3CUGA

Cellulomonas fimi xylanase/cellulase cex (cf xyn10a) in complex with cellotetraose-like isofagomine
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
ATTLKEAADGAGRDFGFALDPNRLSEAQYKAIADSEFNLVVAENAMKWDATEPSQNSFSFGAGDRVASYAADTGKELYGHTLVWHSQLPDWAKNLNGSAFESAMVNHVTKVADHFEGKVASWDVVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGNGYIETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNSLYDLVKDFKARGVPLDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVRITELDIRMRTPSDATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGVTVWGITDKYSWVPDVFPGEGAALVWDASYAKKPAYAAVMEAFGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Probing the binding sites of Family 10 and 11 Xylanases with extended Oligosaccharides
rcsb
molecule keywords Exo-beta-1,4-glucanase
molecule tags Hydrolase
source organism Cellulomonas fimi
total genus 132
structure length 314
sequence length 314
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2008-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3cugA00
1EHNA 3U7BA 3CZ8A 1QNOA 4PMYA 5FIPA 4AIEA 4U5IA 1V6VA 4X0NA 3SUUA 3DHUA 3DC0A 4JKMA 4WK9A 2E0PA 3ARWA 5I23A 1G01A 3CIVA 2WYSA 4DWSB 2CXGA 2DSKA 2ZOXA 3FN9A 2OYKA 2VTFA 1UQYA 3SEPA 4W7UA 5HPOA 3VD7A 1B3WA 3CHDA 2CETA 5IFTA 4P8UA 1TVPA 2JE8A 4Z2KA 2VX7A 1GOMA 1UWTA 2WC7A 1MW1A 2JF7A 1B30A 2Y8VA 1JZ5A 5CXPA 3B9AA 1UQZA 1KGUA 4N42A 3VPLA 5I0DA 3EMZA 3BAWA 2XIBA 4W87A 4AEFA 1B3XA 2E9MA 1VFUA 3W0KA 3GXFA 4AIOA 3SUSA 4KH2A 1C7SA 1CDGA 1FH8A 4PEEA 1G1YA 2V3EA 2A3EA 4JIEA 3PBGA 2QLYA 2UY3A 1H1NA 3U57A 5EFFA 4NF7A 4UQCA 1JZ6A 2PBOA 4GQRA 2BVYA 4W89A 3WMSA 1XCXA 2WHLA 3AHVA 1HVXA 2UY5A 3WD4A 1CXHA 2XFRA 3PTMA 3GZAA 2CBJA 3ZR5A 1US2A 2VZUA 2CKRA 5CSUA 1WKYA 1MYRA 1PZ3A 1B3YA 4D1JA 3CUIA 2WAGA 3IJ7A 1V3KA 5A6BA 1WZKA 3HU7A 4LXFA 4P8VA 1I1XA 4MDOA 2J7DA 3RIKA 4PMRA 1J9YA 4NZCA 3W6LA 4D6CA 1TFVA 1RH9A 3HJEA 2WHKA 4W5UA 5LA2A 