3GYEA

Didydroorotate dehydrogenase from leishmania major
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
312
structure length
299
Chain Sequence
MSLQVNLLNNTFANPFMNAAGVMCTTTEELVAMTESASGSLVSKSCTPALREGNPTPRYQALPLGSINSMGLPNNGFDFYLAYAAEQHDYGKKPLFLSMSGLSMRENVEMCKRLAAVATEKGVILELNLDFDAMRQCLTAVSEVYPHSFGVKMPPYFDFAHFDAAAEILNEFPKVQFITCINSIGNGLVIDAETESVVIKPKQGFGGLGGRYVLPTALANINAFYRRCPGKLIFGCGGVYTGEDAFLHVLAGASMVQVGTALQEEGPSIFERLTSELLGVMAKKRYQTLDEFRGKVRTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Leishmania major Dihydroorotate dehydrogenase
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase, putative
molecule tags Oxidoreductase
source organism Leishmania major
total genus 105
structure length 299
sequence length 312
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.3.1: Transferred entry: 1.3.98.1.
pdb deposition date 2009-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3gyeA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3gyeA01
3W71A 2DP3A 1QOQA 3Q37A 2BZNA 2ISWA 1O5XA 3IGUA 3WK0A 3E0IA 1KW1A 2E6YA 4K6AA 2A1YA 4N6FA 1ZAIA 4LVFA 2FJKA 2X2GA 1QPQA 3P67A 5CKSA 3UWYA 1IIHA 2PRMA 3HIJA 2EHHA 3DFNA 2WNNA 1C8VA 1S5TA 3LRKA 2HS6A 1KM6A 1V5XA 4WY0F 1TB3A 4H3DA 2NV2A 5EA9A 2JKPA 4WZHA 3EXRA 2FB3A 4HKPA 3UY7A 3DBPA 4YCPA 1IIGA 4TIMA 3BV4A 1DQWA 1XKYA 3HB9A 3UWZA 3RMJA 5DY2A 2ISVA 2CU0A 3SR7A 3RFAA 1TSIA 4UTTC 1RPXA 3E02A 4FX7A 3INPA 1QNVA 3SECA 3UPBA 3IVSA 1XM3A 1LRQA 3L0NA 2C13A 2Y63A 3WK3A 2P10A 1KM1A 3G18A 3T44A 3LCXA 1K8XA 3G8EA 5G1TA 3G1FA 3IIOA 2VEMA 4O4VA 1CI1A 3QYQA 3M1ZA 4ICNA 3HPSA 4AWUA 3ZFHA 4FF7A 4ZQPA 2RDWA 3QQ1A 3A5VA 5FF7A 4Y90A 2ISSA 3A22A 3HGRA 5AC7A 4XQ6A 1Q6RA 5CZSA 1TPB1 4MLJA 3LLFA 1OX5A 5F2MA 3ABOA 1IXOA 1Z42A 3G1AA 2CZ5A 4YCOA 3LTYA 3W2JA 4UFJA 4UTWA 5G1YA 4FNPA 3MMTA 3PVFA 4N9CA 2ZZ5A 4Y9AA 1IGSA 1SR9A 1RQHA 3EXTA 5LKYA 3N73A 5BOOA 4JY9A 1U83A 3DFOA 