3BLE | Genus

Total Genus 123

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	123
sequence length	319
structure length	307
Chain Sequence	RLEILDVTLRDGEQTRGVSFSTSEKLNIAKFLLQKLNVDRVEIASARVSKGELETVQKIMEWAATEQLTERIEILGFVDGNKTVDWIKDSGAKVLNLLTKGSLHHLEKQLGKTPKEFFTDVSFVIEYAIKSGLKINVYLEDWSNGFRNSPDYVKSLVEHLSKEHIERIFLPDTLGVLSPEETFQGVDSLIQKYPDIHFEFHGHNDYDLSVANSLQAIRAGVKGLHASINGLGERAGNTPLEALVTTIHDKSNSKTNINEIAITEASRLVEVFSGKRISANRPIVGEDVFTQNLYANPILPERFGRKR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Molecular basis of the substrate specificity and the catalytic mechanism of citramalate synthase from Leptospira interrogans pubmed doi rcsb
molecule keywords	Citramalate synthase from Leptospira interrogans
molecule tags	Transferase
source organism	Leptospira interrogans
total genus	123
structure length	307
sequence length	319
ec nomenclature	ec 2.3.3.13: 2-isopropylmalate synthase.
pdb deposition date	2007-12-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00682	HMGL-like	HMGL-like

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3bleA00

1DQXA 1LZOA 1OYCA 4NNBA 3QFEA 2NUYA 1K7XA 2EPHA 3F03K 3DGRA 1GYNA 5AHEA 1TTJA 3W88A 3CHVA 4MLJA 3S1WA 1JCMP 2QAPA 4LV4A 3VNDA 2CZ5A 1OK6A 4BWLA 3WJWA 2X1UA 3MJYA 5D04C 3STGA 5C5YA 4OT7A 1IXQA 2Y88A 3T4CA 4UTMA 4EOUA 3IGXA 3GIYA 5L9FA 2Y89A 3MW7A 2V2DA 3P62A 2WSRA 2DZXA 3O6DA 3SIZA 5CPNA 5J5RA 3DFNA 1B57A 2KZHA 2RFGA 3TAKA 3EX6A 1FCUA 3MI6A 3G0XA 4IGHA 3IGUA 1TRDA 1W5QA 4IX0A 2JGQA 1TPEA 3MP3A 2NUWA 3E02A 4AEOA 4FX6M 4UTHA 1UASA 4MUZA 4RV8A 4CCDA 2VEKA 3IVSA 2CLKA 3PC0A 5K3VA 3MI3A 2GQAA 1AK5A 3V1PA 3W6YA 2F84A 3QSRA 2J88A 2WO5A 1I2NA 1JRBA 3TIMA 3PWAA 4JIPA 4XZ9A 6ALDA 3N14A 1KM1A 4RZ4A 2B0MA 3SW6A 3LRLA 2OZ0A 2DZUA 3BVJA 2Q8LA 3ZFHA 3CB8A 3KX6A 3M44A 4NJHA 4WD0A 3PVFA 4DO6A 1JCXA 3GYEA 3O06A 5CPLA 3LM7A 1H51A 4S2BA 2NWRA 5DY3A 4CNPA 3SR7A 2ZQ0A 3EXSA 3QF0A 3L65A 2C15A 2B7OA 4GUGA 2QCFA 3WK1A 2W6RA 5DELA 1VYSX 3SGZA 4W9TA 5DCBA 3C3NA 4BF9A 3UQNA 1Q6RA 2YXGA 4ADTA 3BG9A 5KITA 4NNCA 4I7WA 1KV5A 1BEUA 3LCXA 1TO3A 4QJ1A 3W1QA 1NVMA 3NDOA 3NQFA 5L6UA 2JGYA 4Q4KA 