3KAOA

Crystal structure of tagatose 1,6-diphosphate aldolase from staphylococcus aureus
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
325
structure length
325
Chain Sequence
SKSNQKIASIEQLSNNEGIISALAFDQRGALKRMMAKHQTEEPTVAQIEQLKVLVAEELTQYASSILLDPEYGLPASDARNKDCGLLLAYEKTGYDVNAKGRLPDCLVEWSAKRLKEQGANAVKFLLYYDVDDAEEINIQKKAYIERIGSECVAEDIPFFLEVLTYDDNIPDNGSVEFAKVKPRKVNEAMKLFSEPRFNVDVLKVEVPVNMKYVEGFAEGEVVYTKEEAAQHFKDQDAATHLPYIYLSAGVSAELFQETLKFAHEAGAKFNGVLCGRATWSGAVQVYIEQGEDAAREWLRTTGFKNIDDLNKVLKDTATSWKQRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of tagatose 1,6-diphosphate aldolase from Staphylococcus aureus
rcsb
molecule keywords Tagatose 1,6-diphosphate aldolase
molecule tags Lyase
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus mu50
total genus 123
structure length 325
sequence length 325
ec nomenclature ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2009-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3kaoA00
3DH7A 1GG0A 6ALDA 3TU9A 1WX0A 3GDKA 4DEFA 1M5WA 1TJRA 1FXPA 3T4CA 4MVAA 1YTKA 2YZRA 5DBTA 3FFSA 3HO8A 1ICQA 5C2XA 1TPUA 3UNDA 5D09A 1AL7A 4NJJA 4J9JA 3R12A 1OFDA 4OU1A 4ZMGA 3W1XA 4CCCA 1FDJA 1ZALA 3TE9A 1JCMP 4XZ9A 4I9AA 3TJLA 4NUWA 5AC6A 4L4MA 2ZZ1A 2GVJA 3QZEA 2CFFA 2PE4A 1F7BA 3HG5A 1WYIA 3G1DA 4MZ1A 4O28A 4O1CA 5L9FA 4UNKA 4YMZA 1P1XA 3KHJA 3DI1A 3PS7A 4GUGA 1W5QA 2ZRXA 2FIQA 2ABAA 1KM6A 3NDOA 4JY9A 1YPIA 2G5WA 5CPNA 2GJNA 3IIPA 1UUOA 5D2VA 2I1OA 4I7UA 3B0VC 1XCFA 3OVRA 2GQAA 3HPSA 2W79A 2Z6JA 4LU0A 2RFGA 1D3HA 1EX5A 1FXQA 3L67A 4E2BA 1G7UA 5F1VA 5KITA 4IWWA 1C29A 2HTMA 5A5WA 3O6DA 2Y70A 2R14A 1KM2A 2DZSA 1QNVA 4DPQA 3QMSA 3M43A 1GOXA 2C0AA 2D73A 1KV5A 5E1QA 2J27A 5EPDA 1SZGA 3O1NA 4O4VA 2B7NA 3M16A 2YYTA 4NVTA 3S1XA 2YYUA 4AXKA 3EKLA 5I3HA 3STEA 4MOZA 5KINA 3G8RA 3HMJG 3W2KA 1JULA 1DKWA 1TPB1 3SGUA 3LCLA 1GVSA 4JYEA 3B05A 1DBTA 1VS1A 2C3ZA 4LY8A 1I2NA 2OCZA 2ZTKA 3NOEA 4MY1A 1XBYA 4CNOA 3L5LA 2QCDA 1V7YA 1AMKA 1JVNA 1YXDA 4UMBA 4AWUA 4DBEA 4DELA 4JIPA 5DY3A 3GKAA 3TCEA 4FB7A 4N9BA 4ICNA 3GK0A 2ZZ2A 5D37A 4GC4A 1TB3A 3LV5A 3LCXA 4JTKA 