3G3MA

Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase covalently modified by 5-fluoro-6-iodo-ump
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
257
structure length
256
Chain Sequence
KELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-activity relationships of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase inhibitors as anticancer agents.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 97
structure length 256
sequence length 257
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2009-02-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3g3mA00
3FYPA 3CEUA 4LU0A 4ZQNA 3TDFA 4YXGA 2NZLA 4UR7A 2VEKA 3RNDA 1JVNA 3QW3A 3UY7A 4IMFA 5LNWA 3I6RA 1R30A 1X1ZA 1OK6A 3HGRA 3GAKA 3V1PA 3SR7A 3T40A 3ELFA 1WYIA 1EP2A 1D9EA 1QPOA 4CCCA 1TPUA 3U6WA 3HGOA 4O18A 4ICNA 1FCBA 3P67A 2V9DA 4EOUA 2F7FA 1K03A 2DJLA 3C0JA 4PCFA 3RF9A 5K3VA 3HBLA 4QITA 4MPQA 3QFEA 4RLIA 1G6CA 1KM0A 1M5WA 5CZTA 4Z1CA 5D05A 5AHLA 2FDSA 3N19B 2A2IA 3EKLA 2X1RA 1K3UA 3QMSA 3AJXA 1RZMA 5IBXA 1WOBA 1TO3A 1C8VA 4DBEA 2EKCA 3P81A 1PL9A 5LHEA 1I2NA 1Q6QA 3HQ1A 1XFBA 5CPLA 3WK0A 4QSHA 4HHPA 3IRDA 3GX9A 4O52A 4WX2A 1D3GA 4BFAA 3PUEA 3QPZA 4H6KA 1IIGA 4ZMGA 1UASA 3ZFHA 4JD4A 5AYXA 3F1QA 3MP3A 3W7HA 3NEVA 5H2ZA 2A85A 4RKAA 1W54A 3W7MA 1WXJA 2Y85A 1LOSA 4K7VA 3HG2A 4FB7A 1F05A 5HWJA 3M5VA 3W87A 3G0SA 2W0UA 5FI8A 4LUJA 1TPH1 3MHUA 5AHFA 3SJ3A 2QCNA 1M7PA 3DKLA 3UZJA 2GQAA 4Q33A 4LVFA 3G8EA 1NF7A 1QO5A 2A6NA 3NO5A 1XDLA 3V75A 4NUWA 3NDOA 4XTDA 3GR7A 4ZQOA 3NPWA 4OGZA 4RXFA 4D2JA 1AK5A 2Z1BA 1TV5A 3EEGA 5CPNA 3MHGA 4UFIA 4WY0B 3O15A 3RMJA 1GZGA 2H8ZA 1JUEA 4RZ4A 1AL7A 3L9CA 3SZ8A 3L68A 1H1ZA 3NQFA 2FLIA 4IMGA 3L5AA 1MZHA 3LGEA 2I14A 2YYTA 4O1AA 2QCMA 1A5CA 1TREA 4AF0B 5GVJA 2W79A 3BARA 3EX1A 3LLFA 3W1UA 3BLEA 1K7FA 4Z1AA 1XBXA 3TFCA 5D38A 5CZJA 4B5NA 4PEKA 3GB6A 2X2GA 3TU9A 3PG9A 4I7VA 4K6AA 3LXBA 2ZZ1A 1L6WA 4MJZA 5DELA 1UB3A 1EEPA 4JR5A 4OE7A 4S2BA 5L6UA 3FJ6A 2FB2A 1L6SA 3TK7A 3N73A 2V2CA 1TV7A 3CTLA 