3F4WA

The 1.65a crystal structure of 3-hexulose-6-phosphate synthase from salmonella typhimurium
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
211
structure length
211
Chain Sequence
MKLQLALDELTLPEAMVFMDKVVDDVDIIEVGTPFLIREGVNAIKAIKEKYPHKEVLADAKIMDGGHFESQLLFDAGADYVTVLGVTDVLTIQSCIRAAKEAGKQVVVDMICVDDLPARVRLLEEAGADMLAVHTGTDQQAAGRKPIDDLITMLKVRRKARIAVAGGISSQTVKDYALLGPDVVIVGSAITHAADPAGEARKISQVLLQHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The 1.65A Crystal Structure of 3-hexulose-6-phosphate synthase from Salmonella typhimurium
rcsb
molecule keywords Putative hexulose 6 phosphate synthase
molecule tags Synthase, lyase
source organism Salmonella typhimurium
total genus 80
structure length 211
sequence length 211
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.-:
pdb deposition date 2008-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3f4wA00
2CWNA 1W5OA 4EWND 1H7OA 5FF0A 4KWVA 3QC3A 3HG2A 4BWLC 2GVGA 3W85A 1EIXA 1B4EA 3FS2A 4YXGA 5CGQA 3SY5A 5G2WA 1CI1A 3BW4A 3NM1A 2LLEA 4HN4A 3CQ0A 3L0GA 5EKYA 5IBXA 3TAOA 4AWSA 4A29A 1OABA 3NEVA 1F76A 4ZQCA 2Q8ZA 2V0TA 4KKXA 2OZ0A 1YXCA 1UCWA 2WKJA 3MHFA 4U4MA 4WXZA 2NUWA 4O16A 3W2KA 4JYDA 3G22A 4LUIA 3CIWA 1OF8A 4Y6GA 1OFOA 5CPOA 5TQLA 1VC4A 3BG3A 3IV3A 3TFCA 2DP3A 3HPXA 2Y88A 5IBXC 2H6RA 5CPMA 4O50A 2CZFA 4LY8A 3PSVA 1KM6A 3O6DA 1GVRA 4GUIA 4RJEA 2JGQA 1TO3A 3QRHA 1Z42A 4LRSA 5G2HA 2QDHA 4A21A 5K7JA 1KW1A 2IQTA 2Y61A 4R33A 1F5ZA 1GVQA 3S8HA 3MBFA 4B5NA 4KFNA 3AO0A 5DCBA 1QPOA 3OVPA 2VFEA 5D02A 2YW3A 2ALDA 4WQ6A 3TJLA 3S0CA 4NNCA 1BWKA 4JN6A 4Y9AA 1DV7A 1T0OA 2RHGA 4TMBA 3DFSA 1S5WA 4QM1A 1BKSA 3C6CA 5DCEA 4FNQA 5K9XA 3PUEA 5CPNA 2A5HA 3UXDA 5J5RA 3BK0A 4NU7A 1Q6QA 4QITA 3DI0A 1YTEA 3KFTA 3NQ2A 3VE7A 1JUBA 2QUUA 4IOTA 5AOUA 2ZZ6A 4ZQOA 1UJPA 3TQ0A 5D2VA 2J9YA 3O15A 3TK7A 2ZZ4A 4GRSA 4NX5A 4UTIA 4FX6M 1DJQA 4FB7A 1JR1A 1Q3NA 4H3DA 4Q33A 1A5AA 4ML9A 3EXSA 3DXIA 2CLLA 5J5DA 1TJRA 1ME9A 2BLEA 5AYYA 4AWTA 2ISWA 3CHVA 4KWWA 3P5ZA 4JGDA 3P81A 2DU2A 4M6QA 1KTNA 5AHLA 1UUOA 2H3BA 4LS1A 4LT9A 3CT7A 3M5XA 