3C6C | Genus

Total Genus 96

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	96
sequence length	294
structure length	294
Chain Sequence	SRKVILTCAVTGNAPFNPKHPSMPITPAQIADACVEAAKAGASVAHIHVRDPKTGGGSRDPVLFKEVVDRVRSSGTDIVLNLTCGLGAFLLPDPEDESKALPESDVVPVAERVKHLEDCLPEIASLDITTGNQVEGKLEFVYLNTTRTLRAMARRFQELGIKPELEVFSPGDILFGKQLIEEGLIDGVPLFQMVLGVLWGAPASTETMIYQRNLIPANAQWAAFGIGRDQMPMMAQAALLGGNVRVGLEDNLYLSRGVFATNGQLVERARTVIEHLGMSVATPDEARDIMGLSR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of 3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme (YP_293392.1) from Ralstonia eutropha JMP134 at 1.72 A resolution rcsb
molecule keywords	3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme
molecule tags	Hydrolase
source organism	Ralstonia eutropha
total genus	96
structure length	294
sequence length	294
ec nomenclature
pdb deposition date	2008-02-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF05853	BKACE	beta-keto acid cleavage enzyme

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3c6cA00

3LX9A 1H7NA 1ZFJA 4HIBA 3W7DA 2R8WA 3HO8A 1ICQA 1G7VA 2R94A 3PSVA 3KVKA 2QDGA 4FO4A 3N9SA 4A2RA 3LOTA 3N2XA 4O4WA 3NL5A 3O6CA 4M6QA 1OVDA 2W6RA 3W87A 3BW3A 4XTIA 1BWLA 5FEZA 3NQEA 3OHIA 4AWTA 3WK1A 4NXKA 4Z1DA 4LS0A 5DN1A 1LTDA 2ATMA 1I45A 3U6WA 3ELFA 5C2XA 4A21A 3MBDA 5TQLA 1K7XA 3EX1A 4Y90A 3NDOA 3LHWA 3W2KA 1FWTA 5IBXA 3GDMA 3EXTA 4LVDA 3GX9A 1AMKA 1T8XA 3HG5A 3KXQA 4JIQA 2YPIA 2RDTA 1SSGA 3FKRA 5G4EA 1QPQA 3QM3A 2OT1A 4LS2A 4J9JA 1HTIA 1K8ZA 3R8RA 4E2DA 3QSTA 3RLVA 3U2OA 1VR6A 4O14A 4E2BA 3TA6A 4JTTA 3C2EA 3L21A 4JICA 1TREA 3HGRA 1RZMA 1TQXA 4JR5A 4JYFA 4Z0SA 1G7UA 3LV6A 4HNVA 1S5WA 3W6YA 1ZNNA 5LGXA 4N9CA 3T55A 2EHHA 3CEUA 3STCA 3W2JA 1Q6RA 3L0GA 3THAA 2YCEA 2YXGA 5HR6A 5FF4A 1TPFA 3FKKA 1GQNA 4FNSA 2YW3A 2OCZA 1GTEA 5DCEA 1C9DA 1PS9A 3ABSA 3CWOX 3O6YX 4XBKA 4EF9A 2X1UA 4CCCA 3NG3A 5DXXA 3PY2A 1K02A 2WKJA 4PFMA 1OFOA 2G5WA 1NVMA 3O63A 1H1YA 2V2HA 3OEXA 4FXRA 3SFKA 1N7KA 3LHTA 3I7SA 3DKJA 5AC6A 2RKXA 2Y85A 4DF1A 5LNRA 1OF8A 3N73A 3TUUA 1VLWA 3V75A 4Y6GA 2C16A 3W7MA 3BW4A 3UNDA 3HIJA 3PBWA 