3KRSA

Structure of triosephosphate isomerase from cryptosporidium parvum at 1.55a resolution
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
SRKYFVGGNFKCNGTKESLKTLIDSFKQVESSNSEVYVFPTSLHISLVKEFFGNDHPGVFKIGSQNISCTGNGAFTGEVSCEMLKDMDVDCSLVGHSERRQYYSETDQIVNNKVKKGLENGLKIVLCIGESLSERETGKTNDVIQKQLTEALKDVSDLSNLVIAYEPIWAIGTGVVATPGQAQEAHAFIREYVTRMYNPQVSSNLRIIYGGSVTPDNCNELIKCADIDGFLVGGASLKPTFAKIIESAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of triosephosphate isomerase from Cryptosporidium parvum.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Cryptosporidium parvum iowa ii
total genus 99
structure length 249
sequence length 249
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2009-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3krsA00
4N02A 2F84A 2ZRXA 4IPIA 2J24A 3L5AA 1IIHA 4GWEA 2Q8ZA 4N9DA 4O15A 3GIYA 3LM7A 2PURA 3CB8A 5CSSA 3OIXA 1NSJA 1A5CA 5H2ZA 1AMKA 4LOCA 1XUUA 3DFPA 2C0AA 1GVRA 1TQJA 4O17A 2V81A 4OV4A 1FY6A 5DN1A 3P74A 1H7WA 1GOXA 1SSGA 1LLWA 1F6PA 2B7PA 2BLEA 3HPSA 3O6DA 1TQXA 4JTLA 2NUYA 4ONVA 1CW2A 1LOQA 4GE8A 1W5MA 2I1OA 4AH7A 4J9JA 4O11A 5EL1A 4P2VA 1K7EA 1R47A 4UTLA 2RH9A 5CPOA 1JCJA 2ZBTA 2TSYA 1H61A 3BG3A 3I68A 3OA3A 3QRHA 2QJHA 4NU7A 4NZFA 4TMBA 4JTHA 1VQTA 2OCZA 1Q45A 4R53A 3BLEA 3M47A 1G67A 4X2RA 3FFSA 1K8YA 5HUPA 1OHLA 4I9AA 4MKNA 5F2MA 3CC1A 1QOQA 1KW1A 3G1FA 5IBXC 2ZFAA 2AGKA 1UASA 2QCNA 4FNRA 1FCVA 3B06A 2XN1A 5C6MA 4O1AA 2WNZA 3SFKA 4UFHA 1W54A 4X22A 3G1AA 4M5PA 1LRQA 2QDGA 3K30A 1QFEA 4MPQA 3PF3A 4MY1A 1KA9F 2GVLA 5FEXA 1JRCA 4FHAA 4ADUA 2WOQA 5DLCA 2V2DA 3A24A 1TSIA 4GRSA 3PBYA 3LBCA 1BTMA 5G2IA 4AEOA 3JRKA 3W1PA 2YW3A 4IXHA 5AHMA 4ZMGA 2VFHA 3EEGA 3NPVA 1XBZA 3HG3A 1KM1A 2XN0A 1NF0A 5K2ZA 3I7QA 4IJBA 3NOEA 3NL6A 4LUJA 1DJQA 5FF2A 1JQXA 3KVLA 2HS8A 1H7RA 2WJZA 1QPRA 4JS3A 4POCA 5CPMA 3NR0A 1RQEA 2Z6IA 4OT7A 3TV8A 5F1UA 3QFEA 1ZY9A 4MLRA 3BG5A 1W0MA 4RLIA 4DPQA 4GUHA 3B8DA 5D2TA 4JY8A 2ISSA 1H51A 2A1YA 3OVQA 1AW1A 4IWWA 5G2WA 3TX9A 3GAYA 3IIXA 3UPWA 5BMXA 3R12A 4GJ1A 2A7NA 4K6AA 