3BO9 | Genus

Total Genus 100

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	100
sequence length	314
structure length	314
Chain Sequence	HMTVRTRVTDLLEIEHPILMGGMAWAGTPTLAAAVSEAGGLGIIGSGAMKPDDLRKAISELRQKTDKPFGVNIILVSPWADDLVKVCIEEKVPVVTFGAGNPTKYIRELKENGTKVIPVVASDSLARMVERAGADAVIAEGMESGGHIGEVTTFVLVNKVSRSVNIPVIAAGGIADGRGMAAAFALGAEAVQMGTRFVASVESDVHPVYKEKIVKASIRDTVVTGAKLGHPARVLRTPFARKIQEMEFENPMQAEEMLVGSLRRAVVEGDLERGSFMVGQSAGLIDEIKPVKQIIEDILKEFKETVEKLRGYIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of putative nitroalkan dioxygenase (TM0800) from Thermotoga maritima at 2.71 A resolution rcsb
molecule keywords	Putative nitroalkan dioxygenase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Thermotoga maritima msb8
total genus	100
structure length	314
sequence length	314
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.1.9: Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH).
pdb deposition date	2007-12-17

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF03060	NMO	Nitronate monooxygenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3bo9A00

3DBPA 3W7JA 3I7SA 3DI0A 4Z1AA 1AL8A 2PURA 1T0OA 4M7SA 4UTTC 4NQ1A 4R34A 1TQJA 4PC8A 3E9AA 4Q32A 3W70A 3W22A 5D09A 3MYPA 4N4PA 3SECA 3CTLA 1A53A 2CZDA 5F2GA 2QDGA 4YMZA 2CLLA 1E51A 3O16A 4TX9A 3GLCA 3HG5A 1KFEA 4RX0A 2PRLA 1SO4A 4GUIA 1VQTA 3G0UA 3A5FA 3CU2A 2BSLA 4JYEA 1WAUA 3ELFA 5D2XA 1TRDA 2P1FA 6ALDA 5HWJA 2FJKA 4JD4A 3UXAA 4RLIA 4MOZA 4KWVA 4ZQPA 5U7SA 1G69A 3LM7A 3UNDA 1H60A 3ATYA 1TV8A 2FPYA 4S1FA 3TROA 4CCEA 1A5CA 4FNUA 1SPQA 1XI3A 3UWWA 3M5ZA 1DJNA 3KVMA 3LRMA 3HGOA 2XN2A 2DZXA 3O8AA 3L21A 5FEZA 1Q6OA 3MBFA 3IIXA 2B4GA 3B05A 3L5LA 5EKYA 2VEKA 5AHLA 2VXNA 4JYFA 1ZFJA 2X2GA 1XDMA 3TIMA 3DXIA 4PCFA 3F03K 3M5YA 4QITA 5G4EA 1OFEA 4MLRA 3S5ZA 4HSNA 2OT1A 4YLWA 1FWNA 1XL9A 4QIUA 4NVTA 2OCZA 3W76A 4DPPA 5HUPA 2Y63A 1X7FA 3NR0A 4FNPA 3M5VA 4PL1A 