3G0X | Genus

Total Genus 141

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	141
sequence length	363
structure length	360
Chain Sequence	DERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure-based design, synthesis, and characterization of inhibitors of human and Plasmodium falciparum dihydroorotate dehydrogenases pubmed doi rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Homo sapiens
total genus	141
structure length	360
sequence length	363
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2009-01-29

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3g0xA00

4TMCA 5LNSA 3S1XA 3W7DA 5SWUA 2YSWA 3O6DA 3C2RA 4UTHA 5EL1A 4LC8A 5EA9A 1LBFA 1PCWA 2QCDA 3PUDA 1FWWA 1VH7A 3HGRA 3NO5A 3HG2A 2ZZ4A 3R89A 4Z1BA 1ZCOA 3L5LA 2NLIA 3NDOA 3TV8A 2ZZ3A 3W7EA 5CPLA 2QR6A 2X1UA 2QCMA 2E6YA 2WOQA 3TE9A 3S8HA 4IMEA 2YX0A 3GNDA 3N19B 4OQVA 4PA8A 4BFAA 4UXDA 2WSQA 4LUJA 3T44A 1XBXA 2JKPA 3DXIA 1HUVA 4ZQPA 5FF4A 2VC6A 4LY8A 3MI3A 2ZZ2A 3LXBA 3LERA 3W7KA 3CQ0A 3VKJA 2ZTKA 3A22A 3LTSA 4UTUA 1Q6RA 2W79A 2WKJA 3EX3A 4TO8A 1H7WA 5AHEA 3I7RA 3DHFA 2R94A 4GC4A 4A2RA 3I65A 1AG1O 3U8GA 3QW4B 3BVJA 4LVFA 3W71A 4O11A 4MZ1A 3W2NA 1Q6QA 2Y61A 1AW1A 1B57A 1WDWA 4KKXA 4JTSA 1J5TA 2EAWA 4DEFA 3W72A 2DZSA 4A2SA 3KVKA 2B4GA 2JKEA 3LX9A 1FCUA 1FCQA 3PBVA 2FPYA 3DFOA 3W7IA 1Q6OA 1SO4A 4IWWA 3L9CA 3GB6A 1ZAIA 1L6YA 1WBHA 3KVMA 4O4VA 3JS3A 3BO9A 3HG3A 4FXRA 1FX6A 4O1BA 5HR6A 1GEQA 3CHVA 1SQ7A 2GOUA 3DENA 3W7OA 2J6XA 3W1PA 1PHWA 3RMJA 5C55A 1NF7A 4YXGA 1W31A 3KVLA 3THQA 3PF3A 4UR7A 5G4WA 5D2XA 3TSMA 2PRLA 1XI3A 3KRZA 4XTIA 1KV8A 3STFA 4OGZA 1TPUA 1GOXA 1YXCA 4FF7A 4UFHA 1YDVA 2JKAA 3FYOA 4BI5A 5CPNA 1OX4B 1FQ0A 4GWEA 4I7VA 4EIVA 1TPC1 2A85A 5G1TA 2G5WA 3QJAA 3CB8A 3Q58A 3VI2A 1OFAA 3W87A 1FCBA 3WK3A 1TPWA 1DL3A 2Z2UA 4LRSA 3G3DA 3GXTA 1NSJA 4JTGA 4O57A 1H5YA 2AAMA 2Z6JA 4O1CA 5DXYA 1TQXA 2QJIA 3PG8A 3HJZA 2NWRA 4JIQA 1GVRA 4NZFA 2PC4A 4ADTA 1HG3A 2VFGA 3Q37A 1OX5A 1V5XA 1R2RA 3P61A 3TK7A 3W23A 4JTLA 2V9DA 1WOAA 2OX1A 4K7YA 