3DHDA

Crystal structure of human nampt complexed with nicotinamide mononucleotide and pyrophosphate
Total Genus 165
50100150200250300350400450020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
476
structure length
464
Chain Sequence
FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A phosphoenzyme mimic, overlapping catalytic sites and reaction coordinate motion for human NAMPT.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 165
structure length 464
sequence length 476
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2008-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3dhdA02
1ME7A 1ZAIA 3UD6A 1DORA 2WQPA 2OMAA 2QF7A 1O95A 2TYSA 3N14A 5AHEA 3N9RA 2XFWA 4O18A 4WD0A 3OBKA 4K8HA 4TIMA 1SZGA 3VCRA 1QPQA 3VE9A 2BLEA 4FNTA 3O16A 4EVZA 1LTDA 3B0VC 1BKSA 2GJNA 4IX2A 3UY8A 2Y85A 1SFLA 2CW6A 3RU6A 4TO8A 4JTKA 5A8GA 1TTQA 4I7VA 2CZEA 4L4LA 4FXRA 5I3KA 1TIMA 1JQVA 4Z0SA 1FUYA 2QCEA 4IGHA 1LRTA 1FBAA 3C2OA 1VRDA 2E1DA 1ZY9A 2VEMA 1KLZA 3W7RA 3PY2A 1Q6RA 4GUJA 4PODA 3GK0A 5CGQA 3MBDA 2EPHA 4MYXA 2XN2A 1DQXA 1VZWA 2X16A 1OYBA 1TQXA 5BOOA 3CIXA 4UNLA 3JR2A 4UTIA 2ZZ6A 1TMHA 4I7UA 3KFTA 4GFSA 3QMTA 3HO8A 2KZHA 3INPA 4JTUA 3WFAA 2OT0A 3RFAA 1AMKA 2C18A 2WSQA 4E2BA 1RV8A 1J4EA 4IXHA 5LNWA 2ZRZA 5H2ZA 2VXNA 1RZMA 3FA5A 3TC6A 1UASA 4UFLA 3TIMA 1UJPA 4RLIA 3NG3A 1K03A 2I1OA 2B7PA 4O19A 3TFXA 4JTGA 3HQ1A 1JCMP 2V8ZA 4MJZA 1K7EA 2PRMA 2E6AA 1QPRA 2ZFAA 4NU7A 1TRIA 1SZEA 1TV7A 1W3TA 3NR0A 3LCFA 1XI3A 3TR2A 3MYPA 3HMJG 1VJIA 6ALDA 1LZOA 3HOJA 5E0KA 3HGOA 3ABOA 4A2RA 4NNAA 1TPVA 2E68A 3O63A 3QMSA 1KA9F 2ISVA 1JCNA 3TMQA 3M43A 5D37A 5C2XA 4G1KA 3S0CA 2Y7FA 3ATYA 1G6CA 3C2VA 3G1SA 4AB4A 1OABA 3B0PA 1JUBA 1VH7A 1H7PA 2C15A 1KM1A 4QISA 4DQWA 2YR1A 3LCGA 1AK5A 2E77A 4OHQA 3M44A 2H90A 2RH9A 3GAKA 2IQTA 3A23A 3KVKA 