3AZRA

Diverse substrates recognition mechanism revealed by thermotoga maritima cel5a structures in complex with cellobiose
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
MGVDPFERNKILGRGINIGNALEAPNEGDWGVVIKDEFFDIIKEAGFSHVRIPIRWSTHAYAFPPYKIMDRFFKRVDEVINGALKRGLAVVINIHHYEELMNDPEEHKERFLALWKQIADRYKDYPETLFFEILNEPHGNLTPEKWNELLEEALKVIRSIDKKHTIIIGTAEWGGISALEKLSVPKWEKNSIVTIHYYNPFEFTHQGAEWVEGSEKWLGRKWGSPDDQKHLIEEFNFIEEWSKKNKRPIYIGAFGAYRKADLESRIKWTSFVVREMEKRRWSWAYWEFCSGFGVYDTLRKTWNKDLLEALI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Diverse substrate recognition mechanism revealed by Thermotoga maritima Cel5A structures in complex with cellotetraose, cellobiose and mannotriose
pubmed doi rcsb
molecule keywords Endoglucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Thermotoga maritima
total genus 125
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2011-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3azrA00
4L4PA 5M5DA 1HIZA 1OD0A 4QCEA 1BGGA 1ISWA 1B3YA 4AZCB 1W3KA 1OSEA 2PWEA 4CU8A 2W92A 3AXXA 4J28A 4PBGA 4HA1A 3OLGA 5I0DA 1NOWA 2BVTA 4HOWA 3NSXA 4P8VA 1LL7A 2VX5A 4ZXLA 4C7DA 1EDQA 2WAGA 3ARRA 4MADA 1V3JA 4ZEPA 1J0IA 1V6VA 1RPKA 1UKTA 1V6YA 1CTNA 4MNJA 1C7TA 3IJ8A 1PX8A 1KGUA 2D1ZA 2E8ZA 4GIAA 1W91A 2CCRA 1UR8A 3BGAA 1E6NA 2DQXA 1CXFA 1ZBVA 3ZJ6A 1KGWA 3GXIA 4AISA 1XSKA 3KL0A 1E9LA 1KCKA 1HJWA 2HVMA 4W7WA 3BLKA 4TVUA 1K9FA 1E43A 3AS0A 3BMWA 1G5AA 1BPLB 1SYTA 3BMVA 2J77A 3O9NA 2QMJA 1JYWA 1XHGA 3AIRA 2AAAA 1J11A 3RIKA 1NARA 3FAWA 9CGTA 3FNDA 4S3KA 5BXRA 2PWHA 1HN1A 4MPKA 1G9HA 2W5FA 1EXPA 2WZEA 3ZT5A 5DT5A 5A8MA 4P7OA 1G01A 1JNEA 2OYMA 3L2MA 2J75A 2XPKA 2YBUA 2DPEA 4KGJA 4Z2LA 2XHYA 1QI2A 2IUZA 5CPQA 3VUPA 1VRXA 4AD1A 2PB1A 3ARQA 3W29A 1W3LA 1W32A 2ZX8A 1MW0A 2F2HA 3OIHA 4JFTA 4U2YA 1QNPA 2PF0A 4WKFA 1JYXA 1V08A 4YHEA 2XVNA 4AD4A 4UFLA 3AHXA 2CBIA 4E8CA 5IFPA 1WPCA 