3F5JA

Semi-active e176q mutant of rice bglu1, a plant exoglucanase/beta-glucosidase
Total Genus 194
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
194
sequence length
472
structure length
472
Chain Sequence
NWLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNQPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The structural basis of oligosaccharide binding by rice BGlu1 beta-glucosidase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Oryza sativa japonica group
total genus 194
structure length 472
sequence length 472
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2008-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3f5jA00
2WMHA 4OUEA 1TCMA 3WNNA 4GO8A 1ECEA 2FDMA 2YL9A 3PTKA 4IISA 2CYGA 1E9LA 4Y7EA 5JIPA 1OT1A 3UG5A 1WAWA 4UOQA 5BYWA 4PCSA 3WSUA 3MUY1 1C93A 1G5AA 4OBSA 3WH6A 2O9RA 4C7DA 2VVNA 1MW3A 2WSPA 1HP5A 5I3DA 2UY5A 2VX4A 6CGTA 4U5KA 4E8DA 2E0PA 4PTVA 2EPLX 2C0HA 2XM2A 3VIJA 5EMYA 3WQ8A 3CHFA 2XFFA 4CU7A 1DWAM 3WEMA 3AISA 2FH8A 2X0YA 2XFYA 1LL6A 2IXUA 2X2YA 1NWSA 5BXTA 2ZXBA 3VIKA 2WMIA 1E4LA 3ZJ6A 1HT6A 1ZU8A 5A94A 5A8OA 3A47A 1SMAA 1ZBWA 1CEOA 1B3ZA 2DSVA 4PN2A 2IUZA 1EQCA 1R7AA 4W7UA 2ZXQA 2E4TA 4JKLA 2YDRA 4BQ2A 4BQ5A 1DWHM 5BCAA 5CPSA 3WDIA 2WHKA 1IZKA 3OGRA 2G8ZA 1UR4A 3TONA 2YA2A 2PWHA 2XM1A 4H41A 3L4UA 4J3TA 4PUDA 1E1FA 1W3LA 2WK2A 3IK2A 4XV0A 5LA0A 2OWXA 3BAWA 3CUHA 1NM9A 2G3NA 2PBOA 4D6CA 1TA3B 1FFQA 4J3UA 3WNLA 4AD3A 2VZVA 3S6TA 1AQMA 1W9VA 4H8UA 4J3WA 2EJ1A 2F2HA 3VIIA 5BRPA 3N15A 5C70A 3GXMA 2WWDA 3ZJ8A 2OWWA 1DWJM 2VX5A 3VPLA 1V02A 4J27A 1CLXA 2VC9A 3MMDA 4C7GA 2EPOA 4PEEA 2G3IA 4CU6A 2O9TA 1HF6A 3NDYA 3HMCA 5A6KA 4HA3A 3CUFA 5A6JA 1U33A 4B3KA 2EPKX 1H41A 3NJ3A 3PZNA 3WF4A 2BV9A 3N1AA 2BNJA 3L4XA 4DUWA 4ACZB 2FHBA 5FKYA 4CVWA 2X09A 4Z2IA 1HJSA 3GXIA 3AIUA 3DHPA 4BQ3A 1W1PA 1B3VA 4PYSA 2V5CA 1W3KA 3AOFA 2PF0A 2WVUA 1E56A 3AI0A 1PPIA 2FGLA 1WZLA 1KQZA 3MUZ1 1BVZA 3VM5A 5IDIA 1TVNA 1WKYA 5E09A 1JYXA 3IJ7A 1C8QA 2JE8A 4WF7A 3WDQA 3WQWA 4GQQA 1GVIA 1EDGA 3ZMRA 3K8KA 1GQLA 1CBGA 