3BO9 | Genus

Total Genus 100

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	100
sequence length	314
structure length	314
Chain Sequence	HMTVRTRVTDLLEIEHPILMGGMAWAGTPTLAAAVSEAGGLGIIGSGAMKPDDLRKAISELRQKTDKPFGVNIILVSPWADDLVKVCIEEKVPVVTFGAGNPTKYIRELKENGTKVIPVVASDSLARMVERAGADAVIAEGMESGGHIGEVTTFVLVNKVSRSVNIPVIAAGGIADGRGMAAAFALGAEAVQMGTRFVASVESDVHPVYKEKIVKASIRDTVVTGAKLGHPARVLRTPFARKIQEMEFENPMQAEEMLVGSLRRAVVEGDLERGSFMVGQSAGLIDEIKPVKQIIEDILKEFKETVEKLRGYIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Thermotoga maritima msb8
publication title	Crystal structure of putative nitroalkan dioxygenase (TM0800) from Thermotoga maritima at 2.71 A resolution rcsb
molecule keywords	Putative nitroalkan dioxygenase
total genus	100
structure length	314
sequence length	314
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.1.9: Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH).
pdb deposition date	2007-12-17

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF03060	NMO	Nitronate monooxygenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3bo9A00

2WSYA 3BGGA 1Q6RA 4XBKA 1ZENA 4DF0A 2RHGA 2YX0A 1JR1A 1JCNA 4EIVA 2Z2UA 3MI3A 3NQ6A 3SY5A 2ABAA 4AHOA 2E6FA 3EEGA 3HGSA 4AF0B 3WK2A 3P5ZA 4LVBA 3KRSA 5KINA 3EX2A 1E51A 3KXQA 2DZVA 3IGXA 2QJGA 2C0AA 4NNCA 3HG4A 1AL7A 1TYGA 2A5HA 2QEZA 5LNUA 2V2CA 2DZPA 5EBUA 1XC4A 2YYUA 3W1MA 2ZZ1A 2FPYA 3BLEA 4H6KA 3W1QA 4JTFA 3GAYA 1AG1O 5EKYA 1ZJIA 3DAQA 3G22A 3GYEA 2ISVA 5G2IA 3DFPA 2VC6A 4JIPA 3TQVA 1TPH1 3LI1A 1O4UA 2VEMA 2E68A 3HGOA 3MP3A 1VS1A 2QCDB 5AYZA 4FIQA 3ZFHA 2X16A 4H3DA 3BW2A 1L9WA 1RR2A 2VXNA 1JCMP 2WNZA 1OFAA 3GXNA 1EEPA 3O6CA 4TIMA 3M1ZA 1L6WA 1VC4A 3FS2A 2ZZ2A 2ZRWA 3UWQA 3W2JA 1AW1A 3PF3A 3W1PA 3GIYA 2V2HA 1QNVA 