1UD5A 2PC8A 3EDEA 4MNLA 2UY3A 1KBBA 3PBGA 3PZ9A 3RILA 4HZ8A 2EQDA 3WQWA 3VNZA 2V3FA 3T2QA 4H8UA 4QDMA 4WLCA 4H2CA 3L4YA 4D6GA 3NUKA 1H11A 1HVQA 1UR4A 2DDXA 3VIPA 3RDKA 2DT2A 1LWJA 2CHOA 1LQ0A 3DC0A 4PMOA 3W38A 3VGGA 2PBOA 4DWSD 1UD8A 2WCSA 1QNSA 3WDPP 2J7EA 3VMOA 1JGIA 1NOFA 1G0CA 1YQ2A 2VZVA 2BXYA 3UERA 1MW1A 3EMCA 3N15A 4CCCA 3THDA 3AZTA 2RGLA 3AIQA 4LX4A 4NRSA 1TVNA 1WZAA 3NSMA 6A3HA 3MUIA 4B9ZA 2QF8A 1HJSA 1OGGA 4CN4A 1KWGA 2XSBA 3F5JA 5EFFA 3ZM8A 1ESWA 3N1AA 1JXJA 1QW9A 3CMGA 4JIEA 3OGRA 5IHRA 2C0HA 1UWQA 4AD3A 6TAAA 1X6NA 2WW5A 1KFWA 4TOQA 3SCUA 4DUVA 1MW2A 3FHQA 4H7VA 1MVYA 2GK1A 3IJ7A 3K4DA 1VB9A 2ZUTA 1KB3A 3POHA 1V0NA 3B8SA 4CVWA 3DYPA 3KEHA 3VINA 1QBBA 1NWSA 2QV4A 1V3MA 1HKMA 2VO5A 3ZJ8A 1H2JA 2F61A 1HL9A 3PN8A 1JI1A 3CZEA 2ZX6A 4PTWA 1QI5A 5ECUA 1CZ1A 5HOSA 3EDDA 2VQUA 3W37A 3NCOA 1PPIA 1XCXA 2DSZA 1J9YA 1B90A 2BHUA 1CWYA 4IM4A 2XFFA 1WDSA 3M6DA 1W9BM 2X1IA 3LMYA 4JCMA 1V3LA 4DUXA 2WKLA 1ZBKA 2GDVA 2J79A 4PMQA 3AMCA 3A6OA 3VIMA 2XVGA 1BVZA 5HPCA 2O9TA 4W88A 1DWHM 3BLPX 5FIPA 3W6LA 3ARSA 1C93A 5DO8A 5AYIA 4DUWA 1ZBWA 1XYZA 3WN6A 3WUBA 2VCBA 1ISVA 2CXGA 5ABFA 5BXSA 3K4AA 1V03A 5A8PA 5FOOA 2XGBA 1J12A 1MWOA 5LA1A 3QHNA 3SUVA 5KZ6A 4AEEA 5A6KA 3T2PA 5E6ZA 1Y7VA 3VTRA 1AMYA 3OBAA 3E1F1 5DT7A 2ZUWA 1CNVA 3OB8A 1HL8A 1OCQA 1C8YA 1FOBA 1XSJA 2O9PA 5D9MA 3SCTA 2XVKA 4U33A 1KXQA 4WIWA 3AXHA 4HMEA 3W0KA 1D3CA 2VCAA 1KXHA 1NOUA 4CN6A 1UA7A 2WANA 4LXFA 3CBWA 4ZENA 1M03A 1M53A 2CETA 1HJXA 1IZKA 1LG1A 4FF5A 5LA2A 3ARZA 1EQPA 2VRJA 1BYBA 2X0YA 2YDSA 3RM4A 3UG5A 2DGAA 4E4PA 3WDHA 1K9TA 2J78A 5A94A 1J0KA 1UH2A 2OSYA 1E5JA 3NSNA 1VJZA 2V3EA 3CUGA 1JZ8A 3MUY1 1RH9A 3WQ5A 3ARWA 1D7FA 1E0WA 4PN2A 3IJ9A 3VIOA 4U3CA 4PMDA 3K8KA 4HPGA 4FLOA 1H41A 2XGIA 1O7AA 2V5DA 2DSVA 1U30A 4Q22A 2DH3A 3N18A 2EPKX 5CSUA 5CZKA 2EPOA 1C8XA 3K46A 5I5RA 2YA1A 2WK2A 2WVUA 2A3BA 7TAAA 2WMIA 3MU7A 1CDGA 2BS9A 1NM9A 