3EX4A

Human orotidyl-5'-monophosphate decarboxylase in complex with bmp
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Lys314 is a nucleophile in non-classical reactions of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 99
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2008-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ex4A00
2QCHA 4N02A 2H3BA 3W07A 1PHQA 2X1TA 2WSQA 2RFGA 1LLWA 3TCEA 3GDRA 4M6PA 3KAOA 2BSLA 3KRSA 1ICSA 4JGDA 2RH9A 3G8EA 3OVPA 4O15A 3NL6A 4OE7A 1O60A 4Z1CA 1TPVA 3CC1A 5K9XA 4PL1A 1TTIA 3UY8A 3W7LA 3NYZA 3GVGA 2VXNA 5DY2A 3DHDA 2XN0A 3S9YA 3MYPA 1RQBA 4R53A 1U83A 1D3HA 4AH7A 2HS6A 2YW4A 1T8XA 4L4LA 2NXHA 1A53A 3B05A 3PWAA 3MP5A 4MLJA 5HJLA 3NQ7A 3WJYA 4JTKA 4N9CA 4HNUA 4PODA 3W88A 3G1SA 4GBUA 5CSRA 4N4PA 3QJAA 1VPXA 4J9JA 3W1TA 3TQVA 3CT7A 3W1LA 3IGUA 3E0IA 3QFEA 1SW3A 3L5LA 3LB0A 1I45A 1OG0A 1FUYA 1VYPX 3W1UA 1LLZA 3SGZA 3LI1A 4UFHA 5F1VA 3TE9A 3A22A 3PUDA 3M41A 5AFDA 3OA3A 3VKJA 4M7SA 1B4KA 2V9DA 3LRLA 3USBA 2ZRZA 1W3IA 1WDWA 4Y6GA 2ZZ2A 4UR7A 1FWWA 3R2GA 2XFWA 5HUPA 1M7PA 3N34A 2NXIA 1JCJA 3G1HA 4BK9A 3TC6A 3GDMA 4DO6A 3N2XA 3ANYA 3M5YA 4JEQA 4OT7A 3IIXA 5C55A 4TMBA 1KM1A 1FQ0A 2Y7DA 3C2RA 1H5YA 2GQ8A 1RR2A 3LGEA 2NXGA 3CEUA 2GPTA 1L6WA 3QW4B 4ZQNA 2VEKA 4MIMA 5G2HA 1QFEA 1THFD 1RQHA 3BK0A 4IX0A 2VFIA 2BWGA 5FF0A 4H4IA 3M5ZA 3HF3A 2YDAA 3N14A 4O1AA 1H7OA 4O1BA 3HPXA 3W7CA 3RLUA 3NDOA 1LDCA 3LHTA 4YCOA 2FB2A 3EWBX 5I3HA 4E38A 3INPA 3NG3A 1TQXA 1PCKA 3O8AA 3G0SA 3GNNA 1SZEA 3CU2A 3OG3A 1WQ5A 2J9YA 3QMTA 3KVMA 3JR2A 4NJIA 1J2WA 3PG9A 5EBUA 3VE9A 3QSTA 4MPQA 3MHUA 5CPMA 1YPIA 3B03A 3N2MA 1VRDA 3GR7A 4P61A 4DXVA 5A8GA 3TROA 3UXAA 3MW7A 4LY8A 3NZ1A 2QKFA 5BRBA 2C15A 1VZWA 3R8RA 1LROA 3VNDA 5AHLA 3LXBA 4LS1A 4MJMA 2V81A 3SGUA 4JR5A 