3EBVA

Crystal structure of putative chitinase a from streptomyces coelicolor.
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
SLKHAVTGYWQNFNNGATVQKISDVPSAYDIIAVAFADATTTPGAVTFNLDSAGLGGYTVDQFKADVRAKQAAGKKVIISVGGEKGTVSVNSSASATNFANSVYSVMREYGFDGVDIDLENGLNPTYMTQALRALSAKAGPDMILTMAPQTIDMQSTQGGYFQTALNVKDILTVVNMQYYNSGTMLGCDGKVYAQGTVDFLTALACIQLEGGLAPSQVGLGLPASTRAAGGGYVSPSVVNAALDCLTKATNCGSFKPSKTYPDLRGAMTWSTNWDATAGNAWSNSVGAHVHAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of putative Chitinase A from Streptomyces coelicolor
rcsb
molecule keywords Chinitase A
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Streptomyces coelicolor
total genus 99
structure length 293
sequence length 293
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ebvA00
4AEFA 2UY4A 3FHQA 4P7RA 3CH9A 5BROA 3VKKA 1KB3A 2WVTA 4XV0A 3DYOA 4ZENA 3VDAA 1E6RA 4PMNA 5HBFA 3F4VA 1VEPA 4X0NA 1JZ8A 3DECA 2YBUA 1WP6A 5C70A 1A47A 2J8GA 1V6VA 1AQMA 3CZGA 1W1VA 1BYDA 3MUAA 5E0CA 4XX6A 2XM1A 4BQ2A 2ZUTA 2QMJA 3D5HA 2XGBA 4BF7A 4CD6A 3SUWA 1EO7A 1JZ7A 1V3LA 1BHGA 1XSJA 1ZL1A 4JKLA 2WW5A 5DMYA 3U7BA 2OWCA 4ZXOA 2ZXDA 1GJUA 3WD0A 1BFNA 2EEXA 3PZOA 5CPSA 3ZO9A 2J7GA 3FN9A 1A3HA 3AMKA 3GTNA 3BGAA 5CJ5A 3G6LA 1V3HA 3NIYA 4CD4A 2CBJA 4RE4A 3W0KA 1KCLA 2WB5A 1R7OA 3VTRA 2DIEA 3U7VA 1TVPA 1E72M 1JD7A 1UR2A 2XTKA 2ZX6A 4AZ6A 2G3IA 5E09A 4D6CA 2YLLA 5HXMA 4TVDA 4CU7A 1FH9A 1M01A 4AD1A 3A4AA 3SURA 1PX3A 2XFFA 1HX0A 3O6AA 4LYPA 3L4WA 2XVGA 3VIHA 4OBRA 1HVQA 2E4TA 1EQPA 4CVUA 1QW9A 1VJZA 4WSKA 1SMAA 3DC0A 1QNOA 2J7BA 3BC9A 4ACZB 4MNKA 2UY3A 3AZSA 4L4PA 2A3EA 4FLSA 1PPIA 2E8ZA 2FH8A 5AC5A 1MVYA 3WDJA 4Y7EA 1E9LA 5LA1A 4CU6A 2W66A 1KBKA 3MV01 1B2YA 1UZ1A 3CUFA 2W92A 5A6BD 2XVPA 1HJQA 2HISA 3AIRA 2EPLX 4WKFA 5AY7A 1OM0A 1L8NA 3VD5A 1Q6FA 1GZJA 3VX0A 2GDUA 2BS9A 3BAWA 4UFMA 3N13A 3RM8A 3OZPA 3HJEA 4QDMA 