4N4PA 3NPXA 1KFBA 3VI2A 3UXDA 5K4XA 3NQAA 1I2PA 1DV7A 4JXCA 2C1HA 5I3IA 1A5AA 1G7VA 2Y61A 4LVBA 3GKFA 1JJKA 3SECA 4N9EA 4RK8A 1I45A 3EXRA 3MI2A 5D30A 1H7OA 4UR8A 3NR0A 2Y7FA 4DF0A 1ZAJA 5F2MA 2ZDRA 3LBCA 5CG7A 3DFTA 3S1VA 1TQXA 5EKYA 3EWYA 4JS3A 3GVGA 3WK3A 4CQ8A 1KFJA 2JK2A 1OFRA 5CPOA 3H55A 4BR1A 1ICSA 2C18A 1OK4A 2B7NA 3S8HA 2CLIA 1SO5A 1KA9F 3CC1A 3H53A 2DP3A 1LDCA 3LCXA 4LC8A 1JCXA 3OVRA 1YTKA 3WK2A 4Y9AA 1DJQA 3E0IA 3FEMA 2QJIA 2R14A 4QNWA 3W72A 3TNOA 1OYBA 4N6EA 5TBOA 5C55A 2I9EA 3T44A 3W2MA 3FFSA 1QOPA 4HT3A 5G2IA 1RR2A 5F1UA 3W1XA 1ADOA 2B0MA 3OVPA 2ZZ4A 2CZ5A 4OU1A 4L4MA 5FF0A 3U2OA 4IPJA 3IIXA 1XC4A 1WX0A 4O13A 2BX7A 3NYZA 1H7XA 1O5XA 3SY5A 5HQEA 3MBDA 2YFOA 3W23A 4IWWA 3A23A 1P4CA 1LOQA 1KW1A 5AC7A 3LHZA 1JUBA 2A7NA 1KTCA 1QR7A 4WY0F 4LY8A 1FCQA 2J88A 3RLVA 3DAQA 1GYNA 1EA0A 4LV4A 1FXQA 5SWUA 5AHEA 1R47A 1TPFA 3IVTA 1OX4B 3CIXA 1YPIA 3B4UA 1QOQA 2HMCA 4UTJA 1QWGA 3BLIA 4WOQA 3LTYA 1I8JA 3L65A 5KINA 3LHTA 3W22A 5KMYA 3W83A 5F4XA 5KZDA 4N6FA 2PRHA 2E5CA 1GG1A 2FQIA 5AC8A 2EF9A 5DBTA 1OFQA 4FNUA 1TPEA 4OV4A 4ZQMA 2V5LA 4MY9A 4JTEA 2CZFA 4O14A 5D04C 4H4IA 3THAA 4XZ9A 1GTHA 2WNZA 2BWGA 3STCA 2QJHA 3O16A 3TROA 1LCOA 2J6XA 1F7BA 4JICA 5TQLA 4FNPA 4EF8A 1HO4A 5CZSA 1XXXA 2WJZA 2PC4A 1SQ7A 1FWRA 1H60A 5K2ZA 4MZ1A 2QCFA 3TIMA 5F1VA 3WJWA 2FPYA 3LM7A 4MOZA 2Q3OA 1V5XA 3L0KA 4JYFA 3PWAA 4A29A 4K36A 5MHBA 4JX6A 4LC6A 1KFLA 1OF6A 1Q6OA 5LNSA 2V0TA 3LI0A 1YADA 4O57A 4NU7A 1KTNA 5I3KA 1S5WA 2X30A 3OG3A 2Z6JA 4OWGA 5EY5A 1W5MA 4N9DA 1K8YA 2CW6A 4QNEA 3KX6A 1J4EA 2CLLA 3C4UA 4IMCA 4MVAA 3DFQA 3CEPA 3M5ZA 3R89A 3OVQA 1LBFA 1NFBA 2VEPA 4WY0A 3TJLA 3ABRA 3IIOA 5LGXA 1A50A 2DZPA 3NQVA 3NQMA 4JNMA 3ZR4A 1IXNA 3TX9A 2Y7EA 1VLIA 1OX5A 1L9WA 2RH9A 2ZA2A 4WD0A 4DF2A 2A0NA 3BG9A 4AF0A 4E2BA 4M7SA 1K8XA 1OABA 3M43A 3R13A 4JX5A 4CQAA 2DZTA 3E96A 3PR2A 4NJKA 2QUUA 5HR6A 1FWTA 4U28A 2QCGA 3NA8A 3B0PA 2V30A 1XDMA 1SZFA 1VS1A 3BG3A 3W74A 4UFJA 2Z6IA 4KFNA 2AAMA 1H7PA 1T99A 3P84A 4PTNA 1FQ0A 1H1YA 4AHPA 