3AXXA

Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from the archaeon pyrococcus horikoshii
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
QTPTGIYYEVRGDTIYMINVTSGEETPIHLFGVNWFGFETPNHVVHGLWKRNWEDMLLQIKSLGFNAIRLPFCTESVKPGTQPIGIDYSKNPDLRGLDSLQIMEKIIKKAGDLGIFVLLDYHRIGCTHIEPLWYTEDFSEEDFINTWIEVAKRFGKYWNVIGADLKNEPHSVTSPPAAYTDGTGATWGMGNPATDWNLAAERIGKAILKVAPHWLIFVEGTQFTNPKTDSSYKWGYNAWWGGNLMAVKDYPVNLPRNKLVYSPHVYGPDVYNQPYFGPAKGFPDNLPDIWYHHFGYVKLELGYSVVIGEFGGKYGHGGDPRDVIWQNKLVDWMIENKFCDFFYWSWNPDSGDTGGILQDDWTTIWEDKYNNLKRLMD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Hydrolase
source organism Pyrococcus horikoshii
publication title Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from Pyrococcus horikoshii by crystallographic snapshots
pubmed doi rcsb
molecule keywords 458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase
total genus 140
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3axxA00
1LL4A 4K68A 5HPOA 1QI0A 4LX4A 2J7GA 4UFIA 1OT1A 3SCRA 3ARSA 4X0VA 1C8YA 1BGGA 4E4PA 1JZ6A 4UZUA 1W9UA 3MSDA 2XM1A 3EMCA 3DYMA 4P7RA 1QNQA 1W1PA 4W7VA 4JFWA 3ZSSA 3KZSA 3ARRA 4NI3A 3W81A 2WMFA 4CU7A 1LF1A 2CBVA 2QPUA 3ARTA 4S3JA 1UWIA 3BCFA 1Q6FA 1RP8A 2WBGA 1YHTA 1BFNA 3QOKA 3VUPA 3BXWA 3J7HA 2WBKA 2CBUA 4B3KA 1QPKA 1EDTA 3SCUA 4JFSA 4MNKA 3NJ3A 1KR0A 3OLIA 4F79A 3WENA 5D8ZA 2J78A 4WIWA 1HKJA 4LYRA 1W32A 4JZ5A 3GH7A 3WDQA 2D2OA 2EPNA 2BXYA 1KCLA 3AS2A 4HZ6A 2GK1B 4JIEA 3ALGA 4D6DA 2WZIA 2UY4A 1B1YA 1WZMA 1GQLA 2WHJA 1HF6A 4CU8A 3ARXA 3THDA 2YBUA 5CGMA 1F4HA 1B3WA 5GNXA 3WMCA 1KGUA 2D0HA 4ZENA 1JG9A 4W84A 3ZM8A 1J12A 4OUEA 5FL1A 3VD4A 1GNXA 1E4IA 3ARVA 1UA7A 3WDHA 4GI8A 4QDMA 4C7DA 2BY2A 5A2AA 1GCYA 1VFFA 3O2LA 3S6TA 1DTUA 1V3HA 1NWUA 3ALFA 3SUUA 4MDPA 4PSPA 5DT7A 1E4NA 3AMCA 3UG5A 5CLWA 1J0ZA 3T0AA 4MAZA 2XIBA 5E6ZA 3CUGA 4W8BA 3SCTA 1JZ3A 1JFHA 1E55A 2PI6A 3A4XA 3AXHA 