4D71A 5A8OA 3I3EA 2DSUA 2WLYA 1V3KA 1AMYA 1V6XA 2G3JA 3CUHA 3VMPA 3IAQA 5CLWA 1XH2A 4MB1A 3WF1A 1J0JA 3NSNA 4S3KA 1J10A 4UQDA 5A8NA 3HMCA 2O92A 2FGLA 3TTQA 2V5CA 1GQJA 1W3JA 3MS8A 4PMVA 2EXOA 3CZEA 1DWFM 1MW1A 4HMDA 3RJXA 1BYBA 5I3DA 3GH4A 1GQLA 4TXEA 1EHAA 2VC9A 4MDPA 2RGLA 2JEPA 1UR4A 3FW6A 1XH1A 4R27A 1E6ZA 1CLVA 1GPFA 3VD7A 3AXXA 5LA2A 1HP5A 4HU0A 3CZLA 1WDPA 1UKQA 4AD2A 3N9KA 4HP5A 3AMLA 1UZ4A 1ODZA 1J9YA 4CD8A 1O7AA 4KRUA 3G6MA 1LL7A 1TFVA 3IJ9A 1ZBCA 1OT1A 4MPKA 2OSYA 1UWUA 4OUEA 1DEDA 4P8XA 1HJUA 1FH8A 3WH7A 4W5UA 1CXFA 2OSXA 3KWXA 1X6NA 2VI0A 4GIAA 1NWRA 2VR5A 1JNDA 1IZKA 5D9NA 3L4VA 2ESCA 1FHLA 4N42A 2WHLA 2WWDA 3T2QA 4AW7A 1MW0A 3EMCA 1UWSA 3SUTA 4M81A 5FIPA 1UH2A 5E70A 4E4PA 2FHBA 3WSUA 5A6AA 1J0HA 3VU2A 2WVVA 4TOQA 3W24A 1JIBA 1BQCA 1PAMA 5JBDA 3VINA 2A3HA 4AZBA 1WCGA 4AIOA 3PZUA 4QCFA 1E5JA 1XH0A 5JUVA 3L4YA 2V5DA 4H8UA 3SCPA 3WBAA 4D6HA 5A8PA 4B9YA 3GNPA 4AWEA 2YA0A 1J12A 1QBAA 3ARPA 1G5AA 2VZOA 1TA3B 1M03A 1NOUA 4AXNA 3VD3A 1Z32X 4BS0A 3VUPA 2XVLA 3MSGA 1H0GA 1E6XM 2DDXA 5IDIA 1JYVA 1ZJAA 4MB4A 2WYSA 1VEOA 1WDSA 2QLYA 2BNJA 2YJQA 4A3HA 4MDOA 3NSMA 1E0VA 3W81A 1CXKA 3MUY1 3AIEA 3BH4A 2BY3A 4NRRA 1PZ3A 4AC1X 1CIUA 1RD6A 1FFRA 2OYKA 4UNIA 3OIHA 2D3LA 3IJ8A 1WZLA 3WMCA 4AMCA 2DSKA 5BXSA 2EPNA 2X05A 3QR3A 3KL3A 5CGTA 3EDFA 1MQPA 3ARSA 4K68A 1E1FA 3ECQA 1MW2A 1B90A 5A6BA 5IFPA 1W91A 3L4TA 3B9EA 2XJ7A 2D22A 4HA3A 3AIQA 3BLKA 4UFHA 2DGAA 3VDHA 5JBFA 1Q6DA 4KH2A 2OYMA 4UQBA 2E9LA 2BVDA 1W3KA 5D9PA 3VGHA 3VDCA 1CECA 4CN1A 1QHOA 3AS1A 1B1YA 2WK2A 4XB3A 4P7OA 1EOKA 3RO8A 2BXZA 2OWWA 1E55A 3VX1A 1ISXA 1WPCA 4H8VA 2VUYA 3SIMA 1PEZA 3B8SA 4PMXA 3N04A 3GZAA 4WK9A 4P7NA 2YL5A 3AMGA 1GOIA 1EGZA 2NT0A 2EPOA 3FAXA 1FP9A 2D3NA 1GHRA 2WZHA 3UERA 1K9FA 2DEPA 2DT1A 3VGFA 2ZXQA 1K9TA 4QFUA 3PTMA 3KE0A 5BCAA 3VGGA 3CBWA 2X09A 4JKMA 4U5IA 4W7VA 3VNZA 1UYQA 