3BW2 | Genus

Total Genus 123

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	123
sequence length	350
structure length	347
Chain Sequence	SALTDLFPLPIVQAPMAGGVSVPQLAAAVCEAGGLGFLAAGYKTADGMYQEIKRLRGLTGRPFGVNVFMPQPELGAVEVYAHQLAGEAAWYETELGDPDGGRDDGYDAKLAVLLDDPVPVVSFHFGVPDREVIARLRRAGTLTLVTATTPEEARAVEAAGADAVIAQGVEAGGHQGTHRDSSEDDGAGIGLLSLLAQVREAVDIPVVAAGGIMRGGQIAAVLAAGADAAQLGTAFLATDESGAPGPHKRALTDPLFARTRLTRAFTGRPARSLVNRFLREHGPYAPAAYPDVHHLTSPLRKAAAKAGDAQGMALWAGQGHRMARELPAGRLVEVLAAELAEARTALS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure and site-directed mutagenesis of a nitroalkane oxidase from Streptomyces ansochromogenes pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-nitropropane dioxygenase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Streptomyces ansochromogenes
total genus	123
structure length	347
sequence length	350
ec nomenclature	ec 1.7.3.1: Nitroalkane oxidase.
pdb deposition date	2008-01-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF03060	NMO	Nitronate monooxygenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3bw2A00

3F03K 4NUWA 5G2HA 2YGYA 1BEUA 4N9BA 3LCHA 2YSWA 5CPNA 3KRUA 4ADSA 4BWLC 2FPYA 3OEXA 2QF7A 4O57A 4RXGA 2DZTA 3G24A 1NEYA 1PL9A 3KVLA 2HMCA 4MZ8A 3GDRA 3PUOA 3KHJA 1A5SA 3EKLA 4MFDA 3RK8A 1T96A 1Q6LA 2H3BA 3TXVA 3NGJA 3BW2A 3C4UA 1TYGA 3TV8A 3LX9A 2PE4A 4PTNA 3LCXA 3PS7A 2Z2UA 4LV9A 4UTWC 4DBEA 1JULA 1E51A 4NJJA 3NQ6A 3TC6A 4FNUA 1P4CA 4X3ZA 1EP1A 2YX0A 1FXQA 2WPBA 4UMAA 4EWND 1PV8A 4XUGA 2ZZ3A 1CI1A 3G22A 4RZ6A 3W7CA 4CQ8A 1U83A 4MLJA 1XBVA 2A21A 3DGRA 4JX4A 5LNUA 1YDVA 1YLVA 5HJLA 2HS6A 1EIXA 2CLFA 1OFRA 3UZ5A 5D2YA 4HHPA 2WOQA 4NZFA 4NJIA 3M9YA 1GEQA 3GDLA 2J24A 5C55A 4AAJA 2QCGA 5J5RA 3BG3A 1KTCA 2Y70A 3NPVA 4N02A 2PCQA 4LC6A 1IGSA 3R12A 5KINA 3LCFA 1W0MA 3G1DA 4J9JA 3SIZA 1OJXA 1KTBA 4H6KA 3G1FA 2Q8ZA 3TC7A 1UBSA 3L66A 1QOQA 1TPB1 1N55A 3L21A 5HUPA 3O1NA 1V7YA 3LGEA 4QNWA 5AHEA 3W7HA 4IMGA 4O17A 1PHWA 5L9FA 2NX3A 2QUTA 1KBIA 3N19B 2YW3A 2B7PA 3HGOA 1TQJA 1OFEA 3EX3A 3ZFHA 2BXVA 4NVTA 2YPIA 4ADTA 3G18A 2QAPA 3N2XA 4FF7A 2GQ9A 4LRSA 3M6YA 1C29A 