2GK1B 1NWSA 3FY1A 4BZYA 5C71A 3THCA 1M03A 2G3NA 4QLKA 3BSHA 1CXLA 1QI3A 1JFHA 1HT6A 1MWOA 4L4PA 4LYQA 4EAMA 3K46A 3ZM8A 1KR0A 3SUVA 1LL7A 1PPIA 4GZEA 1UYQA 4TX6A 3PTQA 3VMPA 5BXSA 2VCCA 1VJZA 2PI6A 2YLAA 2GDVA 4UQEA 3NYDA 3O9NA 1LJYA 3U7VA 1GQLA 4AZGA 1K9EA 1B3VA 5DMYA 4GZIA 4W7WA 3VDCA 3WEZA 1OGGA 5M17A 5A8OA 4CN4A 3N15A 1NP2A 3L4YA 1JDCA 1BYDA 3E1F1 3K1DA 3KL3A 5I3DA 5KZ6A 3IJ8A 5D9PA 4AD5A 3BAYA 3GXIA 1VAHA 1GHSA 1E72M 1V0NA 4PUDA 1R86A 3CBWA 2V5DA 3MANA 1W1VA 2CIPA 5JIWA 4JKKA 1XH2A 2DH2A 2OYMA 1QI5A 2CPUA 4PYSA 1E1FA 2BY2A 4MAZA 5I78A 1KGWA 4KRTA 1TA3A 2DDXA 3HMCA 4AIUA 3WH7A 4HOWA 3L2MA 1E1EA 1HX0A 4BQ5A 3EDKA 3T2PA 2AMGA 2BY1A 3RM4A 5CQ1A 1IV8A 1KXQA 3UG4A 3AS2A 5A6AA 4QLJA 3BCDA 1BLIA 2DH3A 1YQ2A 4E2OA 3WQ5A 3KWXA 3A47A 3OIHA 2W66A 5GNYA 2CBVA 1WP6A 4B3KA 1H4PA 3F5LA 3GXMA 1Q4NX 1BYBA 3MSDA 1LL6A 4F9DA 3M46A 3BAXA 3FNDA 1E56A 3WDQA 4CU6A 3BAKA 4BQ2A 3NSMA 4AC1X 4CD5A 3PZOA 1M04A 4D6IA 5BWFA 3T2OA 2GVYA 4GI9A 3AXHA 5KEZA 1WO2A 3AISA 1UUQA 2AAAA 1V6WA 3W27A 1VENA 1JXJA 1UD8A 4CD8A 4S3KA 4WSKA 5A94A 1X6NA 2DSZA 4JZ5A 3ZSTA 2ZWZA 2F2HA 1UHVA 1WZAA 2XFYA 3AMKA 1MW2A 3GM8A 4PMUA 3KEHA 3WBEA 1NQ6A 1XGZA 3W28A 4ZEPA 4FK9A 1O6IA 3CUFA 3WQ6A 4XV0A 1V3MA 2QPUA 5EBAA 4ATDA 5EMYA 3T09A 1YHTA 1ZU8A 2MANA 3AIRA 2VZVA 4WKAA 4UCFA 5DF0A 1SMDA 4Q7NA 1EQPA 2WHMA 1A3HA 3TA9A 2V5CA 4PTMA 3SCVA 3N17A 4WKFA 1H09A 5F7UA 4V27A 5CJ5A 1MW3A 3BH4A 1LG1A 5EB8A 2PF0A 4AWEA 3WF2A 3W29A 4OKDA 3WDRA 2YL9A 1AQHA 3UG5A 4XZWA 4KMQA 3GH4A 3B9DA 4J3WA 5IHRA 2HISA 1EOMA 1XSKA 3VIHA 4PSPA 5I79A 4JFWA 3VIFA 2WPGA 4E4PA 2WB5A 4HOXA 1CIUA 3VDBA 1ISXA 3DECA 1UA3A 1BF2A 1CXEA 3AS3A 4CD6A 1AMYA 4P7RA 3VIPA 1KQYA 4KGLA 1W9PA 4PMVA 4GI8A 4ACZB 4GO9A 3WH6A 4DWSA 2W92A 2D22A 3K4AA 3AZSA 1E6SM 1KXHA 3W82A 1W3HA 2RGMA 2WHJA 4A3YA 5BCAA 3I3DA 2VCAA 1OD8A 1J0YA 3N11A 1DTUA 1B1YA 1J0JA 2WK2A 3LPOA 4DUXA 3WF3A 4XZBA 1PEZA 4JL1A 3ZOAA 3ZIZA 1NP0A 