3DFPA

Phosphate ions in d33n mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
Total Genus 138
50100150200250300020406080100120140
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
363
structure length
350
Chain Sequence
PHSHPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAANESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPCIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKCPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLACQGKYTPSSNHAY
5010015020025030030025020015010050
020406080100120Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH7 (160-179)TVIII1 (5-8)AH1 (9-23)AH6 (130-140)TII1 (24-27)S10 (296-301)S1 (28-31)TI1 (69-72)EMPTYS2 (73-78)AH2 (36-46)O1 (49-51)AH3 (52-64)AH4 (80-84)TI3 (87-90)AH11 (306-313)AH12 (320-338)3H1 (67-69)AH5 (93-100)S4 (111-114)S5 (122-125)TII2 (115-118)TIV1 (118-121)TIV2 (156-159)S6 (144-151)TI4 (154-157)AH8 (198-219)S7 (183-190)3H2 (223-225)AH9 (245-258)TI5 (236-239)TI6 (261-264)TI'1 (271-274)AH10 (276-288)3H3 (303-305)3H4 (317-319)TI'2 (313-316)S3 (103-107)TII3 (127-130)S8 (227-228)S9 (266-269)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Oryctolagus cuniculus
publication title Charge stabilization and entropy reduction of central lysine residues in fructose-bisphosphate aldolase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase A
total genus 138
structure length 350
sequence length 363
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2008-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00274 Glycolytic Fructose-bisphosphate aldolase class-I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3dfpA00
4LS1A 2B7QA 5DCEA 5DXXA 4UMAA 4UTWC 3S9YA 4O16A 2C3ZA 4FNPA 3TUUA 3OVQA 3LTPA 3W7NA 1LRTA 3EXSA 3TSDA 3LRMA 4UFKA 2QAPA 1XL9A 1TTJA 1GJPA 3S5OA 3NOEA 3C2RA 1Q6RA 4O0ZA 3W74A 5K9DA 1GTEA 3FEMA 4Y90A 2VFIA 2JKAA 1PS9A 2X1RA 1U5JA 3JRKA 3TH6A 3UPWA 1M6JA 3E96A 3W84A 1FWRA 2ZZ7A 3W87A 3BW3A 1TPC1 3KFTA 2Y61A 4UTIA 4CQ8A 3EX3A 3B04A 5TIMA 2W6RA 4WX2A 4QQ3A 1G4SA 2EKCA 3R12A 2B7OA 3EWXA 3N2MA 2NV2A 2FB2A 4CNNA 1JVNA 3LLFA 2C16A 2V82A 2D73A 1AK5A 2ZZ5A 3SW6A 3QMTA 1W3NA 2PCQA 2Y7EA 4YLWA 6ALDA 3MYPA 1VHCA 1L9WA 2GPTA 3HB9A 3K30A 5AOUA 4MFEA 5BW6A 2QCCA 4IXXA 