3G3D | Genus

Total Genus 95

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	95
sequence length	256
structure length	256
Chain Sequence	ELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure-activity relationships of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase inhibitors as anticancer agents. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Uridine 5'-monophosphate synthase
molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
total genus	95
structure length	256
sequence length	256
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2009-02-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00215	OMPdecase	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3g3dA00

3LRKA 1GTEA 2ZQ0A 3LRLA 3U6WA 5FEXA 2PRMA 3KAOA 3U8GA 2QF7A 1TPC1 1KLZA 4UTHA 4IWWA 1ZAJA 3CTLA 2EAWA 2DORA 5LHEA 3M6YA 4CQ8A 3W2KA 1T99A 4DO6A 3TX9A 1LBLA 4R34A 2ZRUA 2V2HA 3ABSA 2X1RA 1JUEA 1ICQA 4MY1A 2YW3A 3W7LA 1M7OA 1F74A 4HIBA 1I2OA 4DXVA 3TSDA 1JRBA 2VKZG 2WQPA 3HMJG 3NZ1A 3IIZA 3M0ZA 1SO6A 3NXFA 4ORMA 1JQVA 1KM6A 2OT0A 4FNRA 3C2FA 4JX6A 1FCVA 1GJPA 4X3ZA 5DY3A 2ZBTA 5AHNA 4NXKA 1UB3A 3TH6A 2KZHA 2V9DA 2JK2A 4JTEA 4HNUA 4JTJA 3HG4A 5TIMA 1PL9A 2A5HA 2RDWA 3MP3A 5HWNA 1TMHA 3H55A 3W1QA 3LCFA 3NQEA 3RNDA 4FNQA 3SECA 1LRTA 3C61A 2R8WA 1SO5A 3TC7A 3QQ0A 2E5BA 2Y88A 3K30A 4MJZA 3TKFA 5DBTA 5D09A 1E51A 2QAPA 3W85A 2Y7EA 4UTWA 1C29A 2C18A 3ATZA 1I2PA 4O11A 5BOOA 5IM51 4OHQA 4KFPA 1A53A 3TE9A 4JICA 5KTLA 1QR7A 3M44A 3W1XA 3GAKA 1W5NA 1XDLA 3EWBX 1PV8A 2NZLA 5HQEA 1BWKA 5HNRA 3NM1A 4ZL1A 4FX8A 3QJAA 5AHLA 5BMXA 5BW6A 4CNNA 3W7NA 3BW2A 1SSDA 1YYAA 4NVTA 4EF9A 3NOEA 1QCWA 1XBZA 5D05A 5K9XA 1HO1A 2CLHA 3DHFA 4JX4A 5AOUA 1M6JA 1SZNA 4FX7A 3GVGA 1H7OA 1ML1A 3AO0A 3GXNA 1WA3A 2VFEA 3P82A 1TPB1 3A5VA 5KINA 2J27A 4ZQMA 1UJPA 4X22A 4JTIA 2J9XA 4N9CA 3V1PA 1VCVA 1DHPA 1VJIA 2Z6IA 3W1RA 2X1UA 3LXCA 2ZZ7A 4N02A 3G1AA 4DEFA 2FJKA 4PL2A 4QJ1A 2AQWA 2Y7FA 2V5BA 3BW4A 3DFNA 3HF3A 3M16A 3IIXA 4MLJA 4ZQOA 1OX5A 4P2VA 5IBXC 2FLIA 1CW2A 