3EWXA

K314a mutant of human orotidyl-5'-monophosphate decarboxylase in complex with 6-azido-ump, degraded to bmp
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
257
structure length
256
Chain Sequence
MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKHEFLIFEDRAFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Lys314 is a nucleophile in non-classical reactions of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 95
structure length 256
sequence length 257
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2008-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ewxA00
2EHHA 2OCZA 1JCLA 2CLMA 4Y96A 1A53A 3PF3A 2CLFA 2IQTA 5EPDA 2AQWA 1SZNA 2OT0A 4M6VA 1YXYA 1B3OA 4AWUA 4PTNA 4MJZA 4XKYA 5E0KA 3G1SA 3C56A 1GYLA 4Y6GA 3W2LA 1CX9A 4K8HA 4UTJA 4UFHA 3LTYA 3BV4A 1O60A 5DXYA 7TIMA 1K3UA 2ZRXA 1KTCA 3PUOA 3FIGA 2E6AA 1FDJA 4UMAA 3L0NA 3R8RA 3FS2A 4DBDA 5SWUA 3T7VA 3GNDA 4LNYA 4MVAA 3TIMA 2Z1BA 4RZ4A 2YYUA 2NUXA 2QDGA 3FEMA 2ISWA 1UJPA 4JYFA 4S2BA 3DI1A 4M5PA 4LV9A 3TNOA 4NX5A 3UWVA 4ALDA 2DZVA 1YXDA 1B4KA 3LTPA 2V9DA 3C8FA 1LRNA 3WJZA 1OF6A 4UNLA 4K7YA 3PB0A 3NL5A 4P2VA 1O4UA 4CQ9A 2X1TA 1VC4A 5CSSA 2YCEA 4WOQA 4XBKA 3TC6A 4NXSA 3W23A 4OV4A 3C2RA 1WA3A 2WSQA 3R12A 2WNZA 1ZY9A 1TV5A 1FWRA 1XXXA 3HB9A 3A21A 1ADOA 3FJLA 3MP5A 5TIMA 1MEHA 4KFNA 1LRQA 4TMCA 3RF9A 5LNUA 4PL2A 2VFGA 3G1XA 2OJPA 3IVUA 3KFTA 2A6NA 4MFEA 1LBMA 2EGZA 4GE8A 4O13A 4X22A 4N9BA 2YSWA 1DJNA 3M43A 3ZWSA 1LDCA 4O4WA 5IBXC 2BX7A 1W3IA 1LBFA 2QCLA 5FF0A 5U7SA 2I1OA 3W7EA 3KHJA 1XC4A 2ZZ6A 4R33A 2NV2A 3GDLA 5LNWA 2R14A 4YWIA 4AF0B 3HGSA 4MLJA 3MJYA 2ZZ7A 1F05A 3F4NA 4GNJA 3M6YA 4L4MA 4DXVA 2WOQA 5HUPA 3C2VA 4DEFA 3V1PA 4O0ZA 4LU0A 3SGZA 3TW7A 5KINA 4OHQA 4JYDA 3VFLA 2DU2A 2PRHA 1ZCOA 1TTQA 4YLWA 3GKAA 1FDYA 2NUYA 1Y0EA 1EIXA 1YPIA 3WJYA 2TMDA 3MHGA 2J27A 3TJLA 3SSJA 2XFWA 1W5NA 5D2VA 1L6YA 3HGJA 4IMDA 1Z44A 2Y61A 1PIIA 1XBYA 2C0AA 3THQA 3S6DA 4RXFA 4QITA 3NGJA 3WJXA 4DPPA 1QPOA 3P74A 1UUOA 3NL3A 2CZFA 3TUUA 