3DHDA

Crystal structure of human nampt complexed with nicotinamide mononucleotide and pyrophosphate
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
476
structure length
464
Chain Sequence
FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A phosphoenzyme mimic, overlapping catalytic sites and reaction coordinate motion for human NAMPT.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 165
structure length 464
sequence length 476
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2008-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3dhdA02
2H3BA 1RPXA 1H63A 1PVNA 3W7EA 3P82A 4ZQOA 3H53A 3KRSA 1FWNA 4O18A 1EP2A 2EKCA 1H5YA 3HPZA 1QPRA 4MPQA 4S1FA 3HOJA 4FNQA 4M19A 4CCDA 1A50A 2ZRYA 3HMJG 4DF2A 3BG9A 4Y6GA 3L66A 3KX6A 3W7NA 5T26A 2Z0IA 1OYCA 2P1FA 2XN0A 3W72A 1XCFA 2HS6A 3PAJA 1OX4A 5DCBA 5FEWA 1SO6A 1W37A 4GNJA 1DJNA 4LS0A 1DQWA 1YXCA 1TPB1 2YR1A 3NEVA 4CQ9A 2YCEA 2H90A 3NM3A 1GVQA 3IGSA 4ZQCA 8TIMA 1IF2A 1FY6A 1F76A 4MZ1A 2I1OA 5FF4A 5K7JA 3A23A 3G24A 4FIRA 4NNAA 3FLUA 1PHQA 5FF7A 1XDLA 1VCVA 1QAPA 2DP3A 5L9FA 3G0XA 3W70A 1TTIA 3P5ZA 1YTKA 2ALDA 4IGHA 3ABQA 1BWLA 4FNTA 4BWLA 4X22A 4BF9A 4QSHA 2GQAA 5FESA 1ZY9A 2IQTA 3PR2A 2R94A 2ZRUA 2BX7A 5LGZA 1HL2A 4LV9A 3B0VC 2E6DA 2GVLA 3PB0A 1GVOA 3R5EA 1H1YA 2Q3RA 3A22A 4UTKA 2CLOA 4O0KA 3IGXA 4QAIA 1TTPA 1BTMA 4JTIA 2DZUA 2VXNA 4X9SA 1KA9F 1AL8A 3G1SA 3S42A 1GEQA 3NG3A 5D37A 1KM0A 1TIMA 4U28A 1KTBA 4FHAA 3LBCA 2J9ZA 3L67A 4IMGA 5IBXC 1V5XA 3GXTA 2V0TA 1XXXA 1HTIA 1R47A 4MY8A 4KFPA 2PURA 5CPOA 1VYPX 2YGYA 3S5NA 3G1FA 2CW6A 4IMDA 4DO5A 5DCEA 1MEIA 4NJIA 4PCFA 3EXSA 5G1YA 2E5BA 2QJIA 4LRSA 4XWUA 2PRLA 2ISWA 2CLLA 2ZRZA 1K8YA 2A7PA 2EHHA 3BO9A 3OVQA 3LRKA 1TTQA 3SSJA 3CU2A 1RQEA 4UMBA 4AWUA 3TUUA 4UFLA 1VPXA 4LVFA 1OX4B 3NZRA 4NU7A 4WY0F 3QW4B 1OF8A 3GAYA 1QPQA 2FQIA 5CZJA 1LOLA 4ZQPA 1KW1A 3HJZA 5BOOA 2Q8ZA 2FFCA 4IMEA 1DKWA 3HG2A 5FEXA 2W79A 4IQLA 5K2ZA 2RDWA 2QCHA 1KBIA 5HINA 2GQ8A 1HO4A 5AHLA 3G8RA 3BLFA 4OV4A 1G6CA 