5AHMA 3QW3A 5L6UA 4CNOA 4K37A 3IIVA 5KMYA 4HN4A 1GG0A 1KLZA 2OMAA 4AWTA 3TXVA 4ML9A 3IIZA 4FEZA 5BNKA 4IMGA 1NSJA 3GX9A 3FJLA 3A21A 3LTYA 5FI8A 2Y62A 4JTFA 2DP3A 1AG1O 3A22A 4K38A 1QPNA 2JKAA 1RV8A 3M47A 3UZJA 4TR9A 5D33A 3G8EA 2PC4A 3GZ3A 4I7UA 3S0CA 3PF3A 1XCFA 3QC3A 3DZ1A 4Y96A 1SW3A 1YXDA 1VLWA 3QW4B 4O4WA 1O60A 3I7QA 4FB7A 5AC8A 1SSDA 3W7OA 2QJGA 3L68A 2CLIA 4MYXA 5K4ZA 5IM51 1EP1A 4JY8A 4YCPA 3RU6A 1T8XA 2QAPA 1ZCOA 3PG9A 3NQEA 4BWLC 4ICNA 2BZNA 4FF7A 4WD0A 4TMCA 1H7RA 2RDTA 4JIQA 3TJLA 2Y89A 4LVFA 4DPQA 3W73A 3EXRA 3P8JA 5T26A 3M1ZA 3BGJA 1TTJA 1TPVA 3FA5A 1DQWA 1D9EA 3NQAA 4IUOA 4NJHA 3UZ5A 3LCLA 5L9FA 1EB3A 3CT7A 3P84A 5EL1A 3BPWA 2EKCA 5U4NA 1LOQA 1W8SA 1OFOA 1W0MA 5LNRA 1JR1A 2HS8A 3LXCA 5F2LA 4YCOA 2DZUA 2WNZA 3IRDA 4LC6A 1DORA 4X22A 5LNSA 4LVAA 3N9SA 1OVDA 4LY8A 2E6AA 1NF7A 3CWOX 4O57A 3G8RA 4WX2A 4W9TA 3G1SA 3UY7A 3O63A 3HIJA 4AMAA 4FIQA 4LOCA 3TK7A 4E38A 1G7VA 2WNQA 1Q6QA 3C6CA 3EWUA 1VJIA 3W84A 3I68A 1X1ZA 2Z6JA 1LLWA 1FDYA 2F7FA 3NQ2A 3PBVA 5LKYA 1UUMA 3BW3A 1FWSA 1HL2A 1G4EA 3TA6A 1FCQA 1LP6A 4O28A 5AFDA 3KRSA 1LM1A 3GDKA 4NXSA 5I3JA 1MXSA 3VE9A 2FDSA 2VC6A 3W2NA 2ZRZA 5KZDA 5K9DA 2BTMA 4ZQMA 1QMLA 5G2HA 2FB2A 2X1SA 3RLUA 1OF6A 5EA9A 3QQ1A 3NQFA 1ALDA 3OVQA 4IPIA 2AQWA 1AW1A 3MI6A 4EOUA 4CQ8A 3TAKA 2NUWA 2A0NA 1TPB1 2Y7DA 1MEWA 1QAPA 5CZ0A 3TAOA 2QCCA 3TDFA 3P62A 1OK6A 4HPJA 3G1HA 1K7FA 4Z08A 2QUTA 3MHUA 5LHFA 3Q2DA 3W2JA 1RQBA 2DU2A 3TMQA 3I65A 4JTIA 3M9YA 3HGSA 2C16A 4Z0JA 4KKXA 1O94A 2A1YA 4LS1A 3PUDA 5K2ZA 3EX2A 2ATSA 2WSRA 3TE9A 4LC8A 1LLZA 1XKYA 1R2TA 4UTMA 3OBKA 4BFAA 1LOSA 4PEKA 2R94A 1SFLA 4OQVA 4RXGA 2JKPA 5HR6A 5KINA 1X1OA 1I2QA 3PM6A 2DZPA 1IIHA 4HIBA 3TR2A 1EP2A 3H53A 1KM5A 3LGEA 1KM2A 5HWNA 3BW2A 3TQKA 2W6RA 3E12A 2ZTJA 3K30A 2VEPA 1EX5A 3UY8A 3TFCA 1L6WA 3C61A 4X9SA 1P4CA 3P81A 3MI3A 3ZS4A 4NXKA 1OFDA 2O7SA 3W87A 2NX3A 5BMXA 4DBEA 3H54A 4GC4A 3W83A 3LHWA 3M44A 4YWIA 2CFFA 3DI1A 