJA 4JIEA 3AHZA 3DYOA 2EEXA 4H8UA 3AXIA 3PTQA 4PMQA 2WMHA 4KRTA 2E3ZA 1E9LA 3FXYA 4P8VA 1QBAA 4WKAA 4PEEA 3QOKA 1HJSA 3EMZA 5CZKA 4MAVA 3KEHA 5GQBA 4XZBA 3EDEA 1VBRA 1E6SM 5I6SA 1J10A 3M46A 3BAIA 3WNMA 2ZOXA 1CPUA 3FY1A 3ARTA 1W9BM 5JBFA 3MUIA 1W2PA 3FAWA 1V02A 5JBDA 5BRQA 2EPMX 1W1PA 2BNJA 2RGMA 3CZLA 2J77A 3FNDA 2ZXDA 5E0CA 1WPCA 3AMGA 5IFPA 2ZUNA 3WEMA 2E8YA 3SUWA 4PMOA 4V2XA 1E72M 2GSJA 3GM8A 1W9VA 1XH0A 2WMFA 1LL4A 3WQ8A 5I79A 1W9UA 1VEPA 3F5JA 2WZIA 1B31A 4FMVA 1LL6A 3VDAA 3GH5A 1UKQA 3EBVA 3RM9A 2JEQA 3SCWA 3UEQA 3VO0A 4GPNA 4EK7A 4UQ9A 1XC6A 3PZVA 4UOZA 1E71M 1V0MA 3WSUA 1NARA 5CJ5A 2WB5A 1R8LA 4WKFA 3U7VA 3CMGA 4UQBA 4U3CA 1ITXA 3MSDA 2J25A 1UD4A 4HMEA 4TUFA 4WLCA 1H2JA 2VVSA 5AC5A 4PTMA 1B0IA 1Q4NX 2WZEA 1MQRA 1E5NA 1TFVA 1JD7A 2NSXA 4RE4A 3GH4A 1P6WA 2DT0A 3OGSA 4QCEA 3WDJA 5CQ1A 3MUAA 1TVNA 1JDCA 3WD3A 4OOUA 1B3ZA 4XUYA 3EDKA 1JZ7A 3WBAA 1JZ5A 1HNYA 4W84A 1Q6FA 5FIPA 3RIKA 1O7AA 1D7FA 4AYSA 3AIUA 1V6YA 1EOMA 2OSWA 3WF3A 2OYKA 5A6KA 1ECEA 3KZSA 1SMDA 4FK9A 3W37A 2W61A 1J0IA 4PSPA 4FLQA 2XM1A 3JUGA 4W8BA 1MWOA 1H3GA 1B3XA 3W0KA 2D0GA 1OM0A 1E56A 2IXVA 1JZ3A 5BRPA 1E70M 3POCA 1HF6A 4U3AA 1Q6GA 4CN4A 4HU8A 2BY2A 4CU6A 3W4RA 1J0ZA 2QPUA 4QLLA 2VZVA 1ZBWA 4C7GA 1OT1A 1PJ9A 4GI9A 1OINA 2A3HA 4PMYA 2G3IA 4D6CA 2GK1A 4BF7A 1UKSA 3VGGA 3BLPX 3ARUA 2D20A 1MVYA 4W85A 4D1IA 1V6WA 2GDUA 3ZSSA 3EDDA 2CHNA 5BXTA 1GONA 1LLOA 4P8UA 2WVSA 1KB3A 4AD5A 4PTVA 4JFSA 4L4OA 4LXFA 4PCTA 1M7XA 2EPNA 4B3KA 1LQ0A 4HOZA 3PZIA 5A8QA 5HNNA 5A6AA 2A3AA 3WUGA 1ZU8A 3G6MA 2CBVA 3BMWA 2J7DA 2VR5A 1MQQA 4J3WA 4WF7A 1E3ZA 4D6JA 3W28A 2V38A 2ZX5A 1E6ZA 1UWTA 2WBGA 3WH5A 4FLRA 5E6YA 4W5UA 1PPIA 1VF8A 2XWEA 3EMCA 2CESA 4AIEA 3T2QA 1GCYA 2BFGA 1WCGA 1UD8A 1K6AA 1QI3A 3AIBA 3RO8A 1V6XA 3WUEA 1H09A 4F79A 1JXKA 3PZ9A 1HKMA 5FL1A 3WFZA 4TVUA 3MUZ1 3APGA 1HVXA 2BXYA 3PZGA 3DHUA 4BQ2A 3AFBA 3F5LA 4ZE4A 3LPFA 4D6HA 3B9DA 4MJ4A 2ZWYA 1AQHA 4J7RA 3AICA 2XVKA 4CCDA 5D9NA 1XSKA 1J18A 4AEEA 1UD6A 2F61A 1J12A 1NWUA 1J01A 3A4AA 1DWGM 