3WENA 1VFFA 3QOKA 2YOCA 5HBFA 3M07A 3UETA 1GOWA 4ATLA 5CLWA 4R27A 5ABFB 3ZOAA 2UY5A 1ODZA 2TAAA 4PYSA 1OIFA 3RJXA 1ZL1A 6CGTA 1WB0A 1VIWA 2J62A 5A95A 1WE5A 3WQVA 4JFWA 3FXYA 1TG7A 1CGTA 2DIEA 4CD7A 5IDIA 3WMSA 2ZE0A 2D22A 1US2A 1QOXA 3I3BA 1ITCA 1UZ1A 1MW3A 1UD6A 2JFEX 1QHZA 1DP0A 1H4PA 3AMGA 4GQRA 3GM8A 2J7CA 1UKQA 2AOSA 1UWRA 3BXWA 3MMDA 4UFJA 3CUJA 1DEDA 1MQRA 3WDJA 2AMGA 3SUTA 3VM5A 1FFQA 1HVXA 1E3ZA 1BFNA 1XGZA 5C70A 3EDKA 3OA5A 2G3NA 1V0MA 4F9JA 1XH1A 1V3KA 3CPUA 5DEZA 1WO2A 2IXVA 5IFTA 4PMNA 1UD3A 4LYPA 3VX1A 1SFSA 1UH4A 4PEEA 1H5VA 4HMDA 1W2PA 3RMEA 3SCRA 1HJUA 1NP0A 1OB0A 5JIPA 1EO7A 3CZJA 1F4AA 3AJ7A 2D24A 2VRQA 3AMDA 4GQQA 5A8OA 1J0ZA 5A3HA 1C3FA 3U7BA 1NQ6A 1W9UA 3WDIA 3ARVA 4P7RA 4HMCA 3CUFA 4LPCA 2XWDA 5CQ1A 1JZ4A 3TTYA 4OBSA 4IPNB 2DEPA 1NWRA 1K9EA 3MO4A 1J18A 1FH8A 3VKKA 4ZFMA 3G6MA 1W3HA 3OGSA 3VU2A 4Z2IA 2IXUA 5CSYA 2V3DA 1GQLA 4UFKA 4UZSA 1IZJA 1UWUA 4D72A 2WCAA 1K6AA 5FD0A 4W87A 3SUSA 3N17A 3VIJA 1EDGA 1UOKA 1GW1A 2J7GA 5JBEA 2W91A 3VM7A 4CVUA 3WUEA 4PSRA 4W8BA 1ECEA 4GZIA 4TXEA 3WEOA 2Y5EA 4UQ9A 1X6LA 3CO4A 2XG9A 3KWXA 2J47A 4GO8A 1C8QA 5A2BA 3WD2A 3ALFA 2ZWZA 1ZJBA 2GSJA 4RE2A 1BTCA 3WBAA 1UWSA 2X8RA 4JKKA 1E1EA 2YL6A 4MNKA 1B30A 5A8QA 2VT0A 1LL4A 2GFTA 1H0GA 3GH5A 4HOZA 4ACZA 3WKZA 2NW0A 4UFIA 4W85A 2WVSA 4QP0A 3S2CA 5C71A 3T09A 3ARUA 4AIEA 2W4XA 3MKKA 3ZR6A 2B31A 1GHRA 4WSJA 3ZJ7A 4AYSA 2VC9A 3VMPA 1AQMA 5E70A 3UG3A 4C7FA 5I77A 2C7FA 1EOMA 3VIKA 3FW6A 1P6WA 3W81A 1ISZA 1LG2A 3VD3A 4AW7A 1E4NA 1W1VA 5LA0A 1GZJA 3U7VA 4A3HA 4CD6A 2D0FA 3WD4A 3HN3A 2WMKA 4MNMA 4Q7NA 5D9PA 1JFHA 5BYWA 1UWTA 2CIPA 2EPNA 3ALGA 2C8NA 1EGZA 1NWUA 3UEQA 3I3DA 2WWDA 3SCPA 2VX6A 2CNCA 4AWEA 1CGXA 1R7AA 4BQ4A 3AIEA 4Z2GA 5GNXA 5CXPA 4AIUA 5HNNA 1TR1A 1E40A 3AZSA 2YL5A 4AD0A 5BCAA 2BY0A 3GXFA 4D6FA 1TZ7A 3WF0A 2E40A 1HKKA 1PX3A 1VENA 4QFUA 5E0FA 3L4XA 1HF6A 5M03A 5I79A 1E4IA 2FHBA 3GH4A 3OZPA 