1ME8A 2E5DA 2ABBA 5D30A 4CCEA 3TQKA 3GKFA 1OX4A 1XKYA 1UASA 2C3ZA 4HIBA 4CNNA 3QW4B 3B8DA 1A50A 1X1OA 1TV8A 1F5ZA 1TSIA 5K4ZA 3C0JA 4L4MA 3QMRA 1S5WA 2P0OA 3MP4A 4NXKA 5CG7A 4M7SA 5EYWA 4GUIA 3CM4A 4ZQOA 4OQVA 2V81A 2CLOA 4O19A 5FESA 3P60A 3LLFA 4JIQA 1O60A 1YXYA 3HGSA 4UMBA 4H3DA 1EP2A 4O16A 1K7EA 1SSGA 3DU0A 2V8ZA 3E9AA 4UFKA 2GVGA 3EKZA 4ZMGA 3UXAA 3WK3A 4ZQPA 4K39A 3NQ2A 3TUUA 5FF3A 3BLFA 1BWLA 2I14A 5EMUA 3CQ0A 1OABA 5KSWA 4Z1BA 1JUBA 2ZDRA 3QSRA 4DBDA 4NT0A 4JGDA 5AFDA 5EPDA 4M19A 5CZSA 2B4GA 5I3JA 5BW6A 5AHFA 1YTDA 1QAPA 3QQ0A 4E38A 2EAWA 1PVNA 1EX5A 1GYNA 1W5MA 1FWNA 1H61A 1B57A 3DBPA 3W7PA 4M5PA 3UXDA 2ALDA 1L6SA 4Y96A 1KM4A 4O4WA 5HINA 5D02A 5HWMA 4HNUA 1KA9F 1V5XA 4CQAA 5DN1A 2H8XA 2C14A 3IGXA 1SQ7A 1AW1A 4XKYA 1H7XA 4AB4A 2Y7DA 1TV5A 3L0NA 3SFKA 2I9EA 3W6YA 4R53A 3O63A 3E0IA 5LNRA 3HQ1A 1TPDA 3STCA 2X1TA 5CPMA 1QPRA 4O4VA 4AHOA 1H62A 4N4PA 1TTQA 2BTMA 1KFEA 3W88A 5U7SA 3WK2A 3N34A 1BTMA 1SW7A 2QCEA 3GYEA 1RR2A 2FLIA 3D0CA 1M7PA 3TKFA 1DORA 1THFD 4IX2A 3DFPA 4JTKA 1G67A 3W83A 1M7OA 3EX2A 3O07A 4GWEA 3LRMA 4Y90A 4PCFA 4UXDA 3P5ZA 3RMJA 1QR7A 1IF2A 2BZNA 1JRBA 1W5NA 5HNRA 3C56A 1Z44A 4FX6M 4FNRA 4WY0F 5DBUA 1G4TA 3MYOA 1JVNA 1OF6A 3GDKA 2OMAA 5HWNA 1YPFA 3MHUA 4HPXA 4UR7A 3W07A 3TCEA 3LTPA 1LRNA 5DCBA 2HS8A 3IGUA 2A2IA 1XDMA 3ZWSA 4LTSA 4FXSA 2ISVA 2CZ5A 2GJLA 3NQ7A 3EX4A 4JDBA 2CLMA 3CT7A 4N9EA 1TCDA 3S6DA 4YCPA 3NDOA 4JN6A 4IGHA 1HL2A 3EWYA 4BR1A 4FB7A 3V1PA 4AWUA 4JX5A 2B7NA 1QDSA 4AF0A 3CLMA 4UR8A 1O95A 3WK1A 1O5KA 2ZFAA 3A23A 3BVJA 2ZCGA 4YMZA 2J9ZA 1JCXA 4WOZA 2FPVA 3LXBA 2TPSA 1H7WA 2VFIA 3N14A 2QJIA 5C54A 5HMSA 3Q58A 2JBMA 1ZAJA 5T26A 1MEIA 2CW6A 2QUVA 1OX5A 2DZXA 3S5OA 3P81A 4UFMA 3G8EA 1QWGA 3NZRA 3GXTA 3DENA 2C1HA 1KFBA 1GQNA 3TE9A 1XBZA 1TPH1 2TRSA 1XFBA 3GDMA 1ONRA 2QCDA 1WA3A 4FNQA 3TW6A 4N6FA 4QAIA 1TTJA 4BFAA 3A24A 1NF0A 2RFGA 5E1QA 4GBUA 4C1KA 1R46A 3C2VA 4IWWA 1JR1A 4O1BA 5LSMA 1DQWA 3FJLA 1LBFA 3S1XA 1CX9A 2F7FA 2QCHA 2C15A 1VR6A 3HMJG 2A6LA 1BWKA 5EBUA 2CLIA 2E68A 2ZRXA 4AWSA 2E09A 2Z6JA 2NV2A 3W75A 2OJPA 1OYAA 5AC8A 4Y8FA 3TFCA 3N73A 3MJYA 4JYEA 4JTSA 3QQ1A 3O6YX 1H5YA 5LNWA 