3DGRA

Crystal structure of human nampt complexed with adp analogue
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
476
structure length
464
Chain Sequence
FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A phosphoenzyme mimic, overlapping catalytic sites and reaction coordinate motion for human NAMPT.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 168
structure length 464
sequence length 476
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2008-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3dgrA02
3IGSA 2CFFA 2V0TA 3NGJA 1LRTA 1Q6LA 4LVGA 1EEPA 1OX4B 1AK5A 5D38A 4MY8A 1Q6OA 3KOFA 1G7UA 1JCYA 1FWTA 3DFOA 1TREA 3VCRA 1GPWA 1W54A 3HJZA 3IIXA 1HO1A 2GJLA 1EP3A 3VE9A 1SU5A 2DZUA 1FQ0A 1L2UA 1ADOA 1JUEA 3SJ3A 5K2ZA 3GLCA 3O16A 5F2IA 3LHVA 3FJLA 1O60A 1X1ZA 1SSDA 1H7WA 1KV8A 3PVFA 1W37A 4FX8A 4MJMA 4JX5A 2ABAA 4IMEA 1TPC1 2B0MA 4GXMA 1LORA 3A5VA 5AHIA 5F2GA 2GOUA 4NUWA 3A23A 5CKSA 2H8XA 4LUIA 1K8YA 4ZQMA 1OYCA 5AHEA 3EX6A 5HUPA 1A5AA 2GQ8A 4Y9AA 4HNUA 5AC6A 1SO4A 1MEIA 1NSJA 5CSRA 2QCLA 2QCMA 4NX5A 1OABA 1VH7A 3QJAA 5CPOA 3G1YA 4LRTA 4X2RA 2X1TA 5DY2A 2Z2UA 3LCHA 4Y96A 2DZPA 3QF0A 5DN1A 4Z1BA 4N4QA 1KTNA 3B03A 3NO5A 4EOUA 3PB0A 3C2EA 3UWUA 5IBXC 3FJ6A 3W7OA 5HWNA 3HB9A 4K36A 3CT7A 4ICNA 4U4MA 4M6VA 2YR1A 3V1PA 6TIMA 1A5BA 5CZSA 3EX2A 1F76A 4GC4A 3HG5A 3QW4B 2C14A 4CQ9A 2Y7DA 4JIPA 4ZQPA 1KA9F 4UTWA 2RDWA 5G2HA 4X9SA 2KZHA 4XBSA 3QM3A 2NWRA 2RH9A 4IGHA 4AWSA 3GR8A 1L6SA 3TR2A 3W1AA 1CI1A 1SFJA 1XBVA 3N34A 4N6EA 3MHGA 5LHFA 1O5KA 1VS1A 4M6QA 4GUGA 3O8AA 4O4WA 5LZLA 3E96A 3R2GA 4ZZ9A 4X22A 3B06A 4CQAA 1IXPA 4WXYA 3HIJA 1TIMA 1N55A 2R94A 3FIGA 1B4KA 1W5MA 4JTTA 4QNEA 3PULA 2FPTA 4E0CA 3L68A 2WSRA 4LNYA 5TBOA 3TUUA 1Z48A 2Y7EA 1TYGA 1R47A 2HMCA 5EPDA 3P80A 4NXKA 5AFDA 4AHOA 