3EX6A

D312n mutant of human orotidyl-5'-monophosphate decarboxylase in complex with 6-azido-ump, covalent adduct
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
MELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFENRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH1 (227-231)AH2 (238-250)S1 (254-257)TI1 (233-236)EMPTYUpdating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Lys314 is a nucleophile in non-classical reactions of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine-5'-phosphate decarboxylase
total genus 97
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2008-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ex6A00
1RQEA 3GYEA 3W84A 2RDTA 1ME9A 1DOSA 1X6UA 3R13A 1QAPA 4AB4A 1TTIA 1V7YA 3L9CA 1V5XA 1QWGA 4ML9A 4GUHA 3EB2A 3TAOA 4O1BA 3S5OA 5CKSA 1F6PA 2JK2A 1TPB1 2Y85A 5F2LA 1GTHA 3EWBX 4K6AA 1BEUA 4A21A 2NWRA 3TAKA 1X1ZA 3NR0A 1ZNNA 2A2IA 3W1LA 3W74A 3C2VA 1EUAA 5G4WA 4Y6GA 4YLWA 4TR9A 3MBFA 3EX6A 3TSBA 1IF2A 4JICA 4FX6M 4HSOA 5D2WA 4Q32A 1RVGA 1AL8A 4FNQA 1OJXA 4JGDA 3PR2A 1Q6QA 4CQ9A 1MSSA 3C3NA 1ML1A 2H3BA 1KFKA 3L2IA 2GVLA 3W7DA 2I14A 2Z6JA 4ZQRA 1OG0A 2QAFA 2ZQ0A 3SY5A 4K39A 4OBTA 1NVMA 2QUVA 4K7VA 1ZAHA 4BWLA 1LORA 2PCQA 1WX0A 3PBUA 3F03K 1CX9A 4JS3A 1Y0EA 1J2WA 5KITA 4RZ6A 3PUEA 5J5RA 3P67A 3N2XA 2E09A 5EA9A 1O5XA 1T96A 2ZZ4A 1CI1A 1Z42A 3DENA 3QFEA 4O1DA 3NPVA 4DO5A 1I4NA 5LNVA 2C15A 2ZRVA 1YTEA 1WOBA 4B5NA 3BLFA 2FPYA 3P60A 4K37A 1D3HA 3CT7A 2NX9A 3PULA 3KOFA 3PBVA 3W2JA 1DV7A 3ZS4A 1C9DA 1YLVA 3G1FA 1F5ZA 3MP5A 2E1DA 3W1RA 1NFBA 3NZ1A 1SO4A 4EWND 4IMDA 3HPZA 4PCFA 3PG8A 2C13A 4FF7A 3WJSA 3NM1A 2W79A 4AWTA 3HGJA 3QMRA 3E0IA 3G1DA 4JIPA 3L0NA 3MJYA 3SI9A 2C1HA 2YW4A 3A24A 2A7NA 4GUGA 1TRDA 4QIUA 2F7FA 3RK8A 1KA9F 4XWUA 3F1QA 1UJPA 3FYOA 3LCLA 1TJRA 3TA6A 4UMBA 3TKFA 3LRKA 3B0UX 5C6MA 1FY6A 1EWDA 2DZTA 2OT0A 2UV8G 1WQ5A 4N2YA 5I3FA 3S5ZA 3MBDA 1DJNA 1OF6A 3PC0A 2NUWA 1DKWA 5TBOA 1L6WA 1G7VA 1JR1A 3GDTA 3GIYA 3O16A 3C8FA 4IPIA 2ZA3A 3E02A 3QQ1A 3WJZA 