3DFOA

Dihydroxyacetone phosphate schiff base and enamine intermediates in d33n mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
363
structure length
350
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAANESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSSNHAY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Oryctolagus cuniculus
publication title Charge stabilization and entropy reduction of central lysine residues in fructose-bisphosphate aldolase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
total genus 140
structure length 350
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2008-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3dfoA00
2WSYA 2DZUA 3FYOA 4QISA 3SSJA 2GUUA 1TYGA 4AMAA 2HS6A 5I3KA 4CCEA 4FEZA 3QSTA 2ZZ5A 2E6DA 4QITA 5F2MA 1JCLA 3R2GA 1PHQA 3BG5A 1PHWA 1GJPA 3LX9A 3W2MA 1XI3A 5TQLA 1R2RA 1EA0A 1GG1A 1A5BA 1N55A 3C2EA 4K38A 5HR7A 3W9ZA 1Z42A 1HO1A 3ANYA 3DKLA 4GXMA 1UJPA 4MIMA 1AW5A 5D33A 1GQNA 4LTSA 1A50A 1BWLA 3M1ZA 3M6YA 4BK9A 4NUWA 1C29A 4MZ1A 1CW2A 1B3OA 3IVUA 1DJQA 5EMUA 4NVTA 3R13A 1ZHAA 2JGYA 1VRDA 4KFPA 5LNUA 2QCGA 4HPJA 4ORIA 2OMAA 1I45A 4N4PA 2E77A 1NFBA 1TV8A 4AHPA 3U6WA 1QO2A 5CPLA 1ME7A 1HUVA 4N6FA 3SJ3A 4N9DA 4L4MA 3W84A 2I9EA 2QR6A 3QYQA 4ADUA 1ME9A 4YCOA 4HPXA 1KM6A 1SO4A 2I1OA 1NAL1 4WXZA 1KFCA 4AVFA 4LS2A 4OV9A 1BEUA 4H4IA 1ZALA 2ZDRA 2GOUA 4A29A 2Y61A 1ZFJA 4UCGA 2QJIA 1JCJA 2FPYA 3EX2A 1YLVA 3C2RA 4OWGA 4WY0B 1F76A 3PR2A 1LBLA 2RH9A 3UZ5A 4K6AA 2E5BA 4FXSA 3GDLA 3PBUA 5BMWA 3B0UX 3TQ0A 3JR2A 3WK3A 1XDLA 3NM3A 1ZNNA 1X8FA 3LCFA 3B4UA 3HMJG 5HJLA 2GQ8A 4IGHA 1EP1A 1W3IA 3MI3A 2X1RA 3KVMA 2G95A 1HG3A 4NJIA 2HS8A 4E2DA 1TMHA 2E1DA 1Q45A 3HOJA 5LGXA 4TX9A 3C52A 2OJPA 3BVJA 1YPFA 4BI5A 4FXRA 5KSWA 1T8XA 3O6DA 2C15A 1GVQA 3ZWTA 1Z41A 2J88A 3O06A 1I2NA 4U28A 3P84A 5HUPA 1GPWA 4RXGA 4GUHA 2Q3RA 4UFMA 3HGSA 1LM1A 4I7WA 2A7PA 2J6XA 4MYXA 3F1QA 3KVJA 2LLEA 1QPQA 3C6CA 3PULA 2DORA 3QJAA 1EUAA 4K36A 3E0IA 1WBHA 2QAFA 4QIUA 4N4QA 2ZBTA 1VYPX 5G1YA 