3HPX | Genus

Total Genus 148

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	148
sequence length	407
structure length	407
Chain Sequence	IVKPAGPPRVGQPSWNPQRASSMPVNRYRPFAEEVEPIRLRNRTWPDRVIDRAPLWCAVDLRDGNQALIDPMSPARKRRMFDLLVRMGYKEIEVGFPSASQTDFDFVREIIEQGAIPDDVTIQVLTQCRPELIERTFQACSGAPRAIVHFYNSTSILQRRVVFRANRAEVQAIATDGARKCVEQAAKYPGTQWRFEYSPESYTGTELEYAKQVCDAVGEVIAPTPERPIIFNLPATVEMTTPNVYADSIEWMSRNLANRESVILSLHPHNDRGTAVAAAELGFAAGADRIEGCLFGNGERTGNVCLVTLGLNLFSRGVDPQIDFSNIDEIRRTVEYCNQLPVHERHPYGGDLVYTAFSGSHQDAINKGLDAMKLDADAADCDVDDMLWQVPYLPIDPRDVGRTYEAV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Removal of the C-terminal regulatory domain of alpha-isopropylmalate synthase disrupts functional substrate binding pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-isopropylmalate synthase
molecule tags	Transferase
source organism	Mycobacterium tuberculosis
total genus	148
structure length	407
sequence length	407
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.3.3.13: 2-isopropylmalate synthase.
pdb deposition date	2009-06-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00682	HMGL-like	HMGL-like

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3hpxA01

3M1ZA 3O6YX 1FBAA 3DH7A 1XBYA 2OZ0A 1BWLA 1YXCA 3H55A 4MFEA 4PA8A 3MW7A 3TW6A 4ORIA 5G1YA 4OWGA 1SZGA 3VKJA 1HUVA 3FLUA 3G1VA 3FA5A 2X2GA 4XQ6A 3G0XA 1ZAJA 1RR2A 2A7PA 3C0JA 4O1AA 2RFGA 1I2QA 3NPWA 1I2RA 4FXRA 3W2UA 4UUIA 3I6RA 1LOSA 3B0UX 1SO4A 1DJQA 1SZEA 3CEUA 3EKLA 1B9BA 4O1CA 3TMQA 1TYGA 2JK2A 3C3NA 1V5XA 5F4WA 3LTSA 4FIRA 3O07A 5AN7A 3ZWTA 3SFKA 4DPQA 4M5PA 1Z42A 2YCEA 5E1QA 4WUIA 2VFIA 2RDTA 5DCEA 1H7RA 2Y7DA 3EKZA 3BGJA 4NXSA 3ANYA 5CPNA 3SGZA 4NJGA 2ZYFA 3W86A 3LHZA 4UFIA 3HG5A 2VEMA 3MHGA 3EX6A 1L6YA 1F5ZA 2VFHA 3L2IA 1G6CA 3DFTA 4ALDA 2YYTA 2TSYA 2CU0A 4L4MA 3RF9A 2V30A 1OFEA 1EPXA 3GYEA 1XCFA 3M5YA 1LP6A 2FQIA 1H7OA 4O12A 1P1XA 2C18A 4UTHA 3TAKA 3QF0A 2E5DA 3TJLA 3TX9A 3G8RA 2ZZ1A 5TQLA 3W7KA 4WY0F 3GNNA 5HWNA 3NNTA 3LLDA 1X1ZA 1VGAA 3HPXA 4UNLA 3UWZA 2O7SA 3L5LA 1LLWA 4JICA 3BO9A 3TC7A 3NM1A 3QQ1A 4U4MA 2ZZ2A 4MIMA 4TMCA 4WXZA 2OCZA 4LVFA 4TO8A 4MYXA 4KWVA 2NZLA 1K8YA 