3DGRA

Crystal structure of human nampt complexed with adp analogue
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
476
structure length
464
Chain Sequence
FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A phosphoenzyme mimic, overlapping catalytic sites and reaction coordinate motion for human NAMPT.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 168
structure length 464
sequence length 476
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2008-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3dgrA02
4MKNA 3S1WA 3PAJA 3RLUA 3LCXA 3JS3A 5HINA 1I2RA 2A1YA 1TPDA 3NQ7A 1TRDA 1FCUA 2J88A 3PR2A 2UV8G 1DQXA 2H8XA 4JTGA 3KRSA 2ISSA 2Y6ZA 2CLFA 2H3BA 4UFHA 3ABSA 2JBMA 1HUVA 1WDWA 1YDVA 1OYAA 2HTMA 2E5BA 3I7RA 3NO5A 1VCVA 3TC7A 1G4EA 3ZWSA 1SU5A 1RR2A 4O54A 1IXPA 4LS0A 2NZLA 3B06A 4TO8A 3DBPA 4AF0A 4CQAA 1GT8A 1W5QA 5FF7A 1TV7A 1QMLA 4IX0A 3HG2A 1L2UA 5C54A 1FUYA 4FX8A 4R53A 3IVUA 2QCNA 4JYFA 1R2RA 2VC6A 2CLLA 2ZZ3A 3W88A 4O14A 2QUTA 4RCXA 3LHWA 1P0KA 3DENA 4CCCA 1ZHAA 4NQ1A 4NT0A 1Y0EA 2PCQA 1SQ7A 2B7PA 1ZENA 2FJKA 4HPXA 1VLWA 4FXRA 3S0CA 5F4WA 1LBMA 1XI3A 1TJRA 4XZ9A 3IIPA 2NV2A 3ABRA 3DU0A 4M5PA 1FWNA 3LHYA 2CZ5A 3P5YA 3PC0A 1QPNA 3EX4A 4MJZA 4Q32A 2Y7FA 3S5OA 2RDTA 5E0KA 2OT0A 3Q37A 4MUZA 3IVSA 4IX2A 4IUOA 1PIIA 3MW7A 2WSQA 5I3KA 1EP2A 1GG0A 3NL6A 3TV8A 4TU1A 1A5BA 1FCQA 1GOXA 4N02A 4MJMA 1K03A 1HFBA 4KWVA 5HR7A 2QCCA 4FNSA 4BK9A 2ZRZA 3CT7A 3FIGA 1TPVA 3K30A 1FQ0A 2F7FA 2FPYA 3PWAA 4MLJA 3W6YA 5HNRA 1KV5A 3TXZA 1W0MA 3W72A 3G24A 1K7EA 1W5NA 2V2DA 1GVSA 3U8GA 4ZQMA 3E0IA 4JY8A 1F2JA 4AWTA 5IM51 4FIQA 1F7BA 1VPXA 4BR1A 4POCA 1H7OA 3PSWA 3W87A 1G4TA 3A23A 1DORA 1TV8A 1N8FA 2AAMA 2CLOA 3IVTA 2EAWA 4JTLA 1OFPA 1J2WA 3P84A 1L6SA 1NFBA 4IMCA 1XBYA 4GUGA 2FLIA 2YSWA 4MOZA 4UTKA 1VYRA 1ZCOA 4R33A 1ADOA 1XBZA 4O16A 2ZTKA 5K9DA 4HIBA 4JYDA 4NJJA 4JR5A 3PUOA 4CLMA 3E96A 4N2YA 2DZUA 4FNTA 4O57A 3QW4B 3TJLA 3G0XA 3P62A 4YCOA 3WK1A 2BXVA 2GJLA 3UZ5A 4MIMA 3BVJA 