1K8XA 3IGXA 4K39A 3TW7A 1SR9A 3W22A 1W3TA 2Y88A 1YTEA 2YPIA 3EWWA 3WJXA 3P82A 1SFJA 2FB3A 4UMCA 2W79A 3RFAA 1PL9A 3ZR4A 4MYAA 5F2LA 3ZWTA 1WA3A 3O15A 5D05A 4NQ1A 3INPA 2ZZ5A 3C2EA 3W7QA 3ABQA 2V5LA 1MEWA 2I14A 1JCXA 2QR6A 5DY2A 3CIXA 2BX7A 2O7SA 4LU0A 4QIUA 3W83A 2VEPA 3W86A 3WK1A 3HG2A 3DU0A 1WX0A 4NZJA 1W5OA 1O4UA 2FQIA 2Y7DA 4LV4A 1O94A 3FS2A 3LI1A 4UNLA 1Y0EA 1LOLA 3FKKA 1SU5A 3NGJA 3OBKA 4HHPA 3IIZA 1ICPA 2A21A 2AQWA 4BI6A 3MO7A 1YDOA 3N14A 1IIGA 5AFDA 1IXNA 4FX6M 3PM6A 2ABBA 2V5BA 3WJWA 2OX1A 3IEBA 3RF9A 2GQ8A 2WO5A 2X1SA 3GDLA 2H90A 1YDNA 5LNVA 3S5OA 3G8RA 3HBLA 3OHIA 4HNVA 2BXVA 1LLZA 2ISWA 2E6FA 2DZSA 3LHYA 3HOJA 1GVSA 2E6AA 2YFOA 3S1XA 3QPZA 3NQEA 1VJIA 2Y89A 3DI0A 3EX2A 5E0KA 4U4MA 3IGUA 1K8ZA 3MHUA 1SZFA 3LERA 1OYAA 3NL5A 3HJZA 3SZ8A 5BOOA 4FXSA 1TMHA 4O19A 2P0OA 4GNJA 1D9EA 4GUJA 4NX0A 4UTKA 3DFSA 4XTDA 1O95A 4XKYA 1XCFA 1XBVA 3WFAA 3TJLA 3MW7A 3MYOA 4LVDA 2XN2A 3LLDA 3P62A 3CM4A 4O52A 5KMYA 4BFAA 4MIMA 2W0UA 5H91A 1OYCA 4NXKA 1UBSA 2IQTA 2R14A 5CG7A 3TFCA 5I3JA 4HN4A 4A22A 2NV1A 1Q6LA 3DKJA 4LVAA 2QAFA 2ZA1A 4IMEA 5I3IA 3W7JA 4AMAA 3DH7A 4DO6A 3TIMA 2C15A 3I65A 2C18A 3TSMA 2WSRA 1HFBA 4UTTC 2FIQA 3L0GA 4WQ6A 1I2RA 2RDWA 2G95A 3A21A 4O4WA 3QJAA 4MJMA 1I45A 2QDHA 3BW4A 3PUEA 1JULA 4X3ZA 1WV2A 4WJEA 1GYNA 4HNTA 4N2YA 4UTWC 1SZGA 3NXFA 3ANYA 3S5YA 1GVQA 2VFEA 2FPTA 2HSAA 3UZ5A 3W7HA 2ZDRA 4NNAA 4NX5A 4L4LA 3HGSA 4E38A 4AWSA 3TH6A 2PRLA 4UIOA 1JCMP 3TMLA 3TSBA 3W71A 4CLMA 1VR6A 4A2SA 3UWWA 3TXZA 1T99A 1BWKA 3W6YA 2ZA3A 3W1RA 1UB3A 4ZZ9A 3L5LA 1HUVA 3G1HA 1SPQA 3LRLA 4CQ9A 8TIMA 3CTLA 3LGEA 3KOFA 2A6NA 2NXIA 4NVTA 2BZNA 1W3NA 1MZHA 2TMDA 3LHZA 4O53A 2VFGA 3W1XA 3QYQA 4DEFA 2QKFA 3CQ0A 2ZQ0A 4ZQMA 1R2TA 3W7LA 2RKXA 4UFMA 3C8FA 4QQ3A 3W7CA 1ZAHA 1F76A 5HMSA 3USBA 2VFDA 1OFDA 4UR7A 1LCOA 4LVBA 3C0JA 1QPQA 2ZRZA 3RLUA 4XWUA 3THQA 2WSQA 4TIMA 5AHEA 5LNSA 1RQHA 1VYSX 3RLVA 5D30A 2PC4A 1OFEA 1H5YA 1F05A 5D03A 3LB0A 5FI8A 5I3GA 3V75A 3SR7A 2QJGA 2FPVA 1HG3A 2UV8G 3TW6A 5ABTA 4RR4A 1JCYA 1P0NA 2ATSA 2A4AA 1OYBA 5EKYA 3GXNA 2YX0A 