3G8EA

Crystal structure of rattus norvegicus visfatin/pbef/nampt in complex with an fk866-based inhibitor
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
475
structure length
463
Chain Sequence
FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYREHFQDDVFNERGWNYILEKYDGHLPIEVKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGIALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTEAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLDILGKKFPVSENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKKWSIENVSFGSGGALLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGVNVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGTFVTLEEGKGDLEEYGHDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEVRKNAQLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of Rattus norvegicus Visfatin/PBEF/Nampt in complex with an FK866-based inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
total genus 132
structure length 463
sequence length 475
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2009-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3g8eA02
1B57A 1LDCA 5EKYA 1MO0A 3FKRA 5G4EA 3W7OA 1F6KA 5A5WA 4GBUA 4M7SA 5CSRA 1A5CA 4JY9A 3FKKA 5AYZA 3W7PA 2E6AA 3IVTA 8TIMA 1YXCA 1NVMA 3EX4A 2CLMA 4ZQPA 1YTDA 2QF7A 3EWZA 1MEIA 4NNAA 2CZEA 3PVFA 3S8HA 4NQ1A 3UWUA 3GDLA 4TIMA 2YYTA 2PRMA 3BGGA 1W37A 1EUNA 4JDBA 2RFGA 2BXVA 2GUUA 3W1UA 1OK4A 3QMRA 4TR9A 1HUVA 2NZLA 3IIZA 1JUBA 3W7GA 2FPTA 2EGZA 3G0XA 2H6RA 4LU0A 2QCNA 4N2YA 4AHPA 3ZFHA 2CLIA 2VEMA 3W7MA 2C18A 2VFFA 3KRUA 3PWAA 2ZRYA 3W87A 3E12A 4PA8A 4MVAA 1CI1A 1H60A 4O10A 3KX6A 3KAOA 3PBWA 3OVPA 1FXQA 4LVAA 3HIJA 2FFCA 3FYOA 4KFOA 3WK2A 3LB0A 4N4PA 3GDKA 4GFSA 3TW6A 2VEIA 2AGKA 3DI1A 1R2TA 2VXNA 3LLDA 3I7QA 1SZFA 4CLMA 3NA8A 3B0UX 1XDMA 4JTLA 4AAJA 1TTPA 3D0CA 4N9CA 3TIMA 1ZY9A 3BW2A 4JTTA 4FF7A 3GKAA 1XUUA 2DJXA 3GXNA 4NVTA 3TE9A 3O1NA 5I3FA 1R47A 1T8XA 1ZFJA 1QPOA 3K30A 1FXPA 4P61A 4EF9A 5G2WA 1H50A 4A21A 3QQ1A 1VJIA 1R30A 4AWUA 4RR4A 4CQAA 3TAOA 4KWWA 2VOMA 1TPWA 1L6WA 5K9DA 4WY0F 4ZMGA 5G4WA 4XBKA 4UTMA 3HPSA 4UCGA 1W5QA 3RMJA 4W9TA 1JCXA 5HR6A 