1QR7A 5K4XA 2WNQA 4X2RA 3H55A 4NU7A 3NZ1A 3LBMA 3CC1A 2BWGA 1FWWA 1NEYA 2B0MA 4PODA 3BLIA 3UY7A 1TTIA 3R5EA 1ZHAA 3TC6A 1Z42A 1EB3A 3TW6A 3HO8A 1ZY9A 1I2QA 1ZJIA 3MYOA 4AH7A 3DBPA 3H54A 2H8ZA 3TU9A 3C8FA 2Y63A 3DI1A 1ME8A 3AJXA 2EGZA 3TA6A 1N55A 5HULA 3TJXA 1EWDA 2B7PA 4O18A 3G0SA 3ABSA 3QEZA 4A29A 3ZR4A 1SO6A 4JY8A 2J27A 1ZAHA 2DZWA 5FEWA 1XUUA 1W31A 1CW2A 3TKFA 3IIOA 4MY1A 2Y6ZA 2HS8A 5D2YA 2ZRZA 3P82A 2WV8A 4JY9A 4AMAA 3W85A 1W5MA 3P7YA 3NQGA 3QZEA 3UQNA 3DH7A 5BMWA 2RDUA 4JTLA 3S1VA 5FI8A 5D37A 1R30A 2FPVA 4Z0JA 4FIRA 3VNDA 1VZWA 3S42A 4HT3A 5AHIA 2PRLA 4IMGA 3DENA 3FYPA 2VFEA 1QO2A 2C13A 3W2MA 3SI9A 3RMJA 2QAFA 5H91A 1PE1A 1Q6QA 4UR8A 1X8FA 3P84A 4AF0A 1TV5A 1OFAA 3L5MA 4X3ZA 1DVJA 3M5VA 2GUUA 4YXGA 4FF7A 4MY9A 1XBYA 1F73A 3T4CA 3BO9A 4WJEA 5LNSA 4KFPA 1AW5A 2YDAA 3NPVA 4JTUA 1ML1A 2CLLA 3O16A 3SY5A 1G6CA 1RQHA 1YXCA 2QCFA 4GUJA 3TW7A 3W7HA 1KFLA 3M5XA 2F7FA 1OK4A 1SR9A 4DF1A 4LW7A 3P8IA 2E1DA 3W73A 2QUTA 1FX6A 3GB6A 1F2JA 3WK0A 1FBAA 3CQ0A 4IMCA 5HUOA 3LGEA 2ZZ2A 4JGDA 2C15A 5AC6A 2ZYFA 4LVGA 2VELA 3KXQA 2J6XA 2QCGA 2BTMA 4JIQA 3NL6A 1HTIA 1DQXA 1ZNNA 3HIJA 3EWWA 5CSSA 2ALDA 3DFSA 1SW3A 4WY0B 3W1PA 2ZQ0A 1GOXA 4JNMA 3JS3A 3VE7A 3P80A 2PRHA 1W56A 2C14A 5DLCA 3QMRA 3L67A 3CWNA 1UASA 1UUMA 3S0CA 4AEOA 5LNVA 3ANYA 2YX0A 4MLJA 5EL1A 4FNQA 3DI0A 2OX1A 3T44A 3DHDA 4UC5A 4LVBA 3IV3A 2QF7A 1P0NA 1LOQA 3G1HA 4PC8A 3UPBA 4JTHA 1TO3A 5HUPA 1EEPA 1ADOA 2Z0IA 2G5WA 1L6YA 2I9EA 1TSIA 4UTLA 1YADA 5G2HA 3I7RA 3G1FA 4M5PA 3LCHA 3W2UA 1K8YA 1G7VA 2C0AA 1TPWA 3A23A 1K3UA 2A21A 4CQ9A 4LOCA 1EA0A 3VI2A 5HNRA 3S1XA 4TX9A 3GNDA 3RK8A 3OIXA 3UZ5A 4RK8A 1SU5A 1GVFA 5FF7A 4DBDA 3M41A 3QPYA 2YW3A 3UWQA 3O63A 3QJAA 4GWEA 2V30A 2V5BA 4A3UA 1S5TA 4XQ6A 1TTQA 4IUOA 1NAL1 4CCDA 5MHBA 5U4NA 3GX9A 3LCLA 3G18A 2TYSA 3CHVA 4ADSA 4CLMA 2DZTA 3DHFA 1GQNA 3LDVA 2H8XA 3GKAA 4P61A 4DBEA 4O50A 1YTKA 4A21A 3ABRA 3TFXA 2ZA3A 2QCDB 4NJGA 3MBDA 3TSBA 4XZ9A 3S6DA 5EBUA 3W2JA 5FEXA 3CWOX 3LXCA 3NQ2A 1XCFA 2VXNA 1UCWA 5HR7A 2A0NA 4NJIA 3DFTA 4DQWA 4OV9A 4Q33A 3PUDA 4JDYA 1VCVA 4NJHA 3W75A 3NQAA 4HSNA 3QH2A 3U6WA 4LVAA 4QM1A 2OT0A 2PURA 5DCDA 2QJGA 3W7PA 2W79A 3C56A 4LU0A 4ZQNA 4JICA 1H60A 2Z2UA 3M5YA 3NVTA 1VYRA 4N02A 2DZVA 3GVGA 1AG1O 1TPVA 1OFOA 3M5ZA 5DXYA 1I4NA 4BF9A 2NZLA 