3KRU | Genus

Total Genus 128

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	128
sequence length	335
structure length	335
Chain Sequence	SILHMPLKIKDITIKNRIMMSPMCMYSASTDGMPNDWHIVHYATRAIGGVGLIMQEATAVESRGRITDHDLGIWNDEQVKELKKIVDICKANGAVMGIQLAHAGRKCNISYEDVVGPSPIKAGDRYKLPRELSVEEIKSIVKAFGEAAKRANLAGYDVVEIHAAHGYLIHEFLSPLSNKRKDEYGNSIENRARFLIEVIDEVRKNWPENKPIFVRVSADDYMEGGINIDMMVEYINMIKDKVDLIDVSSGGLLNVDINLYPGYQVKYAETIKKRCNIKTSAVGLITTQELAEEILSNERADLVALGRELLRNPYWVLHTYTSKEDWPKQYERAFK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Thermoanaerobacter pseudethanolicus atcc 33223
publication title	Biocatalysis with thermostable enzymes: structure and properties of a thermophilic 'ene'-reductase related to old yellow enzyme. pubmed doi rcsb
molecule keywords	NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase
total genus	128
structure length	335
sequence length	335
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date	2009-11-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3kruA00

4A3UA 1N8FA 1EP2A 1XL9A 3LRMA 4BFAA 4RZ5A 5LZLA 2WNNA 4O4VA 1S5WA 2GJLA 1DQXA 2P0OA 1SU5A 5AHFA 3G24A 2W79A 4MKNA 1UUOA 5K4XA 4GUFA 3HO8A 2QJHA 3VKJA 1WA3A 3WJSA 1QCWA 3PG9A 4GNJA 1FWSA 3V1PA 5KSWA 2X1UA 1VHCA 3DFTA 3TX9A 2CLKA 2FB3A 2B7PA 4A2SA 4FX6M 2ZDRA 4KFPA 4WY0B 1X8FA 3CIWA 3MUXA 1OX6A 3MJYA 3UD6A 1LYXA 1G69A 2OCZA 2VXNA 3KXQA 4IX2A 4UTUA 1I2NA 1VCGA 1BKSA 1H7OA 1JCXA 3TR2A 4EF9A 1VYPX 4FXSA 3S1WA 4QAIA 3FEMA 5HUOA 2OX1A 3NZRA 5I3JA 2VFIA 1M6JA 5CZ0A 1RQHA 1K02A 4PA8A 5HQEA 5IM51 5FEXA 3UY7A 4N9CA 2IQTA 3NQMA 4FNQA 3M1ZA 4N02A 3NVTA 1YDNA 4AHQA 4HKPA 1DV7A 1GG0A 4YMZA 2DJLA 3LBCA 4N4PA 1ML1A 2E5BA 1NFBA 2CWNA 2ZTJA 3L5AA 4WJEA 4QJ1A 4JTLA 3MBFA 1G4PA 4JTTA 4O15A 2CFFA 4JX5A 1LZOA 4AB4A 4GC4A 1TTIA 3THQA 1J4EA 3PBWA 4NJJA 3USBA 3PWAA 1W8SA 2WKJA 4GXMA 1HL2A 3W84A 5H91A 3GDRA 1WOAA 4IQLA 3SW6A 4LRSA 3W1XA 1LOLA 1PCKA 1B3OA 5LHFA 3L0KA 5EBUA 1ME7A 1W5OA 1GTHA 3SECA 3PSWA 3KVKA 4I9AA 3FIGA 2Q3OA 4RV8A 3WK3A 4DO4A 2BX7A 4JDBA 3ZWTA 3M5ZA 2X2GA 3KRZA 4AXKA 3EX2A 4NXSA 2X16A 1F05A 3JRKA 1GVRA 2BZNA 1TV7A 