1V7YA 1TPDA 2Y89A 3GAYA 4FHAA 4NJGA 2FPYA 4CLMA 3EB2A 4R33A 3GDLA 3TC7A 3GX9A 3DFQA 3NL3A 1YDVA 4Z1BA 3GXNA 3W7DA 5K3VA 1M7OA 1XBZA 1UUOA 3MBDA 2WNNA 1F5ZA 4LV9A 2GOUA 3FEMA 4JTTA 4R34A 3IRDA 1LBFA 1YPFA 3O63A 3JRKA 1YDNA 1YADA 1GOXA 3HB9A 3L0KA 4JIQA 4MJZA 3I7QA 3O16A 4ZQRA 3O6DA 4K38A 1O95A 3BW4A 3U6WA 2PCQA 3R89A 1O5XA 3HQ1A 4Z1DA 1AL8A 4JY9A 1WOBA 2CZ5A 5D38A 5DELA 2FPVA 2FDSA 3G1DA 3BG3A 3IGXA 3W2LA 2X2GA 3FJLA 4C1KA 4WY0B 3UZ5A 2Y88A 3ZS4A 2AQWA 4O19A 4NXKA 5D2TA 5F4SA 2H6RA 4FF7A 2WO5A 4FXRA 1X1ZA 1VJIA 4O17A 4N2YA 2VELA 2Y70A 2GVLA 2E5BA 2QCNA 2ZTJA 3IGSA 4TX9A 4ALDA 4Y90A 2TPSA 1TQJA 1OFOA 2CZDA 1HFBA 4XBSA 2R94A 4N4QA 2P1FA 3TK7A 2NLIA 3E02A 1KV8A 3F1QA 4HNTA 5J5DA 1SZGA 3FIGA 4X3ZA 4QSHA 3T55A 3QM3A 2F7FA 1PV8A 3I7SA 2ZCGA 3NQAA 1M6JA 3W2KA 3HGOA 1YXCA 1TTPA 1VGAA 3LM7A 5F2LA 2E1DA 3W72A 1IXPA 3GYEA 1F05A 2GJNA 4O50A 1EIXA 4ZVJA 4CNOA 4O18A 2VC6A 2YYUA 4UFJA 3P62A 4GUIA 1P0KA 3TIMA 5LNSA 3A5VA 4I7VA 4A2RA 4XQ6A 3ABOA 1J5TA 3LHZA 2A85A 4LOCA 4O54A 4A22A 3W76A 2W6RA 2NUWA 1OFQA 4FNPA 5HR6A 4NX0A 4KFNA 1Q6RA 4RXGA 3ZFHA 3DBPA 1X6UA 4JTHA 4O28A 2GQAA 4M6QA 4NVTA 1DQWA 5FEXA 3DFNA 1H7XA 3EXRA 2VEMA 1FDYA 1A5SA 1PE1A 3QMRA 2YCEA 3C2EA 5D04C 1AL7A 3G1VA 4KKXA 4JTFA 2I14A 2EHHA 1R2TA 1W3NA 4RV8A 4JN6A 2DU2A 2Y85A 3KVLA 5KSWA 2R91A 1H7PA 4ONVA 3L9CA 2YYTA 1W3TA 4FIQA 1XKYA 2V5LA 4OV4A 1KBJA 2C14A 1F6PA 2QUVA 2Y6ZA 3GDKA 1ZJIA 1GYLA 3N9RA 3L65A 2HS8A 3NM3A 1SZNA 1LRNA 4WD0A 2V82A 3QW3A 1H50A 3AO0A 2ZRWA 3HIJA 3P81A 2Q3OA 5FF7A 3UXDA 1Y0EA 4TMCA 2V8ZA 5HWMA 4GRSA 3C61A 5L6UA 3ZWTA 1Z41A 1K8ZA 1W0MA 4CQ8A 2NX9A 3EWUA 2UV8G 2ALDA 1SFJA 1RV8A 2TSYA 3R5EA 5HWNA 3TH6A 5K9DA 3LHUA 3PR2A 5KZDA 1ME8A 5DBUA 1HO1A 5CPOA 1QCWA 1FBAA 3DAQA 3W2NA 1YDOA 3LCXA 3L0NA 1SUXA 4O13A 1OYBA 