5AFDA 2W0UA 2TPSA 4FIRA 2X2GA 3CT7A 1KTCA 1XFBA 1YTEA 3LB0A 3LHYA 3IIXA 2YXGA 2A2IA 2Y62A 4RCXA 4O1DA 5AOUA 1ICPA 3N3MA 5DXXA 4AF0A 5BMXA 3G22A 2DJLA 1SO4A 3E9AA 1P5BA 1KFEA 1IXNA 1H1YA 1S5WA 4N9CA 1XC4A 1MXSA 6TIMA 3C0JA 3QQ0A 4QSHA 4P2VA 1G6CA 4OQVA 4Q32A 1FWSA 1PIIA 3NQ7A 1VCVA 3KRZA 4IOTA 4K39A 1TV7A 3QRHA 4JTUA 1GEQA 2E09A 3I68A 3NQVA 1H7NA 3CB8A 1W5MA 3B4UA 5HINA 1GYNA 3BGJA 5DCEA 4ZVJA 3BV4A 4M7SA 2C18A 3P62A 1SPQA 4H6KA 1NF7A 5DLCA 3OG3A 3NM1A 4X3ZA 2VFFA 3DI0A 4GBUA 3HPZA 2WOQA 1I2RA 1UB3A 3LBMA 1LCOA 3NNTA 1PL9A 3W7HA 3IVSA 3LX9A 3M6YA 3T44A 3EWUA 4NU7A 1OFOA 4HT3A 2CZFA 4P61A 5I3JA 1DHPA 1SO5A 4FNSA 5I3KA 1LYXA 4HNVA 4GJ1A 1OK4A 1YLVA 4BR1A 4N2YA 4EWND 2E5DA 1RQEA 1PS9A 1OYAA 2YFNA 1W1ZA 5AHNA 1O60A 3SSJA 2XFWA 1BTMA 1FCUA 3NQEA 3DHFA 3KVKA 3MJYA 4WZHA 2V2HA 1B9BA 1SR9A 3EKZA 3HB9A 2VFIA 4LC6A 3W07A 4BFAA 4CCEA 5ABTA 3L0KA 3C4UA 2PRMA 4MLJA 2ZDRA 3UXAA 4FNTA 1Q6RA 1EEPA 4LVBA 4O13A 5HQEA 3G1VA 1AW1A 3L5MA 1XBXA 4UIOA 4PA8A 3CU2A 4UC5A 1JCXA 1H63A 2DZVA 4GUIA 3G1YA 4WD0A 4KFPA 1VR6A 4LC8A 1G7VA 3EX3A 3E96A 3W7MA 5HWNA 1CW2A 4JDYA 4BI5A 1TTPA 2ZBTA 3O06A 4N4QA 5AB3A 5CG7A 4AHQA 3IV3A 3MW7A 5LNVA 2DZTA 4KFNA 2NUWA 3SFKA 3QSTA 4NNAA 3TNOA 2VEPA 3TSMA 1OYBA 3NA8A 5FEWA 5I3FA 4ZQNA 3L0NA 4UFMA 1PHWA 4IMDA 3S6DA 4C1KA 4BWLC 3CQ0A 4Y6GA 3S5ZA 5CSRA 3VFLA 2P10A 1U83A 1W3NA 2ZCGA 2DP3A 3PB2A 3PBVA 2A4AA 4N4PA 4BI6A 4OV9A 3EX1A 2ZRWA 5EMUA 3ABRA 2ZRYA 3HGJA 3NL6A 5CGQA 2RKXA 2WPBA 3QM3A 3GAKA 2VKZG 3V1PA 1L6SA 2JGQA 4UTWA 4HPXA 1ZAJA 4IGHA 3S8HA 2O7SA 3EWZA 5LHEA 5DCDA 3FOKA 3P61A 5FEPA 3CEUA 5H2ZA 3QPYA 3T78A 4XWUA 1MEWA 5BRBA 3KXQA 3NQ6A 1TYGA 3C56A 3P8IA 4JS3A 3L0GA 4Y96A 2RH9A 1YXCA 5LNSA 3NZRA 2WNQA 3V75A 1JQVA 4WOZA 2J6XA 3HG4A 4K8HA 2WSYA 2GJLA 1VRDA 4NJIA 1TTIA 3BLIA 4CQ8A 1S3HA 3IVTA 4NJKA 4YCOA 3TUUA 3F4NA 1OG0A 3B8DA 5LNWA 1TTJA 4YWIA 4A2SA 5K7JA 4NQ1A 2R94A 1VCFA 1KTBA 1VPXA 2E6DA 4FEZA 3CC1A 3CWOX 4XBSA 4AHOA 2WO5A 2YGYA 3G0XA 1Z41A 1FQ0A 3USBA 3QW3A 5D05A 3RU6A 3C8FA 1LORA 3AO0A 4MY8A 4XTIA 3OVQA 3HF3A 1JCJA 3UZ5A 3W2JA 4KFOA 5AN7A 3PG9A 3GXPA 2A6LA 2H8ZA 