3CQ0A

Crystal structure of tal2_yeast
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
328
structure length
325
Chain Sequence
ATSSLEQLKKAGTHVVADSGDFEAISKYEPQDSTTNPSLILAASKLEKYARFIDAAVEYGRKHGKTDHEKIENAMDKILVEFGTQILKVVPGRVSTEVDARLSFDKKATVKKALHIIKLYKDAGVPKERVLIKIASTWEGIQAARELEVKHGIHCNMTLLFSFTQAVACAEANVTLISPFVGRIMDFYKALDYTAETDPGVLSVKKIYSYYKRHGYATEVMAASFRNLDELKALAGIDNMTLPLNLLEQLYESTDPIENKLNSESAKEEGVEKVSFINDEPHFRYVLNEDQMATEKLSDGIRKFSADIEALYKLVEEKMLEHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The crystal structure and identification of NQM1/YGR043C, a transaldolase from Saccharomyces cerevisiae
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative transaldolase YGR043C
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 134
structure length 325
sequence length 328
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2008-04-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3cq0A00
3ANYA 5F4XA 5G5IA 4IXXA 3E12A 1G4EA 3NVTA 1QOPA 1XCFA 2NV2A 3DXIA 3NAVA 1H1ZA 2JK2A 2ZTJA 3W07A 4I7UA 3LHUA 3NEVA 5EA9A 2J9ZA 3NQMA 3S1WA 3KVLA 3W7JA 1FWSA 3KHJA 5CZSA 4FNPA 3UZ5A 2J27A 3UNDA 1JQVA 5F4SA 2C18A 1ICQA 2P0OA 2ZRYA 4FHAA 3IEBA 2CFFA 1OFBA 4QM1A 1JVNA 4KFPA 2RH9A 3EWXA 4I7VA 3IIVA 1WOAA 1THFD 4RJEA 1TRDA 3QZEA 1WX0A 2ATSA 4XUGA 1FDZA 4AH7A 1GVFA 3NM3A 3PSVA 5CPOA 1GYLA 1L6YA 3MUXA 2HSAA 3KFTA 2DORA 5FF2A 5C2XA 3CIWA 3A22A 2Y7GA 5FF4A 1GWJA 4GBUA 4Z08A 2WNNA 1ME9A 1ZAHA 1PS9A 1H61A 4PL2A 1JCMP 1EPXA 1B4EA 3GAKA 1JCXA 3DKLA 2VFFA 1PHWA 4L4MA 4A2RA 4YLWA 5C5YA 1TPEA 3ABRA 1AL8A 1VLIA 2JKAA 4O1CA 2DZPA 3QFEA 2VC6A 3U2OA 4LC6A 1RQBA 3MHFA 1WBHA 3KRSA 3L5LA 4O53A 3MP4A 3ABOA 4MZ1A 3USBA 1SW3A 2WPBA 4QSHA 4R34A 4AHQA 4MJZA 3QRHA 4DELA 3V75A 1YPFA 1VHNA 3PUDA 4NJKA 1MZHA 3TAKA 1L6WA 3M9YA 3GDRA 3IVSA 1K3UA 4O1AA 3MHGA 3TJLA 1LM1A 3I65A 3ZWTA 1PIIA 2ZDRA 2NWSA 4FX8A 1IXPA 3OVPA 3B06A 4UFLA 1D3HA 2VXNA 3W71A 3A5FA 4WXYA 4ZQRA 1LRTA 2OX1A 4WD0A 1HO1A 3DI1A 3V1PA 2O7SA 1XC4A 1UJPA 2P10A 4E2DA 3LCFA 5LHFA 2ZA2A 1IXQA 2OJPA 1Q6RA 4K6AA 2EGZA 3GB6A 4KFOA 3NQFA 4S2BA 3W7QA 