1SSGA 2ZYFA 3W7RA 4UFKA 5BMXA 4QM1A 1I4NA 2QEZA 2YSWA 2ZZ3A 2ZRUA 4OQVA 3BGGA 4K36A 4IPIA 3SZ8A 1KA9F 3W7JA 1G4PA 1G4SA 5CKSA 3LLFA 1KFLA 4UCGA 4LVBA 2NX3A 4IXXA 3RFAA 4O0ZA 1EWDA 8TIMA 1GVRA 4FNUA 3FLUA 4ADUA 3NPUA 2A5HA 3TJXA 4LTSA 3NL2A 2CWNA 4K7YA 3B0PA 4XTDA 4S1FA 3G22A 3G1FA 5SWUA 1WV2A 4LVGA 1JCMP 1L2UA 1X8FA 3TMLA 3DFPA 2FJKA 4HT3A 1EEPA 1VS1A 3PM6A 3LTSA 1JCXA 1P4CA 1JRBA 3NM1A 4LRSA 3NQEA 3P82A 4JTIA 1JCNA 4IMEA 4CQ9A 3Q37A 3WJXA 2W79A 4AHPA 3G0XA 3EX4A 1JUKA 4DELA 4NJHA 2VKZG 5IM51 1LYXA 3LCHA 1ZAHA 4IMCA 2OZ0A 2JK2A 4AWSA 2ZTKA 2H8ZA 1FWNA 3F4NA 1MEIA 3TAKA 3QSRA 3BARA 1OFBA 4ZL1A 1OVDA 2VEPA 3W86A 4U4MA 2BTMA 3VI2A 4IMGA 4JTJA 4LWWA 4OV9A 5AC6A 1QR7A 5BNKA 1K02A 3VFLA 1H7RA 3CHVA 5CZSA 4PC8A 3C2FA 3TDFA 3L0GA 1OHLA 1EB3A 1T0OA 1W5PA 1AK5A 2WNZA 1KFJA 1LORA 1LBLA 2GVJA 3EWXA 2XN1A 5CSSA 2ZZ6A 3B0VC 1DJQA 4LC8A 5FF4A 1ZNNA 1ZENA 1XFBA 2VFDA 2YW3A 3NQMA 4MLRA 3UWWA 2HMCA 1SO5A 2XN2A 1SFLA 5DCDA 5I3FA 2VFHA 2RHGA 1A5BA 1Q3NA 3W7OA 1GVQA 4NQ1A 5MHBA 3PVFA 1KM6A 3P67A 1GVSA 5G4WA 4LU0A 3C2VA 2OT1A 3EX6A 1XCFA 4D2JA 2DZUA 4P2VA 2C16A 1NEYA 1TJRA 1H63A 5I3GA 3HG5A 4JD4A 3HG4A 5LNRA 4QNWA 3LHWA 4UC5A 3W7NA 2OJPA 5I3KA 3MMTA 4ZMGA 3R12A 5FF3A 1I2OA 3NOEA 5CPNA 3LV6A 4Y96A 4FNTA 1JUEA 4EVZA 3L21A 1TJPA 3RK8A 3STEA 4O1DA 3BO9A 4PH6A 2A7RA 2CLHA 3V1PA 3R13A 1OF6A 2H3DA 4QISA 1KM4A 4CNPA 1JULA 1JCYA 3M1ZA 4FNQA 4UR8A 2Z6IA 3T40A 2BX7A 1JCLA 3W7PA 4NNBA 3N73A 2E5DA 4NNCA 3NZRA 4RLIA 3YPIA 3LCIA 3M44A 5HWJA 3HPSA 4O14A 4O4WA 2H90A 5DXXA 5LSMA 3GLCA 2ISWA 4AHQA 4JYEA 3EX1A 1Z44A 3DGRA 3PULA 4RXFA 5DCBA 2QCLA 3UPBA 1YYAA 2P0OA 2CLIA 2QJGA 2CW6A 5E93A 3S5OA 1KW1A 4JX6A 4AXKA 2O7QA 3P7YA 2G95A 3HJZA 2E6FA 4O52A 1T99A 2R14A 4YXGA 4Z08A 1X7FA 2OMAA 1SR9A 1FCQA 3MI3A 3S1VA 1P1XA 