1TMHA 2E6DA 4DBDA 1TPWA 3GIYA 4WOZA 2ZBTA 2ZRUA 3G22A 3W1NA 5DCDA 5C2XA 1RVGA 4AXKA 1GWJA 3M7WA 3UD6A 2A7PA 4GUIA 3W86A 1B57A 3NL5A 1BEUA 1S5TA 4XBKA 4CNPA 4KWWA 3CQ0A 4JTSA 3TW7A 3HIJA 2AQWA 4AVFA 2R94A 3NVTA 1T96A 5CPMA 1Z42A 3TSBA 1VCFA 4YCPA 4IMEA 3DKJA 3S5ZA 3IGXA 1G67A 3O05A 2RKXA 4GRSA 3C8FA 1CX9A 4X9SA 2NXHA 4UNKA 1QPQA 1ZFJA 4TX9A 3TC7A 4MZ8A 4UTIA 2C3ZA 2Y88A 4UCGA 2VKZG 1FY6A 4JTHA 1SO4A 4O16A 4UUIA 1DOSA 4YLWA 6TIMA 2TYSA 1P1XA 3NQ7A 1SW3A 3LERA 2OX1A 5HJLA 3O07A 3QYQA 3LTPA 4OT7A 1SUXA 3CWOX 1JULA 1H7NA 2QCEA 1EP1A 2OJPA 4CNNA 1FX6A 4TMCA 4O28A 5BMWA 2QF7A 2XN2A 3LCIA 2Y7GA 3TQ0A 3JS3A 3UXAA 3QSRA 4TO8A 5D33A 3MI3A 1PHQA 3HB9A 3IV3A 1XBYA 1EIXA 1ZALA 2NUWA 3P61A 2GPTA 3W1AA 5FEWA 3GXNA 3HO8A 1X6UA 3B8DA 5U7SA 4JTKA 3SSJA 3C61A 2HSAA 1L6YA 1L2UA 3TAKA 1KM2A 1NAL1 4FNRA 4ZQRA 2CLKA 4UFKA 1T0OA 2Z2UA 2ZZ7A 3NQCA 3UY8A 1GEQA 3QQ0A 5K9DA 3I7QA 2VFFA 1ZCOA 3HJZA 3W7RA 1HTIA 3KHJA 2RFGA 2QCDA 3N3MA 1TPVA 3W2UA 4O4VA 2YCEA 4GXMA 4KFOA 2EHHA 4UTWC 1WBHA 2PCQA 4XKYA 3SGUA 2P0OA 1PIIA 4O0KA 4PFMA 4NZFA 2PRMA 4O12A 1Z41A 3C2FA 4PL2A 4FNSA 1WOAA 1DQWA 1M6JA 2ZYFA 3OA3A 2J9XA 3IIZA 5J5RA 5BW6A 3ZS4A 2V82A 4ADTA 3P5YA 3VKJA 2NLIA 3A24A 1OFPA 3OEXA 4LVAA 2JGQA 3ABQA 1XBZA 4UTHA 5EA9A 1Q6RA 5D37A 1LLZA 1ME7A 1J5TA 4JDBA 5BRBA 1IIHA 1QNVA 3W2KA 3BW2A 5F2LA 4O50A 1DVJA 3QSTA 3E12A 5D09A 1W5PA 3WJSA 4NJHA 3DHFA 4GBUA 1DL3A 2PE4A 3LCGA 4AB4A 4X3ZA 1R46A 4NJGA 3UYCA 4X2RA 4Q32A 2FB3A 4MJMA 1W5QA 3NQDA 1KLZA 5CSSA 3QEZA 4NQ1A 1RQEA 3TC6A 2ISVA 4PODA 3NZ1A 2DZXA 1VYSX 2QKFA 5HUOA 3LCHA 4O19A 5DXYA 2B7OA 1VPXA 3ZWTA 2YSWA 4ML9A 2XN1A 2FPTA 2BSLA 3PS7A 3LRMA 2DJXA 2H90A 8TIMA 4O54A 5LNUA 2H8XA 3NXFA 4CNOA 1GYLA 1QPNA 4WZHA 5DCBA 7TIMA 4FX6M 4JTJA 1KM4A 2B7QA 4A2RA 4DPQA 3W1RA 5FF3A 3NM1A 4MLRA 1F76A 3KAOA 4U4MA 2PURA 4FO4A 3QC3A 3EB2A 1K7EA 3P82A 1HL2A 5D32A 3N14A 4UNLA 1DKWA 4NT0A 3IVSA 1OYCA 4K8HA 3PC0A 4NVTA 1RD5A 3JRKA 2WQPA 3IGSA 3M44A 3FS2A 3MP4A 3W7DA 3Q94A 2C16A 3HOJA 2WKJA 4HSNA 4WQ6A 1VZWA 