3C6C | Genus

Total Genus 96

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	96
sequence length	294
structure length	294
Chain Sequence	SRKVILTCAVTGNAPFNPKHPSMPITPAQIADACVEAAKAGASVAHIHVRDPKTGGGSRDPVLFKEVVDRVRSSGTDIVLNLTCGLGAFLLPDPEDESKALPESDVVPVAERVKHLEDCLPEIASLDITTGNQVEGKLEFVYLNTTRTLRAMARRFQELGIKPELEVFSPGDILFGKQLIEEGLIDGVPLFQMVLGVLWGAPASTETMIYQRNLIPANAQWAAFGIGRDQMPMMAQAALLGGNVRVGLEDNLYLSRGVFATNGQLVERARTVIEHLGMSVATPDEARDIMGLSR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of 3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme (YP_293392.1) from Ralstonia eutropha JMP134 at 1.72 A resolution rcsb
molecule keywords	3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme
molecule tags	Hydrolase
source organism	Ralstonia eutropha
total genus	96
structure length	294
sequence length	294
ec nomenclature
pdb deposition date	2008-02-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF05853	BKACE	beta-keto acid cleavage enzyme

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3c6cA00

4QNWA 2A0NA 3O1NA 1L2UA 4P61A 4A2SA 1SQ7A 1GTEA 4DEFA 1ZHAA 2RDTA 3NQEA 2GQAA 3N3MA 1P0NA 3S0CA 4JTFA 4EIVA 2F7FA 4FB7A 5CZTA 1AW1A 1T0OA 3BVJA 3TKFA 1BWKA 3TC7A 4LT9A 3BW4A 4JNMA 5HWMA 5J5DA 1RQHA 3F03K 5F2MA 5K4ZA 5LHEA 1B9BA 4JR5A 1EEPA 1M7PA 4UMCA 4MY8A 5F1VA 3QW4B 2YFOA 4JYFA 3TNOA 1LLZA 1I8JA 1S5VA 4XKYB 1QFEA 2ZRXA 4EOUA 1DJNA 1SW7A 4NNCA 3I7RA 1WAUA 4XBKA 3NM1A 2HSAA 3UNDA 5L6UA 1A5CA 2FJKA 5CKSA 4DO6A 1FCUA 2A1YA 3QJAA 1W56A 4NQ1A 1WX0A 2PRHA 3NG3A 4ALDA 2VEPA 3F4WA 1OX6A 1WXJA 1CI1A 2QJHA 2J6XA 3NPVA 1VRDA 2QCDA 2X1SA 2ZRUA 3NNTA 5D33A 2XFWA 3EXRA 3MW7A 3HG4A 2Y7GA 4ZQMA 4OWGA 1QNVA 3O63A 3VE7A 4HNTA 1JQXA 3PSWA 3SFKA 3W83A 2TPSA 4E2DA 4IX0A 5LSMA 3WJZA 4UNLA 4XWUA 4GUGA 3V75A 5I3GA 1TPC1 4JX4A 3W84A 3DXIA 3NM3A 5I3KA 1TRDA 2ZQ0A 3CHVA 1I45A 3OG3A 1QOPA 3KX6A 3JRKA 4O28A 4PODA 4HNNA 2X2GA 3MWAA 3S9YA 3UY8A 1TQXA 2CU0A 1QWGA 3BK0A 4OE7A 2GVGA 4JIPA 3SI9A 4QJ1A 4AF0B 2QDHA 1J2WA 1EB3A 3IVSA 2G5WA 2FDSA 4WY0B 4Y9AA 3S5ZA 4FXRA 1AK5A 1JRBA 2XN2A 3Q94A 1VS1A 1VCVA 3GXPA 3OHIA 2E77A 3Q37A 