3AOFA

Crystal structures of thermotoga maritima cel5a in complex with mannotriose substrate
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DPFERNKILGRGINIGNALEAPNEGDWGVVIKDEFFDIIKEAGFSHVRIPIRWSTHAYAFPPYKIMDRFFKRVDEVINGALKRGLAVVINIHHYEELMNDPEEHKERFLALWKQIADRYKDYPETLFFEILNAPHGNLTPEKWNELLEEALKVIRSIDKKHTIIIGTAEWGGISALEKLSVPKWEKNSIVTIHYYNPFEFTHQGAEWVEGSEKWLGRKWGSPDDQKHLIEEFNFIEEWSKKNKRPIYIGEFGAYRKADLESRIKWTSFVVREMEKRRWSLAYWEFCSGFGVYDTLRKTWNKDLLEALI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Diverse substrate recognition mechanism revealed by Thermotoga maritima Cel5A structures in complex with cellotetraose, cellobiose and mannotriose
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
molecule keywords Endoglucanase
total genus 127
structure length 308
sequence length 308
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2010-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aofA00
1CYGA 3OGRA 1P6WA 2XM1A 1QPKA 3BXWA 1W9VA 1UD5A 1VRXA 3TTQA 3T08A 3RM9A 3FW6A 3ZSSA 3K8KA 2X09A 4W7VA 1WDRA 2WWCA 4IPLA 4TXEA 1QNRA 1E70M 1OB0A 1UKPA 2BVYA 2Z1KA 3FXYA 2DEPA 1HP4A 5A2CA 3AS1A 1H1NA 3BMVA 1A47A 1E0XA 4UR9A 1GCYA 4BZYA 3THDA 1HVQA 1KR0A 4QLKA 3FHQA 5BRQA 5GNZA 4AMCA 1NP2A 4DWSD 1V3JA 1OGBA 1KCLA 3EDFA 8A3HA 4AZIA 3MV01 2WMIA 2G3NA 2VNCA 1TZ7A 1H3GA 4Z2GA 3KE0A 3B9DA 5EBAA 5A6BA 2VX6A 3DYMA 4Z2JA 3JUGA 2WNWA 4UQBA 5A8NA 1DP0A 3AOFA 1KCKA 4J3TA 4PMZA 2WCAA 3CIVA 3SCNA 3WEOA 1C7TA 3VU2A 1E15A 3K1DA 5I23A 1J12A 1E3XA 1PZ3A 4GIAA 1TA3A 3OGSA 1ZBKA 3AIQA 3CHCA 4OKDA 2DPEA 2BXZA 1B31A 5LA1A 4Z2LA 2W61A 1BVZA 1TR1A 1LJYA 1B0IA 1QNSA 2CESA 3EBVA 2EPOA 1XH0A 1KBKA 1MW1A 2W67A 1HIZA 3N12A 1ISXA 1I1XA 4AZGA 3SEPA 3ZQ9A 4PMUA 2UWFA 5A6LA 2DGAA 1UR0A 1WKYA 3U7VA 3VIFA 5CPQA 3VO0A 3K46A 2JEPA 2C0HA 4PMXA 3AHZA 3VGHA 5AC4A 4GPNA 4P7LA 2QHAA 1JNDA 3VOCA 3ARQA 1C7SA 4IUGA 3VGFA 3VIJA 