3LI0A 4O15A 3C4UA 2ZA2A 3QMSA 2ATSA 2BTMA 3D0CA 2FLIA 5KSWA 2NUXA 2E5CA 3W2MA 3EKLA 3GR8A 2OCZA 4UUIA 1WAUA 1OK4A 2ZA1A 1EUNA 4OWGA 5LKYA 2Y85A 3O05A 1HO4A 1OYCA 3TC7A 1DL3A 3G0SA 1ICQA 1SSDA 5D37A 3W71A 3N19B 1H62A 2YSWA 3UWUA 2H90A 4LC6A 4N4QA 3S9YA 3MYOA 2WV8A 4ZQNA 5D33A 1TTIA 3ABOA 3WK1A 4PTNA 2XN0A 1W5MA 3CLMA 1G69A 5HWJA 1FWWA 1TQJA 3PWAA 4HHPA 2XN2A 5DY2A 3AJXA 3LCIA 1G67A 3NNTA 3W73A 2E5DA 3BPWA 1S3HA 4PA8A 1KFKA 4O0ZA 2JK2A 1LDCA 2X16A 3MJYA 2ZZ2A 1LZOA 1Z41A 2DZTA 4UTTA 1TPUA 3I68A 4O54A 2HS8A 2VKZG 3G3MA 1SFJA 1THFD 2RFGA 2AQWA 3CIXA 3PULA 2CLKA 4CCEA 2E6FA 4JTJA 4LVDA 1BWLA 1FX6A 4CNOA 3N3MA 3UZJA 5CG7A 3L0NA 4UTTC 5AYXA 1OX6A 3W7CA 1TV5A 4O13A 3U6WA 3TU9A 1H60A 3KXQA 4MLJA 3NPXA 3RNDA 2JKPA 3VCRA 4OV4A 4LRTA 5F2MA 4RZ5A 4ORIA 3CWNA 1AMKA 3EX1A 3FA5A 1FY6A 2J9XA 4AB4A 2DZUA 3N34A 2UV8G 1PHWA 3P5YA 1XBZA 3ANYA 5DN1A 4ZQRA 2VFDA 5H91A 3ZR4A 2CLOA 4LOCA 1QFEA 2TSYA 2Z6IA 4Z08A 1G7VA 4YLWA 4WJEA 2A6LA 1LLZA 3LLFA 4JTLA 3TXVA 1DOSA 4MY8A 3EXTA 2ZRXA 3DHDA 3UQNA 4UTLA 4JNMA 1O5KA 4MYXA 4ZVJA 4X3ZA 3O06A 4S2CA 4LS2A 4WD0A 1K7EA 3W7RA 2B7PA 2BX7A 1TJPA 5C2XA 3NG3A 4E0CA 3HBLA 3S5OA 4GBUA 5HUPA 1PCKA 1XDMA 5I3HA 2RDTA 2W6RA 4GE8A 4AAJA 3O63A 3KRUA 3S1XA 4NJGA 3QMRA 1B3OA 1D3HA 1GPWA 4UNLA 3PBWA 3NPUA 4Y96A 3PY2A 3IIOA 1IXNA 1J4EA 4JY8A 1SW0A 1PV8A 4LU0A 4PL1A 3HGSA 2ABAA 5F1UA 1HUVA 4WXYA 3A5VA 4Z1DA 4DF1A 2GPTA 3NDOA 3L65A 1PCWA 2X1UA 2GQAA 2YFOA 1W56A 3NQ7A 3PG9A 3EWYA 2Y89A 2R8WA 1W0MA 4GJ1A 4N02A 2YR1A 4BI6A 2QJIA 4Z0SA 5LHEA 4RX0A 4PL2A 1SO5A 3W1RA 4OV9A 2BSLA 2GVJA 4HIBA 1VLIA 2O7QA 4NJJA 3TSBA 1LLWA 3TDFA 5FF2A 1RVGA 3T55A 3LRMA 4MUZA 3EX2A 4IMGA 1EP1A 3LHVA 3TMLA 1JCMP 5CZ0A 4K8EA 3SECA 3MI3A 1SZNA 1KM5A 1AL7A 1TRDA 3P82A 3TXZA 1FQ0A 1LCOA 5D2WA 4AMAA 3DENA 4JTGA 5AHIA 2CFFA 2Y6ZA 4M7TA 1FWRA 1W5QA 3LERA 1K7FA 3OVQA 4IXXA 4NX0A 2QCDA 5CSSA 3LTYA 4Q4KA 3P8JA 3C8FA 4I7UA 5FEZA 1I2QA 1ZCOA 3CC1A 4BR1A 4ONVA 4MKNA 2QR6A 1XI3A 4FIQA 1FCUA 2DJLA 1F05A 1ZJIA 1H5YA 4AH7A 2CLIA 3DH7A 4DO6A 3FFSA 2A7PA 4DQWA 5L9FA 1MXSA 3P62A 3T7VA 4N9CA 4ZL1A 5D30A 1SO4A 