2WO5A 5FI8A 2CLOA 1Q6LA 4K7YA 2DP3A 1OJXA 1M6JA 3N2XA 5FF7A 2BWGA 3TQVA 3ABQA 2AQWA 3S1UA 3FS2A 1XC4A 4N9CA 1ZFJA 3OVPA 4N9EA 1TJRA 4N4QA 2OT0A 3L9CA 4O1DA 1O5XA 3T78A 1I2PA 1TPDA 1MXSA 3I68A 1ZENA 3BG5A 1QDSA 3WJYA 3HGRA 1FCBA 3GAKA 3PG8A 4NXSA 3LTPA 4UFIA 3GR7A 1D3GA 2NUWA 3C2EA 2CZDA 1X7FA 1VLWA 5AC7A 3B0PA 1B4KA 5CG7A 1TPUA 1TPH1 1Z41A 2DZXA 4MYXA 1G4EA 3TH6A 4UTKA 1K8YA 3SECA 3FKRA 1SO4A 2C13A 2G97A 3INPA 4JTSA 4O19A 2V9DA 3KVJA 4FX8A 3THAA 1I2RA 1XDLA 2KZHA 5EKYA 2VOMA 3CPRA 3PBVA 4TR9A 1V5XA 1XBVA 5LZLA 3LCLA 1TREA 2E6DA 3ZWSA 4MVAA 1LOSA 5K3VA 3H55A 2ZTKA 5I3FA 3TQKA 3MBFA 1B57A 1LZOA 5HJLA 4JDYA 4OV9A 1SFJA 1RR2A 4UTIA 3HPZA 3P5YA 3W75A 2P1FA 2E09A 1MZHA 4QIUA 4RR4A 3ZWTA 3STCA 3G24A 4GUIA 3DKJA 1F7BA 1IXNA 4UFJA 3NQ7A 4AH7A 6ALDA 3A22A 3NYZA 2BSLA 3TSDA 4K6AA 3UYCA 4CNPA 2GOUA 3HO8A 3PSVA 4FNPA 3GLCA 3VI2A 4N02A 5C54A 4GNJA 4JYDA 4I7UA 4O4WA 3HJZA 3W1PA 3SIZA 2NX1A 1PL9A 3FIGA 2FB2A 4MJZA 4JDBA 4UTTC 1BEUA 1TPVA 2EAWA 3ANYA 5AB3A 4QSHA 5HUOA 4I9AA 1N8FA 6TIMA 3ZR4A 1A5BA 3M7WA 1GT8A 4Q33A 4OV4A 3LLDA 1G67A 4O11A 1M7OA 1W5OA 3G18A 2NV2A 3C2VA 2PRLA 1FY6A 3EB2A 1FBAA 3G1HA 1XBYA 1NSJA 3M41A 3B4UA 1SFLA 2V2CA 2ZZ2A 3OVRA 1TTJA 1W31A 4Y96A 1TV7A 3L67A 5AHNA 1KM2A 3EX6A 1SZNA 3KRUA 1IIHA 4QISA 4DXVA 4M6QA 2QCLA 3QRHA 3FYPA 1LOQA 1OF6A 1VCFA 2RHGA 1OF8A 4N6EA 5G2HA 1W54A 3NQ6A 3B03A 4AHOA 4AHPA 4HIBA 2GQ9A 3IGUA 3UD6A 1NF7A 2DZPA 3RNDA 3E9AA 5LKYA 2ZA1A 4RK8A 1I4NA 1KA9F 5HUPA 1G6CA 2ZYFA 5FEPA 2NLIA 4Z1AA 2VFDA 4WX2A 3S1XA 2VXNA 3QYQA 2QDGA 5F2IA 2X16A 4LC6A 3LCGA 1VCGA 3NQ2A 4FIRA 3TW6A 2E6AA 2PURA 3S8HA 3PBWA 3FFSA 4UC5A 4QAIA 3QC3A 4MJMA 4Z0SA 1SZEA 2ISSA 4ZQOA 1H1YA 1YPFA 4LRSA 2VFIA 2CLFA 1VPXA 4X9SA 3UPBA 3LHTA 1IXQA 3TE9A 1AL8A 1HL2A 4PFMA 3P8JA 1VYPX 2W79A 1Y0EA 5E0KA 1QR7A 2V30A 3NL6A 4JX6A 4PH6A 3SGUA 4OQVA 3S42A 1EWDA 4FO4A 1SZFA 4WZHA 2JBMA 4IOTA 3TROA 1ME7A 4LNYA 4EF9A 2NZLA 3NPUA 4CQAA 1NEYA 1Q6QA 2A2IA 2Z2UA 5TBOA 3L21A 2GVLA 3DAQA 2Z6IA 2QCEA 5CPOA 3WFAA 4FHAA 2I1OA 2QKFA 3C4UA 2JKEA 1OFPA 4BI7A 1I2QA 3QQ0A 4NJJA 2C0AA 5ABTA 3H54A 3PR2A 4O1CA 4JICA 3CEPA 2Q3RA 4M6VA 5AOUA 