4ZQMA 3H54A 2YW4A 3NQCA 4OGZA 4YXGA 1TTQA 1LRQA 3FLUA 3B06A 3BG9A 1U5JA 1OK6A 3DENA 2ISSA 2QCGA 4NNBA 1SFLA 4K37A 2YPIA 2P0OA 1FWWA 3GAYA 2DZWA 1VHNA 2XN0A 1JJKA 3WJXA 1AG1O 4WUIA 4ZQCA 3HQ1A 1A50A 5IBXA 4RR4A 1S5TA 3P82A 1W5NA 1K7EA 4R34A 5H91A 1JRCA 2ZRVA 1VZWA 1AW5A 4IMFA 2I9EA 3BW3A 2CLIA 4IMCA 1QO2A 3ABQA 4IX2A 3QSRA 1EUAA 2Z2UA 2FFCA 4RZ6A 3UXDA 5DBUA 4S2CA 3S5OA 4XQ6A 3N2XA 5LHFA 3G8EA 1RR2A 2ZRUA 3WJZA 1FCBA 3HOJA 1TIMA 4ZQRA 4Z0SA 2DZXA 2V82A 3UWWA 3LV6A 1GJPA 4FNRA 3JR2A 5D33A 5FEZA 3W1AA 3G0UA 1R46A 1TRIA 2YFOA 3LDVA 4JTJA 1DL3A 3GDMA 3NGJA 1T0OA 3QYQA 2CZ5A 4K38A 5E0KA 2Y6ZA 1G69A 3M47A 5U4NA 3O07A 3BG5A 4LRTA 4H4IA 4O10A 3EWXA 3QQ1A 2TSYA 4OWGA 5LGZA 1LOSA 3W87A 4JYDA 1OX5A 1ALDA 3SW6A 2G96A 3L68A 4TIMA 2E5CA 1NAL1 1W0MA 4WOQA 3C3NA 5HWJA 3UWVA 4BI7A 1O5KA 3IGXA 4IXXA 1KW1A 1WQ5A 2ABBA 2X1SA 3WK1A 1VLIA 2JKEA 2PURA 4RV8A 3W9ZA 4LVAA 1GT8A 1PHQA 3PG8A 4KWWA 3KAOA 4E38A 2E6YA 5CPLA 1NEYA 2QCNA 5LNUA 4LW7A 3DFTA 3NPWA 1ME8A 1W31A 4JNMA 1LRTA 5HJLA 1GZGA 3TW7A 3G1SA 2HS8A 3W85A 3A22A 3TFXA 1F2JA 3Q2DA 3MI6A 4GNJA 2QJGA 4CCDA 1YDOA 2DZUA 3TW6A 3L21A 4LUIA 4JDBA 1ZAHA 3TFCA 4IXHA 2VEMA 1HO4A 1E51A 2QF7A 1L2UA 2NWSA 2R8WA 3L5AA 1W5PA 2QCHA 2Y61A 1VYSX 1EPXA 4ZL1A 5HULA 3HPXA 1TQJA 1Z42A 4LVDA 2V2CA 1TPVA 2WQPA 3M44A 1GWJA 1QPQA 5K4XA 5LKYA 3HJZA 4I7WA 4UFHA 3R89A 1XUZA 1Q45A 3GNNA 4LVGA 1W56A 3IGUA 1SW0A 3S1UA 3RK8A 1KM0A 2CZEA 1GPWA 1WBHA 3W7LA 4MZ8A 2DU2A 4O52A 3P67A 5BOOA 1W37A 3TAOA 3GDTA 1A5SA 1WOAA 1RVGA 3E0IA 2QUTA 4OHQA 2NXIA 3G24A 1G4SA 4RJEA 3S9YA 3LLDA 2NV2A 1FDYA 3LRKA 2NUXA 4B5NA 4R7JA 4W9TA 1KA9F 2BXVA 1J2WA 3N19B 1VQTA 2V2DA 1OFBA 1WDWA 4KKXA 5D30A 1GTHA 2GOUA 1OFRA 1V5XA 3ANYA 3EXTA 4FXSA 1H60A 3O8AA 3L66A 1ZHAA 3W75A 1ONRA 2X1UA 4WY0A 4UMCA 4UTTA 2E5BA 1QPNA 3LCGA 4UTKA 2A85A 1WXJA 2FLIA 1X1OA 2CLHA 4ADTA 1A53A 5I3IA 3LHVA 2HSAA 4CLMA 1EA0A 3P8JA 4MYAA 4WQ6A 5DCBA 1H62A 2ZFAA 4O57A 4UTJA 4TMBA 4DBDA 1RPXA 4FX8A 3EX4A 2QAPA 3SECA 1QWGA 4M7TA 2CLLA 3MP3A 1GVQA 4MPQA 3W7RA 4FHAA 1IXPA 4DPPA 3STGA 4O0KA 3ATYA 1LOQA 2PCQA 4N02A 1IF2A 3TV8A 3W1MA 3LRMA 1JCYA 