3BW4A

Crystal structures and site-directed mutagenesis study of nitroalkane oxidase from streptomyces ansochromogenes
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
350
structure length
347
Chain Sequence
SALTDLFPLPIVQAPMAGGVSVPQLAAAVCEAGGLGFLAAGYKTADGMYQEIKRLRGLTGRPFGVNVFMPQPELGAVEVYAHQLAGEAAWYETELGDPDGGRDDGYDAKLAVLLDDPVPVVSFHFGVPDREVIARLRRAGTLTLVTATTPEEARAVEAAGADAVIAQGVEAGGHQGTHRDSSEDDGAGIGLLSLLAQVREAVDIPVVAAGGIMRGGQIAAVLAAGADAAQLGTAFLATDESGAPGPHKRALTDPLFARTRLTRAFTGRPARSLVNRFLREHGPYAPAAYPDVHHLTSPLRKAAAKAGDAQGMALYAGQGHRMARELPAGRLVEVLAAELAEARTALS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and site-directed mutagenesis study of nitroalkane oxidase from Streptomyces ansochromogenes
rcsb
molecule keywords 2-nitropropane dioxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Streptomyces ansochromogenes
total genus 128
structure length 347
sequence length 350
ec nomenclature ec 1.7.3.1: Nitroalkane oxidase.
pdb deposition date 2008-01-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03060 NMO Nitronate monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3bw4A00
3QC3A 2WO5A 1KM2A 4K7VA 3MI3A 3KRUA 5EKYA 5DLCA 3CIXA 1VZWA 4FIQA 4N9DA 5CSSA 3DFOA 4AXKA 3L21A 3SFKA 3PULA 4UTUA 1DORA 3UXDA 1W54A 1GYLA 3KOFA 2WNZA 1KTBA 3I65A 5G4WA 4XKYB 1I45A 3SJ3A 1KTNA 2ZDRA 3B0PA 3CB8A 4LV9A 4U28A 2TYSA 1H7OA 1YADA 2FFCA 5U7SA 4UTHA 1H7NA 1ME9A 3EKLA 2J9XA 1G67A 3LTSA 3H53A 4UTTA 3DENA 3TV8A 2ZZ1A 4XTIA 4IMFA 1G4PA 1M7PA 1TPC1 5F2MA 4ZQOA 4TMBA 4OV4A 2ISSA 3PSVA 1B57A 3W2UA 3FOKA 1JQXA 2V2CA 3GDMA 3CPRA 1SUXA 5KZDA 3G18A 3OVPA 4JX6A 3U6WA 1YTKA 2JGQA 3EXTA 3QW3A 4FXSA 4FNRA 4EF8A 1ZNNA 5CGQA 2NUXA 1TTIA 5G5IA 2YFOA 4UFKA 4ZQPA 4M19A 2GQ8A 1VYRA 1KFBA 5EA9A 4LC6A 4DO6A 3W84A 3W72A 2A85A 3LHUA 3SW6A 4PCFA 3M5XA 1OF6A 1FCUA 3DI0A 2J6XA 1XXXA 4XBKA 4ZVJA 1N7KA 2YR1A 1O94A 1A50A 4LC8A 2ZYFA 3NVTA 2C19A 4Y90A 2GJNA 4OBTA 3S0CA 4WZHA 1VCVA 3LCLA 3ABQA 3B4UA 2WPBA 1OFOA 3B06A 1I2PA 3I68A 3G3MA 4K37A 3E02A 3SY5A 3TSBA 3L68A 1F6PA 2WKJA 4R7JA 5DCBA 3LV5A 2HS6A 1SW7A 3LBMA 4LRTA 3EX6A 3HF3A 1VC4A 