1U5JA 4IJBA 2A6NA 1O60A 4NX0A 2VEIA 4IPJA 1TPH1 2A2IA 3GDTA 5KTLA 5D2TA 3STGA 2TSYA 2Y63A 2ISVA 3SZ8A 1LOSA 4OV9A 5LHEA 2FQIA 3B4UA 3GNDA 3P8JA 4U4MA 5L6UA 4RZ5A 3FS2A 2KZHA 3R5EA 2Z1BA 3KX6A 4FHAA 3VE7A 4JTIA 1XCFA 2YYUA 1C29A 4IOTA 1H7PA 1RQEA 4YWIA 1WAUA 2ZZ7A 5D2VA 3EWXA 3O6CA 5C6MA 3W1MA 3BW2A 1ME8A 4PL2A 2W79A 3FA5A 3S6DA 5HQEA 1OX4B 5AHFA 4OE7A 4NXKA 3TDFA 4S2BA 3NQAA 5FF4A 1AMKA 5LGXA 4LT9A 1NF7A 3EX6A 1I2PA 1CI1A 4M6PA 2ZZ5A 4I7UA 3WJWA 4ML9A 2E6DA 4IMGA 1TJPA 3SW6A 3W22A 2I14A 2Y7EA 5K9CA 3RMJA 3QSRA 1G7UA 1K3UA 3A5FA 1I4NA 4MZYA 3R8RA 3G1SA 3LHUA 3ATZA 1RQBA 4A3UA 3TW6A 1RZMA 3ABOA 2QEZA 4N4QA 3EKZA 1D3GA 5CSSA 3OVRA 3IRDA 3A22A 4EVZA 4JTUA 4HNUA 2C13A 4DPQA 3W7NA 2QDHA 2X1RA 1TIMA 1H7NA 1KLZA 1QNVA 1LBLA 4BI7A 3PULA 3L0KA 1SFLA 2Y7DA 3NQDA 2G97A 1OYBA 1ZALA 3EWWA 3QPYA 5LNSA 1Q6LA 3H53A 3NXFA 2VFEA 3HPZA 3DFOA 1H5YA 3UNDA 4CNNA 1H51A 1K7XA 3S5YA 3UWZA 2NUWA 1A50A 2FB3A 3UWUA 3R2GA 3S1XA 3LI1A 3KVKA 1YXDA 3EX1A 3PG9A 2WV8A 1EP1A 5HR6A 3CTLA 1ZAHA 3ABQA 2YR1A 3SJ3A 4KKXA 2QCHA 2R91A 3ATYA 3W76A 3SSJA 3FJ6A 2NXGA 2CW6A 1VHCA 1T8XA 3GNNA 3QH2A 3UWYA 4AHQA 3BGGA 4O8RA 1Q3NA 4GE8A 2NV1A 3UQNA 1VJIA 1PHWA 1FY6A 3R12A 1KM4A 4LC6A 4RZ4A 4UFKA 5F2IA 1B4KA 3KXQA 2V2CA 1GYNA 1FWTA 4LS2A 3L67A 5DELA 2E6AA 2BSLA 5D09A 3NG3A 3O06A 1OX6A 3M41A 4QSHA 4ZQNA 2Q3OA 4NZFA 2B7NA 3NQ8A 1W1ZA 4UFLA 1A5SA 2ZZ4A 3G0UA 1OVDA 3W7GA 1XDLA 4HN4A 1LTDA 3G8EA 3GAKA 2QAFA 4NJHA 4N6EA 3DFSA 2EGZA 4PTNA 3B03A 4MY1A 3CPRA 4X9SA 2A7PA 4DO5A 4RXFA 2V9DA 4GUHA 3CC1A 1IIGA 2WSRA 4WXYA 3SGZA 2E1DA 3DFPA 5AHLA 3P80A 4WY0A 3CEUA 3LTPA 5DLCA 3W2UA 3DHFA 3W2MA 4PH6A 1KM0A 4IMFA 2A0NA 1XUUA 1N55A 1YADA 2W6RA 1C9DA 1M6JA 4M6VA 4O13A 2YCEA 1GWJA 1U83A 5BW6A 3B0VC 1XXXA 5CZSA 4PA8A 3LXAA 4S1FA 3HMJG 3G3MA 3BLEA 3VFLA 1NVMA 2QR6A 3DHDA 2J9ZA 5CGQA 3GK0A 4XBSA 1S5WA 3DKJA 7TIMA 3EX3A 1PCKA 3F4WA 3MI6A 1YDNA 2FDSA 2ZA1A 4XKYA 1VZWA 4C1KA 3I6RA 3TAOA 1HL2A 3W7JA 5FEZA 3LGEA 3NQEA 3CWOX 5DY2A 3NPXA 4Z1BA 2OX1A 