3EWWA

D312n mutant of human orotidyl-5'-monophosphate decarboxylase in complex with 6-cyano-ump, covalent adduct
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFENRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Lys314 is a nucleophile in non-classical reactions of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
total genus 100
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2008-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ewwA00
3LRKA 5DELA 3IVTA 3PC0A 5D33A 4JX4A 3SW6A 3PUEA 1QR7A 4K39A 1G4PA 1RZMA 3MHGA 2VEKA 4DXVA 2NXGA 1DJQA 4Z0JA 3W7QA 2NUYA 4MJMA 1YTDA 3SFKA 1W1ZA 3ATZA 1I8JA 1XXXA 4JYEA 1R46A 1OYCA 2CZEA 2E6FA 3CEPA 3NL6A 3HJZA 3NQDA 3O15A 1L6SA 2WV8A 1U5JA 2V82A 3ABOA 1FWNA 3MBFA 3QPZA 2BZNA 1YDVA 1WOBA 3QPYA 3EWXA 3QSTA 4K8HA 3NQFA 4JIQA 4AB4A 3DXIA 3M44A 4ALDA 5FF0A 3LRLA 1NSJA 1H62A 2Z1BA 2Y62A 3E0IA 4IJBA 3W23A 1OFDA 2QDGA 4Z1BA 3RMJA 2QCDA 1BEUA 5LHFA 5E0KA 4O1CA 4RZ6A 1IIHA 4ZQOA 4O0KA 5DCBA 5TIMA 5C6MA 2VEPA 3TSMA 3W85A 2X1UA 3NQ7A 3KRSA 2Y63A 1KFJA 4JN6A 3QC3A 1AL8A 2A7RA 2CLIA 4JX5A 1DJNA 4UTLA 3L66A 3A22A 3W2JA 3DFPA 2C15A 4ICNA 4L4LA 1DQXA 1OJXA 3AJXA 1Q45A 3FYOA 2CLHA 4M6VA 1ZY9A 4X2RA 2ABAA 3GR7A 4BI5A 1FDYA 5CGQA 2PCQA 1OX4A 1F6PA 1R2SA 2YPIA 1YTEA 3R89A 4GNJA 3W1TA 5KITA 2QJGA 3UQNA 4A21A 1W3IA 4O28A 2ZBTA 4FIRA 2ZZ3A 5FF4A 3M0ZA 4AHQA 3W1PA 3W22A 3AO0A 1D9EA 3S5ZA 3NYZA 1AK5A 1CI1A 3HPZA 5CZTA 1LRTA 1EUNA 1SW7A 5D30A 4N9CA 1O5XA 3DHFA 1YTKA 4JTSA 2Q3OA 3LLDA 4UTTC 3NVTA 1WBJA 4IPJA 3W7OA 1JRCA 3F1QA 1WOAA 3LI0A 4LTSA 3T44A 1FQ0A 3C2VA 3L0GA 3BW3A 1JULA 3O6DA 3C2FA 1SZFA 1JUBA 5BMXA 3ATYA 5D32A 3NM3A 4CLMA 3LTSA 1LZOA 3UY7A 3O6CA 3QJAA 4O0ZA 1KFKA 2F7FA 5C54A 1V5XA 4K37A 1WBHA 1KA9F 3LM7A 4NX0A 3G0UA 2PURA 4JTIA 1JVNA 1SO5A 5J5DA 1O5KA 2Q8ZA 3FIGA 4LVAA 1ICQA 3NZ1A 3WK1A 3N14A 3NR0A 3PR2A 4XZ9A 4IMDA 5H2ZA 4HSOA 3FJLA 3IV3A 3PM6A 2VKZG 1YADA 3THQA 3HPSA 4NU7A 1SO6A 4GXMA 5CG7A 1H7XA 5HNRA 5K9CA 1XBYA 