1EDQA 4GPNA 1U2YA 3N13A 1OBAA 3PZNA 3ARQA 4TVCA 3POCA 1WDQA 4V2XA 1ISVA 3THDA 4XB3A 4ZE4A 2OLHA 1JFXA 1QHOA 4AYSA 3CH9A 2A3CA 4FMVA 2PWFA 1E6XM 1L8NA 2EPOA 2ZX9A 3FAXA 3MV01 1XSIA 3WMCA 3VDHA 3VIGA 2ZICA 3VM5A 4GIAA 1V6YA 5CLWA 1G0CA 2RGLA 4BF7A 3W37A 4KWUA 4LYPA 4LPCA 1C92A 1OM0A 1UWUA 1FP9A 1WNOA 4M56A 3APGA 1OINA 1GVYA 1W2VA 2WVUA 3D3AA 2J77A 2D0GA 3TTOA 2DIJA 4MPKA 4QCFA 3VU2A 2VQTA 3A4WA 2ZUUA 4D6DA 2XVGA 1VFOA 1QPKA 1UD3A 2VO5A 3A3HA 3WSUA 3A6OA 2VJXA 1XCWA 1Y7VA 1VBUA 1UD4A 1MQRA 1LQ0A 3K8LA 3J7HA 5A6SA 3UR7A 4JAWA 1XYZA 2WMIB 3QHNA 2ZUMA 4QFUA 3PZIA 4FLQA 2YDRA 3L2LA 4HA1A 3EYPA 4F9JA 1KBBA 1VFFA 3BLKA 2HVMA 2Z1SA 3VX1A 4U3AA 1OT2A 2GK1A 2OSWA 4J3TA 1TG7A 1W9DM 1UH2A 3II1A 2BY0A 2EJ1A 4DM1A 1ISYA 2C7FA 1GORA 4J3UA 1E0VA 3WNNA 3VNYA 1H0GA 2O9PA 1DWIM 4M80A 4YHGA 2G3MA 1UOKA 4IPLA 3VGFA 3AMLA 3BMVA 1E43A 1FFRA 2J7FA 1CGTA 2QV4A 4HTYA 1G9HA 1C8XA 4GZJA 1UKQA 3OGVA 1GCYA 3QR3A 3UERA 1Z32X 1OWQA 1UWRA 5DT7A 1J01A 3CZEA 1E70M 1C8QA 1CEOA 1W91A 3PZTA 3VTRA 2OWXA 3WNOA 1DEDA 1E73M 4CVWA 3UR8A 2BV9A 2A3BA 2WCSA 2EPMX 3SCOA 5A2BA 4A3HA 1CTNA 1SR0A 1GW1A 3VDAA 4J7RA 4WJXA 2XYLA 4HU0A 4LGXA 2VX5A 3I3EA 1UKTA 4HPGA 1OGBA 5FL1A 1J0HA 3WH9A 2G41A 3BCFA 5FD0A 2ZX7A 2C8NA 3NJ3A 3HN3A 1UR8A 3GNRA 4OIFA 3RMEA 1HP5A 2EXOA 3SCRA 4TVDA 2VURA 3FXYA 3SCPA 2NSXA 1RP9A 1V3IA 1KXVA 3WNPA 1JIBA 1RD6A 2DPEA 1GJUA 1FP8A 2BXYA 3VIOA 3WF1A 2JFEX 4XX6A 2V3FA 1B9ZA 1VFMA 4CN1A 2VMFA 4GO8A 3PZQA 5CG0A 1CXFA 2QMJA 4NRSA 1V0KA 3ZSSA 3LPPA 5D9OA 3DYOA 4P7NA 4PTXA 2VZSA 2VQUA 4GKLA 2E8YA 1EDGA 1UZ4A 4GQQA 3KL0A 3WUEA 4H7VA 1GQIA 4CVUA 4IISA 2DSWA 1VJSA 5A8MA 1VB9A 1ISZA 1C93A 4TX8A 1EO5A 2XSAA 1KBKA 3TTYA 4UZSA 5E0CA 1OB0A 1QBBA 3WBAA 1W9UA 5E6ZA 1CLVA 2FHBA 5LYRA 2VZOA 2VT0A 3OGRA 3O6AA 1E3ZA 1OIMA 3OLEA 4AD4A 4FF5A 4WSJA 1KQZA 3VIKA 4UZUA 2WZEA 1IZJA 2GJPA 1C91A 1JGIA 4HZ8A 9CGTA 3AIEA 2J62A 1MFUA 3MMUA 1NARA 3EMCA 1JAKA 