4TTGA 2IXVA 1TG7A 5M3WA 1NWRA 1KXHA 1C90A 3WD3A 1JZ8A 5A2CA 3AHXA 1E73M 3GXDA 2YKKA 1HKMA 3MANA 1G94A 2DSZA 5A1AA 3CGTA 3W81A 4RE2A 3ARQA 3PTMA 5EB8A 3QHMA 4FK9A 3WH7A 1WZMA 1JD9A 4X0VA 4AZ7A 2FGZA 1KXTA 3WMBA 1KBBA 5I0DA 1Q6EA 1SFSA 4JCMA 3T08A 3M7SA 1RP9A 5KEZA 1GQIA 1QPKA 4YN5A 1ISYA 1FH8A 3ARXA 2QMKA 4W8AA 2CEQA 3T0DA 1D2KA 3AQUA 4LYRA 1WDPA 4LGXA 2ZXDA 5CG0A 3OLEA 4GI6A 2XVKA 1WCGA 3OLIA 3N17A 3F5JA 5I77A 4JFVA 2J47A 3GH5A 4HPGA 4L4PA 1E6RA 2CESA 1E55A 2WMGA 3I3EA 3GBEA 2CXGA 4D6JA 1NOWA 1ODZA 1JXKA 2JFEX 3CZJA 1IV8A 3UR8A 2BFGA 3KL0A 5A8NA 2VJXA 4X0NA 1V0NA 3PBGA 4DWSD 1M03A 2PWFA 3WQVA 4D1JA 1UWQA 3TOPA 1XSKA 1SR0A 1W91A 2BY3A 1QNRA 4P8WA 1C92A 5AYIA 4GZIA 4J3SA 4JKMA 1K6AA 5LA1A 2E9BA 4P7OA 1NOFA 1E72M 4A4AA 1VEPA 2ZIDA 2CERA 2WCSA 4ZEPA 4GIAA 5HPCA 1U30A 3B9AA 3EDEA 1EQPA 2ZUWA 3AYSA 1ODUA 3MUAA 4QLJA 4W7WA 1H09A 3ALGA 3VD7A 1CGUA 3EMQA 3W6LA 4D72A 1BPLB 4X9YA 1E5NA 3ARZA 4P7QA 4AEFA 1CENA 3EYPA 3AIWA 5I78A 3AS2A 3WF0A 1UWTA 4M81A 4UFIA 2VQUA 2GUYA 3NDZA 2WNWA 2EO7A 1QW8A 3NIYA 4EKJA 1E4IA 3ZSSA 5I24A 5DFAA 4JFTA 1KGWA 2V3EA 1JZ3A 4PBGA 2WBGA 5I79A 5DO8A 3UESA 1V0KA 1EGZA 3WN6A 1V6WA 1UR2A 2CBUA 1XCXA 2WAGA 3K8LA 1BVNP 3VIGA 5I2UA 4PMXA 2WVTA 3BAJA 4LYQA 1CDGA 4W5ZA 4AD2A 4CVUA 4MB1A 3PZQA 1PAMA 3W26A 4LXFA 1UWSA 4MJ4A 3UETA 1CXKA 4ATWA 1DWFM 8CGTA 5ABHA 3KL3A 5M5DA 3AROA 2WMJA 3AZSA 4CGTA 4N0RA 5CPQA 2WSKA 3AIEA 2GK1B 3GBDA 4GKLA 4U5IA 1UHVA 2EQDA 1GQKA 1J0IA 3CMJA 2VCAA 2O9OA 2BXZA 3SUVA 1CXEA 4DWSB 2OYMA 2DSWA 4HA4A 4UFLA 2WC4A 3PZOA 2VTFA 1B9ZA 1BG4A 3PZMA 4NZCA 4GI8A 5DT7A 3CHEA 3SCQA 2G3JA 4JHZA 1CPUA 1PX3A 4P7NA 5EFFA 3WL1A 4UZSA 1CYGA 1FOBA 1KGUA 4HMCA 1VJZA 4AYSA 5IHSA 1US2A 1XD1A 1V3MA 2JF7A 5E6YA 4JCLA 4Z2KA 1V6XA 2NT0A 2J8GA 3WUBA 1SYTA 1JFHA 3N18A 3CZ8A 2V5DA 1GOWA 2GJPA 4IPLA 4ZXOA 2X8RA 1X1NA 1BGGA 5FIPA 3AMDA 2J7EA 3K8MA 2DH3A 1CLVA 4CD8A 1V6UA 1SMDA 4MTVA 1C7TA 4MADA 3PZTA 2OYKA 2J79A 3ZT7A 3KL5A 4HOZA 3AS3A 1J0JA 1BYCA 3GDBA 4UQEA 1E0XA 4XB3A 1K9EA 8A3HA 1BTCA 1OGBA 1KXQA 2WKLA 2Z1KA 3VD3A 1ZL1A 1Q6GA 