3IIXA

X-ray structure of the fefe-hydrogenase maturase hyde from t. maritima in complex with methionine and 5'deoxyadenosine
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
347
structure length
344
Chain Sequence
MTGREILEKLERREFTREVLKEALSINDRGFNEALFKLADEIRRKYVGDEVHIRAIIEFSNVCRKNCLYCGLRRDNKNLKRYRMTPEEIVERARLAVQFGAKTIVLQSGEDPYMPDVISDIVKEIKKMGVAVTLSLGEWPREYYEKWKEAGADRYLLRHETANPVLHRKLRPDTSFENRLNLLTLKELGYETGAGSMVGLPGQTIDDLVDDLLFLKEHDFDMVGIGPFIPHPDTPLANEKKGDFTLTLKMVALTRILLPDSNIPATTAMGTIVPGGREITLRCGANVIMPNWTPSPYRQLYQLYPGKICVFEKDTACIPVMKMIELLGRKPGRDWGGRKRVFET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Unexpected electron transfer mechanism upon AdoMet cleavage in radical SAM proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords Biotin synthetase, putative
molecule tags Adomet binding protein
source organism Thermotoga maritima
total genus 141
structure length 344
sequence length 347
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04055 Radical_SAM Radical SAM superfamily
A PF06968 BATS Biotin and Thiamin Synthesis associated domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3iixA00
3DU0A 5D03A 3O8AA 1TPDA 3GYEA 1JR1A 1XBYA 4B5NA 1M6JA 1O5XA 2P1FA 1G7VA 3UZ5A 5G4EA 5DY3A 1Z44A 1SFJA 2JGYA 1DKWA 2Y7GA 1TJPA 3NA8A 1K8XA 3NZ1A 1Q6QA 3UWQA 2QUUA 3L0KA 5CPOA 2WNQA 1HTIA 3P60A 2Y89A 1MSSA 3QMTA 3TKFA 4PL2A 2CZDA 2ZBTA 4N9DA 2NXHA 2ZA1A 2QCEA 3W7PA 4FNRA 3BARA 1ZAHA 5F2GA 4UCGA 3G0SA 3GR7A 3E02A 1TPUA 4LS2A 3P5ZA 5HUOA 2V2CA 3IIOA 1W54A 2CZEA 1SZNA 4MPQA 5AYYA 3CPRA 4FB7A 1JRCA 3W1RA 2WNZA 3PUDA 1MEIA 4S2CA 4ADUA 4ICNA 1H5YA 5BOOA 1RR2A 1H7OA 5LNWA 2X1SA 3F4WA 5ABTA 3ZR4A 1WA3A 3C2FA 1ME9A 4YWIA 4AWTA 1LRQA 1XBVA 4RCXA 4WD0A 3IIPA 3KX6A 2GQ9A 1R2RA 2GPTA 4NXKA 6ALDA 1JQXA 3PC0A 3BG5A 3GLCA 1YDVA 3NQDA 1KM4A 3QC3A 2ABAA 3HJZA 3ELFA 5D33A 4DELA 1WOBA 2YYUA 3NG3A 3TE9A 4E2DA 3TIMA 4ML9A 2VEPA 4UFMA 1EP1A 1K8YA 2A21A 5D05A 3TV8A 4IWWA 4HKPA 5LGXA 3W7JA 4S1FA 1OG0A 3UWZA 2NV1A 4XUGA 3NDOA 1I2QA 3M47A 3OA3A 4MZ1A 3L5LA 1YDOA 3Q37A 4GFSA 4JY8A 1JUEA 2C19A 5DLCA 5D2WA 2WNNA 2WSRA 3NL2A 2FTPA 2ALDA 3N9RA 