3PVFA 3CIWA 4QAIA 5CZ0A 1TRIA 3QPZA 3L5AA 3OEXA 4AEOA 1XC4A 3IIZA 5F2LA 3TU9A 5K4XA 2DZPA 1KTBA 5AHEA 4O11A 3MHGA 1ICPA 4Y9AA 1G67A 5DXXA 2QJHA 3S8HA 4P61A 5LNVA 2OMAA 2V8ZA 4NX5A 2YGYA 2ZRYA 3LBMA 1OF8A 1H7WA 2X1TA 5FF2A 3NQMA 4JTFA 3BARA 1LCOA 1O5KA 3H54A 3M43A 2ZZ2A 4JIPA 5D2XA 2EF9A 2O7SA 1UUMA 3N73A 4N9BA 1CX9A 4UXDA 4JICA 4D2JA 1AW5A 4JXCA 4OV4A 1D3HA 3LHVA 3KOFA 2E68A 1JUEA 2P0OA 3LV6A 1X7FA 3KVLA 2WJZA 1EUNA 1F5ZA 1SPQA 1DJQA 1SSDA 2NUXA 2R8WA 3R89A 3EXSA 3OHIA 3HIJA 1OG0A 3HPSA 2A7RA 1YLVA 4DQWA 1OJXA 1W3TA 3OG3A 4XTIA 4QJ1A 2CU0A 5LKYA 1UJPA 2H90A 3C52A 4M7TA 4O50A 4Q33A 2PRHA 3GXPA 2G5WA 1QWGA 3A21A 4JTKA 4TX9A 3WK0A 2Y89A 2GQ9A 2QF7A 2C16A 3FEMA 1ONRA 2Y88A 3CEPA 4UC5A 3KRZA 3LTSA 1XDMA 1K8YA 2HMCA 3TQ0A 4DELA 3RU6A 3NZRA 1UASA 2I1OA 3FYPA 4QM1A 1ICSA 1XKYA 3LERA 3SECA 1RPXA 5F2MA 2VFGA 2Y85A 1OHLA 1SO6A 1Q6RA 5I3HA 1YPIA 3LTYA 3P8IA 2FFCA 1FCVA 2QJIA 3M47A 4UUIA 4HPJA 3DFNA 3NPWA 2RH9A 4WD0A 1D9EA 1UBSA 5G5IA 2ZA2A 1X8FA 2CZEA 3BG9A 5G2HA 1Z48A 2WQPA 4RX0A 5EYWA 5CZJA 1RD5A 1R2SA 4WOZA 2ZRXA 2WPBA 1EUAA 3DFTA 1LOLA 1B3OA 4JNMA 4HT3A 4NU7A 1H63A 4FNUA 1BWKA 3MYPA 4A2RA 1QOQA 3L21A 1G69A 2PE4A 4QNWA 4JD4A 3BG3A 2NWSA 1F05A 3C4UA 3PF3A 1QPOA 4KFOA 3LXBA 2ZRVA 5BRBA 3HO8A 3Q58A 1V5XA 3STEA 4JGDA 5K4ZA 4KWWA 3TSBA 2DJLA 1L6YA 1PV8A 1GJPA 1L6WA 1WYIA 4W9TA 3FOKA 4UTJA 5D05A 3W1UA 1TO3A 5K9XA 1K8ZA 4HSOA 3IEBA 1H50A 1SUXA 4OQVA 2ZYFA 1JUBA 1Q6QA 1GVFA 4ONVA 4Z1AA 1YYAA 1VCGA 4GUJA 1TV5A 1RVGA 3NZ1A 1JUKA 4P2VA 3RNDA 1A5AA 2YX0A 2VFIA 1GQNA 3QJAA 2J6XA 2PRLA 4M19A 1KTCA 3TMLA 4AHPA 3FLUA 1M5WA 4NNAA 4NXSA 5F2GA 2DU2A 3O1NA 3CWNA 4UTMA 1DQWA 4EF8A 3M1ZA 3BO9A 3W2LA 3DI1A 5K7JA 3N2MA 4AWSA 1JR1A 1FCBA 1LLWA 5HUPA 1LDCA 3DXIA 2QCFA 3TMQA 3PSVA 3S5NA 2NWRA 3C61A 3F4NA 4K37A 3QZEA 3MP3A 2QCMA 2Z0IA 4LVBA 3T55A 3W1LA 3GDMA 4LNYA 3PBVA 1BWLA 3M5XA 3VE9A 3YPIA 5G2IA 4EOUA 1RQHA 1VGAA 4A29A 4MFDA 1OFOA 1DJNA 2EHHA 3EWUA 4ZQOA 4LVGA 1PE1A 2IQTA 2A6LA 4EF9A 1FXPA 3W2JA 5F4SA 