3ATZA

Crystal structure of tcoye with phba
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
373
structure length
368
Chain Sequence
FPELLRPLKLGRYTLRNRIIMAPLTRCQATEDDHVPRTESMLKYYEDRASAGLIIAEATMVQPNYTGFLTEPGIYSDAQIEEWRKIVDAVHKKGGLIFLQLIHAGRAGIPEKILQQDPLAGRLLAASAIPIKDHRIPAYFAASGEKETYGVPEELTDDEVRDGIIPLFVEGAKNAIFKAGFDGVEIHGANGYLLDAFFRESSNKRQSGPYAGTTIDTRCQLIYDVTKSVCDAVGSDRVGLRISPLNGVHGMIDSNPEALTKHLCKKIEPLSLAYLHYLRGDMVNQQIGDVVAWVRGSYSGVKISNLRYDFEEADQQIREGKVDAVAFGAKFIANPDLVERAQQNWPLNEPRPETYYTRTAVGYNDYPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
publication title Structural insight into the stereoselective production of PGF2(alpha) by Old Yellow Enzyme from Trypanosoma cruzi
pubmed doi rcsb
molecule keywords Prostaglandin F2a synthase
total genus 133
structure length 368
sequence length 373
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3atzA00
4O12A 1EUNA 4OE7A 3V1PA 2E1DA 4PTNA 5CZ0A 3MP3A 2AAMA 2ZTJA 2A6LA 4ZMGA 3QSRA 4NZJA 3HQ1A 2E68A 3RLVA 2NUXA 1OVDA 1TPFA 3TA6A 2C0AA 1PHWA 4WXYA 4XWUA 1AL7A 3QRHA 3F4NA 3NQ2A 3SSJA 4OHQA 4JTEA 5AHLA 3W1PA 4NZFA 3PULA 1KV8A 2QUUA 1OX5A 3PG9A 1XUZA 4EVZA 3L0KA 4M7SA 3BLIA 1H50A 4D2JA 2ALDA 3TSMA 3LDVA 3W2KA 1LYXA 2DZPA 1PCWA 5AC8A 3STFA 3W1AA 2E5DA 4WXZA 2EKCA 3TIMA 4N9CA 3SGZA 1VGAA 2ZQ0A 4IXHA 2TPSA 3NL5A 4PFMA 3I65A 1C9DA 1M7OA 1JRBA 1G7UA 3K30A 4MFDA 3L21A 3P8IA 4UXDA 3NQMA 4X2RA 3LXBA 3M5XA 5LGXA 2F7FA 3TC6A 4ZZ9A 3Q94A 4L4MA 4NNAA 4IWWA 3E96A 2C1HA 5DBTA 1F05A 3TXZA 4YMZA 3PSVA 3HIJA 4GXMA 4BI6A 5FEXA 1KBJA 1WQ5A 3BGJA 4UCGA 3W2LA 2VFDA 4O1AA 4O1BA 4P2VA 4JD4A 1RQHA 1F6PA 2DORA 3TW6A 2B0MA 4M6VA 2PC4A 3TCEA 1LLZA 5DY2A 1VHCA 2O7QA 3QMSA 4FXSA 4WOZA 2CLHA 5CZSA 4DBDA 1FCUA 5DCEA 3QPYA 2KZHA 1G4PA 1NF7A 1SSDA 4LV9A 5G1TA 2RKXA 1P5BA 4Q4KA 3SR7A 4JIPA 1W5QA 1VC4A 3EX2A 3UXDA 4LWWA 3QPZA 1YDVA 1O5KA 4LU0A 1HFBA 1GTHA 2ZRUA 4PL2A 1SU5A 3S1VA 3HGRA 3FFSA 3IV3A 4OV9A 1ZAHA 4HHPA 4TIMA 2VEMA 3LHVA 1TPB1 2C6QA 2ZZ2A 3TMQA 5EMUA 3FYOA 4RK8A 2Y70A 3KX6A 3DGRA 4OU1A 2VEIA 3M5ZA 4JYFA 2V5LA 4QSHA 2H3DA 2G5WA 5G5IA 