5C6MA 5KITA 4I7VA 5F1UA 3NL5A 1XUZA 4JGDA 1WV2A 4UFMA 4JY9A 1FWWA 2Y7EA 2NUYA 2EAWA 2A85A 1TTQA 5D30A 3W7KA 4EVZA 2VFGA 1VLIA 3RLVA 1QPOA 1F6KA 3H55A 2VFEA 3LTPA 2YYTA 2E1DA 3FKKA 2XN1A 3WFAA 2FB3A 3EWBX 3HPXA 1FXQA 1KFJA 3VNDA 1VHCA 4RZ5A 3M7WA 1W31A 4EF9A 2GQ9A 3L9CA 4UR7A 1N55A 1RVGA 1TV5A 3OA3A 3S5YA 4MFEA 1ME9A 3NYZA 4N2YA 4PTNA 4UTUA 3KAOA 5KZEA 5DLCA 3NQ8A 5HNRA 3M5XA 4LVBA 4KFNA 2I1OA 1X8FA 4XQ6A 1ZAHA 2C19A 4LV4A 1T96A 2ZA3A 3DFPA 3P80A 2A7NA 2C0AA 3BARA 3NDOA 4XZ9A 2YYUA 1S5TA 1PHWA 3LHYA 1XUUA 3PS7A 5KTLA 1H1YA 1M5WA 3V75A 3SSJA 3MP3A 3E02A 3N2MA 2CZFA 4O18A 3GVGA 1R46A 1KFKA 1JVNA 1SU5A 4FNQA 1O95A 1GJPA 3WK3A 2A21A 1MEHA 1IXNA 2QCDA 3TX9A 1DQXA 3S1WA 3C52A 3LCIA 3S9YA 2ZRYA 4JDYA 1VS1A 4MJMA 1TIMA 2FPTA 4O52A 1R30A 4O16A 5CGQA 2AAMA 5HR7A 3N19B 3E96A 4RKAA 5I3FA 3EX6A 3UWQA 5FF4A 1F73A 3W2MA 3QH2A 4RZ4A 4UTLA 5D32A 3CEUA 1RR2A 2Y85A 4U4MA 1IXPA 4FNSA 1KFCA 3GIYA 4DBDA 3C0JA 2ZCGA 2Z6IA 3GNDA 3HPZA 3UWUA 4N6FA 3QSTA 1OX5A 4GUFA 3GK0A 1ZENA 2NV2A 4CNPA 4GNJA 1YDVA 3CPRA 2JKEA 1S5WA 1KTNA 3LCFA 1OF8A 2YW4A 4K7VA 3LXAA 3ZR4A 4OBTA 1LZOA 3NQMA 1WBJA 4NUWA 3NPXA 5FEPA 1TREA 1EEPA 1F76A 3JS3A 1W3TA 5DCBA 3ZFHA 1OYBA 1ZAIA 3DH7A 4S2CA 5CSRA 4LU0A 3T40A 2NLIA 3N73A 5GVJA 3IGXA 4JTLA 3UWZA 3N2XA 4GXMA 4IGHA 2B7OA 1XFBA 4KWWA 4N9EA 2C1HA 1OX6A 4QM1A 3QMSA 1PCWA 1JULA 3PBWA 2Q8LA 2RH9A 5FF2A 4JXCA 2J24A 4QQ3A 2RDUA 2J9ZA 1FXPA 1G4TA 2GVLA 4DEFA 1SO6A 1YLVA 3HGJA 3W7DA 3LBMA 2E5DA 5FF3A 1B9BA 1KA9F 5K4XA 4JTGA 4A2SA 3G3DA 3GDMA 2E6DA 3E49A 4UMAA 1ICSA 1I2NA 3G0XA 2HTMA 3OEXA 3A23A 1I2PA 3FIGA 3NPUA 3DAQA 3EB2A 1G6CA 4UTHA 4A29A 2J9XA 4LVGA 5K3VA 1VYPX 1K8ZA 1KM3A 3DFTA 1EWEA 5F4XA 2NX9A 1XBXA 2Q3OA 3V1PA 3QM3A 2Y7GA 1W54A 1SZFA 3FOKA 4UCGA 2H8XA 2DZSA 2ISWA 3TQVA 2JGYA 3B4UA 1DV7A 3VI2A 3SR7A 4M6VA 1VR6A 3LCHA 3RMJA 3S6DA 3NO5A 3GB6A 2GVJA 3THAA 1YADA 4CCDA 4OV4A 3FYOA 3IVSA 5TBOA 3L0GA 3NQGA 3QMTA 1V7YA 1JUBA 