4LC6A 2TYSA 1H7NA 1QOPA 4UTKA 3O6CA 3KFTA 3NQEA 4CQ9A 3HPZA 1L2UA 1VR6A 6TIMA 4LS0A 4KWVA 3CU2A 4O1CA 2X30A 3BG5A 2B7NA 3TFXA 4O18A 2ATMA 2E6DA 3CC1A 1IXNA 3U6WA 4QITA 2V30A 3LI1A 3B04A 4LVFA 5HR6A 1OVDA 3TV8A 1SW0A 1XBYA 2H3BA 4Z1BA 1KFJA 4EVZA 1OFDA 1G4TA 5EPDA 4HKPA 2FJKA 4BI7A 4O54A 4U28A 3PBVA 5D32A 2HS8A 3FYOA 2YW4A 1OFEA 1JCJA 3MMTA 3BG3A 3LXBA 4EWND 2VFIA 4PA8A 3QPZA 4UMAA 3DAQA 4UR7A 3B06A 2ZRVA 3FFSA 4ZMGA 4O15A 4BK9A 4PL2A 3G22A 4PH6A 1J4EA 2Q3OA 3W75A 3KRSA 3IIXA 3LV5A 3G1XA 3I7SA 4ICNA 4O28A 3KVJA 3W22A 3LHUA 3A24A 3MBFA 2Y85A 3N3MA 1EP3A 2ZA2A 1A5BA 1DJQA 1TPH1 4HIBA 4QM1A 3LCWA 1VLIA 1GPWA 2ZTJA 3PS7A 4GUHA 5LGXA 3GDMA 1JUEA 3HGOA 4O4WA 5C6MA 4K7YA 3U8GA 4R33A 1F76A 4CNOA 2PC4A 3UPBA 3NG3A 3I7RA 1SSGA 3DFTA 1GTEA 2QAFA 4AF0B 4M19A 2W79A 2ZZ7A 1RD5A 1LBLA 2GOUA 1KW1A 2WNQA 1N8FA 4UFLA 5AYZA 3EX4A 3H54A 3QEZA 1YDVA 3TSMA 2QCDB 3DKLA 1ICQA 2ZCGA 3M0ZA 4UR8A 2C0AA 2AAMA 4K7VA 1ZFJA 5C2XA 1G4EA 5EA9A 1KFBA 1SR9A 3A21A 5LNWA 2J6XA 3LHZA 4OBTA 5BMWA 1QO2A 4Y90A 1KM0A 2P10A 1DOSA 3B4UA 1OFOA 2ZYFA 4M6VA 2CLEA 1NF7A 3PUEA 2BTMA 1ME9A 3C8FA 2YYUA 1JJKA 4HT3A 4CNNA 3NYZA 2YFNA 3S42A 4CCCA 4MZ8A 4UFIA 1EB3A 1Q6QA 2CZFA 3CLMA 3Q58A 4JNMA 3LBCA 3LERA 2OCZA 3N73A 1SZGA 1XL9A 3RK8A 4ZQPA 4LVGA 1AW5A 1LDCA 3S5ZA 2QCLA 2NX9A 3HF3A 5FI8A 3NL2A 1AL7A 1EEPA 1YXYA 2NXGA 3NQ2A 4FNQA 2DJLA 4A21A 1YTEA 2BLEA 4H4IA 3UZJA 2Y7GA 4YCPA 3W7CA 3KOFA 1X7FA 2GJLA 1I4NA 1PHQA 1WQ5A 2E1DA 2WOQA 3F4WA 4K8EA 1VQTA 3Q37A 3M5VA 3MP5A 2QJIA 1ICSA 4NNAA 3DFPA 5F2IA 1JVNA 4N9CA 1UUOA 2Y7EA 3G1AA 2YGYA 2X16A 3R8RA 3LCIA 1H62A 2QCCA 1NF0A 1FUYA 3NA8A 3NL6A 1EUNA 3LCFA 3LCHA 5EBUA 3TSDA 1ZAHA 4QIUA 5T26A 2WQPA 2HTMA 3KVMA 5HUOA 2ZRYA 2ZA3A 4ZQOA 3LHWA 2X2GA 3A23A 2ZZ3A 5F2GA 5DCEA 2LLEA 4O14A 3GKFA 1GVSA 4AWSA 1L6WA 1XDMA 3P80A 4JTLA 1K7EA 1ML1A 3VE7A 3LXCA 4A29A 1XBXA 3NZ1A 3UY7A 2CLHA 3TXVA 3NL5A 1VYPX 3W7LA 4IMFA 1QAPA 4IQLA 2ZRUA 1H1YA 3CEUA 3TCEA 3IRDA 1LOQA 1OX4A 2E5CA 1B4KA 3W2LA 4OV9A 1G69A 4RXFA 3W1AA 3I7QA 5KTLA 4C1LA 1RQEA 4OQVA 4UTJA 3W72A 3B03A 4QQ3A 2VELA 4HSNA 1Z44A 3P5YA 4Y8FA 4X3ZA 4LUJA 4MY8A 1OYBA 4K36A 1OABA 3CTLA 