1EIBA 2RGMA 2XVKA 2ZXBA 3AJ7A 2CYGA 3SCUA 1JZ2A 1HJVA 1HNYA 2C0HA 3VGDA 4CCCA 3W25A 2CBVA 4P7QA 2G3NA 5D4YA 1J01A 1C8XA 1HF6A 2YBTA 2W61A 3RM4A 5CG0A 5HPCA 1OB0A 5BWFA 4ZFMA 2CIPA 1NARA 1NWSA 2OSWA 1KCKA 1MFVA 3T2PA 3CZ8A 2C7FA 2XGIA 4GZIA 1MW3A 1JNEA 1CXHA 1CBGA 2BFGA 4TX8A 5BYWA 5CXPA 3U5YA 1ECEA 1ZBWA 3VPLA 1KXTA 1HIZA 1H49A 5KZ6A 1H1NA 5LYRA 2ZUWA 1QI5A 2DH3A 2ZWZA 4PUEA 3WF0A 2D23A 4CKQA 3NJ3A 3CUIA 3CZKA 2YDQA 1TE1A 1XRVA 1E4LA 3IJ7A 1HJWA 1PX4A 1YHTA 1JAKA 1UG6A 4JFSA 3GDBA 3WMBA 4AD5A 1EO5A 2IXVA 5A6LA 2EPMX 1OGGA 4M1RA 1V3IA 4GI8A 1QBBA 3LPPA 4A4AA 3OB8A 4NF7A 1LJYA 4LGXA 1GOKA 5CGMA 4WKAA 1ISWA 4DUXA 3CHEA 5A8QA 1W2VA 1PIGA 1V6UA 3T0DA 3OLIA 1JI2A 1KQZA 4C7DA 2WC4A 1XSKA 3RPMA 4JCMA 1ZBKA 5AC4A 1QI0A 1Y7VA 1QOXA 5E9AA 8A3HA 2GK1A 1E73M 4GI9A 4AZHA 3M7SA 2NW0A 3AIVA 4FK9A 8CGTA 3CZJA 4R5EA 4AIEA 1UD3A 1QW8A 2DSZA 3NYDA 5ABEA 5A6SA 1XD1A 4OOZA 4GPNA 2BV9A 2CERA 1J18A 1H09A 2E40A 3WDHA 4DM2A 3FHAA 1BAGA 1C7SA 1E1EA 4H04A 3AYRA 4TX6A 2VX6A 5A6MA 2W63A 4AISA 5A2CA 1TMQA 4KGLA 3BAKA 4AIUA 1GOOA 3AIUA 4JHZA 1E0WA 2VRQA 1UH4A 3SCTA 4WF7A 2XSBA 3N1AA 4HA1A 3QHNA 4W88A 3L4UA 1JI1A 4JFTA 2PC8A 5FOOA 4NZCA 1E6SM 3W38A 2DPEA 2ZICA 5DT7A 3DYPA 2JE8A 3AHZA 3AHYA 1RP9A 1WKYA 2DH2A 3TONA 5A3HA 2WVVB 1LF1A 3VIOA 2Z1SA 3TTOA 1XCWA 2PB1A 5I77A 2WANA 2XFYA 4X0VA 1VBUA 3QHOA 3WELA 4YPJA 3WD3A 5M3WA 1ZJBA 2F61A 4Q7NA 5A1AA 1UD6A 2X1IA 4BQ3A 2WM0A 4OKDA 1CXIA 2WHJA 4V2XA 1KBBA 2WMIA 4NSBA 3II1A 1E4MM 1XC6A 1AQHA 3OGRA 1E40A 3GNOA 3SUVA 1XYFA 4PSPA 5I0DA 4W84A 1H5VA 5I2UA 1GCYA 1BVZA 1UH3A 3WH6A 7A3HA 4CCDA 5FKYA 1NM9A 4GQRA 3BCFA 5EFDA 3ZT7A 1KGXA 3GXDA 3GNRA 4UQ9A 1JDAA 3LMYA 3GXIA 3WQVA 4GINA 3WL0A 5FL1A 1SFSA 2DQXA 4JZ5A 1HKIA 3ARRA 3RDKA 4PYSA 1EXPA 3MMWA 3WL1A 3QOMA 1LL4A 3EMQA 4QP0A 5I5RA 1ISYA 4J7RA 4UFLA 1EOMA 1GQKA 2WCGA 4OIFA 5IHRA 3WUBA 1JG9A 1HVXA 4HZ7A 