5K3VA 4U28A 3DI1A 4BF9A 5I3FA 3G22A 1OK4A 1NAL1 2ZRXA 5LGZA 3W87A 1W56A 3P5YA 2FQIA 5KITA 5D2WA 2RH9A 4XKYA 4N4QA 1KTBA 1EP2A 3HF3A 4K38A 3ABRA 4KWWA 5FI8A 5FEPA 1OFBA 2IQTA 4TO8A 5TQLA 2OX1A 3WK0A 3MMTA 2ATMA 3HG5A 1N7KA 2CLKA 4XBSA 1I8JA 3MBFA 4MYXA 3LHYA 1DBTA 2ISSA 4CQ9A 3G1AA 1Y0EA 5DY3A 3HGSA 1MEHA 3OVRA 4HNVA 3RF9A 1Q6OA 3PBYA 4GUHA 3MYOA 4UTMA 3P61A 4UTTA 1UCWA 3NQDA 2J9XA 4O28A 3W1MA 3RMJA 2AGKA 1K7FA 3TU9A 3L5LA 3P62A 3UY7A 5LNUA 4IMDA 3WK2A 5A5WA 1U5JA 2X30A 5KZMA 3IGSA 2BLEA 3ZWSA 3CM4A 3LCFA 3PVFA 4OV4A 4MLRA 1JQVA 3W7PA 4UMBA 3G0UA 3NM3A 3GDLA 1QR7A 2WNNA 2FDSA 1KFEA 3JR2A 3P84A 1SZGA 2VFGA 5AHIA 3CU2A 3HOJA 1X8FA 3B04A 4O8RA 1WBJA 2C3ZA 4ICNA 1AW1A 4M19A 4Z08A 3W2NA 4BFAA 3I68A 4WD0A 2QCDB 2NX9A 3KAOA 4AF0A 1S5WA 3QFEA 3W74A 2J27A 2QDHA 3EWUA 4M6QA 1SUXA 3KFTA 3FEMA 4UFMA 4A3UA 1XL9A 4MLJA 1XDMA 3B4UA 1W5PA 4O0KA 1KM1A 4WOQA 5HJLA 1FWSA 6TIMA 1RQEA 3LRLA 2CLFA 3IRDA 4DO6A 3BLEA 5CSRA 5LHFA 3L9CA 5EPDA 1RZMA 1AK5A 5F4XA 3THAA 3RK8A 1VH7A 2FPYA 5K9DA 1GVFA 4MFEA 3W1RA 1J4EA 2Z2UA 3IIXA 5CZJA 3LHUA 4S2CA 1DJQA 3SZ8A 1I2QA 1KBIA 3GAKA 4E2DA 5HULA 1O95A 3BVJA 1SO6A 5KSWA 1KFJA 4ZQOA 3NAVA 1S5TA 1VCGA 1YTDA 3LOTA 3O1NA 3IGXA 1UBSA 4ZQPA 1J2WA 3TC7A 3PBUA 1OX4A 4JEQA 5FESA 3TJLA 1JR1A 4UNLA 2GQ9A 4NJKA 3I7QA 3VCRA 2QCMA 2HSAA 2X16A 3W84A 3HO8A 4A21A 1GTEA 1H7XA 4O18A 5FF7A 1TTJA 5HUOA 5F4WA 2E77A 1YDOA 2QAPA 4K37A 3AJXA 5LZLA 1VLWA 3KOFA 4N6EA 1W5NA 1YTEA 3W7JA 5KMYA 4GFSA 2QF7A 3UXAA 4FIQA 3WK3A 3C2VA 3Q58A 4R53A 2WKJA 2CLMA 1EEPA 4ONVA 3W73A 5EKYA 1XM3A 4N9DA 3OA3A 1EIXA 3UNDA 1TQJA 2JKEA 3CB8A 2R8WA 4H3DA 2HS8A 4JY9A 3F03K 4GC4A 1G67A 5BMWA 3BO9A 4Z1DA 1IIHA 1VZWA 1IXOA 4Y6GA 4R7JA 5HINA 4ADTA 5G4EA 4O0ZA 2PE4A 1A5BA 3INPA 5C2XA 3IIPA 5HWMA 3VFLA 1GYNA 3N2MA 5K2ZA 4UFJA 3PB0A 4CCCA 3HGOA 5AC7A 4K6AA 1R2RA 3NQVA 4OQVA 4MIMA 1IIGA 3M0ZA 4PCFA 1L9WA 3LXAA 1W3IA 3IIZA 1JCMP 4K7YA 7TIMA 3E0IA 1P0KA 4CQ8A 3C6CA 2ABAA 3W6YA 2GOUA 3LB0A 3P74A 2BXVA 5H2ZA 2EPHA 3P82A 4JTGA 2A7RA 1R2SA 1FQ0A 2V30A 3NQ6A 4DO4A 1FWWA 2VKZG 5F2GA 1KFCA 2I1OA 3IIOA 3W71A 