3AYR | Genus

Total Genus 142

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	142
sequence length	366
structure length	366
Chain Sequence	HHVDDDDKIRDISSKELIKEMNFGWNLGNTMDAQCIEYLNYEKDQTASETCWGNPKTTEDMFKVLIDNQFNVFRIPTTWSGHFGEAPDYKIDEKWLKRVHEVVDYPYKNGAFVILNLHHETWNHAFSETLDTAKEILEKIWSQIAEEFKDYDEHLIFEGLNEPRKNDTPVEWTGGDQEGWDAVNAMNAVFLKTVRSAGGNNPKRHLMIPPYAAACNENSFNNFIFPEDDDKVIASVHAYAPYNFALNNGEGAVDKFDAAGKRDLEWNINLMKKRFVDQGIPMILGEYGAMNRDNEEDRATWAEFYMEKVTAMGVPQIWWDNGVFEGTGERFGLLDRKNLKIVYPTIVAALQKGRGLEVNVVHAIEK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Substrate binding of a GH5 endoglucanase from the ruminal fungus Piromyces rhizinflata. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Endoglucanase
molecule tags	Hydrolase
source organism	Piromyces rhizinflatus
total genus	142
structure length	366
sequence length	366
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2011-05-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3ayrA00

4S3KA 3VUPA 1OGSA 3WD3A 2GK1A 2WMJA 1BVNP 3EDJA 2GJPA 1LJYA 3VU2A 1DWAM 5E70A 1E6XM 4PRWA 2CPUA 5EMYA 1V02E 3CHEA 1B3ZA 5C71A 5BXSA 1HP4A 3WNLA 5F7UA 3WQ5A 5I2UA 1VRXA 4D6GA 2XSAA 1VENA 1SMDA 1YQ2A 3DYOA 4IUGA 4PCTA 2PI6A 2V38A 3WDQA 2OYLA 1JYWA 1JI1A 1X6LA 3WQ4A 1GOQA 2D20A 4MAVA 1UHVA 1QOXA 1W3LA 1W3KA 3OIHA 3TOPA 1E4NA 4OIFA 3N1AA 4MPKA 3W6LA 1FH8A 3IK2A 2CYGA 3VM5A 1OSEA 3RPMA 3CZGA 1GOMA 3SCUA 3EDDA 1HNYA 4M80A 2XVLA 3BCDA 5C70A 2WMFA 4UQEA 4GIAA 4E8DA 3VD9A 2VR5A 2WMIB 3FHQA 1XH0A 1NM9A 4PMUA 3UR8A 4BS0A 4UTFA 1GNXA 1ZB5A 5M5DA 4MAZA 7A3HA 2EPMX 4WKHA 4EANA 1W1VA 1M53A 4ZE5A 1GQLA 4GZJA 3L4ZA 4YHEA 5ABEA 3A3HA 1HJSA 4AD5A 4W93A 3PBGA 3ZSSA 3SURA 1CPUA 3POHA 1EDQA 3WEZA 4QLJA 3WELA 3U7BA 4PTXA 4RE2A 3TTYA 2DH2A 1ITXA 2W5FA 3OA5A 1JF5A 1C92A 3RCNA 5HPCA 2F2HA 1TMQA 1C7TA 3EMZA 3UERA 3AZTA 3II1A 4GQQA 1EHNA 3VD4A 2WXDM 3MO4A 1EO5A 3ZJ6A 3CMGA 2UY5A 3BAXA 3WH8A 1UQZA 3NSNA 1J18A 1HVXA 2X09A 1FH7A 4PMQA 5ABFA 4FLRA 1UKOA 1GPFA 2VR4A 4PTWA 3WSUA 4ZXOA 1NWUA 1E70M 3SCSA 2VCAA 4CCCA 3ARVA 4LX4A 3CUGA 1E6SM 3ZOAA 1EA9C 3L4YA 1CYGA 1O6IA 1ISYA 3VD3A 