3DKLA

Crystal structure of phosphorylated mimic form of human nampt complexed with benzamide and phosphoribosyl pyrophosphate
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
476
structure length
464
Chain Sequence
FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title A phosphoenzyme mimic, overlapping catalytic sites and reaction coordinate motion for human NAMPT.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 169
structure length 464
sequence length 476
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2008-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3dklA02
1TTQA 1I2NA 3CU2A 5EA9A 4EOUA 3CWOX 3W7NA 1DV7A 3IIVA 4FO4A 4FF7A 2VFHA 4M7TA 5U7SA 1TRDA 3GKFA 3G24A 1EX5A 3RMJA 3GDRA 3NYZA 2QCCA 2FIQA 5G2HA 5KZDA 3NR0A 4M5PA 5IBXA 4LS1A 1KM3A 4K39A 3B0UX 1GVRA 1LBFA 1QAPA 3IIPA 4N2YA 4GWEA 3CPRA 3DFSA 1W5PA 4H4IA 5HINA 2C0AA 3WJXA 2E09A 2E1DA 3NQFA 4AEOA 4LNYA 3FJ6A 3I6RA 1EIXA 4K38A 5CZ0A 3SW6A 3P84A 1HO1A 3HJZA 4YL2A 4LWWA 3BG3A 2A6LA 3IRDA 3EWUA 1I2PA 2WKJA 2ZA3A 1OABA 1FXPA 1LYXA 4ADSA 1OX6A 2WSQA 4NX5A 5AC7A 3U6WA 3DHFA 1ME7A 1I2QA 1LBLA 4GRSA 1TREA 3HG3A 4K37A 4HN4A 4EWND 5HR6A 5EKYA 4RK8A 3TXZA 1KW1A 3NGJA 3M16A 1AW1A 5FF7A 5G5IA 2OX1A 1YLVA 1PCWA 3TAKA 2QCHA 2ZRYA 3PY2A 2V0TA 2DZWA 4FB7A 2YCEA 1H1ZA 1GEQA 1JCLA 1VLIA 4XBKA 4EVZA 2QCFA 3GXNA 2FB3A 1VHCA 1LM1A 2TRSA 2B7NA 1EEPA 1VYPX 3G1HA 4MY9A 1TPUA 1DOSA 2X2GA 4A21A 1QOQA 5I3FA 3GX9A 1RV8A 3HGRA 3C2EA 3L0GA 3W1RA 1W8SA 2VXNA 1G4PA 4NXKA 5DBTA 2BSLA 1TYGA 3RLUA 3L68A 3UPWA 3I7QA 2DZPA 1YDVA 1K8YA 1LROA 2Q8LA 4RKAA 3ZFHA 1D3HA 3DFNA 1HFBA 1DQWA 3SECA 2VFDA 5EPDA 4UNKA 4IMDA 3U2OA 4LV4A 3HGSA 5C2XA 3G1VA 1ZNNA 2DZXA 3C2VA 5C6MA 1NAL1 3W72A 4JS3A 2YFOA 4U28A 1U83A 1Z42A 3FJLA 3EWWA 4JYDA 3IGSA 2ABBA 1QR7A 4BR1A 2GJNA 3LCGA 1G4TA 1KM1A 1KTNA 3O07A 2Y88A 2GOUA 3SGZA 3GZ3A 2V30A 5HUPA 5KSWA 4AF0B 3NQDA 1RZMA 4TO8A 3HIJA 3QMSA 3ATZA 3NG3A 2NXHA 3NAVA 4GE8A 1SW0A 4XWUA 1TTJA 4OBTA 1EB3A 2E77A 2YSWA 2A21A 4MY8A 