2B0MA 2VEIA 4N9DA 1HUVA 4O17A 1SQ7A 1Q45A 3LCHA 4JTKA 1KLYA 1DV7A 5KZMA 4NT0A 3QYQA 4IUOA 2JGYA 2QF7A 2NUWA 4M6QA 3L5LA 4XBSA 2V5LA 3NQDA 3SGUA 2A7RA 4MFEA 1IXOA 4RK8A 3NXFA 1R30A 4ZMGA 3JS3A 2C19A 2C0AA 4GUHA 3PSVA 5G2HA 5IBXA 1OF6A 3DHDA 2QUTA 1OYBA 1QOQA 2E09A 4O52A 3MHUA 1UUMA 1B4EA 1OK6A 3HBLA 2RFGA 3LOTA 1WXJA 5DXYA 1E51A 1UCWA 1W54A 1B4KA 2DJXA 4QJ1A 2C1HA 1JRCA 1VLIA 1G4TA 3CT7A 3P62A 1JCLA 2D73A 2WPBA 1Z42A 3ABSA 1CI1A 1A5AA 2A6LA 4AWTA 1TPH1 1XL9A 3IVUA 3P61A 3PB2A 3S9YA 1JVNA 2FLIA 4R34A 4LOCA 5C55A 4MYAA 4O1CA 3TKFA 3TXVA 3VFLA 5HUPA 5LNSA 1DORA 4BFAA 4XTIA 2ZTKA 4JYFA 3MHGA 4IJBA 2Z1BA 1WA3A 2ZDRA 3LCIA 5LKYA 4YLWA 3W7RA 3NZ1A 1OFAA 1YXYA 4IMCA 1MEWA 3O6YX 3BW3A 3GLCA 3F4NA 3B05A 5CSSA 4MYXA 5KITA 1VJIA 1WAUA 2YDAA 4TIMA 1XBVA 3GXNA 4FNSA 3EWUA 4UFHA 1R2TA 4YMZA 3TA6A 1SW7A 3W7CA 3W7GA 3ANYA 5SWUA 4JTHA 3UWUA 4NZFA 4YCPA 3W1XA 4LRTA 4LVGA 3F1QA 1K03A 5D03A 3AJXA 3G1HA 3NYZA 4K36A 3ZFHA 4AHQA 4BR1A 1T96A 2QCLA 3UY7A 4JIPA 1AG1O 4WOZA 1PE1A 2ZQ0A 2YPIA 1ADOA 1YDNA 4FB7A 4LTSA 3E02A 3IV3A 5LNWA 5G1TA 1SSDA 1WBJA 4UXDA 3CM4A 3WK3A 3DFNA 3OHIA 3TXZA 3PUEA 2B7NA 3O06A 5K4XA 1QNVA 4K6AA 4HN4A 3G0UA 3RF9A 4AWSA 3S0CA 3EWZA 4AEOA 1FUYA 1LOQA 4RX0A 4UIOA 4DPPA 1LBFA 4ORIA 2GVGA 1D9EA 1NEYA 5TIMA 3B0PA 5ABTA 1UJPA 3W07A 1VGAA 4Y90A 2C18A 4CCCA 2CLHA 4GUJA 4O11A 1X8FA 3FIGA 4N02A 3TC6A 1H51A 1FCQA 3W7LA 4R53A 2X2GA 1ICPA 1XM3A 3HPXA 3RU6A 2GPTA 2V2CA 4QIUA 2A0NA 4UTUA 1XDMA 1RVGA 4MVAA 1H7WA 3PULA 5AOUA 4C1KA 3STEA 3W23A 3DFOA 4PL1A 3PM6A 2DZTA 3W85A 2WSQA 4NJKA 2VFGA 4N9BA 5FEZA 1G67A 5DXXA 3BW4A 2RH9A 3L2IA 4O4VA 3IIXA 4P2VA 3O15A 2GOUA 5CZ0A 3QPYA 3W1RA 4LVDA 1WBHA 3N34A 4O28A 1M6JA 4LUJA 2Z2UA 1W5OA 1V7YA 2J9YA 2QJGA 3INPA 4GUFA 3R8RA 4YCOA 4HPXA 2QCCA 4MZ8A 4HSNA 2A6NA 2LLEA 4Z1DA 1TJRA 5DY3A 3G22A 2YW3A 4JTGA 3CIWA 1HO1A 1O5XA 3VI2A 1KFEA 1DL3A 3CQ0A 4ICNA 1ONRA 3N2MA 4OWGA 3PBVA 4JS3A 3TX9A 1MXSA 1W5MA 2ZZ2A 1SFLA 2Y7DA 1KFCA 2CZ5A 3SW6A 2YFNA 1TQXA 3G1VA 5AN7A 3K30A 1P4CA 