3ATZA

Crystal structure of tcoye with phba
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
373
structure length
368
Chain Sequence
FPELLRPLKLGRYTLRNRIIMAPLTRCQATEDDHVPRTESMLKYYEDRASAGLIIAEATMVQPNYTGFLTEPGIYSDAQIEEWRKIVDAVHKKGGLIFLQLIHAGRAGIPEKILQQDPLAGRLLAASAIPIKDHRIPAYFAASGEKETYGVPEELTDDEVRDGIIPLFVEGAKNAIFKAGFDGVEIHGANGYLLDAFFRESSNKRQSGPYAGTTIDTRCQLIYDVTKSVCDAVGSDRVGLRISPLNGVHGMIDSNPEALTKHLCKKIEPLSLAYLHYLRGDMVNQQIGDVVAWVRGSYSGVKISNLRYDFEEADQQIREGKVDAVAFGAKFIANPDLVERAQQNWPLNEPRPETYYTRTAVGYNDYPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural insight into the stereoselective production of PGF2(alpha) by Old Yellow Enzyme from Trypanosoma cruzi
pubmed doi rcsb
molecule keywords Prostaglandin F2a synthase
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 133
structure length 368
sequence length 373
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3atzA00
2EKCA 4WQ6A 3HIJA 3PSVA 4UCGA 4OQVA 3S1VA 1T99A 4A2RA 4IMGA 3VE9A 3EWYA 3SGZA 2QCDA 2CLMA 3W7QA 4EVZA 4AB4A 1I8JA 2Y7FA 3SSJA 2WOQA 2R8WA 3W1TA 4DO6A 4AHPA 1VPXA 3HGRA 4EF8A 4I7UA 3L0GA 4X22A 3CU2A 1X6UA 3R12A 2QCFA 2C18A 1M6JA 3DH7A 4I7WA 3M9YA 1WBJA 1LLWA 3OHIA 1DVJA 2YFNA 4GUIA 4H3DA 4RZ6A 4K36A 1OABA 3QPYA 5LHFA 4R53A 3NQ8A 5K9CA 2ZTJA 1RZMA 3IVUA 1TPEA 4UTLA 1OX6A 3W70A 4O10A 4RKAA 4AMAA 2ZRUA 3LLDA 4CQAA 1WDWA 5G4EA 1EUNA 2Y6ZA 3GIYA 3N19B 5CSRA 2B7QA 3PB2A 2B7PA 3C8FA 3OVQA 2Y61A 1FCUA 4W9TA 2ISVA 1T0OA 4JTHA 1SUXA 1ALDA 4AF0A 4HNVA 2FIQA 2Y63A 1EUAA 2QCCA 5SWUA 1VLIA 3A9IA 5KZMA 3LRKA 2ZRWA 1FWSA 3HPXA 3L5LA 3U8GA 1IXQA 2VKZG 2X16A 3BLFA 1W3TA 2FB3A 1GEQA 2J27A 3MMTA 4HKPA 3RNDA 2RFGA 1A5CA 1KTBA 1L6WA 4LVBA 4CNPA 4RXFA 1FDYA 5FEPA 3A21A 3TMLA 3KRSA 2QKFA 3S5OA 2CLHA 4OV4A 1L2UA 3NQ2A 2Z0IA 5DN1A 3E12A 3PG9A 4XZ9A 3Q37A 1QPRA 1LLZA 3NL5A 3PULA 4M6VA 8TIMA 1H7XA 1J4EA 2WSYA 3DI1A 4OE7A 5TQLA 2XN1A 4JNMA 3ABRA 5CKSA 2PC4A 4Z0SA 5A8GA 3EKZA 1LBLA 4PEKA 3PBUA 1O5XA 3TMQA 3DGRA 3TXZA 4K6AA 5F4WA 1TJPA 1UBSA 1P5BA 3L66A 4XKYA 1FUYA 2WO5A 3S1XA 1DL3A 1JUKA 3NVTA 1XDLA 2Y62A 1TV7A 2OX1A 