3EX3A

Human orotidyl-5'-monophosphate decarboxylase in complex with 6-azido-ump, covalent adduct
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Lys314 is a nucleophile in non-classical reactions of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
total genus 97
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2008-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ex3A00
4I7WA 4ZQNA 3TROA 2VXNA 1IIGA 3GK0A 1SR9A 3P8JA 2E6DA 5HJLA 3W86A 1FUYA 1C8VA 3F4WA 3GAKA 3W7CA 4YCPA 3HB9A 3NQ6A 2ZQ0A 4UIOA 3HGOA 3IRDA 1X6UA 2WQPA 3HGRA 5G1TA 4TMCA 1E51A 1QR7A 1LM1A 4RXFA 1P0NA 2HS6A 4UTTA 4N2YA 4X3ZA 3M5ZA 4AXKA 4E0CA 2QJIA 3HGJA 2WO5A 4FX6M 3W84A 1TPH1 1VPXA 3W7HA 2C3ZA 2C15A 3O8AA 2NWRA 4O57A 3NQCA 4CLMA 2EKCA 1A50A 4HNTA 2RDTA 4FNSA 3IVSA 4E2BA 5D03A 2V2CA 2QCNA 5FEWA 2NX9A 1EP1A 3CT7A 2J6XA 5DLCA 1KM5A 3NL2A 4WJEA 3DFQA 2ZCGA 3F1QA 1KV8A 3M43A 5KINA 3L68A 1ADOA 4WOZA 4O10A 4UTMA 1H5YA 1WBHA 3LHTA 2Y85A 4RLIA 1W5PA 3TAKA 3MJYA 5LNSA 3TXVA 4E38A 1YXDA 1OX6A 4ORMA 3OVPA 2NZLA 2QUTA 1GVSA 1NSJA 2J27A 4H6KA 1OX5A 4JTUA 4RXGA 4CQ9A 2WPBA 3MYPA 4AB4A 4A3UA 1UASA 4D2JA 3NGJA 4MLJA 2QJGA 5AOUA 1AW1A 1GZGA 4A2SA 3LCXA 1J2WA 3O15A 3O1NA 1FXQA 3S5NA 5D30A 3W6YA 1BKSA 5A5WA 2B7NA 3LCFA 3LLDA 3FJLA 3DKLA 4KFNA 3PC0A 1QOPA 3TA6A 2YSWA 2JGYA 1TTIA 1LOSA 1F5ZA 2E5BA 4PC8A 4PEKA 3P5YA 1ML1A 2GVGA 4TU1A 3FIGA 1OFOA 2A6LA 4JTGA 1G6CA 5KZMA 1QPRA 3W76A 3RMJA 3G1AA 4N02A 4JDBA 3JR2A 5EL1A 6ALDA 2Y7FA 1VCGA 4UTTC 3W2NA 3SGUA 2QKFA 1R2TA 2A0NA 3TQVA 4TO8A 5AHMA 4O16A 3M41A 2TMDA 1QPQA 4DO5A 1LRNA 1KTBA 4NXSA 3W2LA 2ZRYA 5EY5A 2YXGA 4L4LA 2A85A 1EP2A 3W7LA 3R8RA 3IIZA 1KA9F 4DBDA 1GYNA 1WYIA 3ATZA 5J5DA 2FDSA 1JULA 4EF9A 4YCOA 3TC7A 3G1DA 2FPVA 2A7PA 3LV5A 2GQAA 2BLEA 3W07A 4YMZA 4DF2A 1YPFA 