4B5NA 5D05A 2VFIA 3EWYA 1SR9A 2VEKA 1O5KA 4GRSA 4PA8A 3IRDA 2RHGA 7TIMA 3W7IA 3TFCA 2GJNA 3UY8A 1C29A 3GXPA 3MP5A 3W6YA 3NM1A 3QM3A 5D2WA 5J5RA 3C8FA 1LLWA 3UWVA 4TMBA 1YDVA 1WQ5A 1LCOA 3DFPA 2ZCGA 1P0NA 2CU0A 4WY0A 1GG1A 3W75A 1LTDA 3BV4A 3M7WA 5I3JA 1VLWA 1JCMP 3KAOA 5HR7A 3P80A 1G4PA 1FWTA 3UZJA 1K02A 2B4GA 3W7KA 3VE7A 2J9XA 3GDLA 4QQ3A 4BI6A 3QW3A 3NQ8A 1TV8A 3G18A 4JTLA 1GPWA 1Z48A 2CLEA 3QRHA 3O6DA 1XI3A 1GTHA 1W5PA 2E77A 3EEGA 2A21A 5AHFA 1I2OA 4DEFA 3TCEA 2PC4A 2QCDA 1TMHA 1FWRA 2UV8G 4AB4A 5EA9A 1FDYA 3UWQA 2Z6JA 1I2QA 4UTIA 4H6KA 1GZGA 4UTJA 2FDSA 5AC7A 3EX1A 3EX3A 3G1AA 1UB3A 3UYCA 3NQFA 3P67A 1G4SA 2QAPA 3OEXA 3NOEA 4E2DA 2BZNA 3PUDA 3UWZA 3C3NA 3KRZA 2P0OA 5DCDA 2H3DA 2W0UA 1DOSA 5G4WA 1S5VA 2G96A 1VR6A 2Y7GA 3BGGA 4NJHA 3OIXA 3UD6A 4Y96A 4UR7A 3CWNA 5KSWA 1IXPA 1CW2A 1Q6QA 1FWWA 3F4WA 3LHZA 3EWWA 3TJLA 4LV4A 1WX0A 1LYXA 4CQ8A 4ADUA 4WQ6A 1IXNA 2C6QA 5C5YA 1BEUA 3T40A 3C2OA 5DBUA 2WV8A 1W3TA 1FX6A 2QAFA 5IM51 3W1LA 1ME9A 3R89A 4N2YA 3TC7A 3HG3A 1ZCOA 4MY1A 4EIVA 3DGRA 1VHNA 3NNTA 3TSMA 1T99A 1JUBA 2WSRA 2ZFAA 3LV5A 1W1ZA 1SPQA 2Y6ZA 5FF2A 2V81A 4JY8A 1SW0A 2YYUA 1GG0A 3BG3A 1SO3A 3P7YA 4HT3A 4K38A 4NX5A 1OFQA 4LVBA 3PVFA 1GQNA 1SO5A 1U5JA 4XKYA 1P1XA 3PSWA 3C2EA 2QCFA 3LTYA 4YWIA 3STGA 3GDMA 5BMWA 3B8DA 4FXRA 5I3GA 2VEPA 1I4NA 3C61A 1LRQA 4S2BA 5HJLA 5GVJA 3LM7A 4IX2A 4GFSA 1KFJA 2JBMA 3DBPA 3I65A 3W1UA 4WY0B 3LB0A 3Q2DA 1YPFA 5TQLA 3TK7A 1EX5A 2VELA 5KMYA 4LU0A 3NQVA 1VRDA 3GNNA 4FXSA 3DFQA 3SGZA 2FTPA 2Y70A 1XFBA 3E0IA 4BK9A 2QDGA 1LP6A 3TQVA 4EVZA 3DI0A 2OT0A 1BWKA 1G4EA 4ADSA 4UFIA 1SU5A 2Y89A 4M7SA 1IGSA 2V30A 1VCFA 4PFMA 1TPDA 3LI0A 1A53A 4GUIA 5BW6A 2C15A 4UTTC 5F2IA 3TSDA 4JTTA 1S3HA 2QCDB 3NQEA 1R2SA 4A21A 3C2RA 5AHNA 3SZ8A 4OQVA 3LCWA 3MP3A 2QUVA 3THQA 2V82A 2DZXA 1DVJA 3M16A 3O63A 5F2GA 4H3DA 2NUYA 1QDSA 3N3MA 1J2WA 2EF9A 4ONVA 2DZPA 4H4IA 4DPQA 3GVGA 3HGRA 2A2IA 3BGJA 3VKJA 2WSYA 2J27A 3LX9A 4X2RA 3TIMA 3JRKA 4CNPA 1SW3A 4DF1A 3M6YA 5AHIA 4O12A 3C56A 