2YR1A 4FB7A 1PCKA 2WSRA 3P60A 2HTMA 3PM6A 4JTGA 4L4MA 5AHNA 3I65A 3P62A 3W87A 5BMXA 3TAKA 1ZALA 3W86A 4K7YA 4UR8A 3BPWA 3P61A 1TIMA 3L0NA 4FX8A 2ZRZA 4A29A 3S1WA 1OX4B 3GDRA 1GOXA 3G1XA 4NX5A 3NAVA 3M5VA 5HUOA 2VEIA 5G2WA 2GVGA 3W7RA 5D32A 1DV7A 2X1UA 2QCEA 3W83A 3E0IA 1THFD 1MEWA 3TAOA 2A1YA 4NJIA 2Z1BA 4MYXA 1VGAA 4N4PA 3NXFA 3T4CA 1H60A 1GYLA 1VYPX 2Y88A 1ICQA 1K03A 3QC3A 3FEMA 3RU6A 3N2XA 3PS7A 4LT9A 1JRCA 1F6PA 1IGSA 4MUZA 5DY2A 4YCPA 2DZPA 1X8FA 4N2YA 2VFFA 1W5MA 3QF0A 4L4LA 1QPNA 2GQAA 3LBMA 3PUEA 3LCFA 4MFEA 3TA6A 1G6CA 3G22A 2ZZ1A 4O13A 5KMYA 1WOBA 3SGUA 1EP3A 1YDOA 2P0OA 1I2QA 3C2EA 3LI0A 5K4ZA 1A5AA 1DHPA 3MI6A 2O7SA 4YMZA 1AL7A 4FO4A 2B0MA 1S5VA 4JIQA 5HJLA 1KBJA 5E0KA 5T26A 5BMWA 1SZEA 3VFLA 1WBHA 2A0NA 3W1UA 1KFLA 5HNRA 2DP3A 2A4AA 3RFAA 1GVQA 1NFBA 1YXYA 4DEFA 3B04A 3E96A 3TW6A 2B4GA 2A7NA 3BW2A 4LUJA 3UY7A 4WJEA 4JD4A 4K7VA 2QJHA 3O6YX 2QUVA 2X1TA 1Y0EA 3KVKA 3B05A 2F84A 1RQHA 4JTLA 4YCOA 4R7JA 1NVMA 3W2JA 3GAYA 4MJZA 3SZ8A 4LVDA 2XFWA 4NNCA 3PC0A 2QCHA 1NAL1 3GXPA 5KZEA 2YGYA 4IPIA 4Y96A 3W1LA 3TQKA 4JDYA 4K39A 4RR4A 3G1FA 3ANYA 5HMSA 3PVFA 4PFMA 1F5ZA 4GBUA 1EX5A 3UY8A 3R2GA 2CZ5A 5DBTA 1SZFA 4YWIA 3NGJA 4ALDA 3H55A 2JK2A 1ZY9A 1XM3A 3CB8A 5C6MA 4NZFA 1J5TA 3KOFA 1LM1A 3O63A 5E1QA 4NT0A 1K7EA 2H8XA 1BWLA 1PV8A 3O6CA 2CZDA 4XTIA 4IOTA 2CLOA 3F03K 3PWAA 3NL2A 1P0NA 1B9BA 1DKWA 4Z08A 4WUIA 2VFGA 5IBXC 1QO5A 2ZTKA 1KFCA 4OU1A 4JTKA 5C54A 1NSJA 4NZJA 2QCDB 4JEQA 2NWRA 1H51A 3LLFA 2CFFA 4POCA 1JCXA 5I3GA 1PIIA 4M7TA 1A5SA 2QUTA 1IIGA 3KVJA 3M0ZA 2WQPA 3CC1A 4ONVA 4NQ1A 4KFOA 2C6QA 4MY1A 4AVFA 3V75A 2Y70A 4UXDA 4DO4A 3DFTA 5HQEA 4BK9A 4DBEA 1VRDA 3AJXA 3KX6A 3H54A 4HSOA 2VFIA 3UWZA 2NUWA 4R34A 4WZHA 2CZFA 2E68A 5AC8A 3OVPA 3TXVA 1KM0A 4AWTA 4PA8A 3AO0A 5HWJA 4ZVJA 4KWWA 1ME8A 2Z6IA 5DXYA 3PBWA 2CLIA 5K9XA 3M7WA 3S5ZA 1QO2A 4YLWA 3HOJA 4N6EA 3O15A 5DXXA 1OJXA 2ZZ6A 3BW4A 1G67A 2V81A 3MUXA 1XC4A 3CEUA 1OX4A 4K38A 1FWWA 1LROA 2DZSA 4O54A 3M6YA 2GPTA 5D2WA 1R2RA 3PB0A 2WSQA 4O19A 4N9BA 4LUIA 5FEZA 3WK0A 3VKJA 4FF7A 1VJIA 1VH7A 3DFSA 3NPVA 4P2VA 3U2OA 