3BLE | Genus

Total Genus 123

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	123
sequence length	319
structure length	307
Chain Sequence	RLEILDVTLRDGEQTRGVSFSTSEKLNIAKFLLQKLNVDRVEIASARVSKGELETVQKIMEWAATEQLTERIEILGFVDGNKTVDWIKDSGAKVLNLLTKGSLHHLEKQLGKTPKEFFTDVSFVIEYAIKSGLKINVYLEDWSNGFRNSPDYVKSLVEHLSKEHIERIFLPDTLGVLSPEETFQGVDSLIQKYPDIHFEFHGHNDYDLSVANSLQAIRAGVKGLHASINGLGERAGNTPLEALVTTIHDKSNSKTNINEIAITEASRLVEVFSGKRISANRPIVGEDVFTQNLYANPILPERFGRKR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Molecular basis of the substrate specificity and the catalytic mechanism of citramalate synthase from Leptospira interrogans pubmed doi rcsb
molecule keywords	Citramalate synthase from Leptospira interrogans
molecule tags	Transferase
source organism	Leptospira interrogans
total genus	123
structure length	307
sequence length	319
ec nomenclature	ec 2.3.3.13: 2-isopropylmalate synthase.
pdb deposition date	2007-12-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00682	HMGL-like	HMGL-like

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3bleA00

5LHEA 1G4TA 4YCPA 4O1BA 1RPXA 3K30A 3TA6A 4LVAA 5ABTA 5K2ZA 1P0KA 2CU0A 1B9BA 1KA9F 3PWAA 1H1YA 4JEQA 1SR9A 3S1XA 5AOUA 4HNUA 3W2JA 1OF8A 4JTUA 2RKXA 3NO5A 1T99A 4D2JA 4RZ6A 2TMDA 5D32A 2YDAA 4QJ1A 1SPQA 4I7UA 1LCOA 4MIMA 5D05A 1FY6A 3BGJA 5DBTA 2YW3A 2RH9A 1O60A 3NEVA 1KTNA 1VHCA 2PRMA 4JTTA 3LI0A 3G3MA 2ZZ6A 1MEWA 3FOKA 3CQ0A 3E02A 5CZTA 5KMYA 4MY1A 5CSSA 7TIMA 2BWGA 2ZFAA 3CLMA 2CZDA 1FUYA 4A3UA 3B05A 1F76A 1H7WA 1WAUA 1K7XA 4J9JA 2V8ZA 3HGSA 5HJLA 4K39A 4KFPA 3TX9A 3PB2A 4UTHA 4HPJA 3S9YA 3H54A 4MZ8A 3MI2A 2C18A 2VFGA 3EWXA 4AWTA 1CW2A 5I3FA 4JTHA 2PRHA 2Y6ZA 3S5YA 2A6LA 1VR6A 3CM4A 4PL1A 3TAKA 3O63A 4BI7A 1EP3A 3UWZA 1G4SA 4S2CA 2ZA3A 5D2VA 4U4MA 4A2SA 3IVTA 1HFBA 2H3DA 1JULA 1WBJA 1AMKA 1EIXA 3MI3A 3CC1A 3TROA 1MEHA 1QO2A 1FXPA 3W1MA 3W7EA 4K37A 3M47A 1K3UA 3GZ3A 4KKXA 1OYCA 3WK3A 4JTJA 4O54A 4MY9A 3FKRA 3W76A 3EWZA 4NUWA 4Q4KA 1D3GA 1TPVA 3W2UA 3FJ6A 1NAL1 3KRSA 3W2KA 4XKYA 3SSJA 2R14A 1SZNA 4O16A 3S1WA 5FEWA 3UPBA 3N9RA 1VC4A 1LORA 4JGDA 3EX6A 3IIOA 