3WF2A 3KL5A 3WNNA 1CEOA 2GFTA 3AZRA 1KGWA 4HTYA 2FHFA 3RJXA 1UZ4A 3AHVA 1H5VA 1L0PA 4JKLA 2WC4A 3NSMA 1B90A 3THCA 1PBGA 5FL0A 2BVTA 2V5DA 1XC6A 4CKQA 1CIUA 3B9AA 3OLIA 2VTFA 4PN2A 2WZIA 1UWQA 3VINA 2VRJA 3WDRA 5AYIA 3A4WA 2EPOA 4HZ7A 3FAWA 3EMCA 3SCPA 3WDIA 1A47A 3L2LA 1F4HA 3WL1A 4IM4A 1JZ8A 1KGUA 4MJ4A 2GDVA 1JZ7A 2TAAA 1KGXA 2BVDA 5TD4A 2WVVB 5DT7A 3B9DA 2JFEX 1H4PA 4H8HA 2WSPA 5EBAA 4X0VA 1HF6A 1MYRA 2ZUWA 3WH7A 2F61A 2ZWZA 2W92A 1SR0A 1UZ1A 3PN8A 2J7EA 3F5LA 3FNDA 4CD5A 5LA0A 2PBGA 4W89A 3RO8A 3FN9A 1K9DA 2WKLA 1X6NA 3AMCA 3NUKA 3VTRA 5A6MA 1G0CA 4JKMA 1V3JA 3QHMA 1UYQA 1W2VA 1E0WA 1UKTA 3T09A 4R5EA 3OB8A 3A47A 5M03A 3HU7A 1JL8A 5GNYA 1DWIM 3DHPA 5I23A 3G6LA 4CD7A 1WDQA 2Z1KA 4UOZA 5GPRA 3WDJA 1QNSA 3ZJ8A 4WF7A 2Y24A 1FP8A 2WK2A 1QW8A 1RP8A 3VDCA 3W28A 2V3FA 3W0KA 4AC1X 2DPEA 3GTNA 4CN1A 2CNCA 3ZR6A 2CHNA 2FGZA 1GJUA 5IFTA 1LWJA 5CSYA 3VIIA 1W32A 1AQ0A 5I0DA 2WKGA 5I78A 3GBEA 3SUWA 1H1NA 4WK9A 1LWHA 1UR9A 1VBRA 4M8UA 4U33A 3AHXA 3AI0A 2J75A 3AHZA 4BCEA 2J4GA 3GNRA 1JDDA 3W4RA 1KB3A 5JBDA 2ZX6A 1UG6A 1UR0A 3EDFA 1UR4A 1Z32X 1PX3A 3PTKA 4MDPA 4A3HA 4DWSA 3GYCA 4XV0A 1NOFA 3D5HA 4Z2GA 3S6TA 1KXTA 3APGA 2WSKA 2OWWA 4ML4A 3VMNA 1UA3A 1NWSA 3L4XA 3QGVA 4HA4A 4HZ8A 4QCEA 4YN5A 2JEQA 1BG4A 3SUSA 2J79A 5D8ZA 3CBWA 3WUEA 1UKQA 1ZBWA 4QLKA 1CWYA 1E72M 1G5AA 1HIZA 4AZ6A 4BQ5A 3I3DA 3RIKA 1GORA 3A4XA 4LYRA 3N17A 4AD0A 3K8LA 4Y7EA 3RM8A 2WWCA 1US2A 3RM9A 1XSJA 4P7NA 2VT0A 2A3BA 2J8GA 1PZ2A 3WF0A 1E6RA 1XHGA 1JGIA 3VX0A 2V3EA 1HJQA 1MFVA 3WMBA 4PSPA 2VMFA 1W2PA 1PZ3A 1DWFM 2XIIA 4GI9A 1J0HA 4HU0A 1VJSA 3PTMA 3WL0A 4AD1A 3CHDA 2YLLA 2VUYA 2G8ZA 3W26A 3OLEA 1GW1A 3ARXA 3U5UA 1W1YA 2IUZA 1EHAA 1AMYA 5LA2A 2YIHA 4U3AA 1VAHA 1V3KA 1WAWA 4M56A 3MANA 4QCFA 3NCOA 1HN1A 3WY1A 1XCWA 3WF1A 1U33A 4E2OA 1SFSA 4J3WA 4GQRA 1W9UA 1NWTA 3TTOA 2VNCA 4N42A 2NT0A 2D3LA 2XHYA 2D0FA 3MKKA 1WPCA 3WF3A 4HMDA 4K68A 4AZGA 4ZXLA 3T0BA 4BZYA 2J7HA 1EH9A 1E6PA 1TUXA 1K9EA 5KZ6A 4WSKA 1UR1A 3ALGA 5IFPA 2WVTA 3VIMA 2QLYA 5I79A 3PZUA 3A4AA 3EBVA 1MQPA 2W66A 4U2YA 1CNVA 1HL8A 4TXEA 2PWEA 1OGBA 1XYZA 4ACZA 1IZJA 1J12A 4KWUA 2J7CA 