3G3D | Genus

Total Genus 95

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	95
sequence length	256
structure length	256
Chain Sequence	ELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure-activity relationships of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase inhibitors as anticancer agents. pubmed doi rcsb
molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	Uridine 5'-monophosphate synthase
total genus	95
structure length	256
sequence length	256
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2009-02-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00215	OMPdecase	Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3g3dA00

2Z1BA 4IUOA 1GZGA 3H53A 2TRSA 5BNKA 3H54A 2YX0A 3TJXA 1CX9A 1BEUA 5LKYA 1KFJA 5AB3A 3TMLA 1ZAIA 1YPFA 1BTMA 1KFKA 4HN4A 5HR7A 4MPQA 3W07A 2VXNA 3E02A 4JDYA 3UXDA 1X1ZA 5EKYA 4ZQRA 1AW5A 3W7GA 2NX9A 5I3KA 1TJRA 1ML1A 2X1RA 2LLEA 1SW0A 2QUVA 1KM5A 4LOCA 2FPYA 3UWUA 4DBEA 3QMSA 3UYCA 4FHAA 2O7QA 4QM1A 3BGGA 5H2ZA 5AFDA 3N9SA 4JTIA 2XN0A 1FWRA 4FNRA 3INPA 4O10A 3NXFA 3EB2A 2QDGA 1E51A 1DJQA 3R13A 4LVDA 4Q32A 3DH7A 5LGXA 1G4EA 2GVJA 4MY9A 4O18A 2ZQ0A 3W2MA 1UUOA 5C54A 5LNUA 2C15A 2VEIA 1UASA 3VNDA 2ZZ2A 3NL6A 4TR9A 3LCFA 2Z6IA 3G1HA 2RDTA 4JTJA 2A85A 1CW2A 2E6DA 5F2GA 3JR2A 4XWUA 3BLFA 4NJHA 1SSGA 5D09A 4RR4A 4I9AA 3GNNA 2DJXA 2VOMA 4O0KA 4NXKA 5KZDA 3TDFA 2W79A 2ZRVA 3GR7A 1Y0EA 4AF0A 4K39A 4UTJA 1TRDA 3LLFA 4UFKA 5BOOA 3LTYA 3IVUA 3TE9A 4AMAA 4AH7A 5CG7A 1W31A 3UXAA 2I9EA 3IVTA 4O14A 4DXVA 3B03A 2QJHA 3CIWA 3PM6A 1TV5A 2VFDA 2V81A 5K2ZA 2FPVA 4S1FA 4MKNA 1NAL1 2EHHA 4UIOA 2NUWA 3HBLA 3LRMA 2AQWA 1KLZA 2VEKA 1V7YA 1W5OA 3UD6A 4LW7A 1TTQA 3NQ2A 4ALDA 3FKRA 5LNRA 3LLDA 3PUDA 2BX7A 4EVZA 3FLUA 3GKAA 3LBCA 2ZZ6A 1WYIA 3ZFHA 2ALDA 3FOKA 2J9ZA 4IGHA 3BG3A 2TYSA 3W7LA 5I3FA 4IQLA 1O5XA 1AL8A 3CLMA 