4UFLA 1S5WA 1FXPA 2OCZA 3BGJA 3EWUA 2PURA 3FKKA 4TIMA 3PVFA 2C19A 2VFHA 3W7DA 4ADTA 2Y61A 2V81A 3WK2A 2RH9A 1F5ZA 3HGRA 2C15A 3G1VA 5E0KA 4IQLA 1MEIA 1DL3A 3TAKA 4O17A 1M7PA 3B8DA 5ABTA 1OFQA 4MIMA 4PH6A 1DORA 1F73A 4DQWA 3SGUA 1VCFA 2YFNA 1ME9A 2QR6A 3ABQA 5FI8A 1YXYA 4A22A 2Q3RA 3MYPA 4UUIA 5D38A 2ATSA 5AYXA 3L2IA 2E68A 4RV8A 1H7WA 5D02A 4ICNA 1GG0A 2H3DA 3NGJA 3O63A 3LHUA 1VRDA 4O10A 1YTKA 3E96A 3MW7A 4BI6A 2BZNA 1BEUA 3ZFHA 4NJGA 5H91A 4HNNA 3UNDA 4A2RA 3C2VA 1XBVA 3N9RA 1YTDA 2GVJA 4O14A 3M43A 5LNRA 4QNWA 1Q6OA 4AWTA 4GUGA 3WJWA 4FNUA 3NEVA 5EYWA 2HS8A 1Q6QA 5FESA 2WO5A 3L65A 3M41A 3G1XA 3LHZA 2J24A 2RHGA 3SY5A 1JCNA 1EPXA 4GUIA 1KLYA 5HWMA 5U7SA 1PIIA 3NDOA 1YPFA 5I3FA 4LRSA 3NL3A 1YPIA 3ZR4A 2A6NA 3LHYA 1YDVA 1P0NA 2O7SA 3SIZA 4IGHA 1AK5A 1EWEA 2ALDA 4O0KA 4ONVA 3W84A 4LOCA 4K37A 5DXXA 2V30A 3O05A 3FYPA 1VYPX 4FF7A 2NUWA 5LHFA 3S1WA 4MLRA 3P7YA 3R13A 4JY8A 4RCXA 4M19A 3CIWA 1EIXA 1W3NA 3GAYA 4CCCA 4W9TA 4XUGA 1OFPA 1X8FA 3T40A 4EWND 1KM4A 2GOUA 4Z0JA 2E5CA 3W2LA 4DELA 2YW4A 3NM3A 1KA9F 3I7QA 4RJEA 3HPXA 5CZSA 1KTBA 3EWYA 4LV9A 3DHDA 3PUEA 4O1BA 1SUXA 3EX6A 3QYQA 1HG3A 3E12A 5D33A 3PF3A 2CLLA 4Z1BA 4IMDA 4DBDA 1OF6A 3UY7A 3FEMA 1FWTA 3IIPA 1ONRA 4LVGA 5D2TA 4N2YA 1OG0A 3P67A 5CPOA 2E1DA 3G1SA 3IVUA 3FKRA 4IX2A 1S5VA 4BK9A 1IIGA 1R2SA 5FF7A 1K8XA 4QITA 2J9YA 3OBKA 3W7PA 1QO5A 3LBCA 3L5MA 4FNPA 1GYLA 1TTPA 5E93A 4M6PA 3GXTA 3CHVA 4XBKA 1IIHA 4WXZA 2EPHA 4IMEA 5D32A 2PRHA 1JUBA 3G1HA 2YCEA 2FB2A 2QUTA 3VNDA 1Q6LA 4WOQA 3GNDA 4JTUA 1OJXA 1PHWA 4NT0A 3IGUA 3W7EA 3UQNA 1KM1A 3EX4A 1SZGA 3WK3A 2G95A 1OX4B 4Z0SA 1EA0A 2CZ5A 3NPXA 1JCYA 3KVJA 4LRTA 1IXPA 1NSJA 3O6CA 3RFAA 3W7CA 4PODA 3TSMA 6ALDA 2CW6A 1IXQA 4QAIA 5D04C 3U2OA 4AHQA 2V2DA 5AYZA 3EXSA 3S6DA 4XKYA 3G3DA 2Q3OA 1QPRA 1S5TA 3W86A 3KFTA 5TQLA 3NQDA 1XC4A 2C16A 4FO4A 3DI1A 5K9DA 5G5IA 3RMJA 2J9ZA 2QCCA 3S5YA 4AMAA 2E5DA 3TCEA 4L4LA 4EIVA 4O50A 2QCDA 3A5FA 3PG9A 3L9CA 1TRIA 4NNAA 3LXAA 5C6MA 1XM3A 3TA6A 3EX3A 1VHNA 3S5NA 3C3NA 1LZOA 2ISWA 4ZZ9A 1GYNA 1DV7A 2DJXA 