7TIMA 5D30A 1GEQA 5CZJA 3O63A 4H6KA 2ZZ1A 2ZRXA 1TJRA 1AK5A 1VPXA 2FPTA 1K02A 3NQ6A 2TPSA 1SO5A 3EX2A 2CWNA 5FF3A 3IGSA 5D33A 3HB9A 1W3TA 1OFDA 2EPHA 4OGZA 4UR8A 3VI2A 3IVTA 4NQ1A 1KM3A 4JR5A 3WK2A 3DKJA 4M7SA 5LNWA 4K8HA 3RU6A 3W7EA 1O95A 2H90A 5K3VA 4LC8A 2OZ0A 1PCWA 5AC6A 1TV8A 3JRKA 3DU0A 2CLFA 2GQ9A 4XTIA 2ZRVA 4IX2A 1FWWA 4MOZA 3T44A 4RV8A 2EAWA 3LLDA 1W3IA 4DBEA 3L0KA 3TUUA 4O11A 3HOJA 3B05A 4K8EA 1UCWA 2WSQA 1TPB1 4N6FA 2E1DA 3GZ3A 1JUKA 1C29A 3F1QA 3O6YX 1X6UA 4UTKA 3QF0A 4NNBA 3LTYA 2I14A 2TYSA 3FFSA 3P74A 4NJHA 3C2RA 4QNWA 4YCOA 3NGJA 1I45A 3LI0A 5H2ZA 4J9JA 1A5CA 3CPRA 3W9ZA 3SGUA 1ZAIA 3LHYA 3K30A 5CZ0A 2QR6A 4ZQNA 2WO5A 1F74A 3HO8A 1YXDA 3HQ1A 1IXNA 5AHFA 3N14A 4UC5A 2NV1A 3W3OA 4PCFA 4CCCA 1KV5A 2YFOA 1VHCA 3PBVA 4WJEA 1DJQA 1QWGA 2ZCGA 3Q94A 3PB2A 3S1UA 1OYBA 3P8IA 3GIYA 1YPIA 4RZ6A 5CG7A 3M41A 5D38A 2IQTA 4R53A 5BMXA 4Z1BA 4Z0JA 4Z0SA 3T40A 1EUNA 1OYAA 1ZHAA 3M6YA 1TB3A 4JTSA 1W5MA 2V81A 1SW7A 1M6JA 1ZY9A 1JR1A 4MJMA 3UD6A 1ZFJA 2ZTKA 4DO6A 5IM51 4HN4A 1ZALA 4BR1A 3HBLA 1P1XA 2ZA1A 2QAPA 3TROA 1SSGA 4MVAA 5HUPA 4FNSA 5FEWA 3P5YA 3BVJA 1X7FA 4G1KA 2CU0A 5DXYA 1A5SA 4ORMA 2H3BA 5HMSA 4CQ9A 4O16A 1P0NA 3IVUA 1W5QA 3O05A 2Z0IA 2YW4A 1YDOA 4O15A 4NVTA 5L9FA 4OU1A 4S2CA 1R30A 1WV2A 1Z42A 2X16A 2VFEA 1TYGA 3TMQA 2HMCA 2E09A 1KLZA 5AHLA 5TQLA 2VFIA 1LORA 3WFAA 1SZEA 3NG3A 4N9BA 1QCWA 2D73A 1O4UA 1XBYA 2V30A 1BWLA 4NUWA 4X22A 4CCDA 5KZEA 5CPLA 1OFAA 1OX6A 4Y8FA 2CLKA 4HPXA 4JTKA 2ZBTA 4B5NA 4GUFA 3W7NA 3PUOA 3H54A 5KMYA 3U8GA 3PWAA 2PRHA 3W1UA 1F05A 1S5WA 3BO9A 3PY2A 2C6QA 1NSJA 4QJ1A 2VFGA 1U5JA 3C2OA 3TCEA 1J2WA 3QMRA 1VRDA 2YCEA 3BW2A 2WOQA 3R2GA 2ZRUA 3DHFA 4TO8A 3E02A 2PCQA 3CT7A 3G1DA 1X1ZA 3P61A 1HG3A 3BARA 3LRKA 4JTEA 1L2UA 3NXFA 3B0PA 5LZLA 2Z6IA 5AYYA 3STGA 3O15A 3TIMA 3TX9A 5D2TA 3G0UA 3NZRA 4O4VA 1KM4A 3PBYA 3GK0A 4DPPA 2GQ8A 3IIXA 3HG4A 5D2XA 4LNYA 2E6YA 1F5ZA 1EWDA 1SO3A 4UMBA 4JEQA 3W2UA 5HR6A 3KRUA 3W2LA 2FLIA 1YDNA 3AJXA 4MY9A 3M16A 3MYOA 1UUMA 3ABQA 3MP3A 1OF8A 2NUWA 1VGAA 1BKSA 3HPZA 1OFOA 1R2SA 3PSWA 3TFXA 4NU7A 3CTLA 4UMAA 4C1LA 