3IVUA

Homocitrate synthase lys4 bound to 2-og
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
401
structure length
386
Chain Sequence
SEANGTETIKPPPYGPNPSDFLSRVNNFSIIESTLREGEQFANAFFDTEKKIQIAKALDNFGVDYIELTSPVASEQSRQDCEAICKLGLKCKILTHIRCHMDDARVAVETGVDGVDVVIGTSQYLRKYSHDMTYIIDSATEVINFVKSKGIEVRFSSEDSFRSDLVDLLSLYKAVDKIGVNRVGIADTVGCATPRQVYDLIRTLRGVVSCDIECHFHNDTGMAIANAYCALEAGATHIDTSILGIGERNGITPLGALLARMYVTDREYITHKYKLNQLRELENLVADAVEVQIPFNNYITGMCAFTHKAGISTYEILKPEDFGMSRYVHVGSRLTGWNAIKSRAEQLNLHLTDAQAKELTVRIKKLADVRTLAMDDVDRVLREYHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure and functional analysis of homocitrate synthase, an essential enzyme in lysine biosynthesis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Homocitrate synthase, mitochondrial
molecule tags Transferase
source organism Schizosaccharomyces pombe
total genus 133
structure length 386
sequence length 401
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.3.14: Homocitrate synthase.
pdb deposition date 2009-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ivuA01
3WJYA 3GLCA 1I2OA 4N9EA 3W7RA 3ATZA 1TO3A 4PC8A 3FYOA 1F5ZA 3M5YA 4HPXA 4UNKA 3QM3A 4NX0A 1C8VA 2BTMA 2BZNA 1LRQA 3QPZA 4IMDA 2Q3OA 4FB7A 1TRIA 4O4VA 3MW7A 3DHFA 5F2MA 2JKAA 1LBFA 1VCVA 4K36A 3O15A 1LCOA 4NU7A 3KRZA 2TPSA 3F4WA 3NQDA 4GUFA 4EF8A 1NFBA 3KAOA 4DBEA 4RZ4A 2Y88A 3GXNA 4Q32A 3S5YA 4UTWC 2C18A 3GR8A 4LOCA 3LXAA 1ZHAA 1FXQA 1P0KA 1O4UA 1VJIA 2WV8A 3MHGA 2P10A 4CNPA 5T26A 3HG5A 1AW2A 5EKYA 3P82A 4CQ9A 4N9DA 3W7NA 1TV7A 2JGQA 3W2JA 4HIBA 4OV4A 4K7YA 1B9BA 1JCXA 3NQ8A 3PF3A 4OV9A 3RFAA 2DJLA 3C3NA 1XXXA 1VQTA 1TPH1 3EKZA 3NA8A 2WQPA 1IIGA 3R8RA 1SQ7A 2FPYA 3W2MA 4H4IA 5FI8A 2IQTA 4GUIA 2YFOA 4K8HA 3W7IA 4QITA 4Y8FA 3I7SA 1VC4A 2E6YA 3LBCA 3BG9A 5KZMA 3W7GA 4BI5A 3NQEA 4JTSA 1W1ZA 5AYYA 1FCQA 3G0SA 5IBXC 1JRBA 5K9XA 1YYAA 4GUJA 3MWAA 1FX6A 4PL2A 5G2IA 5I3GA 5HWMA 2W79A 1VCGA 1I4NA 3A22A 5AN7A 4DF2A 3NL5A 5D03A 3EXTA 2O7QA 3G1XA 5AC8A 1NF7A 3G1HA 2PC4A 3CTLA 4QISA 4WY0B 5K3VA 4Z1CA 2QJIA 4JTTA 1H7OA 1SZFA 2F7FA 2TMDA 5DLCA 1JCMP 5BRBA 4RV8A 3QW3A 1BTMA 5K2ZA 