3F4WA

The 1.65a crystal structure of 3-hexulose-6-phosphate synthase from salmonella typhimurium
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
211
structure length
211
Chain Sequence
MKLQLALDELTLPEAMVFMDKVVDDVDIIEVGTPFLIREGVNAIKAIKEKYPHKEVLADAKIMDGGHFESQLLFDAGADYVTVLGVTDVLTIQSCIRAAKEAGKQVVVDMICVDDLPARVRLLEEAGADMLAVHTGTDQQAAGRKPIDDLITMLKVRRKARIAVAGGISSQTVKDYALLGPDVVIVGSAITHAADPAGEARKISQVLLQHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Synthase, lyase
source organism Salmonella typhimurium
publication title The 1.65A Crystal Structure of 3-hexulose-6-phosphate synthase from Salmonella typhimurium
rcsb
molecule keywords Putative hexulose 6 phosphate synthase
total genus 80
structure length 211
sequence length 211
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.2.-:
pdb deposition date 2008-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3f4wA00
2VFEA 1OK4A 3GDRA 2Z6IA 3E02A 3LOTA 3GX9A 3AJXA 1B57A 3UWYA 2KZHA 4Z08A 3LXAA 3SECA 1KFLA 3FA5A 1JRBA 3T40A 3GNDA 3CC1A 4RXFA 4QNEA 2GPTA 3UZ5A 1PS9A 5LGZA 4O1DA 5EL1A 1OX5A 2WJZA 3M5ZA 1KTCA 3A23A 4UFMA 4JTEA 3QW4B 1OX4A 3N73A 5IM51 2QAFA 1NSJA 2V9DA 2WO5A 2Z1BA 4MJZA 3HMJG 4E2DA 4M6PA 5U4NA 3W74A 4UMAA 2GJNA 1JR1A 1QR7A 5BMXA 3SJ3A 3Q2DA 3UZJA 5CPOA 4CCCA 1FXQA 2J24A 3STFA 3QM3A 1U5JA 2RFGA 2XN1A 2NWRA 4POCA 5HMSA 3M1ZA 1LDCA 3M44A 5DCBA 3PWAA 3LGEA 1VCFA 1LTDA 5EY5A 4LTSA 4LVGA 3G1HA 4OV4A 2QJIA 3I68A 2W0UA 4XBKA 2RHGA 2ISVA 3PSVA 1V5XA 5FF4A 1EIXA 4HNTA 5I3KA 5J5RA 4I7VA 3UWVA 3IGUA 3A22A 4IMDA 5CGQA 4C1LA 4U4MA 3IEBA 1C29A 2Y6ZA 1G7UA 3LTYA 3U2OA 3EWBX 3W86A 3WK3A 1XCFA 3M5YA 4X22A 2ZFAA 3GDTA 5F2LA 4LS1A 1KV5A 4K39A 3TR2A 3ZS4A 1QPNA 1QFEA 2VFIA 5AYXA 4O12A 2ABAA 4LVBA 3VCRA 1SW3A 3W2JA 1FDZA 4Y8FA 3DHFA 3W83A 2WNQA 5KMYA 3EWYA 1IIGA 5J5DA 1YYAA 1BTMA 3L67A 3TUUA 3IIZA 2OT1A 3W73A 4HT3A 5LHEA 3F03K 3TV8A 1EWEA 4NJJA 5LNRA 2E6FA 1P1XA 1GVOA 2ZRVA 1QPQA 1M7PA 1TMHA 2GOUA 2YR1A 4LW7A 1MZHA 1TIMA 4AHQA 5D03A 3TC7A 4FO4A 4PH6A 3MHFA 3G1SA 4HNNA 1QNVA 2ZRZA 2RKXA 4GUFA 3MBFA 2V8ZA 4JGDA 2NXGA 