4HT3A 2DORA 5K4ZA 3NYZA 1J5TA 1KFJA 1Q6QA 1FWSA 1X8FA 4L4MA 4HSNA 4MOZA 1GPWA 1B57A 2H3BA 2C6QA 1WOAA 3DI1A 3UWUA 4OQVA 4FIRA 4JN6A 3I6RA 3KHJA 3E02A 1KBIA 2KZHA 3GK0A 3E96A 4NJIA 2V2HA 3H53A 5DCDA 2DU2A 2C13A 4Y9AA 1W1ZA 2GPTA 3HG4A 1I8JA 4QNEA 1A5AA 3W7KA 5CPNA 3UXDA 4UC5A 3T55A 3NQ6A 1LBMA 1C29A 4O12A 1F73A 1THFD 2VEIA 2NXHA 2Y7GA 2X1UA 3CHVA 2QCGA 1H7NA 3L0KA 3SW6A 4UTWA 1ALDA 2HTMA 1U5JA 3NQ2A 3KXQA 1Z44A 3A23A 3ABSA 4WOQA 4BI7A 3EKZA 1KM4A 2YDAA 3W2MA 1P5BA 1XBYA 3TAKA 3M41A 3L2IA 3UPBA 4M19A 4RK8A 4MVAA 3SGZA 5BRBA 2QCDA 1EWEA 4O10A 1NAL1 5LZLA 2A85A 3E12A 3RK8A 3LCXA 3IIOA 4LV9A 1KTBA 3LCHA 3NM3A 1OFPA 4M6VA 5A8GA 4WY0A 2DP3A 1L9WA 2A7PA 3P60A 3STFA 4Y90A 3L68A 1X1OA 2Q3OA 3EX6A 2QCFA 4U28A 5HULA 4DQWA 4JEQA 5IM51 3MP4A 3R8RA 2E5BA 3LCLA 4LS0A 1Z41A 5FEWA 3MI3A 3NQGA 2ZTJA 5C54A 3EXSA 3UZJA 3LTSA 3IV3A 2NX1A 4OWGA 2BSLA 2H8XA 3UWVA 4MLJA 4YL2A 3W7EA 1FUYA 2FDSA 2LLEA 1TV5A 5C5YA 3W2UA 4N6EA 4DPPA 5D38A 3KRSA 3W2LA 1ZENA 1G4TA 3C3NA 3RU6A 2B0MA 4MFDA 5HWNA 2Y7EA 3NM1A 4UFKA 3NPWA 1N8FA 3VE7A 3IGSA 3OVPA 1K02A 1SZEA 3C2FA 4O54A 3DKLA 4LT9A 5FF0A 4X9SA 1VPXA 3W75A 3G3MA 5FF3A 5HUOA 1H7OA 5E93A 3WK3A 3G1XA 2FJKA 1SQ7A 3GXTA 5KINA 4MFEA 5K9XA 4UTMA 3QQ0A 3DFTA 4RZ6A 2Q3RA 4EIVA 4G1KA 4FO4A 4IX2A 4FXRA 5D02A 3UD6A 1DHPA 3FIGA 4Y6GA 2J88A 4M6QA 3FJLA 1QAPA 3CPRA 2Z0IA 1UUMA 3EXRA 3LV5A 1LTDA 4IQLA 3EKLA 2DZVA 1PHQA 2EHHA 4C1LA 1VCVA 3GZ3A 4GBUA 5EPDA 1EP3A 1GVOA 1DVJA 4NXSA 2VOMA 1TV8A 5K9DA 1QDSA 3PBWA 4JTEA 2GQAA 3BARA 1G7VA 2I9EA 4S1FA 3TMQA 1TPUA 4IMDA 3BPWA 4WXYA 2CU0A 3WK2A 1SO3A 1ZALA 1T96A 2OJPA 1FCQA 1SUXA 2GVGA 3GLCA 4Z0JA 3GKFA 4ADTA 1JRBA 2E5DA 4JX6A 3F03K 5LGXA 4HIBA 2BWGA 4LWWA 4Z1CA 4S2BA 3TR2A 3C6CA 1LOSA 3NNTA 4XBKA 2ZA2A 4O16A 1ZHAA 3F4WA 1L6SA 3TNOA 3UQNA 4A2RA 3C2RA 1KTNA 4XUGA 1KFBA 3T7VA 3PULA 1LZOA 4K38A 2R94A 3OVRA 4YXGA 5AC6A 2OT0A 2G96A 2E77A 3EWYA 3HF3A 3N34A 1H60A 4RKAA 4MUZA 1A50A 1N7KA 2C16A 1KFEA 3CWOX 1MEHA 1YADA 3FEMA 3L66A 1FXQA 3PUOA 3VNDA 2CLKA 1ZCOA 4A21A 1H1ZA 1KM2A 2VELA 3ABOA 3WJZA 1FCUA 