3IVUA

Homocitrate synthase lys4 bound to 2-og
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
401
structure length
386
Chain Sequence
SEANGTETIKPPPYGPNPSDFLSRVNNFSIIESTLREGEQFANAFFDTEKKIQIAKALDNFGVDYIELTSPVASEQSRQDCEAICKLGLKCKILTHIRCHMDDARVAVETGVDGVDVVIGTSQYLRKYSHDMTYIIDSATEVINFVKSKGIEVRFSSEDSFRSDLVDLLSLYKAVDKIGVNRVGIADTVGCATPRQVYDLIRTLRGVVSCDIECHFHNDTGMAIANAYCALEAGATHIDTSILGIGERNGITPLGALLARMYVTDREYITHKYKLNQLRELENLVADAVEVQIPFNNYITGMCAFTHKAGISTYEILKPEDFGMSRYVHVGSRLTGWNAIKSRAEQLNLHLTDAQAKELTVRIKKLADVRTLAMDDVDRVLREYHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure and functional analysis of homocitrate synthase, an essential enzyme in lysine biosynthesis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Homocitrate synthase, mitochondrial
molecule tags Transferase
source organism Schizosaccharomyces pombe
total genus 133
structure length 386
sequence length 401
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.3.14: Homocitrate synthase.
pdb deposition date 2009-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3ivuA01
1JCNA 3AJXA 2P0OA 1M6JA 2XN1A 1A5CA 1GG0A 2CLFA 2ZRYA 2DU2A 5IBXC 3QMTA 3C4UA 5D2VA 2JBMA 3CTLA 5F2MA 1ZCOA 5DELA 3GK0A 4XQ6A 3MUXA 3TFCA 1OF6A 1K8XA 3C3NA 3CM4A 3KRSA 3TC7A 5FEWA 1W37A 1GVQA 4ML9A 4IPJA 1TIMA 2ZA3A 3S0CA 2TRSA 1OFBA 1TV8A 1EIXA 4LT9A 4U28A 1GEQA 4DELA 4CCDA 2RH9A 3LM7A 4WOQA 6TIMA 2TYSA 3G22A 4IMDA 5EMUA 2QCMA 1SZGA 3MYOA 1NVMA 1JQVA 1TTIA 3ATYA 3HOJA 1Q6RA 1JRBA 1FUYA 2Y85A 3DGRA 1C9DA 4K7YA 5CPLA 1Y0EA 3VE9A 1KFBA 2ZZ2A 1R2RA 3K30A 2YR1A 4UTHA 3S5NA 4IMEA 2CU0A 3Q58A 5E0KA 1OX4B 3UWZA 4M19A 2QAPA 3CHVA 3W22A 3TSMA 1KLYA 5CZJA 4UTLA 2QUTA 4KWWA 4MJMA 1ONRA 2F84A 4ZQCA 1VCFA 3P80A 2QCDA 3DFQA 2QCCA 3N2XA 1F05A 4FNRA 1IXPA 3QH2A 4GWEA 1Z42A 4Y96A 1THFD 4N2YA 5J5RA 2EKCA 2E5CA 4FIRA 5D09A 4NJIA 3W7PA 3BPWA 3TCEA 4X9SA 1VCVA 4H6KA 1TB3A 1LZOA 2DJXA 