4EAMA 4QLJA 3TA9A 1QNRA 4S3JA 2Z1KA 1LWHA 3WH5A 3OZOA 1E4IA 1OGBA 3ARXA 4UCFA 2VZSA 4F8XA 2G41A 4M82A 3U5UA 3IK2A 2CCRA 2YOCA 2VX5A 4E8CA 3BAXA 4Z2JA 4CN6A 4DUVA 1LG1A 1MYRA 1CPUA 3WNKA 4HZ8A 4J3VA 1H11A 5DT5A 1DWAM 4MJ2A 3M46A 1HJSA 1QHZA 4AZ5A 2VO5A 4GI6A 2J7DA 1E4NA 1FFQA 2GJXA 1KGWA 3UCQA 4MB3A 2CHOA 1C91A 1HJXA 3MANA 4PEEA 1E43A 2Y8VA 2PF0A 2B31A 1IT0A 1H3GA 3F5JA 4D6FA 1H2JA 2JIWA 3VMNA 1F4AA 4CGTA 1W9XA 3CTTA 4UFIA 4UOJA 2X2YA 1DWHM 1U2YA 5DF0A 1HXJA 3FY1A 5EB8A 3SUSA 4FLRA 4FMVA 4TTUA 1CDGA 4PRWA 4U5KA 2XYLA 2WMKA 5A6JA 2W4XA 4WJXA 4PTVA 3N17A 2PBGA 4P8WA 1CWYA 2D0HA 3CPUA 4YHEA 1JZ5A 1QHPA 3T2OA 4B3LA 5FL0A 1W9VA 3AFBA 1B30A 2J47A 3WQ5A 1GOQA 4B9ZA 1Q6EA 1FHDA 3MMDA 2BY1A 1F4HA 1HN1A 4W87A 3AIBA 3MUIA 3T0BA 3KZSA 1B3WA 2E0PA 2JEQA 1J0ZA 1PZ2A 5CLTA 1E6PA 3UG3A 1E15A 1BYCA 3N11A 2GUYA 2WVSA 3VIIA 5HPOA 1V0LA 3K8KA 1KFWA 3L2LA 5CZKA 5LA0A 2CKRA 5C8BB 2DSWA 2J77A 3OLGA 2J7EA 4ZXLA 2QF8A 1KXQA 1GORA 4LYRA 5HOSA 1CGWA 3THCA 3CMJA 5DFAA 3TTYA 3WDPP 1W9BM 2WPGA 2YDRA 4QLKA 1XGZA 2EO7A 5D9OA 3GBEA 2D0GA 1QI2A 4AY1A 1UR0A 1WDRA 4IM4A 3KL5A 2O9TA 3IAPA 1EDGA 2DT2A 1KQYA 1H4PA 2YL9A 2WXDM 1C92A 4LYQA 5FD0A 1C8YA 2VOTA 2QMKA 4PMZA 3ZJ7A 3VIPA 3AS0A 4UZUA 2PWFA 3SCNA 4ATLA 6TAAA 4EANA 3NDYA 2VRKA 3WDIA 2GK1B 3K8MA 4HTYA 2WBGA 1TR1A 2QV4A 3GXFA 1W3LA 3TTSA 3VIFA 5BXPA 1W1YA 5DEZA 3VOCA 3NDZA 1R87A 3EBVA 1OGSA 3GXMA 2J79A 4PMUA 3NCOA 2VNCA 5E0FA 2GVYA 1V02E 2D20A 1LL6A 3ZOAA 3SCWA 2WHKA 5JIWA 1PIFA 4UR9A 2ZUVA 1CZ1A 3PTQA 4GZJA 4PCTA 4W7WA 4H41A 3QHMA 5JIPA 1JXJA 1HKMA 3ZSSA 1WO2A 4GO9A 2J4GA 5HNNA 4C7GA 3O2LA 1XD0A 3AHXA 5I24A 2ZWYA 1E56A 2BHZA 1UHVA 3OBAA 3VM5A 3T0AA 1O6IA 3THDA 1JZ6A 4ZE5A 3W28A 4TTGA 1VF8A 1K9DA 1DWIM 4W86A 1JF6A 3ARQA 3AXIA 3F5KA 2WMJA 3VD4A 1KR0A 1E6QM 4FLQA 1E3XA 3WQ8A 4MNJA 1KXHA 4HPGA 3SCRA 3S2CA 1D3CA 4DM1A 3AROA 1UUQA 4YHGA 