3LHVA 4ADTA 3A21A 3E9AA 3KVKA 4MYAA 1IXQA 2NLIA 3GNDA 3LM7A 5HWJA 5DN1A 1P1XA 2ZZ3A 1G6CA 4K36A 3TROA 1TSIA 1L6SA 3M44A 2UV8G 1NF7A 3S1VA 1MEIA 4LVAA 2P0OA 4RX0A 1JUKA 2DJLA 5KZMA 2BX7A 3ANYA 4ZQOA 4RV8A 3EKLA 4UMCA 3TK7A 4CQAA 4HNTA 3PB2A 1XDMA 4LU0A 2R8WA 2DZVA 3P80A 3DBPA 3DGRA 2ZBTA 2JKEA 1Q3NA 2HS6A 3F03K 5AHLA 2IQTA 4KWWA 3T78A 3IIOA 3T40A 2Y7GA 4CCDA 2VKZG 3D0CA 4GUFA 2V5BA 4PL2A 1O5KA 1C8VA 4GUIA 2A5HA 2ZZ2A 3PG9A 4I7UA 5H2ZA 5U4NA 2QUVA 4Z1BA 4LT9A 3KX6A 1FDZA 4NJKA 3JR2A 4TIMA 3N73A 3UXAA 1EP1A 3N3MA 1R2SA 1WXJA 2CLOA 4Y90A 3STGA 4MJMA 3LB0A 2H6RA 1TV8A 3UD6A 3UWZA 2O7QA 4GJ1A 3IV3A 1P0NA 4LVFA 4Q32A 3IEBA 3PBYA 2ZA1A 4O15A 3HGJA 3G0SA 3H54A 1B4EA 4NZJA 2C13A 5D33A 4I7WA 1ICSA 4KFNA 4HSNA 5CZJA 2CZEA 3M5ZA 4TMCA 4HHPA 4CNPA 3G0XA 2EGZA 3QMTA 3G0UA 1G67A 2NWSA 3I7SA 2DORA 3KRZA 4KWVA 5D04C 5LHEA 5DLCA 2A7PA 2F84A 4LC8A 1Q6OA 3QM3A 2PCQA 2QDGA 4GBUA 4ZQRA 1SSGA 3L21A 4WY0A 2C18A 2YZRA 3C0JA 4JD4A 2Y89A 3W7RA 4WX2A 1SSDA 1A50A 2ZCGA 3NZ1A 1T99A 4XKYA 1OX4A 3W1LA 2YXGA 3H53A 3MI3A 4JNMA 5AN7A 2CZFA 3GYEA 1PV8A 1KV8A 3FFSA 3CM4A 4DPQA 2VC6A 3LCHA 1PE1A 4E0CA 4UUIA 1JULA 4O16A 3TSMA 1DORA 4RXFA 1XKYA 2QKFA 2GVGA 4ZQMA 3ABSA 4BFAA 3RNDA 3VE7A 1OFDA 4JXCA 4WJEA 3PUEA 4AWSA 1JQVA 5D2XA 3S0CA 4CNNA 4ALDA 3UPBA 5AYZA 1IXNA 3MP3A 3KRSA 3OBKA 3W22A 1W3TA 4QQ3A 4JTJA 3FKRA 5HWNA 5BOOA 4QITA 5G4EA 3CQ0A 1GPWA 1WV2A 1VH7A 1YXYA 3BW4A 4DXVA 4IPJA 4RCXA 3W75A 4LUIA 1VHNA 2GQAA 3CIWA 4Y6GA 2NXGA 3TNOA 3G3MA 2V2DA 3VNDA 3BGGA 2RFGA 1JCMP 3UZ5A 1XBYA 2HMCA 3C3NA 4ORMA 5DBUA 3H55A 4O28A 2VENA 1PVNA 4MUZA 3S5ZA 3C2OA 2G97A 3W7HA 1GJPA 3BLFA 4O19A 3W86A 2C1HA 4AHPA 4ZQNA 1KM4A 4LTSA 5D38A 2NV2A 3LOTA 3LX9A 1BTMA 3QPZA 3TW7A 1R2TA 1TPB1 4Z1CA 3W7DA 5TQLA 1JUBA 2NUWA 1H7WA 2VELA 4UTHA 2FPVA 3LLDA 4RLIA 1T8XA 3N19B 4O0ZA 4JTTA 1FWWA 4UTLA 4JIQA 5LNRA 1KFLA 3EEGA 4UMBA 3O6CA 3FKKA 4FHAA 2Q8ZA 1HTIA 5E1QA 4UCGA 1G7VA 4UFIA 2Z1BA 5H91A 3G22A 3R89A 3TIMA 4FNUA 4DBDA 1PIIA 3R13A 4MLJA 1WOBA 1QCWA 1U5JA 5L6UA 