1DKWA 1W1ZA 4GFSA 5I3JA 3W7PA 2HSAA 1TTPA 3N14A 1IXOA 1BKSA 1M7PA 3NQMA 4OGZA 3NNTA 2ISVA 3I7SA 5CZSA 4CQAA 4JEQA 2CLOA 4JTFA 3W1TA 1SO6A 3S1VA 3TW6A 4DO5A 3JR2A 1KM4A 2VEPA 5CZTA 4O18A 2X2GA 1FWWA 1AW2A 2Y89A 2TPSA 3N9SA 3NA8A 4ORIA 1P1XA 4XQ6A 2C16A 2LLEA 4I9AA 1OFPA 4LT9A 1KFJA 4E0CA 1LRTA 1KFLA 3C0JA 1TRIA 5CGQA 4FO4A 3TSDA 1YLVA 4QNWA 1PHQA 1S3HA 3P5ZA 3ZR4A 1OK4A 4FX6M 2Q3RA 3NQ8A 5DY3A 3BLFA 3IV3A 2JK2A 4GUJA 1W3NA 3HG5A 4EWND 1TMHA 2C13A 4IWWA 3W73A 4NQ1A 1K8YA 3IRDA 3G0SA 2B4GA 5KITA 3GYEA 3VE7A 1GEQA 3U2OA 1TPWA 2NZLA 4AXKA 1GWJA 4TR9A 3UY7A 4U4MA 4UFMA 4Y9AA 1H7XA 2EPHA 3L21A 3QEZA 1NVMA 1EP3A 3QQ0A 3HO8A 2C3ZA 3H55A 5FEPA 3FKKA 4JTJA 1YDOA 4LVBA 4CCEA 3M9YA 2V2HA 2G95A 4FEZA 5D03A 1F7BA 4HSNA 5DN1A 4Y90A 4OT7A 5AHFA 4NU7A 4HNNA 4LW7A 5AFDA 2C18A 2HS6A 2VOMA 3M0ZA 5I3HA 3NL2A 4CCCA 4BI6A 2E77A 1SW0A 3LLFA 3NQAA 1UBSA 4JDYA 3JRKA 1SW3A 4NJHA 1ZAHA 3DFPA 1SZGA 1PCWA 1DORA 3ABQA 4JICA 3UQNA 3DGRA 4IX2A 1OX4B 1XBZA 2VENA 1GG1A 2H6RA 4I7UA 1SO5A 1LLWA 2NXIA 2QCDB 3KRUA 3WJWA 1ME8A 4LC6A 1VLIA 3W6YA 4R7JA 1WAUA 4GWEA 3TMLA 5EL1A 4DF1A 5G2IA 4MZYA 3CM4A 1PS9A 1EA0A 1KV5A 4BWLC 2A85A 5CKSA 3R89A 2V2DA 1FUYA 4IPJA 3A5FA 3GKFA 4K37A 4WX2A 1WOBA 3LLDA 2QCCA 3PY2A 2G5WA 3BARA 1FY6A 3FLUA 2GJNA 3M7WA 5G2WA 4YCOA 2KZHA 1FWTA 2E6FA 1XCFA 1AG1O 2YZRA 3CEUA 5G2HA 4FF7A 3KRZA 1SZEA 3OBKA 1XFBA 3EWYA 4NZJA 1FX6A 4P61A 4G1KA 2DZPA 4KWWA 3BLIA 1GOXA 2PRMA 3A5VA 1BWLA 4RX0A 4B5NA 3MHUA 3G8EA 4LVDA 1A5CA 1NF0A 4OV9A 2ZA3A 3ZWTA 1K02A 3QMRA 1EUAA 4DF2A 2ZRVA 4JTEA 5U4NA 3O6YX 4AWTA 1JJKA 3HGOA 2GVLA 1K8ZA 4UUIA 4WUIA 1ZJIA 1A5BA 3CTLA 4LWWA 3G0UA 2P0OA 1GVOA 2ABAA 4K6AA 1JQXA 3G1DA 3CEPA 3W1PA 3K30A 5LKYA 3M16A 1KM1A 1JCNA 2PURA 3QRHA 3PBYA 4OE7A 1OJXA 3NQEA 1L9WA 2BSLA 2RH9A 1YYAA 3G1VA 3S1XA 3BW4A 5K9DA 4HHPA 1XDMA 1FCQA 3MP4A 4O1DA 1QAPA 5K9XA 3EX3A 2BXVA 3RNDA 4JGDA 3GXTA 1TIMA 3UPBA 1QOQA 1KLYA 3LRMA 3V75A 1OVDA 1QNVA 1RQHA 1C8VA 3C4UA 3QPYA 5FF4A 3L2IA 3PAJA 1H62A 5H2ZA 1F6PA 3LOTA 2C19A 5BNKA 