3IGS | Genus

Total Genus 81

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	81
sequence length	230
structure length	230
Chain Sequence	AMSLLEQLDKNIAASGGLIVSCQPVPGSPLDKPEIVAAMALAAEQAGAVAVRIEGIDNLRMTRSLVSVPIIGIIKRDLDESPVRITPFLDDVDALAQAGAAIIAVDGTARQRPVAVEALLARIHHHHLLTMADCSSVDDGLACQRLGADIIGTTMSGYTTPDTPEEPDLPLVKALHDAGCRVIAEGRYNSPALAAEAIRYGAWAVTVGSAITRLEHICGWYNDALKKAAS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase 2
molecule tags	Isomerase
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus	81
structure length	230
sequence length	230
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.1.3.9: N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase.
pdb deposition date	2009-07-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04131	NanE	Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3igsA00

3C2EA 2WKJA 4K7VA 1JRBA 1O94A 3TXVA 3LHTA 5HWMA 3LCLA 3W2LA 4DBEA 4GXMA 3A5VA 3W7CA 3M7WA 2XN0A 2QAPA 1DJNA 3T44A 2PE4A 4MY1A 4X9SA 2FJKA 4FIQA 1XCFA 3TMQA 1AG1O 1TCDA 3NDOA 2NZLA 1K7FA 2RFGA 1ZAJA 3M5XA 3W7PA 1XDMA 3R12A 1YXDA 3O6DA 1FBAA 3HGOA 1K8XA 3GKAA 3N34A 3CM4A 2A7RA 4I7WA 3UZ5A 1KFCA 5H91A 4FB7A 5C5YA 3YPIA 1XC4A 2FLIA 4MJZA 1YLVA 4IXXA 5AYZA 2A1YA 3LGEA 4IMCA 3FJLA 4AXKA 3AO0A 3GIYA 4M7SA 1THFD 3CEUA 2C6QA 2QCFA 4JDBA 2WNQA 5DCEA 3U8GA 3HBLA 1VCGA 3IIZA 3S1UA 2WV8A 5D30A 3DFNA 3GDTA 3LB0A 3MI3A 4M5PA 2GOUA 5FF0A 2OMAA 2OT0A 1KLZA 3HQ1A 2G95A 3MWAA 3S6DA 5EBUA 2E77A 4Y8FA 4K38A 2V5BA 2BXVA 1C29A 3R8RA 1SUXA 5CKSA 3G0UA 4IMFA 4L4LA 1VH7A 4OWGA 3F03K 2RKXA 1KFEA 4L4MA 2E09A 1WBHA 5FF3A 1WQ5A 2H8ZA 3C52A 1OX5A 1S3HA 1LROA 1ICPA 2B7QA 1Q3NA 2QCMA 4XKYB 3MBFA 3OA3A 1QWGA 2NX3A 1ALDA 2GUUA 1W5QA 2JK2A 1TPDA 3DHDA 2H6RA 3B05A 1VYPX 4FNUA 3BVJA 2VKZG 4MIMA 1H7PA 2I9EA 5ABTA 2CLIA 2CWNA 3MJYA 5HMSA 3PUEA 4K39A 4IJBA 3SY5A 1DQWA 3H55A 3QEZA 1XBVA 4BFAA 1LOLA 4JYEA 4XZ9A 3UWVA 2Q3RA 7TIMA 4BI7A 3Q2DA 3MUXA 3O6CA 3R5EA 3DFPA 1N55A 3ZFHA 5J5DA 1VLWA 4IQLA 4P61A 4RR4A 1JCLA 2VFIA 2DU2A 4RZ5A 3G1FA 3TSMA 1IXNA 4OQVA 3HB9A 1X8FA 3W1MA 5DBTA 3C3NA 3HPSA 