3LBMA 3MP5A 2ATSA 1FWRA 1VQTA 3KRZA 4C1KA 5J5RA 1SSGA 1UJPA 3THQA 3M5VA 1QPRA 4NZJA 1H7PA 2NXIA 4UTWC 3W2LA 3B04A 1YXYA 4IJBA 3QFEA 3BV4A 7TIMA 2LLEA 2EHHA 1V7YA 4CQ9A 1E51A 2PRMA 1H63A 2YFNA 3P60A 5CPNA 5FF2A 1OYBA 3A21A 5KZDA 3TAKA 2RDUA 4UTUA 2V82A 4IXHA 4NZFA 1UCWA 4DELA 4NXKA 1I2NA 3LX9A 3TC6A 3MYOA 2Z1BA 3EX4A 5BMXA 3KVLA 1ADOA 4K36A 1SW3A 3NL3A 4S1FA 4I7VA 2EKCA 3NEVA 4IPJA 4FX7A 1YYAA 1KBJA 2VFFA 1TPWA 2CLLA 4MFEA 1F73A 3QF0A 4HPJA 3NQMA 1TB3A 2E68A 3FKKA 3Q58A 3A9IA 3NPWA 5LNWA 3UQNA 1YPIA 2GVJA 1FDYA 4GXMA 3LXBA 5K9CA 2B7QA 1KBIA 4JN6A 1MO0A 4UMBA 4Z1DA 3R89A 3DFTA 3W23A 4FNQA 3L5AA 5D2YA 3EX1A 3W76A 3TXVA 1FWSA 4O15A 3IRDA 5DELA 3TXZA 1LBLA 5GVJA 1ZJIA 5IBXA 1XXXA 3MHUA 1XUUA 2WNQA 3CT7A 1LROA 1K7FA 5LHFA 1UUMA 3DBPA 3VE9A 3G3MA 3W7RA 2VFEA 3EWZA 3CC1A 1LM1A 2E5CA 3GK0A 3LXAA 4ORMA 5LNRA 5CGQA 4RJEA 4K8HA 3RMJA 2J9YA 1FWWA 2YYTA 4LUIA 4O50A 3FYOA 1SUXA 3P62A 5DCBA 4IMCA 4FXSA 5AHMA 3QH2A 3UWUA 3W7DA 2ISVA 4CNNA 3L5MA 2Y62A 4R7JA 2VELA 5TQLA 3UWZA 3PWAA 3KOFA 2OX1A 3L0NA 1VR6A 1IXOA 5I3IA 2R91A 4H4IA 3EWBX 4HN4A 1GWJA 3DGRA 1KFJA 3TX9A 5DY2A 2YPIA 3E0IA 2FPYA 5KITA 4MZYA 1ALDA 2C15A 3S1WA 3EX2A 3I7QA 4LC8A 2CWNA 3W2UA 3PVFA 2ZZ3A 3HQ1A 4U28A 2A21A 3DENA 2B7OA 4YCPA 1LRNA 1KTBA 3HPSA 1SU5A 3TCEA 4E2BA 3N9SA 4LRTA 3N2MA 1ME8A 2X1TA 3LM7A 3BPWA 1MEHA 1QPQA 4GWEA 1VHNA 3IV3A 4AEOA 4ZZ9A 4TIMA 1TRIA 2PE4A 2CLIA 2FTPA 3M5ZA 1A5SA 1N55A 4M7TA 4QQ3A 4NUWA 5I3JA 3ATYA 1FQ0A 1L6YA 1O95A 3P8IA 5A8GA 5BMWA 2R8WA 3DI0A 1PIIA 5K9DA 1XKYA 2A7NA 3BW2A 1T96A 4XTIA 5F2GA 1RD5A 1PCKA 4JX5A 3T44A 1VGAA 1VJIA 1W5MA 4Z08A 2JKAA 1JCJA 4KWVA 1SO3A 1LCOA 1AG1O 2WNZA 2B7NA 1LRQA 3E12A 1RPXA 3SGZA 1JVNA 2Z6JA 2E6FA 3B06A 3MI3A 4WD0A 4Q4KA 3LCIA 4GFSA 2Q3OA 2QCCA 4CLMA 1F6PA 3GAYA 1U83A 4DQWA 2YR1A 4UFLA 3M5YA 4JTHA 5L9FA 1I2OA 1KM6A 1R30A 2QJGA 5KTLA 3OBKA 3ZFHA 2QCDB 1OK4A 3LB0A 1TPEA 4NX5A 5U4NA 3PS7A 1H7XA 1JCLA 3OA3A 4JXCA 4KWWA 3W7PA 5C6MA 1THFD 3L68A 1EUAA 1GG0A 4FIQA 3O6CA 4NNAA 1ONRA 2G96A 2F84A 3LBCA 2PC4A 2ZA2A 3G22A 2W6RA 1KFCA 3IEBA 3MP3A 5AHIA 3KVKA 2G95A 1GVSA 3O05A 3UWWA 2H8XA 4UMAA 4NU7A 