4KKXA 4H6KA 3TA6A 2WSYA 1SZEA 4LVGA 1QNVA 3G0UA 3SI9A 1FXQA 1YPIA 2H8XA 3HPSA 2CZDA 2BTMA 4NJGA 3IGUA 1ICQA 3NQEA 1S5TA 1JCJA 1TCDA 1PL9A 3SZ8A 5H2ZA 3E9AA 3M43A 5AHIA 5F4SA 2ZZ2A 1TV5A 3FJ6A 3CTLA 3VFLA 3P7YA 4Z1BA 3NNTA 2GQAA 4MY1A 1NSJA 2ZQ0A 1OABA 3HB9A 4X9SA 2ZZ4A 1LOSA 2A7PA 3EXSA 2GUUA 1YTEA 2J24A 4IX0A 3UPWA 1FBAA 2QCHA 4AH7A 2VC6A 3SR7A 1XC4A 2ISWA 2YGYA 1DVJA 4IGHA 4O18A 1GEQA 3BGGA 3NPXA 3TE9A 4QIUA 4PTNA 1YPFA 2G97A 1QPOA 4ZL1A 4TMBA 2ZZ5A 4JTHA 2E6YA 5CPLA 1AG1O 5C5YA 3LHUA 5AN7A 5HWJA 1WBHA 3STGA 5C55A 5AB3A 5BOOA 3DFPA 3N9SA 3W2KA 2E6FA 4GE8A 1L6WA 3W2JA 3C2VA 2EHHA 3NQDA 4P61A 2WSQA 5C6MA 2NWSA 3W1RA 1HO1A 4NNBA 5D2WA 5G1YA 1N7KA 1TYGA 4PL2A 5DELA 4CQAA 4FXRA 3SSJA 4XZ9A 4Q33A 4H3DA 3M6YA 1GVOA 3A24A 3B0UX 4P2VA 3W72A 3G1VA 1ALDA 1OFEA 1LP6A 3E96A 3K30A 2ZFAA 4GUJA 4MLJA 2YCEA 3LDVA 4UTJA 1H5YA 3CWOX 3BG3A 4XTIA 4DO5A 3UWZA 1Q6OA 1FDYA 3GAYA 1R2SA 5DXYA 4JD4A 1FCUA 3QRHA 4WD0A 1EA0A 3NL3A 3G1HA 1KM2A 3WJYA 4A22A 3B04A 1ADOA 3LERA 3W73A 4JTIA 2V8ZA 2DZTA 1O5KA 3KVMA 3NQ2A 3IRDA 4O57A 3KVLA 3W07A 2DZUA 2ZRZA 3C61A 3G1FA 1LRQA 2CW6A 5D04C 1W1ZA 3CHVA 3C3NA 4O28A 4XWUA 2R94A 2CZ5A 2JKEA 1ZALA 4C1KA 1FUYA 3GDKA 1TPB1 2C1HA 3DFQA 3G3MA 4ADTA 1KBIA 2E68A 2R91A 4GJ1A 4ADSA 3LHZA 4FIRA 1SO4A 2FIQA 2V0TA 4UMCA 3B0VC 1Q6QA 1L6YA 2KZHA 4UTMA 2QCGA 4E0CA 3W2NA 4NXKA 2A6LA 1XUUA 4TMCA 3C8FA 5LGZA 2ZA1A 4M6QA 1B9BA 4LVFA 3RFAA 1HTIA 3A21A 1VLWA 1KM3A 3C0JA 3PB2A 4AHOA 4GBUA 2QCNA 4DF2A 3C56A 1RVGA 3GKFA 2FPTA 4L4LA 3DU0A 4IPIA 3HG3A 2XN2A 4IWWA 4UR8A 4ZQRA 1B4EA 5HUPA 4JEQA 3LI0A 1Q3NA 2RDUA 3HG4A 5D05A 3LHTA 3NA8A 4PEKA 3GXTA 3TMQA 2ZZ1A 5C54A 3TAOA 2NUXA 4TR9A 2JK2A 3LHWA 3VI2A 2TMDA 1QFEA 2NXIA 5U7SA 4ALDA 2YFNA 3GR8A 4IMFA 1WBJA 1TTPA 4DEFA 3FYOA 3TFXA 2Y70A 3NG3A 1ZAIA 3W22A 1U5JA 2A6NA 1TJPA 5DCBA 2CZEA 5HR7A 3NQCA 5D02A 3P81A 5HMSA 1Q6RA 1SO3A 3W7RA 3NM3A 4CNNA 4UTIA 4ZQOA 5AC6A 4O19A 4EOUA 1W5PA 2HS6A 4HNVA 1G4SA 3L0NA 1B4KA 3KRSA 3Q2DA 1JCNA 3ELFA 3QEZA 3IEBA 1TIMA 1ICPA 3QW3A 3FS2A 4EVZA 3QPZA 2RFGA 1JVNA 3W7LA 3GIYA 4E2BA 1TV8A 5G1TA 3TK7A 3EWZA 3M9YA 3LCGA 4NJHA 2NWRA 3LTPA 