3BAJA 5A8NA 1OT1A 5D9MA 4PMXA 4D1IA 2XWDA 1WPCA 3WIJA 1VEOA 5AYBA 4GI6A 2VZTA 3POHA 1BPLB 1E71M 1WZMA 4CD7A 4UFIA 4M81A 4QP0A 6TAAA 3SURA 3K8KA 1TMQA 3MSGA 4EE9A 3VIIA 5ABFA 1JXKA 3L4WA 1GPFA 1F4HA 1ISWA 1J11A 2YLLA 3VMOA 5A3HA 4X9YA 1BGAA 3N9KA 2PWEA 4ACZA 4ZE5A 1J12A 2F8QA 1DWJM 1KWGA 1W1PA 2YKKA 1UWIA 3WDHA 1V0LA 1CWYA 5A6MA 2WLZA 1H2JA 4R5EA 1O7AA 1TE1A 2D20A 3ARZA 4MADA 5BXPA 1QI2A 1FH9A 2VUYA 1FA2A 1A47A 4H41A 3CPUA 4UFKA 2CKSA 2XVLA 3T2QA 2JEQA 2WSPA 2J4GA 4OJYA 1BG9A 1K9DA 2D2OA 2PB1A 5I24A 2YOCA 3ZJ6A 2W67A 3VIMA 3ARPA 4MB3A 4WKHA 2VRJA 3EDEA 2ZXDA 3K4DA 1BTCA 5DT5A 4YN5A 3VINA 1V6XA 1HF6A 3AIVA 8A3HA 3MV11 1NWUA 4CD4A 1WE5A 1QNSA 1B2YA 4J3SA 1GNXA 3ARSA 4BS0A 3WH8A 4QAWA 1JYWA 1U30A 3EDDA 1FFQA 4HMEA 5I6SA 3AIQA 1AQMA 4BA0A 5GPRA 1KGXA 2YDSA 4H8HA 1S46A 4JCLA 1I75A 3MKKA 4M1RA 2WBGA 1TUXA 2XIIA 5CSYA 1W3KA 1NOUA 1OSEA 1JYNA 1UWSA 5IHSA 4HMDA 1NM9A 2BHYA 4P7LA 5A2AA 1I1WA 1UKOA 1XRVA 5A8PA 2DQXA 2WMIA 4PTVA 4AISA 3VIJA 4AZ5A 4L4OA 2BS9A 5DO8A 3OA5A 1HVQA 5AC5A 1HKJA 3SCNA 1PZ2A 3GYCA 3BMWA 1E4LA 3FHQA 1MQQA 1V3LA 4D6JA 1EXPA 4U3CA 2VC9A 4RL3A 2V3GA 3ARVA 2XM1A 3QGVA 4BCEA 2UWFA 3A4AA 1H49A 1PAMA 2NT0A 1OD0A 5JUVA 3GXDA 1ESWA 3SIMA 2FHFA 4MTVA 1WDRA 1FHLA 3IANA 4HA4A 5AY7A 4PCSA 1E5JA 2IUZA 5CPSA 3AHYA 1EA9C 4Z2LA 3WD2A 2WBKA 4FLRA 4U2YA 1R87A 2J78A 3TOPA 1V02A 3WQWA 4OBRA 2FGZA 2ZWYA 1V6UA 4UQAA 1CENA 1OIFA 2BXZA 3AXXA 3SCUA 5AC4A 1UH4A 3MS8A 2UY2A 1PX3A 3ZQ9A 2GUYA 4AEEA 3TP4A 5E6YA 1EO7A 1H41A 3AS0A 2O92A 1JD7A 3QOKA 3A4XA 2WW5A 2E8ZA 3G6LA 1DHKA 4TUFA 2PC8A 2ESCA 1XHGA 2XHYA 3WMBA 1GOIA 3MUIA 2EPKX 1JF5A 2CCRA 5A8QA 1C3FA 1QOXA 3AXIA 4K68A 1JZ3A 2WNWA 2G3IA 1EIBA 3ZJKA 4KRUA 1J18A 3CZKA 4Z2GA 1E6RA 2BY3A 3L4UA 3WN6A 3VD4A 2WC4A 3OLGA 2DIEA 4MNJA 4MAVA 3CGTA 3VM7A 4AMCA 5ABFB 4JCMA 1N82A 2EO7A 1KCLA 1JD9A 3WELA 3EDJA 3TTSA 3PZ9A 2ZX6A 3UCQA 3IJ9A 3WUGA 1HP4A 1ZB5A 1XYFA 3W53A 4DUVA 1CYGA 