3PZMA 4WSKA 4GO9A 1H09A 5E6YA 3W26A 2VQTA 4JCLA 1JIBA 1XD1A 1KQZA 1V0KA 2ZUVA 4D6EA 4BCEA 3AROA 2EO7A 4NSBA 4UFMA 3WF3A 2XFYA 3N12A 2JIEA 1EQCA 3PTKA 3WF4A 2YL9A 1UKPA 2FHCA 4WKHA 4QAWA 1QNRA 3AHYA 2XM2A 3W24A 2FH8A 3EDFA 4HZ7A 1WAWA 1FP8A 1FFRA 4ACZB 3CZLA 2J7HA 1E4MM 3KZSA 4U2ZA 3UR8A 3AS1A 4M56A 1VEPA 2FDMA 2ZUSA 4BA0A 1ZJAA 2NSXA 2ZXQA 5HPOA 2XJ7A 4JKLA 4JAWA 3WNNA 1J0YA 3PTMA 2VMFA 3QR3A 4BS0A 1W1YA 3NDYA 4X9YA 1E6XM 1GVIA 1VF8A 2JF6A 2VZOA 1UR1A 1UWIA 5DMYA 1BF2A 1RD6A 3PZQA 3VOCA 4TTUA 3WDRA 2WXDM 3RCNA 2WZHA 3BH4A 4P8UA 4U5IA 1TMQA 2G4FA 2CBJA 5EMYA 1KR0A 2G3MA 1WZLA 3AQUA 4GI6A 2WWCA 4JHOA 3WH9A 1E73M 1E6RA 2JF7A 3VGEA 3WF2A 3VIGA 1UD2A 5AC4A 3HMCA 1LLOA 5BRPA 2VURA 4F9DA 2VCCA 4QLKA 2CBUA 4MB3A 1VFUA 3SUUA 4CUCA 4Z2HA 1BHGA 4UQCA 3WD3A 1E6PA 3AS3A 1TE1A 3BSGA 4UR9A 4N0RA 3IAPA 3RPMA 4R5EA 4J3TA 2VNCA 5D8ZA 4D6HA 2J7DA 1B3VA 4RE4A 2MANA 3WDQA 2WHMA 2VI0A 3TONA 1C91A 1V6UA 1A3HA 3PZVA 3UCQA 2X0HA 3B9EA 1V3IA 3WH8A 2YJQA 4HOXA 3MS8A 2WC3A 4JKMA 4LQ1A 2E9MA 1ISXA 3FHAA 3D5HA 3WMCA 2VX4A 1DWAM 3CZGA 1EDTA 2G3IA 3BC9A 3G6LA 1BLIA 1H1NA 1E0XA 1UH3A 3CIVA 3MUZ1 3AI0A 3ARTA 4W5UA 1GQIA 4H41A 2XTKA 1PZ2A 3W82A 1JDAA 3WBEA 2EPMX 4F79A 1EHNA 5ABGA 1B1YA 4J3SA 1WNOA 1TFVA 3WUFA 1CLXA 1ZB5A 4YN5A 3CHFA 1QHOA 1VFMA 1EIBA 2XUCA 4CKQA 4MB5A 1GONA 1N82A 4ML4A 1HNYA 3DYMA 3VD7A 5LYRA 2XFRA 1TUXA 3IAQA 3MV01 4F8XA 3ZSTA 3WNKA 4KRUA 2A3EA 3RO8A 4OKDA 1JZ3A 2Q8XA 1UR2A 4HA4A 1KCLA 2UY2A 4V27A 4B16A 3SEPA 1H49A 1W9XA 1TA3B 3OLDA 1E0VA 3BAKA 4P7QA 5EB8A 3APGA 2A3CA 2HISA 1HP4A 2BXZA 3TP4A 5FL0A 4GPNA 3QOMA 4LYRA 1UHVA 3GBEA 1E55A 3UR7A 4M29A 1KQYA 5CPSA 2OWXA 2VUYA 4FLRA 1KXVA 1XSIA 2GDUA 2YA0A 1OBAA 2VX7A 3ZQ9A 4AY1A 3A3HA 4H8VA 2O9RA 1UKOA 2XYLA 1V6XA 4AZ7A 1WZKA 4JFUA 4X0VA 3GXDA 2GJRA 1JF6A 1W3JA 2OSXA 4GI8A 1QI4A 3WQ4A 1CXEA 3UESA 5JIWA 1JF5A 3HU7A 3ARYA 3CLWA 4WJXA 3PTQA 4CN1A 3K8LA 3W6MA 