3AXXA

Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from the archaeon pyrococcus horikoshii
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
QTPTGIYYEVRGDTIYMINVTSGEETPIHLFGVNWFGFETPNHVVHGLWKRNWEDMLLQIKSLGFNAIRLPFCTESVKPGTQPIGIDYSKNPDLRGLDSLQIMEKIIKKAGDLGIFVLLDYHRIGCTHIEPLWYTEDFSEEDFINTWIEVAKRFGKYWNVIGADLKNEPHSVTSPPAAYTDGTGATWGMGNPATDWNLAAERIGKAILKVAPHWLIFVEGTQFTNPKTDSSYKWGYNAWWGGNLMAVKDYPVNLPRNKLVYSPHVYGPDVYNQPYFGPAKGFPDNLPDIWYHHFGYVKLELGYSVVIGEFGGKYGHGGDPRDVIWQNKLVDWMIENKFCDFFYWSWNPDSGDTGGILQDDWTTIWEDKYNNLKRLMD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Functional analysis of hyperthermophilic endocellulase from Pyrococcus horikoshii by crystallographic snapshots
pubmed doi rcsb
molecule keywords 458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Pyrococcus horikoshii
total genus 140
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3axxA00
4P8WA 3PN8A 1PEZA 4AD3A 2DDXA 1UH4A 4M29A 1QI2A 1B9ZA 1MWOA 1HKKA 3MU7A 3EDJA 3SCUA 4PCTA 2V3GA 3WF0A 3IJ9A 3N12A 3WMCA 4ATWA 4K68A 4CVUA 2Z1KA 4CN1A 3HJEA 1B3VA 4GQRA 2XJ7A 4F66A 1R7OA 5D9PA 1CXFA 2PC8A 4NRSA 1EH9A 4HPGA 4W7WA 4AZHA 4A4AA 5BWFA 4PMVA 1ZBVA 2YA0A 1UG6A 4CVWA 4BQ2A 2GFTA 4CCEA 1UR2A 1ZBWA 1ITXA 3AS0A 2CPUA 2O9OA 4RE3A 2VX4A 3L4TA 5DF0A 3VO0A 2VZTA 5BRQA 2ZIDA 3NCOA 5C71A 1V03A 4P7NA 3VMNA 2VMFA 1BGAA 3CZ8A 3GBDA 1GOQA 1VEMA 4B9ZA 1VBUA 4U5IA 1S46A 5DT5A 1GPFA 1X6NA 4CKQA 3PZOA 2FH6A 2WB5A 3AZRA 1H4PA 3VIMA 1NOUA 4TX8A 2V5CA 1SFSA 1A3HA 4P8XA 3NDYA 4YHEA 1ITCA 2JEQA 5BXRA 4KRUA 1V3MA 3CGTA 3QHMA 1J0YA 3L4ZA 1W1YA 3CZLA 4TXEA 3PBGA 2WLYA 2VX5A 1ODUA 1XH1A 2PI6A 3W6MA 3WIJA 5ABFA 4PTMA 2PWGA 5A6BD 3U57A 1JIBA 1C7SA 1W1TA 3AHVA 5A8PA 2RGLA 3ALFA 1JG9A 2OYMA 1H0IA 2XSBA 2XFYA 1DWFM 1HP4A 2A3HA 2BNJA 2X8RA 3M6DA 5D9MA 4ACZA 2VCCA 1JAEA 1V3IA 1GHSA 3ARXA 3O6AA 5JIWA 1Y7VA 4NZCA 1V0LA 2CKRA 3WDHA 