4HNVA 5AN7A 3UXAA 2G5WA 2YPIA 4UTWC 4IPIA 4P2VA 3MYPA 7TIMA 2QUUA 2RDTA 3W2JA 4DBEA 3P84A 2UV8G 1BWLA 2WV8A 3KVKA 3MO7A 1KTCA 5A8GA 1LLWA 4OWGA 3C4UA 1TYGA 2RDWA 2NUXA 3M1ZA 1FQ0A 4O52A 4DXVA 3UWWA 5D2YA 1A5AA 3IIVA 2EF9A 2DZPA 1W3TA 4NU7A 1VZWA 2VENA 4ZVJA 3P81A 3P74A 4M7SA 5KZMA 1KM6A 4FF7A 4DF0A 2QDHA 3BLEA 3EWXA 2RKXA 3EWWA 1YDNA 2XN0A 3E9AA 3ANYA 1LRQA 4GC4A 4P61A 3NM1A 1R2TA 1M7OA 5KSWA 2QCMA 2I14A 2QF7A 2R14A 1VPXA 3LTPA 2PRMA 3EKLA 4K8HA 1SZEA 2A7NA 4AXKA 4GUIA 4IOTA 4DO4A 1LOLA 4A2RA 3LCGA 5LNRA 1SW7A 4MY1A 4IXHA 1A50A 3WFAA 3OIXA 1A5SA 2C1HA 3G1FA 3W83A 1EP1A 3JR2A 3IIZA 1PS9A 1OFAA 1TPC1 1ME8A 5G2IA 4JGDA 1QO5A 3LCLA 3R89A 1GG0A 1H7XA 1G7VA 3G3DA 1J5TA 1IIGA 4TX9A 1WA3A 3O6YX 1F7BA 5FEZA 1W5OA 5HINA 2C18A 3DFQA 4EF8A 4GE8A 4ML9A 1SU5A 4NX5A 4UC5A 3SJ3A 2FLIA 2DORA 1LLZA 1VJIA 1PV8A 3QQ1A 3C56A 3MI2A 5DBTA 4G1KA 5K9DA 4GWEA 1GQNA 1NEYA 1YTKA 3G3MA 4FNTA 4HHPA 2VFFA 4MJZA 5D03A 2C3ZA 4LV9A 2V2CA 5I3HA 1R2RA 1WAUA 5D09A 1VCVA 3PF3A 4UCGA 2VC6A 1TRIA 1T8XA 3GNNA 2VEMA 3STEA 3MUXA 2CWNA 3YPIA 1H7RA 5EY5A 5K2ZA 3IEBA 4ADUA 3W7GA 2CU0A 1ZY9A 3CIXA 1O95A 4UTTC 4Q33A 1OYAA 3A22A 3MHUA 1FXPA 4UTTA 3NQ8A 1VLWA 3BK0A 1GTHA 2YW3A 3OVQA 1KFEA 3VKJA 2CZDA 3NR0A 5LHEA 3HG2A 1TPFA 1JRCA 1UCWA 3W87A 1XI3A 2GVJA 2H8ZA 3L21A 4XTDA 4IX2A 3LGEA 2VFHA 1GWJA 1E51A 5CG7A 3G1DA 4BWLC 4EIVA 4JTSA 1KV8A 4UFJA 3C2VA 2CLOA 1P0KA 1QPNA 3QYQA 3IVUA 2BWGA 4QAIA 1WXJA 1B3OA 1N7KA 3L0KA 4O11A 4MPQA 1OF8A 3DXIA 3GLCA 2YFOA 4UFHA 5FF0A 2QCEA 3PUOA 4JTHA 5HQEA 1ZAIA 4TU1A 2VFEA 3CWOX 1VHNA 1K8YA 3M41A 3W1MA 1K8ZA 4MOZA 4BI5A 5TBOA 1WV2A 3K30A 1HTIA 4A3UA 3TSBA 1IF2A 4IJBA 5K9XA 1UJPA 2CW6A 3QJAA 2DZSA 2ISVA 3GX9A 5G5IA 5HWNA 5FF2A 4PEKA 3DI1A 3SI9A 4MZYA 3SECA 2ZRWA 5DBUA 5CPOA 3SY5A 4FX7A 5IM51 4UNKA 1B9BA 2C19A 1QDSA 4L4LA 4OGZA 4NJJA 4XWUA 1C8VA 4WY0A 1FWSA 1LTDA 3HO8A 1MEWA 4PTNA 2E6AA 4K39A 3NQ7A 3TU9A 1KTBA 4I7VA 4XUGA 2WNNA 2YX0A 3T44A 1TJPA 3W7QA 3OEXA 4H6KA 5G1TA 4RLIA 1GT8A 3S1VA 1TQXA 4FXSA 3WJZA 4FXRA 2ZRXA 3N19B 1TSIA 3LLDA 3O16A 5AHLA 1HO4A 4MVAA 4RK8A 1SUXA 4NT0A 3E0IA 2Y63A 1DQWA 1OX6A 1KA9F 4FNPA 4AHQA 3RMJA 