1A5AA 2CZDA 3WK2A 1FCUA 4X3ZA 3LCLA 1GVSA 3LCIA 1FBAA 3NXFA 5G5IA 4FHAA 2Q8ZA 3HB9A 2J88A 3GNNA 3ELFA 4NVTA 2NX3A 3LCWA 2X1TA 5CG7A 2RDUA 2DZSA 1I45A 1B9BA 2VEPA 3ABRA 3D0CA 4IMCA 4QSHA 1GYNA 1A5CA 1ONRA 5I3JA 3KHJA 1EA0A 5EBUA 1IXNA 3W7GA 3W87A 2FPTA 4JS3A 2VENA 5D2TA 3FYPA 3T7VA 4O13A 2E68A 2G95A 4CNNA 3WJYA 4FNUA 2A5HA 2ZTKA 3S1XA 5G4EA 1FDYA 2QAPA 3TXZA 1DOSA 3G18A 2B7NA 3P80A 1ICPA 3G1YA 1F73A 4AB4A 3H53A 4O8RA 3MI3A 3H54A 4PA8A 1X6UA 1H1ZA 2R91A 1X1ZA 4MUZA 4LNYA 2AQWA 1TCDA 4Y96A 4BR1A 2Y7DA 3LBMA 3OEXA 4DBDA 4DBEA 4FB7A 4RZ4A 3VI2A 1SW7A 1PCWA 3T78A 2YZRA 3W76A 3KVLA 2Z0IA 4JTIA 1WOBA 1KLYA 3MUXA 3TW7A 2H8XA 3W1UA 2A7NA 2BLEA 2VEMA 4C1KA 2YCEA 2TMDA 3MHUA 3QSRA 2B7OA 3WJZA 4PEKA 2R14A 4Z1CA 5IBXC 1A53A 4GUGA 1K03A 3IRDA 3C2FA 1SU5A 4K6AA 3R89A 5BRBA 1ZY9A 3PBVA 4AF0A 2I14A 3TK7A 3N3MA 1Y0EA 1QOPA 3EXSA 3TSBA 3HGRA 1TQXA 2I9EA 1GVRA 2A6NA 3V75A 1OFBA 1GEQA 5KITA 3UWQA 4M7SA 3DFOA 4JTJA 1YTKA 3W7CA 2P1FA 1KW1A 4PODA 4CLMA 1W5NA 2A7RA 1XBXA 3I7RA 5C5YA 3C56A 4UUIA 4UTMA 3E0IA 1XDMA 1W31A 1C9DA 2J9YA 3S1UA 4IXHA 4N9CA 4XKYA 4GC4A 4MKNA 4CQAA 1O5XA 3O06A 4FX8A 6TIMA 1DJNA 1ZAHA 5D30A 3PAJA 5TIMA 1JUBA 4LRSA 5I3HA 3EX4A 4MLRA 3LLDA 4YL2A 3DKJA 3M5XA 4JIQA 4LOCA 1YDNA 1A50A 3DFTA 3GR7A 4WOQA 3W1MA 1WBJA 2HS6A 1K7FA 5LGXA 2WKJA 3DFPA 1TPEA 3W71A 3F4WA 4OHQA 1VLIA 5LKYA 3GDKA 2NUYA 4R34A 3W2UA 1I4NA 1EP3A 1NF0A 3TSDA 3L66A 3S42A 2NXIA 1T8XA 4N9BA 3ANYA 4X9SA 3EWUA 1KM3A 4TMCA 4HN4A 3DKLA 5DY2A 3W7RA 2CLLA 1H1YA 2A6LA 4BWLC 4GNJA 2Y62A 1Q6OA 3B04A 1B3OA 3BPWA 4MPQA 3UWUA 3NQ7A 1VJIA 3TDFA 2V2DA 4ADSA 1JCXA 1BWLA 1PCKA 3HPXA 1I2PA 2QF7A 4UFIA 2YGYA 2ZRXA 3HG4A 3O6CA 3A21A 4KWWA 4UTJA 1F6KA 2H6RA 4LS0A 3NA8A 5G4WA 3P81A 1H7NA 1ME9A 5FEZA 4MVAA 4R7JA 5MHBA 3BW2A 5F1VA 4K38A 2E5CA 3N2MA 4UC5A 1TV7A 2C1HA 4ORIA 4ZQNA 1RPXA 4I9AA 1U83A 4ALDA 2NZLA 2YW4A 4P61A 1BKSA 4CCDA 1ZJIA 3W3OA 1VGAA 3LI0A 3TU9A 1JUKA 4JIPA 1FWWA 3NQDA 4MFEA 3P74A 2ZZ2A 1GJPA 3TCEA 3NZ1A 4HHPA 1XXXA 5F2GA 3BW3A 1WA3A 3HG2A 1TRDA 3LV5A 4JTHA 1O5KA 2VC6A 4JYDA 4IXXA 4E2BA 1JQXA 2I1OA 3OG3A 