5E6ZA 1WKYA 2FHCA 1C8YA 4UNIA 4H41A 4TUFA 3L4UA 2CKSA 3AS2A 2WHJA 1GONA 4W7UA 3VX1A 4XB3A 2JIWA 4GZIA 1CXFA 1KXQA 4IPLA 2VQUA 2QPSA 3OGVA 4PMVA 2ZX8A 2ZXBA 4N0RA 2OSXA 1LL4A 3EDKA 1JG9A 2DSVA 1H41A 3NIYA 4M1RA 5A2BA 2XGBA 1ECEA 2WCGA 3CTTA 1C8QA 3KL3A 1KXVA 2WMKA 4PMOA 2EEXA 4J3SA 4AZCB 4PUEA 3GH5A 5LA1A 3WDPP 5E6YA 1Q6DA 4D71A 3TA9A 5FCZA 3WNPA 3KE0A 1MXGA 3SCNA 1PEZA 4OZOA 4LPCA 2XFRA 1BYAA 2B31A 3ARQA 4CUCA 1Q4NX 5A6JA 3VIGA 5KEZA 3CHFA 3TTSA 1JDAA 3AS0A 4CN6A 5CPQA 3OG2A 2VCCA 4BF7A 4WJXA 1TG7A 3AIUA 1E15A 4V27A 1Y7VA 2W61A 3AIRA 1G1YA 1QI4A 1RD6A 3IAQA 1W1TA 3UG5A 4V28A 1W9PA 1V6WA 3VMPA 4XX6A 2YOCA 1CDGA 1XD0A 2HVMA 2Z1SA 4C7FA 4MDOA 3N11A 1OD0A 4UOQA 1PX4A 4A4AA 4Z2HA 2WANA 5A8OA 4D6DA 3NYDA 2BHZA 3IANA 1GOKA 1ZBCA 2XWEA 2ZX9A 1WZKA 3ARYA 1BYCA 1J0IA 3VGDA 1ITCA 2C0HA 1VFOA 3BMVA 4QAWA 3VD7A 8CGTA 5GQBA 2VVSA 4UFJA 1ODZA 1VBUA 3BLKA 1R8LA 3VNYA 2CBJA 3B8SA 3PZIA 4W5ZA 3AMGA 4QFUA 3N13A 4NZCA 4W85A 2WZHA 4UQCA 2NW0A 3PZTA 2UWFA 1HKMA 5E9AA 1KWGA 3ZMRA 1JNDA 2J7BA 2J47A 2CHOA 1IV8A 3VIOA 2WLZA 1V08A 4CVWA 4B16A 1JZ2A 1LL6A 1NH6A 1ISXA 3WMCA 1CGWA 3MS8A 3AOFA 4TVUA 1D2KA 2E8ZA 2EBNA 4JZ5A 1QNOA 4J7RA 1C7SA 3LPGA 3LPOA 5CLWA 3WUGA 2JF7A 1J10A 1G01A 1UWRA 3GBDA 4NRSA 2E3ZA 5DO8A 4MADA 1E71M 3CUHA 5CXPA 5EFFA 3WD0A 1PIGA 2VZSA 5CGMA 5A8QA 5ABFB 5IHSA 1QHOA 4HPHA 2OLHA 2J77A 4H04A 1E6NA 3T0AA 1WCGA 2PWHA 3O9NA 1CENA 5BRQA 2WB5A 4DM2A 3RMEA 3GNOA 1HP5A 1E3XA 1GHRA 1CXEA 4KGLA 5AY7A 3VIJA 5M17A 4OKDA 3W82A 1GCYA 2J7FA 3I3EA 2VC9A 1J0KA 1B9ZA 4C7GA 1OBAA 3GM8A 3AYRA 1RH9A 3PZNA 7CGTA 1BPLB 5CGTA 3UG3A 5BXRA 4NI3A 1W91A 3G6MA 1VFMA 3PZOA 1W9DM 5A94A 1JYNA 3ZQ9A 3NDYA 5E0FA 3WQWA 2XIBA 5E0CA 4CN4A 1QNPA 4M82A 1CZ1A 3MUY1 1QNRA 1XRVA 4JFWA 2X8RA 4L4PA 3ZIZA 1JFXA 3CZLA 1DTUA 4MNKA 4JKKA 3NJ3A 1IT0A 1BSIA 2VO5A 3IJ8A 2V3GA 2EQDA 2CITA 1R86A 2X2YA 4AD2A 4BQ4A 3MV01 1GVIA 1FHLA 1JZ6A 1M7XA 4J28A 3T08A 1BGGA 3QR3A 2WMIA 4JL2A 1H11A 1WDPA 3CZJA 3CLWA 1LL7A 2G3IA 3ALFA 2QHAA 3BC9A 1R85A 2J7DA 1WZLA 2XVPA 4D6EA 2GJXB 3AXXA 2XSBA 1QBBA 1VJZA 3N12A 5A2AA 3M46A 4PTMA 2A3AA 4GZEA 4J27A 1EGZA 3VIPA 1MVYA 1CXLA 