1T8XA 4BI6A 2TSYA 1D9EA 3A5VA 4MKNA 1OYBA 3IEBA 2P0OA 2VENA 3NQCA 2QJIA 3JS3A 3FA5A 1IIHA 4O4VA 1TSIA 5FF2A 1ZAIA 2Y63A 4LVGA 3NM3A 3IGUA 2J88A 4O0KA 3KXQA 3LCGA 1HTIA 3DBPA 4RK8A 4GFSA 4S1FA 1EUNA 1L9WA 4LOCA 4M6PA 4IX0A 1XI3A 2E6YA 3MMTA 5HWJA 4IUOA 1VYSX 2VEIA 1N8FA 3C56A 3NQFA 2J9XA 2V2CA 1OFEA 1ONRA 3TIMA 2F84A 4N9CA 3LHWA 5LNRA 1U5JA 3S1VA 2YYUA 2H8XA 2QR6A 3PB0A 4AMAA 6TIMA 2V2HA 8TIMA 2GOUA 4H4IA 5DBUA 1TRIA 4JY8A 5L9FA 1TPDA 3VKJA 1XUZA 3TJLA 4GUIA 3EKLA 3C52A 1TV7A 1WOAA 1GYNA 4UTWA 1K8XA 3KFTA 3QYQA 1W0MA 4NNCA 4X2RA 5D04C 2NUXA 4PEKA 4MYXA 4O12A 2E68A 4UTIA 3LRLA 2WSRA 3KVKA 3W85A 4AXKA 3PBWA 3EWWA 4AEOA 4JTFA 1K7FA 4O0ZA 3T55A 3P8JA 3R5EA 1P5BA 2QF7A 4RJEA 2OX1A 4LS2A 1H61A 3RF9A 4WZHA 4JD4A 1GQNA 4KWWA 2WSQA 1QPRA 2BSLA 4FEZA 1LOQA 1A5BA 2Y7DA 3G1XA 2V2DA 2NXHA 1SZFA 3S5YA 4AF0A 4ZQOA 2WNNA 4UTHA 2GUUA 2TRSA 4O10A 3KRUA 2C14A 5CZSA 1VYRA 4NNBA 3TSDA 5I3GA 1FWNA 4Y90A 1OYAA 2DORA 3O63A 3DFSA 2I9EA 4I7WA 2QDHA 4YXGA 4WY0F 1OYCA 3I65A 1ZALA 4FX7A 4UTTA 2ISWA 1LBFA 4M7TA 6ALDA 3NVTA 1RQBA 3BG5A 3LTSA 4WD0A 3NQ7A 4PH6A 5LGZA 1MZHA 5BNKA 4O13A 3W23A 1TPWA 3W88A 4JDBA 4KKXA 4RR4A 3G3DA 3MI2A 1WXJA 2A7PA 2RDUA 3BW3A 1QOQA 1SUXA 3HG3A 4Y96A 3BG9A 3S5NA 5DY3A 4EF8A 3HB9A 1DBTA 3GXPA 1SSGA 2XN2A 2QUUA 4DXVA 3KHJA 2ISVA 4IXHA 2Y7FA 2YW3A 1XCFA 1LLWA 4N02A 4N9BA 3W7CA 2FTPA 5BRBA 1DJQA 3W7PA 2J27A 4UFHA 3PUOA 3WJXA 1UUMA 5T26A 3NQMA 1ZENA 1BTMA 1VCFA 3LHTA 3QSTA 2PRLA 3E9AA 3GAKA 3TFXA 3STGA 1H63A 1OFQA 3SGUA 3DGRA 5DN1A 5KZEA 2NV2A 4FNPA 2YZRA 3WK3A 4WUIA 2W6RA 3TC7A 3PS7A 3DFPA 1PCWA 3PG9A 1R2SA 3NEVA 3UQNA 4DPPA 1O5KA 2V0TA 3TH6A 3IVTA 1QFEA 4GC4A 1L2UA 1WA3A 5E1QA 4E2DA 4IGHA 3C0JA 1LP6A 4L4LA 4JN6A 3P61A 3FLUA 2VOMA 1TPH1 3B06A 4FNTA 3M5VA 3MO7A 3UPWA 2ISSA 4J9JA 5SWUA 1OK6A 3ZFHA 3IGXA 3NQVA 4GJ1A 1VR6A 5KTLA 1W54A 5DCBA 4LV4A 3I68A 3N19B 3BLIA 2QCGA 4BWLC 3NYZA 3IV3A 3IIZA 5E0KA 3M47A 3A9IA 1AW5A 1GVFA 2NZLA 1H60A 4IMFA 5G1TA 1KTNA 3R12A 2FFCA 2FB2A 1D3GA 4ZQNA 5DXYA 5F4WA 3CEPA 4GXMA 5AYXA 2VEPA 