1Z48A 1LTDA 1QPNA 1LZOA 3A23A 4ZQMA 3GR7A 1TPC1 3LLFA 1K7FA 5AHLA 4JXCA 3NZRA 2V8ZA 1G69A 5HUOA 2QJHA 2HTMA 3OBKA 3VNDA 1DHPA 5HJLA 1H51A 2RDTA 1SFJA 2BX7A 1M6JA 2ZRUA 1ML1A 1XBYA 2VXNA 2ZQ0A 3RLUA 1ME9A 3W1UA 2QR6A 3T55A 1FWNA 2CZ5A 5A8GA 2AGKA 1DL3A 2GJNA 3GDRA 3UY7A 3T78A 2YW4A 2QCNA 3MYOA 2X1RA 1OYCA 2PURA 1TSIA 3PB2A 1ONRA 4JYDA 2XN1A 2EHHA 1OVDA 5K4ZA 1O95A 3OVPA 4AF0A 4O1BA 1RQEA 4HHPA 3G1AA 1OFPA 1WA3A 4N6EA 3CWOX 3E49A 3P8JA 3S1VA 3E96A 5F2LA 5EA9A 5G1TA 4N6FA 4UR8A 3W1RA 5CZTA 2D73A 4DQWA 1EIXA 1QCWA 1QDSA 3NVTA 3DFTA 1AMKA 8TIMA 4NXKA 1G4EA 4RZ5A 3QJAA 1HO4A 1Q45A 4FHAA 5D02A 3E12A 2Z6IA 3SR7A 1TPVA 4OQVA 5A5WA 1BKSA 1SUXA 4X2RA 4NQ1A 1RPXA 3CPRA 1ZENA 2C14A 3PBYA 2J27A 3STGA 1FQ0A 2Y7FA 4XKYA 4S1FA 3ABQA 4UIOA 4GE8A 2CLMA 5FF4A 5L6UA 2XN0A 2Z2UA 3NQFA 1DV7A 3NQVA 5D04C 3H53A 4JYEA 3LHZA 1B3OA 2HS6A 1FDYA 2ZZ1A 3L5LA 2J6XA 5HUPA 1GT8A 3E9AA 2A6LA 1P0NA 2CZDA 2R91A 4Z1DA 1UUMA 2NV2A 1TPB1 2V9DA 1TTQA 4M5PA 2GQ9A 5D32A 4NZFA 4WZHA 3QRHA 3L5MA 2H3DA 3HPSA 2R94A 3P5YA 1TTPA 4FNRA 5I3HA 1UUOA 3BLEA 1LBLA 1GEQA 4NJGA 4M7SA 3HO8A 2G97A 4O15A 5AYXA 2HS8A 4LS2A 3U2OA 4O16A 2OT0A 1PL9A 3WK2A 3ZFHA 1XDMA 3TXVA 3VFLA 1LDCA 4LU0A 4Y6GA 2Y7GA 3MO7A 3LXCA 1DVJA 3BK0A 5D09A 3TFXA 3C8FA 3QC3A 2Q8LA 1OABA 2H6RA 3HBLA 5F1VA 2FDSA 5H91A 3KVJA 3GDTA 1TJRA 1WOBA 2RH9A 5DXXA 3B0UX 1KBJA 5C2XA 4ORMA 3DKJA 2WSYA 3EWYA 3MMTA 4DPQA 1YLVA 3S8HA 3OA3A 4BK9A 2GQAA 1H63A 3BW3A 3PC0A 3BV4A 1TPEA 3G3MA 4O18A 3QSTA 2DP3A 3DI1A 1JQVA 1JCJA 1SO6A 4FNPA 3PBWA 3W7HA 4TR9A 3LCFA 3HJZA 3OG3A 1MZHA 4AH7A 2DORA 1TIMA 3B06A 1QPQA 4TO8A 4QIUA 3WK0A 2YGYA 1XDLA 4OWGA 4QAIA 1TQXA 3G3DA 3UWZA 3HG2A 1FCUA 4WOQA 1R46A 3CLMA 2V30A 5DCEA 1AG1O 1VZWA 4EWND 1DOSA 2NX9A 4HNNA 1JCLA 1NF0A 1SW7A 2ZBTA 3NM1A 2FB2A 3R12A 3NZ1A 1LLZA 3LBMA 2DZPA 3LB0A 3MI6A 1EEPA 1KM6A 1SZEA 2QCEA 3W2NA 5F4SA 1OK4A 1SW0A 1YDOA 1WDWA 4IXHA 1N8FA 5FF3A 4DBDA 5MHBA 1SU5A 3CU2A 4MZYA 3KFTA 3NO5A 4UTLA 3NOEA 1OX4A 3LHWA 3STCA 3W1NA 2EGZA 1M7OA 4L4MA 5HINA 3EX1A 4CQ8A 3W7CA 2QCLA 2OCZA 3FA5A 4L4LA 2GPTA 5DCBA 4DF0A 3TH6A 3O8AA 5K9CA 4WXZA 4UR7A 1XUUA 5KZEA 1MEHA 4PODA 