1TREA 2J9ZA 1A5BA 3O8AA 2ZZ2A 4O14A 2OZ0A 1WYIA 1TTQA 3P5YA 5HWNA 3MBDA 4RLIA 2JKAA 1TV8A 1GYNA 1ZHAA 3TX9A 1HO4A 1QMLA 3LV5A 1VHNA 5AYYA 3W2MA 4UTUA 2H8ZA 3QJAA 5HINA 2E6YA 1F73A 1W0MA 2A6NA 2VELA 2QJIA 2Q8ZA 4FNQA 3UWVA 1LP6A 4MJMA 4TX9A 4JTSA 3DZ1A 4S1FA 3SI9A 4JY8A 4O1BA 1AL8A 4IJBA 4IUOA 4LU0A 4IQLA 1TQJA 3LV6A 1ZNNA 1TQXA 3LOTA 3LHUA 1B4EA 1G4PA 2ZA3A 2V2HA 2VFDA 1G4TA 1HTIA 1F05A 3E49A 3QW4B 2V0TA 3P80A 4Q32A 3O16A 1JCNA 2C14A 3BO9A 2ZRVA 5U4NA 2EGZA 1W5OA 3BV4A 3M5ZA 2GJLA 1SSGA 2G97A 5LHEA 4OT7A 1KFBA 4NX0A 1ME7A 3HG4A 3ZR4A 1FWNA 3C2OA 3QMTA 3LCLA 2XN0A 3TNOA 1QOPA 2NX9A 2OMAA 4GRSA 4BFAA 3SR7A 3FA5A 5EBUA 2WKJA 1SZGA 4JN6A 1GG0A 2QCLA 3M47A 4NNAA 3QQ1A 1V5XA 1IXPA 1GVOA 6TIMA 6ALDA 1G4EA 1KM3A 2J88A 2H3DA 2LLEA 1KA9F 3ATYA 5D30A 2EF9A 4UTHA 1VCVA 3QFEA 3F4WA 3G1HA 1OFAA 2BWGA 1K7FA 1R46A 3NQVA 3FKRA 3NPWA 5CPOA 3CPRA 3THQA 2G95A 3HJZA 3K30A 3EWBX 4HSNA 4XBKA 4MIMA 1EA0A 3HGOA 3G24A 1Q6QA 4NNBA 1G69A 3WJSA 4UFJA 2J9XA 3STEA 2TPSA 2J9YA 2G5WA 1RQEA 2FFCA 1LBFA 3A5VA 1TPH1 1OVDA 1D3HA 1QCWA 3FS2A 1JCMP 3INPA 3PF3A 3DENA 2CLEA 3TQVA 2C15A 4BI5A 4IXXA 3T7VA 4N9CA 1XL9A 1JUBA 4FNTA 4JDBA 4HIBA 2QDHA 1G7VA 4JX4A 2NLIA 4NVTA 1CI1A 3OEXA 1XUUA 2A5HA 2X30A 1EWEA 3C0JA 4O50A 3P5ZA 2XN2A 3T40A 4QNEA 1R2SA 3W3OA 5F2GA 3M5YA 1AW2A 3LCGA 5I3HA 2ZRYA 5AYZA 4E0CA 5G2HA 1H7NA 4CNOA 4DQWA 5AHLA 5D38A 1VR6A 1ZAHA 4ML9A 1VCFA 2B7NA 3H53A 2JGQA 3ATZA 1JQVA 2AGKA 1QPOA 1DORA 1YLVA 4GFSA 1SQ7A 3W7LA 4HT3A 3TROA 1Z42A 2G96A 5FEXA 5F2LA 2BSLA 1R47A 3CEPA 4KFNA 3NQEA 2ZZ4A 3SECA 3M16A 3RF9A 5CG7A 5AFDA 2YZRA 4O0ZA 5D2XA 2PE4A 1IF2A 5DCDA 1VZWA 3P8JA 4O11A 2QDGA 4LRTA 3W88A 2EAWA 1C8VA 3QEZA 1G4SA 3SJ3A 2ZA1A 5EL1A 3N2MA 3CIWA 2GVLA 3W22A 1LRNA 1WXJA 3MP4A 4QM1A 3EB2A 3E02A 2FQIA 2DORA 3F4NA 4BR1A 2Z6JA 4LWWA 3CT7A 3TFXA 3ABSA 4DO5A 3S9YA 3PG8A 3QM3A 3UWQA 4FIRA 1YADA 3I7RA 1C9DA 1UASA 1RV8A 1E51A 3C3NA 1N8FA 4H4IA 2AAMA 4TU1A 3FKKA 3KFTA 1VYRA 1KTNA 4PL1A 1G7UA 1LZOA 1MZHA 3BG9A 3EX2A 4JYFA 4Z0JA 3W7GA 2Q8LA 1W3NA 1BWKA 3C4UA 3W1PA 4GWEA 3ABQA 1TCDA 4JTUA 4JTEA 4O53A 4WOZA 