3A9IA 3EX1A 1OFRA 3L5AA 3P74A 3W73A 4N9BA 2G97A 2VXNA 2TPSA 1SU5A 3M5YA 3Q94A 5HMSA 1H7RA 1VLIA 5J5RA 4JY9A 3NL2A 1TV7A 4XZ9A 1FY6A 2GQAA 1H7NA 2FB3A 4HSNA 1PE1A 2CZEA 4K6AA 1OFEA 5DLCA 2EKCA 3JRKA 4MJMA 2WKJA 2DU2A 1GOXA 3TR2A 3VI2A 5HR7A 3RLVA 3HPZA 1NVMA 1BWLA 3A22A 3SJ3A 3TV8A 3W7RA 3GX9A 4TR9A 3W75A 3UPBA 2WV8A 4AHOA 4PFMA 3W7HA 3BG9A 3GDKA 1RPXA 1GVSA 4E0CA 1K7EA 1LOSA 2DZVA 3NQ6A 4Y6GA 2JGYA 3I6RA 3W74A 3QSTA 4Y90A 3CT7A 1SW7A 3IGSA 3QMTA 2QDHA 4IMCA 4QQ3A 4RXGA 4AWSA 3G8EA 2Y7DA 1QPQA 4RLIA 1H61A 4UC5A 3PSWA 3TMLA 3CB8A 3GDRA 5K7JA 1GVOA 2JKPA 4NNCA 4NZJA 3DZ1A 1KM5A 4UR7A 4NX0A 5J5DA 1DJNA 2Z0IA 1OABA 3NNTA 2CWNA 3O8AA 3LOTA 4K38A 4Z1CA 3S5ZA 1TCDA 2RKXA 3HOJA 3P8JA 4A21A 4RZ6A 2EF9A 4BI7A 3L0KA 3C0JA 3TQKA 3MBFA 2D73A 4RX0A 4A29A 4CQAA 4BI5A 1WBJA 2NUXA 3KRSA 1FQ0A 1B57A 1TQXA 4MFDA 1L2UA 1SO3A 1TO3A 3DFPA 1W5PA 2A1YA 2Q8LA 3UY8A 1Y0EA 4RZ5A 1B3OA 1CX9A 2VEMA 3EEGA 2J6XA 5H2ZA 4HKPA 1ZCOA 4MFEA 4AF0B 4O1DA 3ZWSA 1H7PA 1LCOA 1RQBA 2YR1A 3PM6A 5F2LA 3W7OA 1IGSA 2A85A 3C8FA 2X16A 4XQ6A 3W3OA 4JTFA 2GQ8A 4LS1A 3FJ6A 4BFAA 1Z48A 4PC8A 5D2WA 3GXPA 3Q2DA 3IRDA 3FA5A 3LBMA 3LV6A 1I2RA 3H53A 3VE9A 4ZQPA 3W9ZA 1YADA 3FYOA 1AL7A 2H90A 2A7NA 3W1AA 3LCHA 3B05A 3W71A 1D3GA 1I2NA 2Q8ZA 1EEPA 1N7KA 4N6FA 2R91A 3EKZA 1WXJA 3P61A 7TIMA 4N4QA 1XBXA 4JTGA 2F84A 4WZHA 2E6FA 3BLEA 1O5XA 3KRZA 4Z08A 3UWYA 1FX6A 1SR9A 2ZZ6A 4IPJA 3GK0A 2VC6A 4YMZA 3W1NA 5HUPA 2OMAA 2TRSA 3QC3A 3R5EA 1IXNA 1LYXA 2FDSA 3PR2A 1LOLA 2ZDRA 1OX6A 5DY2A 1VS1A 3F4NA 1R47A 2QJIA 1OVDA 1KM3A 1FWRA 1AMKA 4NJIA 4HHPA 1K7XA 5FF4A 2B0MA 4XTIA 2FPTA 4A2SA 4GRSA 1ZAIA 1JJKA 3KXQA 5F4WA 3R8RA 4GXMA 1SFLA 1X6UA 1O60A 3QRHA 2VEIA 4DPPA 3AJXA 2BX7A 4WY0B 3BK0A 2BSLA 4LUIA 3C4UA 3KHJA 1ZJIA 3GKAA 4N4PA 5FEPA 3EWZA 4AHPA 5FF0A 4O19A 1U83A 2W0UA 3CEUA 4OU1A 3CWOX 3S5OA 3HO8A 5L6UA 4XTDA 5F4SA 2ZZ1A 1RR2A 1OHLA 3NPWA 2V82A 4UTMA 3F1QA 4YWIA 1NF0A 2X1TA 3LXBA 4NX5A 3S42A 2E09A 3EKLA 3QMRA 2CFFA 3O6DA 4JYEA 3MBDA 3W2JA 1A5AA 1VCGA 3LHVA 2FIQA 4GBUA 3M5VA 3OVPA 4O18A 