1KFCA 1YPFA 3LV6A 4O1BA 3WFAA 2QF7A 4R7JA 3A24A 1BWLA 1KV5A 2FQIA 2EPHA 2NUYA 5CSRA 3OVQA 3W2UA 1RQHA 3G1YA 2ISWA 3GR7A 3L0NA 4R34A 1KTNA 2EAWA 4O53A 2B7PA 2DU2A 1BEUA 2R94A 1F76A 3W86A 2J9YA 2CLIA 1KM3A 1XBXA 3P82A 3MJYA 4LTSA 1XFBA 3NZRA 1KBIA 1K3UA 4LUJA 4DELA 1S5WA 4M6QA 4LRSA 4PCFA 1TPUA 1BKSA 3P81A 3QQ1A 1SU5A 3EWWA 3H54A 4JGDA 1LRQA 1P4CA 3LRKA 4UCGA 4QISA 1TV5A 3CIWA 5L9FA 1F73A 2RDTA 1TTQA 1LRTA 4JN6A 5HWMA 1KTCA 1NFBA 3MP4A 4WOZA 4E2DA 5C54A 2ISSA 5FEZA 5HJLA 1YTKA 3TV8A 1IGSA 2Q3OA 3HG3A 3QM3A 5DCDA 3GDRA 5CZTA 1Z48A 1PHQA 3P8IA 1SFLA 4DBEA 5HINA 3L68A 3N3MA 1XUZA 1K7FA 2GVGA 1OF6A 4TMBA 2ZFAA 2QJIA 1I8JA 3HPZA 1OX6A 5AFDA 4XKYA 1FUYA 1QFEA 3JRKA 3NOEA 3W3OA 4RJEA 4O12A 4GUIA 3TQKA 1A53A 3W1XA 4LOCA 4LVGA 1QR7A 2VFFA 2CLFA 5LKYA 1R2TA 1ZFJA 1SSGA 4I9AA 1O5XA 3T4CA 4YCPA 2V8ZA 1TB3A 2VOMA 1FY6A 1QO2A 1R30A 2XN0A 4IJBA 3ELFA 4UTKA 1DORA 1TPB1 2FIQA 3MI2A 4M19A 1LBLA 1K7XA 4LS0A 3HGJA 5CZJA 5FEPA 3IRDA 4AHPA 3LHTA 4UFJA 1DJQA 3NQVA 1X7FA 4RZ6A 2V5BA 5I3JA 4GC4A 4JTHA 1H1YA 5BRBA 3T44A 5D04C 3S5ZA 2PURA 3EX1A 2ZTJA 2WNNA 1SZNA 3MI6A 3WJYA 3KOFA 3L0GA 4NJGA 1ZY9A 2ZRZA 5CPMA 1A50A 2C19A 3PBVA 3G1SA 2WSRA 1QMLA 1L6YA 4RXGA 1G4PA 3G1XA 2YR1A 4I7UA 1HG3A 2ZA1A 4AEOA 2YYTA 1PV8A 3M41A 2G5WA 3TX9A 2QAFA 3O6YX 3HGRA 3CLMA 4O4VA 1ONRA 3E0IA 2C14A 3M5XA 3CB8A 3LCLA 2NWSA 3FYOA 3PG9A 4EVZA 4NX0A 4MIMA 4AVFA 3BG9A 4JICA 3W1UA 1WBHA 1EPXA 1VYRA 1LCOA 3QMRA 4LRTA 2JGQA 1OK6A 3NO5A 3W1TA 4HPJA 3LBMA 3EB2A 4MZ1A 3TK7A 1SW0A 2BZNA 4K8HA 3CM4A 3S42A 2QCEA 3LI0A 1WOBA 6ALDA 1KM6A 4WY0B 4MLRA 3N14A 4JIQA 3MHFA 3BV4A 1W37A 3OA3A 4GWEA 3G0XA 3LHYA 3DGRA 4NX5A 1GVQA 3RU6A 3G3DA 1QO5A 2J9XA 3NQMA 3PC0A 2ZTKA 2WQPA 1THFD 2DZXA 1KM4A 2CLLA 5HR6A 2FPVA 3DU0A 1VGAA 4RKAA 2YZRA 