1LBMA 5LHEA 3IVSA 4Q33A 3QC3A 4M6VA 2JGYA 4PC8A 4UXDA 2X2GA 4JTGA 3W75A 4GNJA 4I7VA 3KX6A 4LS1A 4JDYA 2FPTA 3I6RA 1JJKA 1J5TA 4MLRA 4JIQA 2X16A 3IRDA 3K30A 3SFKA 4JTKA 3O15A 2DJXA 3M5XA 2NX3A 4DF0A 1TJPA 1GZGA 3HOJA 3W1PA 4UFLA 1GG1A 1W5MA 3FYPA 2CLFA 4AH7A 2QKFA 4UFJA 1LBLA 4NJKA 3TW6A 4JTEA 1VRDA 4FHAA 1TPFA 5C2XA 4WOQA 1ADOA 5J5DA 1KFJA 3FS2A 1KBIA 1FWTA 1P1XA 4TX9A 3PSWA 5FEXA 2V8ZA 1W5PA 1VGAA 3OHIA 5HR7A 3FFSA 1XUUA 4JYFA 2ZRUA 4QNEA 5A5WA 2G96A 3G3MA 3W70A 2E6FA 4ZQMA 1YPIA 2ZZ1A 2C0AA 2NX1A 3OA3A 3QPYA 3W87A 1YXDA 1FBAA 5K9CA 3UWQA 2NXIA 3LV5A 4ICNA 4ZQPA 5DCDA 1G7UA 4JTJA 1H7XA 3W7EA 3UZJA 3M9YA 4WJEA 3TU9A 2H3DA 2VFHA 2HS8A 3GKFA 4NUWA 3O8AA 4M6QA 5AC8A 4M7SA 5BMWA 4C1KA 3O07A 1THFD 5HMSA 1HUVA 2QCFA 2HMCA 1S5VA 3G1YA 3I7QA 3LERA 1IXNA 3R2GA 3CB8A 3L66A 1F2JA 3EEGA 2QCHA 5FI8A 1S5WA 4OGZA 4XKYB 1KV5A 4UNLA 3P82A 1QR7A 3G1HA 4NZFA 1EA0A 4X3ZA 3W7RA 1U83A 3KRSA 1KM6A 1WV2A 2OZ0A 2VELA 5CGQA 3LB0A 1IXPA 2H6RA 1GOXA 1VH7A 3CU2A 3WFAA 1XBVA 4IPJA 1I45A 3BK0A 1GPWA 3TK7A 3UWZA 4UTWC 4CNNA 5D30A 2WOQA 1JUKA 3GXTA 3KAOA 3DXIA 3EXTA 4ALDA 5AHLA 2A6NA 3EWYA 4OE7A 4MJMA 4BK9A 2JGQA 2AAMA 1LYXA 4UFIA 1H5YA 4EOUA 4OU1A 1TV8A 2NV1A 3UNDA 4BR1A 4O57A 1NF0A 2CZEA 2ZTJA 4O28A 2OJPA 5HJLA 3P81A 2GQ8A 4L4MA 1LTDA 2NWSA 2X30A 1TPEA 5D2YA 1YPFA 4WXYA 4KFNA 2CFFA 1IIGA 4C1LA 3PB2A 5BOOA 5G4EA 1XKYA 3CLMA 3W7IA 5BW6A 4GBUA 5DCEA 4AVFA 2J9YA 1A50A 5E93A 5KSWA 5TIMA 3PY2A 2OMAA 2WKJA 4POCA 3N73A 3MHFA 3OEXA 4JTSA 3B04A 5FESA 1QNVA 4K36A 4JYEA 4QSHA 3LRMA 2BZNA 3W76A 3I7SA 1GT8A 2Q8ZA 1XBYA 1KLYA 5CSSA 1G67A 2ZA2A 3PWAA 4JNMA 4UTTC 1L6SA 3GAYA 1OFPA 2CLOA 1SFJA 1TYGA 4HNNA 5AHMA 1W3NA 4DF1A 4WQ6A 2TYSA 3TX9A 3G0SA 1B4EA 2GQAA 4XQ6A 5AHNA 4NQ1A 1O95A 5AHFA 3LOTA 2Q3OA 5HQEA 2VFDA 5CPOA 2P10A 3GVGA 1K8ZA 4BFAA 3OVRA 2Y70A 1A53A 4HPJA 3GZ3A 3BLEA 3NPUA 4JTUA 1ICSA 2ZZ3A 3WJWA 2QCMA 4ZL1A 4BF9A 1VJIA 1RR2A 4CCCA 3EXRA 2OT1A 3CTLA 1GVOA 4EIVA 1XBXA 3A22A 1AW1A 2XFWA 3M43A 4ORIA 2DZXA 3W2UA 1MEHA 1AMKA 4S2CA 1F73A 5HR6A 1X8FA 