3IGUA 1A5CA 4IWWA 2WNQA 3OHIA 3TQKA 1EEPA 4NNBA 6ALDA 3R5EA 4DO4A 1S5VA 3DFQA 3LV6A 5D2YA 1Q6RA 3RFAA 2QUVA 5DBTA 1BTMA 3WJWA 2QAPA 3S1VA 3CWOX 4NJIA 4E38A 1C8VA 4NJHA 3A23A 1OJXA 3PC0A 3TV8A 4P2VA 3FYPA 5HINA 1SZGA 3S1WA 4FNRA 1V5XA 1CX9A 2W79A 5U7SA 5C55A 3QF0A 3WJSA 5DY3A 3N9SA 3O16A 2ZTKA 3EWBX 3TSMA 1TTJA 3LOTA 3LTSA 3C56A 5C6MA 1C9DA 4GUJA 3W2UA 3LDVA 1A5BA 3TQVA 3E02A 4CCCA 5FI8A 1XDLA 2FIQA 5E1QA 3O6CA 1P0NA 3Q58A 3M5VA 4FX8A 3DFPA 4LTSA 1G4SA 2E1DA 3DZ1A 3DKJA 5D04C 4DEFA 3NL5A 4NVTA 3MWAA 4XKYA 3GAYA 1H7NA 1HFBA 3GDLA 2ZRWA 4QSHA 4A2SA 5BOOA 3W7DA 1I45A 5AYZA 1SR9A 3H54A 3FKKA 2A21A 3SI9A 3PF3A 5EL1A 3NQCA 2WO5A 2VEMA 5AFDA 2QCMA 3M6YA 1ZFJA 2X2GA 3G1AA 4FEZA 3NQGA 4MFDA 1M6JA 4O4WA 3G1YA 1ZAIA 1TRIA 2HSAA 4K39A 5AB3A 1R2SA 1E51A 1JCXA 3UWWA 4X9SA 2X30A 3SGZA 1YXDA 4DBDA 1FWNA 3L68A 2Z2UA 2YGYA 1GJPA 3GVGA 2E6DA 3T44A 2FFCA 4JEQA 3FEMA 1W37A 2QCGA 1X1ZA 3W7EA 3S6DA 1TB3A 3KAOA 3STEA 1WQ5A 1W3IA 1FWSA 3TJXA 3TSDA 3M16A 3UY7A 3UPWA 1FDZA 1MSSA 3FJ6A 4IUOA 3IIPA 4AF0A 4UFJA 5T26A 3W83A 5D2XA 1K8YA 4AF0B 4LV4A 1WOBA 1ADOA 3TW6A 3G1DA 1KLZA 3IGSA 1JJKA 4HSOA 3M43A 4LNYA 5F4SA 1JULA 2YZRA 4NT0A 2QF7A 4C1KA 3NXFA 4N6EA 1I2NA 3GLCA 2QEZA 3L21A 4TR9A 1J5TA 5G2IA 1XBVA 4QNWA 2ZDRA 3W1PA 1H7RA 1F7BA 1K8ZA 3CEUA 1M7OA 1A5SA 2W0UA 2F84A 4J9JA 2V2CA 3R12A 3UXAA 3A24A 3G1SA 1P1XA 2VENA 3L2IA 5L6UA 2V82A 5HR6A 1T96A 3CEPA 4PODA 3C2RA 2EHHA 3N9RA 3NGJA 3HG5A 2CZDA 3KHJA 4I7VA 1H7XA 3IIXA 4JYFA 1FUYA 1FXQA 3LHZA 2ZZ5A 1GT8A 2Y62A 4JXCA 3M1ZA 4JTSA 1R30A 3MO7A 3MUXA 3G1FA 4O53A 5FEPA 2P0OA 1OF6A 3MHGA 1V7YA 1QR7A 2NV1A 4QAIA 1XL9A 3SZ8A 4UTWA 3ZFHA 1OFEA 3W72A 1SW7A 1LBFA 1WX0A 4OGZA 2NX9A 2V81A 3MBDA 3G24A 3OEXA 5DCDA 3NAVA 3LB0A 1GZGA 3B0VC 3LXAA 1VHNA 1LOSA 1P5BA 1O5XA 3P7YA 1YLVA 2ZQ0A 3VFLA 3NPWA 3BLFA 1G4TA 1F6KA 4UTWC 3JRKA 3L0KA 3LHTA 3I65A 4A2RA 3TW7A 1KA9F 3GAKA 3KOFA 5KTLA 1NVMA 3LHYA 1RQEA 4U28A 4FNTA 1SPQA 3NQMA 3QW4B 1DHPA 1GEQA 2NV2A 1W8SA 1QCWA 1XM3A 5EMUA 1NSJA 1SW3A 1L9WA 2QCHA 4AHPA 4O1BA 4DXVA 4CLMA 3KVJA 3O8AA 3UYCA 3DBPA 5ABTA 1N7KA 3PAJA 