1JRBA 2B7QA 4CQ9A 2PC4A 3C6CA 5EL1A 1MZHA 4JY9A 4S2BA 1SO4A 4N4QA 3A22A 3C2OA 1H7PA 1L2UA 2ATSA 1JQVA 5GVJA 3STFA 1ICPA 2H3BA 2OCZA 4FNTA 5HUPA 3B8DA 4XTDA 3EWBX 1H51A 4L4LA 4LC6A 3QFEA 1WXJA 5EA9A 3G1AA 4JYEA 2C16A 4GUJA 1D9EA 4XKYB 2GQ9A 2WKJA 5HR7A 1YADA 3AO0A 3W75A 3GLCA 1GTEA 1OFDA 2GVJA 3UY8A 3LERA 4AWSA 3IIXA 3NXFA 3LCXA 3NPUA 1BTMA 4FF7A 3G0SA 4TO8A 2NV1A 2BSLA 2X1RA 3S5YA 3LX9A 2C6QA 5A5WA 5MHBA 4GUGA 2QCGA 3PBUA 4ZZ9A 1MEIA 4AWUA 3QC3A 5BMWA 4OQVA 3HQ1A 1G7UA 4UTJA 2ZQ0A 1BWKA 3RK8A 3F1QA 1VJIA 1KM1A 3M9YA 5F4XA 4K36A 1IIGA 3EX3A 1H50A 4M7SA 5K3VA 2WV8A 2NV2A 4DPQA 5CG7A 2FTPA 3EXTA 3THAA 1TTPA 3FEMA 1S5TA 2CU0A 4JS3A 4HKPA 5AN7A 4MZYA 5D05A 5DBUA 1OABA 1YTEA 3TJLA 3NM1A 3CQ0A 1I2OA 3M43A 1ZAHA 1OFQA 1W5NA 1K8YA 2W6RA 1B4KA 4DEFA 4GE8A 3PB2A 3W87A 5G2WA 1OFPA 1VPXA 3C2EA 3MYPA 4I7VA 3M6YA 3W1NA 3T40A 5IM51 4RX0A 3L5LA 3PBYA 2Y63A 4IX0A 3S6DA 3BW3A 3QRHA 3TA6A 1RVGA 3W7OA 3GK0A 5TQLA 4S2CA 3HG5A 5U7SA 3W7MA 2ZA2A 4MPQA 3WJSA 4P61A 2A1YA 1AW5A 2X1TA 4CNNA 3BG3A 5D2VA 3W7EA 4MY9A 4D2JA 4X2RA 1XUUA 3W76A 4N9BA 2P1FA 2O7QA 2ZRUA 5D2WA 1N8FA 7TIMA 3KHJA 1J5TA 1WX0A 3HG2A 3W7CA 4YMZA 4RCXA 3BARA 1I45A 3MP5A 4Z0SA 1WOAA 2ZZ3A 2I14A 3M5VA 1SSDA 1UASA 3K30A 4EWND 1QDSA 1R46A 2C13A 3V75A 3R5EA 3UZJA 2ZZ5A 4M7TA 3NM3A 1SZGA 5TBOA 3S1UA 4QJ1A 4Z1AA 1H1ZA 3G1DA 4OHQA 3JR2A 3W7IA 1GVSA 4JTIA 3SZ8A 1UCWA 4ALDA 4HNTA 2UV8G 1AMKA 4FX7A 1TTIA 2J27A 2F84A 5AOUA 3HOJA 5T26A 2VFHA 1NVMA 3P80A 1TSIA 2QUVA 2Z1BA 2OMAA 2YW4A 1TTJA 1GQNA 2E6AA 1WAUA 2Q8ZA 3NL6A 1Q6QA 4TU1A 3C0JA 1KW1A 3WK1A 1PS9A 4K39A 3TC6A 3W84A 3KVLA 1OK4A 4X22A 3VFLA 5LHEA 3W2LA 4DO6A 4MJZA 3OG3A 2E6YA 4GNJA 4QAIA 4IQLA 1F6PA 5HWJA 1PHWA 4Y9AA 4PTNA 3W7KA 1I2PA 1ADOA 1KTBA 1GOXA 3N34A 5G2HA 5G1TA 2ABBA 3GDLA 