3HV8A

Crystal structure of fimx eal domain from pseudomonas aeruginosa bound to c-di-gmp
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
247
structure length
242
Chain Sequence
GDVIAILQQALETNSFRLLFQPVISLRGDSHENYEVLLRLLNPQGQEVPPAEFLHAAKEAGLAEKIDRWVILNSIKLLAEHQTKLFVHLSSASLQDPGLLPWLGVALKAARLPPESLVFQISEADATSYLKQAKQLTQGLATLHCQAAISQFGCSLNPFNALKHLTVQFIKIDGSFVQDLNQVENQEILKGLIAELHEQQKLSIVPFVESASVLATLWQAGATYIQGYYLQGPSQAMDYDFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Pseudomonas aeruginosa pao1
publication title Structural analysis of the GGDEF-EAL domain-containing c-di-GMP receptor FimX.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein FimX
total genus 80
structure length 242
sequence length 247
ec nomenclature ec 3.1.4.52: Cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase.
pdb deposition date 2009-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00563 EAL EAL domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.450 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel EAL domain 3hv8A00
4AG0A 4Y8EA 4FOJA 4AFYA 4RNJA 4F3HA 4RNFA 5MF5A 3U2EA 4HJFA 3GG1A 3HV8A 4J40A 2W27A 3GG0A 3GFXA 3PJUA 4ES4A 4FOUA 4KIEA 4RNIA 4Y9OA 4F48A 5MKGB 4LYKA 3PJWA 4Y9NA 4HU3A 4RNHA 3PFMA 4FOKA 3TLQA 3N3TA 3GFYA 3PJXA 5M1TA 3HV9A 3S83A 4Y9PA 4HU4A 4Y9MA 3GFZA 3PJTA 2R6OA 4LJ3A 3SY8A 3KZPA 5MKGA 4Q6JA 2BASA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2LLEA 5CLTA 1TTJA 2VEPA 4FF5A 1OGSA 1M6JA 3DHDA 1OK6A 1UH4A 4DJFA 4IPNB 5HWMA 4KCUA 4AVNA 2NQJA 3OP2A 1GVSA 2CWXA 1MYRA 1Q45A 4FNQA 1LBFA 1HT6A 1RP8A 3QY8A 2YA2A 3UZWA 3AYTA 3PBGA 1XG3A 1XWYA 2Y89A 3EWXA 4Q22A 3QEZA 4TVUA 3RF9A 4Q7NA 1E9LA 3H2NA 2J78A 1J6PA 2D22A 2AAMA 1Y5XA 2BASA 2PDIA 3GW3A 3CHFA 3G24A 4JYDA 1QPOA 1XLKA 3GW0A 3SRKA 4MIMA 4IG2A 4PUJA 3UG5A 3WQ6A 