1DJNA 1FCBA 4O0KA 1TYGA 3UWVA 1O5XA 5FEXA 3A21A 1IXPA 5F4WA 2ZZ1A 3MHUA 4IX2A 3BK0A 4UTWC 3N19B 1O60A 3TX9A 3NQAA 1MSSA 4RCXA 4JY9A 1VC4A 3MUXA 5DCDA 2Y62A 1GVRA 4N02A 2GUUA 3UPWA 3TH6A 4QITA 3T78A 5AYZA 4TR9A 2GQ9A 3JR2A 1KM0A 3LCIA 4LWWA 1FCUA 4AHPA 3IIOA 1PV8A 4O10A 5L9FA 1TJRA 3TFXA 3VKJA 2V0TA 3W1TA 4XTDA 3QPZA 4LU0A 3NQVA 1F6PA 4K8HA 4JYDA 3TU9A 4TMCA 1L6WA 1DQXA 2CWNA 2CZFA 3ZWSA 4IUOA 4ADSA 2WSRA 1P5BA 4GRSA 2PC4A 3DU0A 2JKAA 4LNYA 3W7PA 4WUIA 3LRMA 3TCEA 3S6DA 4AHOA 4CQ8A 4O50A 5LNSA 5D03A 3L65A 4Q33A 4QIUA 3TJLA 4JN6A 3PS7A 2YGYA 5K9XA 1ZCOA 4EWND 1WAUA 1GG1A 3TQVA 4BI7A 3RF9A 3W1PA 5D30A 1F73A 2VFEA 4ZQCA 4W9TA 1TQJA 2J9XA 3PWAA 3CPRA 2BSLA 3LCHA 1YDOA 2VEMA 2A85A 2ZZ6A 3TXZA 5HNRA 4WY0B 1Z44A 3D0CA 3M43A 5I3HA 4DO6A 1MEIA 1KFBA 3WK3A 1TTIA 5CSSA 3W76A 2E6AA 4GE8A 2Z1BA 1VH7A 1R2RA 4XWUA 4PTNA 1W8SA 3KRSA 3TSDA 1OFQA 5DY2A 4IMEA 2NXGA 3MHGA 1W31A 4BI6A 4IMCA 1LROA 4N4PA 5KSWA 3O1NA 5CPOA 3W1LA 2GVGA 5G2HA 3FLUA 3GLCA 5BNKA 1WYIA 1EA0A 3QSRA 5U4NA 2A6LA 4CQAA 3FIGA 3LI0A 1OF6A 4FX8A 1SZFA 3DAQA 2Y61A 1TO3A 4LT9A 1OYAA 1H1ZA 3DZ1A 3ZR4A 3QRHA 2FLIA 5LHEA 2DORA 3UZ5A 4UTTA 2Z0IA 3W1QA 3DHFA 4AXKA 3M5XA 2QCGA 2J9YA 2QCLA 1IIGA 1VGAA 1MXSA 1TV7A 2OT0A 3LBMA 3HGJA 1UCWA 4O54A 3QFEA 4DPPA 4MUZA 3L5LA 3GKFA 3N9RA 1LCOA 2CU0A 2IQTA 2Y6ZA 1G4EA 3YPIA 4X2RA 3EWBX 4UFLA 1C8VA 4Z0JA 4LUJA 4UXDA 2GQAA 3ABOA 5KZDA 5EYWA 1OFDA 4AF0B 1SZNA 1JRCA 4MOZA 2LLEA 2YFNA 3EXSA 4FNTA 4FXSA 3I6RA 1YYAA 3PR2A 4JY8A 3E9AA 5AHMA 3BG9A 1W5OA 5EMUA 3P5YA 4RXGA 3TROA 1QPRA 2E5BA 1BEUA 1QPNA 1ICSA 2ISSA 2OZ0A 2QAPA 1JCLA 2VC6A 4K37A 4UTUA 4YL2A 3NOEA 4C1LA 1WV2A 1KM5A 3QPYA 2P1FA 4DELA 3S5ZA 3KRUA 5TIMA 3W2LA 4JNMA 2O7SA 4N9EA 4Y96A 3QMRA 4FNQA 1GJPA 1KM4A 1J2WA 2NLIA 3LLDA 2EGZA 2ZRZA 1LRQA 2P10A 3T44A 2E6YA 3M5YA 1XBYA 2F7FA 2ZRUA 1XXXA 4N2YA 1G6CA 1W5PA 3VI2A 5CZTA 2ZZ3A 3NXFA 1L2UA 3IRDA 2GPTA 4UFJA 4GUHA 4RV8A 5D2TA 4UTJA 3CIWA 2NZLA 3S5NA 3ZFHA 2B4GA 2ISVA 4QAIA 4JTSA 5F2MA 4NZFA 2V2CA 4FIQA 1G4SA 4O16A 3C61A 3EEGA 4O52A 3C2VA 4LY8A 1VJIA 2ZRXA 3O6DA 3W1RA 3QMSA 3LBCA 1WQ5A 4XUGA 3FA5A 1VS1A 3NQ8A 3GDKA 4NQ1A 