3FOKA

Crystal structure of cgl0159 from corynebacterium glutamicum (brevibacterium flavum). northeast structural genomics target cgr115
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
297
structure length
295
Chain Sequence
PPIISPESFEALRRMRAAEPTMVAERFKQRRKRELLGEDGKLFIVAADHPARGALAVGDNETAMANRYELLERMAIALSRPGVDGVLGTPDIIDDLAALGLLDDKIVVGSMNRGGLRGASFEMDDRYTGYNVSSMVDRGVDFAKTLVRINLSDAGTAPTLEATAHAVNEAAAAQLPIMLEPFMSNWVNGKVVNDLSTDAVIQSVAIAAGLGNDSSYTWMKLPVVEEMERVMESTTMPTLLLGGEGGPDATFASWEHALTLPGVRGLTVGRTLLYPQDGDVAAAVDTAARLVHTDI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Cgl0159 From Corynebacterium glutamicum (Brevibacterium flavum). Northeast Structural Genomics Target CgR115
rcsb
molecule keywords uncharacterized protein Cgl0159
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Corynebacterium glutamicum
total genus 82
structure length 295
sequence length 297
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-12-30
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3fokA00
1X1OA 4M7TA 1A5CA 3P80A 3N34A 1XUZA 2Y63A 4WY0B 1VJIA 5F4XA 3M5XA 3O8AA 5HWNA 3LRKA 1ZY9A 3IVTA 5DY2A 1QAPA 1L9WA 3G1DA 2ZQ0A 4AWUA 4IJBA 4JTLA 1H7PA 1UUMA 4IMFA 5D05A 2YPIA 3W22A 1K7FA 2NV1A 1QOPA 5D2XA 1YXDA 1QPRA 3IVSA 1W5QA 2P0OA 1Q6RA 3P81A 3DI0A 3N14A 3HIJA 2B4GA 3P74A 5KMYA 1B3OA 4QQ3A 1I8JA 3TFCA 2GPTA 3G0UA 1LTDA 4QSHA 4WUIA 1KM4A 4DPQA 3MJYA 3MO7A 2GQAA 4JS3A 2EAWA 1LOSA 2YX0A 4JTJA 1LM1A 2PRMA 2EF9A 5G4EA 1TPH1 3W7IA 4IMEA 3GYEA 5I3KA 2PC4A 2H8XA 4AF0A 4BF9A 2R94A 1FCBA 2NWSA 3PS7A 3DAQA 4E2DA 5K3VA 3HG5A 4DO6A 4UFLA 2Y70A 4EF9A 5AC8A 4PL2A 1I2NA 2CZ5A 2FJKA 2RDWA 3HO8A 3ZWTA 4QJ1A 4CCDA 1MXSA 3W1TA 5C6MA 1PL9A 1N55A 1RPXA 4Q33A 4KKXA 4I7VA 3T4CA 3BGJA 4A29A 2I1OA 1DORA 1DHPA 1S3HA 4Y9AA 4BWLC 4QAIA 2G96A 1Z41A 4JN6A 3KHJA 7TIMA 4N4QA 2X1RA 1NAL1 4DBDA 1W37A 4PA8A 3L5AA 3UWUA 3SGZA 3EX4A 4R53A 2XN2A 1J2WA 