3W74A 2VEKA 3SZ8A 3W1XA 4HKPA 5H91A 1G7VA 2WV8A 5G5IA 2Y7EA 3V1PA 2WSRA 1D9EA 2W0UA 4PL1A 1XBXA 2JGQA 3DKLA 4PA8A 4JTEA 1SSDA 3LCFA 4NJHA 4DBDA 1YXCA 4ICNA 4OU1A 1MEWA 1KM4A 3UWVA 3LTSA 3ATZA 3BG9A 3EKLA 2ISWA 3QSTA 3HIJA 4LS1A 1T8XA 2DORA 2H6RA 2DZSA 3W86A 4RV8A 4LS0A 2E5BA 3SSJA 3DFPA 4S2CA 1ZALA 4RKAA 4UCGA 3LHYA 1ICPA 3PUEA 4AHQA 3O8AA 3MI2A 1YTEA 5EL1A 2B7PA 3LHZA 3MUXA 5C5YA 1K7XA 1OFDA 2WKJA 3NQ8A 1Q6OA 3TSBA 3R13A 5LGZA 3LHWA 2WQPA 1OK6A 3E02A 3GYEA 3QMRA 2A85A 1XI3A 4B5NA 3RLUA 4YWIA 3IIXA 5BOOA 4NT0A 1SO6A 2WOQA 4UXDA 3ABOA 1OX5A 5HR6A 4O53A 4RZ4A 2NXHA 5DXYA 5FESA 1Q6RA 3T4CA 1WOBA 3R12A 2A5HA 4JTGA 3WK1A 5KMYA 4A3UA 4MY9A 4OT7A 1YLVA 3LHVA 1HUVA 4HNVA 2FFCA 2YYUA 4N2YA 4FNSA 4UTHA 2YX0A 1ZCOA 3S6DA 3EKZA 2V81A 4G1KA 3TW7A 5F4XA 5AFDA 1OFQA 1LORA 4ORIA 5AYZA 5LNVA 3LHUA 3GKFA 5HQEA 4HNUA 3LOTA 4HSOA 1GOXA 2ZZ7A 3CU2A 5U7SA 1KTNA 1AW5A 1GYNA 3I7SA 4AWUA 1O5KA 1TO3A 3EWXA 1GZGA 1OFEA 4BR1A 3STFA 1FDZA 1HO1A 1X8FA 2QCMA 1H7NA 4YLWA 3L0KA 4UTLA 4O0KA 1EPXA 2ABBA 3HPXA 4A21A 3C0JA 3QEZA 4AAJA 4TMCA 3TJXA 5CZ0A 3GZ3A 1PCWA 3DFSA 3W1TA 2YXGA 2CZFA 2QAPA 4N9DA 3W22A 4O8RA 5FF0A 1UASA 2A4AA 4HHPA 1GTHA 4AWTA 1SZGA 2FIQA 2RDWA 4MZ1A 1OG0A 1OX4A 4CQ8A 4POCA 4YMZA 4MIMA 1JCNA 2O7QA 3M0ZA 3P84A 3CIWA 1DL3A 2JGYA 3LRLA 4CNOA 4HT3A 3CM4A 4LVGA 3L5LA 4UFMA 2R94A 1JQVA 4DF0A 1DVJA 2E1DA 1XCFA 1XL9A 3W2JA 4Y8FA 5AHFA 4MFDA 3K30A 3WK2A 3NZ1A 3I65A 3W7GA 3G1DA 4ONVA 2CFFA 2FB3A 3UPWA 4FNRA 3WJXA 4O12A 5EYWA 3EWUA 3UWQA 4LU0A 1SPQA 5KSWA 4MLRA 3G3DA 1H5YA 1KV5A 1JR1A 2QF7A 5CPLA 2Y61A 4TMBA 2C1HA 1LYXA 4NVTA 2ZA3A 3FA5A 3MJYA 4JTJA 1UUOA 4N6FA 3H53A 3TAOA 1OFBA 2GQ8A 4NNBA 2IQTA 3WK0A 1EIXA 1K3UA 1VZWA 2HMCA 4BWLA 3BO9A 4WQ6A 2YDAA 5HWJA 3Q2DA 4M5PA 1IXPA 4UTJA 3TFXA 3KVMA 1LDCA 1A50A 3W1UA 4TO8A 5LGXA 1ML1A 1H7RA 4PL2A 4Y90A 4E38A 3NDOA 4ZQRA 2R14A 1X6UA 2Y89A 4DF1A 3TDFA 3DI1A 3W7KA 5E1QA 3C2RA 3L2IA 3W7OA 2I14A 1GEQA 4LVFA 4JTTA 3GNDA 5CZJA 2ALDA 1WDWA 3FJ6A 3BGGA 4JY9A 3BARA 3HOJA 5DBTA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3C6CA

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