2BSLA 5D02A 3B05A 4AH7A 3HG2A 3M43A 1X6UA 3BGJA 1ZAIA 2WSYA 3PS7A 1NF7A 4G1KA 3TUUA 1O60A 1JJKA 3CEUA 2A1YA 1A50A 3G1XA 5F2IA 3C4UA 3W74A 3W7EA 4FNRA 3LI1A 1X1ZA 5FESA 3IV3A 5IBXC 3KHJA 4GUJA 5EL1A 5FEZA 1WDWA 3KOFA 3LX9A 4ZQNA 4A29A 1VZWA 1ME8A 5CPLA 3W75A 3NEVA 3ELFA 4JTIA 1DOSA 1H5YA 2CLHA 5F4WA 3T44A 3TFCA 2GVGA 1AMKA 4QISA 5C55A 1H7XA 1QPNA 2NXIA 3MHGA 2A7PA 6ALDA 3O07A 3W2JA 3GK0A 1VR6A 3O16A 4DO5A 2ABAA 1W3IA 1QMLA 4O13A 1W3TA 3C2RA 2ZBTA 4FX7A 1K7XA 4RKAA 4HNUA 4JY8A 3TC6A 3W7JA 3G1DA 4FX6M 2NV2A 4P2VA 1RQEA 1KM4A 4UFJA 5FEXA 4ZQCA 3G22A 4WJEA 3TQ0A 5DELA 1K02A 1UBSA 5E93A 4X9SA 1I2RA 1JCYA 2FDSA 2QUVA 2VFDA 4BR1A 3LCWA 1XCFA 3W7CA 4A2SA 2A6LA 5G5IA 4MYXA 5AHFA 3DKLA 2TSYA 1AW5A 2HS8A 5DY3A 1U5JA 1WA3A 3SGUA 4BI7A 4I9AA 3PG8A 2YR1A 2AAMA 2A21A 4OU1A 2G96A 4O1CA 1SSDA 2XN1A 3PULA 4IWWA 3UXDA 3QMSA 1RR2A 3O6YX 3F03K 2ZDRA 4WY0B 4EWND 2CU0A 2FPYA 3ANYA 3MHUA 5EBUA 5HWNA 2YSWA 3GNNA 2V81A 1ADOA 3S6DA 1F73A 3H53A 2ZRXA 3LHZA 3N9RA 3W3OA 2J9YA 3G1VA 1A53A 4HIBA 5HWJA 2VFEA 3L0KA 4HPJA 3MYOA 1TPEA 5D30A 3SECA 3ZR4A 1TSIA 4JGDA 2NV1A 4O0KA 2Q8LA 4QAIA 1W0MA 3W1PA 1AK5A 3V75A 2CZ5A 3PUEA 1KM5A 2Y61A 3S5OA 3ABQA 4NUWA 4JTJA 2E6FA 3NQ8A 4QNEA 1PE1A 3ZS4A 4IQLA 3KXQA 1QCWA 1FWWA 1SSGA 4PCFA 4UNKA 1XUZA 3U6WA 1GPWA 3B0PA 1K8XA 2GVLA 3EX2A 3I7SA 4BWLA 3R89A 3L2IA 3PF3A 4UTLA 2J88A 2C15A 2E5CA 3W1RA 1GTEA 3OHIA 2VFHA 4H6KA 2Y63A 5AHEA 3C52A 2NX1A 3MI6A 4L4MA 3CC1A 5FEPA 3IVSA 2A2IA 3HBLA 1VYRA 5CPNA 1LBLA 3A9IA 1Y0EA 1TV5A 2YPIA 5FI8A 1F5ZA 4KWVA 4KFNA 1P0KA 2DZVA 1I2OA 2ZQ0A 5DLCA 5K4XA 3A5VA 3FA5A 4N6EA 2YX0A 3F1QA 4DBDA 3NYZA 1DBTA 2QR6A 2QCGA 1VGAA 2DORA 2CLKA 4O1AA 3ATZA 3TV8A 2J6XA 3DFOA 4N9DA 1J5TA 3STCA 2Z6JA 3BG3A 3OVRA 1P5BA 2JKPA 3PSWA 3QPYA 4Z0JA 2C6QA 3TU9A 1OABA 4WXYA 1LOQA 5AHMA 2NXGA 4ORIA 4K6AA 2W79A 3UPBA 3HGOA 1UUMA 2PE4A 5F1VA 1YADA 3RNDA 3GAKA 4MFEA 3TX9A 1TPUA 2QDHA 3VFLA 5F2LA 1YTEA 2YZRA 2VEKA 1GG1A 1PL9A 1ZAHA 4IPIA 2GPTA 3FOKA 4WX2A 1S3HA 2RDTA 4AMAA 5H91A 1IIGA 2AQWA 4ZL1A 4OHQA 1KFJA 4MY9A 3HG5A 1V7YA 4IMCA 4X3ZA 2Z1BA 4UUIA 1OFDA 3R8RA 2G97A 5D38A 3BV4A 4AF0B 5TBOA 4O17A 2FIQA 1L9WA 