1OIMA 2WC3A 5E0FA 1WDQA 4J7RA 3GNOA 3GH7A 3IJ7A 4UFLA 1VF8A 4HPGA 2DDXA 4J3XA 2J4GA 2OYLA 1CXFA 5HNNA 5HOSA 1JFHA 2GUYA 1UQZA 4MTVA 3A3HA 4UCFA 2G4FA 3HMCA 3GBEA 4UFJA 2QPUA 3OGVA 1Q6FA 4V28A 2YDSA 2WZHA 2E9LA 7A3HA 4DWSC 5KZ6A 1JYNA 2OSYA 3TA9A 2YOCA 1HJUA 2CNCA 2ZE0A 4HOZA 3VIHA 3I3DA 2W4XA 4TVCA 2V3DA 4UFKA 7CGTA 1XD0A 5IFTA 1Q6GA 3GDBA 3WDIA 4HMDA 4J3WA 5I24A 1Q6EA 3WH6A 5GNXA 2ZWYA 1JDAA 2XFYA 4CVWA 3ARWA 1OT1A 5JBFA 4D6EA 3W29A 4NZCA 1ZS2A 4LYPA 2CITA 1HN1A 3AICA 2JE8A 1CXHA 2EBNA 2WLZA 3GTNA 3F5KA 2XFFA 3PTKA 2ZUWA 5ABHA 5D4YA 2O9RA 2XTKA 5BRPA 3PTMA 2A3AA 2WVTA 1E6PA 3O9NA 2J7GA 4PSPA 3NIYA 3IANA 4ATDA 2O92A 3AMCA 3SCUA 4BQ2A 1GOMA 1UD3A 4JKMA 2OSWA 1VBUA 2J7BA 2HVMA 4GZIA 3EDJA 1EQPA 3U57A 3RM8A 1TCMA 1W1VA 1Q6DA 2WMIB 3L4UA 1FH8A 2IXVA 1E9LA 4NRRA 1AVAA 1BG4A 1HL9A 4P8VA 1JG9A 3WEMA 3WBEA 2XG9A 1JZ8A 1JAEA 4A3YA 4U3AA 1E4MM 1V6VA 1CENA 5LA0A 2QF8A 5JIWA 3AIBA 2WHLA 2E8YA 5HPCA 2DSUA 4E8DA 2OYKA 1QI2A 1FP9A 2X0HA 4FLQA 5FIPA 4HPHA 5A6BD 5LA2A 1TA3B 3WD0A 1ZJAA 3AROA 1IZKA 1HVXA 4RE4A 3SCPA 4M56A 1DTUA 3PBGA 1E1FA 4J27A 1L8NA 1EGZA 4AD5A 1VFOA 1E0WA 2D1ZA 4CN4A 1EOKA 1NP0A 1J0IA 4D6CA 3HJEA 5A6AA 2W92A 1FFQA 5CG0A 1HNYA 1PZ2A 1NQ6A 1CLXA 3OLDA 1R87A 4MNKA 2D20A 4J28A 1J0YA 1JFXA 2CBUA 4CCEA 2YA2A 1KBBA 5C71A 3BLPX 4ML4A 3RIKA 1JF5A 5M17A 3O6AA 4AWEA 4H8VA 4MAZA 1V02E 2WBKA 5AY7A 3CUFA 4CU8A 1ZBWA 4JKKA 1PBGA 5FD0A 4E2OA 2DT0A 2Y24A 2NSXA 3A6OA 3AHYA 1PJ9A 3RO8A 4AD3A 4U2ZA 1WZAA 2EO7A 2VOTA 1QNQA 2GJXA 3SCTA 3WH5A 1HXJA 4ZEPA 3AYSA 2WSKA 4F9JA 2PBGA 3WD1A 5IHSA 3ZJ6A 4C7FA 5FKYA 1GQJA 4QCEA 2VJXA 4H04A 2JF7A 4MB1A 3W25A 1JD9A 1W9BM 1DWGM 3EDDA 3CTTA 3ARVA 1KXHA 3WD4A 3WELA 4MB5A 2ZWZA 5ABFA 4AW7A 3CPUA 4AEFA 3M07A 3AHXA 1GOKA 3RDKA 1QHOA 1MQQA 4HU8A 3UG5A 1U33A 4S3KA 3DC0A 1IT0A 1M03A 1H0IA 4W5ZA 4W84A 1W1PA 2VQTA 2BS9A 5AYIA 1ZJBA 3ECQA 3AIVA 2W91A 1JDCA 5ABGA 1CGUA 3NYDA 