1M6JA 3TH6A 2QAPA 1OF8A 3S8HA 3GDTA 3NAVA 4N9BA 1W5OA 5DCEA 4HSOA 5D33A 4UMBA 3D0CA 1NF7A 3DFPA 1K7EA 1I2PA 5IBXA 1SPQA 3PM6A 1EPXA 2TRSA 4DQWA 4EF8A 1CW2A 3IIOA 3B8DA 5HWNA 3ZWSA 2DZXA 2YW3A 5HR6A 4O17A 3M5VA 3W1XA 2QDHA 3EKLA 3ZR4A 1MEHA 4MJZA 3A24A 4X2RA 2BSLA 2WSQA 3TMQA 2B7OA 4QJ1A 4O4VA 2CZ5A 2CW6A 5G4EA 3ABRA 3FEMA 2TYSA 4KFOA 1ONRA 1Z41A 4TMBA 1TPVA 4LC8A 3A22A 2CU0A 5DXXA 3T55A 1QDSA 4JY8A 1LLZA 2QCFA 3CPRA 3O06A 4UFKA 1KM4A 3SW6A 3O16A 2VEPA 4NQ1A 5HUPA 4CNPA 5AN7A 4KFPA 1GVQA 3MWAA 4NX0A 1H61A 1M7OA 4IGHA 5C54A 1OX4B 2C1HA 1PIIA 2O7QA 1QOQA 2TSYA 4AWTA 3WK0A 1W54A 1VR6A 1OFEA 3N14A 1SSDA 3UXDA 4RR4A 3G24A 5K7JA 1B3OA 1XBXA 1K7XA 6TIMA 1WA3A 2J9YA 4AMAA 3DZ1A 2OX1A 4NJHA 3PBWA 1I2OA 3HPZA 1B4KA 2V81A 4O4WA 1VLWA 3CU2A 4AAJA 5HWMA 1FDJA 3LHYA 2EHHA 3QH2A 5K4ZA 5EYWA 3FYPA 3LOTA 2QJHA 5FF0A 5EKYA 3CEUA 1N8FA 5CSSA 1W0MA 1IXOA 1QNVA 4MKNA 3ABOA 3OHIA 5AHLA 2QCDA 1OFDA 1UUMA 1VYRA 2WSRA 1H50A 2VFFA 3PG8A 4OQVA 3QJAA 1GEQA 1L6SA 3NL5A 3O05A 4LTSA 3N9SA 1WQ5A 5IBXC 5K4XA 5K2ZA 3ATYA 5CGQA 5KZEA 1QPOA 3W9ZA 1LORA 1H7OA 4MFDA 3L65A 3LX9A 1GVOA 2ZA2A 5GVJA 3DBPA 3BG9A 3HOJA 2RDUA 2VFHA 2Y89A 3THAA 4WX2A 3GXTA 3MI6A 1G4PA 4M6QA 2YR1A 1CX9A 1OG0A 3NNTA 1NVMA 4JGDA 4LU0A 4Y8FA 1P1XA 2X30A 4O13A 3W1PA 3FS2A 1GVRA 3NQMA 5HQEA 2QAFA 2EAWA 1JRCA 3W7GA 5KZDA 2GUUA 3DFOA 5CPMA 1Y0EA 3QF0A 1OF6A 2DZWA 3TSDA 1P5BA 2CWNA 3HIJA 2QCLA 3GNDA 3OEXA 3GDLA 4UTUA 2G96A 4XZ9A 1AL7A 1KFKA 4K6AA 3MBDA 2CZEA 2Z6IA 3HG3A 4FX8A 2VELA 3UY7A 3S1UA 2X1UA 1SZNA 1RD5A 3LTYA 1HG3A 4DF0A 1H60A 4EOUA 4H3DA 4ADSA 3ZWTA 2ZRWA 3B0PA 1SSGA 1VJIA 3GKAA 3W85A 3THQA 3LI0A 3LRMA 1H1YA 3W1QA 2OCZA 1VGAA 1FQ0A 2FB2A 4XWUA 1PV8A 4LY8A 2H3DA 3GXPA 1PCWA 1WOAA 1K02A 4JYDA 2Y62A 3N73A 1SW0A 4XUGA 3LHZA 2ZTJA 4UFMA 3KX6A 