3B8DA

Fructose 1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVQPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSGQAGAAASESLFISNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A conserved glutamate residue exhibits multifunctional catalytic roles in D-fructose-1,6-bisphosphate aldolases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
molecule tags Lyase
source organism Oryctolagus cuniculus
total genus 134
structure length 363
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2007-11-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3b8dA00
2GJNA 2YR1A 5EBUA 2QCGA 3PBWA 3OBKA 4HHPA 3G8EA 2AGKA 2GJLA 3GDRA 3QC3A 5HR7A 1KLZA 5F2IA 3ABSA 4WY0A 1DJQA 1RR2A 2G5WA 5FI8A 3H55A 2WSRA 1ZALA 1FBAA 3F1QA 3LX9A 3A21A 3N3MA 1OFAA 4LRTA 3M47A 1EP2A 3CHVA 4LS0A 1MO0A 5SWUA 4FNQA 3UWWA 5K2ZA 1XL9A 1M5WA 3EEGA 2VFFA 3KVJA 1PHWA 4QJ1A 5CG7A 3PG9A 1PL9A 1HO4A 3S5ZA 3DFNA 2DP3A 4NJKA 4FIQA 1R2RA 3TXVA 3PBYA 4Z08A 3W71A 1KTCA 2ZRUA 3TR2A 2W0UA 2V2HA 3LCXA 5LGXA 3GXNA 3VI2A 2RHGA 5CPOA 3TKFA 2QUVA 2XN2A 3ABRA 5FEPA 4N6EA 3PAJA 4O16A 2PURA 4OHQA 2QJGA 2E6AA 5DCBA 5CZTA 3HGSA 3NL3A 1OX4B 2B7OA 3DFSA 1W5OA 1VS1A 1XDLA 1TPDA 1WOAA 3CB8A 1KM0A 2ALDA 5E0KA 4IMDA 1PV8A 4LVFA 1IXOA 3LHUA 4N4QA 4ML9A 5A5WA 3EX3A 4FNSA 4IMFA 2ZFAA 1RVGA 2NXGA 1FWWA 4FX7A 2E77A 4ALDA 1VYPX 3LCIA 3C52A 2BXVA 3M5ZA 1S5VA 1VZWA 3GKFA 4NT0A 1B9BA 3SSJA 2WNQA 2Y7EA 2YYUA 5FF4A 3CIWA 1Z48A 2ISSA 5CGQA 3SFKA 4AB4A 1JVNA 2E5BA 1VCVA 5D03A 1PCKA 4OQVA 1W1ZA 4RR4A 1TPVA 1MEIA 3M6YA 3TV8A 4A2SA 3PWAA 1LP6A 1EWEA 2ZRWA 3S1XA 1FUYA 4YCPA 1WAUA 1GVQA 4AHQA 4UFJA 3MHUA 5K9DA 4UTTC 3EWXA 2B4GA 4Q33A 4NJIA 4O0KA 1YADA 3R12A 3TNOA 3PBUA 4AAJA 3F4WA 1T8XA 3D0CA 4KKXA 3PC0A 3MI2A 4KWWA 2ATSA 5K4XA 2J27A 4Z1CA 3L67A 1AK5A 5D02A 1TJPA 2HS6A 1LLWA 3GDMA 3R8RA 1VHCA 5LHFA 4O1CA 2FB3A 4YLWA 3RNDA 4H4IA 1QPOA 4H3DA 3QPYA 1XKYA 1B4EA 4IJBA 4FNRA 2ZYFA 2QUTA 3S0CA 3TW6A 3B06A 2DZPA 4K8EA 4POCA 2DZSA 1NEYA 3UY8A 5LNUA 4JX4A 2G97A 