4UXDA 2CLEA 1DVJA 3O05A 2E6DA 2J88A 3NQ7A 3EWWA 3LBCA 5LNUA 4U28A 2EPHA 3BLIA 3KRUA 4O4VA 3BG9A 3UWYA 4YMZA 4TMBA 2V81A 4L4LA 3W86A 3M5ZA 3LV6A 4TR9A 2Q3OA 1O94A 3FKRA 3B04A 3C4UA 4JD4A 3W7DA 3QSRA 7TIMA 5SWUA 4POCA 1LLZA 5L6UA 4O1AA 3T55A 3HGRA 1W3IA 2E5CA 4LV9A 1W0MA 4IX0A 1QO5A 3W07A 1H63A 3ATYA 3SZ8A 2Y6ZA 3W1LA 3T40A 3W7RA 3DFSA 2FLIA 5G1TA 4NX0A 2E5BA 3I7SA 4JXCA 1DOSA 1OYCA 3W1QA 3WJWA 2ZRYA 4KFNA 4LRTA 5E93A 2DZPA 1W31A 1SSDA 3PG9A 1FCQA 2FB2A 5HWJA 1UB3A 3O6YX 4CCEA 3CEPA 3MHUA 1SW0A 1PHWA 4IXXA 4O57A 3RLUA 3RK8A 3GZ3A 1TTQA 1XUZA 3NPWA 1HO4A 4ZL1A 1OK4A 4HSNA 3C8FA 1QPOA 6TIMA 4CNNA 1ZNNA 2H3BA 4JTEA 2P0OA 5G5IA 1XDMA 2TSYA 1AMKA 2FFCA 4LV4A 3DFQA 3IRDA 4DBEA 5AC8A 3OBKA 1GVQA 2E6YA 4NNCA 3ABQA 3M5XA 4HSOA 4NQ1A 3DFNA 5F2MA 3STFA 1R47A 4HNTA 2G95A 4DEFA 3EX3A 3BVJA 1HG3A 3WFAA 1E51A 3Q2DA 3IEBA 1LCOA 2CLIA 3HG4A 3B03A 3SSJA 1LOLA 4UNKA 3PAJA 2NX3A 3W7LA 1P0KA 2GJNA 1SPQA 2AGKA 5TIMA 1P5BA 4AVFA 1H50A 4O0KA 4NUWA 2VOMA 3W70A 1XDLA 4HPJA 2ZA3A 4WQ6A 3PBUA 1O95A 1U5JA 1ME8A 1OF8A 1P1XA 3P81A 4JX4A 5F1VA 3TQVA 4BWLA 3W85A 1I45A 1V5XA 4MVAA 3NQEA 4PA8A 1GTHA 5I3JA 3G1YA 5H91A 1IXQA 2CLFA 2YDAA 3PBYA 2CZ5A 3LBMA 1VRDA 2E6AA 1UASA 2YPIA 4O4WA 3EWUA 1GYNA 2GVGA 4CCCA 5CPLA 2EKCA 4PEKA 4AHPA 5DBTA 1BTMA 3C56A 4AEOA 3F4NA 1AG1O 4M7TA 1W5NA 4I7UA 5EL1A 2E5DA 3P74A 4GC4A 3FYPA 4UFHA 1TTIA 2CWNA 4XTDA 3QMSA 4WJEA 1KM0A 2C3ZA 1OFQA 1SQ7A 2DU2A 3LERA 3NNTA 3NL6A 4O53A 3CWOX 4KFOA 4O54A 2V5BA 4MKNA 1OFDA 2EGZA 1A50A 3A5VA 1TCDA 1EIXA 3P61A 2E77A 3LTSA 3TC6A 4ZZ9A 2XN2A 3PB2A 4IMEA 3LXCA 1K7EA 1VC4A 1W3NA 1K3UA 1OFPA 3DHFA 3GB6A 4AXKA 1TQXA 5K3VA 5HR7A 1EWDA 2BLEA 3LCLA 2JGQA 4TIMA 1CI1A 1FWWA 1KFJA 1KLYA 1HFBA 2WO5A 2DZVA 4UC5A 3L65A 1H7WA 1TPVA 1EEPA 3SFKA 4CNPA 1YTKA 3L21A 2CZFA 1GEQA 2W6RA 2BX7A 4UTWC 2VEMA 4HN4A 4NJIA 1JCNA 4OWGA 3ANYA 2XFWA 3NL5A 3KOFA 1A5SA 1RQHA 3EKLA 3S5OA 1YADA 2LLEA 3VE9A 2H6RA 5AYZA 3SI9A 1HUVA 2TMDA 4JR5A 1VLWA 1QCWA 1GQNA 4GUIA 5DXXA 2Z1BA 1KM5A 4GUGA 3TXZA 4UTMA 4M6QA 3ZWTA 5IBXA 1H61A 3QYQA 1SFLA 5HWMA 4R53A 3W1UA 4KWWA 1Z48A 2H3DA 5CKSA 4O52A 4WZHA 3CQ0A 4WY0A 1U83A 3KXQA 3BLEA 3LHUA 1W5QA 