4NNCA 3EXRA 3DFNA 1WBJA 4NX5A 1R2SA 3NQFA 5KTLA 4NXSA 3W1TA 4GUJA 4IQLA 1I2PA 2J9YA 3H53A 2FB3A 3GYEA 2V8ZA 3LM7A 5KZMA 3RLVA 4AH7A 3DKJA 1H7XA 3GB6A 1UCWA 2FPVA 2Z1BA 3QEZA 2ZA3A 4JTIA 2C1HA 2EF9A 2Q3OA 2A5HA 4ONVA 3L65A 3W1NA 1UBSA 5G2IA 4YLWA 5D2WA 4Z1CA 3MI3A 3NPXA 4MFDA 2G97A 3CM4A 1N7KA 1ME9A 4Q4KA 1F6PA 3N9SA 5FI8A 2GQ9A 3HG3A 4H3DA 4RXGA 3W88A 5J5DA 3E49A 3QC3A 2FQIA 1MEIA 3W1RA 2LLEA 3PULA 4O1BA 4YCPA 1LOLA 3PUEA 3TXZA 1A5AA 3LCWA 4K7VA 3N34A 1Y0EA 1LP6A 3TR2A 4OBTA 1XL9A 2JGYA 1TCDA 3OA3A 4NZFA 2Y7DA 4UTLA 4XBKA 1WA3A 3P60A 2E68A 2EGZA 3LCHA 3QMTA 3W2LA 2V81A 3M1ZA 1JUBA 4IMGA 4LRSA 2C14A 2ZA1A 1G4EA 3A9IA 1PV8A 4JTEA 5EKYA 3NM3A 5CZ0A 5D32A 1TPC1 3LHTA 2G95A 3P7YA 4RXFA 4UTIA 4LS0A 3DU0A 3W1LA 3DFPA 1Q6QA 4UFIA 5F4SA 2J9XA 1F5ZA 4DO4A 3W7EA 2BLEA 2A6NA 3NAVA 2B7PA 3GDLA 3PBUA 5EA9A 5FF4A 2O7QA 2GVLA 2KZHA 4IPIA 4DF1A 3UWZA 4UTWC 4NT0A 3P5YA 4LV9A 5C6MA 2ZZ5A 1L6YA 4JYFA 1QFEA 2ZRZA 1LBLA 1I45A 3DFQA 3MI2A 4A2RA 3FIGA 3JS3A 3LXAA 1BKSA 4HNUA 3G18A 2X1RA 3S5YA 2Y7GA 4FF7A 4WX2A 4MJMA 4HKPA 1TPFA 3PAJA 1W54A 3U8GA 3CTLA 1OJXA 5LZLA 2PRHA 5K4ZA 1L6WA 3BK0A 3NQAA 3GR7A 3U2OA 4Z08A 3R8RA 3W7OA 3W83A 2A21A 3BGGA 3ABSA 1B4KA 1SU5A 1ZAIA 2J24A 2OT0A 1RQBA 1BEUA 1HL2A 1H5YA 5G4WA 3C2VA 3TIMA 1YXYA 3TQ0A 2WNNA 3UPBA 3FA5A 4A3UA 4IUOA 2EPHA 1FDZA 4DQWA 1I2OA 1KLZA 1TSIA 1KFJA 4MY9A 3M7WA 1SO6A 3O16A 1OHLA 2VFHA 3PWAA 1W8SA 2F7FA 3QPZA 4ORMA 3QW4B 3MBFA 1Q3NA 1VCGA 3W1UA 3JRKA 3FEMA 3N9RA 3Q58A 2OZ0A 2VC6A 4MUZA 3U6WA 5F2MA 2QCMA 2ZTJA 4D2JA 1GVRA 3UZJA 5FESA 3M5XA 3UY7A 3TXVA 2ZZ4A 3IVUA 3FJ6A 3KOFA 4EF8A 4GUHA 1F76A 3INPA 4JXCA 1SW3A 3SIZA 2X30A 3ZR4A 4JY8A 2NZLA 1K8XA 2TMDA 4LV4A 4JX5A 5IBXC 3TX9A 1EP3A 1F6KA 1A5BA 3PUDA 4YL2A 1HG3A 1T8XA 3PBYA 2VFGA 3TSBA 1K8ZA 4JX6A 4OV4A 4UCGA 4O14A 3EX6A 3P80A 3G1FA 4Q33A 5G2WA 2Y63A 3WJYA 1F74A 1ZY9A 2WSQA 1I2QA 1OVDA 3LI1A 2XN1A 4O16A 1OFQA 3MO7A 1XBVA 1RD5A 1QPOA 3PB0A 4RZ5A 4JR5A 3G1XA 3O15A 2NXHA 5FF0A 4R33A 1O5XA 3IEBA 4K6AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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