3CQ0A

Crystal structure of tal2_yeast
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
328
structure length
325
Chain Sequence
ATSSLEQLKKAGTHVVADSGDFEAISKYEPQDSTTNPSLILAASKLEKYARFIDAAVEYGRKHGKTDHEKIENAMDKILVEFGTQILKVVPGRVSTEVDARLSFDKKATVKKALHIIKLYKDAGVPKERVLIKIASTWEGIQAARELEVKHGIHCNMTLLFSFTQAVACAEANVTLISPFVGRIMDFYKALDYTAETDPGVLSVKKIYSYYKRHGYATEVMAASFRNLDELKALAGIDNMTLPLNLLEQLYESTDPIENKLNSESAKEEGVEKVSFINDEPHFRYVLNEDQMATEKLSDGIRKFSADIEALYKLVEEKMLEHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The crystal structure and identification of NQM1/YGR043C, a transaldolase from Saccharomyces cerevisiae
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative transaldolase YGR043C
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 134
structure length 325
sequence length 328
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2008-04-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3cq0A00
4YCPA 1AMKA 1C9DA 4LVFA 3W2MA 4NXSA 3M41A 4JTEA 4W9TA 5CSSA 1XI3A 4FX6M 2NXHA 2CLOA 3TQ0A 4Q33A 2C0AA 2Y61A 1DQXA 1X1ZA 2GPTA 3EKLA 3FKKA 3G3MA 3BG5A 4EOUA 1SR9A 4QAIA 1QO2A 3CHVA 2WV8A 4TR9A 1RQEA 5DELA 2G96A 3MW7A 2X16A 2PURA 1T99A 1GZGA 2B7OA 2C1HA 3UWYA 4CCEA 2FDSA 3NXFA 2FLIA 3PG8A 4XQ6A 3VCRA 3CC1A 3OG3A 2J88A 3N73A 1SZFA 4BI7A 5U7SA 1C8VA 1ME9A 2ZTKA 4LTSA 4IQLA 1DKWA 2A7RA 2Y6ZA 1I4NA 2BSLA 5I3HA 4DO4A 1I2RA 3WJZA 5AOUA 3M16A 1TPB1 1OFOA 3SGZA 2Y7EA 3RLUA 3HIJA 4BWLC 3M6YA 3HGSA 3UY8A 1PCKA 1SO6A 4NJHA 1W3IA 3G1XA 3P81A 6TIMA 1OX4B 1QMLA 4GBUA 3UXDA 1DVJA 4RZ4A 1W56A 4UTUA 1YTDA 1Q3NA 1TJPA 2QCMA 3TU9A 5C5YA 3MP4A 4LVAA 2V30A 3NNTA 3M7WA 3SR7A 3N9SA 4H3DA 4N4PA 2YYTA 1KFLA 1L9WA 4FXSA 3UXAA 1W54A 1H7NA 3SZ8A 4IMCA 4Y90A 4JN6A 3E96A 2QR6A 3PY2A 3S1XA 5AHFA 4HHPA 3I7SA 3CEUA 4Z1CA 2JKAA 1W1ZA 1IXQA 1F6PA 1R2TA 4WD0A 3NG3A 3PR2A 4ZQMA 1FCVA 3MYPA 3LCFA 4LWWA 3NL6A 3HQ1A 