3N3MA 4O4WA 2Z1BA 4FNTA 1KV8A 2OMAA 1P4CA 2B7QA 1LCOA 2JKAA 2TYSA 3PB2A 4X22A 3NQCA 1KTNA 1JJKA 4MIMA 3EKLA 1W5MA 3SJ3A 1P1XA 5F1VA 4K39A 4FX8A 3O1NA 3LCFA 5FF4A 1W3TA 4O13A 3CHVA 1EWDA 4AWTA 3GLCA 2Y61A 1Z48A 1HO1A 1W5PA 2C0AA 1PE1A 3O6YX 3MW7A 3LGEA 4GE8A 4WJEA 1OG0A 4MLRA 4PTNA 1JCLA 1ME8A 1N8FA 4FNSA 1YDVA 5KTLA 3C8FA 2PRLA 3F03K 2Y7EA 3TSDA 4PCFA 1VLIA 5DY3A 2I9EA 2QDGA 4NJKA 3LTSA 4H6KA 5AB3A 1RZMA 3NEVA 5AHLA 5E0KA 5D03A 4OU1A 5D30A 4NXKA 3B4UA 5U7SA 2WSYA 1VRDA 4GUJA 3BG3A 5HUOA 4XBSA 2HSAA 4I7UA 4IUOA 1SZNA 4Z1AA 4HPJA 2V2HA 3TNOA 5DLCA 4FX6M 3CPRA 1OK6A 1QDSA 4AF0B 4UMCA 4JTUA 1QPRA 1YPIA 4BWLA 1SO3A 4BF9A 3O06A 5D32A 1XDMA 3FJ6A 4UXDA 4I9AA 4PL2A 3U6WA 1QCWA 1VR6A 5TBOA 1TYGA 4WY0B 5FF0A 4O14A 1H60A 1KLZA 3DHDA 1O94A 4Q33A 4UTJA 5KMYA 2BWGA 1HTIA 3JRKA 3TDFA 3UYCA 4MYAA 4A21A 5K9XA 3B8DA 5CSSA 4S2CA 2OT0A 2X16A 4LVDA 2XN2A 3BLFA 4B5NA 3W7RA 3W70A 4LTSA 4HN4A 1ONRA 1LZOA 1RR2A 4P61A 1K8YA 1VCFA 4XTDA 3FYOA 5I3HA 3S1VA 3MHFA 5HWJA 3G1SA 1ZCOA 3PAJA 3I68A 1ZENA 2VELA 1UUMA 1CW2A 5G5IA 1OFEA 3QSTA 5IBXC 3C61A 1D9EA 3S1UA 3C3NA 2W6RA 3IVUA 3SW6A 1WXJA 3NM1A 3GR8A 4ZZ9A 4DELA 3S5YA 1WX0A 3ATZA 5K9DA 3RK8A 4WXYA 3W7KA 3LHTA 5HNRA 1WQ5A 4TR9A 1TPH1 5FEZA 4IPIA 3W83A 1EP1A 3EWYA 2GQAA 1UUOA 3EWWA 1TTIA 3IRDA 2PC4A 4U28A 1SQ7A 5C54A 1F7BA 1KM5A 1WOBA 1HUVA 4JIPA 3MI2A 2C3ZA 1GWJA 1ZNNA 4EOUA 1KM0A 4NX5A 3EX6A 3BLIA 2I14A 1VQTA 4O28A 5HR6A 2VENA 1WOAA 3NL5A 4O53A 3BLEA 2YCEA 4JTLA 3CLMA 5CPMA 5F4WA 1A5AA 3N19B 1DL3A 3LHZA 1FDZA 3C0JA 3O6DA 4K37A 3HMJG 4RZ6A 3NQMA 3DKLA 2OZ0A 4N02A 5LZLA 2H8ZA 1FUYA 3TSMA 4DQWA 2H6RA 3LV5A 5T26A 3YPIA 1PIIA 1NVMA 3GKFA 4UNKA 3GNDA 4GUIA 1SU5A 1PV8A 5HULA 2PE4A 5D2YA 3L21A 3A5FA 4LVBA 2Z6JA 3Q2DA 2GVGA 3TC6A 4IMDA 2H3DA 1TPC1 2WJZA 1H50A 2B7NA 4K7VA 1EP3A 2J6XA 1SW3A 3NPWA 1QFEA 4UFMA 3UWUA 3JR2A 4AH7A 3GDTA 3PC0A 3O16A 1M6JA 1LORA 2VFDA 1FCVA 2J9XA 3W9ZA 