5FEXA 4MUZA 1VC4A 2FDSA 3MHUA 3PVFA 2C1HA 1W5NA 3TR2A 2YFOA 5H2ZA 4WZHA 4O10A 1F7BA 3MUXA 4UFMA 3GNDA 1KBJA 2VFHA 1LRQA 1IXNA 3EWWA 4K37A 5HWMA 4O0ZA 3BG9A 3ZFHA 2PURA 4ZQOA 1OFEA 1D9EA 3FFSA 4BI7A 3BW4A 4K38A 2C15A 4JY9A 3BG3A 3HG4A 2R91A 3FJLA 3MYOA 4C1KA 2QKFA 3T78A 5D38A 1LLWA 4Q32A 4YCOA 3L9CA 4PODA 3UWWA 5KINA 5AHNA 1T96A 4AAJA 5LGZA 3E12A 3W74A 1W3TA 1XI3A 1LZOA 3IIXA 1LROA 1M7PA 2BX7A 1W5MA 1TPUA 2NUXA 4XBSA 2NLIA 5DELA 5FEZA 2A2IA 3UZ5A 5CSRA 2V5BA 1PCWA 1SO5A 1JQVA 5L6UA 3QMSA 5G5IA 3C61A 3MBFA 1KFLA 5C2XA 1GVOA 1ICPA 3WK1A 5BRBA 1EP1A 4R7JA 4FNQA 2ATSA 4GFSA 4GWEA 1YXCA 4O0KA 3ABQA 4YL2A 4O8RA 4FF7A 3W83A 5AYZA 1OF8A 5G4WA 1HTIA 2V5LA 2HSAA 1FWWA 3HJZA 4Y6GA 2Z0IA 4NNCA 1DV7A 3Q37A 2YYTA 4O1CA 1OK4A 4JX4A 1FWTA 3A21A 1XXXA 1E51A 2DZPA 3WK2A 3GXTA 5AYYA 2YYUA 4KFNA 2A7PA 3MI3A 4AHPA 1GTHA 1TV5A 4RKAA 1R30A 3UWZA 2CWNA 3C8FA 2FLIA 3NAVA 5K2ZA 4D2JA 3W23A 4YMZA 2Q8ZA 2NX3A 4ADTA 4LT9A 4BI5A 4MJMA 3DFQA 3C56A 1WBHA 3LHYA 1JRCA 3UPWA 3NQVA 1SR9A 2ZRXA 4PL1A 4X2RA 3USBA 2C3ZA 3GKFA 1YPFA 1O95A 1ZHAA 1VQTA 4O54A 3OA3A 1QDSA 2DZTA 4U4MA 2XFWA 3LHZA 3AO0A 3G1XA 3CLMA 4JTEA 4LW7A 2V0TA 1H5YA 4FEZA 5AN7A 2YW4A 1LBLA 1O5XA 3CQ0A 3O16A 3BG5A 5CG7A 3INPA 3LHWA 1F05A 2ABAA 1FCQA 3LCGA 4FNRA 1OX4A 3HGOA 3LCWA 3B8DA 1TQJA 2JK2A 3L2IA 1NF7A 3T44A 2IQTA 2Z2UA 1JCYA 4I9AA 3QC3A 2WOQA 4K36A 4MYXA 4O4VA 3W2KA 2HMCA 3HB9A 2Y6ZA 1SFJA 4LRSA 1JJKA 1GT8A 1OF6A 1SW7A 4LNYA 2QJIA 2ZTKA 1YADA 1S5VA 4M6QA 3NQGA 3EKLA 4LU0A 1Q6QA 3STEA 5F1UA 3ZWSA 1QMLA 4DQWA 3L65A 1FDJA 3NM1A 5CPNA 2XN0A 4UTTA 1OVDA 4MLRA 3THQA 1ML1A 3UWVA 5HMSA 3PBYA 2VENA 4XUGA 3FJ6A 2VFFA 1DQXA 5D32A 1R2TA 4M19A 5GVJA 3LBCA 3LERA 3QMRA 4OU1A 1TB3A 3TW7A 3GLCA 1WQ5A 4UFKA 1WA3A 2DP3A 5AHIA 1TRDA 4IX2A 1N7KA 1VRDA 4A22A 1B57A 1AMKA 1MEIA 1H50A 1KBIA 2PE4A 1GPWA 3IGXA 4UNLA 2J27A 3N19B 4MLJA 5F4WA 1Q6OA 1TPVA 3KOFA 3GAKA 1ZAIA 3PC0A 1EB3A 1R2SA 