3MHUA 3TR2A 1KTNA 4DPPA 3TXZA 5C6MA 4QIUA 4JEQA 2ABAA 3SSJA 3C56A 2TPSA 4UTHA 3TFCA 4RV8A 1S5VA 4HHPA 1B4EA 4QITA 2FFCA 3CEPA 4JR5A 2D73A 3W1RA 1ICSA 3UWYA 4AF0A 3NA8A 2C18A 3L21A 1Q6QA 3KVLA 2G5WA 1I2RA 1RQHA 3MUXA 1QAPA 3KVJA 3PR2A 3EEGA 1XI3A 4AHPA 5HWJA 4ML9A 3G0UA 4M6PA 5HULA 4AVFA 4OHQA 1SO3A 2RFGA 3EWYA 3VKJA 1EX5A 2PCQA 1KLZA 3L5LA 1FDZA 2Y7EA 1LLWA 3W1NA 1KBJA 4MJMA 3FKKA 4UTIA 1EEPA 2C16A 3PULA 1LOQA 4M7TA 1AL8A 4DO6A 3KHJA 2VEIA 1TB3A 5EA9A 3S9YA 3C61A 5F4SA 2ALDA 5L6UA 2ZRVA 1ME9A 4O11A 1TJPA 3FFSA 1JR1A 4XKYA 5FF4A 2GVJA 2ZRZA 3E0IA 4BI7A 3FYOA 3NVTA 4XBSA 4NU7A 1H63A 1N55A 4GWEA 4GUHA 5CZ0A 3QFEA 1FWNA 3CWNA 3BGJA 4O19A 4Z0JA 3SFKA 1QO2A 4N9DA 4UTLA 1K8XA 1K03A 3S1VA 3NQEA 3W73A 1C9DA 3GDRA 3NPUA 4FIQA 3MI3A 3IGUA 1KLYA 4WOQA 2YZRA 2WJZA 4UFHA 3C2VA 5CSRA 3P8IA 1F05A 1OFAA 3QRHA 1F2JA 2W6RA 1FXPA 3G22A 2V8ZA 1N7KA 2ZZ4A 3G1YA 1X1ZA 3CQ0A 5G2WA 3FOKA 3OVRA 5G5IA 1S3HA 1TCDA 3NQVA 4N6FA 4ZQMA 4FO4A 1I2QA 3ZS4A 3B4UA 3BPWA 1P4CA 3HG5A 5BW6A 2Z1BA 3TFXA 3IGSA 3EX3A 1R46A 1TO3A 3UXAA 1JRBA 3STEA 4JTKA 4JYFA 3NDOA 4QNEA 3N34A 2P0OA 4J9JA 3H54A 5I3JA 1IXNA 1LZOA 1THFD 1TQJA 3CB8A 1KFLA 1OFPA 3S42A 1S5TA 4PCFA 3WJWA 4HSNA 3BLFA 3G8RA 4IPJA 1PCKA 1NFBA 1LBLA 1FWTA 1XBZA 4FNQA 3LM7A 3IGXA 4IMGA 3LCIA 4LVDA 3BG3A 1GVFA 4MPQA 2G97A 3CC1A 2QCDB 3PBYA 3EX4A 3WJZA 3P61A 4K7YA 3LV6A 4P2VA 4PA8A 1EP3A 1Q3NA 1D3GA 4JTLA 1ZCOA 1XBYA 2V82A 3DFNA 4R34A 1TPB1 5I3IA 5TQLA 3I68A 3DU0A 3M7WA 3M1ZA 4LVFA 4O54A 3W71A 4TX9A 2HSAA 3NZ1A 5FF2A 3UNDA 4ALDA 3R12A 3L67A 4UC5A 1SQ7A 2X1RA 4LWWA 2NUXA 1OHLA 2ZZ6A 1ICQA 1WDWA 2ZA1A 2J88A 1VC4A 4UTKA 2J9ZA 1LTDA 3UY8A 5LGXA 4AWUA 4WZHA 2Y6ZA 1HFBA 1G7UA 4FXSA 3DKJA 3W87A 5K9XA 4NNBA 1W31A 4O15A 4FX7A 5E1QA 3P81A 1UBSA 5I3FA 4OU1A 3W2MA 3SR7A 3C6CA 