2WJZA 3QM3A 1XBZA 1KV8A 3IGUA 1ME9A 4WZHA 3LLFA 2WPBA 1T0OA 2V2CA 4QM1A 2G96A 4HIBA 4NJGA 1ONRA 2CLEA 4BI6A 4M5PA 2Y88A 1JQXA 1I8JA 3W7OA 4QISA 5FEZA 3N73A 4A3UA 1O94A 3VKJA 3KHJA 4G1KA 4M6QA 5G5IA 1QR7A 2C13A 3T44A 4GUHA 1KV5A 2X1RA 3MP5A 3L9CA 2VEMA 2DZUA 5CSSA 3JS3A 4CNPA 3MO7A 4LW7A 1OFQA 5AHMA 5AC8A 2Y7FA 3W7RA 1XM3A 4X9SA 4GNJA 3SGZA 2YZRA 4UTWA 3FLUA 3M43A 3ZR4A 4A22A 1Q45A 3NQEA 4UTHA 3THQA 1H7NA 3LCHA 4J9JA 2QCLA 3EWBX 5F1VA 4IXHA 4L4MA 1P1XA 2BX7A 1X1OA 5U4NA 3MI6A 1G7VA 4DPQA 5HJLA 4O28A 1EWDA 1W5NA 3Q58A 1VGAA 1OFDA 2NZLA 3E02A 4UCGA 4HSNA 2P10A 3S8HA 2HSAA 4MOZA 3B04A 3UZJA 4OT7A 3P67A 2A5HA 1GG0A 2CW6A 2Z2UA 4MFEA 3I6RA 4RK8A 3KRUA 2JBMA 3LHYA 4DXVA 4DELA 3T55A 5EY5A 1QFEA 4LV4A 4WXZA 1W0MA 3WJYA 3O05A 3TAKA 1KFEA 5IBXA 4UFLA 4ZZ9A 1HTIA 3UD6A 1B4KA 1OFBA 1T96A 1OFEA 3Q94A 3IGXA 3FKRA 3M5VA 3QPZA 5CZJA 1EIXA 1FXPA 4ZQNA 4CNOA 3KVMA 4BR1A 4EOUA 1YTDA 3UWYA 3W84A 3ZS4A 4Z0SA 1SZNA 3S1VA 5KINA 1LRQA 1AW2A 4RJEA 2NX3A 3W9ZA 2ZQ0A 4UMBA 2ZZ7A 2OCZA 3L0GA 5DY2A 2YPIA 5HWMA 4FIRA 3WJZA 2ZDRA 4M19A 3TFCA 2CLHA 2NWSA 3TK7A 4LV9A 1JQVA 4XZ9A 3UWQA 3TUUA 5AYXA 1DORA 3NQFA 2QCFA 5CSRA 3MP4A 5HINA 3TC6A 3W2JA 4UTJA 3P7YA 1NSJA 4UMCA 3Q2DA 4RXGA 1UUOA 3G1AA 4XBSA 4R33A 3T40A 5MHBA 4QSHA 1W54A 3G0UA 3HGOA 4FNPA 2B0MA 1VPXA 5J5DA 4MLJA 2RDUA 4E2BA 5CZ0A 3L2IA 3W7JA 3NQDA 3PY2A 3TSDA 3CTLA 1AW5A 4IMEA 3L0KA 5HMSA 1TJRA 1KM3A 3TX9A 5D33A 4HN4A 3NL5A 4O8RA 3E0IA 4A2RA 3PSWA 4IWWA 4ORMA 3P5YA 1LBFA 4Y6GA 4FB7A 3PF3A 1XXXA 3EWUA 1EP3A 1EUNA 3BW3A 2Q3RA 2YGYA 4JNMA 3NM3A 2TPSA 3MUXA 1W37A 2E5CA 3AO0A 1A5AA 1FCBA 3GXPA 1L9WA 4N6FA 3GYEA 1H50A 1K02A 1H5YA 5AHFA 5TQLA 4EF9A 1N7KA 3N19B 3UY7A 5GVJA 1SZGA 1DHPA 3N9RA 5DCEA 3W1RA 5AOUA 3B0VC 2BWGA 4OGZA 2H90A 3NPUA 1U5JA 5FF7A 5D05A 3NPXA 5HWNA 1TO3A 5F2GA 3BLIA 5G1YA 1ICPA 2NLIA 4AF0B 3PR2A 4O53A 1G67A 2A4AA 3IV3A 4TIMA 2V8ZA 3C2RA 2FPVA 3QMRA 2A0NA 1VYRA 5CPLA 5DCDA 1F74A 2QEZA 3NNTA 1TCDA 4UTWC 1YXYA 1FXQA 1LYXA 4NJJA 3W1MA 4UTMA 2X1SA 1L6WA 