4NJKA 1TRDA 4AHPA 1WOAA 1FWSA 1GQNA 4O1BA 1JQVA 4LTSA 3EX1A 4FNQA 3SFKA 3C3NA 5DLCA 1GZGA 5I3GA 1PHWA 4R34A 2ZA1A 5D38A 5I3FA 3OHIA 1J4EA 3IEBA 3W2NA 2YFNA 5F1VA 4N6FA 4A22A 5K2ZA 3A23A 3EWXA 5FF3A 5J5RA 4FNRA 3EWWA 3UXAA 3W75A 1H60A 2WQPA 1NF7A 3UNDA 2CZDA 1KM0A 1P0NA 2CLKA 1KLZA 3T55A 5DCDA 4MY8A 3NQGA 2A1YA 1T0OA 2PE4A 3C52A 4CQ8A 2X1SA 6ALDA 5BMXA 2RDTA 4NXKA 1WDWA 3BVJA 1QO2A 3F03K 3DENA 3W9ZA 3HF3A 3USBA 1O5KA 1TV8A 2R94A 2NXHA 3DFNA 5HR7A 3N9RA 4X9SA 2GQ8A 5FF2A 4BI5A 5D02A 3PBWA 3SW6A 5C55A 3BLEA 3UWUA 4NJJA 5C2XA 3FOKA 4LUJA 4DF0A 5EY5A 6TIMA 4M6PA 2XN2A 4IPIA 3S42A 2BZNA 3MMTA 5L9FA 2H90A 3QH2A 5C54A 1KBJA 4UTIA 3JS3A 4HPXA 1PVNA 3LB0A 4OQVA 1SR9A 3DKJA 1G4TA 1L6SA 4IXXA 1TCDA 2JKAA 2G97A 3EXRA 4L4LA 4RV8A 2GUUA 1HG3A 1DJQA 2OT1A 1G4PA 3W7RA 1Z48A 2ZCGA 1NEYA 4UTTA 1JVNA 1NAL1 2I14A 4CNNA 4C1LA 2Y7DA 1I2QA 3LCIA 2QF7A 3PSVA 3I65A 3KVKA 4MKNA 3NPWA 1TPUA 3NVTA 3QM3A 1OFAA 3QJAA 1VHNA 1EEPA 1YADA 5AYYA 3OEXA 4AVFA 1ICQA 3E96A 3MWAA 3G1AA 1Q3NA 5DXXA 2V30A 3QMSA 3IVTA 4O14A 3TFCA 4ICNA 4IMGA 3THAA 3W86A 1W5PA 3HG3A 4N4QA 4GXMA 1GVRA 3B04A 4N9DA 3GDTA 1OABA 1ZAIA 3A22A 1LCOA 4FXSA 1KM3A 1W56A 1XUUA 3TSMA 1HTIA 2TRSA 3HPZA 4O0KA 3DH7A 4E2DA 3FA5A 3KRSA 4LS2A 3M5YA 1R2TA 3W1UA 4IQLA 3W7DA 3SY5A 2EAWA 4HT3A 5KMYA 1Z42A 2WSRA 4O17A 4XUGA 5D2YA 3O16A 4WD0A 1M7OA 1SQ7A 2A7PA 1FQ0A 1IXQA 3NQCA 2ZBTA 2V5BA 3UWYA 2A5HA 3LCLA 3MW7A 4UTWA 3DXIA 4ZQCA 1U83A 5G1YA 4MLRA 1KFKA 3NAVA 1H51A 3YPIA 3Q37A 3NZ1A 4S2CA 1A5AA 4Y8FA 5HWNA 2V81A 1RV8A 3DHFA 4KKXA 3MO7A 2DZUA 3IIVA 3P82A 1JRBA 1E51A 1VYRA 1OFOA 1EB3A 3W74A 1U5JA 3W83A 1IIHA 1RQBA 4QIUA 5LGZA 3W7GA 5HQEA 3TQ0A 3T40A 4K39A 4O1AA 1W0MA 3UWQA 3IGUA 2QCGA 3M5VA 3EX6A 5G1TA 2FIQA 4OU1A 4LV4A 5D09A 2EF9A 1QO5A 1H61A 2A7RA 3L5AA 2B7QA 2CW6A 4Z0SA 3UY8A 4I7VA 1LM1A 4DQWA 1KTBA 5HMSA 3FFSA 4N2YA 4ML9A 2DZTA 2VFDA 2WKJA 2Y85A 3P8JA 4UFIA 2WSYA 3QW3A 3MI2A 2YDAA 3TAKA 1X1ZA 3LDVA 3B0VC 1J2WA 3LRLA 4I7WA 3L0GA 2C1HA 4GUFA 3TA6A 1X1OA 3PR2A 1XBVA 2ZFAA 