3M16A 1R2SA 1XDMA 1S5WA 2EHHA 4CCCA 1CW2A 5BOOA 1Z41A 3MUXA 1SPQA 2Y62A 3MYOA 5AYXA 2ISVA 5DCDA 5LGXA 3O05A 2LLEA 3NGJA 4FHAA 3KAOA 3KHJA 4TIMA 1UJPA 2VFIA 5DN1A 4FX8A 3W1RA 3ABQA 3NQEA 2ZZ5A 3DFPA 5EBUA 5DCBA 2PRHA 1MZHA 3UY8A 1TPDA 1GVSA 2VEPA 2AGKA 2RH9A 4PL2A 2ZRZA 3TMQA 4KWWA 5G1YA 3W7RA 1D3HA 4FNSA 3MBFA 3S0CA 3L66A 1VHCA 3DFTA 1OYBA 4H3DA 5CKSA 3HB9A 3LLFA 4YCOA 4X2RA 3N9SA 4NX5A 3HG4A 3W70A 3NPUA 3FEMA 4K37A 3TMLA 3E9AA 1H7OA 4WOQA 2QUVA 2NXGA 4GJ1A 1JRCA 1IIGA 2Y85A 4WZHA 2CLHA 5F4XA 3W86A 3A24A 3GXPA 2CZFA 4MY9A 1JQVA 1RVGA 2CLEA 1W5NA 3IIPA 4M6VA 3ZS4A 3M44A 1OFRA 4UTTC 2PCQA 3C2FA 3DU0A 5KINA 3G1XA 5FF2A 1KFEA 1OK4A 3PSVA 5BMXA 5F4SA 5HR7A 1MEIA 2FLIA 1KFCA 5DY2A 2TRSA 1AW5A 3TAOA 2A21A 3BG5A 4MIMA 4IMDA 5I3HA 2A5HA 1QO2A 1ZFJA 2BX7A 2ZFAA 5L9FA 1XXXA 3LBCA 1F7BA 3UY7A 4KFPA 3HBLA 3M5VA 3MHUA 5FF7A 2OT1A 3LHVA 3W73A 5D32A 2VFDA 1OVDA 4GXMA 1HFBA 3GLCA 3QMRA 4Z0SA 2ZZ7A 3GZ3A 4MLJA 3EX6A 3E49A 3NQDA 4NQ1A 2PRMA 3R12A 1TV5A 1X7FA 3IVTA 4OHQA 4LUIA 3HGOA 3W07A 5FEWA 1SSDA 1C29A 2FB2A 5HWNA 1NEYA 3Q94A 2GJNA 3TC6A 1WYIA 1LBMA 1WX0A 4PEKA 4UTMA 1KM6A 4B5NA 3OIXA 4LS2A 3LCHA 2B7NA 1XBZA 1TTJA 2D73A 4R33A 4AHQA 3LRMA 1TJRA 1W5OA 1DJNA 5G4EA 4FIRA 2GVJA 4K39A 2QCCA 2XN2A 4A21A 1G4PA 3BGGA 4K8HA 2CLFA 2FDSA 2RDWA 4OBTA 3GDRA 3MP5A 1EP2A 4HPJA 4OV4A 1IF2A 1UUOA 1JRBA 3MMTA 3NQGA 4ZZ9A 3LCXA 3UYCA 1SZFA 1VLWA 2E1DA 4HNNA 3FKKA 3I7SA 1GQNA 3LB0A 4ICNA 4TX9A 5AC6A 2JK2A 3WJYA 1YTEA 5BMWA 3TAKA 1LOLA 4FX6M 2A7NA 3SZ8A 3O1NA 4UTTA 4AHOA 1JCMP 1IIHA 3O8AA 1SO5A 3IIVA 5K4ZA 3HO8A 5AC7A 3NQCA 3IRDA 3LBMA 1P0KA 3IIXA 4G1KA 2NV1A 2R8WA 4EVZA 2ABAA 1N55A 1T96A 3L68A 3TH6A 5LHFA 3SGZA 3IIZA 1O5XA 5G2HA 1F5ZA 3VCRA 1LOSA 2HS6A 4UTIA 2V2DA 6TIMA 4N2YA 3SSJA 3HPXA 4MPQA 2XN0A 3G24A 3LHYA 3GR8A 4IMGA 5HWMA 3M5ZA 5T26A 3W75A 4NJHA 7TIMA 3G1HA 2FQIA 1SZEA 5EPDA 2J9ZA 4A22A 3IEBA 1JR1A 4IMCA 3LV6A 2QCGA 1VYSX 1WA3A 1SUXA 3PBUA 4IJBA 3BW4A 2V0TA 3PBWA 4FNPA 3KX6A 5CSSA 2V30A 5KZMA 1DHPA 2C16A 2Z1BA 1FCVA 2TSYA 2ZRYA 3QEZA 