3IIZA

X-ray structure of the fefe-hydrogenase maturase hyde from t. maritima in complex with s-adenosyl-l-methionine
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
346
structure length
344
Chain Sequence
TGREILEKLERREFTREVLKEALSINDRGFNEALFKLADEIRRKYVGDEVHIRAIIEFSNVCRKNCLYCGLRRDNKNLKRYRMTPEEIVERARLAVQFGAKTIVLQSGEDPYMPDVISDIVKEIKKMGVAVTLSLGEWPREYYEKWKEAGADRYLLRHETANPVLHRKLRPDTSFENRLNLLTLKELGYETGAGSMVGLPGQTIDDLVDDLLFLKEHDFDMVGIGPFIPHPDTPLANEKKGDFTLTLKMVALTRILLPDSNIPATTAMGTIVPGGREITLRCGANVIMPNWTPSPYRQLYQLYPGKICVFEKDTACIPCVMKMIELLGRKPGRDWGGRKRVFET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Adomet binding protein
source organism Thermotoga maritima
publication title Unexpected electron transfer mechanism upon AdoMet cleavage in radical SAM proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords Biotin synthetase, putative
total genus 141
structure length 344
sequence length 346
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04055 Radical_SAM Radical SAM superfamily
A PF06968 BATS Biotin and Thiamin Synthesis associated domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3iizA00
3MJYA 1F5ZA 4NX0A 4UTKA 4Q32A 3FS2A 3TK7A 1QPQA 1ALDA 3V75A 3A5VA 4AVFA 4BI6A 3USBA 3JR2A 1DJQA 4E0CA 4GUJA 4WOQA 3C2RA 5FF0A 3NVTA 2NX3A 5AOUA 3B8DA 1LLWA 4LV9A 3WK0A 2QJIA 3PBWA 8TIMA 3KHJA 3HGSA 2C6QA 5EBUA 3F03K 4XKYB 4LOCA 3EX2A 3GXPA 1C8VA 1JRCA 3PULA 1XL9A 3DFNA 4AH7A 1TPDA 3PS7A 4W9TA 3W71A 5FESA 1WDWA 5KZDA 5DELA 2H6RA 4MY8A 5G2HA 2RFGA 2Q8LA 2Y89A 5C6MA 3M16A 4UFKA 2J9YA 1JUBA 3UNDA 5CGQA 4XBSA 4FNQA 4HSNA 1QCWA 1Q45A 4LS0A 5AHEA 2YDAA 3GR8A 3R8RA 1JULA 4YCPA 2BSLA 3P8JA 3P81A 5D2TA 1KFJA 1SR9A 3OHIA 1PCWA 2P0OA 4GBUA 3NQCA 1FXQA 1EB3A 3VKJA 4FNRA 2RDWA 3A21A 4JDBA 1GQNA 3FEMA 3QW4B 3RLUA 3TJLA 5J5DA 4LC6A 2DZPA 2DJXA 2DZSA 3PB0A 3ELFA 4PC8A 4O4WA 4GNJA 4N9BA 1GT8A 1JCNA 1QPOA 4R7JA 1LORA 3W85A 4QAIA 3BG9A 3NQGA 2IQTA 3NQDA 2GUUA 4PTNA 3L65A 3BO9A 4QSHA 3UPWA 1F05A 5HQEA 1SQ7A 4Y9AA 3NL2A 1WBHA 5HUPA 2CU0A 3EWBX 3O16A 1VS1A 1CI1A 5GVJA 1F2JA 3DU0A 4OWGA 3NL6A 2O7SA 5AN7A 3W2JA 4GE8A 5HMSA 1ZCOA 3BLEA 3S5ZA 