3PB0A 2CLHA 2X1SA 4LS2A 4ADUA 2V2CA 1OFPA 1EA0A 1TPVA 2QUTA 2NLIA 3BGJA 4ZQRA 1DQWA 1EPXA 3DHDA 5T26A 1TRDA 2IQTA 3H53A 3G0SA 2B7QA 3MHGA 4IMFA 2NV2A 4WX2A 1FCQA 3P8JA 5FF0A 1KM3A 3NZ1A 1AL8A 4JR5A 3FOKA 4GRSA 3W75A 5HNRA 3DFQA 1J5TA 2EAWA 1HO1A 3A23A 2I14A 1TPH1 2J9XA 2YYUA 4O14A 4H4IA 3W7EA 5MHBA 3QPZA 4JTSA 2VXNA 1WV2A 1AK5A 5DY2A 1PE1A 4WY0F 5K4XA 2ATMA 3W83A 4LY8A 5K4ZA 5D2VA 3SGUA 1IF2A 4XUGA 3W7RA 4X22A 2J9YA 1CX9A 3LHYA 3NDOA 4JY8A 2HMCA 5LNVA 1JVNA 1N7KA 4CLMA 3MBFA 4A21A 5G2IA 3CM4A 3H54A 1ONRA 1QR7A 2Y89A 4NT0A 2FTPA 3UPWA 4JIPA 2ZZ7A 1UASA 3OIXA 3UZ5A 2V5LA 3M1ZA 3P7YA 3NQAA 1XKYA 5AN7A 3ATZA 2RFGA 3EWUA 1VQTA 4FXRA 2ZRUA 4GUIA 1SZNA 2RDTA 1LZOA 2J24A 3QEZA 4C1LA 1K3UA 3P5ZA 1QWGA 3PVFA 1DHPA 4TIMA 3RNDA 1QPOA 3DBPA 4QISA 4HIBA 4X9SA 3W7OA 1OF8A 5CPNA 4HPJA 2Z0IA 4NNAA 5G4EA 1X8FA 1BKSA 3NM1A 3R89A 2Z2UA 4K7YA 4JS3A 3C52A 5EKYA 1IIHA 4B5NA 2FB3A 4LUIA 3SFKA 3TC6A 5FEPA 5CZ0A 4O1AA 4O57A 3O6YX 5BRBA 1R2SA 4OV9A 1NSJA 1I8JA 3W72A 2X1TA 1AL7A 3GX9A 3KVJA 1SW0A 4UTHA 3PG9A 1TPFA 4S1FA 3HG3A 4A22A 5KSWA 2YDAA 4LV9A 3BARA 1G4SA 3LCLA 3GXPA 4AF0B 2C19A 2H8ZA 1RQHA 1I2NA 4UFJA 3HF3A 3KRUA 3N14A 3PC0A 1H1YA 3UWQA 1KFJA 1JCYA 3EXTA 5A8GA 3MI2A 6ALDA 1JUEA 1W5OA 2ZDRA 4UMAA 4YLWA 1A5SA 1P5BA 3W7CA 3VKJA 3W2NA 4LRSA 2V9DA 1FDYA 3IGSA 1OX4A 3HB9A 2JKPA 1VYPX 3WK3A 3M5VA 2VENA 3VE9A 1Q6LA 4MYAA 2WOQA 3RFAA 4AWTA 4FX8A 1VC4A 1Z48A 3NPUA 1FCUA 2CLMA 3QW4B 1YTKA 3EKZA 2YXGA 4KFOA 1SPQA 3O1NA 4I7WA 2H6RA 1KFKA 4GUJA 1S5VA 1RZMA 5LNRA 1DOSA 5C54A 1OFBA 4IX0A 2R14A 3G22A 4UTWC 1OFRA 3PUEA 2FB2A 4YWIA 2Y62A 2YW3A 3CB8A 3P84A 2AAMA 3O06A 3L68A 3WJWA 5EL1A 5D09A 4MLJA 4JNMA 2B0MA 4LRTA 1CW2A 5BW6A 2QCGA 1TCDA 1TB3A 3P60A 3W7LA 3W07A 3C6CA 1GG1A 3U2OA 2O7SA 4IOTA 2FQIA 3QYQA 3THAA 1WBHA 4O16A 4MUZA 4LW7A 5ABTA 1RV8A 4OU1A 4ALDA 1XDMA 2NUWA 1ZJIA 5HR6A 1HUVA 3NQ7A 1VCFA 1TIMA 3I68A 