1WCGA 4M81A 4OOZA 2JE8A 4CGTA 2BVYA 4C7GA 2WBKA 3AROA 1LQ0A 2QMKA 1HJXA 3QOKA 4BQ3A 5FCZA 3MMUA 1GOWA 4JFWA 4ACYA 2J75A 1GUVA 2J47A 2O9TA 1E15A 4Z2KA 1HX0A 3RCNA 1UA3A 4LYQA 4AMCA 4CD4A 4U33A 3KL5A 1TFVA 2WLZA 2WKLA 1J01A 1E6QM 3CMGA 1MW0A 4PMOA 4TVCA 1CGYA 1WO2A 4AC1X 3FHAA 1JF6A 3VGHA 3AMCA 3VVGA 3KE0A 1EHAA 2WCAA 2J7DA 4AIUA 4GO8A 4D6FA 4QCEA 3EDEA 4FLQA 2FH8A 2J7EA 2J79A 3AMKA 1FH8A 1RD6A 1D2KA 1I1WA 3S2CA 4D6CA 3GXMA 3LPOA 3BAYA 3AIVA 3WQ4A 1DP0A 2V3DA 3AIQA 3DYMA 2DIEA 1H41A 2WVTA 3N1AA 4J3XA 1CGVA 3A4WA 3MANA 2EPKX 3WEZA 1UWUA 2CBVA 5BXTA 5CXPA 1EGZA 4DWSB 5JBEA 2XFFA 2DH2A 2XVPA 3WD1A 5TD4A 1JZ6A 5E6YA 2BFGA 3ZJ6A 4H2CA 4J28A 4B15A 2WMIA 1J12A 1EXPA 1HJWA 1NOFA 1V6VA 1R85A 1KXVA 1HL8A 1OT1A 4BA0A 1U30A 4AEEA 4PTVA 5A8QA 3AZSA 1CGTA 4KGLA 4EK7A 3AHYA 4JFTA 3FN9A 2WC7A 3BAIA 3GXIA 3WBEA 4ZXOA 4ZXLA 5ECUA 3WDRA 3BAJA 4H8HA 2WXDM 3E1F1 3HU7A 4PUDA 1EA9C 1Q6CA 2DEPA 2WMFA 3BMWA 3WSUA 3WN6A 4PSPA 4U31A 2ZUVA 1R8LA 1VRXA 2GJXA 3VIOA 4E2OA 3NSMA 2YKKA 3VTRA 4MAZA 2E4TA 1NP0A 1B3XA 1RP8A 3WEMA 1W9XA 4GINA 4GZIA 3ARSA 4ZE5A 1MYRA 3THDA 1UD2A 3PZMA 5BROA 1V0KA 2UY2A 1W9PA 3IJ7A 1AVAA 4D71A 4RL3A 1TA3A 4PRWA 4F9DA 2HVMA 3GXFA 4J27A 1PZ3A 1ISYA 1BQCA 1K9TA 3AYSA 1TVPA 4W8AA 3MMDA 3EMCA 3WUEA 5DFAA 4XZBA 3SUVA 2XFRA 2WVVA 4LPCA 4HP5A 1V3HA 1JZ5A 1UUQA 4TOQA 4X0NA 1J9YA 2W92A 3QOMA 2EXOA 2VC9A 1NH6A 4WLCA 5E0FA 1JDAA 4QLLA 1UKQA 2FHCA 1TUXA 1V3JA 4M8UA 6A3HA 5IXEA 1ISXA 1W2VA 2GSJA 2WYSA 1CWYA 5A2AA 5AC5A 1UQYA 4AZGA 1K6AA 3N11A 4X9YA 3IANA 2OYKA 4ATLA 5A6MA 4QCFA 3T2PA 3KL0A 1CECA 2WC3A 1V6YA 1JNEA 1AQHA 1E1EA 3WQ5A 2ZX8A 4W5ZA 4U3AA 3UR7A 4D6GA 1H49A 4GQQA 3SCWA 1CXHA 1M01A 4HZ6A 2XM1A 3WH7A 1J10A 4U2YA 4OBSA 1CYGA 4TTUA 4BQ4A 4D6IA 4HPHA 3EMQA 3WDQA 3WMSA 3WD4A 4PTXA 1GQKA 1UR1A 1HIZA 2WKGA 3K8LA 4CD5A 3EDFA 4AIOA 3W6LA 1FFRA 2C7FA 3AQUA 3ZT6A 2GJRA 3AMLA 1FFQA 1QNQA 6TAAA 3K4AA 