1T96A 2ISSA 3GKFA 2Y61A 3RU6A 4RZ5A 4ZZ9A 1GQNA 1QAPA 4O10A 3RK8A 3STEA 3DI1A 3O1NA 3QSTA 2TPSA 1BEUA 1TJPA 4IX0A 1WDWA 3KXQA 4HSOA 3S5ZA 4ZL1A 3BV4A 2TRSA 1JJKA 4Z1AA 4ADUA 3G3MA 1K7EA 3VE7A 4UCGA 3WJXA 1F6PA 1MEWA 4QM1A 4NNAA 4ZVJA 2BTMA 4FX6M 1H63A 1IXQA 2E77A 5FI8A 1LBFA 3W7LA 3S5YA 1TPVA 3S9YA 2XN2A 4GRSA 1IIHA 3M0ZA 5E1QA 5D04C 1KM6A 2FLIA 3KRUA 1DKWA 3P60A 1P5BA 2TYSA 4JDYA 4QNWA 3BGGA 4O14A 4ZQRA 3W7MA 1RQHA 3EWXA 3OVPA 3SGZA 1LYXA 4AMAA 2QCDB 1LLZA 4AHOA 2FTPA 4H3DA 3GXPA 4NQ1A 3G0UA 3TQKA 3MO7A 3N14A 3QPZA 4I7WA 3T55A 1JQVA 5AC7A 1D9EA 4UTUA 1HG3A 2QCLA 2ATMA 4NNBA 3B05A 5G1TA 1TTIA 1YADA 3GXNA 1H7OA 3PM6A 5CZSA 1UCWA 1P0KA 1QDSA 3P5YA 4HPJA 5CPNA 2J9ZA 3M9YA 1Z41A 4GXMA 1LLWA 2WPBA 1TO3A 5CZTA 1GVQA 5EKYA 3P8JA 5HQEA 3IIXA 4MIMA 1SFJA 4KFPA 3IVSA 2QUTA 1GZGA 3TSMA 2X1RA 3C2RA 3N9RA 1QWGA 4O16A 1OFQA 4DF2A 3FLUA 1OJXA 3ZR4A 3DAQA 3HGJA 4JTSA 4UFKA 3C0JA 4EIVA 2NV1A 4FEZA 3N19B 2ZA2A 3OA3A 3RNDA 2QJGA 3NPWA 3W9ZA 1W5PA 3NQ2A 3WK1A 4N2YA 4UTKA 1HO4A 3RFAA 1TB3A 3FIGA 2Z6JA 3O15A 3NPUA 3B0UX 3THAA 1QPRA 3NQEA 3EB2A 1ML1A 1NF7A 5T26A 3TX9A 3LHZA 3W7HA 4A22A 5KTLA 4XTDA 2JKEA 2RH9A 5HULA 5DY3A 3EX3A 3P5ZA 4DPQA 1LROA 3NQGA 2DZXA 4ML9A 4NJIA 3TQVA 1VYSX 2OCZA 4MY8A 1N7KA 3AO0A 4FNQA 3WFAA 1SO5A 5K7JA 1G67A 1TV5A 2DJXA 1M5WA 2QEZA 2ZZ6A 1H7PA 1SO3A 2WSRA 4N9DA 4AH7A 5BNKA 4XQ6A 2CLKA 3E96A 3IVUA 1OYBA 5FEXA 3L65A 5HWNA 2V0TA 3NYZA 2OJPA 2GQ9A 3GDMA 1S3HA 3Q37A 2YPIA 4MZ1A 5LSMA 3PBUA 2CU0A 3KFTA 3GB6A 4E0CA 3LBCA 1QMLA 4ORMA 4QAIA 5FEWA 1TPC1 3DI0A 3S5NA 4Y6GA 3NQCA 3ABQA 1YDVA 2JGYA 1VZWA 1W1ZA 4UTHA 3WK0A 3NPXA 3L5MA 3GXTA 1DQWA 1OFRA 4BI6A 1X1OA 3P8IA 3INPA 4JTKA 4AWTA 4YXGA 1XFBA 3KRZA 5AHIA 4A2RA 2IQTA 5FF2A 3TQ0A 2DP3A 2GJLA 5L9FA 1YPIA 4JICA 2HS8A 3W85A 1IXPA 5I3GA 3HIJA 2W6RA 1GG1A 3LM7A 1JCNA 3MP3A 4OGZA 1UUOA 2ZRWA 5LZLA 1A5SA 1RR2A 3TFXA 5LNUA 2B7PA 2B0MA 4RLIA 4CCEA 4UIOA 1TREA 2JKPA 4NZJA 2EHHA 2J9XA 5DXYA 3CIWA 4UXDA 3E9AA 4BWLA 4P2VA 3W22A 4UTTC 3G3DA 3ZWSA 1RD5A 2A2IA 1S5VA 5GVJA 2CZEA 4ONVA 3STGA 1FXPA 2NX9A 3DFSA 3W75A 3CB8A 1FWTA 4TU1A 