3NQMA 5IBXA 5H2ZA 3QQ0A 4K37A 2QCMA 3TXZA 1DJNA 1Z44A 4FXRA 4BI5A 5FF0A 4C1KA 3OA3A 5FF2A 3O6CA 4WOQA 1GTHA 3HF3A 4RZ6A 3HOJA 4O11A 1OX4B 4NX0A 4WOZA 3G1YA 4HNTA 4JYEA 1SW0A 4IX0A 3W1NA 1SSDA 1FCUA 2JKPA 4N9EA 5CGQA 2RFGA 4GUFA 1VR6A 3M43A 2VFHA 4IMEA 1H7XA 1A53A 1X6UA 3INPA 4RZ4A 3PBYA 4W9TA 1BKSA 1TJRA 2A7PA 1WOBA 4MKNA 2ZFAA 2VKZG 4MFDA 5K4ZA 1UUOA 3C4UA 3QYQA 3TX9A 1DOSA 3P61A 4TO8A 3LI0A 1N7KA 5EA9A 5I3HA 2Y89A 3GXNA 1OFQA 3H53A 3UZJA 4LV4A 1R2TA 2QCHA 4JTFA 1NVMA 3LHZA 3G3MA 3FKKA 1RQEA 2CLIA 4MVAA 1MEWA 3TV8A 1QOQA 4JYDA 1X1OA 2GOUA 2V0TA 3F4WA 3NL2A 2VOMA 4WUIA 1W5QA 1KFKA 2CU0A 2P0OA 4E0CA 3SZ8A 3L0KA 3TQ0A 3G1AA 3W7CA 3W1RA 1NSJA 2CLEA 4O0KA 1YPIA 3L5AA 5AYYA 4HNNA 1F5ZA 5LKYA 4UNLA 1OFBA 4R53A 4LY8A 5KZEA 3L65A 2DZXA 1D9EA 2ZRVA 3HPXA 3TDFA 2X1SA 2FB3A 3BPWA 1MSSA 3UD6A 4WY0A 2WOQA 4UTJA 3DZ1A 4KWWA 1A5SA 1IGSA 1FCVA 1KM4A 3DFPA 3USBA 2V81A 2YR1A 1P5BA 1O60A 1HUVA 3MP4A 3S5ZA 1OJXA 2WJZA 3B0UX 3IEBA 2QCLA 1SZGA 2ZA2A 3NQ8A 4I7WA 4ZQOA 3W88A 3Q37A 4UFIA 3W2KA 3MP3A 3PM6A 3P5YA 4MYXA 2PRMA 2WNZA 3DU0A 5SWUA 1C9DA 4FNUA 1JCJA 3UY8A 4S1FA 4ML9A 1BTMA 2NX3A 3MO7A 1WQ5A 4LTSA 4KWVA 3C2OA 3T55A 1PIIA 3NG3A 1B9BA 5EMUA 2G97A 3LV6A 5GVJA 3TFCA 1I2PA 2Q3OA 1M5WA 1GYNA 1T0OA 1XM3A 1B4KA 3QW4B 4I7VA 5CZ0A 4CCEA 5FESA 4XBSA 4N6EA 4DPPA 5ABTA 1W8SA 3SJ3A 4OV4A 5F2IA 2ZRWA 2C6QA 3V75A 2I14A 5F1UA 5F2MA 1P0KA 1O94A 3LRLA 3PBUA 2X2GA 1FDJA 4HKPA 1VLIA 4O10A 1K8XA 1VRDA 2QCDA 4WXZA 4WXYA 5AYZA 4R33A 3AO0A 5CSRA 4LUJA 3W1QA 4ADTA 2Q8ZA 1JQXA 2NWSA 5FEPA 3LB0A 5EY5A 3GKFA 1XBVA 4BK9A 4LUIA 4N9CA 2E5BA 4WQ6A 1Z41A 1XDMA 1V5XA 3VE9A 3EX4A 4IMFA 2YSWA 4Y96A 3I7SA 3FS2A 1D3HA 4S2BA 5AHFA 3TAOA 3TAKA 3N73A 3U2OA 4ORIA 4PL2A 3MP5A 5F1VA 4GE8A 4UTKA 4LV9A 5CPLA 3NM3A 1GG0A 3RF9A 1TPEA 4P2VA 3LBCA 4RJEA 1HFBA 1L6SA 5C54A 4UTTA 2FQIA 5E93A 4JTTA 4PL1A 2QJHA 3BVJA 3KVMA 3RU6A 1LOSA 4JIPA 5AHMA 3NDOA 3G1SA 1H1ZA 3E49A 3LERA 3LHUA 1WV2A 3W71A 4FXSA 4K38A 5I3JA 2NX9A 5LNRA 1OX4A 4MY8A 3BLFA 1I2NA 1H50A 5K9XA 3NQVA 3KRSA 3CU2A 2YCEA 4Z1BA 4Q32A 4CNOA 2GQ8A 3PF3A 4C1LA 2CWNA 1FWTA 1KTCA 4IX2A 3IVUA 5HWJA 4RZ5A 1VQTA 4LRSA 4RR4A 1XUZA 3L21A 4O54A 4R34A 4DXVA 1GVSA 2Z1BA 3W7MA 4ZZ9A 3EKLA 1PCKA 3PWAA 4PH6A 4DF2A 1NF0A 2GQ9A 3C52A 1ZALA 5KMYA 4EWND 5F4WA 1X1ZA 