1WX0A 2QEZA 4C1LA 1ZJIA 1OYBA 1EPXA 1NSJA 2ZYFA 1OABA 3SECA 1PV8A 3O6YX 3USBA 2NV1A 1KTNA 3B05A 3W83A 3CHVA 4G1KA 1P4CA 5IBXC 1FCBA 2RDWA 4GUFA 5G1YA 3MHGA 2X30A 5BMXA 1IXPA 1HFBA 1DBTA 4LV4A 1H1YA 3NQ6A 2C16A 5CKSA 1IXOA 2PC4A 2Y63A 1H60A 1F5ZA 1BWKA 2I14A 2DJLA 4CQ9A 1LROA 4O28A 5AC6A 1RQBA 5HMSA 4Z1AA 1SO5A 3B8DA 4N9CA 1LOQA 2Y7GA 2QCGA 4CCDA 4ORMA 1P0NA 3GLCA 3LDVA 4QAIA 4TMCA 3GAKA 4LC8A 3NQ8A 5F1VA 1OK4A 4AXKA 3I7SA 4O11A 4YCPA 1XUZA 4XBKA 1O95A 3YPIA 4O52A 1KM1A 3TR2A 3FYOA 1L6WA 1VZWA 5D03A 1QPNA 3BLEA 4JTGA 3UZJA 3L2IA 3GIYA 4I7UA 3QRHA 4R33A 2JGQA 1X7FA 1RPXA 4LT9A 3THQA 5H91A 1OX4A 4GE8A 1XBYA 1XL9A 1WBJA 1YDOA 3W1XA 4NX0A 2A5HA 5A8GA 4NXSA 3NL3A 4Q33A 4UUIA 1W5PA 1D3GA 2DZPA 2V30A 1I2QA 3DFOA 4QISA 4MLJA 4R34A 2A6LA 1GTHA 1TPC1 3CPRA 3TFCA 2P10A 3HGOA 3L0GA 4I7WA 3LCHA 3IEBA 1SW3A 1KFEA 4FX8A 3LI0A 1GOXA 3U6WA 3GNDA 3B0VC 4DQWA 3MO7A 1OYCA 3RK8A 2DZWA 4PEKA 3RLUA 2PRHA 1O5KA 4NVTA 4DF1A 1LP6A 3PSWA 3I6RA 3JS3A 2GPTA 3LHUA 1QMLA 1KTCA 2QAFA 4Y96A 3OHIA 5AHLA 3VFLA 1K8YA 1O94A 3DKLA 3NQEA 4OGZA 3A22A 1V5XA 3G3MA 1MEIA 3WK3A 4NNBA 2HS8A 3PR2A 3UY8A 2H90A 3JRKA 4WX2A 5E1QA 1GVSA 3MW7A 4AHPA 3OEXA 3G3DA 5EPDA 1F05A 1SUXA 4O4VA 2YZRA 3KHJA 3G1VA 4HT3A 2X1UA 4RJEA 3W1AA 3K30A 4NNAA 1ICPA 3E49A 3LCWA 1VQTA 2B0MA 3NNTA 3ZWSA 4Z1BA 3TQKA 4I7VA 4MFEA 4XTDA 3W1PA 1F6KA 2E68A 4NNCA 4Y90A 4ADTA 5D30A 5IBXA 3M5YA 1R30A 3C2EA 4DEFA 4A2SA 3TC7A 3DXIA 1UUMA 1TREA 3LBMA 2TSYA 1PHWA 3ABOA 2CZEA 1WXJA 2RFGA 4O50A 3TU9A 1HTIA 1KM3A 3LI1A 3P82A 2E5BA 4PL2A 3TSBA 4DBDA 3T78A 1WA3A 1F2JA 4GC4A 4OV4A 3GVGA 3OVRA 3P61A 4AVFA 1JQVA 1H7OA 1P0KA 4GUGA 3MHUA 2CLMA 1GVFA 2QCDA 4DF2A 1W56A 1AW2A 2GQ9A 1W5MA 3Q37A 4NUWA 1JCNA 1GYLA 2E6YA 3P5ZA 1YDVA 4K37A 4PODA 4DPPA 1RZMA 2C3ZA 3L66A 1FXPA 4UMAA 3P67A 3TSDA 3A23A 3NL2A 5HINA 3SZ8A 4DO4A 2W0UA 3ATZA 2J24A 3M5VA 1TMHA 