3VO0A 4P7LA 5D9MA 5ABEA 1CPUA 2VT0A 8CGTA 1MYRA 3M6DA 3THCA 5JIWA 1ZJBA 5E6YA 4ACYA 3B9DA 2GJXB 2BS9A 3AHYA 4CN6A 1MQRA 5AYIA 5FD0A 1FP8A 1QHZA 2EPLX 3FHQA 3WUBA 1JGIA 3AIRA 3OGVA 1VFUA 4W8AA 3L4WA 4HPHA 4AW7A 4GO8A 1FH7A 4CN4A 1PIGA 4D71A 3RILA 2ZX9A 2GJPA 5AY7A 1KXTA 2EPMX 1V0NA 1EHNA 2YDSA 5EFFA 5BXTA 1MQQA 4PCTA 4H8UA 4L4OA 4DUXA 2D23A 2DT0A 5BRQA 1JD9A 1E56A 3L4TA 2QPSA 2W92A 4C7FA 2Y24A 4WLCA 3TTSA 3W38A 3WL0A 2V5CA 4AIUA 4TVDA 2W63A 1JDDA 4B9ZA 2G8ZA 5HXMA 1G9HA 4HZ7A 2EJ1A 3MV01 3EYPA 4XZBA 2DEPA 4MDOA 3WDRA 4EANA 1QW9A 1ODZA 1D3CA 1SR0A 4JL1A 1CXLA 1V3JA 4QP0A 4UQAA 3AS3A 3I3EA 4HU8A 2WWDA 2Z1SA 1MW0A 3AOFA 4YN5A 1BYAA 2CIPA 2A3AA 1O7AA 3DC0A 3PN8A 1WZLA 2XTKA 5GPRA 3WN6A 1EQPA 3AXXA 1I1WA 1GOKA 1M53A 2GVYA 2WM0A 3FXYA 3UR7A 3WF3A 4OKDA 1JI2A 1UWSA 3L4ZA 4KH2A 5HPCA 1ITXA 3BGAA 2GFTA 4M81A 4V28A 2V38A 3F5KA 1VENA 1CGUA 1MWOA 2X05A 3I3DA 5D4YA 2W91A 4XZWA 1J9YA 3BAIA 1CXIA 1CXFA 2MANA 1C90A 3VIJA 4UQ9A 1TCMA 2GDUA 1KGXA 4AD4A 4KGJA 1LLOA 2Y2WA 3QHOA 4N42A 3AICA 1KBBA 5DO8A 1CECA 1Q4NX 3BMVA 3WIJA 4JL2A 3W26A 1TA3B 1MW2A 5A6BD 3VM7A 2YBTA 2DPEA 2OSYA 2XWEA 4Z2HA 1HX0A 1H11A 4M24A 4H2CA 1QNSA 1R7AA 5M03A 4JCMA 4PMQA 1JAEA 4CU6A 4R27A 5F7UA 4X9YA 4DUVA 4ATLA 3K4DA 3ZR5A 1JDCA 1EXPA 3WNOA 1J18A 4EKJA 2VOTA 2AOSA 3CMJA 1XD1A 3AMLA 1GW1A 1JL8A 2WC7A 3BAXA 3A4AA 2PWHA 2EPKX 3KL5A 4PYSA 3WNMA 3K4AA 4XV0A 1HVXA 4M56A 2BFGA 3PZMA 2WMIA 3FAXA 1Q6CA 2ZXDA 3AYSA 3N18A 1SMAA 4KRUA 4HMDA 2DDXA 4RE4A 1P6WA 2VR5A 1TVPA 4QCEA 4C7GA 5E9AA 2VR4A 1VFMA 2D24A 1IZJA 5CG0A 2G3MA 3CH9A 1JF6A 1GVIA 2GDVA 4W8LA 3BAJA 3WQWA 1BVNP 3PTQA 9CGTA 2CBJA 1EQCA 5DMYA 4W5UA 4BQ5A 5EB8A 2OLHA 4IPLA 2G4FA 4AISA 2DQXA 1CNVA 5IHSA 3UERA 1B3YA 2GUYA 1HJQA 2Z1KA 2W66A 2UY2A 4W5ZA 1UR4A 4OZOA 4PMYA 1V3IA 1OIMA 2YKKA 4F9JA 1HP4A 2CNCA 1LL7A 4YHEA 4CD7A 2XJ7A 4YHGA 4GZEA 5IHRA 4KRTA 1V02A 1R7OA 5KEZA 2XFRA 2BV9A 1Q6GA 