4JS3A 4RJEA 5DY2A 3TKFA 2ABBA 3PWAA 3A24A 3GR7A 3HOJA 1M6JA 3W1QA 4JD4A 5LSMA 2WV8A 5K3VA 1LZOA 4RR4A 2J9XA 1JCYA 3F1QA 4DO4A 4HKPA 1ZENA 2JGYA 2VELA 3MI3A 4HPJA 1LBLA 3KOFA 2GJLA 3E12A 4W9TA 5G5IA 3UXDA 4JTIA 4N9EA 4CNOA 2WO5A 3O8AA 4UNKA 5CPOA 5HJLA 2WJZA 3OVPA 3W07A 3DZ1A 3PB2A 3B03A 3NXFA 1I2OA 3GVGA 2ATMA 2R8WA 3CQ0A 3W88A 4A2SA 1F5ZA 1PV8A 2X1RA 5CG7A 3W7KA 1OYBA 2QAFA 3GX9A 3RFAA 4RLIA 2DP3A 4EVZA 5D32A 1HFBA 3EKLA 1VZWA 2ZRWA 2A0NA 3IIOA 1TJRA 2GOUA 5J5DA 5FI8A 1AL8A 1MXSA 1T8XA 3Q94A 4GBUA 2A21A 4FNTA 3C2OA 3RLUA 4AB4A 4HNUA 1LOLA 2VEIA 3PM6A 2P10A 5D30A 3UYCA 2NX1A 1GPWA 3LCWA 3N34A 3I7RA 4S1FA 4WZHA 1XKYA 5EMUA 3PBUA 2CLLA 4GC4A 1TTIA 1EX5A 3HG4A 3WK2A 5BMWA 3DBPA 1JCXA 1LYXA 1TPB1 2NV1A 2Y7EA 3BG5A 2ZDRA 3NQ2A 2VEMA 3RMJA 5LGXA 3BW3A 1JULA 5CZJA 1HO1A 1TPFA 4YXGA 1OFBA 4AH7A 4LVAA 3W87A 1JUBA 4NNCA 4FNSA 1B9BA 1FXPA 3BG3A 3P5YA 3TXVA 1GVFA 5KZDA 4RXGA 1R46A 2QEZA 2FB2A 5CPLA 3GR8A 4Z1DA 5DBTA 3LHWA 4ZMGA 4YMZA 1VGAA 2OMAA 3W7HA 1RQEA 2ZZ1A 4IGHA 1GVSA 2ZQ0A 2BLEA 3M5XA 2B7PA 3A9IA 4DELA 1J5TA 3W7NA 3GIYA 3GB6A 2AAMA 3HIJA 4OWGA 5BRBA 3ABRA 3D0CA 1H7RA 2V8ZA 5HWJA 3LCXA 1VQTA 3EB2A 3GLCA 4UMCA 3MYOA 3TAOA 1OX5A 2YW3A 5EYWA 1FWNA 2V2CA 1G4EA 3DI0A 4JIPA 1XM3A 2QUUA 4OBTA 3EWBX 4JIQA 4GUIA 2NLIA 2QJGA 2Y63A 3G22A 3HBLA 1KM6A 4FIRA 1X7FA 3L9CA 3TDFA 3NQDA 1I2NA 5A5WA 2QUVA 2NX9A 5AOUA 3KAOA 4AF0A 4O12A 3GZ3A 1W54A 2YR1A 2GQAA 5D05A 2VFFA 1KV8A 2GVJA 4NJGA 3HGRA 3LCHA 3DKLA 2UV8G 2ZYFA 4POCA 3UD6A 3I7QA 2OZ0A 4O19A 3CU2A 1WQ5A 3IGSA 2Z0IA 4ZQPA 3W70A 5F2LA 3W2UA 1FCUA 1KFEA 1R47A 3GDKA 3W7IA 1TTJA 1RZMA 5LNRA 2QCMA 4GRSA 4MOZA 3P61A 4H4IA 2Y62A 1YXCA 3SIZA 4HNVA 3NYZA 3P8IA 2FFCA 1H7WA 1F6KA 4O15A 3FYOA 4PODA 3C61A 4UTTC 2JKPA 5F4XA 5LHEA 4JDBA 3G1HA 3O07A 1KM5A 4O57A 3PULA 1EPXA 1TPVA 1H1ZA 2E5DA 3E02A 2V82A 3S0CA 3TROA 5T26A 1VPXA 2F7FA 3KX6A 4JYEA 3W71A 3TFXA 5KZMA 3QW4B 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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