4UFIA 3W76A 4UCGA 4BWLC 2WPBA 5BRBA 1SPQA 1HO4A 4WQ6A 5DN1A 1I8JA 4E38A 3W1TA 4LVDA 1VHCA 3C2EA 2V5LA 3RLUA 3S1XA 4GC4A 3TK7A 2VFIA 1P4CA 3DKJA 2XN0A 1ME7A 5G2IA 3TXVA 2DZPA 3O16A 3QMSA 4ZVJA 1SZEA 1ICSA 2DP3A 3LM7A 4AWUA 2QEZA 2ZRWA 1PVNA 2XN1A 3Q37A 2I14A 3H54A 2P0OA 3W2MA 4M5PA 4AH7A 3I7RA 1OYAA 3LCWA 4KKXA 4G1KA 3R2GA 3KX6A 1R2RA 1DJQA 3NL5A 1EP3A 3FLUA 4R7JA 4UTUA 1H1ZA 5CSRA 4I9AA 4RXFA 1VQTA 1JULA 3F03K 3UYCA 3C56A 4YXGA 2ATMA 2NV1A 1X1OA 3PC0A 1JCJA 1W5MA 1JR1A 1VC4A 1YLVA 3G1YA 3W2NA 2NXHA 4O15A 4UTTC 1A5BA 1VZWA 4JR5A 1ALDA 1W3IA 1QFEA 2DZWA 3W7KA 4ML9A 2QUVA 4O53A 3LI0A 1L9WA 3TFXA 1FCBA 5BNKA 3TFCA 1TJPA 1TQJA 3W1MA 1J4EA 1FDZA 3UZJA 3LTPA 3I65A 4M6VA 2B7PA 5G4WA 2E6YA 4I7WA 4BF9A 3VKJA 1AG1O 3D0CA 3CU2A 5DCBA 5CPLA 5LNUA 1K3UA 3WFAA 2CLMA 2YGYA 3MP5A 4DF2A 1W5QA 2Y7GA 3QEZA 3W07A 4N6EA 4GUFA 3SI9A 4YLWA 2ISVA 4JN6A 2NXIA 3QSRA 5D30A 2X1SA 3BG5A 5LKYA 3NVTA 3PB0A 4H3DA 1XDMA 1CI1A 2PRLA 4HPJA 1XI3A 4IXXA 1GVQA 3SZ8A 5F1UA 2WSQA 3QPYA 2CLFA 2DJLA 3TQ0A 3NQFA 5K4ZA 5F4XA 5BMWA 1Q6RA 5CKSA 3GDMA 5FEWA 2GQ9A 4X9SA 3N19B 4FXSA 8TIMA 1GQNA 4MVAA 1KFJA 1W31A 1I45A 4I7UA 2NWRA 1F6KA 4JTLA 2A7PA 1BTMA 3NYZA 3DXIA 3HGJA 3QM3A 1G6CA 1RZMA 2E77A 2QDGA 3FJLA 2QCGA 3N2MA 4CQ9A 4MYXA 2Y63A 2F7FA 4K8EA 1JCLA 5IBXA 1LP6A 2ZA2A 1KV8A 4LVFA 1KBJA 3QFEA 4ZQRA 3O15A 1LOQA 5TBOA 4K36A 4PA8A 1KTCA 5AHEA 3WJSA 3SR7A 2B7NA 1H63A 3LLFA 1H1YA 1VPXA 3A23A 2CLIA 4NJKA 5L9FA 3S9YA 3PBUA 5LNVA 3W1PA 4GUJA 4JX5A 3W23A 1F76A 3IVSA 3LV5A 1W1ZA 1R2TA 2VELA 3NQ2A 4WJEA 1KTNA 3DH7A 1D9EA 3DFTA 3KOFA 3CC1A 3PULA 3THQA 5G2HA 3HB9A 3NPUA 1O94A 3STGA 4YL2A 5AHFA 3TU9A 2LLEA 1ZY9A 1YDOA 5T26A 1OF8A 3GDTA 4R33A 4TMCA 4J9JA 5I3HA 3FS2A 4JIPA 2YZRA 3NQVA 3TXZA 3GDLA 4O4VA 4NNBA 2YPIA 5LNWA 1J2WA 2QCDB 3I68A 3HJZA 1TREA 1F7BA 1ME8A 1ICPA 3BV4A 2C3ZA 5A8GA 3S8HA 2GVGA 3MUXA 1XL9A 1DVJA 2DZUA 3YPIA 1A5SA 3KVMA 4DO4A 2NV2A 1P5BA 2G5WA 1WX0A 2XFWA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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