5D4YA 1GQKA 4P7OA 4S3JA 4B15A 5A6LA 3UG3A 1C8YA 1HXJA 4HPHA 2VX4A 1JNDA 3M7SA 3PZGA 3WFLA 4UTFA 4W93A 3ARXA 1JYVA 4AD2A 2WLYA 3AOFA 5D9NA 4QDMA 2A3AA 4F8XA 4PMNA 2V38A 4CKQA 4RE4A 4AXNA 3IAQA 1Q6FA 2QHAA 2X2YA 4HOZA 1P6WA 3W24A 2VCBA 2ZUSA 1FHDA 6A3HA 2Q8XA 2CITA 4UFLA 1HJSA 1WZLA 3CUHA 2JALA 4KGJA 1VRXA 1KXTA 1WDPA 3WNKA 1M01A 3KL5A 1CXIA 2DEPA 1ECEA 1BSIA 3WUBA 1WCGA 2BVTA 2OYLA 3MUAA 1UZ1A 5E9AA 3VGHA 1JYXA 3W4RA 4AZIA 2DT2A 3AHTA 3BC9A 1GVIA 1VEPA 1XD0A 3W81A 1GUVA 1JF6A 3VUPA 3UETA 2XG9A 3ZJ8A 1F4AA 1RPKA 3WUFA 1CGWA 2X05A 2D0FA 4PMOA 4AY1A 5BROA 1EGZA 2E3ZA 1D7FA 1LWHA 4Q22A 4ZXLA 2XWEA 2EQDA 4RE3A 1ZBKA 1J0ZA 4B9ZA 3AZRA 3GH5A 1ZBVA 2QMKA 1QHZA 1IT0A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1EHN A;  3U7B A;  3CZ8 A;  1QNO A;  4PMY A;  5FIP A;  4AIE A;  4U5I A;  1V6V A;  4X0N A;  3SUU A;  3DHU A;  3DC0 A;  4JKM A;  4WK9 A;  2E0P A;  3ARW A;  5I23 A;  1G01 A;  3CIV A;  2WYS A;  4DWS B;  2CXG A;  2DSK A;  2ZOX A;  3FN9 A;  2OYK A;  2VTF A;  1UQY A;  3SEP A;  4W7U A;  5HPO A;  3VD7 A;  1B3W A;  3CHD A;  2CET A;  5IFT A;  4P8U A;  1TVP A;  2JE8 A;  4Z2K A;  2VX7 A;  1GOM A;  1UWT A;  2WC7 A;  1MW1 A;  2JF7 A;  1B30 A;  2Y8V A;  1JZ5 A;  5CXP A;  3B9A A;  1UQZ A;  1KGU A;  4N42 A;  3VPL A;  5I0D A;  3EMZ A;  3BAW A;  2XIB A;  4W87 A;  4AEF A;  1B3X A;  2E9M A;  1VFU A;  3W0K A;  3GXF A;  4AIO A;  3SUS A;  4KH2 A;  1C7S A;  1CDG A;  1FH8 A;  4PEE A;  1G1Y A;  2V3E A;  2A3E A;  4JIE A;  3PBG A;  2QLY A;  2UY3 A;  1H1N A;  3U57 A;  5EFF A;  4NF7 A;  4UQC A;  1JZ6 A;  2PBO A;  4GQR A;  2BVY A;  4W89 A;  3WMS A;  1XCX A;  2WHL A;  3AHV A;  1HVX A;  2UY5 A;  3WD4 A;  1CXH A;  2XFR A;  3PTM A;  3GZA A;  2CBJ A;  3ZR5 A;  1US2 A;  2VZU A;  2CKR A;  5CSU A;  1WKY A;  1MYR A;  1PZ3 A;  1B3Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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