3HOJA 3LHUA 2GQAA 3B0VC 4HNNA 3VFLA 3TV8A 3W9ZA 1VQTA 3SZ8A 1GVSA 5D2VA 3FIGA 5DN1A 3W1NA 5AC6A 1QPRA 3RNDA 5LHEA 4O0ZA 5IBXC 4JGDA 4ZQRA 3BK0A 4UNLA 1W3TA 1AMKA 2X1SA 1DHPA 1YTKA 4IGHA 3DFSA 1JUKA 3UZ5A 1WX0A 1F7BA 1K7EA 1I4NA 1TQXA 4MUZA 5AYYA 4CCCA 1I2PA 4RZ6A 3C52A 4R53A 5KITA 2J24A 4TMBA 4LUIA 2FFCA 2VFFA 2G95A 1NSJA 1W5QA 2C18A 3NQ7A 1JCYA 1H7XA 5E93A 3HMJG 3EWZA 5HR7A 3TKFA 1RQEA 2YYUA 1KBIA 1W54A 2ISVA 2G97A 2J9XA 1W1ZA 4LVBA 1K3UA 4M6QA 2VFDA 2VELA 3UWYA 2CLEA 3PVFA 2V2DA 3TW7A 4O54A 2WKJA 1YYAA 1UJPA 3BLFA 4FNSA 5FI8A 2TPSA 4RK8A 1SFLA 2YFOA 1IXPA 3CHVA 5U4NA 1IF2A 1FBAA 2ZTKA 2ATSA 4AMAA 3TX9A 1UB3A 3C2EA 1OF8A 2I9EA 3DI0A 2EHHA 3MI3A 3QFEA 1LYXA 1UBSA 3G1FA 2I1OA 1OX4A 5C54A 4UNKA 4NZFA 5I3HA 3P8IA 3FKKA 3VE9A 1W31A 3OVPA 1KM3A 2YR1A 4CCEA 2QF7A 2G96A 4M5PA 1QMLA 4JICA 5G2WA 3NL5A 4AB4A 3JRKA 2QDGA 1JCJA 3B0PA 1W37A 2OCZA 3CC1A 3ABSA 2QCCA 4HT3A 3UZJA 3G1DA 3P5ZA 2B7NA 3SFKA 3A24A 2V8ZA 4LY8A 5DCDA 1MSSA 1FWSA 1KLYA 3LTPA 5G1TA 5K4ZA 2VOMA 5FF4A 2X2GA 2WSYA 1X7FA 2CLHA 3INPA 3TFCA 1A50A 1GJPA 2TMDA 2BXVA 1UUMA 1OFPA 3SR7A 2WJZA 4TIMA 1H51A 4EWND 5DLCA 2DZXA 2QDHA 3MHUA 3WJXA 3NXFA 1OX4B 4LVDA 2V30A 4X3ZA 5HWNA 4DBEA 2X1TA 2NXIA 2Z1BA 3R89A 1GYNA 2R14A 1RD5A 3C4UA 3ATZA 1SZFA 5D2YA 3KVKA 4BFAA 1KTBA 4UMBA 3E49A 4JTFA 1TIMA 3LCIA 3W2MA 3IV3A 1LOLA 3PR2A 3ZS4A 2E09A 4AWUA 3DHDA 3F4NA 1XCFA 4PL2A 4ZQMA 1L9WA 2Z6IA 2C19A 4K7VA 3G1AA 5HNRA 5DY3A 1LRQA 1DL3A 2NUYA 4AHPA 4XBKA 3IGXA 4QIUA 4IWWA 3B0UX 1MEWA 3DI1A 4NXKA 3JS3A 4ONVA 4EVZA 3P67A 4XQ6A 4CLMA 1W3IA 3S42A 3TIMA 1G7VA 5CPMA 5BMXA 4UR7A 5TBOA 2WSQA 3LDVA 4UFLA 5FEWA 2F84A 2H8ZA 3SECA 2A1YA 2GPTA 3C2VA 1LBFA 3C3NA 3I65A 4FX6M 4P61A 1VYRA 3IIOA 3NPXA 5LZLA 1TTQA 1SZGA 1XBYA 3FFSA 1H5YA 4JTKA 1JJKA 3P84A 3HG5A 4E2DA 3GKAA 3UQNA 1HO1A 2V2HA 3TAKA 1HO4A 3WK1A 1M7OA 3KVLA 5AYXA 4Y6GA 1R47A 1DOSA 1Z41A 3LI1A 3QSRA 2YW4A 4GUIA 3PG8A 5BW6A 3DAQA 1ME8A 3NG3A 3GX9A 2QUUA 4IPJA 3W72A 3FLUA 3M5YA 4O1DA 4JS3A 3W7KA 1AW2A 4CNPA 3T40A 4K37A 2RKXA 1RQHA 6TIMA 5D04C 1VYPX 1QWGA 1JVNA 3THQA 1D3HA 3QSTA 2FPYA 1OFDA 3ATYA 1TJRA 2ZZ2A 1MXSA 4PL1A 2NXHA 3NO5A 1TCDA 4LRTA 4I7WA 