3QFEA 3L2IA 2DZTA 4PCFA 1FWSA 2C18A 3DU0A 2Z1BA 3QH2A 3W7KA 3FYPA 4PODA 2JKEA 2VKZG 5AC6A 1DORA 3G8EA 2TMDA 2E6YA 1I2OA 1SO5A 1VZWA 2F84A 4A3UA 3NZRA 5K9XA 4HSNA 4NQ1A 3STCA 1TTJA 1SW3A 2RH9A 5HMSA 1SQ7A 4JTIA 1OYCA 3GAKA 2GJNA 3WK2A 3Q94A 2VELA 3P62A 3KFTA 3KOFA 4UFHA 4OWGA 1G69A 4YL2A 4GWEA 2Z6IA 3WJXA 2YX0A 4IXHA 5D2TA 3W7JA 3EWXA 2VEMA 2XFWA 1A53A 2HS8A 2WSYA 1TYGA 2EHHA 2NX3A 4MFDA 3GVGA 3O07A 3TXVA 5LZLA 4CCDA 3LTYA 4XTDA 1F05A 3NQ8A 2E5DA 5I3JA 4RZ5A 4L4MA 2DZUA 2ALDA 5SWUA 5D32A 4DPPA 2YFOA 3U6WA 1KBIA 4QSHA 4RKAA 1Q6QA 3CTLA 3T78A 2RKXA 4XWUA 4MZYA 3EWYA 5K2ZA 2OZ0A 3MBDA 4JTUA 2W0UA 1TPC1 5CKSA 4N6EA 5F2MA 4I7UA 1YXCA 5IM51 2WNNA 3PB2A 3M5ZA 4PH6A 1TTPA 3P8IA 3HGRA 1W8SA 4UMBA 1QO5A 4X2RA 3CWNA 1A5CA 1XBYA 3BK0A 2GVLA 2A7PA 1T0OA 5E0KA 4QITA 1W5MA 4K8HA 4MOZA 1WOAA 1TSIA 1EP1A 1WXJA 1QDSA 3WK0A 3SJ3A 4LU0A 3EXRA 3G8RA 3LHWA 5TQLA 4AF0A 3EX2A 3NO5A 5DY3A 4CQ9A 3HG2A 5AHIA 4GE8A 2CLIA 3W1RA 4UFLA 4ML9A 3G1VA 4OT7A 1B9BA 2PRHA 2X1RA 2YSWA 1GPWA 1KFBA 3A22A 2R94A 4IPJA 4QJ1A 1VHCA 3TIMA 2DP3A 4TMCA 3WK1A 1W5QA 4FNUA 1GQNA 3L5MA 4O0KA 1B4KA 3W85A 5AHEA 3WJSA 5AHNA 4K39A 5I3GA 3TW6A 3UYCA 2WO5A 3C8FA 1XM3A 4FEZA 1OFEA 2ZA3A 5KZEA 2E1DA 4UXDA 3C4UA 1LRQA 1Q6RA 5F4WA 3W87A 4IGHA 1UCWA 1FWRA 3ABOA 3MP3A 4LC8A 1DV7A 1NAL1 1O95A 3W71A 5G2WA 1W5NA 1O60A 1ZAHA 1KM6A 4JDBA 5CGQA 3CIXA 1GJPA 1VPXA 5C6MA 3TDFA 1O5KA 4ZQNA 4O11A 1KTNA 4I7VA 4LS0A 1ZAIA 4N9DA 4RJEA 1LBLA 1SSDA 2B4GA 1T8XA 4JYFA 2Y70A 2F7FA 2Y63A 1JRCA 3P82A 3ABSA 4P61A 2ZRXA 3QQ1A 3R2GA 2QDGA 4QM1A 5G5IA 2ISWA 3DKLA 1K03A 1H7RA 1L6WA 3HBLA 3F1QA 4XBKA 5K3VA 4PFMA 3B0VC 3SIZA 3ZR4A 4O1BA 2A4AA 1H51A 1VLWA 3R13A 3FIGA 2GQAA 3L67A 4OBTA 1ALDA 4MPQA 4FNQA 3DFTA 3LHVA 3O16A 4N02A 3NAVA 3UWUA 3NOEA 1BEUA 5BOOA 1GVQA 1C29A 4WJEA 5C55A 3EX6A 1V5XA 4HNUA 4FNSA 4GUFA 1YPFA 1Z42A 3L0KA 4NJIA 1S3HA 1H62A 3DFNA 1G4PA 