1X6UA 3N2MA 1TV8A 2CFFA 1UCWA 2WNNA 1TTQA 3WFAA 2B7PA 2B7OA 3QFEA 3B05A 5K9CA 3P5ZA 1BEUA 2RHGA 4CLMA 3TX9A 4OE7A 4A2RA 3OVRA 2CLHA 3L66A 5EPDA 1IXPA 1SSDA 3EWYA 1DVJA 4W9TA 4JICA 3TQVA 4O16A 2FB2A 2QCLA 5C54A 1WXJA 5HUPA 2J88A 2CLFA 1MZHA 2A4AA 4X3ZA 3EX6A 3GVGA 1KTCA 1GZGA 1TO3A 4MY1A 5EYWA 4WXYA 1A5BA 4GUJA 3DKLA 1EP3A 2E09A 4E0CA 3R13A 4DF0A 1LBMA 4RXFA 1X7FA 2ZDRA 5G1YA 2ZRVA 3L68A 4NZJA 3SGUA 2ABBA 1TREA 2CLOA 2NWRA 3CPRA 3GAYA 5AB3A 4PEKA 4UIOA 5IBXA 2QCDB 3W76A 1GVQA 1R46A 1EPXA 2CLEA 3DENA 5HWJA 4UTLA 2A5HA 3S8HA 3UY8A 3FOKA 3RFAA 3IIZA 3DHDA 4AVFA 8TIMA 4O1DA 3GNNA 5KZEA 1YDNA 3THAA 3P84A 4ZVJA 5EMUA 2X2GA 4XKYA 1IF2A 4WY0F 1H7XA 3M6YA 1ALDA 3DXIA 1ICSA 2YSWA 2VELA 3I7QA 5LGXA 3M7WA 4OT7A 4RR4A 2B7QA 3NXFA 3W2UA 4UUIA 1ZFJA 3P62A 3CWOX 2H3DA 4JTKA 1SSGA 3O05A 2A6LA 3PBWA 3W7JA 5CPLA 3ANYA 3N73A 1H7NA 2ZRYA 3V1PA 3N3MA 3B0PA 1XUUA 3NOEA 4Z1DA 4K39A 3TH6A 2TSYA 2PCQA 3LXBA 3W75A 2ZYFA 4UCGA 3C52A 2A7RA 2F7FA 3UQNA 1SQ7A 4ADSA 2QJGA 5G1TA 1TJRA 3W85A 2E5DA 3S1VA 3W7HA 2CU0A 4QIUA 1O94A 2OMAA 1JCXA 1JULA 1K7EA 1VS1A 4RXGA 1C8VA 3TAOA 2NZLA 1MEWA 3IIVA 1EA0A 2JGQA 2TYSA 1H7RA 4HPJA 3W2LA 3O15A 2ISWA 3NQEA 4O17A 3NDOA 3QEZA 1KFKA 4GXMA 4JEQA 2QUVA 2WQPA 3GXNA 2J9YA 3W7LA 3UXDA 3M9YA 4UTWC 4J9JA 4RCXA 4JY8A 4KWWA 3CB8A 5AHEA 3VI2A 5LKYA 3M44A 4BR1A 3S1XA 3A23A 3LXCA 5TBOA 4GC4A 4IMCA 5DY3A 3S5ZA 2YW3A 3O6DA 1K8XA 3C6CA 3PUOA 1LP6A 1V5XA 2VEPA 3NNTA 1GJPA 4MZ8A 1VR6A 2QUTA 2GJNA 1JCMP 3DBPA 1TSIA 1LOLA 2VEMA 4FB7A 1KFCA 3DZ1A 3DH7A 3GDKA 5CZTA 3NA8A 3W07A 1J5TA 1LYXA 3G1SA 5FF2A 5AC7A 2Y89A 2Y62A 2DORA 4IMGA 2ISSA 1L6YA 2FB3A 3NQDA 1ME8A 1G4PA 4UTTC 3LCFA 5FF4A 3EXTA 5CSSA 5I3JA 2E5CA 4FO4A 1BWKA 3GX9A 2YR1A 3O06A 4AF0B 4TIMA 1ZJIA 4HKPA 4MPQA 3N9RA 4BK9A 4DXVA 1LRTA 3W73A 1JCNA 2ZA3A 2ZRWA 2JBMA 4RZ6A 5G2WA 1FXQA 4N6FA 5DBTA 3UWQA 2EPHA 4XBKA 1YTKA 2E6DA 3M41A 4S1FA 3DFTA 1A5SA 4XTIA 3KFTA 1IIGA 