4ADUA 3DXIA 3MHGA 3W75A 2PRHA 3G8EA 1JUBA 4X9SA 3DFNA 1GVOA 3O15A 1VYPX 2FJKA 4E38A 1Z48A 3KVMA 4DO5A 2F84A 4HPXA 1SO4A 4WUIA 3O63A 2E5BA 3QM3A 3W7IA 2ZZ1A 4IMFA 4LUIA 5DXXA 3GR8A 3NEVA 4LS2A 4FEZA 2QJIA 4JX4A 1AG1O 3GXNA 4AB4A 3G3MA 1VRDA 1F74A 3LTSA 3O6YX 5IBXA 3LTYA 3LCHA 4MYAA 3NQ7A 1VLIA 1O60A 1A5SA 4FO4A 3PUEA 2CZFA 3G1HA 5HR6A 4LVAA 4JY8A 1C8VA 1CX9A 1NF0A 4O52A 3TR2A 4N6FA 3NPUA 2YZRA 1SFLA 3A24A 2B7NA 3HJZA 2Y85A 3N19B 4DQWA 1PE1A 3C52A 4EWND 5U7SA 1WAUA 4O10A 1AW2A 3R2GA 3EWWA 3O6CA 3LLDA 4TX9A 3C56A 4Z0JA 5L6UA 3UWYA 1AW5A 2CZ5A 3DZ1A 1JUKA 2VFFA 4NXSA 4ZVJA 1GVQA 2H90A 1OFAA 1LRQA 4JTFA 2E6FA 2G97A 4JTKA 1TB3A 5AHNA 4NJHA 2Y7EA 3FJ6A 5AFDA 3W7DA 4YLWA 3SW6A 3CIWA 2ISWA 3C2RA 3FKRA 1EPXA 3L65A 3U6WA 5K9CA 3OVPA 3QQ0A 5BNKA 1FWTA 3GDMA 5HNRA 5LNSA 3I7RA 4IPJA 3N34A 2QCNA 3TAKA 1PIIA 3OG3A 5U4NA 1R30A 2NWRA 1XCFA 1DVJA 1TSIA 2ZYFA 1FDYA 5AB3A 1W3TA 2QCGA 3A21A 3MP5A 4ML9A 1YXCA 3F1QA 2QJHA 5E1QA 1H7NA 4ZL1A 4JTUA 1ME8A 3W7OA 5AOUA 3PR2A 2ZDRA 3CIXA 3M43A 1UJPA 4S1FA 3M44A 1BWLA 3NOEA 5BW6A 3NDOA 3TW7A 3W7NA 4EOUA 4DPPA 4MKNA 1FCVA 3S1WA 3RNDA 3MI3A 3S5YA 3ZS4A 1S3HA 4POCA 3GKAA 4Z1CA 5L9FA 3N3MA 3TV8A 5D2YA 3M1ZA 2W6RA 1H62A 3EEGA 3N73A 4JNMA 3RLUA 4HIBA 1K7EA 3M41A 4CCDA 4NXKA 3W7KA 4R34A 3EXRA 1GG0A 4UFHA 2Y7FA 3TNOA 2ZCGA 1Z44A 1SQ7A 4UIOA 4IUOA 2WQPA 3P80A 3OHIA 4MZ8A 3ABSA 1OYCA 4A2SA 5D02A 3W83A 5CG7A 1JJKA 1GQNA 1OFDA 4QQ3A 1B4KA 2YDAA 1TTQA 1KM0A 2BSLA 1UUMA 3NQAA 2CLIA 2Z1BA 5G2IA 3MP4A 3N9SA 2A21A 3OEXA 4XTDA 4IX0A 3TSBA 3UWVA 1VR6A 3LERA 2A85A 3NL3A 4KFPA 3T44A 3CPRA 5DXYA 1JUEA 4IGHA 4U4MA 2VFIA 1LP6A 2ZFAA 4UTHA 1I2PA 4XBKA 1SR9A 3DENA 2DZWA 3B05A 4LV4A 4WJEA 1GYLA 1OK6A 4FB7A 3HPZA 1ME7A 2YFOA 1YPFA 1KM5A 1DV7A 3L5AA 4O19A 5FEWA 3EWBX 1OYBA 2J9ZA 2NV1A 2NXIA 3P67A 2C15A 1F2JA 3LGEA 1HUVA 4AXKA 3O8AA 3T40A 3L2IA 1Q45A 3GXTA 1LOSA 4PEKA 5K7JA 4HNTA 1QPNA 1ICPA 2J6XA 1L6WA 3B06A 2YR1A 2ZTKA 3DI0A 2RDTA 3R89A 1FY6A 3TH6A 5CGQA 3THQA 5LHEA 3PY2A 1LRNA 1O4UA 4DXVA 3MWAA 1LROA 1KFKA 3MHUA 4AHPA 3EWXA 1W1ZA 3ZWTA 3P7YA 3WJSA 4BI5A 1TPUA 3WJXA 