2DORA 2G95A 2OJPA 1OFAA 1W5MA 2H8ZA 2JK2A 2QCDB 2DZWA 4M6PA 5E1QA 1XXXA 1GEQA 2FIQA 3INPA 5DXYA 1QPRA 3STEA 4XTIA 5D04C 2Y88A 4AF0B 1EPXA 4NU7A 2QAFA 3LB0A 5FESA 1F74A 4NNCA 5A8GA 1L9WA 2ZYFA 4BI5A 1ONRA 4IMDA 1SZGA 4JTTA 4NT0A 4ZQNA 3NPWA 4DF0A 1FX6A 5F2MA 1QOQA 5G5IA 5DBUA 2NXHA 1WA3A 3BW4A 4MPQA 1TSIA 3KX6A 4LT9A 5LNVA 5H91A 1KW1A 5K9XA 1GVSA 1LBLA 1SFJA 1V5XA 3GDLA 3NQ7A 3P5ZA 3R89A 5CSSA 3BLIA 1VCGA 2QJIA 2BXVA 1PL9A 3W1UA 1GVFA 1W56A 2C14A 5I3IA 2P0OA 2DJXA 4TIMA 4ONVA 3W7RA 1FCBA 3N34A 1SW0A 1SW7A 2A5HA 1ZJIA 2ZFAA 1SZEA 3ABRA 4R33A 4DELA 5J5RA 3EWYA 2RHGA 2E5BA 4D2JA 3S1XA 1KM0A 5C54A 1DJQA 5LZLA 4HT3A 3O6CA 3THQA 1XBVA 3STGA 4EF8A 4IPJA 3RFAA 5BOOA 4JX6A 2VEMA 4MUZA 2J88A 5MHBA 1I2OA 4IX0A 4UTJA 3C56A 2QUUA 2E6FA 1FDJA 4WXYA 4J9JA 1WXJA 2WO5A 3LTSA 1H7PA 5D38A 4JIPA 3ABQA 5I3HA 4UMBA 4LNYA 4AWUA 3TMLA 4LS2A 3STFA 3T55A 1U5JA 2I9EA 2TYSA 3QZEA 4M19A 3B0VC 1GVQA 3NZ1A 5AYZA 3QMRA 1KTCA 3W2LA 2UV8G 3EWWA 1JCMP 1MO0A 3LLFA 2I14A 4PA8A 2CLHA 4N9CA 3CQ0A 2R14A 3R8RA 3W7CA 3PWAA 4LS0A 2A6LA 5CPLA 2XFWA 3IVTA 1T99A 1FY6A 2H3DA 1YTEA 1Z48A 4FXRA 3LCXA 4UMCA 1TO3A 2ZZ5A 2ZZ6A 1EP3A 3FFSA 1NAL1 2NUXA 1K02A 2RFGA 5CPNA 1VPXA 3S1VA 3L66A 3NL6A 3HO8A 2ALDA 3L67A 3MMTA 4UFLA 2ZA1A 3W88A 2E09A 1LRTA 5E93A 2YZRA 4YL2A 3TW6A 2BX7A 1UUOA 1F2JA 4FIRA 3CIWA 3CB8A 3DKJA 4S2BA 3MP4A 4N6EA 5DBTA 4UFJA 1HO1A 3B06A 2VELA 3PY2A 3DFQA 3KXQA 1ADOA 3M16A 8TIMA 3W1PA 2ZTKA 1H62A 1Z44A 3A24A 3WK2A 3C8FA 3JRKA 3NZRA 4ORIA 2YCEA 2WSYA 2E6YA 3W3OA 1GT8A 4JNMA 2A2IA 2V81A 1I45A 1EA0A 1SO5A 3HG2A 5FF0A 1X6UA 1NEYA 3RF9A 3P7YA 2CU0A 1IGSA 4PH6A 1P1XA 1WYIA 1SO3A 1GPWA 4I7WA 1H7NA 5C2XA 2X1UA 5IBXA 3MI2A 5DY3A 3NA8A 3F4WA 2E77A 4NX0A 3W7HA 3TUUA 3LX9A 4IMCA 2HS6A 4XBKA 4XBSA 4O53A 3HOJA 3PUEA 1EUNA 3BGGA 1OFRA 1KM4A 2J27A 4O1CA 3BK0A 4EWND 3QPYA 4NNBA 3BV4A 4NJJA 3MHFA 2OT0A 1RQHA 3DFOA 1XDLA 2X1TA 4E0CA 4ZVJA 2C13A 5HUOA 3LBCA 1VGAA 5FF7A 