1XH1A 1E5NA 3VPLA 3FHAA 4PMQA 1CGWA 2XVKA 1PAMA 1J0HA 1J0KA 1LG2A 3AJ7A 1QI5A 4W8BA 4PMRA 1V6UA 2Z1SA 4AIEA 4UZSA 1V3HA 4H7VA 1G5AA 1XRVA 2D22A 5A94A 1ISZA 3SUWA 3AXIA 1GHSA 4NI3A 1QBBA 2OWXA 1H11A 2VURA 3WMBA 3KL3A 1XC6A 3VIGA 1MXDA 1ITXA 3K8LA 1GOOA 4B3LA 4LPCA 3T2OA 3BLKA 1OBAA 1NH6A 3ZJ7A 3A47A 3BMWA 3T2QA 1A3HA 2ZIDA 4MADA 3F5LA 1V0KA 2WHKA 1JDDA 4PRWA 2WC4A 5TD4A 1KGWA 1V08A 3KWXA 1KFWA 2XHYA 1E55A 1MW0A 2D23A 2O9TA 4GQRA 4MJ4A 1KXTA 1WZLA 1O7AA 1W32A 5EFDA 1LL6A 4JAWA 5A6SA 1LWHA 1ISWA 4BQ3A 3OG2A 1BFNA 5M03A 2WCSA 1B90A 4IISA 2EEXA 3RM4A 1F4AA 1UYQA 1QI4A 4JFWA 1JZ6A 4WF7A 4U5KA 3K4DA 3POCA 1M04A 1JXJA 1V3IA 1NWRA 2DH3A 2PWHA 2VI0A 4GINA 2VR4A 3MU7A 3MV11 4P7RA 4AD0A 1DWHM 4W88A 6A3HA 2GJXB 2WMGA 4KRTA 4AZCA 1J9YA 5I3DA 3CGTA 4D6GA 1UZ1A 3BH4A 4TUFA 3A4WA 4Z2IA 4B15A 3W27A 3CHDA 3CHFA 1GVYA 3UG3A 3QGVA 2OYMA 4ACZA 5DT7A 4L4OA 2E40A 2VRKA 3F4VA 5D8ZA 4UQCA 1GORA 2XWDA 3IAPA 2YBUA 4CD4A 5FOOA 4MNLA 4D1IA 1UR9A 5D8WA 4X9YA 5ABFB 5CXPA 4GKLA 2PF0A 1D3CA 4AD1A 3MS8A 3WF1A 1WDSA 1JYVA 5HPOA 1M7XA 1PX3A 1UD2A 3AMDA 1UKSA 4CD6A 1K6AA 4M29A 2JFEX 1R86A 5A2AA 2C8NA 3ZIZA 4JKLA 2YLAA 1US2A 3VD5A 3VIMA 2TAAA 3ZR6A 1EQCA 1UR4A 4U31A 3AFBA 2BY3A 1UWSA 4JFUA 2ZXDA 4XB3A 3APGA 4JHOA 3UETA 3AI0A 1VFMA 5GNYA 1W9DM 3A4XA 3AS3A 5I79A 4JFSA 1E4IA 3VGDA 1UR8A 3MMDA 3NDZA 1N82A 4B9ZA 4PMVA 1JZ5A 2J7EA 5DMYA 1XGZA 4CKQA 2GJPA 4FF5A 2VZTA 2YDQA 2YLLA 1HJVA 3W37A 5E09A 4BS0A 2QMKA 1V6XA 4EE9A 2VTFA 1J0JA 1K9FA 1CDGA 3WUFA 3GH4A 1V0NA 1IV8A 4QLLA 2RGLA 3VDBA 4QDMA 5A6JA 2VRQA 5DT5A 4C7GA 4GO8A 4CGTA 2J7FA 2X2YA 1C92A 2V38A 1BLIA 5LYRA 2CIPA 3CZEA 3BAIA 1E3ZA 3PZOA 3WNPA 3ZT6A 1E0VA 1GVIA 3IJ9A 1FH7A 3WD3A 4A3HA 4PMOA 4F8XA 3PZGA 1E4NA 5JIPA 3WQ6A 3T0AA 1UA3A 2CYGA 4D72A 3WNOA 1OD0A 4D6IA 2BVDA 1KQZA 3MUAA 3PZQA 3AMKA 4TOQA 1QI3A 3WDJA 3L4YA 4BCEA 4P7NA 2D0FA 1CZ1A 1WCGA 3ZMRA 1C90A 1YQ2A 2OWWA 