3KL0A 5BXTA 2Y24A 3K4DA 1NH6A 4HOXA 2XFRA 2AAAA 4HA4A 1M04A 2WMIB 4JAWA 3ZT6A 2ZX8A 1VRXA 1IV8A 2GJRA 3APGA 1EDTA 2WAGA 3CUJA 4ACYA 3A6OA 5JBEA 3CO4A 4JFUA 2D24A 3AI0A 2V3GA 1J0YA 1OWQA 3WD1A 3AOFA 1QNPA 3B9AA 3ZIZA 4UZSA 1UOKA 2JALA 3L4ZA 1W1TA 2VR4A 2WKLA 4J3WA 4GXPA 3VIJA 1K9EA 2VJXA 3K8LA 3NSXA 1LG2A 2GFTA 4OZOA 1R86A 1MXGA 3AIWA 1CEOA 5IXEA 1AVAA 2WWCA 1UD5A 4J28A 2PWDA 1JYXA 4W8AA 3LPFA 4XUYA 3SUUA 3BLPX 2CPUA 2BVTA 5EFFA 2WHMA 4Z2IA 3WQ4A 2CBIA 4AZ7A 1N82A 2NT1A 2YDSA 4IISA 4M8UA 4QCEA 1XV8A 5GNZA 2PI6A 4F66A 1JF5A 3WFLA 4W8BA 4DWSD 2XWDA 4M56A 2XG9A 1VENA 1SYTA 1CYGA 2ZUMA 2F2HA 3ZJ6A 5A2AA 2EBNA 1E5NA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4AEF A;  2UY4 A;  3FHQ A;  4P7R A;  3CH9 A;  5BRO A;  3VKK A;  1KB3 A;  2WVT A;  4XV0 A;  3DYO A;  4ZEN A;  3VDA A;  1E6R A;  4PMN A;  5HBF A;  3F4V A;  1VEP A;  4X0N A;  1JZ8 A;  3DEC A;  2YBU A;  1WP6 A;  5C70 A;  1A47 A;  2J8G A;  1V6V A;  1AQM A;  3CZG A;  1W1V A;  1BYD A;  3MUA A;  5E0C A;  4XX6 A;  2XM1 A;  4BQ2 A;  2ZUT A;  2QMJ A;  3D5H A;  2XGB A;  4BF7 A;  4CD6 A;  3SUW A;  1EO7 A;  1JZ7 A;  1V3L A;  1BHG A;  1XSJ A;  1ZL1 A;  4JKL A;  2WW5 A;  5DMY A;  3U7B A;  2OWC A;  4ZXO A;  2ZXD A;  1GJU A;  3WD0 A;  1BFN A;  2EEX A;  3PZO A;  5CPS A;  3ZO9 A;  2J7G A;  3FN9 A;  1A3H A;  3AMK A;  3GTN A;  3BGA A;  5CJ5 A;  3G6L A;  1V3H A;  3NIY A;  4CD4 A;  2CBJ A;  4RE4 A;  3W0K A;  1KCL A;  2WB5 A;  1R7O A;  3VTR A;  2DIE A;  3U7V A;  1TVP A;  1E72 M;  1JD7 A;  1UR2 A;  2XTK A;  2ZX6 A;  4AZ6 A;  2G3I A;  5E09 A;  4D6C A;  2YLL A;  5HXM A;  4TVD A;  4CU7 A;  1FH9 A;  1M01 A;  4AD1 A;  3A4A A;  3SUR A;  1PX3 A;  2XFF A;  1HX0 A;  3O6A A;  4LYP A;  3L4W A;  2XVG A;  3VIH A;  4OBR A;  1HVQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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