2J9ZA 3UWWA 3W74A 3N9RA 3EXTA 2RH9A 1KBJA 3RF9A 4K36A 5KTLA 4UIOA 1JCNA 3LHWA 3TFXA 3HBLA 1H7RA 4JTLA 3EX1A 1TV8A 1KTNA 3G1SA 4OGZA 3WJWA 5LNWA 2WPBA 4GUJA 5DN1A 4LC8A 3CT7A 5EBUA 3P81A 1KFLA 3PBWA 2E1DA 1O95A 3DFSA 4NX5A 5AHIA 4TMCA 4ZZ9A 4UMBA 2PRLA 2GQ8A 2Y7FA 4JIPA 3I7QA 4AH7A 1XDMA 3S1UA 2OX1A 2ISSA 4PEKA 2JGQA 4AEOA 2ZZ7A 3KHJA 5LNUA 4K6AA 1AW2A 5A5WA 2ZTKA 3PSWA 1K8ZA 2VXNA 4DO5A 4O13A 4O12A 1SZGA 5AB3A 1TYGA 2W0UA 5LGXA 1FDZA 3MWAA 2E77A 1FCVA 4GUGA 3BLEA 4RV8A 4M6QA 3W7NA 3ZS4A 4XKYB 3STGA 3NDOA 4DBEA 1VYRA 3FFSA 1PS9A 5AYZA 1QO5A 2E6AA 3JRKA 5F2GA 5C5YA 1TQJA 3HPXA 4Q33A 2EKCA 4ZQMA 1DOSA 1HG3A 3EXSA 1G4SA 1HL2A 3QFEA 1MEIA 2JKAA 2V0TA 1KFBA 2ABBA 1Q6OA 1F05A 4D2JA 4O10A 1OVDA 4WY0F 3E49A 5D2XA 3W2MA 3W88A 4DELA 1JR1A 2A6NA 4RXGA 1KLZA 1FBAA 3L0NA 3BPWA 3LBMA 1XI3A 1VCVA 3TSDA 5CKSA 3DU0A 5E1QA 1FCBA 4RXFA 3STFA 2C19A 4IPIA 1UB3A 2H3DA 3LHYA 1LLWA 3M5XA 3UPBA 3TQVA 1W31A 3W7JA 1VYSX 1GJPA 2V8ZA 3FOKA 3KXQA 2TSYA 3ZWTA 2Y85A 3A5VA 3TK7A 3W73A 1O4UA 2DZTA 3B05A 3PS7A 3TNOA 1PE1A 3ZR4A 2FPTA 3C6CA 2YCEA 5AHMA 5ABTA 2A7PA 2FLIA 4MYAA 3FYPA 4YXGA 1TPVA 3GDTA 1H51A 3BW2A 3H55A 1N7KA 1VCFA 1F76A 2XFWA 3DKJA 3SIZA 3G1VA 1XCFA 5AN7A 4RJEA 4M6PA 3LHTA 5I3IA 2EF9A 5D2YA 1TJRA 1LDCA 2YW3A 3SZ8A 2E6YA 1WQ5A 2G96A 2ZA2A 1R2RA 1EIXA 4O53A 5D02A 3EWUA 1EWDA 3G3DA 4UCGA 2QUTA 3NM1A 1I2OA 2ZZ2A 3B0PA 2ZTJA 1PCKA 5KZDA 1W0MA 3E12A 3TKFA 1KM4A 4U4MA 2E09A 2W6RA 2CZ5A 1LORA 1Z44A 2EPHA 3ANYA 3LV5A 3SJ3A 4AWUA 4S2BA 1JUKA 1LYXA 3V1PA 1KM0A 1ZFJA 3W1LA 4MY1A 3OVRA 4MFDA 4MLJA 1Q6QA 1JJKA 2RKXA 2X1TA 5HJLA 4AXKA 5AFDA 3G0XA 1KW1A 1W37A 2OCZA 2VC6A 3S42A 3DFQA 4P2VA 1K3UA 1J5TA 3P60A 1GVSA 3CLMA 4DPPA 5BRBA 1VHNA 4YMZA 1U83A 4WOQA 1KM1A 2VFIA 1M7OA 1R30A 3V75A 1W5QA 4WY0B 1TMHA 3EX6A 3C0JA 1GVFA 1P0NA 2CU0A 1LOSA 1H7OA 2RDTA 3P7YA 4FEZA 2WKJA 1YXCA 4O50A 3R5EA 1SO3A 3W75A 4XBKA 1T8XA 5LSMA 3D0CA 1VQTA 2FTPA 5KMYA 5D37A 4IMEA 1G7VA 4R33A 3KRUA 4JTEA 4AF0B 1HFBA 4PODA 