3MHUA 2QUUA 4ZL1A 4MPQA 1VCVA 1QPOA 4CQ9A 1KFJA 5AYYA 2OJPA 5G2IA 3NPVA 2B7PA 3GVGA 3PULA 5EKYA 3C61A 1OFQA 5LGZA 1TV7A 1MXSA 2XN2A 3E12A 4NUWA 3GK0A 2JBMA 4IWWA 4K36A 1TPH1 3LX9A 3E0IA 1PV8A 1BWLA 4O16A 3RNDA 4X22A 1SFLA 3EB2A 3WJZA 3Q58A 3GLCA 4GWEA 5EMUA 1W5PA 2YYTA 1TTQA 2FB3A 3G8RA 5FF7A 3W84A 1WXJA 3TC6A 4UTWC 2YYUA 1G67A 1TTJA 2QCHA 3P7YA 1OFAA 4AF0A 5KMYA 3MMTA 1SR9A 3W7KA 1DVJA 2ALDA 1NF0A 1X7FA 3NXFA 2HS8A 4QIUA 3EX2A 2R94A 3Q37A 3L2IA 3HG2A 5F1VA 3W73A 4AAJA 4Q4KA 4N9DA 2Q8ZA 2AQWA 1AW2A 4DPPA 1O4UA 1QPNA 2BX7A 4YCOA 3UZJA 1G6CA 1OYBA 3STEA 1JUEA 2EPHA 1DORA 5DCBA 1OYCA 4RX0A 3T78A 4WQ6A 2Z0IA 2NUXA 4GC4A 3G3DA 2YPIA 5E93A 4WZHA 4LVFA 3QMTA 4UFLA 3CT7A 1CW2A 2GQ9A 4OHQA 5MHBA 3P60A 3NPWA 4JX5A 3E02A 2JKEA 3MO7A 3G24A 3QJAA 3LCGA 4FNTA 4HSNA 3MI2A 1WOAA 4UNLA 4ADSA 1KBIA 1H1YA 3CTLA 4EOUA 3W75A 2A5HA 1KM4A 3W72A 1UBSA 1OF8A 3EKZA 5I3GA 2QJIA 2DORA 1FWTA 4KFNA 3N9SA 4UMBA 2DZXA 4JXCA 4UIOA 1AL7A 1H60A 2VEIA 3L9CA 4RZ4A 3LXAA 4DEFA 3UXDA 3TJLA 4CQAA 5LNWA 1LBMA 3L0NA 3OEXA 4O18A 1K7XA 1K8ZA 4XUGA 3L0KA 2Q8LA 3IGSA 5FEXA 5LNUA 2V81A 3W1UA 4BWLC 4YMZA 4LRSA 1L6SA 3W1QA 3V1PA 4LUJA 2YSWA 5D38A 4O12A 4O10A 1D3GA 3HIJA 4A22A 4UR7A 3QW4B 4RLIA 1P4CA 4FX8A 3A5FA 4A21A 3M44A 3I7QA 1Z48A 3BW3A 3HPZA 3LXCA 5BW6A 4UTWA 3ABRA 3CIXA 2E6DA 3NQ2A 4IMDA 4OT7A 4ADTA 2BLEA 5HJLA 3TAKA 3RFAA 3DBPA 2RDWA 4O54A 3PSVA 3LDVA 3PC0A 1TREA 1HO4A 3MP3A 1O60A 3PBVA 1IXQA 1TRDA 2TSYA 3GX9A 3T40A 1KM2A 1UCWA 2CLHA 2FPVA 3G0XA 4Z08A 3NQ7A 5L6UA 5F2GA 4FX6M 4LVBA 2QCNA 3QQ0A 4FIRA 3UWQA 3DFQA 1N8FA 2A0NA 4NJGA 3KVJA 2RHGA 2Q3OA 3R89A 5FEWA 4HNNA 3P82A 4LUIA 3QM3A 3KVLA 1PL9A 2X2GA 2J6XA 3N2XA 1GQNA 3QSRA 1JJKA 1VRDA 1VHNA 3U6WA 2ZRZA 3EWXA 4HSOA 1OFRA 1VYRA 4UFIA 3WFAA 1QR7A 1VJIA 2FQIA 3C56A 4OU1A 1OVDA 1W37A 3L21A 3W1AA 2FDSA 3RF9A 2PRLA 3NM1A 4TO8A 1A5AA 3PVFA 1GYNA 1WAUA 2R91A 2JGYA 1FDJA 3EXRA 1KFBA 2C1HA 4RKAA 3EX1A 1KM5A 3H54A 4QM1A 3S5ZA 1FDZA 2WSYA 2GQAA 5K9CA 4KWWA 1P0KA 5E1QA 3UY8A 4NJIA 4O4WA 5CGQA 2AGKA 3KAOA 1NEYA 3HG5A 5AC8A 2ZZ2A 3EXSA 4UMAA 3SGZA 4RJEA 1YPIA 3LHUA 2FPTA 