4JTSA 1TPB1 3FEMA 3QQ1A 3GIYA 3NQEA 2FPYA 3L21A 4B5NA 3DH7A 3IVTA 1SR9A 2VOMA 1Q45A 3LHZA 1P0KA 4GUIA 1GTHA 5AHLA 1I4NA 3PVFA 3Q37A 3C4UA 2A7PA 3TMLA 5EYWA 2OX1A 4KWWA 5CPMA 1EIXA 4GUGA 1ONRA 3W1NA 3STEA 1KTCA 3NL5A 1R30A 2YFNA 2A1YA 4GXMA 3ANYA 2Z6JA 2NWSA 4JTHA 4AMAA 2ABAA 3FJ6A 1XUZA 3W1UA 4CNOA 2A21A 1A53A 4NT0A 3N19B 3W1XA 1KFKA 5K9DA 4AWTA 1W5QA 4IMCA 2ZYFA 1VS1A 4MY8A 3RNDA 3NM1A 1KM2A 5K4XA 3C6CA 3P61A 1AW5A 1OHLA 2GQ9A 3UPWA 1OK4A 3CWOX 3DBPA 4AWUA 2D73A 1OYCA 4E38A 1YYAA 1TTJA 1HG3A 3GDMA 4YL2A 4Y90A 4ML9A 5AN7A 3EWUA 5CPLA 2R91A 3LCHA 3TJXA 4WQ6A 4MUZA 1TJRA 3NZ1A 3LV5A 3WJXA 5AC7A 3TH6A 4GC4A 3TW6A 2ALDA 1NVMA 1ADOA 1PIIA 1FXPA 3P7YA 1IF2A 5L6UA 5LGZA 2Y7GA 3R12A 3HIJA 3QH2A 1TJPA 4GWEA 4O4VA 5CSRA 4DBEA 1GJPA 2GUUA 1QDSA 2AQWA 1H7XA 2A5HA 3A5VA 2DZXA 5CZ0A 1SO3A 4FX8A 2QCNA 2WOQA 2V30A 2OCZA 3ABSA 3VI2A 1FWRA 3N2MA 4ADTA 3L68A 4HT3A 1XBXA 2X30A 2VEIA 3E49A 2CU0A 3AO0A 4CQAA 3I7QA 4N9DA 3FKRA 3BPWA 3P74A 2CWNA 4JX6A 5K9XA 3LBMA 3TAKA 3KAOA 3NPVA 1O5XA 2J6XA 3MP3A 4O11A 4NXSA 3QF0A 3UYCA 3QW3A 4NVTA 2QCCA 1QCWA 1LOSA 3H53A 3IRDA 4IMFA 3WJWA 3I65A 3LXBA 2WPBA 5C54A 2VFGA 1FCUA 4UTHA 5FEWA 3FKKA 2FIQA 1PVNA 4ZQNA 3TFCA 5LHEA 4MFEA 3LRMA 3SR7A 3LBCA 4YMZA 4DO5A 4UMAA 4CCDA 3E0IA 3LERA 3TKFA 4BWLA 4FX7A 1K02A 3VE7A 4O17A 2QDHA 3I68A 3W3OA 4FXSA 4H6KA 3ZR4A 3W7EA 5F1UA 1I2OA 3F1QA 4HHPA 4IXXA 3U6WA 3M6YA 4EF9A 2PC4A 4RZ6A 1KW1A 5AHMA 2FJKA 2J9XA 3BW4A 3M5VA 2Y61A 4Z08A 4BI5A 3KHJA 1TPC1 2P1FA 1T96A 4BI7A 1D3HA 1JCLA 5I3HA 4IOTA 3FFSA 4YXGA 3M47A 2J27A 5T26A 3QSRA 4MZYA 3SFKA 1SW0A 1WV2A 3OHIA 4LU0A 1SPQA 4FNPA 4JICA 1Z48A 3QMRA 5KTLA 5HR7A 2VFFA 1PHQA 1TCDA 3UWUA 1R2SA 4K36A 2YPIA 1SO6A 3WJZA 2BWGA 2BX7A 1GVSA 3G1AA 3TCEA 3W2LA 1DHPA 1ZAHA 3W85A 4TMCA 1BWKA 2V2CA 3NQAA 1H60A 4OT7A 3IIPA 1KBJA 2H6RA 5CG7A 