3LCGA 4XUGA 3LCIA 4JYDA 4JX4A 3GDRA 4PTNA 2ZCGA 1EUAA 5D2WA 4O1BA 3GR7A 3NQEA 1AW2A 4JTSA 2CLOA 4Q4KA 2Q3RA 3G1SA 3OG3A 1LORA 2ZRUA 4IUOA 4RZ5A 3R12A 1TO3A 4K7VA 1FCVA 5KSWA 3W1MA 4MJZA 3UD6A 4TMBA 5KITA 4JTEA 6TIMA 1PVNA 2GQAA 3IIOA 2Z0IA 2BX7A 3RFAA 3SY5A 5FEWA 3QSTA 4FIQA 4LVDA 3A5FA 3S5YA 4JN6A 4QNWA 2GJNA 3W1LA 5BMXA 4LOCA 3TK7A 1TV8A 2G95A 4NX5A 4Z0SA 2OMAA 1FDJA 3CEPA 3B06A 5F1UA 3TSBA 3DBPA 2E68A 3LRLA 3MP5A 2V2CA 3UWYA 3WK1A 1LRTA 5AN7A 2X1TA 4N6FA 1QWGA 3P61A 3TW7A 1GJPA 4K7YA 3NL5A 2NUXA 3H55A 1QFEA 2JGYA 1B4KA 1RVGA 5H2ZA 3LCLA 5G2IA 1J2WA 1W5OA 3S1VA 2JGQA 3G8EA 4BF9A 2GJLA 4UR7A 3IIVA 3LRMA 3CLMA 1ZHAA 2ISVA 3NXFA 3EWYA 3GKFA 5I3JA 1FQ0A 5KTLA 2VENA 2HMCA 3QF0A 2Y7DA 1OFAA 4B5NA 2DZSA 1UASA 1Q45A 4NJHA 3ZWTA 1OFBA 3NVTA 3THAA 1IXPA 4JNMA 2C3ZA 1V5XA 4Z08A 1YPFA 4MZ1A 4O14A 4KKXA 4AB4A 3G3MA 2PURA 3MMTA 3P81A 3UZ5A 5K3VA 5EMUA 3KFTA 1KBIA 4GJ1A 1QNVA 1TTQA 1Q3NA 3KVMA 4IJBA 1ZJIA 1C29A 4XKYA 3EWWA 1SZEA 1TMHA 1DVJA 3BVJA 3FIGA 2ZFAA 3P8IA 1NFBA 1UUOA 3LXBA 3P7YA 3Q58A 1JCMP 3KVJA 1VCFA 4X2RA 4PODA 3UQNA 1XL9A 3STEA 4JS3A 3EWBX 3L66A 3NQCA 3QM3A 4O19A 2TMDA 2QCDA 3I6RA 4UXDA 2FB3A 4IOTA 4DPQA 2Y7EA 3MBFA 3NQDA 5D32A 1OJXA 2O7SA 3RLVA 3BPWA 3AO0A 1ML1A 2DZWA 4XTIA 2YCEA 4YXGA 3THQA 1Q6OA 2A4AA 5MHBA 3P5ZA 1VCGA 5D2XA 1VS1A 2OZ0A 1M7OA 3E49A 4UTIA 4K39A 1ZNNA 3USBA 4O57A 3NG3A 4JD4A 1PHWA 3P8JA 1OX4A 4UTWC 1O5XA 3STFA 3DFTA 1ZALA 5GVJA 4ADTA 3O05A 2BTMA 4Q33A 2WNQA 1NAL1 1Q6LA 5T26A 3LV5A 4O1DA 3MO7A 4DELA 4O15A 3EXTA 3WJXA 5DXYA 5HWMA 3CIWA 1KV5A 1HG3A 1LYXA 3FJLA 5C6MA 4IPJA 4PC8A 3N73A 3N34A 3EX3A 3UYCA 1K8YA 1C9DA 1EP1A 5K7JA 4LNYA 4XQ6A 1FWRA 3C6CA 4AVFA 4NNBA 1G4TA 2V2DA 4UMBA 5DY2A 2QEZA 3Q2DA 3VCRA 1A5AA 2V9DA 5D03A 1G4SA 3DFSA 1H7PA 2VFIA 3S5NA 1PCWA 2WOQA 4A22A 1LOSA 4I7VA 3ZWSA 1GTHA 1DORA 3IEBA 2PRHA 4WUIA 2VFGA 4CCCA 1IXQA 2FTPA 5E0KA 1TPH1 4UC5A 2CZDA 1LLZA 1ICSA 2E77A 5FF3A 1JULA 3WJYA 4JEQA 1TREA 1W5PA 3G8RA 4MPQA 5D09A 3HF3A 3QYQA 3G1HA 2RHGA 3B03A 1OFPA 1PS9A 1ICQA 4BK9A 1DKWA 3IIPA 1SU5A 1QOPA 4WOZA 5D05A 2C1HA 2JKAA 1RD5A 1HO4A 2OJPA 1KLZA 4Y96A 1Q6RA 4EOUA 1M5WA 3TFXA 3LBCA 