1CW2A 4M6VA 1V51A 3SI9A 4HHPA 3WDPP 2VVNA 3MUIA 3OYXA 2HJPA 1ZAJA 5G4HC 1HL2A 2GJLA 4NAFA 1J0HA 4NKCA 1ODZA 1F73A 3UJEA 3DG3A 1AA1B 1WXYA 4V2XA 1KLYA 4Q4QA 4FLOA 3SB0A 2E5BA 3VIPA 2DIJA 1I2PA 3NURA 1XG4A 3FA3A 3MO4A 4RXGA 4PRWA 1J5SA 3S6TA 1ADDA 3LXBA 1TPDA 3VKAA 1FCUA 2BVTA 1KFWA 1A5NC 1TX2A 1XCXA 1YNYA 1OQFA 4E0CA 1BVWA 1ONWA 3QRHA 2A3LA 4RW5A 4M24A 1OZQA 5CGTA 1UR2A 4FR6A 4NRRA 3PHAA 1CNVA 1AZ2A 4GGBA 3CM4A 1XDLA 3E96A 3FIGA 1NDWA 3N29A 1XLAA 3HFTA 2J9ZA 1Z7AA 1JUEA 2VX5A 2ZRVA 1VRXA 3CQIA 4O4WA 3P7YA 1U5JA 3DI0A 3LM7A 3XIMA 2J25A 4MKVA 1WBJA 3IUHA 5FI8A 3CC1A 1P6CA 2WAGA 2Z27A 3CAQA 3MP5A 3WEOA 2Z00A 2YW3A 5A8OA 3VE7A 4FR1A 2YL6A 3ORWA 1K77A 5DF0A 3THQA 3IGHX 2E8YA 3LYEA 1WAUA 3DBPA 4JR5A 4WK9A 5LYRA 1EOKA 2IPFA 2ZE0A 3UT0A 4CQ9A 1XDMA 3WUFA 1DOSA 3WQDA 3LB0A 2XG9A 4JTRA 3TONA 5D2WA 4MY9A 2VKZG 3LCFA 4JHOA 3DKLA 4C1NA 4H9VA 2ZRXA 3UG4A 5CZKA 2HISA 2J6VA 4NG3A 1H60A 4O4VA 5I6SA 1A0CA 1ICQA 2W6RA 3AICA 3L5LA 4ROPA 2ON3A 2FGLA 3LK6A 1GG0A 1M53A 2X1IA 2QIWA 4OHQA 4XAFA 3AFBA 2PP3A 3TTSA 4XZHA 4GG9A 4AWSA 3KRUA 3NVDA 1XD1A 4PTXA 3F03K 2OEMA 1YEYA 4IGNA 3H24A 4HD5A 4EOUA 2ZZ2A 5FJRA 1UQZA 3WK1A 2JALA 4GABA 3SFKA 4AWUA 3S42A 4GKTA 4HVXA 1F8IA 3GXMA 5LGXA 1RY0A 2GVYA 3H2AA 3VDBA 2YCKX 3SY5A 2Q02A 3QPYA 3KLKA 1Z42A 2V3GA 1TPH1 2QCDA 1OX4A 1BXCA 4KWUA 1OX5A 4CCEA 1HJSA 2VL4A 3B8TA 5DLCA 1DP0A 1IZKA 3QOMA 3MKCA 4ZOBA 1FXPA 3LCLA 3GR8A 2J66A 1FKXA 1OFEA 2DZSA 1E4NA 2GQ3A 4TTGA 1JCYA 2XVNA 3TXVA 5C2XA 4ATLA 2ZZ4A 1B3WA 3PWAA 2ZXQA 2HNHA 4D1JA 1E6RA 1MSSA 2JE8A 3KTSA 5D37A 4GXPA 4TX9A 3KLLA 3P82A 2C91A 4HSNA 3PZGA 1HP4A 3I4EA 4ICCX 2VGFA 4BA0A 4FEZA 4NJKA 1EKOA 1OSEA 2OOGA 5C0QA 3NZQA 2J7BA 1BLIA 5CZTA 3AXMA 4RW3A 5FL0A 3PZQA 4LQ1A 5BYWA 5HULA 2FZBA 3RRXA 1PV8A 4J3ZA 3T42A 5TBOA 1JPHA 4NRSA 4RNHA 4E3TA 2GWNA 4IFRA 4IMGA 1PL9A 4Z1DA 