1M53A 4J3VA 3CUJA 2WMKA 3LPOA 2QV4A 4GO9A 1BYDA 4BA0A 3B9EA 1TE1A 1WDRA 2XFRA 4H7VA 1IZJA 5F7UA 3CUIA 1CNVA 4U31A 4X0NA 1H11A 1UKOA 5ABEA 1WKYA 2Q8XA 2PI6A 3GXDA 4OOZA 1PX8A 4ATWA 4ATDA 2YJQA 3S2CA 4AZGA 1TR1A 3TTQA 3ZR5A 5CSYA 3RM8A 4GZIA 2YIHA 4KWUA 4MNLA 5LA0A 3THDA 1KXQA 4UTFA 3VMPA 1J0HA 2YDQA 1W3KA 4H8HA 5M3WA 1UR0A 4JKLA 3VX0A 2J74A 2V3EA 4GKLA 2Y5EA 4TVDA 2AMGA 2GJRA 1CXFA 4U2YA 1E4IA 2DH3A 3N13A 3ECQA 4JL2A 4V27A 1FFQA 2ZUVA 4UR9A 1BHGA 2CPUA 3TTOA 3RDKA 1GZJA 3PZMA 2F8QA 4F66A 1VJSA 3AHXA 1PIFA 2RGLA 4GI6A 1JL8A 4Y7EA 1OT2A 4D1JA 3WDRA 2ZX8A 3VPLA 1XHGA 4M81A 1EDQA 5D9PA 3ARVA 1BQCA 1XSIA 3GTNA 4QFUA 1G01A 3N12A 4AD0A 8CGTA 4KGLA 3PZTA 2WCGA 5DO8A 1GORA 5DF0A 1B3WA 3QHNA 5M5DA 2UY4A 1MW1A 3KL0A 4UFMA 2QF8A 2VOTA 4IUGA 3CHFA 1SFSA 1OWQA 1LJYA 1EO7A 1EA9C 3ZMRA 4W88A 5I5RA 3W82A 4YHEA 2DEPA 1C8XA 1ZBKA 4PN2A 4MDOA 1QW9A 1NH6A 4MJ2A 1JZ6A 3ZOAA 3OB8A 1KBBA 2PWGA 2WKLA 3IAPA 1N82A 1ODZA 1UD5A 2ZX6A 4CD6A 5CPTA 1SMAA 3QR3A 4W87A 4HU0A 1FH8A 1UWRA 3VUPA 1GNXA 1DP0A 3UR7A 2J78A 1HP4A 4UFLA 1KR0A 2PBGA 5LYRA 2O9PA 2XVLA 5A6SA 4AZ5A 3PBGA 4HZ7A 2FGLA 4CCCA 1AVAA 4CU7A 1E6NA 1KWGA 3M7SA 5A2AA 2WWCA 4IISA 3WQ4A 2J7EA 4EKJA 4GQQA 3VD7A 3CZ8A 3ARSA 2DSVA 3WL0A 5IDIA 4LQ1A 1BLIA 1MW3A 4P8XA 2D22A 1AQMA 2ZXQA 3RCNA 2WMIA 2FH6A 3AYRA 3LMYA 2ZXAA 1CGUA 1KXTA 1CXLA 3THCA 4MPKA 3UERA 3IJ7A 3SCRA 1E40A 3L4XA 4AD1A 2W92A 3UG4A 3K8KA 3A6OA 3OZPA 1TVPA 2JFEX 2WC3A 3MO4A 2UY2A 1BYBA 3AXXA 5A6BA 1SYTA 1TA3A 2JEPA 1CLVA 2V3FA 3B9AA 1VIWA 1ODUA 1TMQA 3HJEA 4JHZA 3QHOA 1O6IA 4UFKA 2VZSA 2VNCA 2YBTA 3MUY1 1UQYA 2XG9A 3NYDA 3CBWA 4KRUA 1NOWA 2FGZA 5CSUA 4XV0A 1GQKA 1GQIA 4OIFA 2CCRA 5E09A 1G1YA 4YPJA 4HZ6A 4W93A 3VM7A 1WO2A 1KGXA 3POHA 3ARZA 2VMFA 3WDHA 2WMJA 5I3DA 1V3LA 2VCCA 3PZQA 4KH2A 2QMKA 4CGTA 2CYGA 4D6IA 4OUEA 3BAYA 3WMSA 2UY3A 3AS0A 1ISVA 4MB4A 2X09A 5EFDA 4OJYA 1E55A 2WANA 2Y2WA 3ZJ6A 1HL8A 4N0RA 1EH9A 3GXMA 4QAWA 2D0FA 3CTTA 4C7FA 3WDPP 2VQUA 4GIAA 4PMZA 3VNZA 3L2LA 3SCNA 1PAMA 3WQWA 2WBKA 2JF6A 