2QCCA 3PG8A 4OBTA 4GJ1A 4NNBA 4FNPA 4JDYA 1TREA 3VE7A 2ZRVA 3LXCA 1FDJA 2CZFA 2Y62A 1KFLA 3HO8A 3KFTA 4QNWA 1W1ZA 1WQ5A 5I3IA 2Y88A 4HPXA 4O14A 4IX2A 1EP3A 3I65A 1TRDA 3NL2A 3GDKA 4UMCA 4JD4A 1EUNA 1IXPA 1I2QA 2QCHA 3ATYA 3IV3A 4JYDA 4B5NA 1JQXA 3I7SA 5C5YA 3TW7A 5F2MA 2FPTA 2J9ZA 3CHVA 4P2VA 4OV4A 4O19A 5KTLA 1IF2A 2NX9A 1O95A 1EX5A 2JKPA 4ICNA 3G0UA 3EXRA 4Y96A 4DBDA 1F6KA 4Z0JA 4HN4A 1N55A 2B0MA 1PIIA 3BPWA 3IIPA 1DVJA 3I7QA 3RNDA 1SR9A 2X2GA 1UB3A 4NZJA 4E2BA 3TR2A 2DORA 4O17A 1SFJA 3L21A 2CWNA 4DO5A 2R91A 4R53A 3C61A 2G95A 2A7NA 2AQWA 3C56A 4XBSA 5J5DA 1DOSA 3PULA 4K6AA 3CWOX 1DHPA 2OT1A 4RK8A 4M6PA 4ZL1A 1SW7A 1B4EA 4UTLA 4MOZA 3M44A 4IXXA 3P5YA 5CZ0A 3TH6A 5K4XA 2H3DA 4KKXA 2E09A 3F03K 4O57A 5F1VA 1TMHA 1WBJA 2Y85A 3QPZA 2TYSA 1VCFA 5DCEA 4YWIA 5CPNA 3UQNA 2XN1A 3TNOA 1VCGA 2QCNA 4MFDA 1EP2A 2H8ZA 1TIMA 2PE4A 3R13A 5LHFA 2VENA 5HNRA 2EGZA 1GVRA 2Y61A 1TJRA 3PVFA 5LZLA 2Q3RA 1LYXA 1OX5A 3SJ3A 2HS8A 4QITA 3BVJA 2PRHA 1TPDA 1K03A 4UR7A 1OFRA 3QYQA 5AHNA 1PCKA 2AGKA 3NPWA 1VQTA 1VYPX 1P0KA 1KM5A 5AYXA 1TPFA 5AC6A 2HS6A 5LGXA 1UBSA 1L6SA 3N9SA 3O16A 3LRMA 2D73A 3B4UA 1XDMA 3BGJA 2ATMA 4A21A 3QF0A 3KVJA 2J6XA 3L0KA 3O8AA 1A5BA 3PWAA 3CEPA 4K38A 2I9EA 2OX1A 4CCCA 1XKYA 2XFWA 2VEPA 2NZLA 1ZAIA 4O15A 3S1WA 2Z0IA 3ANYA 4MY8A 3SGUA 4HIBA 4K8EA 5LNVA 3P7YA 1F5ZA 1XXXA 4O18A 3F4NA 5D09A 2A6NA 3QZEA 1F74A 1YDVA 1CW2A 3HPSA 1Y0EA 3LXBA 1JCXA 2ZCGA 3PS7A 3U2OA 3GAKA 3ABSA 3NL5A 3U8GA 2GUUA 3L5AA 3PY2A 4IMDA 1O60A 4CQ8A 1OYBA 2E6DA 1O94A 4Q33A 1XI3A 4PA8A 1FWRA 4UTHA 1S5VA 4M6VA 4AH7A 2C3ZA 3LHUA 1LOLA 2CLMA 1H7OA 1FQ0A 5LNWA 4LVAA 3ABOA 2R14A 5C6MA 4ONVA 4JX5A 4BK9A 5LNRA 2E5DA 2DZSA 4LVFA 4N02A 1TRIA 5H2ZA 2Y6ZA 3N2XA 3UWZA 4JX4A 3BW4A 1W5OA 3LOTA 5K7JA 1EA0A 3TSMA 