4O54A 4J7RA 2JKEA 3W83A 1B2YA 1B4KA 4DX3A 2D0FA 3LGDA 4TO8A 5D32A 3FA5A 4MNLA 2YFNA 3EBVA 5B80A 2XFWA 3DZ1A 4B2DD 1XXXA 2DIKA 1N7KA 1NOUA 1J0JA 4O13A 3P0XA 1PTAA 3W7EA 1DKWA 4L4OA 3S1WA 3WD4A 1F4AA 3O0FA 1Q6LA 2F6XA 3N9SA 3TC6A 4F79A 1OCNA 4DJEC 1B57A 2XZ7A 2YCIX 5AYZA 4UBPC 4J3XA 1E9ZB 5LZLA 1J9YA 4JFUA 4UNKA 5BXTA 3P67A 5D04C 4M8UA 1XIGA 4N7QA 1E6PA 3S1VA 3LG3A 5H2ZA 2DU2A 4MG4A 2XH7A 1A5KC 5E70A 2OLSA 2VCBA 1XYZA 5GQBA 2WV8A 3I7SA 1V0MA 1PB0A 2QDDA 4GVHA 2C3ZA 2REQA 4KF1A 4AWTA 4DYEA 3BLDA 3WEZA 5HUPA 3S46A 4Y9OA 3AMDA 5KTLA 3KUMA 4WSKA 5I02A 4FP1A 4M6QA 1W5OA 2AOSA 3CTTA 3NQ6A 1B3OA 5M03A 3QC0A 4PL2A 5EFFA 1EZWA 2FIQA 5D9PA 4DM1A 3EMCA 2J24A 5AOUA 2BNJA 5BRBA 3TQ0A 4QEEA 3TQVA 1RD6A 4AZBA 5E5CA 2FH8A 3MDUA 4W85A 4DJED 1G7UA 3CH9A 2V30A 1I0BA 4AD0A 5IDIA 3O6DA 1XIMA 1RA0A 3VKKA 4HPJA 3S5NA 3UQNA 4C5YA 4MKNA 2FJUB 3CZKA 3QQ0A 4YTTA 5LNRA 5F1UA 2FMNA 1K7EA 3B40A 2NVCA 1RQEA 5K3VA 4GUGA 2BY0A 2OO6A 4HHLA 4NJIA 1P0EA 4UUIA 3RMEA 2W91A 2E7FA 3ARPA 1BQGA 2PDQA 2ZX6A 3SQSA 1BTCA 1L6YA 3QVQA 4BR1A 4GLEA 1DJZA 1FRBA 1S39A 2VDHA 1IV8A 2JF7A 3MV01 3QXBA 2GVJA 1V3KA 4TIMA 2X42A 3EPNA 4LUYA 5K4XA 3TZFA 3POHA 1FA2A 2WCAA 3T0AA 3ANYA 1K9EA 3NYDA 3M5ZA 3CHCA 4XG1A 2ZCGA 4O10A 1E6SM 1BSIA 1QK0A 2WKJA 4MDPA 5DCEA 3AU2A 3N25A 3B9NA 4WCJA 2HVOA 3OPSA 4NXKA 3ATZA 2A2IA 1MNSA 4WGHA 1W3KA 5E6ZA 3TMQA 4ZB5A 3VIFA 4XO7A 4JCMA 1KXVA 3K8LA 4D6IA 1NIUA 4NJHA 3PB2A 1JFHA 4M6PA 4I9MA 1VFLA 3E74A 3TYEA 2VC6A 4EAMA 1W3JA 4NAEB 1E1FA 3N6HA 1PKNA 3ES8A 3KBVA 1WDWA 3L0KA 3VCNA 1S2UA 2VZOA 3HQNA 2ESCA 4LUIA 3V16A 3RLVA 2XFFA 3NL5A 3TA9A 5K4ZA 1F6PA 2TSYA 4Y8EA 3W86A 3NFUA 4D6CA 2CZVA 2A79A 1ZNNA 3WNNA 1FWCC 2Y7DA 2ZX5A 1GVYA 4UMAA 3RN6A 3ZLHA 1LQAA 2QNEA 1EJSC 2V5CA 3W70A 2VENA 4QXIA 4ICMA 3N12A 1QXLA 4S3KA 4ZTXA 2Z29A 4JEQA 1OFDA 4I8DA 3JU2A 1LOLA 2WMIB 