2TPSA 3OA3A 2FPTA 3P60A 1JCYA 1W5QA 1L6YA 1JQVA 2DZXA 2ZZ7A 3G1DA 4EOUA 2GOUA 1PCKA 4FNRA 5D38A 4MZ8A 4CNOA 3W7QA 4ZQRA 1NF0A 2CLLA 3GAYA 4OT7A 1UUOA 5J5DA 1TIMA 3S8HA 5K2ZA 1WOBA 3NO5A 2Q3RA 3BPWA 3GAKA 3L5AA 5CPNA 1J4EA 1Q6LA 2J27A 3DFPA 1JJKA 3WK2A 3LI1A 3E12A 3O15A 5EA9A 3CM4A 4MLRA 5C54A 2V2DA 4K36A 4KWVA 4ZQOA 4RXFA 1TRDA 1ZAHA 4CNPA 2QCFA 2E5CA 3R89A 2C19A 1W5MA 2WQPA 4ORIA 1K8YA 3KOFA 4Z1BA 3HGOA 3E02A 3M7WA 4R7JA 3NGJA 4UTTC 5G2IA 1FWNA 1GYNA 5E0KA 4KWWA 3TC6A 2BWGA 1XM3A 3W7EA 3WJYA 3G3DA 4IXXA 2H8ZA 3L5MA 3U8GA 4ZMGA 2Y70A 3CTLA 1IGSA 4RR4A 1X8FA 5CG7A 1F05A 1QR7A 4WOQA 3W7GA 1M6JA 4JIPA 2Y7FA 2AQWA 3GIYA 3NQ6A 3L67A 3SGUA 3M0ZA 2VKZG 2V81A 3BVJA 4HNTA 1B9BA 1KM6A 2WNQA 3TIMA 1W3IA 2A6NA 4A22A 3SJ3A 3W85A 4XKYB 4O13A 5FF0A 3H53A 3DBPA 2E6FA 1Z41A 3LDVA 1GYLA 2OJPA 3N3MA 5AHLA 4CNNA 1QDSA 3PULA 1THFD 2QDHA 4MJMA 2BX7A 2RH9A 4JTLA 1WDWA 4LVFA 3UXAA 3S1UA 1JULA 3EX4A 2W0UA 5K4XA 4O4VA 4BWLA 3LGEA 3EX6A 2DZUA 3G18A 3MP5A 2I1OA 3GNNA 4U28A 3VNDA 1Y0EA 3LHZA 3HG2A 5CGQA 3CC1A 3TC7A 3FEMA 2V5BA 5AHFA 3MW7A 3M44A 2YYUA 3KVLA 4K39A 2ZRVA 3O06A 5FEPA 2G97A 1KM2A 3HGSA 3HB9A 4ZQNA 4GC4A 1JQXA 3Q94A 1GVSA 3M16A 2A7RA 5G4WA 2ISWA 5HQEA 4UMAA 3C56A 4FX6M 1IXNA 5J5RA 1XBZA 3UZJA 5CPLA 3W7RA 4MPQA 2E1DA 3BLIA 3G0UA 4QJ1A 1H7RA 4NJJA 3M41A 4HSOA 5I3JA 5AOUA 4O11A 3C0JA 3MP3A 3LXAA 3NAVA 2HS8A 2Q8LA 4KFPA 3W7CA 3NQCA 5DBTA 1LLWA 2ZRWA 1G4TA 4D2JA 3NR0A 3ZS4A 2QAFA 4AWUA 1WBJA 1IIHA 1OHLA 1P0NA 1YPIA 4DEFA 2OMAA 2AAMA 4NNAA 4H4IA 1XBVA 5LSMA 3UY8A 2X1TA 4CLMA 3W1MA 2V8ZA 1LRTA 2CLHA 2VELA 4GUJA 4GBUA 1H63A 4XQ6A 5EBUA 2B7QA 1FDJA 3K30A 3G0XA 3ANYA 3P5ZA 1ALDA 2NX3A 3FS2A 2NX1A 1SW7A 2FPYA 1F5ZA 1W56A 4IXHA 1FWRA 6TIMA 4LVAA 4P2VA 1JUKA 4M19A 1O95A 1TTQA 2G95A 2Y7GA 4DPQA 4IX0A 3NQGA 4L4LA 1YTDA 3H55A 4NX0A 3BLFA 3WFAA 3C8FA 4NT0A 3B0VC 3G0SA 3QMTA 4H3DA 3OVQA 2DJLA 5FI8A 3W7IA 1HFBA 4I9AA 4IMGA 1JVNA 3P7YA 1LRNA 4R53A 4PODA 3TQ0A 3W88A 4OU1A 3TKFA 4DXVA 4RZ4A 3HPSA 3QH2A 2V9DA 2JGQA 5AB3A 3P8JA 3HQ1A 3E96A 1LYXA 4DF0A 1M7PA 1R46A 3VFLA 3W22A 1RD5A 4IQLA 1F74A 4AH7A 1H61A 3BLEA 4G1KA 1DV7A 3G1FA 