1LLWA 3MBDA 3S42A 3ABSA 4AEOA 3IVTA 3N2MA 4K6AA 4UFHA 1JCNA 3M0ZA 4EF8A 2E5CA 4GC4A 1NVMA 5KTLA 2FB3A 1HUVA 5I3KA 3W87A 1SU5A 2FJKA 1X7FA 3M5XA 5E0KA 1TJPA 2FFCA 2HSAA 1A5BA 5G2WA 3VFLA 2X2GA 4EF9A 1VHNA 3PWAA 5AB3A 1NF7A 5TIMA 1Q6QA 1WBHA 2W6RA 5KITA 3C2FA 4DEFA 3GX9A 1GT8A 1LYXA 1TMHA 4GXMA 5LKYA 4GUGA 3BV4A 1FCBA 1EB3A 4IX0A 1UUMA 5LGXA 2J9YA 4UC5A 3SI9A 3IEBA 4IPIA 5HUOA 3PB0A 4QIUA 3G0SA 5D05A 3QRHA 3LDVA 3VI2A 2NX1A 3TX9A 3L0KA 4FIRA 3BG5A 1LRTA 5G5IA 1A5AA 2WJZA 2BX7A 2ZTJA 2NUWA 4JTHA 2G95A 3VE7A 1EA0A 3W1QA 4OT7A 2ZRUA 3I7RA 1EUNA 3VCRA 3WK0A 3PBUA 3PVFA 3M16A 1M5WA 1G6CA 1KTNA 2A0NA 1EWDA 4O8RA 3C2RA 3G1VA 3WJWA 2O7QA 4K36A 1F76A 4JEQA 3FS2A 4Z0JA 1X1ZA 1SPQA 4UFIA 3E12A 3ANYA 4WUIA 5AN7A 1ZFJA 2CLEA 4FEZA 3TR2A 3BW4A 5I3HA 4LT9A 4RK8A 4GNJA 4UTJA 4KKXA 5DY2A 1TB3A 4TIMA 3W22A 3JRKA 4ZVJA 3SECA 3HB9A 1KM3A 4DF1A 2PURA 4KWWA 3KX6A 4JTGA 4TO8A 2FQIA 3LOTA 2V5LA 3U6WA 3FYPA 4ADUA 5D2TA 3DFNA 2G96A 1PCWA 2DJLA 3PY2A 4LVGA 2ZYFA 3E49A 3QM3A 1P0KA 1EWEA 4IPJA 3TH6A 4HNNA 4OV9A 1OFDA 1TPEA 2AAMA 4R34A 4MYAA 1L6YA 4X22A 1R30A 1Z41A 3L67A 3M41A 2W79A 2DZUA 1OF8A 4JTTA 3P5YA 6ALDA 1ME9A 4JYDA 4XKYB 5BMWA 3W2UA 4IMCA 5FEWA 4M6QA 4NJGA 1J2WA 3T55A 2E5BA 3HPXA 3G0XA 3OA3A 4HKPA 2CZDA 4JY9A 5HULA 3FJ6A 2X16A 2DORA 1VPXA 1T99A 1H50A 4GUJA 4O15A 1PHQA 4FNSA 4AVFA 1ICQA 5D38A 1MXSA 1QO5A 3I7QA 3AO0A 3LERA 4G1KA 3CC1A 2GVJA 2Y7EA 2VFDA 2PC4A 5G4EA 3LLDA 1AW2A 2JGYA 1GWJA 4ZZ9A 4K7VA 3G1SA 1TREA 4UTLA 2E77A 4Z0SA 5G1YA 3QEZA 4JTEA 3IIOA 4WY0B 4Y6GA 2VEPA 2A4AA 2BWGA 3U8GA 4DXVA 1H7PA 1WX0A 1XUZA 2FTPA 1OFBA 2Y85A 3R13A 4IMEA 3RU6A 4GE8A 3RNDA 2F84A 3NQ8A 1IIHA 5K9CA 2WNQA 2JKEA 2X1RA 3NQAA 4IMDA 5TQLA 3RLUA 3TSDA 1IXPA 1GJPA 5DBTA 3T40A 4LU0A 3KVJA 3OVRA 4RX0A 3KVMA 1I2RA 4A21A 3G0UA 4MUZA 3T78A 1G4SA 1ZHAA 5AHMA 1DVJA 4IXHA 1PE1A 5GVJA 1MEHA 3STFA 1DJQA 2A1YA 2QJHA 2QCFA 2YFNA 3KAOA 3DHFA 3NOEA 3MYPA 3ABOA 4AHPA 1DKWA 3PF3A 4WD0A 4ONVA 1SO5A 3SR7A 5G1TA 1LDCA 3BGGA 4A2RA 4XBSA 2QDGA 3B05A 4GJ1A 3BPWA 5D2XA 2YFOA 2XFWA 2I1OA 1YYAA 4AHQA 3JS3A 3W1RA 3KFTA 1EEPA 2CLKA 1ZNNA 3W2JA 3KOFA 1D3GA 3FEMA 1W3NA 1VRDA 2DZWA 1SO3A 