1SO6A 3IGSA 3S0CA 4MZYA 1O94A 2EGZA 2GOUA 1TB3A 4DXVA 2DZWA 1H7OA 4UCGA 3E02A 3HGJA 2G5WA 4KWWA 3LCXA 1H50A 5DCEA 1QPNA 4R33A 3GAKA 1DQWA 2CLFA 4QJ1A 5U7SA 1KV8A 3GAYA 1A5AA 3F4WA 4AHQA 3W7RA 4M7SA 1C29A 3CWOX 1A5BA 4FXRA 4NJGA 3VNDA 5ABTA 3CPRA 4KFPA 2A4AA 4PH6A 1SO5A 2GJLA 2Z6JA 2YXGA 1KV5A 1JCXA 1BEUA 1R2RA 1BWLA 1XI3A 4GWEA 1O5XA 3BW4A 2Z2UA 3CLMA 3LHWA 4UTTC 4K36A 2JKAA 4O13A 1FCBA 4HPJA 1CW2A 2VFGA 4K38A 3T55A 4N2YA 5KSWA 2CLMA 3LI0A 4OV4A 2FPVA 3S1VA 2XFWA 5T26A 3W1XA 5E0KA 4UTLA 3GXNA 3P7YA 3EEGA 2CZ5A 3Q58A 4LUJA 3NQMA 1B57A 2WNNA 3C61A 3EB2A 2TYSA 3IIVA 4Q4KA 3PAJA 4IMDA 4AWTA 2CLOA 2Y61A 3KRUA 5BRBA 1GZGA 4NJKA 4OV9A 3L67A 5G4WA 1VHNA 4RCXA 5D03A 4GXMA 1WBJA 3B04A 4WXZA 5F4WA 2V81A 4JIPA 5IBXA 3DZ1A 1ZHAA 3G1HA 3M41A 3L9CA 3MBFA 3Q94A 4DF2A 3S5YA 3S5OA 1ADOA 4JYDA 2QJHA 1PS9A 2ZBTA 5CPLA 1JQVA 2PE4A 1KM5A 1Z42A 4N6FA 1QDSA 3HQ1A 1TJPA 2DORA 3IIXA 3UPBA 2YGYA 2FDSA 3GXTA 3HG2A 4N9DA 4NX5A 3MMTA 3TE9A 2A6NA 1JCLA 2YPIA 4ICNA 3UWUA 1B4KA 2DZTA 2VEMA 2EPHA 3P82A 3NEVA 1OJXA 4RXFA 1QAPA 2GJNA 3QPYA 3SSJA 3UXAA 2VFHA 4ADTA 4NZJA 2JK2A 1KM1A 4N9EA 2AGKA 1PHQA 3MBDA 1XBXA 4IOTA 1QR7A 3NQ8A 3S5NA 3W2LA 2X1UA 4GJ1A 1ZFJA 3U6WA 3LRKA 2ZZ6A 1LBMA 3MP4A 3PBVA 1YDNA 2VEKA 5D2WA 1IGSA 3A22A 5CZJA 5FEPA 1I8JA 5CZSA 3GLCA 4FF7A 4O18A 4M6VA 2E5BA 3ZFHA 4NJHA 3L66A 4JR5A 3W7EA 4C1LA 2A6LA 4OU1A 1ME7A 5KZEA 3FYOA 3GKFA 1YADA 3NNTA 1H7NA 2Y6ZA 4RV8A 3W1RA 1PIIA 2Q3RA 3BARA 2ZRZA 4RLIA 1LZOA 1KTCA 1SSGA 3EX1A 1ML1A 1LROA 4Y8FA 4WJEA 3QMRA 1XBZA 2E5DA 1EUAA 3B05A 1EUNA 2C13A 3W7MA 3M6YA 4E2BA 3GR7A 2ZZ3A 1VRDA 4Z0SA 3NQ6A 1GVQA 3QH2A 3S1XA 1GVFA 3SJ3A 2PURA 3QZEA 2Y7EA 4A29A 3BW3A 4BF9A 2C0AA 5EA9A 3HGRA 4X2RA 3NYZA 2ZRWA 2E6AA 1W3NA 1F6PA 1OFAA 3PBUA 1FWWA 3TNOA 1N7KA 2QUVA 4L4LA 4O28A 1PL9A 2WNZA 3VE7A 1TPVA 1TREA 4OGZA 3U2OA 4Z1BA 3C56A 3OVQA 3YPIA 3NQAA 3GB6A 1PVNA 4K8HA 5KINA 4LS1A 3DBPA 4UMCA 4RX0A 1SZEA 3C2OA 4DF1A 5BNKA 5EL1A 3RLVA 3BVJA 1Q6RA 4FIQA 3SY5A 3UWZA 4UC5A 3TU9A 3BW2A 3W1PA 4O57A 2BX7A 5AB3A 1KM0A 3NPWA 4Z0JA 1C9DA 2DZUA 4O4VA 1BKSA 2RDTA 1G4EA 2PC4A 3LOTA 1GG0A 1SW3A 1P4CA 3EXTA 4KKXA 2QCLA 5K7JA 4UFMA 3TCEA 3CTLA 