1LDCA 4O18A 4P61A 1JCLA 1ZAIA 4NX0A 4BFAA 2H8XA 3L0NA 4DO6A 1ZENA 2CZDA 3DU0A 2TYSA 3BARA 3S9YA 2W6RA 4PC8A 3V1PA 3BG5A 4FEZA 3LXCA 2E6YA 4LT9A 4L4LA 4C1LA 2YW4A 3T4CA 4CCEA 3WK0A 4K6AA 4PA8A 4UFMA 1OX5A 1EEPA 3O6YX 3UWUA 3LTPA 3O63A 3W23A 4DBEA 1NF0A 4IQLA 4GUFA 2A2IA 2C6QA 5LKYA 1I2RA 1K03A 3KRSA 4JGDA 3LTYA 3BLFA 4ZL1A 5D2VA 1WA3A 3NO5A 4JX5A 1G6CA 1RZMA 3QMTA 1SSDA 5IBXC 1VC4A 3LCLA 4UNLA 3W7HA 5LHEA 1GPWA 3NGJA 3NL6A 4LVAA 3N14A 5K3VA 2Y89A 5LGZA 4LWWA 1J4EA 1Z44A 2E5DA 1IIHA 3V75A 2VFHA 3HPZA 3NPWA 1OHLA 1S5WA 5K9XA 1VCFA 3NQCA 3TQKA 4X22A 3NVTA 2C14A 2ZZ3A 1LCOA 4AWTA 1K8ZA 4HNNA 4ZQMA 2V5LA 1SSGA 4GUJA 4JS3A 3K30A 2ZZ2A 4JTKA 1H63A 3LERA 3S1UA 3LHWA 1F6PA 1A5BA 1K7EA 5LSMA 3TE9A 1JCJA 4XKYB 3LXAA 1TPWA 1I2OA 4KWVA 1PHQA 2RKXA 5I3JA 2FIQA 2GPTA 1R46A 1W8SA 1Q6LA 2J9YA 3G22A 2Z1BA 4JDBA 3FEMA 3YPIA 1ZCOA 4QNEA 1SO5A 5IM51 1WX0A 3IIZA 3ATZA 4EIVA 2WKJA 4EVZA 3HBLA 2QJIA 3MHGA 3O6CA 4MZ1A 2WNZA 2BZNA 2YYTA 4YCOA 1RV8A 1YXCA 2BLEA 4MYAA 4LVDA 1GTEA 3GB6A 3PVFA 3W2MA 3W76A 3O07A 1JCXA 3QH2A 5D2WA 3DHDA 1F05A 1O4UA 5G4WA 3LOTA 2FJKA 4ICNA 5EKYA 3W6YA 3FS2A 2O7SA 5C5YA 4WX2A 3N34A 1TTQA 4KFNA 3W2LA 1FCQA 2J9XA 3L66A 5TIMA 1S3HA 4JX6A 3GKAA 3N2MA 3O6DA 2E6FA 3W7MA 1DOSA 3R13A 2B7QA 4U4MA 1JR1A 1LRNA 1YTKA 3C2OA 4JTEA 4DEFA 3W07A 4DO5A 3OEXA 3DFOA 4GWEA 4JIQA 1Q3NA 4BI5A 2FFCA 5BMWA 3W7QA 1DBTA 3CIXA 3G3MA 4MZ8A 2Y85A 4UFHA 3P8JA 2ZZ5A 2VKZG 4O12A 5AC7A 3CEUA 3SR7A 3P60A 4UR8A 1OG0A 3W7NA 3C3NA 3S42A 4JY9A 3M5XA 4Z1BA 4CCCA 4GXMA 5AHLA 1QMLA 2VFIA 5AYZA 4O11A 5K9CA 3LCGA 3VNDA 1OABA 3M44A 5CKSA 1IXPA 1GZGA 3LHZA 3B0UX 4UR7A 3HPSA 3P81A 5EL1A 1WQ5A 3U8GA 1TV8A 2ZTJA 4LVGA 2NXIA 4JEQA 3I7RA 1GYNA 1M7PA 1A53A 3MP3A 1GT8A 2CLLA 1VQTA 4RZ5A 4DF2A 3W85A 4JTSA 3NQ2A 3QYQA 4MIMA 2CFFA 2QCHA 3E96A 4OBTA 4N2YA 2FPYA 3OVQA 4OV9A 3KRZA 4O10A 2P1FA 3W7KA 2YDAA 1GYLA 5DELA 4N9CA 3VE9A 3CQ0A 3QQ1A 2EGZA 4CQ8A 3W7DA 3LLDA 2C18A 3R5EA 2E1DA 1W3NA 4XQ6A 2CLOA 1KFCA 5HUPA 4WOZA 4LUIA 3IRDA 1RQHA 