3CTLA 2TMDA 4TR9A 1OYAA 1W3NA 4WX2A 5AC6A 2FPVA 5D2TA 1FUYA 1ONRA 3SFKA 4LVGA 1FBAA 1EA0A 4YXGA 3MYPA 4YCPA 3WJYA 1BWKA 5G2WA 4NNBA 4IJBA 4RZ4A 1LDCA 3GDTA 4UFKA 5AHEA 1M6JA 3DHFA 4K8HA 1ICSA 3TQVA 2BX7A 1Q6RA 3S1XA 4NJJA 3S1UA 3S42A 1EWDA 1E51A 3O05A 3A23A 3RU6A 1GOXA 1IXPA 3C2OA 2JGYA 1JULA 3LI0A 4NNCA 1TQXA 3TFXA 3IVTA 2DZTA 2CU0A 4NQ1A 2JKAA 4K8EA 2J9YA 5LKYA 2O7SA 4IMCA 1ZFJA 1JRCA 2YCEA 1TMHA 4JTIA 1SW7A 3HMJG 3TQKA 4CQAA 5SWUA 2GVLA 1YYAA 5D37A 3T78A 1OFQA 4LVDA 4O4WA 3KRZA 4BK9A 4L4LA 4O16A 4UUIA 3B0UX 4WY0B 2RDUA 3M16A 4O1DA 5D33A 5FF2A 4UTUA 5F2IA 4N02A 4NT0A 5TIMA 1DL3A 1WOBA 4DBEA 3LM7A 3M7WA 1QPOA 1KLYA 4RXFA 5HWNA 3KVLA 1LLWA 3EB2A 3UWQA 4QIUA 3FYPA 3UY8A 3QF0A 3SI9A 5DELA 3WJWA 3PBWA 5KZDA 1H7OA 2OCZA 1KFLA 4XTIA 4Z1AA 3USBA 4CCEA 5DCBA 5C5YA 2ISVA 5CPNA 2ZRZA 3TFCA 1BTMA 2QAFA 1QCWA 5TBOA 4FNTA 2WSQA 5IM51 3T55A 3N14A 2A5HA 1A5AA 4RZ5A 1OFOA 3CEUA 2C14A 3HPXA 4GUJA 1G4TA 2H8XA 4ORMA 2CLEA 4OWGA 3NR0A 2PURA 1TRIA 4RV8A 1NEYA 2WV8A 5AHMA 1TPC1 5G4WA 3EXSA 2A4AA 4JN6A 1X1OA 4QISA 4J9JA 4OT7A 3L66A 3DU0A 3E12A 4RLIA 1H7RA 5KTLA 3G1DA 2G95A 5C55A 3PUDA 3GDRA 1N8FA 4JTLA 3GZ3A 1PL9A 2DP3A 1K8XA 1HTIA 2NXHA 1A53A 4KKXA 1GVSA 4EF9A 4MJZA 3NG3A 3MI6A 3QYQA 1H5YA 3G1XA 3JS3A 1WOAA 3W7MA 4MZYA 3YPIA 3LRKA 4UR8A 1VYSX 1LRTA 3TXVA 1SSGA 2GJLA 3C61A 5F1VA 3VKJA 3D0CA 3L0NA 2ZZ6A 3MBDA 4FX7A 4UTJA 1K03A 3GLCA 4HSNA 5HQEA 1TJPA 4AHOA 3VE7A 3SGUA 2OJPA 4NX0A 1Q3NA 4LVFA 1H7WA 3S6DA 3A5VA 3Q2DA 3STCA 5F4SA 5I3IA 4LC8A 1GWJA 4JTSA 3EKZA 3W1UA 3W3OA 4CNNA 4O13A 3B0VC 1X6UA 1B4EA 4E0CA 1ZY9A 1SFJA 4QAIA 3Q37A 1CI1A 2ATSA 2CWNA 3M9YA 3E49A 5HMSA 5F2MA 5DN1A 1R46A 2ZZ5A 1HG3A 3S8HA 3GNDA 2W79A 3GXPA 4N2YA 1KM3A 3NYZA 3BW4A 1YADA 1GVRA 2YW3A 1Q6QA 3LV6A 5DBUA 3EXTA 4O1CA 3FKKA 1S5VA 1B3OA 3KHJA 4IOTA 5F2LA 4X22A 4ORIA 1EP3A 1TPEA 3SJ3A 3NL2A 4RJEA 3LCXA 1MEWA 4HPJA 1MEIA 1M5WA 4Y96A 1ALDA 3TKFA 1LBLA 2FB3A 1FWNA 4GUFA 1YTKA 3FJLA 3CT7A 2VEKA 3FIGA 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 1OX6 A;  3STE A;  4HSO A;  3F4W A;  1Z41 A;  4LS1 A;  3MO7 A;  