4FF7A 2DZSA 5HQEA 4QQ3A 3W87A 4BWLA 3OG3A 1DL3A 4GRSA 2FTPA 4JTUA 3L65A 3W9ZA 3TAOA 1LM1A 5D2VA 3W7OA 4M19A 1Z41A 4C1LA 4X2RA 2TPSA 3G0SA 5KZEA 3GAYA 2R8WA 2QCGA 1OG0A 5FESA 4PA8A 5AB3A 5D37A 1F5ZA 2Z1BA 2Y88A 1OFEA 1W5MA 4JD4A 3LTYA 3OVQA 1ZFJA 4JTKA 3F1QA 1RR2A 2YR1A 5AHFA 4TMCA 3IRDA 1SU5A 5D02A 1SO6A 1CI1A 3FYPA 1H7WA 4LC8A 1VQTA 3BW2A 4N2YA 3DI0A 4FEZA 2DZPA 1XL9A 2Y62A 1GG0A 3TSDA 2H90A 5TIMA 4A2SA 1EP3A 4BK9A 1DHPA 1M7PA 2JKPA 3PB2A 3PWAA 1I4NA 3LCWA 4JIPA 3W2MA 2NXHA 3H53A 4LWWA 3HJZA 2HSAA 4PC8A 3NZ1A 1O5XA 2NLIA 4O17A 4FX7A 4E38A 5K9DA 4O13A 3W7JA 1EIXA 5J5RA 4EIVA 2C13A 3MP5A 1KTBA 5F2LA 4O15A 2C14A 1GG1A 4JDYA 4S1FA 3UYCA 3KFTA 1ZALA 4JYDA 3W70A 4HNUA 3PG8A 3W88A 1I45A 3LTSA 1OFDA 4LVDA 3LXBA 1LBLA 4N4QA 2QCDA 3DI1A 3W1NA 1R30A 3GB6A 1GWJA 4N6EA 1GVQA 2B7OA 3NL3A 3MYPA 1HUVA 3C4UA 3G1XA 2EKCA 5H2ZA 5DLCA 1A50A 2Y70A 3ZR4A 5D09A 2GJLA 4KKXA 4AF0B 2QJGA 4LOCA 1S5VA 2CZ5A 3CB8A 2FPYA 2CZEA 2NUYA 3NQDA 4LNYA 1PVNA 3ZS4A 1OFBA 1W5OA 4QISA 1FXQA 4PODA 3B04A 3M9YA 2V2CA 4NVTA 3W2NA 3IVTA 3CLMA 1A5SA 3M5YA 2CFFA 2ZDRA 4B5NA 4PEKA 3QYQA 5BOOA 1PCKA 3CPRA 1Q6OA 1W0MA 2WQPA 1H50A 1VR6A 2O7SA 3W7GA 4AHPA 4LW7A 4ZZ9A 4DO5A 3S5NA 1H1ZA 3BV4A 3DFTA 4ZVJA 1JCJA 5LZLA 4NNBA 1MEWA 2E68A 4JTIA 3DFSA 1WBJA 3IIVA 3NEVA 1EX5A 2OX1A 1FDYA 3D0CA 3BLFA 2X16A 2RDTA 3QSTA 4HNVA 4O0ZA 1QFEA 1L2UA 4KFPA 5CG7A 1TMHA 1WDWA 2ZRXA 3FA5A 1G7VA 1FUYA 3NNTA 4MFEA 5F4WA 1V5XA 1WV2A 1XBXA 5HWJA 2E5DA 1IXOA 1SO3A 1EP1A 3HGJA 4WY0F 1YDOA 1LTDA 1TPFA 3ZWSA 1B4KA 1EP2A 4NZFA 3C6CA 3NQFA 5CSSA 3Q94A 1TQJA 5A5WA 4O11A 1LYXA 2ZBTA 2H8XA 2V82A 1LP6A 4YLWA 2NWSA 4CCDA 5KZMA 3LLFA 5BMXA 2ZYFA 1SW7A 2JKAA 1J4EA 2BWGA 3NGJA 2YXGA 2ZZ7A 1LORA 3G1DA 4YCPA 1SO5A 2DP3A 1LRNA 4QITA 1R47A 3VE7A 1TPWA 4PFMA 1SZEA 1XUZA 5CPOA 2ZRVA 1YPFA 4GFSA 3KRZA 2GVGA 4MY9A 3P74A 1FY6A 4WXZA 3HGSA 3W2UA 1FQ0A 1H63A 2PURA 3I7SA 3IGUA 4UTIA 4CCEA 3HOJA 3QH2A 3NG3A 3HG3A 4NT0A 4JTSA 3MBDA 1H7NA 5KINA 3NQ8A 4GUHA 1QPRA 1PE1A 4WJEA 5EY5A 3UWYA 1TPEA 3L5AA 1W54A 1HO1A 1W8SA 4XTDA 4AWUA 4K6AA 5AC6A 1YYAA 3T4CA 4J9JA 3QF0A 