4UNLA 3BGGA 1QPQA 5FESA 5FF4A 1FWTA 3SSJA 1HG3A 4WQ6A 5D2VA 3M9YA 4YL2A 1W3IA 3W2NA 3NXFA 5EL1A 3N9SA 1OFBA 4JX4A 2GPTA 2VFDA 4K37A 4JDYA 3CIWA 2NXHA 3PUDA 4XBSA 3RNDA 4KFOA 4FHAA 5KZDA 4Z1DA 5F2MA 3LBMA 4MJMA 3I68A 1KFKA 4OHQA 3W7HA 5K4XA 3LTYA 1AW1A 1DJNA 3UYCA 2A1YA 2V9DA 3FOKA 5A5WA 5K7JA 3N2XA 4LVDA 3DHDA 3W2KA 4X9SA 4DBDA 3QZEA 3CPRA 3EX2A 3WJYA 1EPXA 1I2PA 3GXPA 3PULA 1ZENA 4JYFA 4Z0JA 1KM3A 1XKYA 1XUUA 3MYOA 2GQ9A 1VH7A 5DLCA 5C54A 1AL8A 5DXXA 3QQ0A 2C16A 4JTUA 1ZNNA 4NXSA 4FEZA 1OG0A 4LW7A 1SO6A 1AW2A 4FX8A 3TROA 4JN6A 1LCOA 2H3DA 5F4XA 2V5BA 1LM1A 1OHLA 3FJ6A 4NZFA 4DF2A 1FWRA 4O0KA 1HFBA 2J9XA 3M5ZA 1TV5A 1NSJA 1RV8A 2QJGA 4OV4A 1EP2A 5CZ0A 1QPOA 5H2ZA 1ALDA 4NVTA 5KZEA 1R46A 1S3HA 5I3KA 3P7YA 4WY0B 1FXQA 3BLFA 4UIOA 2NZLA 3CM4A 4JTIA 4TMBA 1JR1A 5F1VA 1M7PA 3NQVA 1XUZA 4FIQA 3ZR4A 5KINA 1J2WA 1YXCA 3W9ZA 4PL1A 2QCHA 1C29A 2H6RA 5G2WA 1WDWA 5CKSA 4M6PA 3NOEA 5F2LA 4H3DA 5HUPA 1JQVA 3UXDA 2GUUA 2Y61A 5FEXA 3CWNA 3O8AA 3EXRA 5DN1A 1FDJA 4IXXA 3DI0A 4JY8A 5D2XA 4GXMA 2VXNA 5D02A 1RR2A 1X8FA 3QMSA 4NX0A 1GVOA 1W31A 2NWSA 3SFKA 5KMYA 2Z0IA 4ZQRA 2FPTA 2XN2A 1T99A 4S2CA 3G8RA 4XQ6A 3W1PA 4JX5A 3GK0A 2WNZA 3W85A 1CW2A 1DKWA 1YPFA 4RZ5A 3W71A 2CLFA 4WX2A 3W2UA 4IMEA 5BRBA 5AHNA 2D73A 2I1OA 1D9EA 2FQIA 3NGJA 2QUVA 2X1TA 3QPYA 3AJXA 3HBLA 4JYEA 4N9BA 2FDSA 4HN4A 3P82A 5G2HA 1M5WA 2DP3A 4MZ1A 3WK0A 2ISSA 2E5BA 2E68A 4KFNA 3ZWSA 4LY8A 1OFQA 4MIMA 1GZGA 3S5YA 3H55A 3W7MA 5CZTA 1W37A 4MYAA 3UWQA 3P60A 4O1BA 3NNTA 3NQCA 2QJHA 3VI2A 4RCXA 1W0MA 3EX3A 4O16A 2IQTA 3TKFA 1QR7A 3HPXA 3ZS4A 2V5LA 2YYTA 5BMXA 5I3JA 5AHMA 3M5XA 1ZAJA 3FJLA 4HPXA 1OFRA 2C6QA 4RXGA 3HG5A 3BLIA 3C61A 4ALDA 3R12A 1TV7A 1XC4A 4YXGA 4JY9A 4TR9A 3EKZA 2EAWA 4LTSA 1LROA 4JTGA 1O5XA 2C13A 2EHHA 3G1SA 3RFAA 3W1UA 1YDOA 3EWYA 1QPRA 2FPYA 3UWVA 2O7SA 2E77A 2ZTKA 4JXCA 1NAL1 2R91A 4YCOA 4FO4A 1KFCA 2ABBA 1KLYA 2FB2A 4NJKA 3TNOA 1SO5A 1A53A 3PAJA 2ZRZA 2JKAA 3HPSA 4R7JA 2ISWA 3W73A 2Z6IA 3THQA 5CZJA 3W7JA 3W7IA 4CQAA 3LHYA 2E6FA 3E96A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3BLEA

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