5ABTA 3DFTA 4IWWA 5AYZA 2RKXA 1LRQA 1VPXA 3W87A 3CU2A 2V5LA 3HO8A 2EF9A 3DFPA 1X6UA 3GYEA 2FDSA 1TCDA 2QCDB 5C2XA 1H50A 2C18A 3MYOA 3BLEA 3C2FA 1XBYA 4HNTA 1QPQA 2RFGA 4MJZA 3GKAA 3FA5A 2C19A 3IGXA 2GQAA 5F2LA 3UQNA 5EL1A 4IX2A 1AW5A 4OQVA 3R8RA 3HG4A 2CLHA 2E68A 3CWNA 4WD0A 2ZRXA 3S5NA 1QMLA 2B4GA 2W79A 1YLVA 1FWSA 4ML9A 1PS9A 1U83A 4EWND 3TU9A 1XUZA 2ZRVA 4IUOA 4AF0A 5KZDA 1ZCOA 3NAVA 1C8VA 3GDRA 3EKZA 4LS1A 3CLMA 3S0CA 3TH6A 5AYYA 1H7PA 2NV1A 1ICQA 4MYXA 2ZZ6A 4LWWA 1OFPA 1JRCA 1NAL1 4S2CA 3UWWA 4QISA 3EB2A 4MYAA 1B4EA 4DELA 4MFEA 3Q58A 4MY9A 3LDVA 1FY6A 3GDKA 2B7PA 3NL3A 4Z1CA 3ELFA 4AMAA 1QNVA 2PRHA 3IIOA 1FWRA 3W1QA 1LOSA 4MLJA 3UXAA 3G22A 5FF7A 3UZJA 3MO7A 3FKKA 3T78A 2Y62A 4O52A 5HWJA 1M5WA 1JUKA 4O57A 5J5DA 4AB4A 1JCXA 3NQFA 3NQ6A 4XBKA 4ADUA 3GKFA 4YLWA 1TQXA 2XN1A 3GR7A 5KITA 1BKSA 4E2BA 3QRHA 3RFAA 3LV6A 2QF7A 4YL2A 1LBMA 2ZRZA 3BO9A 3O05A 4LV4A 3S1UA 1N7KA 1GEQA 3M5YA 2OT0A 2O7SA 4Q4KA 2IQTA 3TXZA 1OX6A 2ZZ4A 2ZQ0A 1NFBA 3LCWA 3O63A 3QMTA 4MVAA 3UXDA 1TPUA 1NEYA 3TFXA 1SFLA 3UD6A 2BWGA 4JTSA 4LS2A 3RMJA 5AHLA 1VCFA 3C0JA 3GXPA 3HGSA 4WOQA 4WY0A 3GVGA 5J5RA 1TPWA 1OYAA 3M1ZA 1K02A 2J9ZA 2O7QA 3LCFA 3WJSA 4QM1A 3TCEA 3NR0A 3NQDA 3MWAA 3P62A 4QSHA 2C15A 3BW3A 3P61A 2ATSA 3KRUA 3U2OA 1VYPX 3KVLA 3P74A 4MKNA 5FF2A 1KM4A 3W7HA 2QAFA 2VELA 1PCKA 3DZ1A 3RF9A 3LCLA 1OFOA 3LRKA 1T96A 3P67A 3W1TA 1M7OA 1YPIA 2J6XA 3G3MA 3QQ0A 3VNDA 3ABQA 3G0UA 2H6RA 4RCXA 4TR9A 1VQTA 2J88A 2WSYA 1ICSA 4DPPA 5G4EA 3K30A 2DZWA 3V75A 1RQBA 3M44A 1XCFA 5AHFA 4FNUA 2JKEA 1IXQA 4NVTA 3S42A 3NA8A 5H2ZA 3LHYA 3W1LA 4L4LA 3GB6A 3PUDA 2QKFA 3R12A 4NZFA 2FTPA 4LY8A 5G2IA 3C52A 2I14A 1WA3A 4FX6M 5LGXA 3HGJA 4UR8A 1TTQA 2VEIA 4IXHA 5D30A 3WJXA 3SIZA 4JTJA 4Y6GA 4I9AA 3WK1A 1UJPA 4GRSA 5D03A 3FFSA 4LT9A 3NPWA 1J4EA 3UYCA 3L0GA 