3BO9 | Genus

Total Genus 100

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	100
sequence length	314
structure length	314
Chain Sequence	HMTVRTRVTDLLEIEHPILMGGMAWAGTPTLAAAVSEAGGLGIIGSGAMKPDDLRKAISELRQKTDKPFGVNIILVSPWADDLVKVCIEEKVPVVTFGAGNPTKYIRELKENGTKVIPVVASDSLARMVERAGADAVIAEGMESGGHIGEVTTFVLVNKVSRSVNIPVIAAGGIADGRGMAAAFALGAEAVQMGTRFVASVESDVHPVYKEKIVKASIRDTVVTGAKLGHPARVLRTPFARKIQEMEFENPMQAEEMLVGSLRRAVVEGDLERGSFMVGQSAGLIDEIKPVKQIIEDILKEFKETVEKLRGYIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of putative nitroalkan dioxygenase (TM0800) from Thermotoga maritima at 2.71 A resolution rcsb
molecule keywords	Putative nitroalkan dioxygenase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Thermotoga maritima msb8
total genus	100
structure length	314
sequence length	314
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.1.9: Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH).
pdb deposition date	2007-12-17

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF03060	NMO	Nitronate monooxygenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3bo9A00

5AYYA 1FUYA 1S5VA 5HWMA 3TMQA 4JDYA 4RZ6A 2H90A 4Z1AA 2FLIA 4C1KA 1W3IA 1R47A 2A7PA 4IMEA 3STCA 3OBKA 5TQLA 5A8GA 1AL7A 3LV6A 3PM6A 3M5YA 3B8DA 1TPDA 2QUVA 5HINA 1HUVA 3F4WA 4ADSA 3BG3A 4UC5A 3FJLA 1W5PA 3PR2A 4S1FA 3W7CA 3PB0A 3TJLA 3L21A 3O6YX 1GT8A 1RQHA 1EUAA 4FNSA 3N9RA 1PVNA 2NV2A 3ABOA 4IQLA 4FNUA 1I2PA 1PCKA 2QJGA 1TJRA 1AW2A 1SSDA 1OF8A 4JX5A 3QPYA 1AG1O 3LHZA 4RZ4A 3W23A 1HO1A 1FX6A 1EIXA 3G0XA 1WDWA 4X3ZA 3W2UA 1P0NA 3H55A 2F7FA 5D33A 3EKLA 3MP3A 3NL2A 4TO8A 3GX9A 3PAJA 4QITA 2V2DA 2YYUA 4DF1A 3K30A 4JX6A 2J9XA 4UNKA 2FPVA 4UTUA 5BNKA 1TPH1 1I8JA 3I7QA 5DCEA 3O07A 4WZHA 2Q8ZA 2C1HA 1GWJA 1OYCA 3FKKA 3JRKA 3W2MA 1LOLA 3FFSA 1S5TA 1B4KA 2FQIA 3W2NA 1GVRA 2VC6A 3KX6A 3L68A 3GKFA 3IVSA 3NDOA 1SW3A 3G0UA 1DBTA 3TQKA 2R14A 1KW1A 1BKSA 4JEQA 3QM3A 4A29A 3A21A 4KWVA 3OHIA 3W87A 3G1XA 3KHJA 3W7QA 4IMFA 1KM1A 4UUIA 1TPEA 5D02A 3P8IA 3W1TA 1DVJA 3SSJA 1K7XA 4ZQOA 1NAL1 5HULA 3EWZA 3P82A 3MBFA 1KV8A 4RX0A 2ZA3A 1GVSA 1OHLA 3DFSA 3DKLA 2TPSA 