3HPZA 3O07A 4DF2A 5G2WA 3O06A 1SO3A 2EGZA 5U7SA 3QMSA 1HL2A 1AW5A 2Q8ZA 3BG9A 3HMJG 3O15A 4ZQCA 3EWZA 3HGJA 3RNDA 1QAPA 4K39A 2EKCA 4NJKA 1D9EA 2C18A 3M5XA 3NQGA 4DO5A 4ZQPA 3OIXA 2QUUA 4TR9A 3EXSA 3W2JA 4MZYA 2DORA 3GKAA 1OK4A 2J9ZA 2CLOA 3QQ1A 3PF3A 1VYSX 4WXZA 1IGSA 3LOTA 3E12A 3PG8A 5AHFA 4GJ1A 1XI3A 2DP3A 3C56A 4EIVA 3NQ2A 2ZZ1A 4O57A 3W22A 3FOKA 1R2SA 1OJXA 1ZFJA 4EF9A 1IXNA 4X22A 1ML1A 1H1ZA 2C19A 3B0UX 4XKYA 4XZ9A 1KLZA 2ZRYA 2WJZA 3L67A 3W7KA 2C13A 4NXSA 2Z6JA 5LZLA 1Q6LA 2FQIA 1JQVA 3RF9A 2CZFA 1SPQA 2V2CA 5G4EA 5HUOA 2QJHA 4HN4A 1EUAA 7TIMA 4NJJA 3QYQA 4BFAA 4JIPA 1FDJA 3W70A 2ZZ4A 4JTGA 2E5CA 4RX0A 1BTMA 1RZMA 1IIHA 2E68A 1E51A 1JR1A 2X1SA 1QO5A 1OFDA 3EWWA 3PBUA 2ZA2A 1SO4A 3P84A 4UTWC 3W23A 5AYYA 1TTJA 3W7EA 2RKXA 1KTNA 1WBHA 1WAUA 3UNDA 1FX6A 1I2NA 1N55A 3IV3A 4CCCA 3C2OA 3SI9A 2A7PA 2QCMA 2E09A 4ZQMA 4PL2A 4R7JA 5IBXC 2QCDA 3W7QA 1OX4A 4AHOA 1UJPA 3FYOA 2E6DA 1AMKA 1K7EA 1YTKA 2YZRA 1IXQA 1G4EA 3N9SA 5AHEA 3MI6A 3LTPA 2PURA 2V30A 3BLFA 3PSWA 1GZGA 1I2RA 1LOLA 2ZA3A 4NX5A 1UB3A 4HPJA 3NPWA 1SQ7A 1YTDA 1G7UA 1TV8A 2A4AA 2A1YA 1OFAA 1XDLA 4BWLA 2I9EA 4DBEA 4M7TA 3NPXA 3ZWSA 1MXSA 3G1AA 3CPRA 1TPUA 3S5ZA 1YXDA 3EX3A 4IXHA 1S5WA 3LDVA 5EPDA 2JGYA 5K2ZA 1W56A 2BZNA 3KRZA 3NAVA 1AG1O 3Q2DA 1C9DA 5FESA 5ABTA 3ATZA 2WNQA 1A50A 4JDBA 3W1QA 3OEXA 3G18A 2DZSA 5AHMA 3A21A 3FJ6A 4MZ1A 4WY0F 3G8RA 2PC4A 4UTUA 3LI0A 3NPVA 5LKYA 1W31A 4YCPA 2ABAA 4I7WA 4M6VA 5U4NA 5EL1A 2IQTA 2A2IA 4XTIA 3BW2A 2G5WA 5KZMA 3M43A 4UIOA 2RDUA 3UWQA 2R8WA 5K9CA 3RLVA 2WSYA 4IOTA 3MBFA 1EPXA 4WZHA 3P5YA 1K7FA 4IGHA 3TJLA 4HKPA 5KMYA 4S2BA 1KV5A 3PUEA 1OABA 1F6KA 1LRQA 1DQXA 3P60A 3SFKA 4Q4KA 1MSSA 1GPWA 1ME7A 3BGJA 3DKLA 3LXCA 2NWRA 3BVJA 1WA3A 2WSRA 4QJ1A 1X1OA 5AYXA 4X2RA 1VHCA 5KTLA 