4UTIA 3Q58A 3SFKA 4H3DA 4QJ1A 2PRHA 1PS9A 4UFHA 2R8WA 1ME7A 2X16A 3G3MA 3DHDA 3NAVA 4WOZA 2CZ5A 2C3ZA 4OWGA 3LERA 2WJZA 1D3GA 2ATMA 1MEIA 4RZ6A 4O1AA 2Y70A 1KFLA 3RNDA 2QCGA 1K3UA 3W6YA 4RV8A 3CHVA 1FDZA 1K7EA 5TIMA 5D02A 3TJXA 1GTHA 3I7RA 4IMEA 4Y90A 5DCDA 5AN7A 3LXBA 1H1ZA 1SUXA 4R7JA 4O1BA 1TPUA 3WK1A 3C2VA 2Q8ZA 1OK4A 1AMKA 2XN0A 3KHJA 2RKXA 4RK8A 1W5NA 2YXGA 1ZY9A 4G1KA 4TMBA 4JR5A 1W3IA 3NOEA 3EXSA 3SGZA 5HMSA 3P60A 1Q6LA 1RD5A 1K03A 3P61A 4HPXA 1O5KA 2YGYA 3EWXA 3M43A 1B4EA 5CPOA 5AOUA 4JYDA 3B04A 3DFSA 2WQPA 2PRMA 1OYCA 3CLMA 2OX1A 1CI1A 1BTMA 1FCVA 1H7OA 3DKLA 4RR4A 4CQ9A 1MZHA 1JCLA 3FYPA 3VFLA 1VCFA 3EKLA 3W7NA 2V5BA 3TSDA 4BI7A 3DENA 2QF7A 3KOFA 1PHQA 1W5PA 3HBLA 4ZL1A 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1G4PA 3L65A 3CEPA 2YPIA 2WOQA 1C9DA 1ZNNA 4H4IA 4Y8FA 3CM4A 3IIPA 3NL2A 4JTKA 3G18A 2QUVA 1W5QA 4OV9A 4ALDA 4A22A 2W79A 3O15A 1BKSA 1G67A 4HSOA 1DBTA 3LOTA 1HTIA 4JX4A 3LRKA 3GR8A 4LUIA 2Q3RA 3Q94A 5CZJA 4UTWA 4X2RA 2GQAA 1ME8A 1TTIA 3KVJA 3W9ZA 1O5XA 3W2UA 3VCRA 2FPVA 3MW7A 1PCKA 2NWSA 4O13A 4ZQCA 3USBA 4JS3A 4MVAA 3W75A 2QCFA 5DXXA 2ZRXA 3LHTA 4PODA 5ABTA 1RZMA 1JRBA 1SR9A 4UFKA 3LI1A 1YXYA 3EXTA 5I3KA 2ZRWA 4PL2A 4XTDA 4O0ZA 2BWGA 2J6XA 5HQEA 4AEOA 4Q33A 3W86A 3R2GA 3W74A 1RQEA 1THFD 1QWGA 2VOMA 2ZZ3A 3R12A 4UTTA 1WDWA 4HHPA 3N3MA 3EWZA 2YFOA 3IIOA 2F84A 1W1ZA 1H61A 2VKZG 5F1VA 1FUYA 2ABBA 4RJEA 3W7IA 3UPWA 3O6YX 4O10A 1ML1A 3FLUA 4GBUA 4UC5A 2ZRVA 4GWEA 1H5YA 3NQCA 4JTJA 2FQIA 3SJ3A 4O14A 3GXNA 1OJXA 2G97A 1F5ZA 5EPDA 3QSRA 3W1QA 2CLKA 4ZZ9A 1KBJA 4MZ1A 1N8FA 2QCNA 3WJXA 4DQWA 3PG8A 4RXFA 2GJNA 2CW6A 2YX0A 3S42A 3P5YA 3PUOA 1XC4A 1TPWA 3W7LA 1QCWA 4AHQA 1BWLA 2EPHA 1TJPA 1QR7A 2QKFA 4IQLA 4DO4A 3G22A 3NGJA 3LV6A 4QISA 1AL7A 1WBHA 5D03A 1SQ7A 4UNLA 4RCXA 2WNNA 1DKWA 4JICA 3C2FA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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