2YSWA 3AJXA 1XI3A 2EHHA 2VELA 4JR5A 2Y7FA 1Y0EA 3LRKA 5KSWA 4XKYB 3MO7A 3W1XA 4PL2A 3O05A 1VCFA 3LTPA 2V30A 3W1PA 1K7FA 3L0KA 3W84A 3BG5A 3S1VA 2B7NA 3YPIA 5LGZA 1K7EA 4GUJA 1QWGA 4NX5A 3MHUA 2TRSA 1W1ZA 1NF7A 3F4NA 4XZ9A 2J27A 1FXQA 3FEMA 4Y6GA 3LV5A 3IEBA 4EWND 3CWOX 3MW7A 5D30A 1EP1A 2QDGA 4GUFA 4ORMA 2B4GA 1IXQA 4ICNA 5K2ZA 1H7RA 4JTEA 3GXNA 3CPRA 3W7MA 3S9YA 1VYRA 2I9EA 3MP4A 5AHEA 4IWWA 5F1UA 1M6JA 3P74A 1UCWA 1UB3A 4MYAA 1MEIA 4IMCA 1XBZA 3QFEA 3E02A 4JTSA 1CI1A 5HQEA 4HNNA 1BEUA 1MEHA 4S2CA 4KKXA 3NG3A 2W0UA 4N9CA 4FX8A 3NZ1A 3E9AA 4I9AA 1WXJA 2BXVA 2WSRA 3DFTA 4LS2A 3TV8A 4ZQRA 3U2OA 3G22A 2ZZ1A 3MMTA 1DORA 3QZEA 2XN1A 2E5CA 5EMUA 5FF2A 3T55A 5DBTA 2Z2UA 4O14A 1F76A 3NQAA 1YXDA 4OGZA 2DU2A 3KVJA 3NL3A 2X1TA 1RR2A 1EEPA 1B3OA 1VZWA 3THAA 2NX3A 2QDHA 5FF3A 3M5XA 4EVZA 3S0CA 3PUOA 3PG9A 1RVGA 1X1OA 3Q2DA 3S1UA 3G1VA 2PRHA 1PIIA 3M6YA 4XUGA 2VFFA 3TQVA 4UR7A 3NXFA 4O1BA 2ZRVA 2JGQA 3S5NA 3T4CA 3DZ1A 3T7VA 5G5IA 1OX4A 1H63A 3W83A 3O8AA 5LHFA 1TB3A 4LVAA 3G1DA 1XBVA 2G96A 4YL2A 3W76A 4BR1A 4OQVA 5IM51 4N6FA 2ZA1A 1SZGA 1XKYA 3A22A 4X2RA 4QNWA 1P0KA 3WK2A 4AB4A 4JYEA 3M16A 2ISSA 1SW0A 4DQWA 3A23A 4HPXA 4CCEA 2O7SA 4GUGA 2VFDA 4FNQA 3UZ5A 4OBTA 1VLWA 4WOZA 1ADOA 3LI0A 4JN6A 1FWWA 4AHQA 5H91A 1PE1A 2GQAA 3BO9A 2FIQA 4LVFA 1YPIA 3W1QA 2V8ZA 4BWLC 1AW1A 3W1MA 4MVAA 4WUIA 3H53A 1OJXA 5F4SA 1OFPA 3TR2A 4AWSA 1FWSA 2A0NA 4LWWA 2Y62A 3I68A 3M43A 4LNYA 3GIYA 2V81A 1R2SA 3O1NA 2CLMA 4JTUA 1S3HA 1LRNA 2DZWA 3W71A 3PWAA 3L5AA 1TSIA 4ORIA 1G69A 3HPZA 3SGUA 4JTIA 1VRDA 4JTGA 1F74A 2DORA 4JY8A 3C2VA 1H5YA 1TRIA 3A5FA 3C0JA 1GJPA 4RK8A 1Q6LA 4LW7A 3PBWA 3SIZA 3LCGA 3T78A 3W7NA 1JCNA 3MWAA 4ZZ9A 4U28A 1F05A 1OFRA 2CU0A 4L4MA 4CNPA 1QOPA 4IMDA 1B57A 1O4UA 1LLWA 3QSTA 3PY2A 2X1UA 1AMKA 4OHQA 2NXHA 1IXPA 3IRDA 3G8EA 3HG5A 1HTIA 2HS6A 3LB0A 2C0AA 4O50A 5F2GA 4QAIA 4JIQA 1OFQA 4Z1BA 3SZ8A 4GWEA 3C61A 1VJIA 3MHGA 1K8YA 2YW3A 4GE8A 4LC6A 4YMZA 3P8JA 3MJYA 4O19A 1SPQA 5I3IA 3LBMA 4NJGA 1FCQA 1DL3A 4P2VA 3FYOA 3CIXA 2R94A 2Y61A 3RMJA 2Z6IA 1TTJA 2CLEA 3GDKA 3RNDA 1EA0A 3GKAA 4CQ8A 4NT0A 1F7BA 5E1QA 1A50A 4FO4A 1QO5A 1I2QA 1W31A 