3SFKA 4Z08A 3BO9A 1U5JA 3M1ZA 4CNOA 4QAIA 4UTTA 4NT0A 2H3BA 2ISVA 3NQ6A 5LNVA 3T44A 3HG2A 4GNJA 1W5PA 1P1XA 3A22A 3FA5A 3TQVA 3ABSA 3CIXA 2C1HA 3TMQA 2J9YA 3LHWA 4FHAA 4LRTA 5K9CA 3E12A 3NPXA 2NXHA 3S1UA 5G4EA 2ISSA 1A50A 5FEZA 3W87A 4IWWA 2V2CA 2YFNA 2Y7EA 3RF9A 2C3ZA 4GUGA 1QMLA 3IV3A 3M6YA 3UXDA 4DXVA 3L0GA 4OGZA 3ZWSA 5E1QA 3W84A 1LTDA 2Y7DA 4R34A 3S5YA 1XBZA 4Z0JA 5I3IA 3N3MA 2O7QA 4ZQMA 4JYFA 3GDLA 2RKXA 5AOUA 3PBWA 2A7NA 4DO6A 1SFJA 4N4QA 1WBHA 2NUWA 3HF3A 3O07A 2A21A 1G4EA 2E6YA 3F4NA 2B4GA 3W74A 2WKJA 3FLUA 1MSSA 3NPUA 4HSNA 5FI8A 3IGXA 4M7SA 1H7PA 5FF0A 3NPVA 4XTDA 4CQAA 4EVZA 1R2TA 4Y90A 1JCXA 5AHIA 5K7JA 2JKAA 1H7XA 3M44A 4UFHA 1I2RA 5F2LA 3EX1A 2Z2UA 2Y61A 7TIMA 4MZ1A 4N9CA 3PG8A 1ZHAA 3W1UA 4UTWA 2FIQA 3QM3A 2Y89A 3EKZA 5D30A 5C6MA 1TPDA 5BMWA 3UWYA 4XBSA 1K02A 3N34A 4UR7A 5CSRA 1HG3A 3MYPA 4LUIA 1ME9A 5G2IA 2CFFA 3ABRA 3NL2A 1L2UA 3NZRA 1KFJA 4AVFA 3M5ZA 1NF7A 4K36A 2YSWA 5K4ZA 5AHMA 2W79A 1QAPA 1VHCA 3P81A 5AB3A 4LY8A 3V1PA 2B7QA 2NXGA 4JTLA 2Y62A 4OU1A 1B57A 5F1VA 3NEVA 4QIUA 3VKJA 4E2BA 4I7VA 2YYUA 1WYIA 3ABOA 2QUVA 4DF1A 1GG1A 3IIZA 3TQ0A 3GAKA 3UWQA 2ABAA 4RCXA 4UNKA 5HWMA 2C15A 1OFQA 2Y88A 4RJEA 1PIIA 1GZGA 2YGYA 3IRDA 4N4PA 1FY6A 5D2YA 1X8FA 3BARA 4O4VA 4JY9A 1A53A 2J27A 2H3DA 2E6DA 4K39A 4DPPA 4ALDA 5CGQA 4Z1DA 3HQ1A 3W3OA 2ALDA 2PRMA 2ZTKA 4IPIA 4NXKA 1EWEA 2HTMA 3M9YA 1O60A 3W7QA 3W1XA 1JUEA 4O8RA 3M47A 2Q8ZA 1G67A 3W7LA 2QUUA 3GR8A 1MO0A 1ZENA 3S6DA 5G5IA 3NO5A 4PFMA 1TV5A 3A5VA 1UB3A 2ZZ7A 4KFPA 3NQGA 4OE7A 3C52A 1TPC1 2QJIA 5G2WA 3A24A 4EOUA 3H55A 2FDSA 1F76A 3LLFA 4DO5A 4KFNA 4RV8A 3NXFA 4O16A 2JK2A 2QDHA 4MOZA 5HR7A 2G5WA 1OK4A 4S2BA 3TROA 3KHJA 3BW2A 3A5FA 4XWUA 5SWUA 2JGQA 4DO4A 2RDTA 3P7YA 1N8FA 3WK2A 3DI1A 4JDBA 1TPEA 3F4WA 4JIPA 1WBJA 1IGSA 1H5YA 1VC4A 4UIOA 4M5PA 4OWGA 1R2SA 3EEGA 2Y6ZA 1H60A 5C54A 1CW2A 4NJKA 1SPQA 3SSJA 3C2EA 3USBA 3BV4A 5KMYA 3WJWA 3UZJA 