3YPIA 1L6YA 2Q3OA 3O6DA 3STGA 4LC6A 3W1AA 4LV9A 2FPVA 5D33A 1QNVA 3W7NA 3NQGA 4YL2A 1X1ZA 3QZEA 2HS8A 5EYWA 1I2PA 3BVJA 3L5MA 4GC4A 2NV1A 4IMCA 1LOSA 5EMUA 1L9WA 5G5IA 4ZQCA 3GR7A 4RK8A 2ALDA 2FJKA 2DJXA 1W8SA 3GDKA 5DCBA 3FYOA 2YYUA 5TIMA 1W56A 4M5PA 3HQ1A 3W6YA 5CZ0A 3GXNA 4PC8A 4A2SA 3EWUA 1OFBA 2W79A 3KXQA 3LXAA 5CPLA 3DHFA 3FFSA 3STCA 3P84A 2QAPA 3PBVA 2NV2A 3N34A 4M6PA 4HNTA 1GPWA 2PRLA 4BI7A 5LNVA 2ZQ0A 3FYPA 5CSSA 1F2JA 1GG1A 5F2MA 4UUIA 1S5WA 5DELA 1TYGA 3LM7A 3I7QA 5LSMA 1DQWA 3M41A 3O07A 4LS0A 3QQ0A 5D2TA 2QF7A 1WAUA 1HL2A 4MY8A 3C2VA 1L6SA 1NF7A 3W7HA 4RCXA 1K3UA 4XTDA 3W7KA 2VEPA 1OHLA 4OHQA 1TB3A 1YXCA 4JTTA 1UUOA 3B06A 4LW7A 5F2IA 4GXMA 4Z1CA 5CPMA 4NJGA 3C61A 4Y9AA 1FY6A 1EWDA 2QCGA 3ZWSA 2YW4A 3LCHA 2NXGA 3LI1A 2PURA 5E93A 3W2KA 1MEIA 3N14A 3A23A 4CCEA 4A22A 1R30A 4TMCA 4XWUA 2EHHA 1FCVA 4O18A 1M7PA 3R8RA 1VLWA 1N7KA 3IEBA 4Y8FA 4QQ3A 3IV3A 3LCXA 3KVLA 1R2TA 4O1CA 2JKPA 2WNQA 1U5JA 2I14A 2WV8A 3EEGA 3TJLA 3OBKA 3UPWA 4I7VA 4IWWA 1DOSA 4O17A 2YFOA 1YTDA 1S3HA 3LHYA 4E2DA 4IMDA 4X3ZA 2ZYFA 3G1AA 4WY0A 2DZWA 3W7MA 3LRMA 3P7YA 4Z1BA 1F6KA 4JXCA 5BNKA 1YDVA 4UTJA 3OVRA 4KFPA 2ABAA 4MYAA 4QJ1A 7TIMA 3NEVA 4MFDA 4A21A 3JR2A 1QPQA 2ZZ3A 3NQDA 5LNUA 3GDTA 3BLEA 3W2LA 4CCDA 1EIXA 4DELA 1C29A 3MHFA 3MO7A 3LHWA 2CLFA 3G8RA 3LTSA 3NOEA 3A22A 2RH9A 3TR2A 4JICA 4RJEA 4O28A 3QYQA 2V9DA 3O06A 3I7SA 3D0CA 5H91A 3IRDA 5D2VA 5KZDA 3E9AA 3FOKA 4UFLA 1LBMA 1IIHA 5AN7A 3G8EA 1ONRA 3GNDA 1BKSA 5EPDA 5LKYA 3QSRA 4LS1A 3W71A 2YW3A 5ABTA 1GT8A 1K7XA 4IMFA 1M7OA 4MOZA 2YCEA 5F4SA 1P4CA 3BARA 3B4UA 1SO5A 4CQ8A 1OFRA 3CIXA 4MZ8A 4K8HA 4M6QA 3N3MA 4ADTA 3LCWA 3QMRA 4O52A 3MHGA 2FB2A 1TPDA 3GR8A 3L68A 3TIMA 1EP1A 5AHFA 3UZ5A 1OF6A 3C56A 2UV8G 3WK3A 4C1LA 4DXVA 3Q2DA 1OK4A 3EX4A 3P74A 1WX0A 3NO5A 1B3OA 2TSYA 2DJLA 2J6XA 2NUXA 4UMCA 3IVSA 4XBSA 1FQ0A 4ICNA 3TW7A 2X2GA 1W5QA 1K8YA 2CW6A 3UWWA 4IX2A 4AAJA 1H7WA 3HB9A 3EXRA 1BTMA 1TPWA 2H3BA 2DZXA 5EA9A 2Y7DA 3DU0A 5BRBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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