3CTLA 3RLUA 4EVZA 3P8JA 4LOCA 5HJLA 3TE9A 3JRKA 3W9ZA 4MYAA 4OWGA 1OHLA 3E96A 6TIMA 2QDHA 2Z6IA 1M7OA 1OG0A 5BNKA 2ZBTA 2EHHA 2ZTJA 2GVLA 2GUUA 4O15A 1SO6A 1XDMA 3A22A 5EKYA 3TSDA 1H1ZA 2I14A 3BVJA 3L0KA 1QNVA 3QW4B 1PS9A 3M47A 1WOBA 4UTHA 1KM3A 4AWSA 5HULA 3A5FA 3W1QA 3EWUA 3S5YA 3TSMA 3L0NA 1XBZA 3I68A 3P60A 4MFEA 3LTPA 4FX8A 4O19A 1FY6A 1G4TA 5CZJA 3S6DA 2X1TA 4N4PA 2V30A 4N9BA 1ZAHA 3SSJA 3C3NA 1KW1A 3SI9A 3EX1A 4LS0A 3OIXA 2E6FA 3A24A 3NL3A 4TX9A 3FYOA 4BI6A 5IBXC 4K6AA 3TC7A 1KA9F 3QRHA 3NVTA 5DXXA 3UYCA 4LVAA 3TC6A 2A7NA 1ZALA 3MI2A 2EGZA 3TSBA 1QR7A 4P61A 2HTMA 5DBUA 3I6RA 3GDRA 1EWDA 1H7OA 2V81A 1YTDA 1JVNA 5K4ZA 3Q94A 4OQVA 2Y7DA 3QZEA 1FX6A 1G67A 1NEYA 4JTSA 4N6EA 3HPXA 1KM5A 2DZXA 4PC8A 3HPZA 3PY2A 3SFKA 5AYXA 2QR6A 2FIQA 4AXKA 5AFDA 3CM4A 2DZWA 3SIZA 4JYEA 1TRIA 5HR6A 2Q8LA 2Q3OA 1SPQA 4UTIA 2C6QA 3RK8A 4HNTA 3DU0A 1F76A 1TPEA 3BV4A 1SO4A 1T8XA 2H6RA 3ABRA 1HUVA 1WDWA 4JTUA 2GJLA 1BWLA 3L5MA 1K8ZA 1KLZA 4MZYA 1NFBA 2ZZ3A 5CGQA 1HG3A 4JYDA 4K8EA 3EXRA 4HHPA 3N9SA 4JDYA 4O11A 1H51A 4DF2A 2VFIA 3TJLA 3I7SA 3LXAA 2FPVA 4AB4A 1W5OA 3W7CA 3W71A 3TCEA 1JCJA 1W3IA 4JIQA 3B03A 1L2UA 2RH9A 2EKCA 3LDVA 2GOUA 3PF3A 4MIMA 2GQ8A 3H53A 2V2HA 4O14A 2QJHA 4L4MA 4FX7A 1H62A 2FPYA 1SFLA 1VCFA 5I3FA 1XL9A 3S1WA 5F1VA 3GXPA 1VLWA 1PE1A 1Z48A 2H8ZA 1QO2A 4HSOA 1L6SA 3UD6A 1OX4B 1OFPA 3Q2DA 3HGSA 2R14A 1FXPA 3F4NA 1F6PA 3MHFA 4O4WA 4DEFA 5D2VA 1W8SA 2NXGA 4LS2A 4JYFA 3WJWA 3KVKA 3OHIA 3PR2A 2V8ZA 1UBSA 2V2CA 1ICQA 5FI8A 5AOUA 4H6KA 1DKWA 3W1PA 2YXGA 3G0SA 4NQ1A 3U8GA 1IGSA 4GUIA 1LLZA 2WJZA 3EWXA 1F73A 3B4UA 4YXGA 4UFJA 1TPC1 5BW6A 2ALDA 4BFAA 2TMDA 2CLLA 3M1ZA 3TMLA 1G7VA 3KVLA 4CNPA 4WX2A 3G1HA 1YTEA 1JUBA 1Q6LA 3E0IA 2WPBA 3PSWA 3CHVA 3G22A 3FKKA 1A5AA 3I65A 3B0UX 5LSMA 1JCLA 4M6VA 1NSJA 1K3UA 1RQEA 3W7GA 2NX1A 1XBVA 4O18A 2QAPA 3TKFA 4XZ9A 3LM7A 4CNNA 3CT7A 1T99A 3PG8A 3HBLA 1I2PA 5F2IA 1W31A 2C14A 