4RKAA 4FF7A 1VPXA 5G2IA 4PL2A 2DZUA 5CPLA 1OK6A 2GOUA 5F4WA 1WA3A 2QCEA 3M1ZA 4M19A 5AOUA 3T7VA 4AWSA 2ZRYA 4EWND 3Q94A 2JGYA 1ZHAA 3C3NA 3FA5A 2XN1A 4DF1A 4JTKA 4H4IA 5T26A 4GUHA 5FF7A 1NF7A 3DAQA 1OABA 1H5YA 4QJ1A 5H91A 2BXVA 3O8AA 4JICA 4N4PA 1TRIA 3NQGA 3C52A 1FWTA 2VENA 5DBTA 1W8SA 3HGOA 2CLKA 4HT3A 2Z0IA 3P84A 2FFCA 1SW0A 3Q2DA 3W07A 4NUWA 4U28A 3O63A 5D04C 4LS0A 2E5BA 4RR4A 1QWGA 3UWVA 5J5RA 2WNNA 3NQ2A 2A0NA 3NXFA 3GLCA 4E2DA 1EB3A 1VGAA 2OZ0A 3TJXA 1ICSA 1TTJA 3U2OA 3UZ5A 4TIMA 5DCEA 4N2YA 3BV4A 1QPRA 3G8RA 1P1XA 3SSJA 2QAFA 4UFHA 4WZHA 2B0MA 3WK0A 3GNDA 3HG2A 5F4XA 2QUUA 5KZMA 3OIXA 1SW3A 1DQWA 3KX6A 4MLRA 3ABSA 4JNMA 1P4CA 3F4WA 3N34A 3GKFA 4UMAA 1GWJA 3TC7A 1GG0A 3TDFA 3UD6A 5L9FA 4JTJA 1I2QA 3W7HA 4Y96A 4XTDA 5BNKA 1H61A 4NXSA 3PWAA 2X1SA 1XFBA 1WV2A 3G3MA 3CIWA 1PL9A 3QQ0A 5AHEA 5E93A 3R12A 5BMWA 1S5WA 5EA9A 4FNQA 2QAPA 3W7MA 4JYDA 3EB2A 4WXZA 2DORA 4N9EA 4NJJA 5G4EA 3QH2A 5KSWA 3C56A 4O4WA 1K7EA 4O57A 2Y61A 3CEUA 2D73A 1VLWA 3DFOA 4E38A 2VELA 1DORA 1GOXA 4KWVA 3LXBA 3HG4A 4YLWA 1MO0A 4A22A 2B7OA 3MHFA 5I3GA 2X30A 2YZRA 3RNDA 3G18A 4ONVA 3SGUA 1HO4A 4LRTA 1PHQA 2WJZA 2Z6JA 2JKPA 4O4VA 2GVLA 5HWJA 1JCMP 1J4EA 3FKKA 1HTIA 3I7SA 3N19B 4O19A 5HR7A 4LVGA 2OT1A 5K4ZA 3LV6A 1EP1A 1PHWA 2H6RA 2BTMA 1RD5A 3OEXA 3B0VC 2B7NA 1KV8A 4EF9A 3TA6A 1NVMA 1SFJA 2ZZ1A 2GJLA 1BWLA 1OF6A 3N2MA 1LOLA 3W1AA 1MXSA 4FX8A 2DP3A 4UXDA 1RQBA 2C14A 3O07A 4JTHA 1BTMA 1GVQA 1KM2A 3BG5A 1J2WA 4FNSA 4B5NA 3TCEA 3PAJA 1RR2A 3W76A 3A9IA 1LTDA 1KTCA 3P62A 1I4NA 4WQ6A 4N6EA 5DBUA 2BX7A 2E5DA 4JY8A 4RZ4A 2BSLA 1TTIA 1TPEA 5CPOA 4LV9A 1FX6A 3MI3A 1YXDA 3TXVA 4IUOA 4GJ1A 2Z2UA 1ZENA 5CZSA 1H1ZA 2CFFA 6TIMA 3QZEA 1OFEA 1E51A 1XBXA 3WJZA 1SQ7A 3ELFA 1KFCA 3M16A 4XWUA 1TRDA 3T40A 3P5ZA 4LY8A 4WOZA 5D09A 4ORMA 3EXRA 2YFOA 3T4CA 4RX0A 4MKNA 1VC4A 4QISA 4JEQA 5LKYA 5G2WA 3CWNA 1DKWA 4LOCA 3TU9A 4FO4A 2Q3RA 1TPFA 3HIJA 4JTGA 4PH6A 2FIQA 1XBZA 4LV4A 5F1UA 4WX2A 2CWNA 3M7WA 5AYYA 2QJHA 