2VQUA 1DJXA 3TX9A 1CGYA 1UJPA 2PZNA 1XIEA 2VX7A 3TFXA 3TR9A 3PC0A 5G1TA 5E6YA 3UCQA 3WQCA 5C70A 2E68A 1TRIA 3GC4A 4F2UA 4Z0JA 2BXZA 1F74A 6XIAA 2V69A 2QPUA 4L6DA 4LS0A 3HGSA 5FEWA 4CVWA 4IIEA 1LL4A 2ISVA 1YYAA 5C5YA 2C1HA 5A95A 3A13A 3AXXA 1XRSA 4BK9A 3GKFA 4ZTYA 1ITCA 4W4QA 3LPGA 1SJDA 2PUZA 3ARVA 1SZGA 3TN5A 1RQHA 1Q4NX 1WE5A 4F2TA 5DRIA 3EWYA 2QXWA 2X30A 1CXHA 4P8UA 1W3IA 2ZUTA 4GUJA 3L4XA 1TG7A 2VR4A 3B0XA 4ZODA 3THCA 2WPBA 4KFPA 1PHQA 4GY0A 2ZRZA 3UPMA 4DI9A 1GQJA 1JF6A 4UQDA 3JS3A 5CSUA 2H8ZA 2QUNA 2OMAA 4O52A 4H8HA 2QPSA 2GFTA 2WCSA 1I8JA 1Q4WA 4O15A 2F6UA 5G4WA 2GVEA 4FIQA 3PBVA 1ZALA 2VDIA 4ZA0A 2JF6A 4HOWA 1EOMA 4LTSA 5J04A 5KMYA 1F61A 4IQJA 3E2SA 3GDMA 3GDRA 4QG9A 3FEQA 4U28A 4L1GA 1JCMP 1UJQA 1TJ0A 1LUCA 1AK5A 2J4GA 3MA8A 4LUSA 4K7VA 1PHWA 1LBMA 4Y90A 1THFD 1JJKA 3WO8A 3H70A 2VEIA 4GZEA 3HF3A 3U9IA 1O66A 1Q6CA 2QS8A 1JNDA 3BGJA 2ANUA 3KBMA 1A47A 1ADOA 3C3NA 4IJRA 3URQA 1VJSA 1UR9A 1XLGA 3THDA 4FMVA 2RAGA 4NZ4A 3B4UA 1GJUA 1H5VA 5KZMA 2I16A 5C55A 1UUOA 4NILA 4IMAA 3GYEA 3GNPA 2IQTA 1VGAA 4H3DA 2ZYFA 4OECA 2OLHA 2XZ9A 3ZVHB 3W9ZA 1TWWA 3GAYA 1MW1A 2P0OA 5IRPA 3BLOA 5D2TA 1IT0A 1E5NA 1JAEA 5HR6A 2UY5A 4GH3A 2CITA 1XQKA 4I9TA 3TIMA 3TSMA 3CHVA 1PBGA 2X7VA 1DTNA 3A6OA 1RP9A 4S3AA 1OIMA 3DX5A 4S3BA 5AHFA 1FWFC 1HVQA 1E4IA 5D09A 1BVZA 2VT0A 2WHMA 1BTMA 2FZ9A 4H4IA 4C90A 1V79A 1TPUA 1YPIA 4FNPA 4H9TA 4IGSA 2W3ZA 3V5FA 2ZDRA 1KXQA 2WZHA 3WG6A 1VFMA 5BXPA 1FFQA 1K4HA 4DXXA 1NP0A 5IHSA 1UZDA 1V5XA 4GQGA 1WO2A 2ISSA 1R86A 2ISWA 3ITYA 1O68A 3B0PA 3WQOA 3BC9A 1OD8A 1UA3A 3KTCA 4BEUA 3O3RA 2P5NA 4I3GA 4YU1A 4LY4A 2WCGA 2B0MA 4EPDC 3W84A 1I2RA 5HK4A 1FVPA 1EF3A 4XUGA 3U4FA 5CJNA 3KOXA 3GAKA 3DC0A 2ZX8A 1WB0A 3C8NA 3CPRA 3XINA 2TYSA 1TMQA 2EAWA 3GX9A 3B8IA 1GZGA 1JZ2A 4KRZA 2BP1A 3E49A 5C54A 4K2SA 4US5A 3RGTA 2EPOA 3M0XA 2VZSA 