2C13A 2QJHA 2C18A 5CZSA 1IXOA 2A7RA 1ML1A 2JBMA 2ZYFA 3BARA 1GPWA 3LRLA 1H7WA 3M41A 4DBDA 4DPPA 4RXFA 5TIMA 2QCFA 2X30A 3A24A 1FWRA 5L6UA 3TMLA 2J9ZA 4TR9A 5D04C 5HNRA 4JDBA 3IIPA 4Y9AA 3KVMA 2PE4A 2RDWA 3N3MA 4NNCA 1SFLA 3R89A 1OYAA 3NQDA 2OMAA 3OG3A 4DF2A 5DN1A 4UFLA 1TPUA 1YDNA 2E6YA 3A9IA 4A2SA 4IPJA 3T40A 3LGEA 3DFQA 3FJ6A 1JCXA 2ZRZA 4OV4A 3BVJA 4O10A 5CSSA 4E2BA 4YCOA 3IIXA 1FXPA 3GLCA 3TXZA 2HMCA 1PL9A 3V75A 2ZZ3A 4QJ1A 1TO3A 2B0MA 1SZEA 2A21A 4QISA 4MKNA 3W6YA 1ICQA 1ZENA 3LHVA 3OA3A 1TQXA 1YXCA 3EB2A 1VC4A 2FTPA 3RK8A 4E0CA 3LCFA 3BV4A 2GPTA 3DI1A 3STGA 1W5NA 3TFXA 1O94A 1KM4A 3BW4A 3EWYA 2FDSA 5KZDA 4JTKA 3NL6A 5D05A 3LCWA 3QW3A 1GG0A 3R2GA 3S1XA 3O16A 1HL2A 1MEWA 3UWYA 3EWXA 2RDUA 4CLMA 4K6AA 1SSGA 3HBLA 3U8GA 2E6FA 4DEFA 4POCA 2OX1A 1TPC1 3LXCA 4NXSA 3W2KA 4XBKA 1N8FA 3H54A 3W75A 4AHOA 4RR4A 4N9EA 3UWUA 4UTWA 1LOQA 4MJMA 3IVUA 1EB3A 6ALDA 2NXIA 4X9SA 1QNVA 1A5BA 2V9DA 3HG3A 1KTCA 5F2IA 4PC8A 1IGSA 3HG4A 1UBSA 3G1FA 3W70A 3M44A 5AN7A 1Z41A 5EY5A 3PUDA 4XWUA 1U5JA 5AHNA 1TMHA 4HPJA 4K39A 3NVTA 4HHPA 3V1PA 3IGSA 5F4WA 2Y89A 3SI9A 7TIMA 2A7NA 1TPFA 5E0KA 2R8WA 1DHPA 3TQ0A 2ZRXA 4MJZA 3G1AA 4ZQCA 5CG7A 2JKAA 5C2XA 3W2LA 3UD6A 1LTDA 3NM1A 3C3NA 4AWTA 1W37A 4IJBA 4HKPA 4NU7A 4HNUA 4E2DA 1GVQA 5K9CA 2BWGA 3R12A 1KFKA 2YR1A 3BGGA 4TMBA 2ABAA 1K02A 1KLZA 1T0OA 1JRBA 1WQ5A 4R53A 1TPWA 2X16A 1IF2A 2Y63A 4XQ6A 4AWUA 5CPLA 3WJXA 3G1YA 3NPVA 1IIGA 3WK3A 5A5WA 4O11A 6TIMA 2HSAA 1XBXA 4BI5A 1S5WA 4JTHA 4CNNA 2YFNA 2NUWA 3ATZA 4AAJA 3W7JA 4JYDA 3P60A 4RKAA 5HMSA 3UY8A 3C52A 4YLWA 1VHNA 4JTFA 2OZ0A 1CX9A 2W6RA 3TAOA 5CGQA 5AHLA 1OFDA 1R2RA 5L9FA 1BWLA 3HOJA 3W7HA 4ONVA 1Q3NA 1QR7A 3LLDA 3WJWA 5EBUA 4R7JA 1MZHA 3UZJA 5D38A 1FCBA 1A5CA 4D2JA 2GVJA 1LBFA 2WKJA 3HIJA 3NR0A 3ANYA 1JULA 1W8SA 1X6UA 5FI8A 3KXQA 3TE9A 3EWWA 3C2EA 1C8VA 4ZQPA 1SW7A 5AB3A 4O16A 2RKXA 4X22A 4L4LA 3PSVA 4EF9A 3HJZA 2TMDA 4UTKA 5TBOA 1ZHAA 1O5KA 3B0UX 1LLZA 4Y8FA 3USBA 3HGOA 4RLIA 3S42A 4XBSA 4HSOA 5K4ZA 2BLEA 3C2FA 1EWDA 3NO5A 4CQAA 3QYQA 4LRSA 3W7LA 1ME7A 2NLIA 4Z1CA 5EPDA 4IGHA 1D3GA 3OVRA 2WV8A 3N19B 3INPA 2VFGA 1EP3A 3W7GA 3NPUA 3PG8A 