3R2GA 3VI2A 1H62A 3O1NA 2GVLA 1SO3A 3OVRA 4MLJA 3DENA 2ZDRA 4FNRA 3W2NA 3O07A 5FEXA 4IMEA 2OT0A 1F05A 4JEQA 5J5RA 2ZBTA 5KZEA 3R12A 1OVDA 1N7KA 3IEBA 4YCOA 4LUIA 4UTTA 3SSJA 5FF0A 2QJHA 1Z42A 2PRMA 4ZMGA 1ALDA 3W7NA 3QMTA 1RQEA 4OT7A 1MEWA 2FB2A 5E93A 1FX6A 3FYPA 2QCLA 1OX4A 1Q6OA 3NDOA 2NUWA 2FDSA 2C15A 3Q58A 1NF7A 4KFOA 3STGA 4BI7A 4ORMA 1FBAA 1P1XA 1P5BA 3SECA 3W7RA 5I3KA 1RD5A 1VHNA 4BI6A 5KZDA 3ZS4A 3L9CA 3L66A 1LOQA 1XBYA 3NYZA 3TW6A 3SW6A 5D03A 2HMCA 2YDAA 1TQXA 2VFDA 3PR2A 5DBTA 4JTUA 4HSOA 1LROA 5FF3A 2H6RA 1G4TA 3ZWTA 3G8EA 2F7FA 4KWVA 3PSVA 1DQWA 3MUXA 1MO0A 3F4WA 4BWLA 4CLMA 3BLIA 2QCFA 4PEKA 2EKCA 4OGZA 1P0NA 1S3HA 2YFOA 3LDVA 4JTKA 4WX2A 2QKFA 4OV9A 5G4WA 3DI1A 4FNQA 4LC8A 3NQDA 1WV2A 4IXHA 4UR8A 3DFOA 4O8RA 4FNUA 1HL2A 1TPC1 1R2SA 2TMDA 5D02A 2A2IA 4U28A 4Q32A 2VFEA 1M5WA 2B7OA 3W1AA 3E12A 4NJHA 4IWWA 3TMQA 5FF7A 2VEKA 3FLUA 4IMFA 3NQEA 5D32A 3M5YA 1OYCA 3MBFA 1I2RA 1X1ZA 3O05A 2JBMA 3W70A 1AL8A 3QJAA 2QAPA 3STCA 3EWUA 3QW4B 1QPNA 1JUKA 1M7PA 1G69A 1H7NA 4FXRA 5AHIA 3NQ7A 2JKEA 3TAOA 4O52A 4ZQNA 3LHZA 5AHEA 3O6DA 2BXVA 4JTGA 3TCEA 3C2FA 1KFKA 3PUOA 1FCBA 1FWTA 3A5FA 4RXFA 4FX6M 4LT9A 4Z1BA 5F2LA 2BTMA 4LS2A 4C1LA 1T8XA 4X3ZA 3FFSA 4CCDA 3LTPA 1KFBA 1OFEA 3YPIA 2EF9A 2RDUA 5AHFA 3RFAA 1NF0A 1R2RA 1DJNA 4XTIA 4O1DA 5DXXA 5KZMA 2ZZ4A 1A5SA 2VEIA 2NWRA 1QCWA 4M5PA 3USBA 1EWDA 3GVGA 1GVFA 3O63A 4WUIA 3UWWA 2Y7FA 2NXGA 2A21A 2YFNA 3BK0A 3P61A 2CZDA 1HTIA 1KM2A 3S0CA 5BNKA 2RH9A 2A6LA 3WK0A 2QUUA 5F2GA 1WYIA 4MJMA 1EIXA 1FWWA 1TPVA 1LRNA 3LGEA 2ZRXA 4IMCA 4PL2A 1EB3A 3TE9A 3RF9A 1LLZA 5EPDA 2FB3A 3IVSA 1K02A 4POCA 1XBVA 3EWXA 5AHLA 5EY5A 2IQTA 1TO3A 3PUEA 3GNNA 5F2IA 1OHLA 1YXYA 2FLIA 3B06A 3L65A 3TC7A 4AF0A 1Q3NA 4UFMA 1H7RA 3NQGA 4QSHA 1QPRA 2W79A 3DKJA 