3PM6A 3OHIA 2Y88A 1ZFJA 1QOPA 2VOMA 3NYZA 3W70A 3LXBA 4XKYB 2QJHA 2ALDA 4RX0A 3S1VA 4O4VA 5HQEA 4K39A 5K9CA 3A21A 1XUUA 3E49A 4BI5A 1UUMA 4OE7A 1I45A 4IPIA 3MP3A 4N2YA 2J9XA 3TC7A 4R7JA 3CHVA 3LRMA 2NXIA 2RDUA 2CLFA 3LBMA 2H90A 2QDHA 1SZNA 3P5ZA 3EX4A 3DENA 1RQHA 2YYTA 4LV9A 4TIMA 2TYSA 1W3TA 3C3NA 1YDOA 3TMLA 5AN7A 5AC8A 5G2WA 3KX6A 4B5NA 2PRLA 2QCCA 2Y7GA 3MP4A 2WKJA 1UUOA 5GVJA 2CZ5A 3HGRA 4DBEA 4ALDA 2E5CA 1FX6A 2DP3A 2V30A 3PG9A 2JGQA 1FXQA 5D2TA 3YPIA 1SW0A 3EWZA 4FNSA 1PHQA 3W83A 2F7FA 4ZL1A 2VFIA 1C9DA 2VXNA 3W7PA 1W31A 1W5PA 4JTHA 4CNPA 3M0ZA 2AAMA 4RZ4A 4TMBA 3F03K 4JD4A 4MZYA 1EUAA 3BK0A 3BV4A 3TW6A 1FXPA 3A9IA 1VJIA 1HUVA 1YTDA 4KFPA 3PY2A 3SR7A 3DFNA 3QSRA 4UXDA 2DZTA 3NQGA 3NQMA 4RR4A 5EBUA 1FCVA 3NDOA 4XUGA 3QMRA 1B3OA 5HJLA 3EX3A 1ML1A 2DZXA 5DY3A 2Z0IA 3QPYA 5EA9A 2YCEA 2JKAA 3CC1A 4UFJA 4JGDA 4LRSA 4AXKA 1EX5A 4A2RA 4HPJA 4QNWA 2ISVA 2WNNA 1QR7A 3OBKA 4FF7A 1K03A 1KM3A 4LVFA 3NL6A 1L9WA 5KMYA 1GQNA 2FPYA 1IXOA 3UWYA 4HT3A 2E1DA 1KFEA 3C4UA 2UV8G 4FIRA 4Z0JA 5D2XA 5K4ZA 2BLEA 4YWIA 5EMUA 3G18A 3NM3A 1Y0EA 2E6YA 2ZZ3A 2VFFA 1TPB1 3GAKA 3CEUA 3W7RA 1KFKA 1YDNA 3N2XA 4IJBA 5U4NA 4QAIA 3W07A 3NOEA 3PBVA 3GDTA 3QSTA 4O10A 4AHQA 1LM1A 1DJNA 2YW3A 5CZ0A 3NPVA 3ABRA 3CPRA 4BR1A 5KTLA 2FQIA 1QPOA 1WV2A 4JEQA 1W1ZA 4DF2A 2TPSA 4ADTA 5AB3A 1XDMA 4XWUA 3GDLA 1G67A 3T7VA 3PB2A 4Y90A 1Q45A 3EWXA 1QCWA 1AL8A 1P0KA 3PC0A 4JY8A 3S1WA 1YXYA 1G69A 5BOOA 3BPWA 2Y7FA 3CTLA 1OK6A 2J27A 4UTUA 2P10A 2C0AA 1XFBA 4Y8FA 2J9YA 3B0VC 2ZZ7A 4DQWA 4AH7A 5CGQA 4RLIA 3W7JA 3HG2A 3VI2A 1GOXA 4FHAA 1VLWA 4ZMGA 1L6YA 1JUBA 4GBUA 4JYEA 1T99A 1TPVA 1F74A 1VR6A 3MBDA 3U6WA 3NQ2A 4LS0A 3EWBX 2Y70A 1JJKA 4O11A 3F4WA 1THFD 1QWGA 1WYIA 4JTKA 4LC6A 3W2KA 2A6NA 1MSSA 1SW3A 1VLIA 1KW1A 1ONRA 1RD5A 2NUYA 2AQWA 1W5QA 1JCJA 