4Q6JA 4GNJA 3VO0A 7TAAA 6REQA 1EUAA 3NXLA 3S2NA 4CLMA 2HMCA 2BOEX 5A6JA 1EP1A 1MDRA 4A2SA 2WM1A 3A21A 2DVXA 1XD0A 2C19A 4O11A 3BLPX 1VJZA 3P8IA 1RCQA 1IQ8A 3CU2A 3WDRA 5GVJA 2D3NA 3DGRA 3KS5A 3G6MA 1GJPA 3GD6A 4PUNA 3N6QA 4TX8A 4DO4A 1XL9A 3MCNA 3UNDA 3IIZA 1JRCA 4Z2JA 4MPKA 2VFHA 4S38A 3R8GA 1KRBC 3IJ6A 3OLEA 4HHHA 1TJ2A 1C29A 3L4UA 2ZVIA 1H63A 4YMZA 1F07A 1QBBA 4E2DA 4DF1A 4HP5A 2UY2A 3PPCA 3RU8X 2GJXB 4NUWA 3URBA 3VIMA 3IIPA 2QCFA 3PPFA 3HGOA 3ZWTA 1R47A 3HM7A 4RLIA 4DRSA 3NPWA 3BW2A 2WQDA 1Q6RA 4W5ZA 5AHLA 2BXVA 1EDQA 1TTQA 2DDXA 4L5ZA 4K38A 5HBFA 2VM8A 3U4AA 4GFSA 1XYMA 2FPVA 4Z2IA 1X6LA 2EPLX 3EOUA 4AC1X 3CWHA 4OJYA 4QS5A 1ZP4A 1VAHA 1W1IE 1JDCA 2VXNA 4AHOA 2AQVA 3IRDA 3GKAA 1KV5A 1T41A 1NH6A 1B3ZA 5CKSA 3PFRA 3TYZA 5FJOA 1EB3A 4UNLA 1A5CA 4S39A 3NJ3A 4BF7A 2DUZA 4GYJA 2F2HA 3VIOA 2AQOA 3C3UA 3WBWA 4DI8A 1F6KA 2XN1A 1SFLA 9CGTA 4OV4A 4LYQA 4LW7A 4GK8A 2PWUA 3GDTA 3UWEA 4CCCA 1CXEA 1EC9A 3LCGA 3RAOA 3RDKA 1UH3A 5A2AA 4XD4A 3A9BA 4H83A 5HJYA 3NGJA 2QJMA 4LB4A 4WEVX 4MOZA 1YTKA 4DZAA 2Z26A 4M5PA 1KWGA 2A7RA 1QW7A 4TQTA 1VEOA 3NQEA 1UZ4A 4YTQA 4MUPA 3EX2A 2IW0A 2YZRA 4NT0A 6ALDA 2QMJA 4A8LA 3NCOA 5A8QA 3QTPA 5FF7A 3TYDA 4QAIA 3RYSA 1WKDA 3VMPA 4JTTA 3TJLA 2AL2B 3VD9A 1SZNA 4HMDA 1EGVA 2YYTA 3GNXA 2Z24A 4IPLA 1M7OA 4CEUC 1EO7A 1T8QA 5CBJA 4PZVA 3HGRA 3CGTA 1JQXA 3GNRA 1JDAA 5BNKA 3LLFA 1XBVA 1NWTA 4HZ6A 5I07A 3HQPA 1NP2A 3EWCA 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 1LJY A;  3M0I A;  1OC7 A;  4ZO9 A;  1O4U A;  3W2K A;  4XZL X;  3VOJ A;  3HV9 A;  1D8W A;  2CIP A;  4DEL A;  2HNE A;  3OG3 A;  1F3T A;  1H7P A;  1EJT C;  2PD9 A;  4JTL A;  4ZO8 A;  1W6T A;  4GQR A;  2D20 A;  3STE A;  1A4L A;  4YNG A;  3OA5 A;  5I3J A;  3NQ2 A;  1ZJB A;  5IFT A;  1V0N A;  1IEQ A;  1W3L A;  2XU2 A;  4A8N A;  1S38 A;  3DYP A;  3PTQ A;  