3N3MA 3M5VA 2NXGA 5D04C 5FF4A 3RMJA 1GVFA 4AVFA 1SW7A 4CNNA 1T0OA 2FLIA 4LC6A 2TRSA 4FX7A 1LBFA 1PCKA 4LUIA 3GDKA 1FDZA 4M6PA 1LYXA 4DO4A 2ZTKA 3DBPA 2QAPA 1QO5A 3N19B 3LCGA 3PB2A 2NWRA 3UY7A 3LRMA 3Q94A 4CCDA 3E9AA 3HGOA 4QSHA 4LRSA 1JCLA 1YDVA 1ML1A 3PG9A 3HPZA 1P4CA 4GUGA 2C1HA 1H1YA 3QMSA 3QEZA 4BF9A 3LXAA 1KFCA 4QJ1A 2E09A 3O63A 3NDOA 4Z0SA 3M7WA 3TXVA 2ZZ6A 3GR8A 4JIQA 2BTMA 2GQ9A 3FYPA 3PBUA 3U6WA 2RDUA 3S1UA 4IOTA 3M6YA 2ZRWA 3LI0A 1OFRA 1FWRA 3O1NA 1KV5A 1B3OA 2QF7A 5FEZA 5LSMA 3IIVA 5IBXA 2FFCA 3M43A 3S9YA 1S5WA 4MZYA 3VKJA 4DXVA 1YTKA 1NVMA 2O7QA 3ZFHA 3O16A 3C2VA 4RXFA 4EF9A 1J2WA 1LRTA 2Z1BA 3IVSA 1QCWA 2V30A 1TPVA 2QUTA 4M7TA 5I3KA 4JY9A 1BWLA 2JBMA 3LCWA 2X1RA 5AYYA 3R5EA 2CLIA 1TPB1 2CZFA 3B0PA 1BKSA 2RHGA 3T40A 1ADOA 5F1VA 5BNKA 1VC4A 2E68A 1QMLA 1KBJA 3G1SA 5AOUA 4BI5A 5KSWA 3ATYA 3TUUA 1W31A 4K7YA 2DZUA 5FESA 5G5IA 3C2OA 4AF0B 1AG1O 5D2XA 4UMBA 3O07A 1X6UA 4BK9A 2DJXA 3BVJA 1DQWA 1W5QA 3QSTA 4JGDA 2Y61A 3F1QA 3LXBA 3W1QA 2JGQA 4Y8FA 4NUWA 4AXKA 4TO8A 3NQDA 5C55A 2ALDA 1F2JA 1ICSA 1EWDA 3W76A 2PE4A 1AW2A 4K37A 3GKAA 4ZQNA 3PG8A 4NJJA 4O18A 3TK7A 3FOKA 1KM0A 1TCDA 4MYXA 3HGRA 1SFLA 2Y70A 1GG0A 4YLWA 1I2NA 5TQLA 3W73A 4NJHA 1VHCA 3NL3A 4TU1A 5SWUA 4RX0A 3TCEA 1UJPA 2ZZ2A 3QW4B 1QPOA 2YSWA 3GXPA 5DXYA 3PUDA 4DBDA 3H55A 3W1AA 4IX0A 1KLZA 3A5VA 4O28A 2NX9A 3W85A 6TIMA 3M16A 3C61A 4O57A 5LHFA 2WPBA 1GTHA 3TSDA 1W3IA 3NEVA 4WUIA 1LRNA 2TYSA 4R7JA 4ORMA 1IXPA 1K03A 3C52A 1TPC1 3W2KA 3C56A 1IF2A 3PSWA 1R46A 4JTSA 4N4QA 3S1VA 1OX4B 3KAOA 4OE7A 3M5YA 2B7OA 1MO0A 4JXCA 4A3UA 3PSVA 1R2RA 1GYLA 1CI1A 2NV2A 1NF7A 3QMTA 1F5ZA 2QCEA 1RD5A 4WY0B 3W74A 1YTDA 4PTNA 4LW7A 1XDMA 3W70A 2NZLA 3I7RA 3ATZA 3LLFA 4IXXA 3MBFA 5GVJA 3DXIA 1SW3A 3GNNA 1DKWA 5CZSA 1R30A 3IVUA 4OV9A 1XL9A 3A9IA 2YR1A 4UCGA 1O5KA 4KFPA 2QUUA 5G2HA 1NEYA 3M5ZA 3P7YA 1PS9A 3E0IA 1TPFA 3W07A 3OG3A 3P8IA 3TQ0A 2Y6ZA 1HO1A 4S2CA 4QNWA 2YCEA 2QCCA 1QOPA 1N55A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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