3EXRA 4HNUA 1XUZA 3MYOA 3B04A 2GQ8A 1S5VA 2KZHA 3CEPA 3W1AA 1VLIA 3TDFA 4OHQA 5H2ZA 1VQTA 1TV8A 3P84A 3IVUA 4AVFA 4AWSA 2Y63A 2QCDA 2WV8A 5T26A 2V82A 2CLMA 2FFCA 4FHAA 5F1VA 4O28A 1OX4A 1WXJA 1OFRA 2O7QA 4RK8A 4UTIA 3R5EA 5D33A 1ME9A 1DVJA 1I2PA 4BWLC 3UWZA 1OFPA 3L0NA 4JX4A 4M6VA 3WJWA 4KFNA 1Q3NA 4FIRA 4WX2A 1V5XA 3S1WA 1DL3A 5DXYA 4TIMA 5KZEA 1EWDA 3P80A 4DBDA 1O4UA 2QUUA 1GG0A 4LRSA 3A23A 2Q3OA 5LGZA 4WOZA 1JCJA 1FCQA 1H7XA 4ML9A 3W7OA 2PURA 3RK8A 3PF3A 3TK7A 1LBMA 3A22A 3NYZA 5IM51 5G5IA 2JKEA 1R2SA 3GDTA 4PL1A 4S1FA 2DZWA 1WX0A 1S3HA 4UUIA 1MO0A 3PG9A 1AK5A 4RJEA 1RVGA 3IV3A 4NX5A 3NEVA 4AMAA 2HS6A 3TE9A 2DJXA 4JEQA 1GOXA 1FWSA 5FF7A 4U4MA 1SUXA 2A4AA 3G1XA 2X2GA 3EWZA 3JRKA 3HPZA 1W54A 1PHQA 2Q8ZA 1ADOA 4UTMA 4MYAA 4JTUA 1SPQA 2X16A 3W7LA 3TAOA 5IBXC 1YDNA 4YXGA 5LNUA 3H54A 3W86A 1LBFA 2VFHA 4MYXA 1OFBA 3A5FA 3TXVA 4O8RA 4TU1A 2CZDA 5LZLA 2R91A 4LV4A 5EPDA 3LCXA 2WJZA 3T7VA 1KTBA 1I2OA 3P74A 2A21A 2VFIA 1TPDA 3TMLA 3STFA 1SO3A 2PE4A 1FDYA 1ZAIA 3W7NA 3F03K 1TJPA 2A1YA 2YW4A 2YDAA 4EIVA 1H62A 4YCOA 3Q2DA 2GVJA 4HHPA 2VEPA 5D04C 3C2OA 4GNJA 2ATSA 3CB8A 2VFGA 1LM1A 3SY5A 4CCDA 3CQ0A 1L9WA 1Z48A 3PC0A 4MJZA 2WSQA 2FTPA 5CZ0A 3LTYA 5HUPA 3QYQA 3CT7A 3KAOA 2QR6A 4WXZA 2PRMA 1KV5A 3TW6A 1ZHAA 2VOMA 3KRZA 3PUEA 3QEZA 1H7OA 3GXTA 5AC8A 1OFAA 2QCCA 2WNNA 5F2IA 2E6DA 4H6KA 3HPXA 2ABBA 1B4KA 4HNNA 1GVOA 2HTMA 3GXNA 3NL6A 4LW7A 2FJKA 5AYXA 4MZYA 3IIXA 1OJXA 4X22A 1SSDA 1KFJA 1LBLA 4MLJA 2CLFA 1KLZA 2JGYA 4B5NA 4DQWA 3CWNA 1BTMA 1VRDA 3G8EA 3O16A 3NPUA 1VHNA 5FF3A 2TYSA 4O1DA 3PUOA 3LM7A 1SZGA 1ICPA 3W07A 3DGRA 5I3IA 3PBVA 4KFOA 4BFAA 1K7EA 3BO9A 4LUIA 5DCBA 3W84A 3W3OA 1SO4A 1P4CA 3EKLA 3RMJA 4NXSA 3L9CA 4NZJA 3PBYA 1R30A 2E09A 3GDLA 1PL9A 2C14A 3G1SA 1QMLA 1FQ0A 4QQ3A 3B8DA 3SI9A 1YXCA 4MY9A 3LB0A 3WJXA 2V30A 4JTHA 1QO5A 2C13A 1R47A 4UR7A 3NM3A 4Z1CA 1QAPA 3W7JA 4ZZ9A 2RHGA 3G1YA 1EEPA 2A5HA 1KFLA 4Z08A 1SW3A 4DO5A 2BLEA 1TPC1 1KM1A 5CPMA 1XC4A 4UNLA 4ZQPA 1B4EA 1WBHA 1GZGA 2A2IA 2DZTA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3C6CA

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