1TPVA 2QCCA 1L9WA 1TPUA 3PB2A 3W85A 3NR0A 1UUOA 1FBAA 2ZRXA 3QMTA 1F6KA 3PVFA 5HWMA 3IVTA 1W0MA 4PL1A 3THQA 5LZLA 1TPB1 1FDJA 4FX6M 5TBOA 3VE9A 1G4TA 1PCWA 5D38A 3IIOA 3GR7A 4HKPA 4IXHA 3MUXA 4ZQRA 3ATZA 3NAVA 2NUWA 4EOUA 1BTMA 3NQEA 3GIYA 1SZGA 5DN1A 1B9BA 4JX5A 2P10A 3BGGA 5D2VA 3C2VA 3EXRA 1J5TA 1SFJA 4UFIA 4NX5A 2V30A 3NA8A 1UB3A 4IMEA 5AYZA 2O7QA 1YXYA 2VELA 1QAPA 1OF8A 3OVRA 4JTJA 3UZJA 1CX9A 1G6CA 4O18A 3W1NA 3TJXA 1THFD 5I3IA 3O16A 3RK8A 3VE7A 4AXKA 1G4EA 3NQ8A 2ALDA 3IIZA 5HR6A 1G69A 5G4EA 3W07A 2PRLA 1EB3A 4H6KA 2H3DA 4AF0A 2V5LA 4UTWA 1PV8A 5EBUA 5DXXA 3EX4A 3F4WA 1TPC1 3HPSA 4MJZA 4PC8A 1JR1A 4FNSA 5LGZA 4Q32A 1W5QA 1YADA 4IQLA 4BR1A 2C0AA 1OX4A 1TPEA 4DF1A 1Z48A 1DHPA 3CTLA 2JGQA 1P0NA 1RR2A 2ZYFA 3GLCA 3TC6A 1JRCA 1TB3A 3QEZA 2JBMA 2FQIA 2Y89A 2WSRA 3W23A 4MJMA 3N19B 3SGZA 3T55A 1O94A 3UWQA 3DFTA 3W1AA 2QCNA 3QM3A 3W2JA 3PUDA 1VYRA 3W2UA 3LV6A 1G7UA 4FIRA 2FIQA 2ZTJA 3PSWA 4OT7A 3CT7A 3SR7A 3DFQA 3PWAA 3S5NA 3HG2A 2QCMA 2VEKA 3A23A 3SW6A 5D30A 4HN4A 1JCMP 5DELA 2CW6A 3A5VA 4O1DA 4E2BA 4UNLA 4K8EA 5D37A 1SW0A 2ZZ6A 3LRKA 1TIMA 5AB3A 1QNVA 4O0KA 4LC8A 3UYCA 3FIGA 1TV7A 3IEBA 2E6YA 4O11A 2JKPA 1Q3NA 4XBKA 3W7JA 1R2TA 1CI1A 2NX1A 2VXNA 4JTSA 3W87A 5F2LA 2VFHA 3LCLA 1LLZA 3TU9A 1F2JA 2ZCGA 1GG0A 3TUUA 1I2QA 1NF0A 4PCFA 3DHFA 3I7QA 3TSDA 1W8SA 3NQDA 3L0NA 1VS1A 3M9YA 2E6FA 3L65A 3Q37A 4DO6A 2DZVA 2YZRA 1FWRA 3UPWA 5AHMA 1KFKA 1MXSA 3LHTA 2OT1A 3W22A 4R34A 4W9TA 1RQHA 1K7XA 5DBUA 1FWWA 4A3UA 2VEMA 3G1YA 2GJNA 4I7UA 4GNJA 3C61A 1O60A 1JRBA 4H3DA 2CFFA 2PURA 5CPNA 5DY2A 6TIMA 3NZRA 3EWBX 4TMBA 3MHGA 4DQWA 3C8FA 1UBSA 6ALDA 1YTKA 3K30A 2QCHA 5A5WA 4UTJA 4UMCA 4EIVA 1TPDA 3HG3A 3L5LA 3W6YA 2YCEA 1PE1A 1V7YA 3GZ3A 3PG9A 4DEFA 1QWGA 1IF2A 2YPIA 3CU2A 4LS0A 3A22A 4P2VA 4QJ1A 2X1UA 1YDNA 5CG7A 5IBXA 3MBDA 1VZWA 1B4KA 5G2IA 4NXSA 1JUEA 1MEIA 4POCA 4N6EA 3TXVA 1TPWA 2YX0A 4IXXA 4WD0A 4Q33A 1K8XA 1OFEA 2XN1A 4Q4KA 2WNNA 3FEMA 4WOQA 4O14A 1KBIA 3WK0A 3TK7A 5LNSA 4X3ZA 3HG4A 4O1AA 3QSRA 4NNBA 4E0CA 3PUOA 5A8GA 2Z0IA 3GAKA 1X6UA 5G5IA 3NQ2A 3TCEA 2BXVA 3BLIA 1HL2A 1TJRA 1XBXA 2CLMA 3W7RA 3R12A 4JTGA 3P61A 5D2XA 5BNKA 1TO3A 3MP4A 3C4UA 1M7OA 2OZ0A 4TIMA 4GUJA 3UXDA 2EHHA 4IMGA 3TE9A 2V9DA 1Y0EA 1XUZA 2TYSA 2G96A 1TTJA 5I3JA 1XKYA 4C1LA 4ZZ9A 3MHUA 3U8GA 2RDUA 4UTIA 3QQ0A 5FF2A 1Q6QA 1B57A 3I7SA 3W1XA 4CCCA 3W7EA 3INPA 3NQMA 3QW3A 1DQXA 4ONVA 3KVKA 4PL2A 5K4ZA 1Q6OA 3TIMA 2ABAA 1PIIA 4NT0A 5DCEA 3PB0A 4UIOA 1NVMA 4O54A 4LVBA 3W1RA 1OHLA 2V2HA 4FNRA 4LVGA 5C55A 3E49A 1IXOA 5U4NA 5LNRA 4HSOA 1R2SA 4RZ4A 3M7WA 3N34A 1M7PA 2GQ9A 1LRTA 1ZY9A 2H8XA 1TTIA 4O16A 4UR8A 4HNUA 1IXPA 1IGSA 1DORA 3FKRA 5E93A 2RKXA 1VCFA 5SWUA 3FKKA 1KA9F 3BLEA 2V0TA 2W6RA 1YYAA 1DQWA 3W74A 2H90A 1SO3A 1TV5A 3W7IA 2UV8G 3BK0A 3NEVA 1AL7A 1FWNA 3YPIA 4XQ6A 1KM3A 4BI6A 1IXNA 1O5XA 3E9AA 3LTYA 1FCVA 2V2DA 4O17A 1EWDA 5LSMA 3IVSA 4FNTA 4KWVA 2J24A 4LY8A 3W7HA 2WSQA 8TIMA 5L9FA 2BSLA 4D2JA 1I4NA 3BO9A 4TU1A 4E38A 3W72A 5KINA 2PC4A 5LNVA 4LV4A 4O19A 2PCQA 1RQBA 1H62A 4N2YA 3DH7A 5HMSA 2DZPA 3L5MA 3LI0A 2WNQA 4Y9AA 3TROA 4I9AA 1M5WA 3OVQA 4JDBA 1S3HA 2DJLA 3I6RA 1VC4A 4AWSA 5LKYA 1JULA 3EKZA 1ZJIA 4XTDA 2QCLA 2A21A 3M5ZA 1Z44A 5CPMA 5C2XA 1OF6A 1RVGA 1P1XA 2C19A 4MY1A 3VCRA 1DJNA 1YPIA 2WJZA 5K9XA 1XL9A 3L9CA 2NXHA 2B7PA 2NV1A 1GYNA 1A5AA 1H7XA 1OFBA 3I65A 2B7QA 3Q94A 1LRNA 3V75A 2FFCA 3MYOA 5DLCA 4ALDA 1RV8A 2CLHA 5DCBA 3GKFA 1VHCA 2GPTA 3TNOA 3WJXA 3JRKA 3MBFA 3G18A 1ME8A 1WAUA 2CLFA 2YSWA 3TX9A 4WOZA 1FXQA 3MP3A 3W76A 3F4NA 3TV8A 1GWJA 1U5JA 3N9RA 5I3HA 5FESA 1KLYA 1XBYA 3GDKA 2RDWA 5KMYA 2DZTA 2Q8LA 2AGKA 4JTFA 4NNCA 1J4EA 4YLWA 3LCXA 2QF7A 3W7LA 1PL9A 4OE7A 1KBJA 5FF7A 2VFGA 4HHPA 4FB7A 2B0MA 7TIMA 2Y62A 1G4PA 3L68A 3CIXA 1EEPA 2CLEA 2QCDA 3ABQA 4JN6A 1K02A 4AWTA 2J27A 3C0JA 3DZ1A 4UC5A 3TAOA 2ZZ2A 5CPOA 5GVJA 3QFEA 3L67A 3KRZA 3NVTA 1ICQA 1ZAIA 3KRSA 3M44A 4WX2A 5FI8A 1ML1A 3TSBA 2CLOA 3G0UA 3GAYA 3O6CA 4YMZA 5HWNA 3VNDA 4AB4A 5G2WA 3P7YA 1RPXA 3NL5A 1FCUA 1KM5A 1FUYA 1OFRA 1W5PA 1H7PA 4XKYB 1MSSA 4Y90A 2I14A 2VFDA 2ZQ0A 1TTQA 1LRQA 2QCFA 1W56A 4ICNA 