5I3IA 1FXPA 3UD6A 3TXVA 1ZY9A 2ALDA 4EF8A 3DHFA 3QZEA 3LHWA 2UV8G 4ZVJA 4WZHA 4JX4A 1OF6A 2QCNA 3CM4A 3NM3A 5LGZA 4MLRA 1C29A 4JN6A 3EWBX 4JEQA 1OX6A 4M6PA 3I7QA 2A2IA 4JXCA 5CG7A 4GE8A 1ZHAA 1KFJA 4BI6A 2CLMA 1W54A 1M7OA 2NXGA 5U7SA 4JD4A 4O4VA 3ZFHA 1KW1A 1S5WA 5F4XA 3LHVA 2E6DA 3R5EA 1ME9A 1ME8A 1PV8A 2FPTA 4NJKA 2OT0A 5L6UA 4DBDA 1J4EA 3W1QA 1WOBA 5K9DA 2Q8ZA 5K9CA 1BEUA 4IOTA 4S2BA 4O10A 4I9AA 3G3MA 3INPA 3W7PA 1IGSA 5BMXA 2H8ZA 1LRNA 1G4SA 3M6YA 1PIIA 2H6RA 1K8ZA 3KXQA 4UIOA 5D38A 3N14A 2QJIA 2FFCA 1KA9F 5CKSA 1QCWA 4P2VA 3FJ6A 3OG3A 4MZ8A 1X8FA 1R46A 1PS9A 4LVAA 4L4LA 4WXYA 2J9ZA 3Q94A 1F6KA 2QUUA 3B4UA 1R2SA 2BX7A 2ZA1A 3G1YA 3WJZA 3GAKA 1KM2A 5LHFA 4UTUA 3W71A 3DZ1A 3KVLA 3MBFA 3OIXA 5E93A 1YPFA 1JR1A 5EBUA 4M7SA 3GXPA 3M47A 1AW5A 3NL2A 3MP4A 4NJIA 4FNUA 1GQNA 2H90A 4XBSA 4BI5A 2P0OA 4MLJA 5D32A 2OJPA 5LNWA 2P1FA 4AVFA 1W3TA 5TBOA 3T55A 1VR6A 4WX2A 2VFGA 3YPIA 4FB7A 3ATYA 2ZZ5A 3T44A 4DF2A 3EWXA 3QEZA 5K7JA 1VHCA 3C2OA 3PB2A 3NL5A 4O8RA 2TPSA 5FF4A 1W37A 1SFJA 3TAOA 3L21A 1W3IA 1EUAA 1RVGA 2Y7GA 1TB3A 3LGEA 1SZFA 2E1DA 5EMUA 4E2DA 4CNPA 1O60A 1FUYA 1XBVA 4MJMA 1TTIA 2CW6A 1I2OA 3IVTA 3UZJA 1EB3A 4DBEA 2A5HA 2GJLA 1DBTA 1GYLA 4N9DA 3W1MA 1X7FA 1YDVA 4FX8A 4BK9A 1DORA 1TPVA 1Q6LA 3NQVA 4Z0SA 4TMBA 3M43A 3BV4A 3FKRA 1OFAA 1VC4A 2QUTA 5AHLA 4RK8A 3LXAA 4FHAA 3DGRA 2DZPA 4QAIA 2A0NA 5D2WA 4FEZA 4NVTA 1QPRA 5D2VA 1UCWA 2ZTJA 1O5KA 5H91A 5AHEA 1JRBA 3GDRA 1GJPA 2VOMA 1MEHA 2VC6A 3LB0A 5H2ZA 4P61A 4Y8FA 3TXZA 2V2CA 1CW2A 1UUOA 1KV8A 3LCXA 2ZA2A 3G1AA 4KFOA 3W72A 2AAMA 4XKYB 1ME7A 4J9JA 3STGA 2CLEA 4TX9A 2DZSA 3IIZA 4MY8A 1PVNA 1TV7A 3F1QA 3NQGA 2V82A 4UFMA 3FJLA 2RKXA 3S0CA 1GWJA 1XDMA 1SW0A 4K7VA 5G2HA 3GX9A 4RV8A 4E38A 3NQDA 1FDYA 3IIXA 1ZALA 4MY1A 3ZWSA 1TPB1 1JUEA 1RPXA 4LC8A 1EP3A 2FPYA 3E02A 4JTUA 4ZMGA 4UMAA 5CPMA 4MFDA 3QFEA 1WV2A 3LCFA 3W2JA 1TRIA 2YX0A 5HR6A 4O15A 3BPWA 3P67A 1IF2A 2A85A 4CQ8A 5HJLA 3NVTA 3QPYA 1AW2A 3C2VA 5AHMA 4AHQA 2BWGA 3QH2A 3MI2A 4JYEA 1TSIA 1EIXA 3W7GA 3C2FA 1TQXA 3NQAA 4UMCA 3L5AA 3PM6A 1UUMA 1YDNA 3BG5A 4PL1A 4X2RA 4GBUA 1JULA 1IIGA 2X1UA 3JS3A 4AF0B 2DZXA 2OT1A 1EEPA 1WDWA 3NDOA 4HN4A 2YPIA 2H3DA 3W7RA 1ML1A 