3SCVA 4JFUA 2DGAA 2UWFA 4U33A 1JYVA 4GI8A 4PMXA 4AMCA 1GJWA 3EDFA 2G41A 3WMBA 5IXEA 1E6XM 1EHAA 1QI5A 4XB3A 4N42A 3CHDA 5EBAA 4S3KA 3FHQA 3VTRA 4TVCA 5A8MA 4ACYA 2OSYA 1HX0A 4DUWA 4A3HA 4W86A 2J62A 4UOQA 2O9OA 3BMVA 4UQCA 3ALGA 2D3LA 4F8XA 2ZX9A 2FHCA 3TA9A 2ZIDA 2E0PA 1D3CA 2YDRA 1UKPA 1AQ0A 2GK1B 2WCSA 1UWQA 1G0CA 3OZOA 4IPNB 1VAHA 6CGTA 2CITA 2VRQA 2DH2A 4W8AA 1U2YA 4J3XA 1DWHM 1W2VA 1I75A 1QI0A 4LPCA 1UHVA 3CH9A 1GHSA 2B31A 4AZBA 3W27A 2J7FA 2BHYA 4OBSA 1JIBA 4W89A 4CN6A 2VJXA 4ZENA 3WFLA 4E2OA 1CXKA 2WNWA 1QBBA 5FL0A 1KCLA 7A3HA 2DT3A 5BYWA 3M6DA 3WEOA 1KGWA 1C93A 4PTXA 1GQJA 3AMLA 5I2UA 1HKJA 2EPOA 3SUVA 1ISZA 3ZSTA 3VIHA 3WEZA 1JFHA 1GOMA 2XVNA 1MXGA 1C91A 1F4HA 1KXHA 2WXDM 1MXDA 3BCDA 4KMQA 3VIPA 2W63A 4BS0A 2D1ZA 3KWXA 3PHAA 1CYGA 2VRKA 4NSBA 1ZJAA 4BQ4A 3I3EA 2WHJA 3B8SA 3WQ5A 2X2YA 3GBEA 5CLTA 1GOWA 1WNOA 1JNDA 4V28A 1OIMA 4PYSA 5A69A 2Y4SA 3VGFA 2CERA 1XGZA 3AIEA 2VCAA 5JUVA 4AZ7A 3WNLA 2GJXB 3WF2A 4UQAA 3SCTA 3VGBA 5ABFA 1M03A 1NOUA 1MFUA 3PZNA 3LPPA 4J28A 4PMVA 2DIJA 2PF0A 1KBKA 3WUFA 1NOFA 5GNYA 3AS1A 1J9YA 3BSGA 1DTUA 1BYCA 2IXUA 2QHAA 1UR8A 3AI0A 5FD0A 4GZEA 5GPRA 1JD9A 7TAAA 1E6QM 2Y24A 2XM2A 1W3HA 5CGTA 3VGHA 1UD3A 3T0DA 4HMCA 1LG1A 4CU8A 1WE5A 3AS3A 4GXPA 1WB0A 5BCAA 1QHOA 5JIWA 1HIZA 2W5FA 3CHEA 3GZAA 2J4GA 4AZCB 2EXOA 3L4TA 2WVVB 5GNXA 3WENA 1PX3A 2CBIA 3M07A 1JFXA 4AZIA 3U57A 2A3CA 1UH3A 4DWSA 2WC7A 1ZB5A 1HN1A 3L4VA 4ZFMA 3NDYA 1JXJA 4WK9A 3VGDA 3BAJA 1WZMA 3GBDA 2FHFA 3AIRA 3S6TA 4P7LA 3L4ZA 1OD0A 4AIUA 4AY1A 1XYZA 2CKSA 4ACZB 2WSPA 1JI2A 1R7OA 1BGAA 2FHBA 1TUXA 1C7TA 2W67A 3N18A 1G9HA 3GDBA 3K4DA 4ZE5A 2OWWA 1E73M 5AYBA 3NSXA 3WNPA 3G6LA 3VOCA 2DPEA 5EMYA 4MNMA 2YLAA 4M24A 2WVUA 1E4NA 4FLOA 4PTWA 4TOQA 2VX4A 2WK2A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VB9 A;  1KR1 A;  4ACZ A;  1J11 A;  3DHP A;  4CVU A;  2GFT A;  3RJX A;  1HJU A;  2CKR A;  4OBR A;  2E40 A;  3FHA A;  3RJY A;  1A47 A;  1XV8 A;  1OSE A;  1KGU A;  1UR2 A;  4DUV A;  3BH4 A;  3K46 A;  