4N2YA 2A85A 1D3GA 3CIXA 3E0IA 3GXPA 3LHYA 3ZS4A 1AW1A 3TFCA 2GOUA 3HIJA 3FLUA 1JJKA 3G3DA 3USBA 3U2OA 3TU9A 5LHFA 2ISVA 3QSTA 4L4MA 3MI3A 1TIMA 3C6CA 3CWNA 2V82A 3I7RA 4GNJA 1F73A 4JICA 3G8EA 3W7CA 4UMAA 3S42A 1LORA 2AQWA 1F76A 3DI1A 2QCDB 2ZZ5A 4R34A 2A0NA 2RHGA 3TQKA 3W83A 1KA9F 4MY8A 4O28A 1QOPA 1Q45A 3WJYA 1N7KA 1IF2A 1NSJA 4FIQA 5C2XA 2RDUA 1K8ZA 3SIZA 1ZALA 2QCLA 1CX9A 2J9ZA 3KVMA 5DY2A 2VXNA 2FB3A 3M41A 4R33A 5DELA 3NZRA 3S6DA 5AHNA 4O8RA 3FEMA 3IGXA 1EPXA 1LZOA 1X6UA 1RVGA 1TQJA 2BZNA 2DZTA 3O63A 3W23A 5AC7A 1GOXA 4OGZA 4FF7A 2C16A 4O10A 3B8DA 2FPTA 3NQMA 4N6FA 4AB4A 5L9FA 4WY0F 4MJMA 4XWUA 2R14A 3W72A 1TTPA 1YTDA 1DJQA 1GTEA 4GBUA 3W1NA 1F6PA 1Z42A 3E9AA 4HIBA 1LOQA 1F74A 4NT0A 1ZJIA 1IXPA 4KFPA 4Q33A 3PULA 3GVGA 3JRKA 3NAVA 4O12A 1RQEA 4N4PA 5EYWA 5KZEA 1VH7A 2UV8G 3EX2A 4J9JA 5D04C 2XN0A 2I14A 3O07A 1TV7A 3QF0A 3E49A 3QMRA 5AHEA 5AHLA 3G22A 3MI6A 4N9BA 4LRSA 3W1TA 2WSYA 3EXRA 4CNOA 3VKJA 1KW1A 1KTBA 1KM3A 4Q4KA 2G5WA 4GUFA 1MO0A 4IPIA 4FX6M 3TH6A 3SGUA 4O0ZA 4LS0A 5I3IA 3S8HA 2WOQA 1LROA 3MO7A 3HPSA 4HT3A 3DXIA 2Y85A 3QW4B 1ZAIA 1I2PA 3NPUA 4Z1BA 3PR2A 3OVQA 4U4MA 1FCBA 4IMFA 3HB9A 5A8GA 4FX8A 2R8WA 4UIOA 2Y61A 4JTTA 1I2NA 4OBTA 4DBDA 3P8IA 3NYZA 1H7PA 2QUTA 2DZWA 4IOTA 3W2MA 3W88A 3NM3A 1JUBA 1PCKA 1AL8A 4N9EA 3JS3A 1KLZA 4MFEA 3WJZA 4QAIA 4O16A 5D30A 4QSHA 2JKPA 3IIXA 2ZTKA 4EVZA 2QAPA 4NJKA 4H4IA 3EKZA 3PVFA 1JVNA 4K8EA 5CSRA 5C6MA 4UR7A 3W7QA 3QPZA 1XBZA 1XBXA 4RXGA 2J24A 1XUUA 4DF2A 4O1BA 4OV9A 1UUOA 1JULA 1GYLA 1DL3A 4RZ6A 3UWWA 3I6RA 3QFEA 3S1VA 1QAPA 3FJLA 1IXNA 2O7QA 3F1QA 3LCFA 3MW7A 4N6EA 4LS1A 3LRMA 1NF7A 4WOQA 4MJZA 3LHZA 1S3HA 4ZQNA 1B57A 2NXIA 4H3DA 2GQAA 4O18A 3FYOA 4QITA 1G6CA 1WDWA 3KVJA 1GVSA 2X2GA 3I7QA 4N4QA 4UFJA 4ADTA 4UTTC 3FOKA 3GX9A 1BEUA 1TSIA 3C2OA 3C61A 5TBOA 3L67A 3GDTA 4TX9A 1S5WA 4LUIA 5D37A 4QNEA 5FEZA 2V2DA 2I1OA 4O1CA 4CQ8A 2VFGA 3GNNA 1AK5A 4MOZA 1NAL1 2EAWA 1H1YA 3LGEA 4QISA 2R91A 4X3ZA 3JR2A 2QAFA 4E0CA 5D02A 4FNQA 2ZZ4A 3HG3A 1D3HA 5HWNA 4K38A 1BWLA 4FO4A 5HNRA 1CW2A 1OX4B 2QCDA 3QRHA 5LGZA 3DGRA 1W5PA 4TU1A 1H7XA 3EWYA 4ZQPA 3C52A 4Z1CA 1SO6A 2FPYA 3KRSA 1D9EA 5CPMA 