2Y85A 4M6VA 5CKSA 3I65A 3STFA 1XM3A 4AHQA 4E38A 1G7UA 4N9DA 3OEXA 2YFNA 3HMJG 2BWGA 4OU1A 3L2IA 4KKXA 3BV4A 3QJAA 4U4MA 3WK1A 2QCNA 4Y9AA 1DL3A 1I4NA 2JKPA 3ZWSA 1SO4A 1ZAHA 4YWIA 3QQ0A 3PG8A 4XTIA 4C1LA 1QDSA 4L4MA 2JKAA 1O4UA 1I2RA 4A2RA 3O05A 2XN2A 1UUMA 5LNUA 3F1QA 2QEZA 1X1OA 3PVFA 4BI5A 3N2XA 1RPXA 3A5FA 3OVQA 1WBJA 4IGHA 1QO2A 2GJLA 3BLEA 1UBSA 1UJPA 2Y7EA 1B57A 5EMUA 4AHOA 4IMCA 3B4UA 4IX0A 1D9EA 1YPIA 2YPIA 4HNNA 4DQWA 3NPUA 1FCQA 4WZHA 1QPNA 4JGDA 3LTSA 3G1FA 4UC5A 1ME9A 4PTNA 4ZQCA 4MKNA 1KTBA 1Q6QA 3B0VC 1A5SA 4O57A 2B0MA 3NQ8A 4QAIA 4UTTA 1SO5A 3T44A 3S6DA 2QUUA 4O1AA 1ZJIA 3QYQA 3BPWA 2ALDA 3EX3A 5FF3A 3RK8A 3W7LA 3HG5A 2BZNA 3UYCA 5HR7A 1W5QA 2HSAA 5IBXC 1OG0A 1EWDA 3IVSA 2I1OA 2WPBA 3IGUA 4IX2A 3NQEA 3IVUA 2QJIA 2X1TA 4IPIA 1GTEA 4Y96A 5LSMA 4M6QA 4WD0A 1K8XA 1QO5A 5IM51 5C54A 5J5DA 4WQ6A 4H3DA 1IF2A 1H7PA 3LGEA 2Z6IA 3HOJA 1H63A 4NNCA 1FX6A 2VEMA 1WX0A 3TJXA 1XCFA 1NSJA 2FPTA 2Y61A 1TO3A 3W2MA 1TRIA 1LRQA 3G3DA 5GVJA 1VPXA 3N9RA 3LLFA 1B3OA 4FNSA 2WV8A 2J24A 5AYXA 4N9CA 1F7BA 3HPXA 1ZALA 4A22A 4NJHA 5F4WA 1L6YA 2QF7A 4ZQPA 4Z1AA 2FB2A 1F76A 2J88A 3GAYA 5DCEA 1LP6A 4FX7A 4LVDA 4YXGA 5FF0A 5F2MA 4K7YA 3TQKA 4C1KA 1KA9F 2VOMA 2YW3A 2NX1A 2XFWA 4Z0JA 3W74A 3E96A 1OFOA 4UMAA 5MHBA 1A5AA 1JJKA 1AG1O 1GG0A 4IQLA 4PODA 4UTMA 2C15A 2FJKA 3MP5A 3NL6A 5D09A 1VQTA 1S5WA 1EUAA 3PUDA 1YTDA 3P82A 3QFEA 4NZFA 2ZTKA 1H50A 3PWAA 6ALDA 1LRNA 3S5NA 3W7MA 3EWXA 3W1TA 5DXYA 1G4SA 3TE9A 4WXZA 2GQ9A 3WJZA 1TQJA 1R47A 2G5WA 5FEZA 1GVOA 3CC1A 1FUYA 4X22A 3FYOA 4R53A 1OYBA 2Y70A 3NQ6A 1MXSA 3SI9A 1EUNA 3GDTA 2P1FA 3PBWA 3U8GA 1QPOA 2NZLA 6TIMA 1I45A 5D32A 4CNOA 3WJSA 4OV4A 3B8DA 2CW6A 5HQEA 1BEUA 1PS9A 3NQMA 4UIOA 3STCA 2E5CA 1R46A 3W3OA 1TPFA 3P60A 1W3NA 3G8EA 3B04A 3GIYA 3CEPA 4AWTA 1KFJA 3SY5A 3W1QA 3NQ7A 1SW7A 2A2IA 3BG5A 4A2SA 4UTUA 2ZZ7A 4UFHA 3DFTA 2WQPA 1XUZA 1SO3A 2YW4A 3PM6A 2HS8A 1NF0A 4J9JA 1WYIA 3NL5A 4LC6A 3LBMA 3MO7A 1F6KA 1Q45A 4RXGA 3WJWA 1Z44A 2ZRUA 3LRMA 2VFIA 1QOPA 4DEFA 1TV5A 