1CENA 2F2HA 4D6EA 3OLGA 4GZEA 1MXGA 4WF7A 2VVNA 3SEPA 4UQAA 1H1NA 2Y24A 1FH7A 5BYWA 1BYBA 2FDMA 1JZ8A 1EO7A 1QBAA 1K9FA 5E6ZA 4MJ2A 1IV8A 1D3CA 1QNSA 3DHPA 3BC9A 4HA1A 2VX7A 2Y8KA 1B2YA 4EE9A 4W93A 1HT6A 1SR0A 3EBVA 5CQ1A 4GI9A 2BY2A 3DECA 4AD1A 3ALGA 2UY3A 1QI4A 4UQ9A 2XVNA 2V3FA 1MQRA 1E40A 1E4IA 4KRTA 4J7RA 5D9NA 3AFBA 3VD7A 2WZEA 1ZL1A 4P7OA 1AQMA 4H8UA 4HOWA 1BG9A 2ZXQA 2ZUSA 1KBBA 2WZHA 1UWIA 2CIPA 5HDRA 3VIJA 1EDGA 5A6SA 3L2MA 4M82A 2PWDA 3VGGA 1PZ2A 4UFMA 1PAMA 4OZOA 4BF7A 3GNOA 2ZX7A 1GOMA 3BLKA 1DWHM 4GKLA 2WVSA 4M56A 3F4VA 1HJUA 4ZENA 3A4AA 3WUBA 4UFIA 3VOCA 3ARQA 1US2A 5KZ6A 3ZM8A 4B9YA 3WF1A 1JXKA 3AICA 4E8DA 1WZKA 2D0FA 3AHZA 3F5LA 3AYRA 3SUTA 1PX3A 4H7VA 5ABFB 2JF6A 3MMWA 5I3DA 1VAHA 3TP4A 4PMUA 2C8NA 5DMYA 2EPNA 5AYBA 5M17A 1AMYA 2J7HA 3NSXA 3AXXA 1LWJA 4AWEA 2WWDA 1HP5A 4MAVA 1E70M 2QLYA 2NSXA 2W62A 3WF3A 4TVDA 4ACZB 1XYFA 4UZUA 2D20A 2D3NA 3A4XA 2GJPA 1B0IA 2V3EA 2V38A 2DPEA 5I78A 3NYDA 1VFUA 1TE1A 3VU2A 4XZWA 2HISA 2ZUWA 2ZE0A 4GO9A 2DSWA 4N0RA 3CZJA 2DT1A 5E9AA 1JZ4A 2ZWYA 2AMGA 2VL4A 1B31A 1C8XA 3AMDA 3RM4A 3VIPA 1DWAM 4H04A 3SCTA 2ZXDA 1W91A 1BVNP 4PSRA 5BCAA 1MQQA 3AS3A 3OB8A 5I24A 1M53A 1E0VA 1Q6DA 2E40A 5LYRA 2YL5A 2YBUA 3WFLA 1NWSA 3B8SA 1BYDA 1RH9A 3NDZA 2VO5A 4KGJA 1N82A 5I79A 2WCGA 4E8CA 4CU8A 3IAPA 1CLVA 2VURA 4KMQA 1UZ1A 5ABGA 3GH7A 1GNXA 3VD5A 1V08A 4AW7A 4HA3A 1HKMA 2YJQA 1VBRA 2GDVA 3MUY1 1MFUA 1JZ7A 2G3MA 5GPRA 1V6WA 1K9EA 1SMAA 2EPOA 5CLWA 1BPLB 5I77A 4KH2A 3DYOA 5M3WA 3BH4A 1BHGA 1UR8A 2PWEA 1OIFA 3OGRA 2ZUNA 4W87A 3PZQA 1OSEA 2ZX6A 1I1XA 1SMDA 3WUFA 4J3WA 5CPQA 4W84A 2E3ZA 4UFLA 1GHRA 1KBKA 4PMZA 3VX0A 1G1YA 1B3ZA 2WMIB 4MB3A 3ARTA 3QHNA 1UD5A 3CHFA 3KEHA 5LA1A 2A3AA 2XIBA 2DT3A 1CGWA 1QVBA 3EYPA 3WNOA 4V28A 2DSKA 2XSAA 3WQ6A 1I75A 3QHOA 3MO4A 3AS2A 1H11A 3EDKA 3K8MA 1BLIA 1E5NA 4PUEA 3BCFA 1QHZA 5EFFA 2IXUA 1GCYA 4FLRA 3UESA 3BAWA 