3ZJK A;  2WHM A;  1ISW A;  4LYQ A;  1LG2 A;  2EPK X;  2QPS A;  1E4M M;  1MW2 A;  4PMN A;  1H0I A;  1MYR A;  1UZ1 A;  2ZUW A;  3WY1 A;  4MB3 A;  3CZK A;  5A94 A;  2VTF A;  2G8Z A;  3ZJ8 A;  1OBA A;  2PB1 A;  3OLG A;  3MSG A;  4P7Q A;  3MMW A;  4AXN A;  3UR8 A;  3AIV A;  4W7V A;  1PX4 A;  1JZ4 A;  1EDT A;  3N11 A;  3AMC A;  2Z1K A;  2YLL A;  1OD8 A;  1M01 A;  2HIS A;  3N9K A;  1ESW A;  2XIB A;  2J7H A;  3WUB A;  1B3Y A;  1EGZ A;  2CHO A;  2EBN A;  3SCU A;  5I0D A;  3OBA A;  4HA1 A;  4DWS D;  1OGB A;  8A3H A;  2G3N A;  2G3J A;  4QLK A;  1H1N A;  2VI0 A;  3CUG A;  1XD1 A;  1HXJ A;  2WHK A;  2PWE A;  1CEO A;  4GZJ A;  5D9M A;  1ITC A;  4RE3 A;  3AZS A;  1VJZ A;  4TXE A;  3SIM A;  2BV9 A;  4H41 A;  2MAN A;  4CD5 A;  3CGT A;  4LX4 A;  1JYW A;  5JIP A;  3WNO A;  1K9D A;  5A1A A;  1E43 A;  1XH2 A;  3VVG A;  3SUT A;  3AXH A;  4TX6 A;  2ESC A;  2QLY A;  4MAZ A;  3VIO A;  2A3B A;  2D23 A;  1EO5 A;  5A2C A;  1Q6D A;  1CXH A;  2YBU A;  5A8O A;  2YKK A;  3WNN A;  3AOF A;  3TON A;  3WNK A;  4Q22 A;  1VFM A;  1BVN P;  3CO4 A;  1CLX A;  3BGA A;  1LWJ A;  5A2B A;  2VT0 A;  1E0V A;  4Z2I A;  1NQ6 A;  4MDP A;  1R85 A;  2VX7 A;  5A95 A;  4BCE A;  2IUZ A;  3AJ7 A;  3ZT5 A;  3DYM A;  4UQD A;  2WSK A;  2ZXB A;  1OIF A;  2X8R A;  3AQU A;  1GW1 A;  3MAN A;  5CXP A;  1ISX A;  2GJP A;  4HPG A;  3GNP A;  3OGV A;  3W26 A;  3CPU A;  4AD4 A;  3WMC A;  1FHD A;  4CN1 A;  2J8F A;  1XSJ A;  4PMR A;  1UH2 A;  2ZUS A;  4P7O A;  4W7U A;  4X9Y A;  5FOO A;  5ABF B;  1JDA A;  2EQD A;  2JIE A;  3BCF A;  2XFF A;  1LWH A;  1V3H A;  3ARP A;  2OSX A;  2D0H A;  2WMG A;  2NT1 A;  2XII A;  5C8B B;  2WZH A;  2TAA A;  1V0N A;  3VIM A;  5DT5 A;  4PUD A;  1W1Y A;  4CD7 A;  1V08 A;  2V5D A;  4U2Z A;  4E8D A;  4BQ3 A;  1EHN A;  3ALF A;  3GNO A;  3HMC A;  1W1V A;  3WF1 A;  3D3A A;  5FCZ A;  1QNR A;  2JE8 A;  1J0J A;  4M56 A;  3NJ3 A;  1Z32 X; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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