3ZS4A 3IGUA 3DHFA 2BWGA 5D37A 4N6FA 3LCXA 3LHTA 2V0TA 2RH9A 5AYZA 2C14A 1A50A 3N2XA 5CZTA 4ZMGA 2Y6ZA 1SSDA 4Z0JA 3W7QA 2YW4A 1R2SA 4LU0A 2YYTA 3NVTA 2PURA 5U7SA 3EEGA 4JEQA 1ZALA 1JULA 3UWZA 2C19A 3HGJA 3M5ZA 3O63A 1K8ZA 3AJXA 1VHCA 4LY8A 4FIQA 4MOZA 3W2LA 4JTKA 3P7YA 4UTKA 4PL1A 1FBAA 4HPJA 1GWJA 1TV7A 4CCCA 2YDAA 4FNUA 1KFBA 5FEWA 2VFGA 3QFEA 4KFNA 2EAWA 3DU0A 4R53A 2Y61A 4AB4A 1PE1A 4MYAA 4PFMA 3PUEA 2QCFA 3LHZA 3FIGA 3W7OA 1PVNA 2RKXA 2QCNA 1H50A 2J9XA 1A5SA 5G2WA 5FF2A 2A7PA 2V9DA 2P0OA 1JCXA 4ADUA 4XKYB 1NF7A 1TPFA 1TIMA 3HB9A 2Q3OA 1OFPA 2WJZA 1W3IA 3W72A 3G1DA 1GVRA 3M5XA 2ZZ5A 5K9CA 3G24A 4O1BA 2CU0A 1L6YA 3LXAA 1ME8A 3PC0A 3EWZA 2CLEA 4OV9A 2BLEA 2ZTKA 3HF3A 3M1ZA 2ZA3A 3MYPA 1ADOA 3WFAA 4O17A 1EA0A 3THAA 4EOUA 1K7EA 4EIVA 1FUYA 1VYRA 1FCUA 3N2MA 5F2IA 4C1KA 4IOTA 5G2HA 4O1DA 3STGA 3W7DA 5AHIA 4A22A 3TAKA 3BK0A 3VCRA 4RX0A 3IIPA 1Q6QA 5HNRA 1M6JA 1TCDA 1W54A 2QCHA 3F4WA 4A21A 3NQAA 4AEOA 4IJBA 2YSWA 4O4WA 1TPEA 3BGJA 5F4WA 3QQ1A 4DO6A 1QOQA 5FF0A 3W1MA 1GQNA 1MZHA 4WXYA 3MWAA 3MP3A 4DO5A 3E12A 3M43A 1SO6A 1W8SA 1I45A 5CPMA 2ISWA 2YFNA 2PE4A 3LRKA 4JD4A 4WD0A 5CSSA 3GDMA 2Y7FA 2X1TA 2ISSA 1WOBA 3TAOA 1TSIA 4UNKA 3QMRA 2O7SA 2ABAA 1R2TA 1ZAHA 5EY5A 5DCDA 1VHNA 3UNDA 3P8IA 3FKKA 3M44A 3GXPA 4TMBA 3NZRA 3D0CA 4Z1DA 1L6SA 2Y7DA 3E9AA 1F74A 3W76A 3HG3A 4K6AA 2A7RA 3U8GA 3L21A 3FS2A 1YXYA 3CIXA 4POCA 3QPYA 3BLIA 2QUUA 3EKLA 3NR0A 4RZ6A 4IMFA 1LRQA 1SZEA 3S9YA 1UJPA 3MJYA 3UWWA 1JUKA 5TIMA 4W9TA 3BO9A 1H1ZA 1XCFA 2WO5A 3N19B 5HWNA 5E93A 4JY8A 3S5ZA 3A5VA 1DL3A 3QF0A 3TQ0A 1H62A 1S3HA 2PCQA 4LVFA 4HNTA 3W7HA 3W84A 3G1FA 1J5TA 1TV8A 3LB0A 1OX5A 3STEA 2Y70A 1W37A 3WK1A 5LNWA 2NX1A 3G8EA 3W86A 4UMCA 1NVMA 2WNQA 1W1ZA 4JYEA 4BK9A 1ME7A 3PULA 4CNOA 2VELA 3M9YA 4GJ1A 3DENA 3LCLA 3CB8A 5FEPA 4JYDA 1VYPX 4O15A 5G4EA 1DHPA 3BARA 4IPJA 2YPIA 4M6PA 