1V02E 1E40A 3AMLA 4PTXA 4AZCA 3AFBA 1WNOA 3VGFA 1LJYA 1V6VA 2VCBA 3TA9A 1ISXA 1LG1A 4GPNA 5GNXA 1OB0A 2VRQA 3MMWA 1NP2A 2J7HA 1QOXA 1JZ4A 3WBAA 1CGYA 2BVTA 2HISA 2XGIA 1GJUA 5AY7A 2XVGA 2WZIA 3OGSA 5E9AA 3VOCA 1ZJAA 4D6EA 1VFMA 2GDUA 3T0AA 4FLRA 1FP8A 3HN3A 5BXPA 1L0PA 4LPCA 1JDCA 1W9BM 1WDQA 1XCWA 2TAAA 5BXRA 1ESWA 3QR3A 1UD5A 1JL8A 3HJEA 2FH6A 1EO5A 5A2BA 4PMNA 1A47A 5A8QA 1ITCA 3B9DA 2VRKA 1GOMA 2XHYA 2XPKA 5CGTA 2D0GA 1R85A 3PHAA 4LQ1A 3SUTA 3B9EA 4ZE5A 1MQPA 3AIBA 1UR9A 1VJSA 4AIUA 1GUVA 2F8QA 2PB1A 1ISWA 1QNPA 1PZ3A 1GZJA 4P7LA 4UOZA 2WW5A 2PBGA 2J7DA 4MNLA 1HKKA 3THDA 3CLWA 3OIHA 1XHGA 4Z2HA 1XSIA 5KZ6A 1TR1A 2GSJA 3VDCA 5A6BA 2XSBA 4ATLA 3WENA 3SCUA 2XFRA 2XTKA 1BF2A 1TMQA 4JZ5A 1TVPA 4MB3A 4TVUA 1E15A 4S3JA 3U5UA 3VUPA 2XG9A 2WBKA 1J9YA 1IZJA 3ALFA 1W1YA 4PMRA 3MV01 1W1VA 2ZUVA 4A3YA 3RILA 3KEHA 4MNJA 1E6QM 4GQRA 4MDPA 1F4HA 3WF1A 2W66A 1W9XA 2J7BA 4DUVA 1Q6DA 3TP4A 4IM4A 3L4WA 1NARA 1B30A 2J25A 2WHJA 3AIRA 1C91A 2VMFA 1K9FA 1UZ4A 4WLCA 1BYDA 1E6PA 1LL4A 3RM8A 3CUIA 1VF8A 2ZXAA 3TTYA 4QCFA 4V28A 4OZOA 4Z2LA 1KFWA 1CZ1A 4HMDA 2ZICA 4UQDA 4JKKA 2PI6A 1MW0A 2WZHA 4FLOA 3F5LA 1GHSA 1HIZA 1OWQA 1BAGA 2DIEA 4URIA 2WB5A 4GI9A 3BGAA 3ZJ7A 1QW9A 7TAAA 1V3KA 1XH2A 1V3HA 1HJWA 2BY2A 5M17A 4Q22A 3WQ4A 3RMEA 4EAMA 4YHEA 4UFKA 5DF0A 1UKQA 3CH9A 3WEOA 4UQ9A 4B9ZA 3WH5A 2Y2WA 1ZBCA 1G9HA 4UFJA 2W4XA 1M53A 5LYRA 4QAWA 1HXJA 1MQQA 2QHAA 3N13A 2BXYA 3WIJA 2QPUA 1CGXA 4JL2A 1AQ0A 1MW1A 1GONA 1V3IA 1TUXA 4C7FA 1OD8A 2VX7A 2WHMA 3VIMA 3W29A 2CKRA 2GDVA 5CLTA 4P8UA 3RJYA 2J74A 1W1TA 4JHOA 1UZ1A 2WHLA 4CU8A 3RM9A 5FD0A 4AMCA 3UCQA 2D0HA 4A3HA 1V3LA 1MXDA 3ARVA 3SIMA 2E9MA 4B15A 2ZE0A 1UD2A 4KH2A 3EDKA 2BHZA 3TTOA 1Q6FA 3GNOA 4M80A 2G3MA 1XH0A 2UY3A 5AC4A 3NSNA 1QNSA 2WM0A 3SCNA 1JF5A 2ESCA 1WDRA 3O6AA 3AHVA 5C8BB 1BG9A 1UOKA 4J7RA 4H7VA 3WFZA 4HMEA 1UQYA 1FH9A 1RPKA 2WANA 4OKDA 1E71M 2DEPA 2A3EA 2D3LA 4HZ6A 5FL0A 2XVNA 2YOCA 1JDAA 3SCPA 3A4AA 4RE4A 2XVLA 4B16A 1PEZA 3KWXA 1QHOA 3VDAA 3PZVA 1W32A 1QBBA 4HZ8A 2E9LA 3ARUA 1V0LA 1KCKA 4MDOA 4KWUA 