1VCVA 2Q8ZA 2C13A 4IMEA 1VH7A 4JXCA 4NUWA 2TPSA 1VS1A 2CZFA 4HPXA 4K38A 2BWGA 3FJLA 4M6QA 1H7WA 4YMZA 3THQA 4ZZ9A 1KLZA 1B4EA 1XXXA 4MJMA 2FPYA 1GVFA 2GQ9A 4LNYA 4UTKA 5IBXC 1SZEA 3LCIA 4LVBA 4O12A 4HKPA 3QMTA 5H2ZA 1EUAA 3ATYA 3M9YA 1Q6OA 3OA3A 1JCLA 1VJIA 3ZS4A 3T40A 1M5WA 3G3DA 5GVJA 2YGYA 3W1TA 3TW7A 4K36A 1TMHA 2BLEA 1V7YA 5LHFA 1H1ZA 3UPBA 3L5AA 2RHGA 2ZZ1A 4Z1DA 5J5RA 3LRLA 4O53A 4TMBA 3N3MA 4WXZA 3HJZA 4UTLA 2QJGA 3NR0A 4BI6A 5K9CA 3NA8A 5D02A 4K6AA 3HMJG 3LCWA 1N55A 4JX5A 5DXXA 5FF2A 3VNDA 3TFXA 1OYAA 3S1WA 3O05A 1VGAA 4H6KA 4O1DA 1PHWA 4AHQA 4D2JA 1G4EA 1UBSA 2NXGA 1SO3A 2ZTJA 3BGGA 3V75A 4E38A 3LX9A 2ZYFA 3GDRA 2V0TA 3GDKA 1D9EA 3EX3A 5D38A 1LTDA 1WA3A 2ABAA 2QCLA 5F1UA 5HUPA 4YXGA 1W37A 1KTBA 2EGZA 5FF7A 4EWND 2BZNA 2V5BA 4OGZA 4JTLA 2PRMA 3JS3A 1Q45A 3FLUA 3IIZA 1EWDA 4C1KA 3CEPA 4UTIA 1ZFJA 5G4WA 1GWJA 3L5LA 4WZHA 4LS1A 5G2HA 1PHQA 5FEWA 3HPZA 4AXKA 3NL5A 1YXYA 3BW2A 3IGXA 5DBTA 5U4NA 2V2HA 3NPVA 1OHLA 4UMCA 2TYSA 5F1VA 4FNRA 1JCXA 3MJYA 3NQVA 3S5NA 2E6FA 5AC8A 4ADSA 4NNBA 3MHFA 4UCGA 4UFKA 1VRDA 5CPLA 1LLWA 2C14A 2JBMA 5AYZA 1JULA 3LBMA 4S2BA 1JUBA 4POCA 1FDZA 2OT1A 4L4LA 1SO4A 3GKFA 3G1SA 5F4SA 2O7QA 1JCMP 2H3DA 1TRIA 4FB7A 3TXZA 4PL2A 1NEYA 4FNPA 2QCFA 3PBYA 3UWZA 1ICPA 3L66A 4EVZA 3TQVA 2XN0A 3G1YA 1LOLA 1R30A 3I6RA 1XCFA 4GC4A 3MWAA 3B4UA 5L6UA 4MYXA 1SFLA 1YPIA 4UNLA 3G1DA 3SI9A 3E12A 4NZJA 3ZFHA 4ZMGA 1W3TA 5EY5A 1LYXA 5EMUA 1XBZA 4FNTA 2QCCA 5HJLA 3IEBA 1R47A 4O8RA 1GTHA 3LRMA 3TX9A 3B8DA 4QQ3A 2ZRVA 1GOXA 1SSGA 4JGDA 2WJZA 1OABA 1MXSA 3IIOA 5BMXA 3GDTA 1TO3A 4NXKA 3D0CA 1JCNA 3W1UA 1G7UA 1XL9A 4O19A 4MIMA 1K7FA 3O6CA 4XKYB 4NNCA 4UTTA 1P1XA 3L21A 3S5YA 5LNSA 3UZJA 3B05A 2FPTA 2G5WA 3IIXA 4BK9A 5FF3A 1TQJA 2GVJA 3TUUA 1O4UA 3NL2A 3S6DA 2NX1A 3ABRA 1JJKA 4HNTA 2JGQA 3W1LA 4DO6A 2NV1A 4OV4A 4CNOA 4RXGA 5LNWA 1KM0A 1FWTA 2OJPA 1OK4A 5K7JA 3PSVA 4NX5A 