1GG0A 4DXVA 3G1VA 3GXPA 3TUUA 1R2RA 3B4UA 3RLUA 1J5TA 5CZJA 1W5MA 3KRUA 3EX6A 2B4GA 3SGZA 4JD4A 3TJLA 5FF0A 4OWGA 1QO5A 1TPWA 3TU9A 1EP3A 1VLWA 3GXNA 1DVJA 3TW7A 1NAL1 3FJLA 1D9EA 2FPVA 2QKFA 2WO5A 3W70A 4IUOA 2F84A 2PCQA 4UTMA 3F03K 3TSDA 1WDWA 3FLUA 1H7NA 3HBLA 4N4PA 3TDFA 4QIUA 2ZZ1A 5G2IA 3ZFHA 2FPTA 5D02A 4RXGA 2VKZG 4BR1A 4RCXA 4O28A 1TO3A 3TA6A 1JUEA 2I9EA 4QQ3A 1W5PA 3UWVA 1O5KA 3QFEA 4K38A 4JX5A 2Y70A 1GVFA 3TQVA 3HG2A 4FF7A 2QAPA 1IGSA 1YLVA 2Y62A 1GTEA 4LRSA 1GZGA 4JIPA 3NO5A 3NA8A 1GEQA 3OVRA 3QZEA 4LS2A 3R13A 3DI0A 1GVRA 4MPQA 1EPXA 3NL2A 3HG4A 3PSWA 4LW7A 4JX4A 1K7FA 3FS2A 4YCPA 3DENA 3LHUA 2ISSA 1ZHAA 1L2UA 2B7OA 3R5EA 3LLFA 4UC5A 3HJZA 3QQ0A 3PUDA 2E5DA 4JTLA 2E6YA 1LYXA 2C1HA 1L6SA 2QJGA 4TU1A 1XKYA 1H7WA 5KZMA 4NJJA 1YPIA 4RR4A 1R46A 3GKFA 4JNMA 4BF9A 5DCEA 5HMSA 2QCMA 3CLMA 1P1XA 4O4WA 3HPZA 5G2WA 1XFBA 4ZQRA 3S1XA 3SJ3A 4LY8A 4FX6M 3C3NA 3T44A 3VNDA 3C56A 1F7BA 3O6DA 4LUIA 1F76A 4Y9AA 1XUUA 1BEUA 2GPTA 1LCOA 4M19A 5KITA 3DFOA 5D2WA 4MLJA 1R47A 3DFQA 4Q32A 1F05A 4UUIA 3VFLA 5D04C 5AC6A 3C61A 3MYOA 4Q33A 3E96A 3UQNA 1LBLA 1TYGA 2HS8A 4U4MA 1Z44A 4ADUA 1DV7A 2AAMA 5HULA 2DZVA 3F4WA 3PF3A 1JULA 1KFBA 3NQDA 4DELA 3L9CA 4AHPA 2FTPA 2Y7EA 1JRCA 2BXVA 2VFDA 1ME9A 1W1ZA 3UZ5A 1W54A 3NL3A 1HL2A 1KFJA 3UWQA 2H8ZA 1RPXA 1U5JA 3OG3A 1LLWA 3PBVA 1FQ0A 1LLZA 3N2XA 3JS3A 4TR9A 1SO4A 2V2HA 3O1NA 3W7HA 3HG5A 1B4EA 2FQIA 4M6PA 4ZQPA 5TQLA 5D30A 3EWYA 4ALDA 4CNPA 1SZNA 2CLEA 5K3VA 3QC3A 3CQ0A 4HKPA 4NNCA 3BARA 3T78A 2H3DA 3R89A 1THFD 1V5XA 4QJ1A 3S5NA 2YW4A 5D2XA 3GR7A 3CM4A 2GOUA 2ZRWA 4MFDA 3PBUA 3A9IA 5J5DA 2PURA 3MHFA 1KLYA 4LOCA 4MOZA 5DBUA 1GQNA 3Q2DA 2NUWA 3B04A 2RDTA 3W87A 1C8VA 5DY2A 3UXDA 3UWYA 2V2DA 2RDUA 3G18A 4PC8A 2R8WA 3S9YA 4Y96A 3PR2A 3LLDA 3L66A 3KRSA 5G1TA 1K7XA 1L6YA 3MI2A 3P80A 3CEPA 4RZ4A 