1AW2A 1JCJA 4NNCA 2OJPA 4JS3A 1OYBA 1SUXA 1PS9A 5DXXA 5EL1A 3CU2A 3LBCA 4HKPA 4HN4A 1EPXA 3WJZA 4RZ4A 3KXQA 2ZZ1A 3BG9A 4TU1A 3T7VA 4AHOA 1J5TA 3DAQA 4WD0A 2VFGA 4PODA 3DFNA 5HWNA 3C6CA 4N9BA 3C2FA 3Q2DA 2B0MA 4KKXA 3W7EA 4O0ZA 3T40A 1EA0A 1VHNA 1T0OA 2CLIA 1OX6A 1K8YA 1VGAA 1QPNA 3DFSA 3UQNA 3PB0A 5HR6A 2XFWA 5DY2A 3QPZA 1H1YA 1A5SA 1F73A 3TXVA 3TDFA 4Y6GA 1JR1A 2QCHA 1C8VA 2Z6IA 5FEPA 1GVFA 3BG5A 5HUOA 2YZRA 2C14A 5CZSA 4LVDA 4X3ZA 1TTJA 3HIJA 5L6UA 4YCPA 3W7IA 3KVJA 1ICSA 1YTDA 4DF2A 1XXXA 2V5LA 5IM51 4QSHA 3CPRA 1SSDA 1MZHA 3IVSA 3PAJA 3IGUA 4O12A 2IQTA 1L6WA 3R13A 3YPIA 1B4KA 1TCDA 2LLEA 3C2VA 3JR2A 3N9SA 4MZYA 4ORMA 3PWAA 2OX1A 1GJPA 1KA9F 2X2GA 1YDNA 3TXZA 1GOXA 1W3TA 2CZ5A 4C1LA 5AHNA 3GDTA 1RD5A 3NQDA 3BGJA 5TIMA 4UTTC 2R14A 1KV8A 2WPBA 2YXGA 2C18A 3MI6A 3NOEA 1K8ZA 4AH7A 3IGSA 1UASA 1KM4A 1RV8A 3DKLA 4ZQNA 3OIXA 4BR1A 3EWZA 4JTUA 4DEFA 1LYXA 1W31A 1H7RA 5C5YA 1AG1O 3KFTA 4FIQA 3A23A 3W2NA 1F74A 2VENA 4P61A 2QJGA 4IMFA 3S1WA 4PTNA 1WXJA 2ZRXA 1HTIA 3PR2A 3W88A 3TH6A 4UFJA 4FO4A 1GVRA 3G0UA 5BOOA 3NAVA 4IX2A 5KSWA 1KW1A 1DVJA 1FWTA 3HGOA 2X30A 1OFEA 1XBVA 3C2RA 1SW3A 3PUOA 4O13A 1OYAA 4AWUA 2FPTA 1GYLA 1KFEA 3NQ2A 3DBPA 5H91A 4JTTA 4FX8A 4B5NA 1I8JA 4IUOA 1L6YA 3OHIA 3U2OA 5LZLA 5D38A 1YXDA 4WJEA 3TW7A 1I45A 2C19A 1WX0A 3FKRA 2ZZ3A 4O10A 2ZFAA 2FFCA 4AEOA 3PY2A 2A1YA 4JX6A 3TV8A 3NQFA 3LCXA 3MHUA 1ICQA 5LSMA 4NQ1A 2NV2A 5F4WA 4UTWC 3B06A 1EEPA 2H8XA 3E9AA 1N7KA 1CX9A 1SO6A 4JD4A 4KFOA 1LP6A 5DBUA 3N19B 3QYQA 1JCYA 3S9YA 1H50A 3OEXA 3QSTA 3QJAA 2QAFA 3LB0A 3THAA 4R53A 2EGZA 3GDRA 1W5NA 1Q45A 2CZFA 1XUZA 3TIMA 1F6KA 2Q3OA 5E93A 4RXGA 3B8DA 4LNYA 4N6FA 3M5XA 2CLMA 2WSRA 5AFDA 3NQCA 1YTKA 4TIMA 1NSJA 2X1SA 3KX6A 4HT3A 3CEPA 4MY9A 2C16A 1O4UA 4AB4A 4UNLA 3QFEA 4LVFA 1TRIA 5DCEA 1TPWA 2FQIA 3P74A 4K8HA 5D04C 5AC7A 3OBKA 1DOSA 4JX4A 4L4MA 2ZA2A 5BW6A 1Q3NA 1IXNA 2V30A 4UTIA 3QW3A 3LRLA 3A21A 1H61A 