1KV8A 1K8YA 4UTIA 3W84A 4JEQA 3NM3A 3M16A 3BVJA 3KRUA 3B4UA 3P60A 2JK2A 2E77A 3DH7A 1GQNA 1EWDA 2ZZ6A 4AWSA 4JX6A 3NR0A 3W9ZA 3K30A 3TSMA 3IIXA 1G7VA 5C54A 5AHEA 4MY9A 3HOJA 4XUGA 2WKJA 1OFQA 1AW5A 2QUTA 4JTIA 4MZ8A 1KW1A 4O10A 3RNDA 5AFDA 3SY5A 3W1QA 4TMCA 4RXFA 1OK6A 4UFKA 1W3TA 5LHFA 5HR7A 3W7PA 4MFEA 5ABTA 5F2IA 3W85A 1MXSA 5FEWA 1QNVA 3OHIA 1VYRA 1Q6RA 4UTMA 3KVKA 4AHOA 3C52A 4DELA 4WUIA 4OBTA 5IBXA 2VELA 2EPHA 4M6PA 5K9DA 3O05A 1TPFA 1TPWA 2DZTA 1WX0A 3UWWA 3L65A 3C2OA 2QCFA 1X6UA 2NXIA 4UTHA 1OYAA 4FX8A 1XBXA 2E09A 4CLMA 2FTPA 3LCWA 2X30A 4R34A 2H8ZA 5J5RA 3VKJA 3W23A 2A7PA 3O1NA 2ABBA 4N4PA 3W75A 1OFBA 2RDWA 2GUUA 1LP6A 3W7OA 1JUKA 4OU1A 3NDOA 4JDYA 3O6YX 3G1FA 5LZLA 1W56A 3HQ1A 3O6DA 3NL6A 3CEPA 1W8SA 2E1DA 2ATSA 5LNUA 4N2YA 3BO9A 3GVGA 1OF6A 5FF2A 5F4XA 3IVSA 4MY1A 3UWQA 3WJWA 1GG0A 3N3MA 3HF3A 1MEIA 1ME8A 2FPVA 3TMQA 4LTSA 1RQHA 4E2DA 2QDHA 3P80A 2Y70A 2ZFAA 2VFEA 4ZQRA 2E6DA 2NUXA 3O06A 4FNQA 2XN2A 1P1XA 2ZDRA 1LRNA 4E0CA 3ELFA 2BLEA 2VFHA 4MZ1A 2V81A 3TQVA 5HNRA 3W2UA 3A5FA 1N7KA 3SGUA 1X1OA 5LNSA 4JIPA 4XTDA 3BW2A 1BEUA 3EXSA 2ALDA 2W6RA 3KOFA 4K38A 1SPQA 1EUNA 3ABOA 3USBA 2V0TA 2Q3RA 1AL7A 1A53A 4GRSA 1R47A 2PCQA 1L9WA 2WNQA 3SIZA 1OX6A 3GZ3A 4MYXA 5F2GA 1Q3NA 5AHIA 3P8IA 3L9CA 3S0CA 1RQBA 4IX2A 3CC1A 2E6AA 3W07A 4UNLA 2BWGA 3LTSA 3G0UA 3F03K 1ZALA 4LUJA 4WJEA 5J5DA 4JGDA 1VS1A 1ME7A 3I6RA 4IXXA 4CNNA 3OVQA 3IEBA 3TJLA 2VENA 2P1FA 3TW7A 4LVDA 3KVMA 4A2RA 2B4GA 3TQKA 2V5LA 5DXYA 3MYPA 3S6DA 5CGQA 3NEVA 2RFGA 4FX7A 3W76A 3EEGA 2JBMA 1F76A 3S5OA 4JY9A 4M6QA 1F05A 5I3KA 2Y6ZA 3WFAA 3L2IA 2GVGA 4UUIA 1ZJIA 4JD4A 1KM5A 1G6CA 1W5OA 3A24A 5TIMA 4MOZA 2A7RA 2WO5A 1LOLA 4X3ZA 4NNBA 5G2HA 1YDNA 1LORA 1RZMA 5CPMA 4JIQA 2YZRA 2CLLA 1LBMA 1KFBA 5D05A 3OVRA 1YTKA 1FCBA 3TE9A 3DFQA 4WX2A 1CX9A 1EWEA 3TC7A 1FBAA 2TSYA 3CIXA 1XL9A 1SO3A 3PG9A 4N02A 4O28A 1H7RA 4ZQPA 3UZJA 1H50A 4IMEA 2NWSA 5KTLA 2ZZ5A 4LVAA 2NUYA 3H55A 2QCDA 5BNKA 3CQ0A 4RR4A 3W1XA 3LCGA 3W72A 3W3OA 4FEZA 5C55A 4JYFA 3LTPA 1U5JA 1NAL1 3A9IA 2PRLA 1I45A 3QZEA 4O1CA 4ORIA 1A5BA 3FS2A 3P67A 1S3HA 4C1KA 1QAPA 1KM4A 3RU6A 5BMWA 1KFKA 1TQJA 