5EBUA 2IQTA 1R47A 4NNAA 2W0UA 4JTJA 1VS1A 1JVNA 1QMLA 3BV4A 4A2SA 4UTTC 2E6FA 2DJXA 1GTEA 1WOAA 4QJ1A 3BG5A 1DV7A 4UR8A 2CZFA 4OE7A 3NEVA 3C2EA 3P81A 2C1HA 3NQCA 3L65A 1DQWA 5D32A 3WJZA 4M5PA 1MEHA 2QKFA 3NQDA 5CG7A 4OQVA 1L6YA 3FS2A 1D3GA 5HNRA 1JULA 1THFD 2NV1A 3BPWA 2G95A 2QDHA 5LNUA 1GG0A 1H7PA 3P8IA 4LWWA 1BKSA 4ORIA 2D73A 4N9EA 3TXVA 1K3UA 3VE7A 4CQ8A 2X1RA 1OFBA 2V9DA 3H55A 5D2XA 3DKLA 3TNOA 3C2OA 3G1DA 5AFDA 1I2NA 3PBUA 2DU2A 3TFCA 4Z08A 5BRBA 2PCQA 4A2RA 3E0IA 4NX0A 4AHOA 3P80A 3EB2A 5FI8A 3TXZA 3HG2A 3P8JA 4QQ3A 1CX9A 2BLEA 1I2RA 1LZOA 4H3DA 5K9CA 3O6YX 5G1TA 2PRLA 3QPZA 2C13A 1WAUA 2NUYA 2E77A 1O60A 3W7QA 4PL2A 4LT9A 4MZYA 5LNWA 1GEQA 1JQVA 2QCDA 1GTHA 4AH7A 2J24A 3BGGA 3I7QA 1YLVA 1G4EA 3EX2A 2X2GA 2XN2A 5IBXA 5AHIA 5HWNA 4P2VA 1FWWA 4UTWA 5HUPA 3DHFA 1R2SA 4O10A 1OYBA 2CLHA 3NPUA 3GX9A 2QAPA 3C61A 4GUIA 5I3KA 4ZZ9A 5I3JA 4JR5A 3LERA 2RH9A 3T40A 5HUOA 1R30A 3L67A 4M7SA 4RR4A 1JRCA 3MO7A 4O28A 3KVMA 4JTEA 4Y96A 2ZZ3A 2Q3OA 1OK4A 3B05A 4UR7A 1W3TA 3NQAA 2X30A 2EGZA 1ZY9A 2NZLA 3GDKA 3OVRA 3MYPA 5CSRA 1TV7A 4PL1A 3QPYA 4O54A 3UPBA 5AHEA 1SFLA 3BW2A 1F6KA 1K03A 4BF9A 1P5BA 2AGKA 1SZFA 1GVOA 4OV9A 3DAQA 5D30A 4NU7A 3W7PA 1XUZA 5FEZA 1SU5A 4FNPA 5CZ0A 4Y8FA 3W71A 1VCGA 5AC7A 3G1XA 4YWIA 4UNKA 2QCNA 1NEYA 3LRKA 3TSMA 1QPNA 1FWSA 3ANYA 3DFPA 1LLWA 1J4EA 3OG3A 4TO8A 1RZMA 4MLRA 3RFAA 1K02A 1XKYA 3CLMA 4RCXA 4ZQRA 4PFMA 5D04C 2GUUA 3ZWSA 2DZPA 2A6LA 1GVQA 1WX0A 3G8EA 3LXCA 1OFQA 1WA3A 1VLWA 5IBXC 1RQBA 3TROA 4LU0A 4UTWC 4QSHA 3S42A 1XCFA 4O1DA 2LLEA 3IIZA 4H4IA 3FA5A 1PL9A 4MOZA 3QZEA 3O6CA 1OHLA 2WV8A 3K30A 5F2LA 4O52A 1QNVA 1OFEA 4G1KA 3PWAA 4JN6A 1ZENA 5ABTA 1XBVA 1DHPA 5LGZA 1I2QA 3PUOA 2J9ZA 1M7OA 1RV8A 3DH7A 4ORMA 3G3DA 2ATSA 3IEBA 4R33A 4TU1A 1YDNA 3T44A 2NV2A 3KXQA 1ICPA 4O19A 4X2RA 3U2OA 1KFJA 3PUEA 5C54A 3W1TA 3GK0A 1N55A 3QH2A 4RZ5A 4JNMA 3LCFA 2X16A 3KRSA 1F73A 3G1SA 5I3GA 1FWTA 1SO6A 3EXSA 1OFDA 4WJEA 5AC8A 3W7MA 1VYPX 2TPSA 3WK2A 2ISVA 3LHZA 3O05A 2Q8LA 1KM0A 3KHJA 3O8AA 1UB3A 2BZNA 1TSIA 2ABAA 4HNTA 4UFLA 3L0NA 4U4MA 3ZWTA 3W7IA 2C18A 1TPH1 2VELA 3GR8A 3C56A 3T55A 1HL2A 1FWNA 