4AHPA 1H61A 5AB3A 1KBIA 1YTEA 1XBYA 5L9FA 3TQ0A 4LVBA 5D2XA 3OHIA 3R89A 1THFD 6TIMA 3NA8A 2QDHA 1AMKA 5KZMA 3G1XA 5E1QA 4QNWA 2NX1A 2CLKA 1VH7A 2Y70A 1P5BA 4I7WA 3W70A 1VCGA 1MSSA 3BGJA 4K7YA 4UNKA 3RFAA 1DV7A 2H8ZA 4N9EA 1TV7A 3TROA 1TRIA 2D73A 4CQAA 3MJYA 1SW0A 4LS1A 4NXSA 4FX8A 1Y0EA 1FWTA 1WV2A 2GVGA 1C9DA 4XUGA 3QQ0A 4O17A 1I4NA 4AVFA 1HUVA 1YPFA 3PULA 1YLVA 4RLIA 3HQ1A 3HF3A 2VEIA 3EB2A 2WSYA 3W22A 3NQ7A 2QDGA 4JIPA 3DENA 4RX0A 3LBCA 1O5KA 2X1TA 3L5AA 4FNUA 3EXTA 1SUXA 3NL2A 2YXGA 5HULA 5LNRA 3CC1A 5ABTA 5BMXA 3G3DA 3P84A 3BLEA 3STCA 1EPXA 1A50A 1F7BA 3W7IA 1KM4A 4FXRA 5G1TA 3BV4A 1EX5A 3W1PA 3B4UA 1H60A 1L6YA 2VELA 5D2TA 3S6DA 2YFNA 2V81A 3EX2A 3BW4A 1BKSA 2VENA 2V0TA 2C1HA 2C3ZA 3W75A 4BWLA 2W79A 3TFXA 3BGGA 1IXNA 3H54A 4DF0A 1VR6A 1MEWA 1R30A 3WJWA 1PCWA 2QCDA 4PH6A 2Y7DA 2FTPA 1TQXA 4UFIA 3SIZA 3GNDA 5AFDA 1QAPA 4JY8A 1SO4A 1PVNA 1RPXA 1C8VA 3W1LA 1HFBA 1JUBA 3LRMA 3SGUA 1HL2A 4DBDA 1P0NA 5LNSA 3G1VA 1GVSA 5G2IA 3B03A 1I2QA 2ZBTA 1FWSA 1HG3A 4O0ZA 2GQAA 1K7XA 5D04C 3W3OA 1GWJA 2A7PA 2AAMA 2DU2A 4YL2A 3ATYA 1KFLA 1R2TA 4PCFA 3P80A 4PEKA 2PE4A 4XTIA 4O15A 1ML1A 3S5YA 1VJIA 4LY8A 1CX9A 4M7SA 2ABAA 2J88A 3EWYA 4NU7A 3SECA 4IX0A 1W5PA 1XDMA 3C56A 3LBMA 4MY9A 1JCNA 4WJEA 1N55A 4UUIA 3UWZA 2NV1A 2ZRXA 3G0XA 4DO4A 1JUKA 3W2UA 4GUGA 4RKAA 1RQEA 3TH6A 3NM1A 1XC4A 1KFBA 3IIXA 3DI1A 2Z6JA 1H7WA 4NQ1A 1TPH1 2X1UA 2WQPA 1W31A 4JTUA 1SW3A 2JKAA 4JTJA 3KVKA 1IGSA 4YXGA 2R94A 3NZRA 1QPNA 4Z1AA 3I68A 3GDLA 2XN1A 1QPQA 3NR0A 2X30A 5J5RA 4Y90A 3A5VA 4JN6A 5E93A 1JRBA 3CM4A 3NZ1A 4CCDA 5D2YA 3W7PA 3C4UA 4I7UA 3W1UA 4Q4KA 2PC4A 3IGSA 3HO8A 1K8XA 3OIXA 3THAA 2Q8ZA 2QAPA 1L6SA 2EF9A 3FOKA 3P74A 4Z0JA 3B8DA 1QO5A 3UPBA 3FYPA 4NNCA 1SO6A 2YCEA 3ZWTA 2FB2A 4IPJA 3P5ZA 2JGYA 1J2WA 1TB3A 2Y7GA 3W1QA 2E68A 2ISWA 3EKLA 5F2MA 3TSMA 5KITA 3BK0A 4UTLA 3UXAA 3HPXA 3KOFA 1P4CA 4GUIA 3W87A 2F7FA 5D09A 3IVSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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