2C15A 2ISSA 3QYQA 5D2TA 5I3FA 4UTTA 3DXIA 4LNYA 5D38A 2G95A 4JDBA 3HGRA 2ZA2A 3LV5A 4Q4KA 2AAMA 3W7MA 4CCCA 1XUZA 3CHVA 4X9SA 1ZY9A 4WY0F 4JTEA 1DBTA 1B4KA 1W5MA 1PIIA 2V5BA 3GAYA 4RCXA 3AJXA 3M5VA 2OX1A 4K6AA 3UWVA 1I2QA 3L0GA 3DU0A 2BXVA 3NL3A 1FWTA 3P61A 3GK0A 3HGJA 5LHEA 1A5AA 4H6KA 2ZRXA 2B7NA 3NNTA 4JTLA 1DQXA 4K7VA 3LOTA 1JJKA 4BWLC 3MP3A 4K8EA 1THFD 4ZQOA 3P74A 1AL8A 3C0JA 5KSWA 4O4WA 3G1YA 1SSGA 1LM1A 3HPXA 3G22A 3HPZA 1H1YA 3NQ6A 4NX5A 4A22A 2A4AA 3PM6A 3SGZA 2CWNA 3N73A 1K8XA 5FF7A 2ISWA 3S5NA 2ZRVA 3LI1A 4S2BA 1GTEA 1KM1A 2VFGA 3VE7A 5LNRA 5KZDA 1B4EA 4S2CA 4JS3A 4IMFA 1TV8A 2B7OA 2CW6A 4TU1A 4LW7A 3QMTA 1BWLA 1FUYA 3N14A 4JX4A 1J2WA 5FEPA 5H2ZA 1W3IA 3UQNA 3O6CA 5TBOA 2ZTJA 3TW6A 1TPUA 4RZ6A 2NXGA 1IXQA 4WD0A 1VLWA 2C19A 5U4NA 1OG0A 3NPVA 3W7DA 3EWBX 3UD6A 3GNNA 3TIMA 2A21A 1I8JA 2VKZG 3PY2A 4O1DA 5AHNA 5EMUA 2ABAA 2E5BA 3PSWA 3BLFA 3U6WA 3EWZA 3DFOA 1KM0A 4YLWA 1H61A 5G1YA 1ZNNA 3W83A 4AHPA 3H54A 5LGXA 3C2EA 5DCDA 4NJIA 1QR7A 4MY8A 3ZWTA 3BARA 2WOQA 1MSSA 3NL2A 5HULA 4MJZA 1UJPA 3HGOA 1ICPA 3M41A 1WAUA 2JKEA 3GIYA 4KFOA 3T7VA 4HNTA 3PSVA 3FJLA 1PVNA 1Q6QA 4LVBA 4AXKA 3T44A 3FEMA 3TCEA 4XKYB 3LCHA 1KFJA 4CNOA 3HG3A 1KFCA 1ZAHA 2UV8G 3NPWA 3PS7A 1AK5A 1J4EA 1T8XA 2KZHA 2QKFA 2WPBA 4QQ3A 3LRLA 1I2NA 2A7NA 5DBUA 3IGSA 4O12A 1FXPA 1KFLA 1WBHA 1TTJA 5FEXA 1AW1A 3L5AA 1GYLA 3RF9A 1KV5A 2FPTA 4JTFA 5D2YA 1H7PA 2E5DA 3DBPA 4XBKA 5DY2A 3G1DA 4LRTA 5G5IA 4UFLA 2QCHA 3UNDA 4FIQA 2VEIA 1ZAIA 4FNSA 1XBVA 1KLZA 2V82A 3W70A 3HMJG 1U83A 4NZJA 4JR5A 4QJ1A 1QOQA 2V2DA 1OYBA 5LGZA 4YXGA 4QNWA 3DHDA 4FF7A 3VCRA 4R33A 3RK8A 4EIVA 3O07A 3QSRA 1YXCA 4PA8A 3U8GA 1PHWA 2VFIA 3SZ8A 4XBSA 1W5QA 1KTNA 2PRHA 1Q6OA 4O1AA 3W1MA 1L6WA 4UFMA 1OFOA 5DN1A 1GJPA 4LVGA 5LNVA 4I7WA 1CW2A 3FOKA 1F6KA 5HWNA 4QM1A 5EYWA 3FFSA 3G24A 3WJXA 2F84A 4I7VA 3LRKA 1O5XA 1VLIA 3S9YA 5I3JA 4HN4A 3W2KA 1BWKA 3IIOA 4ADTA 3G18A 4RK8A 3P84A 5D2XA 1HG3A 1UB3A 1XM3A 1VPXA 4J9JA 3UZ5A 2ISVA 2C16A 1N55A 3DFPA 3E02A 3MHFA 2WNNA 3B04A 3ABRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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