3HJZA 4UMBA 3NZ1A 2I14A 2JKPA 5F2GA 1QOQA 3W7OA 2A7NA 8TIMA 5BMXA 3TNOA 3A22A 4M7TA 5D33A 2YPIA 3OVPA 4AHPA 4UFMA 2DZXA 3MYOA 3LXAA 4O8RA 1JQVA 2QCDB 3QC3A 4LS1A 3EXTA 2RH9A 3QMTA 5ABTA 1XBVA 2QUTA 3W23A 2EGZA 4NX5A 1SO5A 4UC5A 1AL8A 4K6AA 1IXQA 2G95A 5I3HA 2Y7DA 4MIMA 2TSYA 4O52A 3WJWA 1D3HA 1I45A 1JCYA 4W9TA 3ATZA 3ATYA 3A5FA 3NL2A 1WXJA 3B03A 3L66A 2AQWA 3S42A 1A50A 2DZVA 5EL1A 1V5XA 2Q8ZA 5FESA 5EA9A 1MO0A 1IXNA 2NX3A 4N9BA 5FEWA 3HPZA 4K36A 4O53A 1JCLA 1JR1A 1GVSA 3WK0A 3QQ1A 2J88A 2H6RA 4LRTA 2QCDA 5CG7A 3DZ1A 3E12A 4UFHA 5G2IA 4JN6A 3A23A 4NJKA 4MZ8A 5BMWA 3W74A 1BWLA 4NNAA 3LLDA 2RDWA 3LOTA 1KTBA 3G0SA 1Z42A 3T40A 4FO4A 1MZHA 1G6CA 4DPPA 1T96A 3DXIA 3P74A 5D2XA 5D2YA 4MVAA 3TU9A 3CU2A 3I7SA 4O16A 4M19A 4ZQCA 1G7UA 3QZEA 3BPWA 1M7PA 1OFDA 3P60A 2VFFA 1ONRA 4NX0A 3TC6A 3CM4A 3STFA 5HWNA 3N19B 2DJXA 3BVJA 3PB0A 3CEUA 3Q94A 1XUZA 2R8WA 5F4WA 1FQ0A 5D32A 3O06A 3W76A 1PCWA 2J9ZA 1OFPA 1YXYA 1KLZA 3G1AA 1FCVA 2NZLA 3LCIA 3W7KA 2NUWA 2VOMA 3M41A 2A4AA 1RQEA 4Z1AA 2Y7GA 1LDCA 4WZHA 2C18A 3UZJA 1FWWA 5G5IA 2JBMA 4CNPA 2C15A 3HF3A 1P4CA 4WUIA 5CKSA 1MSSA 4UUIA 3IGSA 1TREA 1PS9A 1ME8A 3NPWA 1XXXA 1NF0A 1GVFA 3BG9A 3I68A 5AHNA 1TPC1 4JTJA 4UXDA 3RU6A 1MEIA 3HGSA 3NPUA 4QITA 1W3IA 3DAQA 2HSAA 1JUBA 2V2HA 3BARA 2PRHA 2A21A 4FNPA 2DZSA 4M6VA 1A5CA 3GYEA 2X1RA 3HBLA 3PULA 3FLUA 2Z1BA 4BWLC 2WSRA 3BW3A 5LNVA 3B05A 3IIOA 2BXVA 3JS3A 4AVFA 5I3IA 1G67A 3EX1A 1JCMP 1H61A 4HSOA 3HQ1A 4O1AA 2Y7EA 1RR2A 3NOEA 3TSBA 3HPXA 3S9YA 3BLEA 3LM7A 4WY0A 4UNKA 4G1KA 3QFEA 5FF7A 1BWKA 2I9EA 3C2RA 3ABOA 2H8ZA 3P67A 3QQ0A 3PUEA 1CW2A 4OE7A 3I65A 2E77A 1GVQA 4RZ4A 3B8DA 1L6SA 4MYXA 5K7JA 3FFSA 1AW1A 1W54A 1SFLA 5K9DA 5AFDA 2C16A 1Z48A 1Z41A 2FQIA 2Z2UA 1CI1A 4RK8A 1UB3A 1M7OA 4ONVA 4YWIA 1H7XA 1OK6A 1PV8A 3TIMA 3O15A 2D73A 2OZ0A 3E49A 3LI1A 4JIPA 4O10A 4FF7A 1DKWA 3S5NA 3S5OA 2W6RA 1WDWA 3PBUA 2CU0A 5G2HA 3N3MA 1K8YA 1EB3A 1DOSA 3EB2A 1AK5A 4KFNA 3TXZA 4EWND 5LNSA 4IMDA 1PIIA 2WNQA 2H3DA 4UR7A 1SZGA 5CGQA 1XBYA 1IIHA 2HS8A 4HHPA 1OF6A 3EEGA 3P5YA 3NEVA 1KM4A 4ZQPA 4POCA 1GZGA 1KLYA 1LM1A 1W3TA 1OYCA 4DQWA 2QR6A 4FX8A 