3NZ1A 2WPBA 3TJXA 4TX9A 3QMSA 4UTKA 1MXSA 2Y6ZA 1I8JA 5FF3A 1XUUA 3DFTA 5DN1A 2ZZ1A 5BMXA 2A6NA 1L9WA 3VNDA 3QSRA 3CU2A 2RHGA 4FO4A 5DCBA 1KLYA 3HGJA 5C55A 3IIPA 3LM7A 4BK9A 1IXNA 3BK0A 2BLEA 1YPFA 5LGZA 1DBTA 3U8GA 5FESA 3BO9A 4PH6A 1FWRA 3NPXA 4I7VA 3OHIA 2NWSA 3UNDA 2ZRZA 3N9RA 2FTPA 2V9DA 2VKZG 4IMGA 2QJHA 1OFRA 4AAJA 8TIMA 3C2RA 4JNMA 3NYZA 4UCGA 4DPPA 2Y62A 1JCYA 1B9BA 1SZGA 4O15A 2HS8A 1SPQA 5D05A 4RX0A 5AYXA 2CLFA 2YW4A 2DZPA 4NXSA 3B06A 3QM3A 1I4NA 3MBFA 4O1AA 2ZYFA 4HSNA 3W7PA 3ATYA 4RZ5A 3GXNA 3TFCA 2GJLA 5DXXA 2A85A 1VS1A 5CZ0A 1PCKA 3W86A 2BSLA 4KWVA 3TR2A 5C2XA 1GYNA 3MI6A 2E1DA 2TRSA 1TQXA 3O63A 1F76A 1GTEA 2HTMA 4LC8A 3CEUA 4RCXA 1XCFA 1G4PA 1OYBA 3W2LA 4BI7A 3LHVA 1KFCA 3STFA 1GYLA 3G8RA 2NWRA 3PBVA 5EPDA 1SZFA 1FX6A 4GFSA 4ADUA 4WX2A 1N55A 1MO0A 2YDAA 2OT1A 5I3FA 2X30A 4UC5A 2ABAA 3IIXA 2VEPA 4UFKA 2ALDA 1XUZA 3O6CA 1OF6A 3TQKA 5L6UA 3M5VA 1WYIA 1JCJA 2VEIA 3NNTA 1TPFA 5A5WA 4ZVJA 2J27A 2ZRWA 3DHFA 4N4PA 1VH7A 4RKAA 3S6DA 1KTCA 4RLIA 1L6SA 4ZQRA 2CLKA 3UY8A 3NQ6A 4LW7A 1GVSA 3WK2A 3EKZA 3VKJA 4L4MA 1GTHA 3DGRA 3QW4B 1OYAA 2QAPA 3LV6A 5LNWA 2Y88A 5F4XA 1B4KA 2VOMA 3A23A 4RJEA 3IIVA 1AW2A 1W5NA 1OF8A 1T8XA 2O7QA 4Y96A 3NQVA 4PODA 4OBTA 4JYFA 4YMZA 3T40A 3PSWA 3M44A 3QQ0A 3BGGA 3LHUA 3HGOA 1VYPX 2QR6A 2X1SA 1OHLA 3NZRA 1F05A 3C4UA 3CC1A 3QH2A 3TV8A 3L5MA 3ABSA 3C2VA 4I7WA 3LBCA 4UTUA 3W76A 1P5BA 4UFIA 5LGXA 1BTMA 1EX5A 3NQFA 3BW4A 2F84A 1OX4B 3EWZA 3T7VA 2V82A 3GYEA 4DF1A 3EWBX 2Q3OA 5CPNA 3TCEA 2VFFA 1SFLA 4UTIA 3KVLA 5DXYA 1LLZA 5C6MA 1BEUA 3UQNA 4XTIA 1CX9A 1TPUA 1SW7A 1KTBA 1JCMP 4O1BA 2Q3RA 4UR7A 1S3HA 3SGZA 3I7QA 2Y7GA 4JTSA 4M19A 5CG7A 1DHPA 1LRTA 1QAPA 4AXKA 4HHPA 5K9CA 1TCDA 2QF7A 2YR1A 4EVZA 4YXGA 3ZS4A 2JBMA 4KFNA 3RF9A 2V0TA 4JX4A 1WV2A 1H62A 2WNQA 1P0NA 1TO3A 1J4EA 3NQAA 4WD0A 1DKWA 5HMSA 3S1XA 2RH9A 1SFJA 1A5SA 3LOTA 4MFDA 3W74A 5K4XA 4Y8FA 1VYSX 5F2LA 1G67A 2NX3A 