1MW1A 2G3MA 2XG9A 3ECQA 4HP5A 4ATDA 3W6MA 1G9HA 3RDKA 1U2YA 1E6QM 5ABGA 3WF4A 2Y5EA 1V3IA 5CJ5A 3SEPA 3WEOA 5HNNA 3AMLA 5DMYA 3CZKA 1MQQA 2FH8A 1G94A 3W38A 1V03A 3SCVA 2AAAA 1HKIA 1Q6CA 3S2CA 4ATWA 4HU8A 2DT2A 4QP0A 1O7AA 2BS9A 3AXIA 4IPNB 4W8AA 5A6BD 5A6SA 2V5CA 3MMDA 4QLLA 1B31A 5JBFA 4HOWA 3PTQA 1DWJM 3U57A 4GKLA 3GXIA 3WFZA 4PSRA 4PEEA 3WUBA 3ARPA 3T0DA 1HKKA 5JUVA 2VZTA 4UFIA 2WAGA 4BA0A 2GJRA 1UWUA 1V02A 4H2CA 4D1IA 2CERA 3KZSA 3MMUA 4JFTA 3UESA 2XM1A 4PBGA 2WHLA 3PZ9A 4FLOA 2ZUUA 1GOWA 1UH2A 2J74A 1OM0A 5C8BB 2G3NA 4URIA 1KQYA 5IXEA 1UD5A 2XJ7A 4OUEA 4AXNA 2JF6A 2WLYA 2DDXA 1GUVA 1MXDA 1CLVA 1E40A 1JD9A 1XSKA 2JE8A 2WMGA 5AC5A 1UWTA 3AFBA 1QI3A 2YBUA 1JYXA 1VFFA 2VZOA 4IISA 3CGTA 4D6JA 4JCMA 3WENA 1J01A 4FF5A 3W25A 3PZVA 3AHYA 1D7FA 3N9KA 4DM1A 2D2OA 2FHBA 2O9PA 4DUWA 1RPKA 1WZAA 3K8KA 1V0MA 2WM0A 1V6YA 1LG1A 2BXYA 2EPNA 3WKZA 3W53A 4W87A 2BVYA 1B2YA 2WHMA 5EB8A 3VGHA 2BY2A 3BAJA 2AOSA 3K46A 2D0HA 1XH2A 4AD3A 2PWFA 1W9VA 1LQ0A 4MTVA 4V2XA 5HXMA 2D3NA 1FHDA 4P8UA 1FFRA 1WB0A 1I75A 1GQJA 5A8PA 1Q6FA 5I3DA 5A95A 2EJ1A 3MUIA 4JFUA 3N18A 3MU7A 2CXGA 2YL9A 1OGGA 1XH1A 3VNZA 2VOTA 1MW0A 1XSIA 1AQMA 4JHZA 1ZJAA 2WPGA 1W3HA 2QF8A 1BF2A 3AROA 4U5IA 5EFDA 4AZIA 3DHUA 3GXFA 3WD1A 1KWKA 5GNZA 4PYSA 2BFGA 2ZUMA 4GI6A 3A6OA 1LG2A 1QI5A 4Z2JA 3WD2A 3J7HA 5FD0A 3W29A 2VX5A 1UWIA 4LQ1A 3CH9A 4B15A 1MW3A 4D72A 3TTQA 3QHOA 3VGGA 1QBAA 4W7VA 1QPKA 2XWDA 1V0KA 3VIKA 4DWSC 1WZMA 1HT6A 1J0JA 2XM2A 1V0LA 1GVYA 1R87A 1JAEA 4H8VA 4TTUA 3F5JA 3SCOA 5I24A 5D9PA 1AVAA 3O2LA 2DEPA 1H49A 2ZUVA 3CZEA 1CXHA 2JALA 3ZT7A 3CHCA 4KRUA 4MJ2A 4AZ7A 2CETA 4EAMA 2DSWA 2FDMA 3LPPA 4KMQA 4GO9A 2RGLA 1B3YA 4AEFA 4D6HA 2G3JA 5CQ1A 3ZO9A 3VO0A 5FKYA 1CGTA 2E9MA 3E1F1 4FLQA 1WDSA 4B3KA 3CUIA 1DP0A 1TVPA 4WKAA 2D22A 3MV11 3WN6A 2FH6A 1EDTA 4AZ5A 4OBRA 4L4OA 2PWDA 1NARA 3FHAA 2ZUTA 4WLCA 2G41A 4W8BA 4AD4A 3F4VA 1BLIA 1B3XA 2PWGA 2OWXA 1EO7A 3BAWA 1CGUA 4FK9A 4AISA 2BHUA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3AYRA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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