1QPQA 3O07A 1TPUA 2Y61A 3W7KA 4ZQRA 3UY7A 2HSAA 3G1VA 1KLYA 1BKSA 2TPSA 3W85A 3EXRA 2YW4A 1JCYA 1H7RA 3QRHA 1OFEA 4RLIA 5AFDA 1TPEA 1R47A 1W54A 3G0SA 1TB3A 3HPXA 3DZ1A 5I3GA 1W37A 3R13A 2X2GA 1LOQA 1VH7A 5AHMA 3I65A 1QAPA 3OVPA 3TKFA 3C3NA 1R30A 3WJSA 3D0CA 3MI2A 1KM1A 2V81A 2YFNA 3SIZA 4AH7A 1JCXA 3RF9A 2DZSA 3NVTA 3GX9A 4LUIA 2VFHA 4JTHA 3QMSA 1VS1A 5CKSA 5DBTA 5LNRA 2QKFA 4UTWA 5D2WA 1OX5A 1Q6OA 4FNRA 3A24A 4IPIA 4JX5A 4O1AA 2VFFA 1H61A 1SZGA 4Y96A 4HKPA 1TTIA 3W7IA 2GUUA 2C1HA 5BOOA 5KZEA 3MBFA 3P60A 4ORMA 2DZVA 1I8JA 3UYCA 1TTQA 4O4WA 4LW7A 4RZ6A 3Q2DA 1ME7A 3I68A 5J5RA 1OYCA 3KAOA 1ALDA 4O0ZA 2DZXA 4FIRA 4ZQPA 2CLEA 3EX2A 3PUEA 1YDOA 1I2NA 2WNZA 1VLIA 1TYGA 3WK2A 2ZRWA 1LBFA 5CZTA 2V82A 1O94A 3OVQA 3IIVA 4FO4A 3TFXA 3C0JA 1MSSA 3TQVA 3LM7A 2Y62A 1AW2A 2QCGA 4WUIA 3NL3A 2FIQA 2NX1A 4JS3A 2WNQA 1SZFA 1ZAIA 3W70A 3W7CA 4O1DA 3DGRA 1A53A 5BNKA 2CFFA 2ZRUA 3LV5A 1AK5A 3GZ3A 3G1XA 4E38A 3GDKA 3FKKA 3L2IA 4O52A 3B05A 2QCDB 3PB0A 1W5PA 2VFDA 3ZWTA 1ZFJA 4O15A 2WO5A 3CU2A 1KM3A 3IGUA 4XQ6A 1OFQA 4OGZA 2HS8A 5DCBA 1TPFA 3LHTA 2V5LA 1G4SA 3NL2A 1BTMA 1MXSA 4UR8A 4UMBA 3WJYA 4RKAA 3LCWA 3G3DA 4NZJA 4XWUA 3M0ZA 4DPPA 5CG7A 4M7SA 3IIOA 1OK6A 1G7VA 4WX2A 5L9FA 3MHUA 2F84A 4GWEA 1F76A 1MEWA 5TQLA 3UWQA 4A22A 3W1XA 3A9IA 3FKRA 1ZY9A 4WZHA 4YXGA 3PBYA 3KRUA 3SR7A 1W5OA 4NJIA 4NNCA 1FWWA 3M6YA 2JK2A 2JKPA 3LHZA 4TIMA 1EWDA 2ZBTA 3TE9A 4E2BA 3EXTA 4DEFA 1KM6A 4AAJA 3OIXA 3M5ZA 1SW3A 3S42A 4FB7A 2ZA3A 5I3FA 1JRCA 3EKLA 4ZZ9A 1VR6A 3L66A 5C55A 5AOUA 1K02A 1EP3A 3B04A 3BG5A 4CQ9A 1UUOA 3HG3A 3E02A 3HG5A 3VKJA 1QCWA 5AYXA 4MY9A 4I7WA 4AHOA 4ZL1A 1I2QA 2ZTJA 3TA6A 3EWBX 3G1AA 5LHFA 3TX9A 2LLEA 4QISA 5G2WA 4K7VA 1FDYA 4NUWA 3UPWA 3H55A 4Z1CA 5EPDA 5D30A 1AG1O 4CCDA 3W7EA 5MHBA 3ANYA 2V5BA 4I7VA 1LRNA 1FDZA 4IXHA 1GVOA 3TAKA 3JR2A 3W71A 3LOTA 3L68A 5FI8A 3PUDA 2CLIA 1J4EA 3UWVA 4AF0B 1TPWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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