4NZFA 2ALDA 2NX1A 4CCDA 2C13A 3P80A 4UUIA 1EWEA 2TPSA 4FNPA 4TX9A 3DENA 2CLLA 4H3DA 1Z41A 1NF0A 3CB8A 4XBSA 2WNQA 1L2UA 3NA8A 2RDUA 1THFD 3OVQA 3QM3A 3HGSA 3L68A 2QDHA 2NUXA 3BGGA 4JY9A 4AF0A 4JYFA 1X1OA 1O60A 2A4AA 5HWNA 3B04A 2F84A 3NEVA 4LWWA 2FB3A 4DF2A 1IXQA 4IX0A 1EP3A 2G95A 4ORIA 5HULA 3TXZA 2FJKA 2RHGA 2ZZ5A 4NVTA 3G1YA 4N9BA 4HHPA 5D03A 1OF8A 5K3VA 3EKZA 3GDLA 3GKAA 1UCWA 5GVJA 3W7EA 5F1VA 4NXKA 4FB7A 3EX4A 3UXDA 5LNSA 3TROA 2ZRUA 4HPJA 1QPNA 2UV8G 3G1XA 3PUDA 3CTLA 3W6YA 1ZAIA 4K8EA 3EWZA 5AHNA 3CQ0A 4OWGA 1YDOA 2X1RA 3Q37A 1LROA 1H7PA 2OJPA 3C61A 1OFBA 4N9DA 5AC8A 2V2DA 1X7FA 2Y7DA 1A5BA 1JQVA 4A2SA 4GC4A 1QDSA 1QFEA 2NV1A 3M9YA 3UWUA 5CSRA 4LS2A 3PULA 3PY2A 5I3KA 4QSHA 1TREA 3HG5A 3UYCA 2QEZA 2Y7EA 3L9CA 1ONRA 3LXAA 3LDVA 5DY3A 1MEHA 1TSIA 4XQ6A 2ZQ0A 1WAUA 2VFGA 2WQPA 1H7NA 3C8FA 5IBXC 3W7RA 5U7SA 4WJEA 5FF2A 1LM1A 5D2WA 3UY8A 3BARA 3G1HA 4LNYA 1F74A 1KTBA 4ML9A 1SR9A 3TQ0A 1EP2A 2YXGA 4PCFA 1ZJIA 3BVJA 4X9SA 1VLIA 4PTNA 3EX3A 2C16A 3OA3A 1FY6A 4JS3A 2DZSA 1W5PA 4HNUA 1T96A 4Y90A 2V5LA 2V81A 2AGKA 4BF9A 4O18A 4RK8A 1FCQA 3GK0A 1G7UA 3LXCA 5IM51 3LTPA 4IXXA 1K8XA 1M6JA 2EHHA 3O06A 2C3ZA 4LC6A 1A5CA 2Y70A 3TW7A 4CQAA 1H63A 3RFAA 5C55A 3VFLA 1L6WA 4IXHA 2TYSA 3GAYA 3IGUA 4NJIA 1SPQA 1QCWA 1YPFA 5CPMA 5A8GA 4CNOA 1I45A 2ISVA 5F4SA 4UTTA 1GVRA 1OFQA 2QCDB 3E02A 2GQ9A 2J9XA 1SZNA 3TC6A 1YXYA 3QSRA 5FEXA 3VE9A 5AC7A 1XKYA 4DQWA 2A2IA 1K7FA 2HMCA 1GVOA 3G1FA 4HKPA 3SGZA 3IEBA 1K8YA 2PRHA 3BO9A 2V5BA 3MJYA 3L21A 1CW2A 4O1BA 3P82A 1KBIA 1P5BA 4LS1A 3EEGA 3GXTA 4FNUA 4OT7A 1FXPA 4M5PA 3GNNA 5DXYA 2GPTA 1FCUA 4OV9A 4MJZA 3IIZA 4UFKA 1OX4B 4E0CA 2AQWA 3LCWA 3G22A 4PC8A 5F2MA 3NQAA 4IMGA 1AW5A 5CPNA 1VS1A 3L0KA 3QMSA 4GE8A 3W7DA 3M41A 4Y8FA 2XN2A 1XDLA 4MIMA 5F2LA 1S5TA 3P74A 3NQMA 3LBCA 3DFNA 5HWMA 3R13A 1W3NA 3M5ZA 1ZCOA 8TIMA 1GPWA 4AVFA 1UBSA 3LCFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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