1JZ7A 1W2PA 3VD3A 2VMFA 2BY3A 3NUKA 1V3LA 2DSVA 2WVSA 2QF8A 3BLPX 4PMNA 4HPGA 3W25A 1TUXA 5CPSA 4PMVA 3OG2A 4JHOA 1Q6EA 3N11A 1TR1A 3EMQA 1BPLB 2VURA 3CZEA 3L4VA 4EK7A 1KR1A 3CUJA 3WD0A 4UTFA 1E6QM 3FNDA 1NOUA 2Y4SA 3WD1A 5BROA 1ZU8A 2XFFA 3BC9A 4TUFA 3MANA 3ZSTA 1LG2A 1CXHA 1F4AA 4ACZA 4ZE5A 2QLYA 4CD6A 2WCAA 3VVGA 1OINA 3WF1A 3WUEA 2CESA 3WDJA 4TX6A 3WUFA 4PN2A 3NDYA 4WSKA 3SUSA 2DGAA 2CITA 4Z2KA 1WO2A 3GXDA 2YDQA 1WPCA 1DWIM 3AZTA 5CXPA 1CTNA 1EGZA 2X8RA 1UH2A 5EMYA 2FHBA 1C8XA 4AZ7A 6TAAA 4J27A 1E3ZA 5JUVA 4UFHA 5I2UA 4DWSA 2YA0A 2DSKA 1HKIA 1RH9A 3B8SA 1K6AA 3UEQA 4UCFA 1E71M 3W53A 2X2YA 1J01A 5I77A 1CGWA 1XGZA 2AMGA 3AISA 1QBBA 1HP5A 2WVVA 1CGTA 1XRVA 2Y8KA 3IAPA 2ZIDA 1NOWA 2GSJA 3UG3A 1UD4A 1GUVA 2E9BA 5M17A 3KWXA 1R86A 4PTMA 3S2CA 2VX6A 5AC5A 3W29A 3WEZA 1UR9A 4BCEA 4H8HA 3VU2A 1R87A 3KEHA 1M03A 5HOSA 3UETA 4X0NA 2XVGA 4OBSA 1BYBA 1OCQA 4GKLA 3AIUA 1WDQA 4D72A 3WD4A 1UKSA 1PZ3A 5TD4A 2FGLA 3WH7A 2JEPA 5ABHA 4W88A 3W6MA 4M8UA 3F5LA 5E70A 1NOFA 4UQDA 5I24A 2JE8A 4Y7EA 2G3IA 1TG7A 2V3EA 3W28A 1CLVA 1MVYA 3PZGA 2CBIA 5JBEA 2WHKA 5A8PA 1K9EA 2D20A 1BYCA 2AAAA 3PTMA 4OOZA 5ABFA 4UFJA 3HJEA 4JKKA 1HJUA 2WNWA 4RL3A 3NSXA 1HKMA 2JIWA 2DIEA 4AIEA 3ARQA 2W67A 3II1A 3ZMRA 1HJWA 1UYQA 2X1IA 4WKAA 1PEZA 7TAAA 1BYDA 3WH6A 2ZX8A 2YA1A 5FL0A 3UESA 3AHTA 1GQJA 1LWJA 3DECA 4H7VA 1JYXA 3VIOA 1GHSA 3W6LA 3SUTA 4MJ4A 1OGGA 2WK2A 2VQTA 3M07A 4J3TA 3VTRA 1C3FA 1OB0A 2E3ZA 2CYGA 2PWEA 1C8QA 2VO5A 1UR2A 1C91A 1GQIA 1G5AA 1W3LA 2NT0A 1E6ZA 1R8LA 1V6XA 1B9ZA 1GJUA 3ARZA 1QHPA 1NARA 4B3LA 3KL0A 1VB9A 1ODUA 1AQ0A 3AMGA 2VZOA 1UKTA 1XV8A 4AZBA 2WKLA 1RPKA 4B16A 1DWFM 1ZBKA 2VX5A 1ISXA 1SYTA 1H0IA 2UY3A 2BVDA 1GJWA 2VNCA 2CERA 2XSBA 4ZEPA 2PWDA 3WF4A 2CXGA 3WMSA 2WMHA 1H1NA 1DWJM 2HVMA 3ZT7A 1BVZA 1WDSA 3WH8A 1QI4A 4KMQA 3W37A 1E1EA 4E2OA 1OIFA 1JFXA 3CUHA 3GNRA 2J47A 5CSYA 2BHYA 4A4AA 2E8ZA 4AD5A 1HJXA 