3KRZA

Crystal structure of the thermostable nadh4-bound old yellow enzyme from thermoanaerobacter pseudethanolicus e39
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
SILHMPLKIKDITIKNRIMMSPMCMYSASTDGMPNDWHIVHYATRAIGGVGLIMQEATAVESRGRITDHDLGIWNDEQVKELKKIVDICKANGAVMGIQLAHAGRKCNISYEDVVGPSPIKAGDRYKLPRELSVEEIKSIVKAFGEAAKRANLAGYDVVEIHAAHGYLIHEFLSPLSNKRKDEYGNSIENRARFLIEVIDEVRKNWPENKPIFVRVSADDYMEGGINIDMMVEYINMIKDKVDLIDVSSGGLLNVDINLYPGYQVKYAETIKKRCNIKTSAVGLITTQELAEEILSNERADLVALGRELLRNPYWVLHTYTSKEDWPKQYERAFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Thermoanaerobacter pseudethanolicus atcc 33223
publication title Biocatalysis with thermostable enzymes: structure and properties of a thermophilic 'ene'-reductase related to old yellow enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase
total genus 129
structure length 335
sequence length 335
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3krzA00
3EXRA 4JTTA 3NQAA 2Q8LA 2VELA 3TSDA 4IMCA 4AAJA 1F5ZA 3KHJA 3NYZA 4UR7A 4IX2A 1WAUA 1YTDA 4Q32A 5DY3A 1VZWA 4N4PA 3B0UX 2J24A 1KFBA 2H90A 3A5VA 5KZDA 5SWUA 4R34A 3RFAA 3W1RA 4UR8A 3HQ1A 1MXSA 3KRSA 4I7WA 1FWWA 5HQEA 2A2IA 1K7FA 5AHFA 1XFBA 3RU6A 1AW5A 4N9BA 2HTMA 3I68A 3HB9A 2FB2A 4O4WA 3GR7A 3VCRA 1TIMA 3L65A 4OQVA 2Y88A 5CKSA 2Q8ZA 1JVNA 1GG1A 3W7IA 1VJIA 2YCEA 3U6WA 2ZRXA 1C9DA 4U4MA 3UY8A 5D09A 1P0NA 1EEPA 1GOXA 5FF4A 3T78A 2ATSA 4X2RA 1HO4A 4DO4A 4DF0A 3I6RA 1B4EA 4FNQA 3HG4A 5C55A 1TB3A 2FQIA 2J6XA 4UTJA 3STGA 2CLKA 1LBFA 3SGUA 5K4ZA 4CCDA 3UPWA 2C19A 4HPXA 5F4SA 4IX0A 3W74A 3EWUA 4WXZA 4RCXA 1F76A 4IPJA 2QJGA 3P80A 4DF2A 3KAOA 3LOTA 5D30A 4DEFA 1SW7A 5GVJA 1TQJA 2NX1A 2Y7FA 3LRKA 2ISWA 3P5YA 5D2XA 3W1LA 2QCHA 3LM7A 4OBTA 2X16A 4PCFA 3QSTA 2DZXA 1N7KA 3QW4B 4FEZA 5F2GA 2TSYA 5IBXC 4LUIA 4Z1CA 2Z0IA 2P0OA 1CW2A 4Y96A 3TW6A 3R5EA 3O8AA 5DLCA 1O95A 5D2YA 4CQ8A 1L6SA 1KFKA 1QFEA 