1H7XA 4AF0A 3QFEA 3FKKA 3O1NA 3CB8A 3W2NA 4K8EA 2F84A 2GJLA 2Y61A 5I3HA 1JCNA 3O6CA 4NX5A 3IIZA 3E49A 1TO3A 3TJLA 3GR7A 1EUNA 2C15A 4Q32A 4XQ6A 3LTSA 3VKJA 3TQ0A 3P82A 2EPHA 4KWWA 3TNOA 3P5ZA 3S5ZA 3Q58A 2VOMA 3C0JA 3DFSA 1I2PA 4NT0A 2FB2A 5G4EA 5DBUA 3SI9A 3PC0A 1HTIA 5F1VA 4IMGA 4LS2A 4M5PA 3P61A 1JCYA 3G1HA 5H2ZA 2JGQA 2Y89A 3PG9A 2B4GA 1G4PA 3L5AA 1OFQA 4MLRA 4DF2A 3W6YA 1FBAA 4BWLA 4MUZA 4GBUA 1C29A 5IBXC 2FJKA 3C56A 1YTKA 2V5BA 3G1SA 4E2BA 1H51A 3EX2A 1OVDA 3TJXA 1OFPA 3P74A 4PFMA 3O6DA 1DVJA 3BVJA 4GNJA 3HG4A 1KM4A 4K8HA 1NFBA 2QCDA 3H55A 1XCFA 5EY5A 3W23A 4IWWA 1K7FA 1PL9A 3OIXA 3NQ6A 4NXKA 4Z0SA 4GC4A 4JY8A 1AW5A 4JDYA 5CZSA 4JICA 2ATSA 1MEIA 4JX6A 4QIUA 3GK0A 1XM3A 4FNTA 3UWWA 1ZENA 4K38A 4WUIA 5DY2A 4R33A 3T55A 1VRDA 2WNNA 3ABSA 1WOBA 3UXAA 4NZFA 4JTKA 1OYBA 1F05A 1ZAHA 3EXTA 1GYLA 2QCGA 1P1XA 1T96A 3PY2A 3HOJA 2C1HA 3W7DA 5HMSA 1KM2A 3RLUA 5LKYA 4FXSA 4O28A 2C19A 4LUIA 3GKAA 3UQNA 2Z6IA 2CLFA 2CLLA 3PVFA 2NX3A 3SJ3A 4LTSA 1LBLA 2VFEA 1EPXA 2AQWA 3RU6A 2E77A 4LVBA 1YXDA 1RQEA 5G1TA 4CLMA 3T44A 1B4EA 2CLHA 4IQLA 1TPEA 2ZTKA 3DXIA 3W1RA 1S5VA 4N6FA 1YDOA 3LV6A 4R34A 2FQIA 1H7PA 1OFEA 5U7SA 2Y63A 1LOLA 1GT8A 2UV8G 3DI0A 3L21A 2J27A 4DEFA 1I2QA 4ZVJA 4GUHA 3NYZA 4UC5A 1I4NA 2VEIA 1PV8A 3HGOA 3NQEA 2YXGA 2ZZ3A 3S1UA 3LBMA 4RX0A 2VC6A 1PS9A 4O19A 1PCWA 3NL2A 2ZYFA 1YYAA 1ZFJA 1U83A 1TTJA 2X30A 4QISA 3Q94A 4JR5A 2YCEA 4EIVA 3NQCA 2V9DA 4TR9A 4JIPA 1NF0A 3WJYA 3N2MA 2B0MA 3PBYA 3IGSA 3GX9A 1QR7A 1XXXA 3KVLA 3DFOA 5LGXA 5MHBA 4UMBA 4OE7A 4JX5A 1QPOA 4AAJA 2Q8LA 3D0CA 4WY0B 2ZRWA 4NJJA 3LXAA 3Q37A 3NXFA 2RDUA 2ZQ0A 5IM51 1Q45A 4AH7A 4G1KA 4UFLA 3BARA 3G1FA 1B57A 2OCZA 5EBUA 3W1UA 3B8DA 4FNRA 3W1PA 2B7PA 2X16A 1M6JA 3BLIA 4UTIA 2BLEA 5LHFA 5KINA 3LHVA 5K4XA 3W7KA 2CFFA 5CKSA 2CLKA 3P67A 4HIBA 2VEKA 2DZVA 4CNNA 4QITA 4DO4A 1X1OA 2DZXA 2PURA 2QDGA 3LTPA 2DZPA 5E93A 1EWDA 4ZQPA 3O07A 2HMCA 1VCVA 4TIMA 2CLEA 3CIWA 4PCFA 3W1TA 4UR7A 5KSWA 5LNSA 4AVFA 4OQVA 5G1YA 4CQ8A 4BK9A 3OVPA 5C6MA 3PBWA 2YPIA 5KZEA 1RZMA 1TIMA 2ZTJA 2WQPA 1SO3A 2VKZG 4JD4A 4NXSA 2G5WA 4KFNA 4H6KA 3B06A 1EX5A 2C3ZA 3I7QA 1SQ7A 3W71A 2GQAA 