3MJYA 4O50A 3UXDA 4DXVA 4LOCA 4Y9AA 3N9RA 5D2YA 3M7WA 5LNUA 2V9DA 3UWUA 2QCEA 3MI3A 1KFBA 5F1UA 5CPLA 1OF8A 4AXKA 4EWND 5G4WA 4QISA 3DI1A 3O1NA 4N9EA 2RHGA 2ZZ4A 1K02A 1ZENA 3FOKA 4LS0A 4BWLA 3P5ZA 1A5SA 3TQ0A 4PH6A 1LCOA 1VRDA 3BK0A 1FXQA 3L5MA 1OK6A 4Q32A 1W5OA 1GZGA 1ZFJA 1SU5A 2ZTKA 1FDZA 3HGRA 3AJXA 4IQLA 3W7IA 3PG8A 4DO4A 1VZWA 1FX6A 3GDKA 2QJGA 3TNOA 4IX0A 4IGHA 1F6PA 2Y70A 2A6NA 4XWUA 3WJXA 1SUXA 4JTTA 4XKYA 2J6XA 1NEYA 2FB2A 3B0PA 3GAYA 1SFLA 5I3KA 1GVFA 2F84A 1RZMA 3S1UA 3U6WA 4IUOA 1X6UA 3OEXA 4Z1DA 3CB8A 1T96A 1OG0A 3DFOA 4MOZA 3S42A 1GYNA 2CZFA 2QCDB 4JR5A 3THAA 3VFLA 3W2NA 4AHPA 1KTBA 1U83A 3O6DA 4Z0JA 1Z41A 3W7MA 8TIMA 4N02A 2LLEA 3IIPA 1DQWA 4UTWC 2FDSA 3GK0A 3USBA 3MHFA 1LRTA 4Z1AA 4JX5A 4IMFA 5EPDA 2WSQA 1FY6A 1YLVA 2ZZ7A 2C13A 1K8XA 1L2UA 2DORA 3B8DA 4M6VA 5F2LA 3TFXA 3TUUA 1R30A 4M7TA 3W73A 4KKXA 5KSWA 4S2CA 1VYPX 5HULA 2QCMA 3D0CA 2J24A 2YGYA 2NUYA 3L67A 5HQEA 3G8EA 3B0VC 3G1HA 4GUIA 1P0KA 5HMSA 4QSHA 5AC8A 4OBTA 4AF0A 2RDUA 1IXPA 3UWQA 3I65A 1PE1A 3PVFA 2I1OA 2QCGA 4I7UA 1SO5A 3U2OA 4O57A 4LRSA 1GVRA 4A2SA 1VPXA 3QW3A 3W7CA 4E2BA 1H7XA 1U5JA 3TU9A 1H50A 1TTJA 2VEIA 4QNWA 4UMBA 2Q8LA 5BRBA 1F2JA 4DF0A 2QF7A 3BLFA 1EX5A 3PY2A 4FNSA 5AOUA 3TSDA 1Y0EA 1QPNA 1AW1A 2G96A 2BZNA 3GDLA 4OHQA 1WAUA 2G95A 4O18A 4WOZA 3VE7A 4N9BA 3W1PA 1SW3A 4RXGA 4YCOA 3PS7A 1HO4A 3KOFA 3NL6A 2D73A 4Y6GA 5A5WA 2Y63A 5BNKA 4GUHA 1LTDA 1OX5A 3M5XA 1WYIA 3JRKA 3E9AA 2CLHA 5HNRA 4OGZA 2QDHA 3W7JA 5I3GA 1V7YA 4RZ6A 4HNVA 4R53A 4HPXA 4NT0A 1B4KA 4TU1A 5G2IA 2X1SA 1NVMA 5CPOA 5DCDA 4C1KA 3TIMA 3W22A 3GKFA 1O95A 3ELFA 4UNKA 1T99A 3C2EA 2W6RA 1K03A 1KM3A 1EP2A 1TJPA 2VFEA 4WJEA 2Y7FA 2ISVA 1Q3NA 2QCDA 3N34A 2C19A 5D05A 3W84A 3LRLA 3NO5A 3GIYA 4O17A 3HPSA 2YW4A 1LOLA 3MWAA 5EA9A 4BWLC 4EF9A 1W5PA 2YFNA 3FFSA 4JTIA 3N73A 4GFSA 1H1ZA 3HF3A 4JYFA 2WNQA 3EX3A 3Q2DA 4O54A 3BW2A 3GNDA 5CSSA 3EXSA 1UJPA 1Q6OA 5I3FA 5AFDA 3G22A 1M6JA 5I3HA 2A1YA 4OU1A 2R94A 1OVDA 1OHLA 4NZJA 2V2DA 2P10A 1ICSA 2FLIA 1SPQA 2VFFA 3G1FA 1GVQA 1WA3A 4JDYA 3O8AA 5K4XA 3NPUA 4UTIA 1LBFA 2HMCA 4CQAA 4UTMA 4GC4A 1FWSA 3W1UA 3W70A 3OVQA 3LRMA 1TTPA 3O63A 4CNOA 4TR9A 1MSSA 4QIUA 1G4TA 5C2XA 