1G67A 3EXSA 3M5VA 5TIMA 1EWDA 4XZ9A 4EF9A 5DXXA 2YX0A 1Q6LA 5D05A 5AHLA 2OT0A 1I2NA 2FJKA 1NF0A 3DXIA 3LHZA 4GC4A 4O1AA 3BGGA 3O15A 3NA8A 4JX5A 5F2GA 2HTMA 3N19B 3ABOA 4FHAA 2ZZ4A 4X9SA 4B5NA 1GOXA 1WYIA 1XUUA 3PY2A 3ZR4A 2HS6A 1DJNA 1Q6QA 3ABQA 4WZHA 1QFEA 1O5KA 3OG3A 4FNTA 4R34A 3IIZA 1SW7A 2QAFA 3TW6A 4DPPA 4ADSA 2J6XA 2C15A 5AC7A 4AHOA 5J5RA 3PC0A 2QCDA 2ZFAA 1MZHA 3M5XA 2E1DA 3T78A 1V7YA 3CEPA 4H6KA 5LNUA 2C14A 3G18A 4WY0F 3R13A 1W5PA 3A23A 5EPDA 3UYCA 4GUGA 3KX6A 4IXXA 2ISWA 4ML9A 4FNPA 4JTGA 3FYPA 5D37A 1J2WA 4AEOA 2D73A 3W1LA 1G4PA 2C3ZA 3IGUA 4YWIA 5D38A 4JY8A 3TJXA 4LU0A 3SW6A 4IUOA 4MY9A 4J9JA 2PCQA 2VEIA 4LWWA 5LSMA 3MI6A 4XUGA 1K8YA 2R94A 4TX9A 5I3JA 2Y88A 4O15A 1ONRA 3TA6A 4DO4A 4BR1A 3KAOA 1ZNNA 3W7LA 3L5LA 3C8FA 5F1UA 4OT7A 3SIZA 1DVJA 2TRSA 2QCEA 1W5OA 2YFNA 4UTMA 1OABA 4DBDA 1EP2A 2QCDB 4X22A 1FDYA 2EKCA 5LNRA 4LVAA 3WJYA 3BV4A 3LCHA 1QO2A 4QISA 3MI2A 3O6YX 2CLLA 4O50A 5HWJA 1KBJA 3W7JA 4LVGA 3CB8A 4DQWA 3EX3A 3L0KA 3STEA 1PCKA 2W6RA 3LCLA 1Q6OA 2A85A 1KFEA 3DKLA 2Y85A 5CPNA 4ZQNA 1OFQA 3LERA 4UTUA 1LP6A 3GIYA 1L6YA 3QPZA 3L2IA 1TPH1 5D2XA 5AYZA 3N3MA 4DPQA 4IX2A 1HFBA 3THAA 1GVRA 5SWUA 4QQ3A 2Y7GA 4JEQA 4I9AA 1NFBA 3H55A 4UTTA 2YW3A 3W76A 1F6KA 3AJXA 1GTEA 2KZHA 1TSIA 1LOQA 1K02A 2QUTA 1W8SA 3CM4A 3HG4A 2YSWA 3LXAA 1TYGA 4UTWA 1H62A 4ZVJA 3UXDA 3P60A 3A5FA 1OFRA 3TAOA 2ZA1A 4KFOA 3TC6A 5DXYA 2FPTA 3W2KA 3NQEA 1YDVA 1TTJA 3P80A 2FB2A 4BWLC 4YMZA 1RPXA 5I3IA 1FCVA 2WQPA 4ORMA 1DQXA 1HUVA 3I7RA 5LGXA 3LXBA 3HGOA 5DBTA 3LCWA 3E12A 1OYAA 3B03A 3LM7A 3EX4A 4BI7A 5G2IA 3UWQA 1TO3A 3C0JA 1TV7A 1OX5A 3W7GA 2FLIA 5H2ZA 1KFKA 2HSAA 2R8WA 3IVSA 2RHGA 3EWWA 2WSRA 3WK2A 2PRHA 2C16A 5K9XA 2WOQA 2A21A 1FX6A 1KW1A 4HIBA 2RDUA 3B06A 3H53A 1DORA 4RXGA 3W2UA 4O53A 2ZZ5A 1AW1A 1LRTA 5K9CA 5AHFA 2NLIA 2FQIA 1LOSA 3LTYA 1XXXA 1T0OA 3TFXA 3FKRA 1P0NA 1XKYA 3GDKA 3HJZA 5HUOA 1K03A 1KFLA 4IMGA 1PHWA 4UUIA 2NUXA 2H90A 3LLFA 4ZQCA 1QO5A 1M6JA 1OVDA 5D02A 1M7PA 4LTSA 1TPUA 5HJLA 4I7VA 2XN2A 4DELA 4LS2A 2JGQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1F5Z A;  3QR1 A;  4L6H A;  4Q32 A;  3FS2 A;  4EPD C;  1ALD A;  4HHH