2YGYA 1RQHA 2ZRVA 4R34A 1EUAA 3NDOA 4FNUA 4WXZA 1IXOA 1HFBA 3NQCA 4WUIA 3MW7A 4NNBA 4JDBA 5FF3A 1H1YA 3WJSA 3HGJA 1X7FA 2ZRXA 3P8JA 3W7NA 1MSSA 4JXCA 3MI6A 5SWUA 4UTKA 3DHDA 1OFPA 1S5TA 4IMGA 2B7QA 2WKJA 2V5LA 3BW2A 3PM6A 3GDTA 2E5BA 4HN4A 3G8RA 2Q3RA 2NX3A 4FB7A 2ATMA 2ZZ5A 4J9JA 3P5YA 2CLHA 1VYRA 3PBYA 2H3BA 1QMLA 3LV6A 3OVPA 4BK9A 4FHAA 4OQVA 5F4XA 1B57A 1G4PA 1VHCA 1YDOA 1DL3A 2EKCA 2DZPA 2OZ0A 4KFNA 3M5YA 3OEXA 5LKYA 1VLIA 1W5NA 5G4WA 1KM6A 2X1UA 1VHNA 1GYNA 1XL9A 1G4EA 1W37A 1LM1A 3CPRA 3MI3A 2JK2A 1RQEA 1WOAA 5CZTA 3NOEA 3A22A 2CZ5A 4GBUA 3PSVA 1HTIA 4PCFA 3IIVA 1JCXA 3GAYA 3PBWA 4MY9A 4XWUA 5E1QA 3LDVA 4N9BA 5KMYA 1TPUA 3ELFA 3DU0A 4MVAA 4UTUA 2VELA 1H5YA 1R2TA 3LB0A 2WSRA 4AWSA 1YPFA 4DBDA 3HB9A 1ZFJA 4TX9A 3HPXA 1GG1A 3EWWA 3MP5A 1XDLA 3R2GA 3W7GA 3CHVA 1UCWA 2FDSA 3EWZA 1F6KA 3LI0A 5FF2A 4PH6A 2Q3OA 4NQ1A 2J24A 1QR7A 4UMBA 1OK6A 1F73A 3BG5A 3M41A 2V5BA 4E0CA 3EXSA 4JTEA 3SSJA 3T7VA 4JYDA 1KV8A 3P67A 5HUPA 1EX5A 1OG0A 2QDGA 3W7MA 3NNTA 4DPPA 5HINA 3RMJA 3PAJA 2QEZA 3TSBA 5ABTA 5BMWA 4K8EA 4O16A 3EWBX 4O13A 3GDLA 3B8DA 4O10A 3LTPA 4JR5A 1I8JA 3UPBA 3F4NA 2PRLA 3PWAA 3IVSA 3TK7A 3G1YA 3N73A 2NV1A 3P81A 4HIBA 5CPNA 2EF9A 1OFQA 1TV8A 4DPQA 4ZQOA 2G95A 3LX9A 5K9CA 4OV4A 3B03A 1EUNA 1TRDA 3HGSA 1JUKA 1M7PA 2Y88A 5D2YA 3A21A 3LTYA 4R7JA 4BWLC 3DGRA 4MYAA 2O7QA 2QR6A 3NQ8A 1LOQA 1AW2A 1WBHA 1IXNA 2QCLA 5D03A 2X1SA 2XN1A 5AFDA 2A2IA 2PE4A 4LNYA 4PEKA 1X8FA 3RF9A 4M7TA 3S1WA 1OFRA 1K8XA 5LGXA 3GVGA 2NWRA 1KTBA 3UWZA 1QPOA 2WNZA 2A6LA 3GKAA 3TC7A 3LHWA 5IBXA 3T4CA 1VGAA 1WYIA 1E51A 1KFLA 1Q6LA 4GJ1A 4CLMA 5F1VA 4RKAA 2NUYA 3W7IA 3W7JA 4Q4KA 2NX9A 2QAFA 4DEFA 7TIMA 3STCA 2CLLA 3SGUA 5D05A 2RDWA 1EA0A 4NJIA 3KXQA 2YYTA 1OVDA 3NAVA 1GVQA 5EBUA 4QAIA 4ZL1A 2ZCGA 4JDYA 1A5SA 4RK8A 1EP2A 3P62A 2NXIA 3ABQA 4R53A 