4L4OA 1MVYA 5I5RA 3SCQA 4EANA 2QF8A 3MSDA 4LQ1A 1EOMA 1YQ2A 2OWWA 2GJXB 2GK1A 3CHEA 4BQ5A 2W91A 3T0DA 3VDHA 2DIJA 1CIUA 4D72A 2W63A 2JALA 3TTSA 4L4PA 5LA2A 2PB1A 3FY1A 1GQJA 1L0PA 1W1VA 4W7VA 1E3ZA 4X0VA 5D8WA 4S3JA 4UQBA 1E56A 3TTOA 4FLOA 4LYPA 3VNYA 3VD4A 6CGTA 3SUUA 5HXMA 4QFUA 4RE2A 4CD7A 5FKYA 1VFFA 2ZWZA 3TTQA 1KWKA 1UYQA 2ZXBA 2CBIA 4U2ZA 4EAMA 3NUKA 2WM0A 4W89A 1G9HA 4FK9A 3KWXA 2CYGA 4UFHA 3ZJKA 1E6SM 1UKTA 4AZIA 2Y5EA 1JDDA 1BTCA 4P7QA 2FHFA 1ODZA 1E6ZA 1ZB5A 3WL0A 1W3KA 4CUCA 3VX1A 1XCXA 5A6BA 3ARVA 1EQPA 4ZE4A 2OLHA 3VDBA 1J0HA 4Z2IA 2DSZA 1CPUA 3D3AA 3GXDA 3VNZA 2WHMA 1VIWA 4WJXA 3CUJA 2EO7A 3AHTA 4JKLA 4F79A 4UQCA 4WKHA 5HPCA 1WAWA 2XHYA 5GNYA 1E5JA 1ZBKA 2QMJA 3WNKA 1JZ2A 1CXKA 3OG2A 4PMRA 4MNKA 1BFNA 2J7BA 4AISA 4TUFA 3F5JA 4PMXA 2VZUA 3VGEA 1UOKA 3CZEA 3W28A 4AYSA 1UH3A 3OGVA 4JFVA 1BVZA 2Y2WA 3GYCA 2VUYA 2JFEX 1UZ4A 4JFUA 3AIUA 4IISA 3UG3A 3WDPP 5FL0A 1OCQA 4JL1A 4P8UA 2A3CA 1W9DM 5CLTA 3SCRA 2XVKA 1X6LA 2J7FA 3ZO9A 3CBWA 2W61A 2E8YA 4LXFA 1Q6FA 1R86A 2PBGA 5A8NA 3VMPA 4RE4A 3L4YA 4AZCB 4MNMA 2GUYA 2VTFA 1LG1A 1E55A 3AXHA 1KXTA 1WNOA 3B9AA 3W38A 4JHOA 1OGBA 3S6TA 4PEEA 2FGLA 1PIFA 1VJZA 1UWTA 1KGXA 4MDOA 4UFKA 3ECQA 2VX6A 5A6KA 1HJVA 4QLJA 4J3SA 3VDCA 4MB4A 3W37A 2DGAA 4P7LA 1R7AA 4D1JA 5CSUA 2WMHA 3W29A 1KQYA 1MW2A 1NWRA 2BS9A 2XWEA 4CU6A 1E9LA 2PWFA 2VQTA 3WH6A 4JAWA 2WHKA 4PCSA 5EB8A 5I6SA 3UCQA 4HU8A 3WNNA 1HNYA 3NJ3A 1P6WA 3MS8A 5FOOA 3SIMA 1XGZA 1UKSA 3WF2A 3T2QA 1KCLA 1Z32X 1JNDA 1EO5A 3PZTA 4HMDA 3VGDA 1NARA 5DEZA 1C8QA 3EDDA 3D5HA 1WZMA 3OLDA 7A3HA 1US3A 3CUIA 1ISWA 4AZ6A 1GONA 1UD4A 1KGWA 1GZJA 1QW9A 3WY1A 4CN6A 4CD6A 1NQ6A 3MUZ1 4YPJA 3AXIA 2BHYA 4M24A 5A6LA 1O7AA 3WQVA 1CNVA 1UHVA 1Q6EA 2GDUA 3ARYA 2CERA 5IHSA 3AISA 3ZOAA 2VR5A 1JD9A 1XH2A 4AZ5A 4UQDA 2C0HA 2FHBA 5EFDA 1B90A 3GM8A 4XB3A 3IAQA 1HVXA 1QNPA 3AJ7A 1LJYA 4JCMA 2BY1A 1OINA 2VRJA 1JYVA 