2WNZA 3S9YA 3MO7A 4ZQOA 2XN1A 5I3FA 2P10A 5KMYA 4BI5A 1OFAA 4CNNA 4CQ8A 3EXSA 2C6QA 1P0NA 3TAOA 3QRHA 3B06A 3H55A 3M47A 1EEPA 2X2GA 3EB2A 2VFFA 2RDWA 1KW1A 2VFDA 3K30A 3YPIA 3LCXA 5EA9A 5CPMA 5LNUA 3S1VA 3TMQA 3LB0A 3SY5A 4KWWA 2VFIA 3JRKA 2BXVA 4JTGA 2A7NA 3KHJA 3O15A 2DZSA 2VFGA 3DFOA 1WAUA 3N19B 3QJAA 1QPNA 2DZWA 4O54A 5CZSA 2ZRYA 2YZRA 3G1FA 3C2RA 4TO8A 3TJLA 4HN4A 4CCCA 3IVSA 3W9ZA 3P5YA 3B04A 3EWBX 3NPWA 2V82A 4ZVJA 1IXOA 2NXIA 3DHFA 5IBXA 4BWLA 1XDLA 2KZHA 4DO5A 3C0JA 3VE7A 1X6UA 3UNDA 2WSRA 1ZALA 1DBTA 4DEFA 1IXPA 4HNNA 2YPIA 1ADOA 1H50A 1TJRA 3MP5A 2R8WA 3G1HA 5LGZA 3SSJA 2NWSA 2H90A 2ZQ0A 2Q3OA 1T96A 3AO0A 1O94A 3QSTA 3W1AA 4JYDA 2RDUA 5TIMA 3TSDA 2VEKA 5LGXA 1X7FA 1F76A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3JVA A;  5XIA A;  4CN4 A;  4J27 A;  3M41 A;  3C3U A;  4FX6 M;  3FST A;  4Q33 A;  1CGW A;  2D1Z A;  2QMK A;  3EKL A;  4W7U A;  3FKK A;  4EOU A;  4JTR A;  3KZP A;  5A8O A;  2CHN A;  1KRC C;  3D3F A;  3MW7 A;  1S2W A;  5HAT A;  5M3W A;  1B3X A;  1KD0 A;  2C1H A;  3NXF A;  3V35 A;  4U3A A;  4DZI A;  3VCR A;  1WUE A;  5EML A;  4AY1 A;  3N73 A;  1RCO B;  3IJQ A;  5DX7 A;  1C8V A;  1YEY A;  2W62 A;  1DJI A;  5I3H A;  1JPK A;  1JGM A;  1I2R A;  3B3D A;  1OFO A;  4TXE A;  1EBG A;  1Z6K A;  4LAU A;  3S2C A;  2Y7E A;  2QPS A;  3EOO A;  4Z2J A;  3GXM A;  3HGS A;  1OM0 A;  4ROP A;  1PCK A;  4NJH A;  3G1X A;  5GNZ A;  1OX4 B;  5HDR A;  4ICC X;  3QLD A;  3TTE A;  3KE0 A;  1DVJ A;  3GWQ A;  3RPT A;  3VNZ A;  3WLT A;  1YTD A;  1Q3N A;  2QCM A;  3GY1 A;  3N6J A;  4HPH A;  3NNT A;  2UY3 A;  4L9X A;  3V4B A;  2J66 A;  4H3D A;  1ISY A;  4H8V A;  5JBE A;  3CYV A;  1W54 A;  1H7N A;  3SZ8 A;  1PWL A;  4AX7 A;  3BXW A;  3CAQ A;  1FWJ C;  3E96 A;  3PY2 A;  4Q4Q A;  4HHP A;  2ZWZ A;  1DPM A;  2OTD A;  2CES A;  5GJP A; 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