2QCFA 3LXAA 3ZWSA 4O1DA 4JS3A 3NGJA 3BG3A 3H55A 1OX6A 2X2GA 5HWJA 4RJEA 4P2VA 1FCQA 3QPZA 3V1PA 3W88A 4JTIA 1XBYA 1QO2A 2R14A 1JR1A 2C6QA 3W07A 1XM3A 2EGZA 3M1ZA 3MUXA 5EA9A 2J88A 3CEUA 5AYXA 1OX4B 3NZRA 4AHOA 1UB3A 5LNUA 3W1MA 3W9ZA 4OU1A 2TSYA 2PRHA 5AYYA 3KVJA 4X9SA 2BZNA 3W7QA 5DXYA 4EIVA 2I14A 1FWWA 3LHTA 2RFGA 1KFEA 3G0UA 3KRZA 3MBFA 3T40A 1KM5A 1M6JA 1OX4A 3G22A 4JY9A 4L4MA 3STGA 4UTWA 4LRTA 1KM0A 5LNVA 1Q3NA 4XBSA 2ZTJA 3QRHA 3RK8A 3TQ0A 4H4IA 1C9DA 2Q8LA 4DF2A 1PV8A 4JY8A 3I7RA 4XKYB 3UY7A 3V75A 2H8XA 4GUHA 4IWWA 2HSAA 3I6RA 3P82A 3MHUA 1TB3A 5CSSA 1JQXA 2JGQA 3DFTA 4BFAA 1QOQA 1VC4A 2CZFA 4UFIA 1IIGA 4UR7A 1RD5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3UD6 A;  3IUD A;  3CZ8 A;  1DJX A;  4QE1 A;  3VGH A;  4QLJ A;  4S39 A;  4I9J A;  4WDT A;  3SB0 A;  2ZAD A;  3AUO A;  4C6C A;  4O18 A;  4QHR A;  3MVT A;  4K8H A;  3QTG A;  2WHK A;  5FJU A;  4FNT A;  1UHV A;  2XSX A;  1CGV A;  2EBN A;  1SFL A;  1KXV A;  1UP2 A;  4J27 A;  2VO5 A;  3U2Z A;  4DJE A;  5CCZ A;  3GVW A;  1DJH A;  4FXR A;  1TIM A;  1UD8 A;  4RNI A;  4Z0S A;  2QCE A;  1FBA A;  4IUG A;  3W7R A;  4IT1 A;  1PIF A;  3PY2 A;  1Q6R A;  3L23 A;  5CGQ A;  3MBD A;  3SAZ A;  3WH5 A;  1W1P A;  1VZW A;  2SFP A;  3W38 A;  1OYB A;  4BJH A;  3B0Y A;  1TQX A;  3VX1 A;  3BSG A;  4UTI A;  4IQD A;  2D20 A;  4N0R A;  5FAC A;  3LPF A;  2P3Z A;  4GFS A;  4JTU A;  3INP A;  2OT0 A;  3RFA A;  4X0V A;  1A0D A;  2VX4 A;  1R7O A;  5LNW A;  2ZRZ A;  5JIW A;  5DRI A;  3I3E A;  4OEC A;  2XGI A;  3Q67 A;  3FA5 A;  3OA5 A;  1B5T A;  4K1G A;  1UJP A;  1EGV A;  3DX5 A;  3IV8 A;  1XLE A;  1IE7 C;  1KXQ A;  1VJS A;  1QK0 A;  1JCM P;  4F66 A;  1BVN P;  1NJJ A;  3WN6 A;  2Z27 A;  4NU7 A;  2NVA A;  1SZE A;  1TV7 A;  3NR0 A; 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