3O63A 1SZGA 2Q3RA 4DO4A 3TFCA 5CPNA 3W85A 3N9SA 5AB3A 1O95A 5FEWA 3S5YA 2WNZA 3QQ1A 3DENA 1KFEA 3QW3A 2CLHA 4N4PA 3LXCA 3NPXA 2RDTA 5I3HA 2ZZ5A 4S1FA 2E68A 4N02A 3MUXA 2ZA2A 3MHGA 1QFEA 1W37A 5A8GA 3BK0A 1PCKA 5HUOA 1TPVA 1AW2A 3PUOA 3LI1A 3PULA 1QMLA 2JBMA 3UXDA 2R91A 4BWLC 1WDWA 2TPSA 2J9YA 1K03A 2YGYA 3W87A 3DZ1A 3QSRA 1A5BA 3T4CA 4TMBA 2C16A 4JTEA 1G4EA 3LDVA 3KFTA 1WA3A 2QCDA 3LHYA 4JTIA 3DKJA 1K7EA 3WK2A 2RKXA 2F7FA 2OZ0A 3NM3A 3B03A 2QCEA 4E2DA 3EKZA 4HPXA 5BNKA 3FYPA 3MWAA 3ZS4A 1OFEA 4CQ9A 2ZDRA 3MW7A 1AMKA 4EF8A 4XTDA 3OIXA 4UNLA 2CFFA 2W79A 1YDOA 5CZSA 1QPQA 3NZRA 2OMAA 3QH2A 4LS2A 5F2LA 2VEIA 1RQHA 4K6AA 4UTWC 4QIUA 4YCPA 4OT7A 1LCOA 4UFKA 3YPIA 5LGXA 5HNRA 1DHPA 1YADA 2ZRZA 4R7JA 5F4XA 1OFRA 3QW4B 2C3ZA 2E5DA 3FEMA 1LZOA 1YYAA 3NPVA 1GYNA 3CT7A 4O4VA 1X8FA 1LTDA 1DBTA 1KTCA 1I8JA 4N6EA 1FDJA 4ADUA 1NVMA 2TSYA 4FNTA 3PSWA 2X1UA 2FFCA 1OFAA 2GVJA 4LVGA 5I3KA 3C61A 4FEZA 1XBXA 4G1KA 4K7VA 3UWYA 8TIMA 4Z08A 1W56A 1BWKA 1C9DA 2ATMA 1FXQA 3S1XA 2J9ZA 3LHWA 3EB2A 5DY2A 4JTFA 3KHJA 3C8FA 5CSRA 1CX9A 5AOUA 1XUUA 5A5WA 1ML1A 1R2RA 3N34A 3Q2DA 4NJJA 3LERA 2YYUA 4HKPA 2XN1A 5TIMA 3KVMA 2V9DA 2BXVA 2NV1A 4GNJA 3DFOA 2YDAA 4WOZA 3FLUA 2J9XA 1H7RA 3FA5A 4RZ5A 5LZLA 3UWUA 2WNQA 1GVFA 1F2JA 1AK5A 3SFKA 2X1SA 5K7JA 2CZ5A 3BLIA 4MOZA 4A29A 3MYOA 4MFDA 1LOSA 1IIGA 3CTLA 1NEYA 1DJNA 1OHLA 3L65A 1CI1A 3DFPA 3IIXA 4LV9A 1ICPA 2WNNA 3GDLA 4PA8A 4ZL1A 5LKYA 1TIMA 1UCWA 5F1VA 4KFOA 1X7FA 1VJIA 1AW5A 1P5BA 1VRDA 2EPHA 2NUYA 3MHFA 2ZRVA 3NNTA 5K9CA 1SFLA 3SJ3A 4O53A 2JGQA 1JCXA 1H1YA 3BARA 2PRMA 2Y7DA 3DAQA 2DJXA 4CCCA 4GXMA 2FQIA 4JX4A 4LRSA 3LXBA 3V75A 1OFBA 1OX5A 1KM6A 5E93A 5BMWA 1OK4A 5G1YA 1K7XA 5AHFA 1SUXA 4POCA 5FESA 5FEXA 4DF0A 1TPWA 3NQVA 3S1UA 2CZDA 3IGXA 2QAPA 2GUUA 3MI2A 1IIHA 5F2IA 5FEPA 3GLCA 4ML9A 1Q6RA 2QUTA 5T26A 4K8HA 3TXVA 2Y63A 1Y0EA 2ZZ1A 1H7OA 1JQXA 5FF2A 3G1YA 4MYXA 1XBZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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