5D32A 5HJLA 3UXAA 2CLKA 3PVFA 5G4EA 3BLFA 5IBXC 1K8ZA 4GRSA 4M5PA 1OK4A 3WK1A 3G24A 3L9CA 3L65A 5H2ZA 3C8FA 1OFOA 2XN0A 2YGYA 2CLIA 1ONRA 1C9DA 2QCHA 2DZPA 5U7SA 1TV7A 4O54A 2Y88A 5C5YA 3HGRA 4K7VA 1DOSA 1PHWA 3LCLA 1TTQA 2H8ZA 3S8HA 5CZ0A 1W54A 4UCGA 1KTBA 5D09A 2PRMA 2CZDA 3LLFA 4R33A 4JIPA 1QPNA 1KFLA 1RQBA 2FB2A 4GUIA 4KWWA 4OV9A 3HB9A 5DLCA 4HNTA 2NXGA 1VLIA 3PB2A 4OU1A 1ME8A 4MZ1A 3QPZA 3W9ZA 1M7OA 3N34A 2JKPA 1UUOA 3LHUA 1F5ZA 2WO5A 5AC7A 3CB8A 3N2XA 3OEXA 3HMJG 4Q33A 4I7WA 4ZMGA 1FDJA 2UV8G 4FNRA 3S5YA 2QCMA 1OVDA 2ATMA 1YTEA 3O63A 2ZRYA 3ABSA 5D2XA 1PHQA 1G4PA 1WOBA 2WSQA 2A85A 4B5NA 1VYPX 1K3UA 3BLEA 1WOAA 1VGAA 1Z48A 1TQJA 3MI2A 5FESA 1LYXA 2YDAA 1Q45A 4JX4A 3TDFA 1TJPA 1LORA 1QCWA 4JTJA 5LNWA 4ADTA 3RLVA 1I4NA 3DFOA 4LRTA 3UY7A 2X1SA 1TYGA 2FFCA 1W3NA 4NVTA 1SO3A 3HF3A 3M1ZA 3KFTA 3UWZA 4DO4A 3ZWTA 3VFLA 4UTJA 3M7WA 3UWWA 5CZJA 3L5LA 4O17A 5CZTA 2CFFA 3LBCA 1QFEA 1TCDA 2FPTA 4IX0A 3P5YA 4MPQA 3G1SA 3R13A 3GAYA 1Q6OA 3AO0A 4M6PA 1Q6QA 1G6CA 3QJAA 4WD0A 3KVLA 5J5DA 5DELA 4AVFA 2ZTJA 4AH7A 3EWBX 4NQ1A 1I2OA 1WAUA 3JS3A 2CZEA 2W79A 4O15A 1JCLA 4HIBA 1BTMA 1TV5A 2QCEA 3GDMA 1G67A 1GEQA 3EXTA 3IIVA 3CLMA 3W1AA 1O5XA 4N2YA 3PBYA 3QH2A 4PTNA 1KLYA 4NJKA 1JVNA 4FIQA 4PFMA 4FNTA 5CPNA 1P5BA 3LRMA 3TC6A 5E93A 5MHBA 4IMGA 5G2WA 1UASA 5BRBA 3S5ZA 4M6QA 3WJYA 3MI3A 4A3UA 4CQ9A 1DJQA 3DU0A 2CW6A 4H4IA 1W5QA 5D03A 1JCYA 1TIMA 4O53A 5I3HA 4PA8A 4M19A 5FEXA 2C15A 1A5SA 3M5VA 1DV7A 4TU1A 4JGDA 2BSLA 1LDCA 3LXAA 2VKZG 4OE7A 4ZQNA 3ZR4A 4DBEA 3NZRA 2TYSA 1IIHA 3NA8A 5DXXA 2ZTKA 5K9XA 2P1FA 5FEWA 2VFIA 1EUNA 5CPMA 4UTTC 1W56A 3T44A 4EF8A 2WQPA 1TTIA 3EX4A 2V0TA 2VENA 1GOXA 2ZZ4A 2CZFA 2LLEA 3NYZA 3GNNA 3W7IA 3C2OA 4RXGA 2R91A 2C19A 1K03A 3FIGA 1YYAA 3MI6A 3QMRA 2OCZA 1O95A 3B03A 4IOTA 3W1NA 1NFBA 4N4QA 4JS3A 3GXPA 4J9JA 4JICA 1L2UA 2EGZA 2H6RA 1KM3A 1F73A 3VE9A 1XCFA 3M47A 1XM3A 2VEPA 2QCGA 5FF7A 2JK2A 4DXVA 3DBPA 3F1QA 2WSYA 5LNRA 4IUOA 3W72A 4CNOA 3W85A 3LCIA 2ZZ6A 5EYWA 1OFBA 1KTNA 4K8EA 4N9BA 4UIOA 3O6CA 1NVMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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