1DWAM 3ZO9A 2VCBA 2F2HA 1V0LA 2J4GA 1X6LA 2OYKA 1UKOA 2WSPA 3MUIA 3CZLA 5BWFA 3AS0A 4WJXA 1H09A 3GYCA 1KCKA 3WEMA 2VZTA 2ZE0A 5IFPA 1XH2A 1ECEA 1W9PA 4B15A 4CUCA 3GXIA 4U5KA 5FIPA 3AFBA 3UG4A 3ARPA 2DT2A 2OYMA 2Q8XA 2VX7A 1EIBA 3AIEA 4W86A 4U5IA 2CEQA 4HA3A 1QI3A 3SUWA 3AIQA 3QHMA 1KBKA 1QI5A 2WAGA 1FH8A 2FDMA 1LL6A 7CGTA 2XGBA 3RIKA 3OZOA 2OSWA 1OSEA 1BQCA 1W9VA 1E15A 4FLSA 3OIHA 2J7DA 1JZ8A 1JAKA 1G1YA 1D2KA 4JFUA 1QNOA 3D5HA 4UOJA 3LPFA 4UFMA 3A47A 3BCDA 3A3HA 1VJSA 2D0GA 1H0GA 4PTWA 1J0KA 1VBUA 2OWXA 2WWCA 2FH6A 3VDBA 1Z32X 3SCOA 4F9DA 3CMGA 4AY1A 1B2YA 1UD3A 3IJ9A 3KE0A 4TXEA 1O6IA 1PX8A 3CHDA 1UKQA 3FAWA 3TA9A 2D0FA 5HNNA 1K9FA 1JIBA 4MB4A 2XM2A 1TFVA 1W2VA 1V02E 4DUWA 4UOZA 5CLTA 3WNPA 5A8MA 3PZUA 4MADA 4FMVA 3AHVA 4JKMA 3W0KA 4WSJA 3WQ8A 5A69A 1WE5A 4V2XA 2XWDA 5LYRA 1UUQA 1XYFA 3ARYA 4RE2A 2ZWYA 1B31A 1WZKA 3U7VA 2GK1A 2EQDA 4BQ3A 3D3AA 3NSNA 2PBOA 4WKHA 2YDRA 3EDDA 1JYNA 3U5UA 5CJ5A 2J8FA 3MV11 3T2QA 2E4TA 1UA3A 4TTGA 1PX3A 2VCCA 5DFAA 1V3MA 3SCNA 1B90A 2DSUA 4PMOA 1FHDA 3WNKA 2IUZA 4QCFA 3VD7A 3K8KA 1E5NA 2VQUA 5CGTA 1QI2A 1Y7VA 2WMIB 3GH4A 3KL3A 3EBVA 5KZ6A 3L4YA 1TE1A 2EBNA 5D9PA 3W27A 3VDHA 2XUCA 1TMQA 1WAWA 4M82A 4V27A 2G3NA 4ZXOA 4U33A 1DWGM 4W7UA 3VGBA 1WZAA 2WCSA 1MXDA 1JZ5A 4CCEA 2JEQA 1DHKA 5ABGA 2XIIA 4AD3A 4QLLA 2XVKA 5C8BB 1CDGA 2J79A 4GQRA 1PIFA 4PUDA 2WYSA 3UCQA 1JF5A 2NW0A 5A6BA 2GJXA 4GZIA 2JALA 3LPOA 1FP9A 1ZBCA 2IXUA 1G0CA 2CHOA 3DYOA 1UWUA 1L8NA 4U2ZA 3PTKA 2PF0A 1Q6DA 1XH1A 3GXMA 3CO4A 4ATDA 3PZOA 5I0DA 2WLZA 1EOKA 3U7BA 4EAMA 3VNYA 3TTOA 1BAGA 4PUEA 4W87A 1V08A 3WNLA 1JYWA 1UQZA 3CTTA 3WL1A 4J3XA 3VINA 3AIBA 2WSKA 3MSGA 1QHOA 4AC1X 4AYSA 5A1AA 3WKZA 4QFUA 2VI0A 1E5JA 3L2MA 4UFLA 5CSUA 1OGBA 3ZJ8A 3WY1A 4UFKA 1U2YA 3ZT6A 4Z2JA 1MQPA 3RPMA 1UWTA 2WPGA 4ACZB 5I5RA 2DH3A 1D7FA 3VGDA 3EDEA 3CZKA 4E8CA 2W5FA 2BNJA 3NDZA 4TX8A 2YIHA 5CPQA 2YL6A 3GBEA 3N1AA 3B9EA 