5HWJA 4OU1A 5C2XA 4GUGA 5KITA 5LKYA 3L21A 4Z0JA 2CZ5A 5D05A 4FO4A 2FIQA 1FUYA 5FEPA 4M7SA 4YLWA 1YTDA 4XTDA 4I7WA 4MZ8A 2WNNA 2YW3A 4JXCA 2CFFA 2NXIA 3LHUA 1TV7A 4NU7A 1GVFA 1KLZA 2V82A 3W22A 1ZALA 4O15A 4O1DA 1H7XA 3W2LA 3L0KA 3LCIA 4FB7A 3ELFA 4KWVA 2DORA 1TTPA 1JUKA 2F84A 3WJXA 4UR8A 1R47A 4ADUA 1M5WA 4M7TA 4JGDA 4EWND 5I3JA 2YW4A 4L4MA 3A5VA 3CWNA 4AF0B 1QMLA 1LCOA 4X9SA 2X1TA 1XKYA 3H54A 5KZDA 3YPIA 1N7KA 3ATYA 1DORA 3EXTA 4LNYA 1KLYA 4UFKA 3NQVA 4ADSA 1TRIA 3KXQA 4CQ9A 2YDAA 1LOQA 4IXHA 3DI0A 4BWLC 3NPWA 3EWYA 5K4XA 1XUZA 4N4PA 4DO4A 2WPBA 3BLEA 4OWGA 1JVNA 2F7FA 4DO5A 3N34A 4WD0A 3KRSA 3L0GA 3MP3A 3BPWA 1I2PA 3PB2A 4S1FA 5D04C 3LV5A 1VPXA 3PUEA 1UUMA 4S2BA 1KM3A 1XCFA 3L5AA 1VS1A 3F03K 4AXKA 4LV9A 2XN1A 4JS3A 4FNQA 1ZY9A 4H6KA 2H90A 5A5WA 1G6CA 1VCVA 1XDLA 1HTIA 1P5BA 5AYZA 5BRBA 1TPH1 2G96A 4QIUA 5D2TA 3SGUA 3HIJA 1HL2A 5H2ZA 5CZ0A 3KRUA 3JR2A 3HGJA 1AW2A 3BV4A 3SIZA 3S9YA 4PTNA 4I9AA 3KOFA 4HT3A 3V1PA 4XKYB 1W1ZA 1RQHA 4CCEA 2BXVA 4M6QA 4RZ4A 4UMBA 2NX1A 4UTLA 1P4CA 1OX6A 2DZTA 3P62A 2ZDRA 1QO5A 3BW3A 5CZJA 3LHWA 2E5BA 3LCLA 3L5MA 3HOJA 3E96A 2G95A 5F2LA 4JNMA 1WQ5A 3O06A 1OABA 2QJGA 3QZEA 4DF0A 2J88A 2WNZA 1NF0A 2WSYA 1TSIA 5H91A 3DFSA 3ZFHA 4LT9A 1R46A 1OJXA 2ZCGA 2VFHA 4O4WA 3QPZA 4JY9A 4BF9A 5D38A 5U4NA 1KFKA 2C15A 4LVGA 3P8JA 2QCDB 4MJZA 2CLLA 2B7OA 4MFEA 3BG9A 3K30A 3PBYA 1PE1A 3GYEA 4E38A 3DH7A 3EB2A 3NZRA 3QMSA 4ORIA 3S5ZA 4IX0A 1K8ZA 3IVUA 3OBKA 3W83A 3G1AA 3DI1A 4GBUA 2CLKA 3U2OA 1TREA 1W3IA 1ALDA 3B0PA 4ONVA 4P2VA 4XBSA 1U83A 5AB3A 3R2GA 2JGYA 3PAJA 4JEQA 2Y63A 2ZYFA 4YCPA 3GDKA 1BKSA 4O10A 1O95A 1L9WA 4DO6A 3F4WA 4YWIA 5AHMA 3TR2A 2A6NA 1QR7A 4N02A 1A5BA 1PVNA 3I6RA 3MP4A 2QEZA 3UPWA 4K38A 1TPB1 1EA0A 4ZMGA 1UASA 3QRHA 1F6KA 4O18A 3O15A 1OHLA 1JCLA 1BTMA 4O52A 1JCXA 2V8ZA 2C18A 2YZRA 3S5OA 3UWYA 3HPZA 3GX9A 1EB3A 1KM5A 4NXSA 3C0JA 2WJZA 5LNUA 3WJZA 3TX9A 5C5YA 1M7PA 1BEUA 3DGRA 4DF1A 1QDSA 3QH2A 2FPVA 4TU1A 1OYCA 4UTKA 3NR0A 3B06A 1I45A 2VENA 1H51A 4WUIA 3CWOX 1TMHA 3TCEA 1FWTA 