4MYXA 3DFSA 2G5WA 4K7VA 3THAA 4X3ZA 3NNTA 4QISA 1ME7A 3SECA 5BMWA 3NO5A 2XN0A 1KW1A 3QMSA 5EL1A 2W0UA 4POCA 5AOUA 3QC3A 3FYOA 2WSRA 3UXDA 5CZTA 3P60A 1NF7A 1I8JA 3MHUA 1W37A 3O06A 1PHQA 5F2MA 2YW3A 4C1KA 5D2WA 2G95A 4AF0A 1HUVA 1SSDA 1LBLA 4K37A 3N34A 3W1QA 3AO0A 4PH6A 1UBSA 2QCFA 3C2FA 1L6SA 1XBVA 3KVKA 5LHEA 4IGHA 3RFAA 3G1HA 2BLEA 4EIVA 2ZRWA 5EPDA 2FDSA 3MP5A 2C0AA 4BI5A 4NNCA 3E96A 1QPOA 2YZRA 5F4WA 3LHTA 3O07A 3LDVA 1T8XA 3BK0A 4O1DA 3HGJA 2J88A 3NPUA 4MPQA 4WY0B 5TIMA 4FB7A 2V2HA 3DI0A 5BRBA 3QMTA 4FX7A 1QPQA 5C6MA 4AAJA 4RXFA 4YXGA 2H8ZA 4AHPA 4GUHA 1QOQA 4IWWA 4AVFA 2HS6A 2OT0A 2Y70A 4Z1DA 2GOUA 1TPUA 1YXCA 4LU0A 1OFEA 4PEKA 4DPQA 3BLEA 2BWGA 1YADA 4CNOA 2QUTA 2RHGA 5DCDA 5AYXA 5K2ZA 3CWNA 3IIZA 3L65A 4NZFA 5AB3A 3N2XA 5CPNA 1ZAJA 1KFKA 1FQ0A 2NXIA 1QAPA 4ZZ9A 1JJKA 1F6KA 2FIQA 1FDYA 3G1XA 2WSYA 3H55A 2NXHA 4O18A 1F76A 2QUVA 3T55A 5MHBA 4GJ1A 1TMHA 3RF9A 3LERA 3W2NA 1K7XA 5K4ZA 2C1HA 2OCZA 4FIQA 5FEZA 3FEMA 4JTLA 4OWGA 4IOTA 4XBKA 3GNDA 4UTHA 3N2MA 2P1FA 3RMJA 1T96A 1LLZA 3B4UA 5I3JA 2HS8A 1EEPA 4UFKA 2E77A 1KFBA 4MYAA 4JX5A 3SZ8A 3G22A 1G6CA 3ZR4A 2E5DA 2A6LA 1J5TA 3M5XA 1YDVA 2B4GA 4O52A 3W7CA 1HTIA 1LROA 4GC4A 1WOBA 3BLIA 4CQAA 3E9AA 1XDMA 1SPQA 5HWJA 1K8XA 1FCBA 3C2EA 3MMTA 4EVZA 3EX4A 3W7RA 4BWLC 4WY0A 3TR2A 1OFRA 3W7PA 3W7LA 5IBXC 4QNEA 2E5CA 3ZWSA 2HTMA 3LCXA 4IMDA 3S5YA 3LOTA 3B04A 2E6AA 2RFGA 2WQPA 4DXVA 4RZ4A 1TPH1 3MJYA 4O14A 1XBXA 3I68A 1K7FA 3EXTA 3W84A 2Y7EA 1KLYA 4NJIA 1KFCA 3GNNA 1MEHA 1W5PA 1K8YA 2GUUA 4ZQCA 3G1VA 4MUZA 1FBAA 3QEZA 4QIUA 3CIXA 2QCNA 1FCUA 2GVGA 5U7SA 2WJZA 3PF3A 3G8EA 1WQ5A 2GJLA 3NA8A 1NEYA 1V5XA 4CCEA 3GXPA 4O12A 5AN7A 2ZYFA 3EWUA 1RQEA 3C6CA 3UWVA 2Q3RA 1LOQA 3BLFA 2UV8G 3HGRA 4LS2A 3W1XA 1I4NA 2YPIA 4FO4A 4RZ5A 4YL2A 1ADOA 3EWBX 4L4LA 4Y6GA 5FF7A 4TU1A 4UNLA 5LNRA 3DAQA 4PFMA 3T78A 1AMKA 5LSMA 1GVSA 2QJIA 3O16A 1KBIA 4A21A 4CNNA 1Q6QA 2B7NA 3M5YA 4H4IA 2B7OA 3LTSA 1WAUA 1RVGA 3C2VA 2A7NA 2C14A 3S5OA 3R13A 1W54A 3DGRA 3EWWA 4GNJA 3HMJG 2E6DA 3GAYA 3BV4A 1ZJIA 3M7WA 2XN1A 4O10A 3TC6A 4NX5A 1VH7A 5AHMA 1KV8A 4QITA 3W1MA 