1G67A 2WPBA 3LTYA 1VR6A 5F4WA 4E2DA 1K03A 5EMUA 2LLEA 4WUIA 3Q94A 4K8EA 5LGZA 2E6AA 3N19B 3WK1A 3PSVA 5AN7A 5G1TA 2ZQ0A 1W37A 3A23A 4AEOA 3DXIA 3EXTA 3G3MA 3A24A 1JJKA 1QMLA 2GQ9A 1LOQA 3LX9A 4UFIA 5LGXA 3TMQA 5EYWA 2V0TA 1HO4A 4QAIA 4FNSA 3QZEA 5F2MA 3W2UA 2JKPA 1WOAA 3C3NA 3C8FA 4OU1A 4HSNA 1NVMA 4UNKA 4BF9A 4E2BA 1MEWA 4GUJA 4A29A 3M47A 1LCOA 4ORMA 3PBYA 1BKSA 4JYFA 4RZ4A 5LNUA 1BWLA 4MY9A 5T26A 3UWZA 2RDTA 3P61A 3HG3A 3KRUA 4FX6M 3CQ0A 3P8IA 3EX2A 4ICNA 3T7VA 5G2IA 3C52A 3Q58A 3QPZA 3CTLA 3I7RA 1S5TA 5D03A 3G3DA 4O8RA 5K7JA 3NA8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1EQP A;  3VIJ A;  4M56 A;  1PHQ A;  4AMC A;  1K9T A;  3GDR A;  1SJB A;  3SQM A;  1GVY A;  4B2D A;  2VR4 A;  4WRH A;  1ICS A;  1HGY A;  2RH9 A;  4FR6 A;  3OVP A;  1PDZ A;  3NL6 A;  4OE7 A;  4LCQ A;  3TQP A;  1TPV A;  4W4Q A;  2XH7 A;  3GUG A;  5FJJ A;  1XD1 A;  3ZQ9 A;  3NYZ A;  3RX3 A;  3I4E A;  3GVG A;  1C92 A;  2VXN A;  1DWF M;  3S9Y A;  4FLQ A;  2W62 A;  1V6Y A;  1D3H A;  3CH0 A;  4AH7 A;  4QLK A;  5DRI A;  2NXH A;  3KE0 A;  1A53 A;  2EG6 A;  2GJR A;  4EXQ A;  1FHD A;  3NQ7 A;  3RX2 A;  1B31 A;  1QOX A;  4GBU A;  1OM0 A;  1O7A A;  3GM8 A;  3VOI A;  4L7Z A;  3RCM A;  3SCQ A;  3WEN A;  1VYP X;  3W1U A;  4E3V A;  2AL2 B;  4I9J A;  4YYC A;  3SGZ A;  4DX3 A;  3LI1 A;  1S46 A;  4XD4 A;  5FJO A;  1UG6 A;  3TC3 A;  1KR0 A;  2V3F A;  3OA3 A;  1EDQ A;  2V6A A;  3GZA A;  2WVV A;  4D8L A;  3IJ6 A;  3L7R A;  1XIB A;  4GI6 A;  1VBU A;  1D7F A;  2ZZ2 A;  4JQ3 A;  1F9C A;  2VUN A;  4JTQ A;  3QV8 A;  1ZZM A;  2IPF A;  3CUI A;  3S1G A;  1ISY A;  4GIS A;  5HUP A;  3N34 A;  3AIE A;  4XZB A;  3GDM A;  3SCW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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