1GYNA 3W6YA 1VCVA 5HWNA 2B7QA 3SFKA 3W1UA 3CTLA 5A8GA 3I7QA 3ABSA 1KM2A 1KV5A 1OYBA 2DZVA 3B4UA 4YWIA 3N14A 3C2OA 1K7XA 4R53A 1NFBA 1OFAA 1ZENA 3MI2A 3ABRA 4GWEA 3CM4A 1F6PA 4IX0A 4MIMA 3W7JA 1A50A 2YXGA 3DI1A 3LCHA 3FLUA 3GR7A 2Z0IA 1H61A 1OVDA 5CSRA 1P0KA 1WYIA 2YDAA 3W7LA 3SGUA 2FTPA 1ZNNA 3W70A 3B03A 3HJZA 4O11A 4RXFA 1IF2A 1LRNA 3RMJA 4JX5A 3T4CA 1R2TA 2A0NA 1IXQA 1I2PA 1TMHA 4ALDA 1LROA 4HNTA 2A6NA 2RH9A 3HGOA 4QISA 4XWUA 3BGGA 5K4XA 2OT0A 2Y70A 3EX3A 1QWGA 3B8DA 1W31A 3W2LA 4GNJA 5CZJA 3OBKA 3LRLA 3MW7A 4XQ6A 1IGSA 3NQ8A 2Q3RA 4QJ1A 5LZLA 2VFIA 1O95A 2E6YA 1VRDA 2CLEA 4UTMA 2VFGA 5K2ZA 3W87A 3BARA 1QOQA 3IVSA 1ZHAA 1Z48A 1SO6A 1EWEA 2I9EA 2J6XA 3RLVA 1N55A 3O1NA 2EKCA 1OFBA 3FIGA 2QJGA 4FXRA 4AWUA 3QM3A 1QO2A 1B4KA 4K7VA 4JX4A 4X2RA 5KMYA 1BEUA 1XUZA 2FJKA 3LHWA 1LTDA 1RPXA 3PR2A 1JCYA 5G4WA 1DKWA 1VJIA 1X8FA 4UFKA 3PUDA 4QIUA 1W3NA 1JCNA 3HB9A 1VYRA 3E49A 4MOZA 4A22A 7TIMA 3OA3A 3C61A 1ME7A 2CLMA 4FF7A 3B0UX 4NQ1A 3P60A 4JTKA 4BI7A 2C3ZA 3HGRA 3TUUA 1ICPA 4IMCA 1WOAA 1VS1A 3F4WA 1OHLA 1K8XA 3HG3A 3VNDA 3TFXA 3GXNA 3C2EA 1TREA 5CPLA 3BV4A 4RCXA 4MZYA 3THAA 4UXDA 2Y63A 3IVUA 5AHNA 4XZ9A 2PCQA 2R14A 3BLIA 3EXRA 4UFLA 1G4EA 1YADA 1H1ZA 3LI1A 2GQ8A 3NPVA 3QSTA 1DQWA 4RR4A 3I6RA 4O14A 1TV8A 2C16A 3W1TA 5FEWA 5FF3A 5LNSA 1YDNA 3V75A 3A9IA 4XTDA 3W1AA 5K9CA 4YCOA 4IMEA 4N6FA 3RK8A 4O0KA 3G1HA 1WDWA 5I3JA 5I3IA 2V30A 3IIZA 4WY0B 1Q45A 4NXSA 3GDTA 2E09A 2V2DA 3G1VA 1H50A 2OT1A 2V9DA 1KV8A 3TH6A 3ELFA 5E93A 5LNVA 3W1MA 1R2RA 2GJLA 3W7QA 3QZEA 1KFLA 2AAMA 2Z6JA 3B05A 3W1NA 2OMAA 3HPSA 3LCWA 3NOEA 3JR2A 4QNEA 1K3UA 3TX9A 4Y8FA 1MEWA 1ML1A 4WOZA 1TTPA 5LGZA 3VI2A 3STGA 2DZSA 3W75A 3HO8A 4GUHA 3W7KA 1FWTA 4WOQA 4DELA 3I7RA 3UWVA 1SZEA 2EF9A 4UTKA 5G4EA 2CU0A 1K02A 1DJNA 4GFSA 5FF7A 3C0JA 2V5LA 3ABQA 3EWWA 3LX9A 4GC4A 3PB2A 4XBKA 5LHFA 5LNRA 2C13A 3QPZA 3P80A 2G97A 5AHFA 1YYAA 4LVFA 1XXXA 2PE4A 3A22A 5D05A 5HQEA 1KM0A 1AK5A 3NQDA 3PB0A 2QCEA 4IQLA 4N2YA 2JGYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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