4XKYA 3TW7A 3CLMA 5LHFA 4NU7A 4EWND 4BI6A 2QCNA 3IGXA 2R8WA 2WSRA 3LCFA 3F03K 1R47A 3RLUA 2GOUA 3LXBA 1TO3A 4TIMA 5DBUA 2QJHA 3L5MA 1W3IA 3MJYA 1KM5A 2QF7A 3EWBX 3W71A 3IIZA 5LGXA 4JX6A 1W5PA 4IUOA 4ORMA 5F4XA 4UXDA 1KM3A 3PR2A 3PB2A 2Y63A 2QDHA 3C2VA 4O57A 3S5YA 5I3FA 1OHLA 1VHCA 1PHQA 4OE7A 1OYCA 2R91A 4XQ6A 4LT9A 2QJIA 3OG3A 3EEGA 1KM6A 5K9CA 2ATMA 4MPQA 5L9FA 5HWNA 1KFEA 2VFFA 3W88A 1T99A 3GIYA 4RZ6A 2G96A 3GVGA 3JS3A 2PRHA 3DHFA 5D37A 4MFEA 1VYRA 5I3IA 5K9DA 3TJXA 2ISSA 3OVQA 3C61A 3SGZA 2V81A 4WX2A 1P0KA 1LRQA 2ISVA 4K39A 4QQ3A 2NXHA 2RH9A 3LXAA 3PF3A 2GJNA 5EPDA 3W86A 3M16A 3P60A 1FCVA 1VH7A 4N9CA 4BFAA 4WY0A 1DVJA 2I1OA 2VEMA 2YFNA 3TC6A 5BMXA 2PE4A 1LLZA 3UWZA 2ZRVA 4YL2A 4PFMA 2VFGA 3PG9A 3NVTA 4WY0B 4UNKA 1XBZA 4FNUA 3LCWA 4FXRA 3HPSA 2ZBTA 3NOEA 4JY8A 3TXZA 4HSNA 3LRLA 4UMBA 3T7VA 1SSGA 3BARA 2FFCA 4DELA 1C8VA 3NM1A 3B0PA 3EX2A 1KLZA 4JY9A 3BG3A 3IGSA 3GR8A 3W72A 5FEXA 2CFFA 4TO8A 1OK4A 4JYDA 5LNVA 4ZQOA 4O15A 1VS1A 4H3DA 4JGDA 4A21A 3I7QA 1IF2A 1YXCA 4GJ1A 3W1AA 3G3MA 4LS0A 4WOQA 2QCCA 1K7EA 3UZ5A 1EP1A 5HNRA 1SFLA 2GVGA 2V8ZA 2J9YA 1Q6QA 1YDOA 1R46A 2H8ZA 3VI2A 3G1HA 4NXKA 3TSBA 4MIMA 5AHEA 4WJEA 4RV8A 2OMAA 1OFQA 2B7QA 4JN6A 1DV7A 4TX9A 2Y70A 1W3TA 1SSDA 3UZJA 2QKFA 2DZVA 3L5LA 4MOZA 1GYNA 4JTEA 1R30A 2WNNA 3KVKA 3IIVA 3QFEA 4O14A 3NQ7A 4OV4A 1GVSA 1GTEA 4N2YA 1YXYA 3KVMA 1QWGA 2ABAA 1QPRA 3LHZA 5D33A 1EUNA 1R2TA 4JICA 3PVFA 1G4TA 5FF7A 3LHTA 1Q45A 5LHEA 4PL2A 1ME8A 1UJPA 2RDUA 3E12A 3DZ1A 3W73A 1WA3A 3NPWA 4EF9A 1A5SA 5A8GA 3LBMA 3SR7A 1WOBA 4JNMA 3QRHA 3S5OA 3P81A 4JTKA 2OJPA 3WK0A 3C56A 3N3MA 3NR0A 1RPXA 4ZQCA 1SPQA 3ABSA 5AHMA 2C14A 2QAPA 1BWKA 3NXFA 2WPBA 1H51A 3RMJA 1KFLA 4DPPA 1I2OA 3QW3A 5EYWA 2BLEA 2WKJA 5K9XA 5D03A 1W5MA 1EWDA 1X1ZA 2FTPA 1FWRA 1L2UA 4UTTA 3LB0A 1BKSA 2V2CA 5EL1A 3N34A 4M6VA 3H55A 3CWNA 5D05A 5AN7A 4NNAA 2ABBA 3STCA 2FB3A 2CZDA 5KZEA 2TPSA 3C6CA 