3S1XA 1Z44A 4IPIA 1GTHA 3EKZA 5BW6A 3LTSA 1VHCA 2H8XA 3W1RA 3FIGA 3QMSA 5D37A 1JJKA 4FHAA 1VRDA 4XWUA 3VE9A 3MHUA 5KITA 1PL9A 4K7VA 4N6EA 1AW2A 1B3OA 3LHWA 4O4WA 3MHGA 1OF8A 4PODA 3OBKA 1LORA 5C55A 2P0OA 1GYNA 4GUFA 1W3NA 4MYAA 1XL9A 2QCDA 1VYSX 3EKLA 3MWAA 5AYYA 2ALDA 5FF4A 3EX6A 2ZZ6A 5K4ZA 3ABRA 4O11A 1QOPA 1TPEA 4KWWA 2ZRYA 4XUGA 1W3TA 2A85A 1K8XA 4UTTC 5LNSA 1YDOA 3LCFA 3NQCA 3EWZA 1ML1A 2DZUA 4X9SA 3W74A 3KAOA 3Q2DA 5CPOA 4UMAA 5K9DA 1H5YA 1G7VA 2E1DA 4UFHA 3W9ZA 2X30A 3PBWA 4RZ4A 3PM6A 3TKFA 2R8WA 2RFGA 3P84A 2X1UA 3NNTA 1SZFA 4NJIA 4UTWA 4UUIA 3GX9A 1VZWA 1SQ7A 1VLIA 1W5PA 3CU2A 1XBZA 4Y90A 1U5JA 1OFOA 4AMAA 3LCGA 2DJXA 4EF9A 1O5KA 4NT0A 3RLVA 4JTEA 4TR9A 3UYCA 4O1AA 2I1OA 5BMXA 2C1HA 2Y70A 3GNDA 5CZSA 4GXMA 8TIMA 1T0OA 2PRLA 3ZWSA 3UPBA 4UFIA 2YSWA 4IOTA 3STEA 3VNDA 3W2MA 2TSYA 2V82A 1IXNA 3G1HA 3QW3A 4YXGA 2O7SA 1VCVA 1XDLA 4JYFA 4LV9A 1FCUA 2CLHA 3B0UX 1UUOA 4MKNA 1I2NA 1GYLA 1WDWA 2E5CA 4ML9A 3BG5A 3P62A 4GUHA 1YXCA 3B03A 3TAKA 4ZQPA 3HMJG 3M7WA 4BFAA 3G24A 4BWLC 5I3FA 2VELA 1ICSA 1GPWA 2TPSA 4Y8FA 2KZHA 4JTLA 4DF2A 3N19B 1NAL1 2BWGA 3CIXA 4Z08A 1LBFA 3SFKA 4JTSA 2CFFA 3DXIA 1HFBA 3LCIA 1PCWA 2DP3A 4LNYA 5D33A 2YPIA 3W2KA 4MY1A 2V9DA 3C8FA 2JGYA 1W3IA 1ME9A 4DO4A 3NA8A 3UWYA 4NNAA 5DLCA 3EWYA 4FB7A 1NEYA 5CPLA 4MZ8A 3UWUA 2AAMA 3MBDA 5K9XA 1EWEA 4JDBA 2FJKA 2GQAA 1KFJA 2Y7EA 1TV8A 1AK5A 4MUZA 3TJXA 1SW3A 4LS1A 5HWNA 1A5CA 5TIMA 3U6WA 1KBJA 5F4WA 3OVPA 4JX6A 2OJPA 2YCEA 2HTMA 3QSRA 2A0NA 4LV4A 4UNKA 1KM0A 3P74A 4FIRA 3O15A 2NUXA 1JUBA 3LV5A 1FWNA 3CT7A 3MMTA 1EUAA 4UXDA 4U4MA 1FDZA 1YPIA 1SUXA 1W0MA 3JS3A 4HNVA 1W54A 4IGHA 2DJLA 3B0PA 4WY0F 3SIZA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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