3V1PA 1L6WA 1TPDA 1BEUA 2C13A 1JQXA 3LDVA 4TR9A 4LVGA 2ZTKA 4HN4A 4Y96A 2H8ZA 2A1YA 3NPVA 4XTDA 1EA0A 3KVMA 4MVAA 5I3KA 4DELA 1DJNA 1YDNA 3L9CA 1FX6A 4YLWA 4AHQA 4O14A 2WOQA 3QMRA 2YCEA 2YGYA 4WY0A 1VZWA 4R53A 5D37A 3M9YA 2RH9A 3TDFA 3DFSA 3AO0A 2H8XA 5SWUA 2VOMA 3UWWA 1VYSX 3TJLA 1DQXA 3G18A 3E9AA 1FWWA 1HUVA 2Y88A 4WY0F 3QQ1A 2EF9A 3E96A 1I4NA 3P60A 3PAJA 2J24A 1TPC1 4AF0B 4LT9A 1A5BA 3TW6A 2O7SA 2H3BA 4IXXA 2NV1A 1X1OA 3PBUA 2C19A 2CLKA 5CZSA 1UUOA 1GYLA 5F1VA 4UFLA 3P74A 2FB3A 3I7SA 5LNUA 1X8FA 3RU6A 1O4UA 2Z2UA 4RZ5A 4WXZA 1KM0A 3RFAA 1G4TA 3I7QA 4C1LA 2PC4A 1YTDA 4LS1A 1SFLA 2P10A 3GKFA 4IUOA 4N9CA 1OABA 3BG5A 4ICNA 3M16A 4P61A 4HNNA 3CHVA 2DZUA 4ONVA 2CLFA 4FF7A 3M5XA 1XKYA 1XUZA 1L2UA 3EWWA 1IXQA 4Z1DA 4AEOA 5J5RA 2FQIA 4WUIA 5CKSA 5D05A 1QO5A 2I9EA 4Z0SA 2NXGA 3E12A 7TIMA 4N4QA 2YW4A 3P7YA 3W7DA 4XKYB 4Z1CA 4MIMA 1AMKA 1PHQA 3R2GA 2XN1A 4LVAA 4BWLA 2YDAA 2ZDRA 4RX0A 3TE9A 2X2GA 3TC6A 3T78A 1BWKA 2DP3A 3W72A 4RJEA 4H4IA 3BK0A 3NPXA 1YADA 5MHBA 4W9TA 4R7JA 1MZHA 2Y7DA 1ALDA 3G1FA 1Z48A 2NLIA 3QSRA 2H90A 3PUEA 2A2IA 2VFIA 2NUYA 2DZPA 3G3MA 5D2YA 3NG3A 4TIMA 3A23A 4S1FA 1TPEA 5FEXA 4FHAA 3O6YX 1QMLA 4JTHA 3EWXA 4HNUA 5D02A 3QEZA 1RR2A 4U28A 2ZZ2A 2EGZA 3NQ2A 5F2GA 4UTWC 4ZL1A 4JN6A 3KRSA 2R8WA 3PWAA 3WJXA 1BTMA 4O12A 4IXHA 1IIHA 2E6YA 4DF1A 3UPBA 4JYEA 3NQ8A 3Q37A 2CLIA 4LNYA 3W7PA 3LXBA 3HPXA 1SUXA 1F6PA 1O95A 3EWZA 3W7RA 3HBLA 1M7PA 2WNNA 1X7FA 2Y63A 3IV3A 4JIQA 1MSSA 4KKXA 1EUNA 3N2XA 1TTQA 5FF3A 5AYXA 3HF3A 3MYOA 1ZAHA 4FNRA 1OFQA 3LCGA 3Q94A 3GX9A 4Y6GA 3P67A 3EXRA 4MUZA 4XTIA 4DPQA 5AHNA 2NX1A 4GBUA 1VCVA 4OWGA 1AW5A 1P0KA 3O6CA 2YYUA 2W0UA 2A6NA 2YFOA 3LCHA 1SO6A 1NF0A 4CNOA 4AHOA 1KM1A 3NQGA 2ZA3A 4NJGA 5BOOA 4Q32A 3ANYA 3CLMA 3W75A 3W7EA 3TNOA 1ME8A 3GXNA 3NPWA 