2FPVA 1XKYA 2J24A 3QSTA 1KFJA 1SU5A 3M47A 3S5NA 1T0OA 1WXJA 3UY8A 2ABBA 4JTGA 4A29A 2QDGA 3HG5A 3MBFA 1EB3A 3LCLA 3GVGA 4BK9A 1JRCA 3NQDA 2Y89A 3S1VA 3TDFA 3IIPA 4O0ZA 4ONVA 4OV9A 2BX7A 2A0NA 1P5BA 1UUOA 3L67A 3UWYA 3CEUA 2B0MA 3EWZA 4PL1A 4PA8A 2PURA 4UNKA 2Q3OA 3TNOA 4HT3A 3PR2A 3S42A 3RNDA 3LXCA 2CLLA 5LGXA 2V8ZA 3N9RA 4M7TA 4IMEA 1WBJA 3TC7A 4AHOA 3PBUA 3OVQA 3UPBA 3ATYA 5EBUA 3G24A 1FCVA 1H7NA 2DJLA 1QO2A 1AG1O 1KFEA 2JKPA 3DENA 5EYWA 1XXXA 2KZHA 3TKFA 4XBSA 3RK8A 2NUXA 2YYTA 3W70A 2QF7A 5I3HA 3HPXA 1D3GA 1VCFA 2QCLA 1H7WA 3QQ1A 4N02A 2QCCA 1CW2A 1DKWA 2QJGA 1FWRA 3VE7A 1L9WA 3W74A 2BXVA 3KOFA 3P8JA 4PTNA 4HNNA 4NZJA 3STFA 3BW4A 1S5TA 3UXAA 4E2BA 1RD5A 1HO4A 3D0CA 4LV4A 5K9DA 3C56A 3E49A 4FX6M 2GPTA 6TIMA 1BWKA 3W7DA 3W2MA 2TSYA 3P81A 1H63A 1KBJA 1JCNA 4JIPA 3GLCA 4XTDA 3W1LA 3W1NA 1SZGA 3SFKA 1QPNA 2OT1A 1IIGA 3B8DA 2A4AA 5LNSA 3NPVA 3L2IA 3KX6A 4NJGA 1GVOA 2ATMA 2Z6JA 3HGOA 2NX9A 3GDLA 1GTHA 5G2IA 2Y85A 2V0TA 4ICNA 5LNVA 5G1YA 4CQ8A 2DZUA 3BGJA 1LBMA 1NVMA 3W87A 4OT7A 3W85A 3W1PA 3TJXA 1MXSA 2NX3A 4N2YA 3IRDA 3WK1A 4JGDA 1ALDA 1Z48A 1TREA 2CZEA 5SWUA 1WYIA 4KWWA 2ZRZA 4YCPA 1SR9A 4FNQA 4ADUA 4PC8A 1K8ZA 4PODA 3W1AA 3TSDA 4GUGA 1XI3A 3IGXA 3QW4B 4N4QA 1SFLA 3W88A 1TO3A 4O19A 1DORA 1JUEA 3SSJA 4M6PA 4UTMA 1VR6A 1VYSX 2A85A 3F4WA 1EX5A 2CZDA 4ZMGA 2WKJA 5AC8A 2NZLA 4S1FA 1OJXA 1EUAA 4UTWA 3EX6A 5HWMA 1G69A 4NXKA 4JTHA 3A9IA 4NXSA 3SR7A 2ISWA 3GYEA 5T26A 1EP2A 3ELFA 2LLEA 2CLMA 1VCVA 1ICSA 1SQ7A 3OA3A 2A7PA 3S1XA 3NPXA 2FQIA 3NOEA 4RKAA 3W76A 3P82A 2OMAA 2TRSA 1GJPA 3LRMA 4IPJA 1TTIA 3CHVA 3FJLA 1JCYA 1EP3A 3NQ8A 3LGEA 4N9EA 3NL5A 4K39A 3S9YA 4WXZA 4AWSA 4O8RA 3P84A 1KM1A 2DJXA 4DF2A 1TPFA 1RR2A 3DHDA 5DLCA 2Q8LA 4EF9A 1LP6A 4RX0A 2A2IA 2AQWA 3G1SA 3H53A 1QDSA 1Q6OA 3TK7A 4AF0B 2V2CA 2RDWA 4RLIA 3SI9A 2NLIA 3NL6A 3L9CA 2A7RA 5D37A 1W8SA 2GVJA 3WJZA 1FCQA 3W7GA 2YSWA 3W1TA 4BI7A 4JXCA 2VEKA 3CB8A 2VFDA 4IMGA 3TQ0A 1F2JA 5KTLA 3VNDA 3FA5A 4N9DA 1TTJA 3G18A 5HWNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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