3EKLA 3FKKA 2YCEA 4UTKA 5AYXA 4MZ8A 1I4NA 1VR6A 3ZWTA 3MO7A 2DP3A 5G1TA 2RDUA 3EWWA 5F1UA 4ADTA 3F03K 3B0UX 3O63A 3MJYA 4MKNA 2NUYA 3W1RA 1TPFA 3HBLA 3KVKA 1I2NA 3PULA 2V8ZA 1T96A 3DZ1A 3W1PA 5CZTA 1QPQA 2H6RA 3EXRA 1SFLA 1RPXA 3EWYA 3S42A 1GQNA 3B04A 4Z1AA 5K3VA 2H90A 5G4WA 4J9JA 2Z1BA 1W54A 4O11A 4C1KA 5LGXA 5G1YA 2ZTJA 4JR5A 5LHFA 2E77A 3LXCA 5LHEA 1SO5A 3CLMA 3R5EA 3MBDA 4K8EA 2NLIA 2ATMA 1ADOA 1XDLA 3ANYA 2Y7GA 4O1AA 3ZFHA 2ZZ6A 1SW0A 2WOQA 2I14A 5FESA 4BI5A 3DU0A 4O18A 4LOCA 2GUUA 2DZVA 1TO3A 3L65A 2FJKA 3C61A 2X1TA 2C6QA 2TSYA 3W7NA 3L5AA 4DF0A 2HS6A 1XFBA 1OX4A 1ICPA 3TUUA 4GJ1A 1EUNA 2ATSA 2KZHA 5DCBA 3HB9A 3NQAA 3CC1A 2GVGA 1R46A 2G95A 4PA8A 5L9FA 1TQXA 4GXMA 5HULA 3TE9A 4FEZA 3FIGA 1YPFA 1M5WA 1S5TA 2A2IA 3CEUA 3W70A 6ALDA 1RQHA 4UFLA 4WUIA 3LOTA 1LLZA 4AF0B 1QPOA 3GB6A 2VFHA 1KBIA 3P67A 1LM1A 4HNTA 2GQ8A 3FYPA 3P62A 5D32A 1VZWA 4N9EA 2V82A 3STGA 3G1XA 4BF9A 1OF8A 4N02A 2DZPA 5DBTA 4A2RA 2NXIA 4MLRA 3DFTA 2CWNA 1NAL1 3DENA 1AMKA 4NX5A 4FNSA 3LGEA 4UR8A 1KV5A 3W7DA 4LS0A 4I9AA 1Q6QA 3FJ6A 4UMBA 1V7YA 4UTJA 2GJLA 4YXGA 3P8IA 3G1DA 4OBTA 1I2OA 1O94A 2J88A 5AHEA 5CKSA 2QCEA 1JUKA 2JKEA 3HPZA 3HG4A 4E38A 3QEZA 3MHGA 3KRZA 3U8GA 3BK0A 3P60A 1IF2A 1P4CA 3IIVA 5U7SA 5H2ZA 3I7SA 3GNDA 3IIOA 3RU6A 4IMCA 2OT1A 3BGGA 3QQ1A 1H1ZA 1LRQA 1LBFA 2I1OA 1KM3A 1MXSA 3QPYA 4GUJA 1W3IA 1Z44A 1LRNA 1KM6A 3L0KA 3UYCA 3W23A 1LROA 2Y63A 3UY7A 1DJNA 4NZJA 3LLDA 2R91A 4O0KA 1OJXA 5I3GA 2VC6A 1KM2A 1ME7A 2GOUA 2E6FA 4CLMA 4ONVA 3LCHA 4MJZA 1SR9A 4GUIA 5F2IA 5D2TA 3M5VA 4CQ9A 1GTEA 3M43A 4GBUA 3A9IA 1AL8A 5FF2A 1KBJA 4GE8A 2G97A 2VFFA 4YMZA 1W3NA 3UPBA 3HPXA 4ZVJA 5FF7A 1EP1A 5LGZA 1YLVA 4XKYB 3B05A 3LTSA 4UFIA 1TPUA 1F5ZA 4JNMA 3PUDA 1G4PA 3W7JA 3N14A 4YWIA 3GXPA 1PVNA 1JRCA 3UNDA 4R33A 2FPYA 4GFSA 1FWWA 3QC3A 4LV4A 2A85A 4HNVA 3THQA 4LS1A 1XBYA 3PS7A 1GVOA 4GRSA 4E0CA 5EBUA 1WDWA 4PC8A 3FOKA 2WNZA 2F7FA 1TSIA 