1B30A 1HVQA 3RM8A 5A6AA 1MXDA 4PYSA 3WQWA 3TONA 2X0HA 3SCVA 1V6UA 1ECEA 1Q6GA 4NSBA 1QI5A 4H8VA 3G6MA 1UWRA 3FAWA 3IK2A 3WD0A 2Q8XA 1W32A 1UA7A 4GPNA 2YIHA 5FD0A 1JGIA 1E71M 1DWIM 1AQ0A 3LMYA 3OGSA 3II1A 2EEXA 1B3WA 3AOFA 4UOQA 4UZSA 5E70A 3HN3A 1LL4A 1KGUA 1VF8A 1VB9A 2ZOXA 4AIEA 1QBBA 4HMCA 3ARRA 1L8NA 2CBUA 2WSPA 5CGTA 5GQBA 1IZKA 2XVLA 3DHUA 3M07A 1QI0A 2BHZA 3LPPA 2UWFA 1H0GA 2F8QA 3WDJA 3U5UA 5CG0A 3CPUA 2BY0A 3WENA 2O9PA 4ATDA 3OZPA 3VD3A 5JIPA 3THCA 2B31A 4BZYA 3K4DA 4DWSD 5GNZA 2VQUA 3ZMRA 2XPKA 3WBAA 3L4WA 1TVNA 1DWJM 4UQEA 1EDQA 3CO4A 1Q4NX 2ZUMA 4QP0A 5DO8A 4DM1A 2EPMX 4NI3A 3WF4A 3AIBA 1WP6A 3W26A 5E0CA 5FIPA 2PBOA 3SCSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4P8W A;  3PN8 A;  1PEZ A;  4AD3 A;  2DDX A;  1UH4 A;  4M29 A;  1QI2 A;  1B9Z A;  1MWO A;  1HKK A;  3MU7 A;  3EDJ A;  3SCU A;  4PCT A;  2V3G A;  3WF0 A;  3IJ9 A;  3N12 A;  3WMC A;  4ATW A;  4K68 A;  4CVU A;  2Z1K A;  4CN1 A;  3HJE A;  1B3V A;  4GQR A;  2XJ7 A;  4F66 A;  1R7O A;  5D9P A;  1CXF A;  2PC8 A;  4NRS A;  1EH9 A;  4HPG A;  4W7W A;  4AZH A;  4A4A A;  5BWF A;  4PMV A;  1ZBV A;  2YA0 A;  1UG6 A;  4CVW A;  4BQ2 A;  2GFT A;  4CCE A;  1UR2 A;  1ZBW A;  1ITX A;  3AS0 A;  2CPU A;  2O9O A;  4RE3 A;  2VX4 A;  3L4T A;  5DF0 A;  3VO0 A;  2VZT A;  5BRQ A;  2ZID A;  3NCO A;  5C71 A;  1V03 A;  4P7N A;  3VMN A;  2VMF A;  1BGA A;  3CZ8 A;  3GBD A;  1GOQ A;  1VEM A;  4B9Z A;  1VBU A;  4U5I A;  1S46 A;  5DT5 A;  1GPF A;  1X6N A;  4CKQ A;  3PZO A;  2FH6 A;  2WB5 A;  3AZR A;  1H4P A;  3VIM A;  1NOU A;  4TX8 A;  2V5C A;  1SFS A;  1A3H A;  4P8X A;  3NDY A;  4YHE A;  1ITC A;  2JEQ A;  5BXR A;  4KRU A;  1V3M A;  3CGT A;  3QHM A;  1J0Y A;  3L4Z A;  1W1Y A;  3CZL A;  4TXE A;  3PBG A;  2WLY A;  2VX5 A;  1ODU A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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