4JFVA 1UA7A 1MW3A 4PSRA 4MDPA 2VZUA 4PCTA 4P7OA 4WSJA 4M80A 1PIFA 3T0DA 3LPGA 3L2MA 4HZ8A 2CERA 2VX4A 1UZ4A 5JUVA 2BV9A 4PYSA 1HKJA 1KXVA 3IAQA 1E4LA 5I0DA 3PZ9A 3BCDA 2GDUA 3KL0A 3CHEA 2WHMA 1UR2A 5IHRA 1RPKA 3UR8A 3VGEA 1GJUA 1WP6A 2AAAA 4B9YA 4B16A 4AZCB 5I6SA 5CGTA 3SUTA 2IXUA 1W9PA 5HBFA 1V0LA 3SCRA 1LQ0A 1NOFA 2WMHA 2W62A 3AIEA 3DECA 2ZX8A 1ISVA 2XUCA 4ACZB 2XM2A 3TP4A 2VRJA 3N1AA 4JFTA 5AYBA 2VUYA 2WK2A 5BXRA 1BHGA 2PWGA 1OM0A 3QOMA 2J25A 3WF2A 5A6MA 1H49A 1BYAA 2BY2A 4KGLA 3PHAA 2BHYA 1LF1A 3GNRA 3W26A 3WH8A 1KB3A 1B30A 3WL0A 4W5UA 4UFHA 1IZJA 3SUUA 1LL7A 5FL1A 3UEQA 1PX4A 3PZMA 4KGJA 1ITCA 1M01A 4LYQA 1DWIM 3VNZA 1W91A 4M1RA 1XD1A 1JNEA 3GH5A 4TVDA 3VIIA 3WMSA 4Q7NA 1EHAA 2J7DA 2YJQA 1HKKA 1PX8A 3WKZA 1EHNA 1H2JA 4W8AA 1C91A 4AZ6A 2CBVA 4CVUA 3ARTA 3MO4A 3N17A 1BGAA 1MWOA 4PMDA 5E6YA 4CD8A 1GNXA 1UUQA 3AMLA 4GXPA 4MJ2A 1K9EA 1Y7VA 1V6YA 1CXLA 2VX5A 1WPCA 1SFSA 4YHGA 4WJXA 4FLRA 3FN9A 3WF4A 3BSGA 4HU0A 4ZE4A 1WNOA 1CPUA 2J74A 3WUEA 1SR0A 1E6SM 2WZEA 1MFVA 2V3EA 1LLOA 2ZX9A 3M46A 1DWAM 1V6WA 1NARA 4GZEA 2RGMA 3FY1A 1E6ZA 4GI8A 3WQ8A 2XVPA 3OZOA 3II1A 3EDKA 1AMYA 1UD4A 1NOUA 4UTFA 8CGTA 1FOBA 4AEEA 4XZBA 3T2PA 2FH6A 1CTNA 1HJSA 1VEMA 2E8ZA 3VM7A 2WB5A 1VAHA 4AZHA 2JF6A 4GQQA 3HN3A 3CO4A 3VD4A 2VX7A 3W6LA 2XJ7A 4C7DA 3MUIA 4WIWA 1J18A 2CEQA 3L4XA 2DSWA 1J01A 2Y8KA 2WWDA 3NSNA 3M6DA 3T0BA 2VT0A 2VCCA 5E0CA 1W3JA 3ZO9A 2PWEA 3WD2A 3WQVA 4U5IA 3I3EA 3W81A 1V3LA 1E71M 3RMEA 2WVSA 1UKTA 1ODUA 3OIHA 5D9PA 3WDQA 3ARSA 3BSHA 1G01A 4NRSA 4HA4A 2ZICA 3BCFA 3N11A 3NSMA 4R27A 1OIFA 5A69A 3OLEA 1XCXA 2EPMX 5CPSA 2XSAA 5AC5A 1VENA 3OZPA 1E40A 1WB0A 2PB1A 2XVLA 1C8QA 1TG7A 4YN5A 6TAAA 4WSKA 3AYRA 1QNPA 5GPRA 1KR1A 3NJ3A 2WYSA 1BSIA 2WC7A 3EYPA 3ARPA 2PWDA 1OT2A 1BPLB 3WQWA 4E4PA 4BQ4A 5EB8A 3U7BA 2X1IA 1CIUA 3QR3A 5EFFA 1JZ3A 1DEDA 1NWTA 1XYZA 3W6MA 2WAGA 4OJYA 2QLYA 1SYTA 1FA2A 3PZTA 4PMNA 