1I2PA 1ZAHA 4PL1A 2J9ZA 4ICNA 3W1AA 3QSRA 3KRUA 5AC8A 1FXPA 3E02A 3TKFA 1B3OA 4OV4A 1H62A 1QOPA 4O15A 2ZA1A 1QWGA 2WSYA 2Q8LA 2QJHA 1RVGA 4MLJA 2V2DA 1G7UA 2WQPA 1U83A 3GAYA 3KVLA 2J9XA 2J6XA 3RK8A 3M16A 3NL6A 1DKWA 3NVTA 4RK8A 1LOSA 4O52A 4WXZA 2ZDRA 3O8AA 3VCRA 2YDAA 4PCFA 1XC4A 3E49A 3D0CA 4Z1CA 3UY8A 3HGSA 4A3UA 3W1LA 4JIQA 3QW4B 1FDYA 4OQVA 4GC4A 2J24A 1OVDA 2BX7A 1XL9A 2QEZA 5I3JA 2Q3RA 4ZQRA 3M41A 2QKFA 1KM5A 3WK1A 3NNTA 1X1OA 3GKAA 4IOTA 4CNNA 3F1QA 2FLIA 4YL2A 1DL3A 4XBKA 1F2JA 1NFBA 3LI1A 1LRTA 3W7KA 4QITA 2Z0IA 1DV7A 4JYDA 3O05A 5TBOA 3M7WA 4IXXA 3W2KA 4IJBA 5T26A 3EB2A 3OA3A 3N2MA 5I3KA 1B4EA 4MUZA 4N6EA 3LCGA 4GUHA 1MEWA 2R8WA 2XN0A 3HG3A 1F6PA 3STEA 1EP2A 4UTUA 2OCZA 1R30A 3W1QA 3LV5A 3BLEA 4P2VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GRI A;  2AQV A;  1JCN A;  4FLQ A;  2XN1 A;  1GG0 A;  1H41 A;  2CLF A;  2DU2 A;  3CS2 A;  2OSW A;  3CQH A;  3RM4 A;  3CPU A;  1OF6 A;  1K8X A;  1GVQ A;  3D47 A;  2ZA3 A;  2ON3 A;  4I9T A;  1CEO A;  3I4E A;  2O56 A;  1TV8 A;  3RXZ A;  4U28 A;  2HXU A;  3A47 A;  3NSM A;  4WOQ A;  4GX8 A;  3TYE A;  5EMU A;  1Y5W A;  2FH8 A;  2ZX6 A;  3MYO A;  4M81 A;  2PDP A;  1Y5X A;  1A5O C;  2WVV A;  3HOJ A;  1JRB A;  2GVY A;  2Y85 A;  4FPS A;  1O6I A;  1ISZ A;  2X40 A;  2NVD A;  3J7H A;  1CGT A;  1G9H A;  2CU0 A;  1I1X A;  3HFT A;  1XDJ A;  4K8G A;  3UWZ A;  3S9Z A;  4M19 A;  2BVW A;  4UTF A;  2QAP A;  4PE8 A;  2GJR A;  4MB4 A;  4UTL A;  4ZQC A;  4XD4 A;  5AY7 A;  3P80 A;  5M17 A;  1O68 A;  5DAN A;  3OLG A;  3DFQ A;  5BU9 A;  4Y96 A;  3UJ2 A;  2Z28 A;  4N2Y A;  4PFH A;  2RUS A;  3W7P A;  2J7F A;  1KR1 A;  1HQT A;  4D9P A;  1LZO A;  3N1A A;  5AZ0 A;  3SFK A;  3NQ6 A;  2BHU A;  2X7V A;  5LNV A;  1SVD A;  3N2C A;  2C1I A;  2C1H A;  1DED A;  3UJS A;  3CAQ A;  4FHA A;  3N25 A;  3E12 A;  3NPX A;  4Y9M A;  5C7H A; 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