1OF8A 1WDWA 4PCFA 2E6AA 3P82A 3RU6A 3Q94A 3W71A 1W8SA 1MZHA 3DBPA 3HF3A 2R91A 4L4MA 4Z0SA 4QITA 3P84A 4OBTA 1BEUA 4NJJA 1OFQA 3GX9A 3C2OA 3L21A 1TV8A 3IIPA 4O0ZA 1D3HA 3PSVA 3W1PA 3IVTA 4AVFA 2X30A 1LDCA 2WPBA 3GK0A 3RLUA 2E77A 1H7NA 3KFTA 1JULA 3G8EA 4JS3A 4Q33A 3G1FA 2A4AA 4JTLA 3NQ7A 3L0KA 4OV4A 3OVRA 1HG3A 3MW7A 3KVJA 5C5YA 2TRSA 2OT1A 4UNKA 4C1LA 5E0KA 3WK3A 3OVPA 3TAOA 3W7KA 2R14A 1QO2A 3EWUA 4LC8A 4POCA 1SQ7A 4M6PA 2BSLA 1KM1A 4FB7A 1VYSX 1G7VA 1MEHA 5LNWA 3KHJA 4AF0B 2QCHA 2H3BA 2RDTA 4W9TA 4R33A 1TPDA 5CG7A 3G1AA 2QR6A 1GZGA 1WBHA 2PRMA 4YMZA 4JNMA 1R30A 1UCWA 4FNRA 2JGYA 3I7SA 3W7QA 1EA0A 3HPXA 5LNVA 1OVDA 1K8XA 2ISWA 5A5WA 3W73A 4ZVJA 1XXXA 2CU0A 4K37A 3O06A 3N9SA 1K3UA 1JCMP 1LROA 3DGRA 4OWGA 1KBIA 4R34A 1DQXA 3QFEA 1KFLA 1I2RA 3L65A 2PC4A 3TSDA 5EY5A 3NZ1A 4N4PA 2R8WA 5D33A 1O4UA 1OFAA 1OJXA 1AMKA 4ZQNA 2G97A 1I2PA 4KWWA 5L9FA 3NQ8A 4AAJA 2X1UA 2A21A 4RKAA 2VEPA 5IBXA 4NNAA 2NV2A 4O13A 3W7CA 1F7BA 2A7PA 1YXCA 4O1AA 1OFBA 4XTIA 5FF4A 3LCGA 1ME7A 2VFGA 3W72A 4WJEA 1DBTA 5HUOA 3GNNA 4O1BA 3RNDA 2CLEA 1H60A 2OJPA 1KLZA 5FF3A 1H1YA 3L5MA 1HO4A 1DQWA 5D05A 1XL9A 2ZA1A 1JQXA 5SWUA 2WNZA 4WY0B 3PUOA 3TC6A 3CB8A 1SO5A 1R2SA 1SZEA 2W6RA 4NQ1A 4UTTC 3W1UA 1YDVA 1B9BA 2J24A 3RK8A 2Q8LA 3N9RA 3PG8A 3NM1A 3TQVA 3SZ8A 3QYQA 4O1CA 1HTIA 1TQJA 2NUWA 4KFOA 4D2JA 4BWLC 5LKYA 3W1MA 4JN6A 3MI6A 3I68A 2CZEA 2FB3A 1Q6RA 1F05A 4UCGA 4Z1DA 3O6CA 2V8ZA 1QPNA 3FYOA 4JX6A 3MP5A 2A1YA 1KBJA 2ZRUA 1YTEA 2VEMA 3W2MA 2TSYA 5C54A 3UZ5A 3U8GA 7TIMA 1H7RA 2VC6A 5AOUA 3ZR4A 4DEFA 4I7UA 1YADA 3NL2A 2D73A 3SSJA 2FLIA 3EXRA 4ZQOA 5KINA 5LNSA 4PTNA 1KM5A 3OVQA 3G1VA 4A2SA 4MLRA 5DBUA 1FCUA 3CIWA 2E09A 3W2NA 1KV5A 4FX7A 3EXTA 1TB3A 1G4SA 3A22A 2GJNA 3N73A 1E51A 4Z1AA 1K7EA 2A85A 4PODA 1EP2A 2GQ9A 3L66A 4TMCA 4X3ZA 3W7LA 