3PF3A 3BW3A 3TW6A 1XC4A 2ZRZA 2YZRA 1ICQA 3GAYA 4NQ1A 2NV1A 5D2TA 3UWQA 1UUMA 4I7WA 1OFRA 4ZL1A 4O17A 1YXCA 1DQXA 1H7NA 4FF7A 4O14A 1TPFA 2IQTA 3A9IA 3INPA 5CZJA 3W74A 3BK0A 3P7YA 3LCIA 1QDSA 1W56A 1O94A 4I9AA 5C5YA 5CZ0A 3IRDA 3F03K 1N55A 1SSGA 3NNTA 1KV5A 4OT7A 4JIQA 2Q3OA 3S1VA 3W73A 1KW1A 4P61A 3DH7A 3LHYA 4MJZA 1VPXA 5BRBA 2XN1A 3DHDA 1TPUA 2WNQA 1X7FA 5I3GA 3N73A 1FWNA 2CZFA 3W7NA 2YGYA 2A7PA 1D3HA 3SGUA 1LBFA 1P4CA 3ABOA 2CZEA 3PBVA 4UNLA 1LROA 4LV9A 1M7PA 3W87A 1YDNA 2E5BA 4IX2A 5F2MA 1QOPA 2QUVA 4LC8A 5D03A 4UCGA 1JRBA 3B0PA 2PRLA 3P84A 3ELFA 4O15A 1A5BA 4W9TA 1D9EA 2Z6JA 4XZ9A 4JY9A 5AHNA 5C54A 3TCEA 1VYRA 1SW7A 4BF9A 4OV9A 1R2SA 3EXRA 3NPUA 4MFDA 3DFTA 2X1RA 1XL9A 3NQFA 3I7SA 1GQNA 2TYSA 3IV3A 3WK1A 3NAVA 3LM7A 3M43A 3GDMA 3LTYA 2FPYA 2GPTA 2DU2A 5T26A 2J9YA 3M41A 4WXZA 1KM5A 2W6RA 2DJLA 1I8JA 1GVRA 3LDVA 3ATZA 4LWWA 3UWUA 3W86A 3MW7A 3T4CA 1J2WA 5LSMA 1TRDA 2ALDA 4JTFA 4M7SA 2CLMA 1W5MA 1C9DA 4GJ1A 3FEMA 2ISVA 1JQVA 1ALDA 2JKEA 4IJBA 2TPSA 3DGRA 3G0UA 1F74A 1GG0A 4PTNA 5DCBA 2ABAA 3G24A 4QNWA 3G22A 4JS3A 2R91A 3TQVA 1Q6QA 1A53A 1L6YA 3PULA 2OJPA 1PHWA 2E5CA 4X2RA 5AHFA 4Z08A 5TQLA 1OK4A 5L6UA 3BG9A 1R2RA 4GUJA 4N4PA 1N7KA 2QJHA 3FYOA 1OHLA 3P62A 4HN4A 1A5CA 4ZQNA 4ALDA 3OHIA 3V75A 3LLDA 2E5DA 2Z0IA 1O95A 3ATYA 3LLFA 1K8XA 4OGZA 4Z1BA 4NNCA 1QPRA 1GTHA 4MZYA 3LRMA 3ZS4A 2A7RA 3R13A 1QPQA 1AK5A 2WOQA 5LGZA 2B7OA 3NZ1A 4WQ6A 3HPZA 4LS1A 2VFDA 4IPJA 3P8IA 1G67A 4K6AA 3A21A 5AB3A 2RFGA 3B04A 1FDJA 2ZZ7A 3LCWA 3G0XA 4IMCA 3E96A 1P5BA 3FYPA 3MHFA 1V7YA 3TMLA 2CZ5A 4BI5A 3W1AA 3W7GA 4CNOA 1XBYA 3W22A 3HIJA 3W1QA 2X1SA 4P2VA 4EF9A 3HGJA 1JCXA 2D73A 1Q6OA 4TO8A 3OVQA 4O4VA 4QNEA 4UTKA 2A5HA 5G2HA 5FEZA 4Y9AA 3DU0A 2HS6A 2EKCA 1H50A 4RZ4A 5EA9A 3TC6A 4MFEA 5G5IA 1DV7A 4YMZA 2QCEA 1ZAJA 1ZJIA 3KRUA 3W72A 2ZZ4A 1KM0A 1I2OA 2TRSA 3WJSA 2GVJA 4WOZA 3W7QA 3C4UA 4Z0JA 1SO5A 3YPIA 1TSIA 2Y7GA 4DBEA 1WXJA 2OT0A 2RDTA 1EWEA 2ISSA 1F5ZA 1A5AA 1E51A 4PL2A 1CX9A 3U8GA 3QC3A 1X8FA 4I7VA 4FX8A 1H7RA 2CWNA 1Q6LA 4NVTA 3R5EA 1VLWA 3NL3A 3R89A 1VYPX 4MY8A 3T7VA 2BXVA 3W1NA 4M6QA 5G2WA 3WK2A 2Y7DA 5U4NA 4LW7A 3QJAA 