2WJZA 3A5VA 3UWUA 1PHQA 1JRBA 2QCMA 4UMAA 2R94A 4MY9A 2V8ZA 4JTKA 3TK7A 4R34A 2DORA 2NX1A 3W6YA 3M16A 1KTCA 2P10A 4ONVA 4NT0A 2C15A 3CC1A 1MSSA 3UQNA 2G97A 1KLYA 1SZNA 4M6QA 3GXPA 3MHUA 2B4GA 4N6FA 2YSWA 2QUVA 3V1PA 4CNOA 3BO9A 3NQVA 4O57A 2FB3A 1M6JA 3UZ5A 3WJSA 2JGYA 4FIRA 5LNVA 3S1UA 3UY8A 3PY2A 1TPB1 3NGJA 3ABOA 3QQ1A 3EWWA 2BX7A 4X22A 1TIMA 4UFIA 3MP5A 2CZEA 3F1QA 1YXYA 2J9YA 4AVFA 3C6CA 2ISWA 2ZA3A 1EP3A 2Y63A 1ZFJA 3NM3A 4JYDA 5F4WA 2GVGA 2NWRA 4I9AA 3W1NA 3UNDA 3NQ7A 3C0JA 5KZMA 1TQXA 4JYFA 5AHMA 1MZHA 1PCWA 1ZAJA 5K7JA 3VKJA 3LM7A 3LCHA 3QM3A 3ATYA 1KFKA 4WY0A 1F7BA 1KV5A 1Q6OA 5J5RA 3CHVA 4UFMA 3W74A 2O7QA 4AMAA 1HO4A 3HIJA 4MFEA 1FUYA 3TU9A 2A0NA 4K8EA 3NPXA 5LHFA 3C8FA 3PS7A 5LKYA 3EKZA 1Z44A 1NF7A 3NAVA 1KBIA 5KITA 3TA6A 4Q32A 4BI5A 1MEIA 1R46A 1H7RA 3HPZA 2Y88A 3L2IA 6TIMA 3E96A 4LW7A 4O1CA 1VJIA 5K9XA 1VHNA 1K7FA 1ME8A 3BLEA 3L5LA 2A5HA 2DJLA 3NPVA 3CIWA 4GUFA 1W3IA 1Q45A 2VC6A 3MYOA 4N2YA 1W5QA 4FNTA 1TTQA 1H1YA 2XFWA 3C2FA 2OCZA 3B03A 4CCCA 4X3ZA 4FX8A 3GNNA 2CW6A 3QW4B 4YL2A 3RLUA 2ZRYA 4A22A 3C2RA 2YW4A 5H91A 2E68A 2Y70A 2UV8G 4GXMA 3GLCA 1Q6LA 2QDGA 2ZZ6A 2GVLA 5KTLA 4N4QA 2PRHA 1TPVA 2YGYA 4N9CA 3O6DA 3QQ0A 4I7WA 3BG9A 3O15A 5CZSA 4POCA 1LORA 3G0UA 1LTDA 3E9AA 1OFRA 4AHQA 1PE1A 4E0CA 1WDWA 4CCDA 2C0AA 1I8JA 4Z1AA 2BXVA 1KBJA 1KM6A 4DBEA 2FTPA 5AYYA 3P67A 5DXXA 4OWGA 4WUIA 3FIGA 1D9EA 1L2UA 4UTKA 3IGXA 1JCJA 4A3UA 4BK9A 4K38A 4OU1A 3MP3A 1HTIA 4GUJA 3ATZA 2ZCGA 2G96A 3TSDA 4O4VA 1AW2A 2Z2UA 2QCHA 3Q94A 3A21A 3NA8A 5K2ZA 4LVGA 4LTSA 4NX5A 4AHPA 2PE4A 4FNSA 4Z1BA 1S5WA 5AYXA 3M6YA 3UWQA 3I6RA 3BARA 3M5ZA 2WSRA 3JS3A 3TAKA 4RV8A 3T78A 1IIHA 4HHPA 3TH6A 1S5TA 5CPOA 1OFPA 2DZUA 1K8YA 2FJKA 2A7RA 3W7KA 3PM6A 5BMWA 3DKJA 3DFQA 2QEZA 1X6UA 5AOUA 3KVKA 5HR6A 1WYIA 3BK0A 3P74A 5C6MA 1EB3A 3MUXA 3I7SA 4LOCA 1JUBA 1TRDA 1HG3A 3SSJA 4GJ1A 3UWWA 2ZZ5A 1WQ5A 1QOPA 1XBYA 5D02A 1O4UA 3W83A 3SECA 2YZRA 4JTUA 2ZZ2A 5HULA 1GYNA 3MWAA 3S5OA 3QFEA 2FQIA 2YW3A 1PCKA 4LVAA 5C55A 2CLOA 3UZJA 4HPXA 4XKYA 3TQKA 3L0GA 3BGJA 1GZGA 1TPDA 3GDRA 3W75A 5G4EA 3M41A 5LGXA 1VPXA 2ZQ0A 4MVAA 3N34A 4DELA 