3T44A 2H90A 3W76A 1LBFA 2CFFA 3G3MA 1L6WA 1KFKA 2JKEA 3CB8A 1F7BA 1WAUA 3W1PA 5FEPA 1NVMA 2Y7FA 4DF1A 3LX9A 4Y90A 1OHLA 4ZVJA 4M6VA 3TAOA 4JIPA 4LNYA 4MY9A 3SR7A 1W8SA 4Z08A 2V8ZA 3WK2A 1TJRA 3IVUA 1FDJA 1SU5A 1TV8A 1SZEA 3DZ1A 4M6PA 2VEKA 3TROA 1O5KA 4MYXA 4RJEA 4NJGA 4KWVA 3TNOA 2C15A 5CPNA 1JCLA 1R2SA 2ZRXA 3W74A 1OFAA 3R8RA 4UFLA 4JN6A 4A3UA 5CSSA 4JS3A 1PCWA 1M7OA 3RMJA 4FHAA 1JRBA 1MEWA 3EXTA 3NPXA 4XZ9A 3B0UX 3W2LA 1KV8A 2NLIA 1JCJA 4C1LA 5FF2A 5EY5A 4GXMA 3PUOA 2HS6A 2HS8A 1RQBA 4DQWA 1QPNA 5D2XA 2ZFAA 5C55A 3HOJA 4NX5A 2BXVA 2QCMA 1OFBA 1VPXA 1M5WA 2B7PA 4ZQOA 4KKXA 2AAMA 3NEVA 5HJLA 1W37A 3S1WA 1X1OA 4PL1A 3LRKA 5DXYA 4FX7A 1X7FA 1PV8A 2YGYA 1OX5A 2Y88A 1FBAA 3HGJA 1LBLA 3HBLA 1QPRA 1K02A 4K36A 4MIMA 3O06A 2DORA 3B0VC 1XC4A 1FQ0A 1OFOA 3L5MA 5AOUA 3C0JA 5A5WA 3S5YA 1LBMA 1KBIA 2FDSA 3GAKA 5HQEA 1ICSA 1K03A 3AO0A 5AHFA 3EXSA 3KFTA 1ONRA 3UXAA 5CZTA 3ABRA 4BI7A 2CU0A 3CLMA 1PIIA 3CC1A 2VC6A 1G4TA 1N55A 5LHEA 1EX5A 1H1ZA 5J5DA 4EWND 4HNUA 4LVAA 3NM1A 1FWNA 3M5VA 1JCXA 4OV4A 1F2JA 2CLHA 3W1XA 3PSVA 4XKYB 5E1QA 2O7SA 1TB3A 3TMQA 5C5YA 4MYAA 3O6DA 4RKAA 4LC6A 1P4CA 1MZHA 2RDWA 2YW4A 2YCEA 2ZTJA 1W56A 3W75A 2Y63A 5K2ZA 2ZZ3A 1QFEA 3UWVA 3LHWA 4MZ8A 3EX6A 2VELA 3NQGA 4QM1A 2NUYA 4NNAA 5G2HA 4O17A 3W1MA 1VR6A 5EKYA 3LCGA 1LRNA 3TX9A 1SUXA 3VNDA 2RKXA 3TR2A 2V5LA 2WPBA 3EX4A 1L9WA 5D2TA 1B3OA 2ISSA 1AL7A 2QUVA 4DO5A 3EWZA 1SW7A 5CG7A 3T7VA 3NQFA 5FESA 3H53A 3OVRA 4IMCA 3VCRA 2OT1A 5K9DA 3QQ0A 3PY2A 4JDYA 1OVDA 3HGOA 2TYSA 1EB3A 3L0NA 3W7HA 1BWKA 3HGSA 3YPIA 2A4AA 4JTUA 3E12A 4MLJA 1IXOA 1OX4A 1VCVA 3BGGA 3WJSA 4CQ9A 3IGSA 4Z0SA 4FXSA 4K8HA 2C18A 5G2IA 5J5RA 3GDKA 2ZZ6A 4OT7A 4NXSA 5KSWA 4RZ4A 4N9CA 5E0KA 1TPWA 3LM7A 1VS1A 3IGUA 2WV8A 3LCWA 1EUNA 4LUJA 3W71A 3S1XA 3A5FA 3W7EA 1VQTA 2Q8ZA 3G1XA 3W7KA 3OIXA 3S5ZA 4MUZA 4YLWA 4AH7A 5EA9A 4LVGA 5F2IA 1ML1A 1OF6A 2Y7EA 2PURA 4PC8A 3L9CA 1XXXA 3L0GA 2ZYFA 1FX6A 3STCA 2DJLA 1L2UA 3AJXA 4K6AA 1Q6OA 1S5TA 1B4EA 1QDSA 4WX2A 2JBMA 4FNTA 4OHQA 3PG8A 3UWUA 2YFOA 3F03K 2NX1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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