A;  4BI6 A;  3CTT A;  4KRU A;  4A8L A;  4GUJ A;  6CGT A;  5LA1 A;  2J8G A;  2VTF A;  3K8M A;  8TIM A;  5CC3 A;  3KHJ A;  1XF0 A;  2CBU A;  2PAJ A;  4KT2 A;  4DM1 A;  1CLX A;  2A3E A;  3EX2 A;  2QZR A;  1C8V A;  1R3V A;  2ZWY A;  3DFN A;  3U9I A;  2VX5 A;  2W4X A;  4Q4O A;  3I10 A;  3W71 A;  3PPC A;  4RUB A;  1P1M A;  3UT0 A;  5CH9 A;  3VD3 A;  4TTG A;  1CTN A;  1HJQ A;  3KEH A;  5G2H A;  2Y89 A;  4DBS A;  3WBW A;  4QE1 A;  1DWI M;  5J8L A;  3UND A;  4XBS A;  2DVU A;  1QCW A;  1Q45 A;  3BWW A;  4LS0 A;  4IP4 A;  2WSP A;  3AS0 A;  5ABH A;  2DUA A;  2X40 A;  4GYK A;  2BSL A;  4WKF A;  3P8J A;  5D2T A;  4CD4 A;  1KFJ A;  1V8E A;  2HNH A;  2ZWZ A;  4GBU A;  2ZAD A;  1D7K A;  5BU6 A;  3V1H A;  2XM1 A;  4KWO A;  2IPF A;  2XJ7 A;  3BAX A;  1Y5V A;  1EHN A;  3A21 A;  3FEM A;  3QW4 B;  3BH4 A;  4IFK B;  3RCN A;  3TJL A;  2EPL X;  4LC6 A;  1PO9 A;  2DZS A;  2VP8 A;  1OT2 A;  2VRJ A;  4R7J A;  4QRO A;  3BG9 A;  3NQG A;  4L9Y A;  3AIE A; 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 5LXE A;  3KX6 A;  4IXX A;  1R7O A;  1HXJ A;  5D37 A;  4AUB A;  2C3Z A;  5D38 A;  1VD6 A;  1KFW A;  3S2L A;  1C93 A;  1U5V A;  3TJX A;  1UUQ A;  4K8G A;  3PHA A;  1UR1 A;  3GHS A;  1L8P A;  2C71 A;  1K8Y A;  4TX9 A;  5DMN A;  4E6M A;  3HA1 A;  3WH6 A;  1VBU A;  3FY1 A;  3GG8 A;  1RBO B;  4DZ5 A;  2WC7 A;  2JEQ A;  3PK7 A;  1E1C B;  1AH4 A;  3KBW A;  3IAP A;  1GOK A;  5F1U A;  2TRS A;  2J25 A;  2FH6 A;  1OAB A;  3QGA C;  1EP2 A;  4XZI A;  5LNR A;  3BJF A;  4LVA A;  2GGG A;  3BV4 A;  3LCH A;  2W66 A;  3MI2 A;  2Z29 A;  4UQD A;  5HWJ A;  4AX7 A;  4H19 A;  2I7G A;  2W6R A;  4JNZ A;  1GGO A;  1NM9 A;  2J7E A;  1NU5 A;  2Y85 A;  1JZ7 A;  4GNK B;  5TF0 A;  2Z7K A;  4J2M A;  4ZQN A;  3LER A;  1L6Y A;  3VIM A;  1TPH 1;  5D2X A;  2X7W A;  1JXK A;  3SIM A;  1HFB A;  1OBA A;  1UP0 A;  1GVR A;  3QKE A;  4ROQ A;  2NVA A;  4EXQ A;  4I9A A;  5ABF A;  1KCX A;  3TEV A;  4GOA A;  2PWU A;  2WPG A;  3W76 A;  1TSI A;  1OGG A;  1K02 A;  4QR6 A;  1AJZ A;  4JN8 A;  3BJT A;  2YSW A;  3LXA A;  3RLG A;  4KFO A;  2QGH A; 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