4MJZA 4OU1A 3W1UA 1S5VA 3R8RA 4Z1CA 3SSJA 4IMFA 5F2MA 1LOSA 3W7QA 3HO8A 2P1FA 5IBXA 1I2OA 3UWYA 3QSTA 4DO5A 1DQXA 3G3DA 5K7JA 2B7QA 2H3DA 3CU2A 2QCNA 2W0UA 2RDWA 5C6MA 2FPTA 2O7SA 3TJLA 3CB8A 1FXPA 3O8AA 1H7OA 1GTEA 4NJKA 1RD5A 4JS3A 3W7DA 1H63A 3PUDA 4MVAA 1JRCA 4E2BA 5KMYA 3HOJA 1ZAHA 3I65A 3BW3A 5CGQA 3NQFA 1JUEA 3QYQA 3A21A 4FIQA 4MPQA 4P61A 3LTYA 3F4NA 1XCFA 3EXSA 2C16A 4LS2A 4UTMA 5BMXA 1TTIA 2ZRWA 4Z08A 2YDAA 2NXHA 3IIXA 4RJEA 3TW7A 4DO6A 4AMAA 1VCVA 3ZR4A 2UV8G 2A7NA 3LRLA 1JCMP 2R14A 5FI8A 4JTUA 4UFJA 3DKLA 5EY5A 1I4NA 1W5QA 4NXSA 1Z48A 4RCXA 2Q3RA 2WO5A 2GQ8A 2ZA2A 3STEA 2E6DA 1L9WA 3LV5A 2PRMA 4TU1A 4DQWA 4O14A 5FEPA 5IBXC 4JTJA 3MW7A 1G4EA 4MFEA 1VCFA 1VLWA 4N4QA 2NV1A 4NNCA 4HNTA 1WBJA 5K4XA 3INPA 3ABRA 3CWNA 4JDYA 4K38A 5BRBA 4O52A 5F4WA 3M5ZA 4XWUA 4O0ZA 4O1DA 5FF7A 2EKCA 2ZZ2A 3C8FA 1Q3NA 2GUUA 2DJXA 1K7FA 3TQ0A 4KWVA 5FF2A 1GPWA 5DY3A 1GG1A 1NSJA 3QMSA 3NPXA 3EXRA 3W71A 1MEWA 5K9DA 1XDLA 3HPSA 3W85A 3DFQA 3W1LA 1J5TA 1WV2A 1GVSA 1KM2A 2ZZ4A 3VKJA 2HTMA 2J9XA 3BLEA 3PG8A 3AJXA 2ISWA 3E96A 3RFAA 5U4NA 4E0CA 1DOSA 3ZWTA 3PULA 4JTIA 5D09A 3W7OA 5I3GA 1EPXA 1YXDA 1LOLA 3UQNA 1QCWA 1OVDA 1VS1A 5AHNA 2Y7FA 1FDJA 4E2DA 4ML9A 2AQWA 1PIIA 3PBYA 2X1UA 4UFLA 3W2LA 1SFLA 1KLYA 4RZ5A 4FNTA 1VZWA 3RLVA 3Q2DA 2QKFA 3PC0A 2P10A 3SGUA 1LORA 3G8RA 3HIJA 4PC8A 1FWRA 3TAOA 1K03A 1FUYA 3M5VA 1TJRA 3W2MA 3GNDA 2GQAA 4HSOA 5AOUA 2WNNA 3C6CA 1ZJIA 1PS9A 3M43A 3TJXA 3W7LA 2KZHA 3P74A 4I7WA 4ALDA 3GNNA 2Z1BA 1FBAA 3EB2A 4LUJA 2ATMA 4JR5A 2NWSA 5AHLA 1GOXA 3W3OA 4K8EA 4CCCA 5CSSA 2VXNA 3C3NA 5DXXA 3W70A 2J88A 4P2VA 3Q37A 1M6JA 3ZS4A 3W86A 1OX6A 4NX5A 2TSYA 3UPWA 4S1FA 3W1AA 1H1ZA 3I68A 4DPPA 3GB6A 4QJ1A 1SW3A 3NNTA 3IIVA 3PAJA 1J4EA 2ISSA 5AYYA 1WQ5A 1GYLA 4CNPA 2WNZA 2R94A 2NUXA 2ZRVA 1F6KA 1LOQA 1JCLA 1S3HA 4S2BA 1AW5A 3LBCA 4OWGA 1VH7A 4O0KA 3EEGA 4O18A 5CKSA 3ABQA 1O94A 7TIMA 2XN1A 1TPC1 3IRDA 4WOQA 3EWZA 3NQVA 5H91A 5F4SA 2WV8A 3N3MA 4UMCA 1XC4A 5HR7A 3NL3A 3P82A 1TRIA 3MI3A 4XZ9A 4M6PA 1WDWA 4MY9A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3BW2A

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