2V5LA 4JTKA 3TXVA 3G22A 3MYPA 5HWNA 1W8SA 4R53A 4GRSA 3NG3A 3L2IA 3TH6A 1XBYA 1GPWA 1YXDA 3GAYA 1KFJA 3W7IA 1JCXA 5I3JA 1SSGA 2DU2A 3F4WA 2GQ8A 1C29A 1H63A 1GVQA 2YZRA 2GUUA 2E6DA 4DO5A 4UTTA 3CIXA 3NGJA 3FA5A 3M5YA 2EGZA 2EAWA 4HT3A 3H53A 3BG9A 4E0CA 3P8IA 3HG5A 3UD6A 3ANYA 2QCMA 4Z1BA 1TTQA 5HJLA 3EX2A 1QPOA 4OV4A 4DPQA 3PM6A 3FKKA 2QCDA 5D2TA 4JTTA 3NA8A 4BR1A 3NAVA 3W7CA 1LP6A 4LRSA 4DF2A 5TIMA 2ZZ2A 3W7HA 3HQ1A 1YYAA 4KWWA 1HFBA 1O95A 2BXVA 1IF2A 2GQ9A 2B0MA 2Y7FA 2B4GA 4BI6A 4WOQA 2FPVA 3P60A 3P80A 2ZRVA 2C15A 4WOZA 3LX9A 2H3BA 3W3OA 2VFIA 1FWTA 3KXQA 3M43A 3R8RA 1GVRA 1UCWA 4CQ8A 3SZ8A 2CW6A 3W73A 3TA6A 5DCEA 2QCHA 2JKEA 3EX4A 3W1UA 1HL2A 1T96A 3PBUA 4FHAA 2YGYA 4JIQA 1TTJA 1XBZA 3W7LA 1XDLA 4LOCA 3S5OA 4HNTA 2VEKA 1K7EA 3OVPA 3HF3A 4ZQOA 5KSWA 1MEHA 3P84A 4IX0A 4O10A 3LRMA 5AC8A 3W75A 2FIQA 4WQ6A 1YADA 1A53A 3QW3A 3I7RA 3GNNA 3L0GA 3M9YA 1Q6OA 3L67A 3PUEA 1ADOA 1KA9F 1M7PA 3L68A 5A8GA 2WNZA 4JTHA 4A3UA 2UV8G 3CIWA 3W7OA 1FY6A 2NXIA 2CFFA 3QEZA 4ALDA 1LBMA 2A2IA 1JUKA 4JTIA 4JEQA 3O05A 4PFMA 4IQLA 4A29A 1G4EA 4IWWA 5GVJA 5AHNA 5CZTA 1XL9A 3TX9A 4PA8A 2FPTA 3RU6A 1WDWA 3EEGA 3OVQA 1XBVA 5J5DA 4TO8A 1W3IA 4BI5A 1R2SA 1TREA 3PR2A 2R14A 1MZHA 2RKXA 4O16A 1O4UA 2TPSA 1JRCA 1H1YA 3OG3A 6TIMA 3G1VA 3G1HA 3P8JA 4N4QA 4E2BA 4N9DA 3HPZA 3W7NA 1I2RA 3UXAA 3CTLA 3GAKA 4UIOA 3S0CA 4FEZA 5DBUA 2IQTA 1KV5A 3S5NA 2NV1A 5FEWA 2G96A 4CQAA 1F6KA 4YLWA 1H51A 1FDJA 3MYOA 4RZ4A 1HG3A 1FDYA 1I2OA 4RXFA 1SSDA 1VCVA 4LV9A 3C2OA 2ZZ3A 2FFCA 1K3UA 1X7FA 4NZFA 3P61A 4QM1A 2NUWA 3E96A 4C1KA 3P5YA 1Q3NA 1X6UA 2B7PA 2E09A 3QMTA 4MKNA 1J2WA 2ZBTA 2QDHA 3PUOA 1OABA 1QPNA 3PG8A 1XC4A 1JUEA 1LYXA 4S1FA 1LROA 2XN1A 4JTGA 4O50A 2QJGA 5IBXA 3C56A 1JQXA 5AHMA 2QEZA 3TW7A 3TROA 5D33A 2Z6IA 3TAOA 4QSHA 2E6AA 1GVFA 1UASA 2YSWA 4IMCA 2WOQA 1W31A 3NO5A 1Z41A 2CLMA 4TMBA 1OX6A 2ABBA 3KRZA 1H7XA 4UR8A 4JXCA 2CWNA 3TW6A 3I7SA 