1FDJA 3GNDA 4XZ9A 5CPLA 2QEZA 1KM4A 1A5BA 5F1UA 3IIPA 1JR1A 2WNZA 4K8EA 5F1VA 1L6YA 3SI9A 5AHMA 4U4MA 4Y9AA 4LT9A 2QDHA 3LBMA 1QFEA 3R2GA 3E96A 3QQ0A 2V8ZA 5I3KA 3DU0A 1VQTA 4EOUA 4KFNA 4MJMA 4ALDA 1GJPA 1ZALA 4WOQA 4CNNA 4WJEA 3FKRA 2ABAA 4XTDA 1JUKA 2NV2A 3L21A 4LC6A 3LXAA 4DELA 4DO4A 2FB2A 4UFJA 3SIZA 2RDUA 3TV8A 3N9SA 1S5WA 3CPRA 1C9DA 4UTTA 2Q8LA 1N8FA 3MUXA 4K39A 1N55A 4WZHA 4O15A 1F73A 1X7FA 1HFBA 2QCNA 5HQEA 3U6WA 1BKSA 4HIBA 3QJAA 1EEPA 2FPYA 3C2FA 4K8HA 2DORA 2TPSA 1C8VA 1GOXA 2HTMA 3GX9A 4AXKA 1LBMA 3UWWA 1KFKA 2E6FA 3NPUA 4UR8A 2Y63A 3TMQA 2NUXA 1SUXA 2FJKA 4HHPA 4WXZA 1LORA 1NFBA 1AK5A 5AB3A 3L0KA 3A21A 1THFD 4BI7A 2AQWA 2QCGA 4FNRA 4GWEA 1TTJA 1NF0A 1VH7A 3Q58A 1MEHA 5C54A 4JR5A 1L2UA 3QMTA 2OX1A 3GDRA 4O16A 5EMUA 3IVSA 4O14A 1OX5A 5F4XA 4JXCA 1F7BA 1VS1A 4Z1AA 3L65A 2KZHA 4E38A 3MJYA 2EPHA 4Q32A 4JX4A 1O95A 3UXDA 3GIYA 3BW2A 4NZJA 1KM2A 5E1QA 3TAOA 1TREA 4AF0A 1Z41A 1ZAIA 5HNRA 1LZOA 3W1QA 3LDVA 1QO5A 5FF3A 3QSRA 2OCZA 1G7VA 4PC8A 2WNNA 2CZFA 2NXHA 3S8HA 3S1UA 5I3HA 1JUEA 2CLFA 4JDBA 2YZRA 1NSJA 5CZTA 3NQAA 4JD4A 3B4UA 3W84A 3W2UA 4TX9A 1LBLA 4MZYA 2WJZA 3JR2A 1Q3NA 5C6MA 2R91A 1FXPA 1YPIA 4PL2A 3FJ6A 3OG3A 3MP4A 3CIXA 4FX8A 4ML9A 1KV8A 1OFBA 2CLKA 4NX0A 4LWWA 2EGZA 4IWWA 3MW7A 5C2XA 3HIJA 3DENA 4UTHA 3LI1A 2ZZ7A 3P60A 1I2NA 1TPC1 1VYRA 3W76A 2A1YA 4RCXA 3USBA 1OFRA 3HG5A 4FEZA 4ZVJA 4ORMA 3UZ5A 4JTSA 2I9EA 4FIQA 5J5DA 3ATZA 3DH7A 1R2RA 2NXIA 3DXIA 4LNYA 3LXBA 1LROA 1Z44A 4UNLA 5D2YA 3ELFA 2NWSA 4A2RA 3I7RA 4ZQNA 1XC4A 1RD5A 3O05A 1H61A 1U83A 1KM3A 1Q6LA 3LXCA 4I7UA 3IIZA 1R46A 1WYIA 4I7WA 3W7PA 2RKXA 5CSRA 3NL5A 4IX0A 4O13A 1NAL1 3WK2A 3LCXA 5BMXA 3A9IA 1PV8A 3NPXA 4ZZ9A 1H7RA 2Z6IA 5AYXA 2FPTA 3TMLA 1ZNNA 5AYYA 5EBUA 4O50A 4MIMA 4CCEA 2Y88A 3UQNA 3L5AA 2P10A 3QF0A 1RQBA 1J5TA 3ABRA 3NL3A 3O6CA 3NPWA 3QSTA 1TCDA 4L4MA 4W9TA 3HPSA 4Z08A 4Z0JA 4AF0B 4IPJA 4N6EA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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