1EH9A 1OGSA 4QCFA 4J3UA 3FAXA 1JGIA 1DWFM 1XYFA 1HKIA 3MMWA 3WUGA 3EMCA 1JXKA 3ZOAA 1UKQA 4S3JA 2OSXA 3OBAA 1QHPA 3ARRA 1W2PA 1EXPA 3WNLA 1UH3A 1WDPA 1UWIA 4NF7A 3S6TA 4ZXLA 1JI1A 1XHGA 2DT1A 3VVGA 1D7FA 4XUYA 1GOIA 4DM2A 2DT3A 2B31A 1ZB5A 3VIKA 1CEOA 3HU7A 1B3ZA 1LWJA 1OD8A 5ECUA 2D24A 4N42A 1QVBA 1EOMA 3NUKA 2XGIA 1W9UA 3QHMA 3L4ZA 2DIEA 1ZBVA 3ALGA 4DWSA 2D0GA 1VJSA 1QW8A 2G3MA 4TVUA 3J7HA 1JZ2A 3DHUA 4YPJA 1HX0A 2UY3A 2F61A 4WK9A 4PUDA 3VIPA 3VD9A 5CLWA 1EDTA 1PPIA 3CMGA 2CPUA 2G41A 1R7OA 2VQUA 2XVNA 2O9OA 2OWCA 4HOWA 5F7UA 4A4AA 5E9AA 4H8HA 4WLCA 3SCVA 1X1NA 4QLJA 1R8LA 5D9NA 4BA0A 1US3A 2FGLA 2VVSA 5CJ5A 1XSIA 2J78A 5A8PA 2PWFA 3AMGA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CYG A;  3OGR A;  1P6W A;  2XM1 A;  1QPK A;  3BXW A;  1W9V A;  1UD5 A;  1VRX A;  3TTQ A;  3T08 A;  3RM9 A;  3FW6 A;  3ZSS A;  3K8K A;  2X09 A;  4W7V A;  1WDR A;  2WWC A;  4IPL A;  4TXE A;  1QNR A;  1E70 M;  1OB0 A;  1UKP A;  2BVY A;  2Z1K A;  3FXY A;  2DEP A;  1HP4 A;  5A2C A;  3AS1 A;  1H1N A;  3BMV A;  1A47 A;  1E0X A;  4UR9 A;  1GCY A;  4BZY A;  3THD A;  1HVQ A;  1KR0 A;  4QLK A;  3FHQ A;  5BRQ A;  5GNZ A;  4AMC A;  1NP2 A;  4DWS D;  1V3J A;  1OGB A;  1KCL A;  3EDF A;  8A3H A;  4AZI A;  3MV0 1;  2WMI A;  2G3N A;  2VNC A;  1TZ7 A;  1H3G A;  4Z2G A;  3KE0 A;  3B9D A;  5EBA A;  5A6B A;  2VX6 A;  3DYM A;  4Z2J A;  3JUG A;  2WNW A;  4UQB A;  5A8N A;  1DP0 A;  3AOF A;  1KCK A;  4J3T A;  4PMZ A;  2WCA A;  3CIV A;  3SCN A;  3WEO A;  1C7T A;  3VU2 A;  1E15 A;  3K1D A;  5I23 A;  1J12 A;  1E3X A;  1PZ3 A;  4GIA A;  1TA3 A;  3OGS A;  1ZBK A;  3AIQ A;  3CHC A;  4OKD A;  2DPE A;  2BXZ A;  1B31 A;  5LA1 A;  4Z2L A;  2W61 A;  1BVZ A;  1TR1 A;  1LJY A;  1B0I A;  1QNS A;  2CES A;  3EBV A;  2EPO A;  1XH0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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