2RHGA 3CIXA 4LW7A 3S6DA 3W1UA 1I2NA 4B5NA 4LS0A 3HJZA 5F1UA 2GOUA 4QNWA 4JIPA 5K9DA 3BW3A 1A5AA 4IMFA 4BWLC 1W8SA 4EIVA 5C2XA 2NXHA 1KM3A 2JBMA 2ZYFA 3UD6A 3NQ7A 4Z1BA 1W5MA 2XN0A 1RZMA 1KFJA 3GIYA 2QCCA 2ISSA 1Q6LA 3EXSA 4BK9A 3GYEA 3GNNA 2ZZ1A 2GJNA 1QWGA 4MY8A 1JCMP 1PHWA 2W79A 2FTPA 5LNRA 1JCYA 3C0JA 2CFFA 2JK2A 3GDMA 4O1AA 1KTCA 2QCMA 1VS1A 3OVQA 4KWWA 5H2ZA 2ZZ7A 3E02A 1V5XA 4JY9A 1TMHA 2QCEA 1JJKA 4GFSA 3W7KA 3P80A 3M6YA 2E1DA 3VE9A 1H62A 3RLVA 1TPFA 4O52A 1LDCA 1DOSA 1KFCA 5K3VA 2QCGA 2C14A 5H91A 4MZYA 5DELA 3TQ0A 2Y61A 1MEIA 5BMWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3WDR A;  2JAL A;  5A6M A;  2XIJ A;  3UVA A;  3CO8 A;  1G94 A;  1WDP A;  2E6D A;  4JTA A;  3W86 A;  3VDA A;  3CV6 A;  2DUA A;  3F4W A;  3GAK A;  3W7C A;  4ZTY A;  3HB9 A;  2QII A;  5LIW X;  1GJW A;  3NQ6 A;  2ZQ0 A;  4UIO A;  2VTF A;  1E6S M;  3IRD A;  2WQP A;  2DH2 A;  2Z27 A;  1LLO A;  1PX4 A;  3WD0 A;  4X63 A;  1QPK A;  4UTT A;  1HXJ A;  2JIE A;  1TWZ A;  3GTF A;  1XS2 A;  3HGJ A;  3T8Q A;  4W89 A;  4LUT B;  4JTC A;  4UQB A;  1W3L A;  2DW6 A;  2E8Y A;  3L4V A;  4L6D A;  2PF0 A;  5JQ9 A;  3MUA A;  1EEX A;  5M2F X;  3GXI A;  4CLM A;  1XLA A;  3B40 A;  5D03 A;  3EA2 A;  2NX9 A;  2J6X A;  3WML A;  4GH3 A;  3KW3 A;  4WJE A;  2CHR A;  2EBN A;  3SUS A;  3LG3 A;  5DRC A;  1ADO A;  1R85 A;  4W88 A;  2W61 A;  1BTC A;  4O10 A;  3U48 A;  1WBH A;  3LHT A;  2Y85 A;  4RLI A;  1W5P A;  3MJY A;  4JFU A;  3OA5 A;  3T08 A;  5M03 A;  4XAP A;  5A95 A;  1M68 A;  3O9N A;  4IHC A;  4ORM A;  2NZL A;  2QUT A;  2Y8V A;  1GVS A;  2J27 A;  4H6K A;  4JTU A;  4E5T A;  4B16 A;  3MYP A;  5A6B A;  1EGM A;  3FHA A;  5AVH A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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