3PBYA 3G3DA 3PR2A 1KM1A 4FNUA 2ZYFA 4MFDA 1JUKA 2TYSA 1I8JA 3P5ZA 4EF8A 3NGJA 4FEZA 2EF9A 4EIVA 2P10A 3LHYA 4PODA 4RCXA 1OF8A 3NO5A 4NJIA 2WJZA 4UFKA 2QCFA 4FB7A 1JJKA 4WX2A 3UWQA 4ICNA 5FF2A 4XUGA 1GT8A 4K37A 4YCPA 4N6EA 1W56A 3W1AA 4O0ZA 1QWGA 1SUXA 2YXGA 3LRKA 3WK1A 2OMAA 2QUVA 1H51A 2J9XA 3QPYA 2YX0A 4RX0A 1EP1A 1R46A 4ML9A 3LTSA 3QJAA 3QW4B 3NQ7A 5CZTA 4O54A 2RKXA 3GB6A 2PRMA 4ZMGA 5KZEA 1OJXA 4NUWA 3IIXA 4N6FA 4JGDA 1OK4A 5BNKA 3R5EA 1I2RA 1TTJA 2NV1A 5U4NA 1KV8A 3DH7A 3E02A 4LUIA 4N9DA 4UTWC 4IMCA 1YTDA 3KVJA 4XBKA 3EWYA 5AC7A 3O16A 4ORMA 4MY8A 2GVGA 4LU0A 1M5WA 3N14A 3IV3A 3V75A 2YW4A 3TQKA 3EX4A 1EUNA 4GRSA 4M7SA 1H1ZA 1H60A 1LLWA 1QOPA 2CZFA 3AO0A 3PBVA 3W87A 4O1DA 5EKYA 1DQWA 3BLFA 1FDJA 4TU1A 5EMUA 2CLHA 5I3KA 1QDSA 2YFOA 4FNRA 5A5WA 1FDZA 2CLLA 4RJEA 3KRUA 2JGQA 4HPXA 3VCRA 1OVDA 3GDMA 3O1NA 1YLVA 5D09A 2V2CA 1SZFA 1RPXA 3D0CA 4MZYA 5D38A 3M5VA 3IGXA 1SZNA 3S5ZA 1ZY9A 4LVDA 1K8ZA 1A5SA 1O94A 1PE1A 3CIXA 3N34A 2EPHA 3LHVA 1FX6A 3STEA 2FPYA 5L9FA 3BV4A 4LTSA 3TKFA 1F6PA 4R53A 3TSMA 2Z0IA 1G7VA 1TPH1 2B4GA 3CB8A 4LV4A 3N9RA 3VNDA 2X30A 4TX9A 4CCEA 1LBLA 4MLRA 3FA5A 3W7EA 3EKZA 3G0XA 3PM6A 1T0OA 3L67A 2ZCGA 1SW3A 4CQ9A 1VS1A 5K2ZA 3LB0A 3O07A 1P1XA 1OHLA 1ZJIA 3DBPA 4NZFA 3THAA 4WOZA 4DO6A 3AJXA 2Q3RA 2ZRYA 5AYXA 3CC1A 4GWEA 3ZR4A 2YYTA 3W1NA 5F2MA 2VENA 3PAJA 3NQ6A 3W9ZA 4MZ1A 5K9CA 4LWWA 2VEKA 4IXHA 4DBDA 2VKZG 2PC4A 1X1ZA 5IBXC 3UWYA 3RNDA 1P0NA 1QO5A 2GVLA 3DHFA 1H7WA 2WV8A 3DFNA 4I7VA 4WY0F 4AMAA 1OFBA 3CPRA 1VLIA 4XTDA 1UASA 3MP3A 1WYIA 5E0KA 4AAJA 4IMGA 1TRIA 5HJLA 2Z6JA 3EWBX 1FXPA 1J2WA 1GWJA 3G1SA 3HG5A 4RXGA 1JQXA 3LBMA 4ZQNA 4I7WA 5AYZA 3W1UA 3PC0A 3W7CA 3E0IA 1P5BA 3W83A 4U28A 3T78A 1DHPA 3EWWA 4JYDA 1KA9F 3IIVA 1A53A 3W86A 2A5HA 2NX9A 4DELA 4FHAA 1T99A 4ORIA 5EY5A 1EP3A 2YR1A 1TJRA 3SIZA 5KMYA 3MP5A 3KHJA 5BW6A 3UYCA 3ABRA 3IVUA 3SJ3A 1R2RA 2B0MA 5I3FA 1K3UA 3EXRA 5A8GA 1KM6A 2FB2A 1P0KA 4IOTA 1OX4B 3SGUA 4PC8A 5F1VA 1VGAA 2E6DA 3MBDA 2J9YA 3L65A 2QCMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3KRUA

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