3SAZ A;  1OG0 A;  5CXP A;  1QFE A;  3GWQ A;  3R8R A;  4LUT B;  3QMS A;  3BJT A;  3WD0 A;  3LNM A;  4WY0 B;  2QAF A;  4UCF A;  3TTQ A;  4HT3 A;  3FGC B;  3A9I A;  1K03 A;  4WDT A;  3HG5 A;  1KLZ A;  3VGG A;  3ES7 A;  2V82 A;  4P7Q A;  3W7C A;  4QE1 A;  1JYN A;  4PMV A;  1BF2 A;  1ZCC A;  4KFN A;  1DJH A;  4QDP A;  3EDF A;  2GJX A;  4O50 A;  1OB0 A;  4M19 A;  2MUC A;  1TZ7 A;  1TA3 A;  1N8I A;  4H7C A;  4AZ5 A;  2CEQ A;  3WH7 A;  5CG0 A;  1B30 A;  3GIY A;  5I24 A;  3PPG A;  4QHR A;  4MJZ A;  1EGM A;  7ODC A;  1PSC A;  1PYF A;  3TTY A;  2BZN A;  3S5Z A;  1G4P A;  5AHE A;  2Y61 A;  5HNN A;  3OVQ A;  1GVI A;  3CZ8 A;  3R8H A;  5LA0 A;  3D5H A;  1EH9 A;  3N4F A;  3AML A;  3EWB X;  2FVL A;  3T4W A;  4LC6 A;  4BHY A;  3VM7 A;  2PGR A;  3AMK A;  1NFG A;  1QNS A;  4J27 A;  3P81 A;  3WYZ A;  3L4W A;  4PSP A;  1L9W A;  3LEN A;  1QW9 A;  3T81 A;  4GJ1 A;  3UU0 A;  4JGD A;  1A3H A;  4X60 A;  3OO2 A;  2QV5 A;  4TTU A;  2UWF A;  3SQM A;  3N2C A;  5HAT A;  3BCF A;  3UP8 A;  2QLY A;  2ZUM A;  1YE6 A;  1VPQ A;  3GBD A;  3FV9 A;  3CLM A;  5FES A;  1EFZ A;  1NWR A;  5GJN A;  4M0X A;  1W1Y A;  4XTI A;  1ZJH A;  1HL8 A;  2PLM A;  3VDG A;  2YB1 A;  3EB3 A;  1OK4 A;  1AJ0 A;  3M6Y A;  1VRD A;  3CZL A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
 4AG0 A;  4Y8E A;  4FOJ A;  4AFY A;  4RNJ A;  4F3H A;  4RNF A;  5MF5 A;  3U2E A;  4HJF A;  3GG1 A;  3HV8 A;  4J40 A;  2W27 A;  3GG0 A;  3GFX A;  3PJU A;  4ES4 A;  4FOU A;  4KIE A;  4RNI A;  4Y9O A;  4F48 A;  5MKG B;  4LYK A;  3PJW A;  4Y9N A;  4HU3 A;  4RNH A;  3PFM A;  4FOK A;  3TLQ A;  3N3T A;  3GFY A;  3PJX A;  5M1T A;  3HV9 A;  3S83 A;  4Y9P A;  4HU4 A;  4Y9M A;  3GFZ A;  3PJT A;  2R6O A;  4LJ3 A;  3SY8 A;  3KZP A;  5MKG A;  4Q6J A;  2BAS A; 
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