1FWSA 1VCGA 2Z2UA 3QF0A 5HWMA 2R8WA 3CEPA 3PSWA 4JEQA 4L4MA 4MLJA 5FEPA 3LXBA 4GWEA 3MJYA 3W1PA 1WOAA 3BLIA 4QQ3A 3M41A 3EKZA 2CWNA 3W7PA 3N9SA 3S1WA 4AWSA 3I65A 1KM2A 3LCFA 5I3IA 2E5BA 2P10A 3PR2A 1A5BA 2X1UA 3IVTA 1EWDA 1AMKA 5AYZA 2YXGA 4ADTA 3TH6A 5KSWA 3LCGA 4M6QA 4WY0F 5BMWA 3IGSA 4LS2A 1O95A 4FF7A 4MZ8A 4FX7A 4O28A 3I7SA 4O0KA 3TKFA 3S8HA 3SZ8A 1G4PA 2GQ8A 3C4UA 5L6UA 1EUAA 1W54A 1OX6A 4MOZA 3NL2A 2R94A 1P4CA 4JYFA 2TSYA 1VCVA 2X2GA 5CKSA 2QCMA 4DXVA 3QPYA 4O4VA 1L6WA 3K30A 5E93A 2VFGA 1MEIA 3G1DA 2JGQA 3KX6A 3RF9A 5K9XA 3V1PA 3FFSA 3GR8A 3C52A 4OBTA 4YLWA 1QO5A 3W2LA 3FKRA 2EKCA 2WSQA 2ZQ0A 5K4XA 3DFQA 4MYAA 1M6JA 1BWKA 2ZZ1A 1EP1A 3ZWTA 1KM0A 3IIOA 2W79A 4ZQPA 3GDLA 1KFKA 2ZTJA 1HFBA 4JD4A 2CLOA 3GVGA 4DEFA 2FJKA 5K9CA 2FPYA 2A4AA 1DJQA 3PB2A 4BF9A 4M19A 4WD0A 3WJSA 4LY8A 2J27A 3W2KA 1XDLA 5CPLA 5AC6A 3O6DA 1KLZA 1I2NA 1K8XA 4XWUA 3QYQA 1R2SA 3C2VA 3PG9A 3QFEA 3CPRA 1DORA 3UPBA 3G8RA 5AHMA 4O57A 1N55A 3O8AA 2WSYA 4GUJA 4WX2A 3GK0A 3CIXA 2A7PA 3NAVA 4OWGA 2P0OA 4IMFA 4FXSA 1VPXA 1ZCOA 3HF3A 4YCOA 3LERA 3JS3A 4IMGA 4J9JA 1RV8A 1XBZA 2VXNA 3HO8A 3TMQA 3QMTA 1KFEA 4LV9A 4FNTA 1LOLA 4CNPA 4IOTA 1T0OA 3JR2A 4O17A 3B4UA 1VS1A 4WQ6A 4N6EA 4AVFA 5F2MA 3TAKA 1KV8A 4JX5A 2NUWA 5SWUA 2V30A 3L5LA 2PCQA 2QCDA 3SGUA 1AW5A 3O07A 1VYRA 2OZ0A 3PB0A 4WOZA 3W1AA 1VYPX 1SSDA 2YSWA 4JTLA 4LVFA 3NQFA 4ZQOA 1G4TA 1R2RA 3LB0A 1XUZA 3S6DA 1JUEA 2C13A 5BW6A 1K7XA 3HPZA 4X2RA 4MYXA 1RQBA 1DL3A 3S1VA 3A9IA 5F4WA 1P0NA 3L0GA 3BO9A 3B0PA 5DBUA 4UTWC 4IMEA 3TAOA 1FCBA 3MHGA 1KFBA 4Y9AA 3HPSA 1O94A 2HMCA 3T44A 1QOQA 2BZNA 1VQTA 1OF8A 1OFOA 3HBLA 3L21A 3DU0A 1FDJA 3NO5A 2VKZG 4UR7A 3EWZA 3O16A 1I2QA 5AFDA 1NVMA 3FEMA 4LT9A 2DU2A 4UTIA 3ABSA 1XC4A 2QKFA 5G1YA 3BG9A 1J5TA 4E38A 4WJEA 1AL7A 4HNVA 1M7OA 4GE8A 1E51A 5HUOA 1H7XA 2QUVA 3QMRA 2Y89A 4QJ1A 2OX1A 4K7VA 4OE7A 1TRIA 1ZAJA 1MSSA 2E09A 3KVKA 4K8EA 3G1FA 4RZ6A 3W2NA 3ABOA 1IF2A 4IX2A 4XBSA 2Q8LA 5D2VA 3L0NA 5K9DA 5HINA 1AW2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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