5AC7A 3IGXA 2E6DA 4JX6A 2WV8A 1BWKA 3P84A 3W1QA 2HSAA 3LDVA 3V1PA 2ZA3A 1FWTA 3GB6A 3PG9A 4FEZA 2ZZ5A 3SSJA 2BWGA 1O95A 3M9YA 3SIZA 2CLLA 3QW4B 4HSNA 4OBTA 3WJWA 1JRCA 3W23A 3W9ZA 1EB3A 5F4XA 3GXTA 5HUOA 4LUIA 1LRQA 1O5KA 2V0TA 4I7UA 3BLIA 5K9XA 4A2RA 2YW3A 4MKNA 3LHTA 1GEQA 2ZZ1A 3S1XA 4CNOA 1YXYA 4MLRA 4BI6A 3LLFA 3W22A 3KRSA 3P74A 1HFBA 1AL8A 3IGSA 3W7LA 2RKXA 1G4EA 2EKCA 3PR2A 1ICPA 3NO5A 2CW6A 4UTHA 5DBUA 2XN0A 5G1TA 1LBFA 4JYFA 3M1ZA 3FYPA 1XM3A 1Z44A 1YDVA 1ZCOA 3EXRA 4O18A 4U28A 3HGJA 2H8XA 1IXOA 2P1FA 3G0SA 3DI0A 3IVUA 3P5YA 3YPIA 4YCPA 1KM1A 1EP2A 3BLEA 5HR7A 2DZUA 1VQTA 4IX0A 1T96A 4JXCA 4Y6GA 4M6VA 2F7FA 1TTJA 1QDSA 3ABSA 1JCLA 2B7PA 4QJ1A 3G0UA 3NAVA 1P1XA 3HQ1A 3PY2A 1SW7A 2Y70A 3OA3A 2O7QA 4LY8A 4AWSA 4Z1AA 1WV2A 5A8GA 4M7TA 2CFFA 2H3DA 3N2XA 1TPC1 4WQ6A 2WO5A 3NQVA 4LVFA 3R5EA 2E5BA 3OBKA 4ICNA 4FHAA 1SFLA 2BZNA 5KZDA 1IXNA 4JDYA 4DO6A 2QAPA 7TIMA 1EWEA 3U8GA 2E6YA 1M7PA 1H51A 5C2XA 1GZGA 3O8AA 1F05A 3W72A 3QSRA 1G6CA 1W3NA 2Y88A 1BTMA 5LNRA 1FX6A 4NT0A 5KINA 2B7QA 4K37A 2R14A 2H90A 4WXZA 3I65A 2H8ZA 3W1AA 5DCEA 4GUGA 3NQAA 2WQPA 3E02A 4OGZA 3M5YA 2V8ZA 1VPXA 3DENA 5CG7A 3SZ8A 4CQ9A 3W7IA 2EF9A 2ALDA 4GUIA 4HKPA 3UPWA 3Q37A 3M0ZA 4UTKA 3MWAA 3W7NA 1S5TA 3SR7A 4GUFA 1WYIA 4C1LA 1A5BA 1TTIA 1XXXA 4R53A 5FF2A 2V82A 2WSRA 3MUXA 2FLIA 2A0NA 2QCCA 3DHDA 3GDTA 5AYYA 3O63A 1LTDA 3EKLA 1IF2A 2FPVA 2C0AA 3A22A 4D2JA 1IIHA 4AHOA 3W86A 1BWLA 3O6DA 5HNRA 4ZQOA 3WK0A 3UWVA 2J9XA 4DPPA 3EX6A 1LLWA 3LHYA 2QUUA 4GRSA 1Q6QA 1XBYA 3B4UA 1TV7A 2V30A 5HQEA 4RV8A 1VCVA 2QUTA 3TH6A 3PUDA 4IXHA 4QSHA 2YXGA 3W7KA 1J4EA 3UWQA 1EA0A 3STGA 3DGRA 3L68A 1W5NA 5TQLA 1SW0A 2ZZ4A 3LM7A 4DF1A 3T7VA 3DH7A 4UFLA 4UIOA 4XKYB 1ME9A 3PB2A 1ZENA 1F7BA 2J27A 3G24A 3PBUA 3LV6A 1GYNA 4CCDA 3M44A 5L6UA 5AOUA 1C8VA 1O94A 3M16A 3G18A 1IGSA 4JTFA 5LSMA 3N9SA 5IBXA 1OFEA 3TJLA 2A5HA 2C16A 3JR2A 3LXCA 4UTUA 1W56A 4O53A 4LV4A 4QITA 1F76A 1GG0A 4MOZA 3TSMA 4MJMA 1K7FA 1WQ5A 4K36A 5EA9A 1QAPA 2ISSA 2F84A 2OX1A 1Z42A 3EWXA 4ONVA 3W7QA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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