3IEBA 3G3DA 3FOKA 3AJXA 3L66A 3CQ0A 1X1OA 4O1DA 1TJPA 2CLLA 1UJPA 1LBFA 4KFPA 4LS0A 4Q32A 1NF7A 2XFWA 4O54A 3GIYA 1O60A 3TQ0A 3LCGA 4IMFA 1KFBA 1L6YA 2A7NA 3NL6A 3T78A 3BPWA 4FNQA 1GVOA 3L5LA 4IX2A 4WUIA 3PB0A 5AC6A 3FFSA 4O1CA 4O18A 3HBLA 2QCFA 5HUPA 2YPIA 3HGSA 3T55A 5D2XA 3MWAA 4GUFA 1K7FA 1A5BA 3E12A 2DZUA 4Y6GA 3W7JA 1PVNA 4HNVA 1VYRA 4Z1DA 3PBWA 2FQIA 1FXQA 3T4CA 1RQBA 2Y89A 1XFBA 3ABQA 3GX9A 1TIMA 2VC6A 1FWNA 1BKSA 1PCWA 1SZEA 2I1OA 4M6QA 2J24A 2EKCA 3PWAA 3C6CA 5K4ZA 3C2FA 5AHEA 3N2MA 3KX6A 4DBDA 3DAQA 3P82A 4OQVA 5ABTA 1NFBA 3MI3A 3STEA 4K7YA 5U4NA 4O0KA 4XKYA 4AVFA 3V1PA 1TTPA 4GUHA 5CPOA 1TV5A 3SFKA 4GXMA 5LNSA 1TPEA 1H7WA 3DXIA 1QO2A 1G7VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3FN9 A;  3N4F A;  4HB7 A;  1NJJ A;  1E0U A;  2ISW A;  2WMK A;  3R1Z A;  3E0I A;  4FK9 A;  3ONB A;  5CKS A;  3WQW A;  1V8E A;  1DTU A;  3IS4 A;  1GKP A;  2WNN A;  1BQC A;  1QBA A;  3LRK A;  1V5X A;  1A0D A;  4JTA A;  3PZM A;  2NV2 A;  5EA9 A;  1J93 A;  1XIC A;  2JKP A;  3IAQ A;  4WZH A;  3THD A;  3GFZ A;  1Z3N A;  3CYJ A;  3UY7 A;  1U1H A;  3DBP A;  2NQL A;  1XKY A;  2AL1 A;  2ISV A;  3AIW A;  1TR9 A;  4HSH A;  4UTT C;  4PMZ A;  2PP3 A;  3HU7 A;  1M03 A;  1M3U A;  3L0N A;  3CUJ A;  3TZF A;  1VB9 A;  1NOF A;  3V16 A;  4GVF A;  1CLX A;  1DWH M;  3T44 A;  3LCX A;  5G1T A;  3G1F A;  1DJZ A;  3IIO A;  5PTD A;  1MNZ A;  4UOJ A;  4O4V A;  4ICN A;  4M1B A;  1QNP A;  2GJX B;  3B8I A;  3PZV A;  1KCZ A;  3VNM A;  2P8C A;  4DN1 A;  5CXP A;  3A22 A;  4DUX A;  3HGR A;  4HYR A;  5HOS A;  1NP2 A;  4XQ6 A;  5CZS A;  5D9P A;  4HBK A;  1QK2 A;  2CZ5 A;  3LTY A;  1NM9 A;  1QI4 A;  3I4K A;  1JYW A;  3AML A;  2XJ7 A;  1ZJA A;  3IK2 A;  2WB5 A;  2ZZ5 A;  3SUR A;  2XVP A;  4ATD A;  2AOS A;  3N73 A;  5BOO A;  2OFJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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