1KV8A 4HNUA 4HN4A 3NO5A 3R2GA 2AAMA 3C0JA 2B0MA 3TU9A 2P1FA 3W7OA 2Y61A 5CZSA 5EL1A 3G0XA 3WK3A 3QPYA 2Y7FA 2V9DA 3IGSA 1P4CA 2E5BA 3PB0A 3RF9A 1ZENA 4O13A 2W79A 2ATMA 2HS6A 2YFNA 1ZCOA 4ZQPA 1I4NA 3H55A 5A8GA 3WJSA 4IUOA 3TJXA 2A0NA 3NQ7A 5DLCA 5HNRA 2NX9A 3CIWA 5K9XA 1G4EA 3C2FA 3ZS4A 3QJAA 3E49A 1EEPA 2V82A 3CIXA 3IIPA 1H63A 3W2MA 1XBXA 1KFJA 2XN1A 1FWRA 2CLIA 4TMBA 1OFDA 2FQIA 4CQAA 5HQEA 3PSVA 4JTIA 1JR1A 4XTDA 3W7PA 3MP5A 3IIOA 3NM3A 2QCFA 3QW3A 1SO3A 4RLIA 1PVNA 3VNDA 4S2BA 4Y8FA 3K30A 1QPQA 1L6WA 1X1ZA 3VE7A 2RDUA 3NGJA 1SW3A 3GDMA 5CKSA 2WSYA 3C2RA 4LC6A 3BPWA 1FCUA 3STFA 3HQ1A 1FWNA 3G1FA 1OYAA 3M43A 4FNTA 3LI1A 5LNVA 1KFEA 3AJXA 1LRNA 4XKYB 4JR5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1O5Q A;  1X1O A;  4M7T A;  4NZ4 A;  2G37 A;  3P80 A;  5ECU A;  3AS3 A;  3N34 A;  1XUZ A;  2D3N A;  1VJI A;  5F4X A;  3M5X A;  3O8A A;  5HWN A;  3IVT A;  2PWV A;  4AX6 A;  1ELS A;  4GQG A;  3G1D A;  4Q8O A;  2PA6 A;  4AWU A;  5I24 A;  2BOG X;  2PWD A;  3LZ5 A;  2BY0 A;  1FWE C;  1GKP A;  3AUO A;  2WC3 A;  3LN3 A;  1K7F A;  1LWJ A;  2NV1 A;  3URB A;  4GO9 A;  1XJB A;  4ZCW A;  2JIW A;  1HKW A;  1A49 A;  1GZJ A;  3KBV A;  5A8M A;  1FFR A;  4IL2 A;  2YBV A;  3WH9 A;  4XBJ A;  3G0U A;  2V67 A;  4WUI A;  4JQ1 A;  4G56 A;  4XAF A;  5E0C A;  3FXY A;  2EAW A;  1LOS A;  3AS2 A;  4JTJ A;  3NWR A;  2IUZ A;  1K9D A;  4AF0 A;  1XYM A;  2R94 A;  2YXO A;  1FCB A;  1XS2 A;  2XH7 A;  2A3B A;  2VGI A;  4H6E A;  4H00 A;  3ZQ9 A;  5K3V A;  4J28 A;  3GIP A;  1W17 A;  5IDZ A;  4UFL A;  5AC8 A;  2VM8 A;  2CZ5 A;  2W5F A;  4GKL A;  3ZWT A;  3DG6 A;  1DIK A;  1IEV A;  1MXS A;  1PZ2 A;  4YTR A;  1QJW A;  1PL9 A;  4Q33 A;  4W4Q A;  1RLC L;  4A29 A;  2PWG A;  1DOR A;  3HA1 A;  1VFM A;  4QAI A;  1Z41 A;  3VDH A;  1PYM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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