1FDYA 5MHBA 1G4TA 1K7FA 4E2DA 4FIQA 3ABSA 4Z1AA 3FLUA 4UFIA 1IGSA 5LNWA 1XBVA 5G2IA 2CLIA 3SFKA 3EXSA 1X8FA 1EWDA 3MI6A 5BNKA 1ZHAA 2WSRA 3A9IA 1OK6A 1MEHA 1W3NA 5K3VA 4UMCA 3W2MA 1QWGA 3GR7A 1OFOA 3C2VA 3TSBA 2E68A 3DKJA 2VOMA 3KVJA 4QNWA 3O6YX 1BWLA 3HQ1A 1R30A 1OFEA 4JDYA 1EUAA 1F74A 5D37A 2ABBA 2V2HA 3GNNA 1JUBA 2P1FA 3W7CA 2Q3OA 3TXVA 1YDOA 3HG5A 3EX4A 3DKLA 2QCFA 3C61A 3W7QA 5HULA 1ICQA 1PHQA 4O19A 4CLMA 2BLEA 4GUIA 5D2VA 1XC4A 1A50A 1WV2A 4O16A 4UMAA 4ZQNA 3M5XA 2QAPA 1D3GA 1B4KA 1I2NA 1TTQA 4D2JA 3C2EA 2P0OA 3W84A 2NWSA 3W2UA 3STEA 3M6YA 4Q32A 1X1ZA 4K36A 3EWBX 2E77A 4AWUA 3CIWA 1UB3A 2CWNA 3N73A 4A29A 3OA3A 1XUUA 1VJIA 1DQXA 3NPVA 1ML1A 3CU2A 3TJLA 4K7VA 2Y7EA 5IBXC 4N6FA 3R13A 3O07A 1QPNA 5F2GA 2OJPA 1VHNA 1B3OA 1SO3A 5CGQA 1QCWA 3MHFA 3TNOA 4LVAA 2YXGA 3QSRA 4HPXA 4PFMA 2XFWA 3H55A 4UFLA 4AHPA 4CNNA 1LYXA 1O60A 4JX5A 5CPMA 3CEUA 5F4WA 5A8GA 4CQ8A 3TQVA 1JCNA 3LTYA 1TV8A 3M7WA 1S3HA 4LS1A 3SY5A 1LDCA 3UQNA 2DZVA 3EXRA 4QSHA 2VEMA 2DP3A 3T55A 2FTPA 2H8ZA 3G0UA 3STGA 3UWZA 1H60A 3A21A 4X22A 2ZA1A 4O12A 3W1TA 2ALDA 3TC7A 4WY0B 5CZTA 3FFSA 4S2CA 4GE8A 1YDNA 3WK1A 2KZHA 4QAIA 3P5ZA 1SU5A 2WO5A 2YR1A 4C1KA 3IGSA 3TQKA 3C52A 5K9CA 4Z08A 3EWWA 1RQEA 1GT8A 3NM1A 1L6WA 3INPA 4FXSA 2TMDA 3RLUA 1S5TA 1B4EA 4GUHA 3TA6A 4ALDA 5I3IA 4U4MA 1AK5A 5D09A 5U7SA 5C6MA 1SW7A 3N2XA 1KFJA 2QKFA 4O0KA 1R2TA 2A7RA 3O63A 1D9EA 1UCWA 1GWJA 1O5KA 2X16A 2QCNA 1T99A 3FIGA 4U28A 5I3GA 1OFQA 2DZPA 5LSMA 1XL9A 3LHTA 3GKAA 1GVOA 2Z6IA 3MHGA 2QCLA 1VYRA 2DJLA 2C6QA 4MFDA 4O28A 3W2JA 1WAUA 3TQ0A 4NJKA 1WBJA 4NNBA 1M7OA 2VEKA 2UV8G 1ZNNA 3S6DA 1I2RA 3N14A 1B9BA 3DAQA 1LTDA 1OFBA 3EX2A 5D33A 1DOSA 5D30A 3QC3A 3HPSA 5FF0A 2QDGA 3BGJA 4R34A 4IX2A 3UXDA 4HNUA 1PS9A 5AN7A 3W7PA 1YXYA 5EMUA 3ABRA 3LGEA 4MUZA 1H1YA 4DBEA 5EY5A 3B0VC 2QUUA 3D0CA 5HNRA 3NQMA 2NXHA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3G0XA

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Chord Diagram

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