1TQJA 4O1CA 4M7TA 3W7QA 1J2WA 2V82A 3HB9A 1IIGA 1OYAA 2E68A 4M5PA 1XC4A 5AYYA 1EPXA 3CQ0A 3ATYA 3M5VA 3Q2DA 1VYSX 1ZAHA 4O1BA 3C3NA 4L4LA 3SIZA 4I7VA 2ZFAA 1OX6A 4S2BA 3PSVA 5EPDA 3W7NA 2YGYA 3O1NA 4RJEA 3HGOA 1LDCA 3N3MA 4CCDA 2A0NA 3FA5A 5AHIA 3HGRA 5CSSA 3TXZA 3IGXA 4O57A 2DZXA 5MHBA 2O7SA 4NNAA 1AG1O 4JNMA 1G4SA 2JKEA 3CWOX 4U4MA 4ZQCA 4O28A 3B05A 3THAA 4IX0A 4ZL1A 2ZZ1A 1EP2A 3DFOA 2TRSA 1UASA 2AAMA 3DI0A 4AHQA 3EWWA 3GYEA 4FX7A 4O13A 1XFBA 1O5KA 1YTDA 3GK0A 3SECA 3STCA 2FJKA 3SFKA 4YCPA 3NPXA 4K39A 5AHNA 1UUMA 1LOSA 2Y70A 4MYAA 1YDVA 4R33A 3P8JA 5K9DA 1R30A 1HFBA 4PH6A 2Y6ZA 5IM51 3RMJA 2CZDA 4C1KA 2YW3A 1XXXA 3G0XA 1SQ7A 2ZTKA 3T7VA 2CLKA 1EWEA 1LP6A 5U7SA 3SI9A 2QDGA 3W7CA 4NZFA 3EWZA 5HINA 2QJHA 1SO5A 2D73A 4Z1AA 4PA8A 2Z6IA 4UTTC 3LI1A 4R7JA 4N9EA 4YL2A 4O53A 3A9IA 1WQ5A 4PODA 1H63A 2F84A 2ISVA 4O8RA 1H7OA 2PE4A 4YWIA 4UFJA 4YXGA 4QQ3A 1I2OA 5F4WA 3QC3A 1OYBA 3B8DA 3NYZA 3EX6A 3DU0A 3S6DA 4LUIA 3S1XA 4FF7A 4UTHA 1WOBA 3TKFA 2JKAA 5D2WA 3LOTA 1V5XA 3NQ7A 3EB2A 4DO5A 3L0GA 1LTDA 2NLIA 4UXDA 4QSHA 3OHIA 2A1YA 3M43A 5K7JA 4FIQA 3O6YX 5AHFA 3ELFA 2PRMA 1AL8A 1AK5A 2V81A 3TQVA 2VEIA 1GTEA 4Z1DA 2R14A 4QNWA 1LZOA 4GJ1A 5K2ZA 3HO8A 2CLIA 1VHNA 4TR9A 2HMCA 3WK2A 1DV7A 5F2GA 4KKXA 2BWGA 3GDMA 1TSIA 2ZA3A 2A6NA 1N7KA 3IIPA 3VFLA 4DBEA 4UTKA 5DCDA 2QDHA 5G2HA 5J5RA 4ADSA 4BI7A 3W75A 3NL3A 3PBVA 2NZLA 1S5VA 1QCWA 1FDYA 4MY9A 4GWEA 1SW3A 4J9JA 3LHVA 4WY0A 5F4SA 1W5OA 5AC6A 4CNOA 5F2IA 1FXPA 3W2KA 4MPQA 5KZEA 2B7OA 2EF9A 2C16A 1TPFA 3N2XA 3IIVA 4IMCA 4Y96A 1F05A 4RX0A 1VPXA 3LTSA 4RLIA 3W1LA 3I68A 4JYDA 1NF7A 3G8EA 4Z0SA 2VC6A 4LW7A 4NZJA 3TSMA 3STGA 3ABOA 4UNKA 5D09A 1QPRA 1K03A 4JIQA 3O15A 4UMAA 3ZR4A 3LM7A 1WXJA 4S2CA 4K37A 3OVPA 3G1VA 3IGSA 3WJWA 4IOTA 3OA3A 2J9YA 3IRDA 3B0PA 2Y63A 2BTMA 4LWWA 2W79A 1ZAJA 4O12A 1H5YA 4QM1A 4JDYA 4JGDA 3LHUA 3CEUA 1LLWA 2ZRUA 4MVAA 3LHZA 3UWWA 2A2IA 1B4EA 3D0CA 1E51A 3NDOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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