3CWNA 4LS0A 3F1QA 2J9YA 5F4SA 5J5DA 1F7BA 1VS1A 4WJEA 5TQLA 1VRDA 4UCGA 5AYXA 3CTLA 3Q2DA 5LSMA 1T99A 4FNTA 2QCDB 4UTIA 4UTMA 4NZJA 2H6RA 3W85A 1WV2A 1THFD 3RLVA 4HNUA 4XQ6A 5D32A 3HMJG 4X22A 5EBUA 2V2CA 1LBLA 3GDRA 5EA9A 3TFXA 5F2MA 2B4GA 4JN6A 4H6KA 1VCFA 4GUJA 2QCLA 4MVAA 1YLVA 4JTHA 2YFOA 4OBTA 5CZJA 2CFFA 5CPOA 4N9DA 1W0MA 3HIJA 5DY3A 1LOLA 3OA3A 1KFLA 4UTUA 3PBYA 1VH7A 1K3UA 4ZL1A 3T7VA 3C4UA 3LOTA 4HSOA 2JK2A 1B4KA 3TXVA 2JKEA 1H7NA 2DZTA 4E2BA 4FB7A 3A9IA 1RQHA 2WNNA 3EXTA 4WY0B 5KZEA 3ABRA 1TPVA 1H7RA 3EWYA 1W5QA 4NQ1A 4MIMA 4JTTA 2BTMA 1TPWA 4X2RA 5FF7A 3G1XA 4RV8A 5AN7A 4NZFA 1QFEA 1YTDA 1JUBA 3TIMA 3KAOA 2EGZA 3RU6A 3L5AA 1W3NA 3B4UA 2A7NA 1DVJA 5G4WA 1SZGA 2E6AA 1H51A 4N9BA 2QUTA 1R47A 3TXZA 3NM1A 3QH2A 2XN1A 5K9DA 5KZMA 1SPQA 1PS9A 3O1NA 3S1XA 2ZRWA 4B5NA 1TPH1 5LHFA 1ZAJA 3QPZA 1XDMA 3EWXA 3M41A 1I2RA 2CZDA 2V8ZA 3H55A 2DZXA 3FYPA 3C2VA 3LM7A 3GDLA 4RZ5A 1XXXA 1LORA 1SFJA 4K38A 4UNLA 2CLKA 2G96A 3HGRA 4N4QA 3W87A 2WSQA 4HNVA 2ZRXA 3I68A 1TPDA 1QDSA 1LLZA 4QIUA 1JQXA 1VCGA 4HNNA 5EYWA 3HPXA 3CQ0A 5D2YA 1G4TA 3GX9A 1G4SA 3DFPA 4BI6A 1DOSA 2AAMA 5FEZA 3KXQA 1ALDA 2ZRZA 5I3JA 2ZCGA 4JX5A 3RF9A 2OMAA 3BW2A 3KVLA 5HR6A 3W7RA 4XKYA 1LBFA 2C0AA 4GXMA 3WJZA 1EP1A 2ZZ1A 3UWYA 1LDCA 3NPWA 2FJKA 3KX6A 2PRLA 3NDOA 4R7JA 3NQCA 1LRTA 1PHQA 1XBZA 2NUXA 1EP2A 2X1SA 3HGSA 3R2GA 4ONVA 3O07A 3B0PA 2QJGA 4JYFA 5F2LA 4K7YA 2GVLA 1TQXA 3SGZA 3NPXA 3CEUA 4EWND 3G1YA 4LWWA 2FLIA 2C13A 3EWBX 4JGDA 5AC8A 3TW7A 3Q94A 2HMCA 2CLIA 1IIHA 1Q6LA 3BV4A 2R94A 3CWOX 2V82A 4TIMA 1OFOA 3L67A 1KV8A 1LBMA 1T8XA 3F03K 3S8HA 4LC6A 2YXGA 5G5IA 1KW1A 3OBKA 2FIQA 2QKFA 2W6RA 1EEPA 1K8XA 3DFSA 1KM6A 1MEWA 2H3DA 3SI9A 3SIZA 3UWVA 1S5WA 2OX1A 3IIXA 3VI2A 4MJMA 3LGEA 1AK5A 4IMEA 2ZTJA 4DPQA 2WOQA 3PB0A 3KFTA 5C5YA 4O12A 4CCEA 2KZHA 2NV2A 1GPWA 3A5FA 1KLYA 5LNVA 1XBVA 3QM3A 2A6NA 