2YGY A;  4M5P A;  4MY8 A;  3G1V A;  3E02 A;  4LT9 A;  3CEP A;  1D3H A;  4RKA A;  3GB6 A;  3HB9 A;  4M6P A;  3BGG A;  3PUO A;  4G1K A;  5GVJ A;  3LTP A;  1LCO A;  1GJP A;  5D38 A;  1F73 A;  1ZEN A;  2B7P A;  3EX4 A;  4BWL C;  3S5O A;  2NUW A;  2TRS A;  2DZU A;  5BMX A;  4O54 A;  2FB2 A;  1O94 A;  1KTC A;  5CPL A;  3M6Y A;  1SO5 A;  3GAY A;  1DQW A;  5LSM A;  1THF D;  1QPQ A;  1VQT A;  4LRS A;  3C0J A;  3E9A A;  2A1Y A;  5BOO A;  3OIX A;  4I9A A;  3PM6 A;  2V2H A;  1MZH A;  4NU7 A;  2YFN A;  2Y7G A;  1DOS A;  4EIV A;  1HL2 A;  1TPD A;  1XDL A;  1M7P A;  5G1Y A;  4RCX A;  3TUU A;  1ZAJ A;  3FLU A;  4AAJ A;  3TML A;  4W9T A;  4YWI A;  4MVA A;  2DZV A;  2ZRW A;  4I7W A;  1W5O A;  2HTM A;  1AL8 A;  3S9Y A;  2ZZ4 A;  1R47 A;  1WA3 A;  3NA8 A;  4JTJ A;  5FF4 A;  3O16 A;  1F76 A;  1RPX A;  2FTP A;  4K36 A;  4H4I A;  2B7Q A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 6PTD A;  1RBL A;  4OE7 A;  1MNZ A;  3I3B A;  2E1D A;  3GDB A;  1X38 A;  2ZTJ A;  4ZMG A;  3O0K A;  3QSR A;  3VNZ A;  2E68 A;  3RLV A;  5T9B G;  3REQ A;  1AL7 A;  4JCL A;  3F4N A;  4TV6 A;  3W1P A;  3PUL A;  4EVZ A;  3GBE A;  3L0K A;  4XV0 A;  7XIM A;  1JI1 A;  3TSM A;  4IGS A;  4EK7 A;  3JW7 A;  3LDV A;  3E74 A;  3W2K A;  2XM2 A;  5EGR A;  5AC8 A;  1XH2 A;  3W1A A;  2E5D A;  4REQ A;  2EKC A;  1ZRQ A;  4WXZ A;  2QJN A;  3SGZ A;  4XZM X;  5EFF A;  3WQG A;  3IAR A;  5A6B D;  4PFM A;  3I65 A;  1V4Y A;  1ZBC A;  2CIT A;  1M7O A;  3D6N A;  5FAG A;  3K30 A;  3L21 A;  1BSL A;  1UW9 A;  3L4X A;  3FSU A;  2WHM A;  3A13 A;  3TC6 A;  1BHG A;  3Q94 A;  1J0K A;  2WHK A;  3QKZ A;  3E96 A;  2PBO A;  3A64 A;  3TXZ A;  2BG5 A;  3VXG A;  3VNI A;  3BCJ A;  4C6O A;  1FWE C;  2HEJ A;  4XD4 A;  2WMG A;  1GOK A;  4L56 A;  4YS1 A;  4O1B A;  1J01 A;  5ENL A;  3TCE A;  1LLZ A;  2Y24 A;  3DES A;  1VHC A;  1WDP A;  5DY2 A;  4GY7 A;  1F6Y A;  2PWU A;  2VGF A;  3IJ7 A;  1REQ B;  4XSM A;  2KZH A;  1O6I A;  1SSD A;  4LV9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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