1QAPA 3PC0A 3NQ8A 1QR7A 1V7YA 1TCDA 1IXQA 4K6AA 5F2IA 5A8GA 3GXTA 1C8VA 1LRQA 3LLDA 3LLFA 2B0MA 3W1QA 5HR7A 4I7UA 5FESA 4MLJA 1TTPA 4FB7A 3S1WA 1O95A 1RD5A 2Z6IA 3IIVA 3FKKA 1XDMA 3NQEA 3G0SA 1SO3A 2RKXA 4MZ8A 4L4MA 5F4XA 4DF2A 3MBFA 2NUWA 4FX7A 1TJRA 3LRLA 3GKAA 4IGHA 1TREA 4MYAA 3S1XA 4S2CA 1IGSA 3RF9A 4FO4A 3LBCA 3PR2A 2QCLA 1JCLA 2DZVA 3EWXA 3S8HA 4RXGA 3I7RA 4EF9A 1JCYA 3KFTA 4GWEA 2TSYA 3WK0A 3WJWA 4C1KA 2AAMA 3IVTA 1VGAA 1AMKA 4O53A 2W79A 5J5DA 1TPEA 2CLEA 1RQHA 4O17A 2FIQA 3L66A 4JDYA 3W2MA 1FDZA 4KFNA 1LM1A 3HGRA 3W3OA 1H60A 1B9BA 4TMCA 3FYPA 3N2MA 3SGUA 3S1VA 1K7EA 2YXGA 3W22A 1Z48A 3ZFHA 1KFLA 1G6CA 2OZ0A 4IXHA 1X8FA 3DGRA 1QPQA 4IPJA 2ZRWA 2H6RA 3CWNA 1IXPA 3SR7A 1KA9F 2V5LA 1LROA 2HTMA 4O1AA 2DZWA 1EWEA 3STFA 5F4SA 5TQLA 4UFHA 3WFAA 4LVBA 3TW6A 4D2JA 4UTMA 1O5KA 1NF0A 3NR0A 4IMGA 5AHNA 1OJXA 3NO5A 1OG0A 4GC4A 2VEPA 4WQ6A 3L0KA 4KFOA 2VEMA 3O16A 4LS1A 2DZSA 5G2HA 3R2GA 4P61A 4R53A 3RU6A 3UXAA 1DQXA 3NXFA 4O12A 3HJZA 2PC4A 1FCBA 5K4ZA 1WOBA 2NXGA 1L6SA 4HT3A 2CLFA 3BVJA 4O15A 1A5AA 4TX9A 4N4PA 3PBVA 3P82A 4OHQA 1H62A 3UYCA 2CU0A 1ME7A 2XN1A 5D05A 3LCWA 4BR1A 4RXFA 3PSWA 1OYAA 1DKWA 2YPIA 4XTDA 3NPWA 1IF2A 1YPFA 5H2ZA 2B7NA 3KX6A 4PA8A 3N9RA 3JR2A 3KAOA 4L4LA 4HSOA 3GDTA 4ML9A 2A21A 3PVFA 2GQAA 5HJLA 3W1RA 1BWKA 4FNQA 5D38A 1SW3A 4YLWA 3DXIA 3R13A 4JTLA 1T8XA 2Z6JA 4MKNA 5CPLA 3FLUA 2TRSA 4AWSA 3GNDA 4UTIA 4MUZA 4O4WA 5FEXA 5E0KA 4MY8A 3W9ZA 4YCPA 4IJBA 3IIPA 3TJLA 1EEPA 3G1VA 1SZEA 2Y62A 4WY0F 1YTEA 3WK3A 2I14A 5LZLA 3M9YA 1XBXA 2CFFA 4WXYA 1LOLA 2VEKA 3OHIA 4Q4KA 5LHEA 2NXHA 2OJPA 2V30A 1OX4B 5HINA 1B4EA 4NJIA 4JY9A 3IVSA 3CU2A 4LY8A 4DPQA 4I7VA 1XC4A 2RHGA 5HWMA 1JUEA 1X1ZA 1A5CA 2A7PA 1VHCA 4XWUA 5MHBA 4MYXA 4QITA 3W7EA 4O50A 5G2IA 1JCNA 1OYCA 4HN4A 1E51A 2DP3A 3WK1A 5K9DA 5U4NA 2I9EA 4M6VA 4QISA 3GVGA 3DFSA 2QCFA 3GIYA 3LI0A 4CNPA 3BW4A 3SI9A 3UY7A 3S9YA 3QSTA 5AHFA 4N02A 1DL3A 1YTDA 4NVTA 1LBFA 3TCEA 3LHYA 5K4XA 1OF8A 4KKXA 1A5SA 1SSDA 1QOQA 3S5NA 4Z1CA 5F1UA 4QNEA 3QEZA 1CW2A 3VE9A 3SGZA 4MFDA 3TQVA 1EA0A 1MO0A 3W7GA 3LOTA 4JX5A 4ADTA 1LCOA 1JCMP 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 