1FWSA 2E5CA 1P1XA 1I2PA 1JRBA 3W2KA 2GJLA 3W2NA 3STFA 4LRSA 2GVGA 3NZ1A 5EL1A 5HQEA 2OT0A 1CI1A 3QW3A 5CGQA 1OX6A 3C61A 4RLIA 4JR5A 2HSAA 4JIPA 3LCGA 5F1UA 3P74A 1SU5A 1SO4A 1G4PA 3BG9A 1OK6A 4YL2A 4MLRA 2CLHA 2A4AA 4NX5A 2TPSA 2YGYA 4QQ3A 3PUOA 4JY9A 1DQXA 4LUJA 3IV3A 3PF3A 5DBUA 4IMCA 3IVSA 2A0NA 1GVQA 3W3OA 1QCWA 1VR6A 3S1UA 4MYXA 1RR2A 1GJPA 4JTUA 3W9ZA 8TIMA 4NJIA 3SGUA 4Z1CA 5HULA 2Y7EA 2CLOA 5L6UA 3W1TA 2QCEA 1TPB1 3IGXA 3EX3A 3I7QA 3MI3A 3P80A 5CSRA 2QDHA 3BW4A 1J4EA 2NX3A 4LS2A 1I8JA 1Z48A 1YTEA 3O05A 3QW4B 3TV8A 4RK8A 3PY2A 3UPBA 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3N9RA 4WUIA 4MY8A 4M6QA 3LV5A 1F73A 5FI8A 3G22A 2QJIA 1WDWA 5BW6A 6TIMA 5HUPA 2Y88A 3O15A 1F76A 4FEZA 3R8RA 1M7OA 3CEPA 5D38A 3CU2A 3FJLA 5DXYA 3W7IA 2QAPA 2VFHA 1XFBA 2B7QA 2DZSA 3QZEA 3TQVA 3HOJA 1N8FA 1N55A 5KITA 2V2HA 1ME9A 3QQ0A 4P2VA 3QSTA 1LRNA 3WJSA 3W75A 3V75A 5DXXA 4GNJA 2WNZA 1RD5A 3PSVA 3W88A 3TUUA 2QF7A 1N7KA 1A5CA 3S5OA 3W2JA 3OVQA 1XBXA 1X8FA 4IX2A 3QEZA 3LTPA 2ZA1A 4ZQPA 1L2UA 4UC5A 2AGKA 1A53A 1C9DA 3S5YA 2FB3A 1YXCA 4OU1A 4OHQA 3RNDA 1M5WA 4K36A 1NEYA 1IXQA 3W7KA 3E96A 5G1TA 4EF8A 3LRLA 3NQVA 3LHYA 2Q8ZA 5AYYA 2ZA2A 3C6CA 2R8WA 2FPTA 1YTKA 4LVBA 2FDSA 4LVGA 1R2RA 2JGYA 4M7SA 4BWLA 2YR1A 3L5MA 4YMZA 4EF9A 4M5PA 4N2YA 4N6EA 5K4ZA 2G95A 1U83A 3CM4A 1A5BA 3MUXA 4PA8A 3W1RA 4LS1A 3NYZA 4ZQOA 4A2RA 3TC6A 3W74A 3ELFA 5TBOA 3WJYA 4HPXA 4O13A 1JR1A 4YCOA 3W7EA 1JCLA 2OJPA 3G0SA 3KRUA 3E0IA 3QYQA 4LV9A 3HO8A 3NGJA 3G1SA 3LCIA 4HIBA 5CZSA 5DCEA 3R5EA 3GR8A 3BW3A 5FEXA 3F4NA 1SZFA 1VCVA 3LHWA 4UTTC 1Q3NA 4WOQA 3B04A 2C6QA 5D2WA 3IIZA 1QOPA 4FF7A 3M6YA 4PCFA 4GRSA 1H63A 4LVAA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3G3DA

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Chord Diagram

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