2CW6A 4I9AA 3A24A 3A5VA 3OBKA 3LCFA 1KA9F 1JRCA 1O5KA 3OG3A 1VC4A 1PL9A 5AHEA 2BLEA 1SFLA 3L0NA 1PCWA 5AC8A 4ZL1A 4M7TA 3W72A 2YYUA 1B3OA 4HNUA 3KRUA 1F6PA 3W1LA 4LT9A 4N6FA 1RVGA 4DO6A 4FEZA 1A5AA 4IGHA 1OFDA 1ONRA 3A5FA 2V8ZA 3W23A 2NUWA 3HG4A 3I7QA 4H3DA 1K03A 1K7EA 1WOAA 3W9ZA 3NEVA 3P5ZA 5DELA 5E0KA 3DKJA 4IWWA 2NLIA 1JCLA 2HSAA 2C19A 2QCNA 1G69A 2DORA 3L5LA 3LTSA 1OX6A 1WYIA 4XTIA 4OWGA 2Y7FA 4O52A 3PUOA 1QCWA 1B57A 2FDSA 2Y62A 3LCWA 1YDNA 3N9RA 1DQWA 1UJPA 1T96A 3W7OA 2V2CA 1H5YA 2QR6A 2FJKA 2Z6JA 2H6RA 4EOUA 1QAPA 4LRTA 1FY6A 3PVFA 3W1MA 5KSWA 3LTYA 2DZUA 3M0ZA 4Y8FA 1JR1A 1YDOA 5I3GA 4XUGA 2UV8G 3G22A 1SPQA 5FF4A 1VYPX 1BWKA 1T99A 2CZEA 1VCGA 5DBTA 2PE4A 1LP6A 4JR5A 3CM4A 5E1QA 1DBTA 1QDSA 5LGZA 5LGXA 3W7DA 1W3TA 1VHNA 4UFHA 4OGZA 2R14A 1TJPA 1SO3A 4R7JA 4IXHA 4NNAA 5AYXA 4LVDA 3W3OA 2FFCA 2XN2A 1JUBA 4DO4A 4O1CA 5IM51 2CLKA 2P1FA 2OZ0A 2YXGA 1THFD 4OE7A 2C18A 4MYAA 3O05A 4WZHA 1XFBA 5F4XA 3YPIA 1YXDA 4M6VA 5D33A 5HR6A 5HWMA 3NL5A 1PHWA 2WPBA 2RHGA 1SUXA 3FJ6A 4EF9A 4CNPA 1KBJA 3DFNA 3PG8A 4LS0A 1IXPA 1ZENA 5K7JA 4Z1AA 1LBFA 2YW4A 3KVJA 1BWLA 1GT8A 1J5TA 2YPIA 3QQ1A 4S2CA 1RR2A 1LROA 3E12A 4O28A 3ATYA 4FO4A 2YYTA 2Y7GA 5HWNA 2VFDA 3LCXA 2V9DA 4QITA 4ZQRA 3OVPA 1KW1A 3EKZA 3DGRA 3WJYA 1W1ZA 4CCCA 3M9YA 1FDZA 3F1QA 3GDLA 1YPFA 3L0GA 3W7LA 1LCOA 4O53A 2DU2A 1SZFA 1IF2A 3KHJA 2BXVA 4GUGA 4JX5A 3W7GA 4MOZA 4XKYB 1UBSA 3QF0A 5KZDA 1LYXA 1XKYA 1PV8A 1KM1A 4ZVJA 5K3VA 3M44A 2J9YA 1TPUA 1K7FA 3W22A 1L2UA 3M16A 5D38A 2Y7DA 2NUYA 3ATZA 1WDWA 5D30A 5J5DA 3W07A 4MJZA 2A5HA 2TMDA 3IIPA 4MUZA 4O1BA 3B0VC 3QPZA 1Z48A 1MEIA 1ZAIA 3NQCA 1YLVA 3HPZA 1M7PA 4NNBA 3N9SA 3LCIA 1H1YA 3GDTA 3P81A 1TMHA 3VCRA 2P10A 1TB3A 1F7BA 1SZNA 4QSHA 3TR2A 3CTLA 3GR7A 4Z1DA 2VEKA 1AL7A 1LRQA 4YCPA 3W7IA 5CG7A 4ADUA 1K8ZA 4RXFA 2GVGA 1Q45A 3N3MA 3I6RA 2ZZ6A 1H62A 3ELFA 1OVDA 3OHIA 4M6QA 4BWLC 4H4IA 3CPRA 3NPUA 3BGGA 2ISWA 1OHLA 1SZEA 4AWSA 1YYAA 4Y6GA 5D2XA 2ZCGA 4QIUA 1RPXA 2NUXA 2JBMA 4GXMA 3GXTA 1DKWA 2WSQA 1GPWA 1CX9A 1WBJA 1H7PA 2H3DA 2QKFA 3GDKA 5DY3A 3HGOA 2Z6IA 4L4MA 4DEFA 4YCOA 3IGSA 3TIMA 1R2RA 1EP2A 5CZTA 3STFA 3PG9A 3T40A 4HIBA 3PAJA 3W7RA 3W76A 2GJLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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