4GUH A;  5FF0 A;  1SPQ A;  3N19 B;  2DZT A;  4MY1 A;  4NJH A;  1NFB A;  3EXR A;  3QMT A;  4E38 A;  4LVD A;  1GOX A;  1ADO A;  3NQG A;  5D33 A;  3TKF A;  3GR7 A;  2J88 A;  3DI1 A;  3EX3 A;  7TIM A;  3TML A;  3D0C A;  2G5W A;  4LS0 A;  4EOU A;  1KM5 A;  3ZS4 A;  3JRK A;  4JX4 A;  4Y9A A;  1KV8 A;  5I3H A;  4PTN A;  3DHD A;  3G8R A;  3BG3 A;  4AEO A;  3LTY A;  1R2T A;  1XL9 A;  4IMC A;  1U83 A;  4CLM A;  3NG3 A;  5CPM A;  3NDO A;  1BEU A;  2WNQ A;  5E1Q A;  5EY5 A;  3QSR A;  2JKE A;  4ZL1 A;  2CZD A;  1TPW A;  3FEM A;  2H8Z A;  4LV4 A;  3S5Y A;  1TO3 A;  5FEP A;  3GB6 A;  1UUO A;  5D2W A;  1YPI A;  1SSG A;  4GBU A;  3WJY A;  4M7T A;  2FPY A;  2JBM A;  1ICS A;  1TV8 A;  3QYQ A;  1FQ0 A;  3QRH A;  2ATM A;  4PH6 A;  1ZAI A;  1G4T A;  2Y85 A;  2YYU A;  3O06 A;  3B8D A;  4KWV A;  4NQ1 A;  2VXN A;  2VFI A;  1Y0E A;  3MBD A;  4GUG A;  1AW5 A;  3L9C A;  4A29 A;  4MZ1 A;  3W73 A;  5DBT A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3NQB A;  4S3A A;  3QC3 A;  2WO5 A;  3UPM A;  3XIM A;  3GFX A;  3MI3 A;  4YS1 A;  4HYV A;  3AFB A;  4TQT A;  2HRO A;  4N9D A;  3DFO A;  4GME A;  3AXK A;  3SFK A;  3L21 A;  1GZJ A;  3I65 A;  5G4W A;  2ZDR A;  3B0P A;  3CB8 A;  5DRC A;  5MF5 A;  2VZO A;  4UOZ A;  1H7N A;  1HP4 A;  1PIF A;  5HAN A;  2WWD A;  4ICC X;  1PZ0 A;  3EKL A;  4CU6 A;  4Z2G A;  3M6D A;  3AZS A;  3DEN A;  1E0U A;  3TV8 A;  4XTI A;  3OA5 A;  4Y9O A;  5F2M A;  4HJF A;  4TMB A;  4OV4 A;  2ISS A;  3PSV A;  1XIC A;  3ARS A;  2QMJ A;  1KGX A;  5KZD A;  3G18 A;  3RCY A;  3WYZ A;  4GKT A;  1OB0 A;  3EXT A;  4DJD A;  4EF8 A;  4FNR A;  4AXN A;  1ZNN A;  1RY8 A;  1Q63 A;  2PLM A;  5G5I A;  4GK8 A;  4OOZ A;  4D6I A;  4ATW A;  2J74 A;  3GM8 A;  2Z1V A;  4MG4 A;  4Q4R A;  2Z29 A;  1X6N A;  4NSB A;  1YQ2 A;  1F6Y A;  1FWF C;  3VD5 A;  2HVM A;  3TN5 A;  3DI0 A;  2OSY A;  3WQE A;  1EBG A;  4NHV A;  3KTX A;  3V16 A;  2O56 A;  1N7K A;  1RD6 A;  3ZSS A;  4KMQ A;  4P7L A;  5I79 A;  1E9Z B;  3QQW A;  1ZJH A;  3NSN A;  4NZ3 A;  4WLC A;  1UIP A; 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