5I3JA 3NOEA 3OBKA 1GVQA 3R12A 1TRDA 2NV2A 1QO2A 3E49A 2Q3RA 3EX2A 2Y70A 2V8ZA 3G1VA 4O4WA 3RK8A 3W73A 3QMRA 5D2WA 4FXRA 2V2DA 2ZFAA 2ZRYA 1LYXA 2NUYA 1UCWA 5G2HA 4YWIA 3QM3A 3L0GA 1G4PA 3EX4A 1DQXA 5A5WA 3NQGA 2GQ9A 3W7EA 3SW6A 3NM3A 3GYEA 3BGGA 5A8GA 4Y8FA 5LZLA 3STGA 2H3BA 3D0CA 4L4LA 3EXTA 2ZQ0A 1F74A 4AH7A 3MP5A 5DXXA 2X1TA 4RZ5A 3H54A 2Q8ZA 4WUIA 1EB3A 1F2JA 1OVDA 2YFNA 1AG1O 3L67A 3GDLA 4LVDA 3NGJA 3A21A 1EWDA 3N2XA 1Q6LA 3NL2A 3LI1A 3EXSA 2CLEA 3O6DA 1VGAA 4Y96A 1DORA 3NAVA 4BK9A 4NX0A 2WSRA 3EWXA 2J9YA 3W70A 2ATMA 3HF3A 3PUDA 3M41A 2CWNA 2X1UA 1YTDA 3TR2A 4LTSA 3C2RA 4A22A 4K7YA 4FIQA 2ZZ2A 2E6FA 4ORMA 2E6YA 3FA5A 3E9AA 3I7RA 2YW3A 2C14A 1EX5A 3DI1A 1ME8A 3STEA 1O4UA 1HO1A 3A22A 4LWWA 3UWUA 4IJBA 3ZWSA 3W7NA 1W56A 5F4WA 4BF9A 4RX0A 3MHFA 4JDYA 4HPXA 3LRKA 4LRTA 4AWUA 3E02A 1JRBA 3MO7A 3CIWA 2XN0A 4ZVJA 1C29A 4N9BA 4Y90A 5EBUA 2ATSA 3KVKA 3CM4A 1GJPA 5E0KA 3W75A 3P62A 3K30A 4DO4A 4FNQA 1EUNA 2HTMA 2X1SA 4FIRA 2JKAA 1YDOA 2BXVA 2RDUA 1H5YA 1T8XA 2A4AA 4UTTC 1G4SA 1XI3A 5CZ0A 1ICPA 3FKKA 3DFOA 3NZRA 1FDZA 2R8WA 4CLMA 3MBFA 4KWVA 3WJZA 1SR9A 2VEMA 3FKRA 4O1BA 3T7VA 4LRSA 4DXVA 3TFXA 3F4NA 4HIBA 5IBXC 1IGSA 1MEIA 2Y6ZA 4GNJA 3GXPA 2TMDA 3KRUA 3LHYA 4UFMA 3YPIA 4WJEA 4K8EA 2PRLA 3T78A 5AOUA 2O7QA 1RPXA 3WJXA 1X7FA 4E2DA 3GNDA 4JTGA 1G7UA 3G18A 3LB0A 1YPFA 1RQHA 4YMZA 1UJPA 3BW3A 4LVGA 4IXHA 4LW7A 3MI6A 2JGYA 3TXZA 4MFDA 1JR1A 2WV8A 4JTFA 3EWUA 1JCJA 4LUIA 2YDAA 5J5DA 3L66A 5D2TA 3KFTA 4ONVA 3WK1A 4RXGA 3A5FA 4TU1A 1KTBA 1D3HA 1MEWA 3GDKA 1GG0A 3VNDA 2H3DA 4R7JA 3S6DA 1KV8A 1GTEA 3DBPA 4DO5A 3HPSA 5G5IA 3QRHA 2E5DA 3PSVA 1IXQA 3EX6A 4YCOA 5FEPA 5LSMA 3GAYA 4Q4KA 5DLCA 4JX4A 2ZRXA 5AHIA 4IMDA 3UWZA 1TTIA 3HPXA 3VCRA 1FCVA 5D03A 1GT8A 4LT9A 2B4GA 5FEXA 4JY9A 2VFEA 1TQJA 1H7RA 4HKPA 3ATZA 4AWTA 1B3OA 3R2GA 3O1NA 1P0NA 4NX5A 4GUHA 4P2VA 2DZSA 3A9IA 3JR2A 3PBVA 1N7KA 5AYZA 1XUUA 3O63A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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