1R2TA 5CPLA 5CGQA 4E0CA 3PUOA 3W7JA 3NQ2A 4N6EA 4RKAA 2QDHA 4RLIA 4KFOA 1SUXA 1G69A 3MO7A 1J4EA 3G8RA 4S1FA 3GYEA 3IIVA 5BNKA 3GDKA 1KM1A 3MWAA 5D2WA 3LCFA 5AHLA 1FWSA 2V82A 2QAFA 3HQ1A 3AJXA 4H3DA 2H90A 5D2YA 5AN7A 3TAOA 2ZRVA 1BWKA 4LRTA 4UFJA 2ZZ5A 3UZ5A 2EAWA 1RQBA 3TFCA 4S2BA 3DHFA 1THFD 1UJPA 1H5YA 1OFAA 3C3NA 2NXHA 1J5TA 3ANYA 4AEOA 4QSHA 5SWUA 2OZ0A 3VE7A 1BTMA 4TU1A 1JRCA 3P60A 3TV8A 1S3HA 3HPSA 1QFEA 3UWVA 1AG1O 3JS3A 2WJZA 1G4EA 3Q2DA 3L0KA 1GWJA 4O53A 5EL1A 5DCEA 2VELA 1KFBA 4CQAA 4GWEA 5BW6A 3MI6A 3MP3A 1JCMP 4JYEA 3F1QA 4IOTA 3HB9A 3WJWA 5G4WA 4FXRA 2YR1A 4ORMA 1KLYA 3UNDA 3C61A 3R8RA 4A22A 5E0KA 3ZWTA 3C6CA 2C14A 3OBKA 3FIGA 5C55A 2ZRXA 1SSDA 2QCCA 3WJXA 1Q3NA 1K7EA 2NLIA 3BLFA 3W84A 3TSMA 4C1KA 8TIMA 3JRKA 3TFXA 1XUUA 4H4IA 2NWRA 4AWSA 1TJPA 3NM1A 1FWRA 1PHQA 2ZZ1A 5D30A 4KWVA 2DZUA 3S0CA 1DQWA 4O1CA 1HUVA 5A5WA 4L4MA 3NM3A 4PH6A 3PS7A 2YYUA 2RDWA 4TX9A 1RQHA 3PM6A 1QNVA 1CI1A 3M9YA 2J88A 3CIXA 2FPTA 1EUAA 1K03A 4LV4A 4N9DA 2WSQA 3QMSA 1ME7A 1LDCA 1OJXA 3W7LA 4L4LA 1F6KA 1K8YA 2E68A 1TB3A 3O6YX 3SR7A 1S5WA 5HULA 4FIQA 4JTGA 3CWNA 3PB0A 3STCA 2G97A 3RLVA 4DQWA 3BLEA 2FTPA 2DZTA 4NJKA 3TXZA 5J5DA 3LX9A 4XTIA 1NVMA 1O5XA 3KRZA 2GQ8A 2DZSA 3OG3A 1GPWA 3ZWSA 4M7TA 3S8HA 4Z1DA 2GVGA 3W85A 1YDVA 1VH7A 4WZHA 1UCWA 1JR1A 4GUIA 3S42A 4Y96A 5F2GA 3NPXA 2YFOA 4U28A 4MKNA 2VEPA 5FF0A 3SW6A 1OX4B 4FIRA 1QAPA 3TU9A 1WBHA 3LHZA 1KFJA 1T8XA 3QRHA 3THQA 1H1ZA 3HG2A 1XBXA 3CT7A 3NPWA 3T78A 1WYIA 1TQXA 4M6PA 3CHVA 2CLIA 4JX4A 1KM6A 3BG5A 1MXSA 3A5FA 3IGXA 4A21A 3NDOA 3STGA 4PODA 5FEPA 3TC7A 1IIGA 4YXGA 4UMCA 4WY0A 4MJMA 2WKJA 3KVJA 3QSRA 3N9SA 4FEZA 5K7JA 1TPC1 1L6SA 1DBTA 4CCCA 1EP2A 2NX1A 3P80A 1NSJA 4GE8A 4UTMA 1F73A 4PA8A 1TPB1 3MP4A 1AW2A 3BG3A 2J6XA 2VEMA 3DZ1A 4MOZA 1LM1A 2YX0A 5BMWA 1TREA 2V2HA 3DAQA 2QCHA 2JKAA 1O4UA 4MYXA 4Q33A 5AC6A 1YTEA 3NQAA 4Y6GA 3USBA 2W0UA 3KX6A 4OWGA 4R7JA 3TR2A 3NPVA 2QJGA 1VLIA 5DCDA 3C2RA 1DOSA 1IXPA 1SU5A 1H61A 1ML1A 3LCHA 4DF1A 1TQJA 5AHMA 1FX6A 3GDLA 1K8ZA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3BLEA

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