5E0CA 1PIGA 3GH7A 1CGYA 2CITA 2WLZA 2A3AA 1WKYA 2FGLA 1GJWA 7CGTA 1GHSA 2RGMA 2D20A 4Y7EA 4A4AA 2W67A 5D4YA 2E8YA 3T0DA 3M7SA 2WKGA 3MMUA 4CU7A 1J0HA 4WK9A 3PZOA 2CBVA 1Q6EA 1AQHA 4QLJA 1SMAA 2VZTA 1YHTA 2W66A 5A6SA 3EDJA 1M7XA 2FGZA 2BHZA 5EFDA 5KEZA 3O2LA 1DWJM 4Z2JA 3GZAA 1BVNP 1C92A 1Q6FA 3KL3A 3ZO9A 1HX0A 4TX6A 1RP8A 1CXHA 4AZHA 4IUGA 4LYQA 3KE0A 3AIWA 3N13A 1UZ4A 1B3WA 2OSWA 4HZ6A 2DSUA 2NT1A 4AZ5A 2D2OA 1Q6GA 2XIBA 1AQ0A 1CLVA 2ZX9A 1E6ZA 3AYSA 4NZCA 1CPUA 3UG4A 3A47A 4W93A 3AIUA 1MQQA 3N11A 2ZIDA 8A3HA 2WSKA 4J3VA 1E4LA 2WHJA 3EMQA 2D0HA 3L4UA 1SR0A 3FAXA 3SCOA 2QLYA 4V28A 1G94A 4PMVA 1XD0A 1JL8A 3L4WA 2ZOXA 4MDOA 2DT0A 4HU0A 1XRVA 4PRWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4L4P A;  5M5D A;  1HIZ A;  1OD0 A;  4QCE A;  1BGG A;  1ISW A;  1B3Y A;  4AZC B;  1W3K A;  1OSE A;  2PWE A;  4CU8 A;  2W92 A;  3AXX A;  4J28 A;  4PBG A;  4HA1 A;  3OLG A;  5I0D A;  1NOW A;  2BVT A;  4HOW A;  3NSX A;  4P8V A;  1LL7 A;  2VX5 A;  4ZXL A;  4C7D A;  1EDQ A;  2WAG A;  3ARR A;  4MAD A;  1V3J A;  4ZEP A;  1J0I A;  1V6V A;  1RPK A;  1UKT A;  1V6Y A;  1CTN A;  4MNJ A;  1C7T A;  3IJ8 A;  1PX8 A;  1KGU A;  2D1Z A;  2E8Z A;  4GIA A;  1W91 A;  2CCR A;  1UR8 A;  3BGA A;  1E6N A;  2DQX A;  1CXF A;  1ZBV A;  3ZJ6 A;  1KGW A;  3GXI A;  4AIS A;  1XSK A;  3KL0 A;  1E9L A;  1KCK A;  1HJW A;  2HVM A;  4W7W A;  3BLK A;  4TVU A;  1K9F A;  1E43 A;  3AS0 A;  3BMW A;  1G5A A;  1BPL B;  1SYT A;  3BMV A;  2J77 A;  3O9N A;  2QMJ A;  1JYW A;  1XHG A;  3AIR A;  2AAA A;  1J11 A;  3RIK A;  1NAR A;  3FAW A;  9CGT A;  3FND A;  4S3K A;  5BXR A;  2PWH A;  1HN1 A;  4MPK A;  1G9H A;  2W5F A;  1EXP A;  2WZE A;  3ZT5 A;  5DT5 A;  5A8M A;  4P7O A;  1G01 A;  1JNE A;  2OYM A;  3L2M A;  2J75 A;  2XPK A;  2YBU A;  2DPE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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