1OFOA 2NV1A 1GTHA 5AHFA 1DQXA 3UWVA 1AL7A 3TFCA 3PC0A 2B7QA 1FWRA 3NG3A 1GPWA 2YZRA 3PSVA 3NXFA 1TPC1 1JCLA 1QWGA 4YXGA 1ADOA 4Z1BA 3STEA 4PTNA 4FNQA 3LM7A 4ZQOA 4A3UA 1TREA 3IVUA 3G1DA 1PHQA 3IRDA 3IEBA 3FKKA 1P4CA 1MEIA 3IGSA 3CU2A 1GEQA 1P0NA 3E0IA 3L9CA 3VE9A 4AWTA 4KFNA 4Y90A 1IIHA 1AL8A 1YXDA 3CTLA 1W8SA 3ABRA 3W1NA 3PUOA 3GDTA 1KBJA 3IIOA 3HGSA 4IX2A 1GTEA 1HL2A 4NUWA 2OX1A 1GOXA 1YPIA 2Y6ZA 4DEFA 1LBLA 2V8ZA 2V2HA 4IJBA 3TDFA 3IIVA 4S1FA 2Y88A 3WJWA 1FWNA 2ZZ3A 3DFQA 1MXSA 1O94A 1VCVA 4GRSA 1VH7A 3CC1A 3PBYA 4UR7A 1Q6RA 3HBLA 4PL2A 1R2RA 3PSWA 2XN0A 1DL3A 3QMTA 1QFEA 3K30A 3A5VA 2VFDA 3I7RA 3DKJA 1WBHA 1TPWA 1XFBA 4Z08A 3WK0A 4FNPA 4NZFA 3H54A 2QCLA 3LCHA 1YTKA 3C6CA 4K6AA 5LNSA 4NU7A 4UFLA 2E09A 1OJXA 3S8HA 3MUXA 3M16A 3UNDA 1FQ0A 1H61A 2HS8A 2CLKA 3WK3A 2C3ZA 4A29A 2PE4A 5L9FA 3B03A 3NQ6A 1W5MA 2DZUA 3TE9A 1LYXA 1DJNA 3O05A 2VEPA 1SO6A 3N2XA 4EVZA 1JUBA 2CLOA 1F76A 2ZDRA 3NAVA 3NOEA 1OYBA 3NZRA 3R89A 3KVKA 3QPZA 2IQTA 2NX3A 5D33A 4ZQRA 1OFDA 3PBUA 5G1TA 1I2PA 2CZEA 3W74A 3N19B 1K7EA 4HKPA 3TJXA 3W6YA 4FO4A 3H53A 4KFPA 2TYSA 3UY7A 3G18A 4JDBA 2PRHA 1G7UA 3PB0A 2J9YA 1HTIA 3LXBA 4IWWA 3KRSA 5DXXA 3W7DA 1KFEA 2H3BA 5FF7A 1FCBA 2JKEA 1ICPA 2ISSA 1W56A 3G0UA 2WO5A 3SGUA 2GUUA 3MO7A 4DF1A 3LERA 4IPJA 1DHPA 1LBMA 4GUFA 5F4SA 4DO5A 4IMDA 1RQEA 1VQTA 3BW3A 1NSJA 3NQ7A 5K4ZA 3W2MA 3LHTA 1BTMA 3AO0A 3NL3A 4HHPA 1G4EA 5EY5A 3DAQA 1IXNA 1QMLA 2EPHA 2ZA3A 4UTWA 4N9CA 3RNDA 3BLEA 1OK4A 4UFJA 4GUJA 3THQA 4NQ1A 4CCDA 2ABAA 2YDAA 4FXSA 1TPH1 1QDSA 4IXHA 1UB3A 3S6DA 3LDVA 3EWZA 3I68A 3TQVA 1DV7A 3VNDA 6TIMA 3HIJA 1YYAA 4LVGA 4EIVA 2EHHA 2B0MA 3TH6A 4XTDA 4JYDA 3TKFA 4XUGA 3W7EA 1RQBA 1ZAIA 4RZ5A 4FX6M 2PCQA 1OYCA 3SSJA 3UQNA 4YLWA 2CLFA 3NQ2A 3LRKA 1EWEA 4JNMA 2CFFA 3C2RA 4ZQPA 3LXCA 4B5NA 1UBSA 1XUUA 1XM3A 3EX4A 2J9XA 3BG9A 2ATSA 2GQ9A 3T4CA 2ZRUA 1OX4B 5HWJA 1HFBA 1W3NA 2QAPA 1QO5A 3CHVA 4WY0B 4CQ9A 1KTCA 3E12A 3A5FA 4LW7A 3PULA 3UZ5A 1LROA 3LV6A 4K36A 3GXNA 3W7HA 4UTKA 3HJZA 2DJXA 5DBTA 6ALDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3HPXA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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