3C8FA 2EGZA 5BMWA 2A2IA 2V5BA 5DXXA 1PV8A 5FEZA 3Q37A 3TAKA 1OYBA 3CWOX 4QJ1A 1VCGA 3TE9A 1P4CA 3LM7A 4NT0A 3W7IA 4A3UA 1IF2A 3STEA 3TJLA 3MHUA 4UTJA 1OFRA 1QFEA 1FBAA 4N9DA 1H1ZA 1W5NA 3KVKA 4BI7A 3NVTA 2B7OA 5AYXA 4IX0A 1C29A 4MZ8A 3B0UX 4G1KA 1JQVA 1EB3A 5E93A 1PVNA 3LTPA 4NJKA 1RZMA 4DO6A 4UTIA 1L6WA 3HPZA 4EIVA 5DCEA 3DHFA 4UUIA 2YYUA 2BTMA 2GVLA 1GTHA 2FFCA 4AWUA 4AHPA 1GJPA 4MOZA 1FWWA 1TTJA 3B05A 1G4TA 1WXJA 3W7GA 2DJXA 3W9ZA 3W6YA 4CCCA 4YXGA 4TX9A 1YTKA 1N8FA 3TJXA 3W1XA 4IQLA 4M19A 3UWVA 2NWSA 4NJGA 1IIHA 5LGZA 4I7WA 4EVZA 3QZEA 3O6DA 4UFMA 3NPXA 6ALDA 2B7QA 3WK0A 5CZJA 2OX1A 2BX7A 1DOSA 1WX0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2CFF A;  1MMF A;  1LRT A;  1Q6L A;  3M0K A;  4LVG A;  3PBM A;  3FY1 A;  1OGS A;  4MY8 A;  3KOF A;  2GJP A;  1AH4 A;  1JCY A;  1US2 A;  3DFO A;  3VCR A;  3WFZ A;  1UWT A;  5D9P A;  4LYP A;  4W8B A;  3IIX A;  1SU5 A;  1YNQ A;  2DH2 A;  2W61 A;  1MW3 A;  1ADO A;  2KAU C;  2IUZ A;  3GLC A;  3RPM A;  3FJL A;  3STP A;  4L7Z A;  2OLA A;  1W3J A;  2DZB A;  4B5U A;  4MJM A;  1IHI A;  3L2L A;  4WF7 A;  1CGW A;  1TPC 1;  4HK5 A;  5I0D A;  3A5V A;  3U5Y A;  3RUB L;  2GOU A;  5IRP A;  3A23 A;  3ARR A;  1IYX A;  2H8X A;  1CGT A;  1W91 A;  4LUI A;  1K8Y A;  4P7R A;  3EX6 A;  1NY1 A;  1PWL A;  4JFU A;  1NSJ A;  3A3W A;  2QCL A;  1K77 A;  1M1B A;  3SQS A;  1VH7 A;  3M07 A;  4ZO7 A;  2OO0 A;  1EHN A;  1V3L A;  1UA3 A;  5CPO A;  3LGD A;  4X2R A;  1OCN A;  3LCH A;  2FMN A;  4XB3 A;  2XSB A;  2YLL A;  4FLO A;  4IL0 A;  5DN1 A;  4N4Q A;  2GUB A;  3B03 A;  3OA5 A;  1OCQ A;  5HAT A;  2EKG A;  1RH9 A;  4ICN A;  4DWS C;  3UT0 A;  1E70 M;  1J18 A;  1OC5 A;  3V1P A;  4IM4 A;  1PKN A;  3QLL A;  3BAK A;  2PDC A;  3QW4 B; 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