4UQAA 4TX8A 3BH4A 1JGIA 3TTSA 2W91A 3A3HA 5D9OA 1G0CA 4MB4A 1QI2A 3AZRA 1VEMA 1QBAA 2VR5A 5D9MA 1UH4A 2DPEA 3LMYA 1VENA 1X6NA 4TOQA 1JZ7A 3TTQA 2ZOXA 4TX6A 1WZAA 4U3AA 5HPOA 4FLQA 1PBGA 4HP5A 4PUEA 1UWUA 1VB9A 4YHGA 4M8UA 5E6ZA 4CN6A 3VIOA 1V08A 2D2OA 2CITA 5D8ZA 4AZHA 1EXPA 4OIFA 4M82A 3ZT5A 3VGHA 4F9DA 3CZEA 1EOMA 1BYAA 4DWSC 2CPUA 2ZWZA 2CNCA 5JBEA 1J11A 3QHOA 1J01A 4LX4A 4U33A 3ARYA 1LF1A 3NCOA 2WLZA 3A4WA 3ARTA 4D6DA 3BXWA 1UR1A 2QLYA 5E70A 4W88A 3RO8A 3G6MA 3OZOA 2YA1A 5TD4A 1UUQA 3SCRA 4UR9A 4B9YA 3GYCA 3O9NA 1TA3A 1VFUA 5C71A 4FLSA 4GXPA 3BSGA 2WCAA 1CGVA 3BCDA 4FF5A 3DECA 3OBAA 2PWDA 4JFWA 3UG4A 1BHGA 3BLKA 3THCA 2GVYA 2YBTA 4AZCB 3WD0A 3WEZA 2VL4A 3VKKA 3OG2A 5I5RA 1DWIM 2OLHA 4OOUA 3JUGA 2QPSA 1LWHA 3L2LA 1KBKA 1OGGA 1RP8A 3W38A 4WIWA 1CWYA 3VX0A 2D24A 3IJ9A 2XIIA 3VMNA 2BHUA 2OSWA 3RM4A 3WMCA 1OT2A 1V6YA 5CZKA 1KR1A 5JUVA 3WF2A 1VFOA 3BSHA 3LPGA 2ZX6A 3AS1A 3WD4A 1QVBA 1M7XA 3MKKA 1J0HA 2DH2A 2WLYA 3BC9A 1E6NA 2DGAA 4FMVA 4EK7A 4D71A 1PX4A 1WB0A 4WSKA 3EDDA 4QLLA 1ISZA 1US3A 5HNNA 5BROA 4S3KA 4H2CA 2G41A 2D0FA 2WKGA 1GOQA 2W67A 2A3CA 3VD4A 2J75A 2B31A 5I6SA 4GINA 4RE3A 3VIHA 1JF6A 3KZSA 4BF7A 3M6DA 3VNZA 3ZR5A 1XGZA 4M24A 4QCEA 4AISA 5CJ5A 4GZJA 2A3HA 4MNKA 3VINA 3EMZA 4W8BA 3GH7A 5ECUA 1EA9C 3WNKA 3CZKA 3N12A 3AICA 1R87A 2FHFA 1J12A 1E3ZA 2QMJA 3ZT6A 2DT3A 4OBRA 5BXSA 4MAZA 4WJXA 1V3JA 3GTNA 4H04A 3SUWA 2DIJA 4TTUA 1OM0A 2YLAA 3EBVA 1BFNA 1E6SM 4PSPA 4MJ2A 3VMOA 3FW6A 3T2PA 1XV8A 4V27A 3AYRA 3N9KA 4BCEA 1MW2A 1E0VA 1XYFA 2NT1A 2QF8A 3GZAA 3T0BA 2E8YA 3VGDA 3CPUA 1JDDA 1H1NA 3PZIA 1I1XA 1C8XA 3FHAA 1O6IA 1LQ0A 5CQ1A 5EBAA 3VGEA 3RCNA 1MFVA 3WD1A 2BVDA 4W5UA 4AD4A 2W5FA 4CD4A 3ZO9A 2Y5EA 5AYBA 5GNZA 4F8XA 2DSKA 3GNRA 1NWUA 4WKAA 2E3ZA 1BGAA 2CBJA 1NOUA 1UWIA 1FP9A 1KXVA 1W3HA 1KQYA 1MWOA 5IXEA 2WMIB 5M03A 1CIUA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2WMH A;  4OUE A;  1TCM A;  3WNN A;  4GO8 A;  1ECE A;  2FDM A;  2YL9 A;  3PTK A;  4IIS A;  2CYG A;  1E9L A;  4Y7E A;  5JIP A;  1OT1 A;  3UG5 A;  1WAW A;  4UOQ A;  5BYW A;  4PCS A;  3WSU A;  3MUY 1;  1C93 A;  1G5A A;  4OBS A;  3WH6 A;  2O9R A;  4C7D A;  2VVN A;  1MW3 A;  2WSP A;  1HP5 A;  5I3D A;  2UY5 A;  2VX4 A;  6CGT A;  4U5K A;  4E8D A;  2E0P A;  4PTV A;  2EPL X;  2C0H A;  2XM2 A;  3VIJ A;  5EMY A;  3WQ8 A;  3CHF A;  2XFF A;  4CU7 A;  1DWA M;  3WEM A;  3AIS A;  2FH8 A;  2X0Y A;  2XFY A;  1LL6 A;  2IXU A;  2X2Y A;  1NWS A;  5BXT A;  2ZXB A;  3VIK A;  2WMI A;  1E4L A;  3ZJ6 A;  1HT6 A;  1ZU8 A;  5A94 A;  5A8O A;  3A47 A;  1SMA A;  1ZBW A;  1CEO A;  1B3Z A;  2DSV A;  4PN2 A;  2IUZ A;  1EQC A;  1R7A A;  4W7U A;  2ZXQ A;  2E4T A;  4JKL A;  2YDR A;  4BQ2 A;  4BQ5 A;  1DWH M;  5BCA A;  5CPS A;  3WDI A;  2WHK A;  1IZK A;  3OGR A;  2G8Z A;  1UR4 A;  3TON A;  2YA2 A;  2PWH A;  2XM1 A;  4H41 A;  3L4U A;  4J3T A;  4PUD A;  1E1F A;  1W3L A;  2WK2 A;  3IK2 A;  4XV0 A;  5LA0 A;  2OWX A;  3BAW A;  3CUH A;  1NM9 A;  2G3N A;  2PBO A;  4D6C A;  1TA3 B;  1FFQ A;  4J3U A;  3WNL A;  4AD3 A;  2VZV A;  3S6T A;  1AQM A;  1W9V A;  4H8U A;  4J3W A;  2EJ1 A;  2F2H A;  3VII A;  5BRP A;  3N15 A;  5C70 A;  3GXM A;  2WWD A;  3ZJ8 A;  2OWW A;  1DWJ M;  2VX5 A;  3VPL A;  1V02 A;  4J27 A;  1CLX A;  2VC9 A;  3MMD A;  4C7G A;  2EPO A;  4PEE A;  2G3I A;  4CU6 A;  2O9T A;  1HF6 A;  3NDY A;  3HMC A;  5A6K A;  4HA3 A;  3CUF A;  5A6J A;  1U33 A;  4B3K A;  2EPK X;  1H41 A;  3NJ3 A;  3PZN A;  3WF4 A;  2BV9 A;  3N1A A;  2BNJ A;  3L4X A;  4DUW A;  4ACZ B;  2FHB A;  5FKY A;  4CVW A;  2X09 A;  4Z2I A;  1HJS A;  3GXI A;  3AIU A;  3DHP A;  4BQ3 A;  1W1P A;  1B3V A;  4PYS A;  2V5C A;  1W3K A;  3AOF A;  2PF0 A;  2WVU A;  1E56 A;  3AI0 A;  1PPI A;  2FGL A;  1WZL A;  1KQZ A;  3MUZ 1;  1BVZ A;  3VM5 A;  5IDI A;  1TVN A;  1WKY A;  5E09 A;  1JYX A;  3IJ7 A;  1C8Q A;  2JE8 A;  4WF7 A;  3WDQ A;  3WQW A;  4GQQ A;  1GVI A;  1EDG A;  3ZMR A;  3K8K A;  1GQL A;  1CBG A;  4TTG A;  2IXV A;  1TG7 A;  5M3W A;  1NWR A;  1KXH A;  1C90 A;  3WD3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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