2OT1A 3MI6A 1WYIA 1B57A 2XN1A 5C6MA 2WPBA 1YXCA 1WX0A 3BLIA 3STFA 3UPBA 5C2XA 3HGRA 1SQ7A 1I2OA 3P81A 5I3FA 2PC4A 3E49A 3WJWA 5BRBA 3W07A 4M6VA 4NNAA 1G4SA 3O63A 2V2HA 2ZA1A 3QQ1A 2X30A 2ISVA 4JICA 1IIHA 1KM3A 1EUNA 3NPXA 3HF3A 1M6JA 1ZENA 1SO4A 2WOQA 4PL1A 5FI8A 1G4PA 1XI3A 3LRKA 3E9AA 1T96A 2A85A 3NL2A 2R14A 1Q6LA 1GVFA 1MZHA 2G97A 3TUUA 1FXPA 3LI0A 3W6YA 3HG4A 1RZMA 3SW6A 3TC7A 1HTIA 1KFKA 5D2TA 4CLMA 3C2OA 3EEGA 4XQ6A 1TPB1 2RH9A 3TV8A 3VCRA 2VFEA 2P1FA 5D33A 1U5JA 4UTJA 3SR7A 3LM7A 4H6KA 3KOFA 3M47A 4QSHA 1Z42A 5AHLA 1AMKA 1QAPA 4PL2A 3VI2A 2A2IA 3NM3A 3OVPA 2W0UA 3EXTA 2NUWA 4MKNA 5EPDA 1PIIA 5LHEA 3DAQA 3OBKA 3W7DA 1QPQA 1RVGA 1XXXA 4O1AA 4ZQPA 1I2PA 2VEPA 4JTJA 1TV5A 2YFNA 4UFMA 3TNOA 1PHQA 3SFKA 4UR8A 2WNNA 5EYWA 3NO5A 3LV6A 1RQEA 3MW7A 3ABSA 3S1VA 3THQA 1N7KA 1G69A 2Z6JA 3W1RA 1V7YA 1SSGA 1WA3A 2ZZ1A 3M5VA 5AN7A 1W56A 1HG3A 2CU0A 2QCDB 2VFFA 2CLLA 5LKYA 1XUUA 1EA0A 3TW7A 2FIQA 2I1OA 2HTMA 4KFOA 2X1RA 1QCWA 3USBA 3LRMA 1KBJA 1GPWA 4U28A 5I3IA 2WO5A 3R13A 3NQGA 1YADA 1RQHA 5TBOA 2RDUA 3N2MA 3VE9A 3S5OA 3N73A 2QDGA 3SSJA 5IM51 3W22A 3GDMA 3O05A 3GXNA 3NA8A 2Y6ZA 4WOZA 4UUIA 1W1ZA 1EB3A 1L6WA 3DZ1A 2CLOA 2V5LA 1GVOA 3M16A 2QJHA 1GYLA 4ORIA 3B8DA 2O7QA 2Y7EA 4JTEA 2EAWA 3LOTA 2V9DA 1TPVA 3SIZA 1UJPA 1EWEA 1GT8A 4HPXA 3DKLA 1J2WA 4O19A 3DHFA 2W79A 4M6QA 3PY2A 3CQ0A 1FCQA 2F7FA 1C9DA 3QPZA 3FS2A 4C1KA 2A21A 4U4MA 4DO4A 4GUIA 2VEMA 3TQ0A 4H3DA 4MJMA 2VOMA 3QMSA 3HPXA 3GR8A 1LOSA 3GDRA 4QAIA 1LBFA 1B9BA 3W85A 1ICSA 4JYFA 3BLEA 3NYZA 3TJXA 3L67A 1UUMA 3E96A 3THAA 2CLMA 3DENA 4N9CA 1ZHAA 1I2QA 4JS3A 3BO9A 3S1XA 1W3NA 2E1DA 1K7EA 3N14A 2EF9A 1C8VA 4K8HA 3A23A 5HNRA 4M7TA 3A9IA 4JX4A 2TMDA 1IIGA 2CZFA 4IMEA 3DFOA 4MLRA 2ATSA 1UB3A 3WK2A 1LLZA 1DV7A 1ZJIA 2EGZA 2QF7A 4ICNA 3S1WA 1K3UA 2ABBA 2NXGA 3N3MA 3TQKA 4UTTC 1EPXA 5HUOA 5HUPA 4CNPA 1TJPA 5G1YA 1XFBA 4GJ1A 3A24A 3O06A 4NNCA 3EX3A 3W7LA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3IGSA

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Chord Diagram

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