1LJYA 1XCWA 2RGMA 4KWUA 4OBRA 4JAWA 4GZJA 3CZ8A 6CGTA 1UWRA 2QHAA 1V0MA 2V3FA 1BG9A 3SCQA 4J3VA 3L2LA 2OYLA 1G01A 2F8QA 2DT1A 2ZX6A 2WANA 2WVTA 2DH2A 3VMNA 1HJSA 4OIFA 4LYQA 1EO7A 4MNMA 4CVUA 4AZCB 3NSMA 2EXOA 2B31A 3F5JA 1VRXA 3CHCA 3MS8A 2J8GA 1ESWA 5A6AA 5D9NA 4E8DA 4J7RA 1KXHA 3WQVA 3WNNA 2OSXA 1UHVA 3CZJA 3OLDA 4AD0A 4IM4A 2WVVB 4AEEA 5I6SA 1PBGA 3WFLA 2JIEA 3ZJ7A 4AZGA 1V03A 1W1TA 1TA3A 1KQYA 1UR0A 3SUVA 3BAWA 3W4RA 1JDAA 2J7FA 2X0HA 4AD2A 4GINA 4URIA 1GOQA 4P8WA 3WMBA 3HU7A 3POCA 2J62A 4JHZA 5I78A 3TTQA 3RM4A 2V5DA 2WXDM 4PCSA 3AIWA 3RDKA 1CIUA 2VZVA 3VD5A 3SIMA 2XVPA 2FHCA 4AZIA 1BGAA 1GOIA 1E73M 4FLQA 4LQ1A 3POHA 3OB8A 3IANA 3AIVA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LL4 A;  4K68 A;  5HPO A;  1QI0 A;  4LX4 A;  2J7G A;  4UFI A;  1OT1 A;  3SCR A;  3ARS A;  4X0V A;  1C8Y A;  1BGG A;  4E4P A;  1JZ6 A;  4UZU A;  1W9U A;  3MSD A;  2XM1 A;  3EMC A;  3DYM A;  4P7R A;  1QNQ A;  1W1P A;  4W7V A;  4JFW A;  3ZSS A;  3KZS A;  3ARR A;  4NI3 A;  3W81 A;  2WMF A;  4CU7 A;  1LF1 A;  2CBV A;  2QPU A;  3ART A;  4S3J A;  1UWI A;  3BCF A;  1Q6F A;  1RP8 A;  2WBG A;  1YHT A;  1BFN A;  3QOK A;  3VUP A;  3BXW A;  3J7H A;  2WBK A;  2CBU A;  4B3K A;  1QPK A;  1EDT A;  3SCU A;  4JFS A;  4MNK A;  3NJ3 A;  1KR0 A;  3OLI A;  4F79 A;  3WEN A;  5D8Z A;  2J78 A;  4WIW A;  1HKJ A;  4LYR A;  1W32 A;  4JZ5 A;  3GH7 A;  3WDQ A;  2D2O A;  2EPN A;  2BXY A;  1KCL A;  3AS2 A;  4HZ6 A;  2GK1 B;  4JIE A;  3ALG A;  4D6D A;  2WZI A;  2UY4 A;  1B1Y A;  1WZM A;  1GQL A;  2WHJ A;  1HF6 A;  4CU8 A;  3ARX A;  3THD A;  2YBU A;  5CGM A;  1F4H A;  1B3W A;  5GNX A;  3WMC A;  1KGU A;  2D0H A;  4ZEN A;  1JG9 A;  4W84 A;  3ZM8 A;  1J12 A;  4OUE A;  5FL1 A;  3VD4 A;  1GNX A;  1E4I A;  3ARV A;  1UA7 A;  3WDH A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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