3L5AA 1KFBA 4XKYA 3TE9A 3DI0A 1SPQA 4O15A 5K4XA 3RMJA 2ZBTA 2FLIA 4FNRA 4UTUA 4HNUA 3G0XA 3TROA 3QJAA 3L67A 3DFTA 3TXVA 3W2MA 3BPWA 3EWUA 4MFDA 3YPIA 3KRZA 1YXCA 1KFEA 3UPBA 3HG2A 4LUJA 1Z44A 3HO8A 5HINA 2YFNA 1AW2A 4YL2A 3TMQA 5I3IA 2B0MA 1UB3A 4ZMGA 1KM2A 4QITA 3UWVA 1BWLA 5EL1A 1ZY9A 3BW2A 5EKYA 1OF8A 2FPVA 4AHQA 1XDLA 2QAPA 2FJKA 3LI1A 4LVFA 4LT9A 3VCRA 4N9DA 3NQAA 1FCBA 4TO8A 1OFAA 3LTYA 1TCDA 3GXNA 3S8HA 2QJHA 5KZMA 3LLDA 3LXAA 4XBKA 3M0ZA 1I2OA 2NUYA 4H3DA 3PAJA 1JCXA 1SO5A 4PTNA 4YMZA 4IMCA 1M6JA 2PRMA 3SZ8A 1A5SA 3MP3A 3L68A 3THQA 3T44A 1EPXA 7TIMA 2BXVA 1VCVA 1KM3A 2R94A 1EP3A 3CWNA 1SR9A 4P2VA 4Z0SA 1OX5A 2J9ZA 3CC1A 5F2IA 1FWSA 4JYDA 1FDZA 2PE4A 3CQ0A 3HQ1A 3G1VA 3RLVA 3W86A 2QCLA 1PHWA 1H51A 1TPC1 1K7EA 3IIVA 1OK4A 1DL3A 2OCZA 1FDJA 3CHVA 2V81A 3STEA 3UY7A 1DQWA 3HBLA 1VHNA 5CZJA 1JRBA 1I2NA 4M5PA 1LOLA 3ABSA 1H1ZA 3GKAA 1X7FA 4QISA 4CNPA 1GWJA 4AHOA 3W7KA 3SGZA 2Y88A 3U8GA 5D02A 4HKPA 4LRSA 3M1ZA 1TTJA 3W7NA 5K3VA 4JXCA 1QOPA 3DH7A 2Y7GA 5AB3A 1Q6LA 3NPXA 4O52A 4DELA 3ATYA 3QW4B 3P5ZA 3W7JA 2E6DA 2ZDRA 2HSAA 3S1XA 1JCYA 2Q8LA 1W8SA 4A29A 1CW2A 2J24A 1W1ZA 2AGKA 3PUDA 5LNSA 2B4GA 1MO0A 3IIOA 3HGSA 1GG0A 3H53A 5LZLA 2CLLA 1TV5A 2RKXA 4RZ5A 5HUOA 2VXNA 1G4TA 2X1TA 1LOSA 3P84A 2VKZG 4Z08A 2CU0A 5D2XA 4I9AA 1JCJA 3B4UA 1PIIA 3MP4A 3C61A 1FXQA 4JTTA 4MYAA 5DLCA 3TC6A 1FCUA 1RZMA 3W72A 1LCOA 3Q37A 1EP1A 1SSDA 4YCOA 4LVAA 2ZYFA 3GX9A 3NQDA 4Z0JA 4N6EA 3N14A 3I7RA 4UMCA 2ZZ2A 3ANYA 1TTPA 5HUPA 5FF4A 1I2QA 4HNVA 3B03A 4CQ8A 2QJGA 4BI7A 5LGXA 3SR7A 2QUTA 2VC6A 2D73A 5KINA 2E5CA 3BV4A 3LCIA 4LC8A 5FF3A 4LC6A 1SO3A 2E5BA 3HIJA 3R8RA 5AHIA 1EIXA 3NXFA 2HS6A 1G4PA 4CCDA 2C18A 1KTCA 4A22A 3TXZA 2GJLA 5DY2A 3PM6A 5D03A 5D37A 2GPTA 5G1YA 4WY0B 4AHPA 2Y6ZA 3FKRA 5AHEA 3TNOA 3W71A 5F2GA 2ABAA 1H7NA 3FIGA 2DP3A 4MUZA 2QDGA 4OQVA 4S2BA 4DBEA 2WNZA 2EKCA 2A85A 3Q2DA 4NX5A 3LGEA 5D09A 1VZWA 2A21A 4NZJA 3QF0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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