1WX0A 2NWSA 5F1VA 4JTUA 3NGJA 4Y9AA 1H7OA 3GDMA 4HNVA 4GE8A 5DCBA 5LZLA 3STEA 5HMSA 3GDLA 2E09A 2F7FA 3QC3A 4Z0SA 4BF9A 1AW2A 1F73A 1FQ0A 1TQXA 2ZA1A 3MHUA 2TMDA 3P8JA 3Q37A 2A85A 3W1MA 3MW7A 3R2GA 3FLUA 3JR2A 4WOZA 1G6CA 2NZLA 4MZ1A 2BX7A 3P84A 2Z2UA 2CLIA 4PC8A 1F7BA 2C6QA 4ONVA 3W2KA 3C4UA 3M41A 1JCNA 3PAJA 5KMYA 1VLWA 3W2NA 4ZMGA 3CIXA 4A2SA 1I45A 3N9SA 4Q33A 1KFCA 1YTKA 4ZQMA 5KINA 2XN1A 3BGJA 3BO9A 2A0NA 4GUFA 3P62A 3DFSA 3HF3A 5C5YA 2V30A 4OT7A 3W1NA 4FB7A 1X7FA 3WK2A 5LSMA 4DPQA 4O1AA 2ZCGA 3SW6A 1O5KA 1VCVA 2NX9A 2QUVA 3PBWA 1JQXA 3BW4A 4M5PA 2YR1A 1RR2A 3EKLA 4O16A 5D32A 4CCEA 4KWWA 4NT0A 3SFKA 3S1UA 3EWZA 1IXNA 1A5CA 2FPVA 3GAKA 4P61A 1WDWA 1OFDA 4LOCA 3PWAA 5FF2A 1ONRA 2RFGA 4FXSA 2BWGA 5I3GA 2UV8G 4IOTA 1ZENA 4PEKA 3C8FA 5CZSA 1YLVA 1FY6A 4WY0F 4LS2A 1QPNA 1K7XA 1S5VA 3GK0A 5G1TA 4ADSA 3AO0A 2ZRUA 1EX5A 3HGSA 3IIPA 3S1WA 5G5IA 1KTBA 3UQNA 4ADUA 3TMLA 4FIQA 4OWGA 4UTTC 4QSHA 2A7RA 3T4CA 1TYGA 4AHOA 5KZMA 1V5XA 3W2MA 4LU0A 3CU2A 3BV4A 4W9TA 5AC7A 1PE1A 3SSJA 2X1RA 3HPXA 3S0CA 4O0KA 1SW0A 1TRIA 2E5DA 3EX6A 1OF6A 3TNOA 2X30A 1ZALA 4RZ5A 2WO5A 1H7WA 1FCQA 4Y8FA 1P4CA 2YZRA 1TV7A 3TAOA 3DFQA 4FX6M 3T44A 1J5TA 1ZAJA 4HPJA 2Q3RA 3DAQA 5AC6A 1LOQA 3CT7A 3ZS4A 5E93A 2IQTA 4MYAA 1JCXA 4FNPA 4L4MA 4TU1A 3G1SA 1EA0A 1JULA 4GRSA 4I7UA 1OFEA 2FLIA 4O10A 1F74A 5BOOA 2E6AA 1EP2A 1W5QA 4AB4A 4LNYA 3S1XA 3F1QA 3LTPA 1O60A 1ZJIA 3PSVA 2NXIA 3KOFA 3MBFA 1AL8A 2Y61A 3BW3A 4QJ1A 3C2OA 4CQAA 4TMBA 3WJWA 2GQ8A 4IGHA 1HG3A 1TTIA 4O12A 2VXNA 3IIOA 3NQFA 3MYPA 3ELFA 5D2WA 3LCLA 4OHQA 3B8DA 4WD0A 1GTHA 1FWSA 3RF9A 2V9DA 3TFXA 5C6MA 2EHHA 1JCYA 4IMEA 4N4QA 2RHGA 1ZFJA 3TCEA 3GNDA 3TKFA 3QPYA 4YCOA 1ADOA 3A22A 4H4IA 4NNCA 5EA9A 1JUEA 1TPWA 3MHGA 4FX8A 4NX0A 1UASA 2Y7EA 4AEOA 5MHBA 1VRDA 4AHQA 3TQ0A 3MO7A 2ZZ1A 1F05A 2RDTA 1M5WA 4S2CA 2ZZ2A 3N14A 2EGZA 1JUKA 3A23A 2ZDRA 1VYSX 1B4KA 3PUEA 5AC8A 4O0ZA 1FUYA 3BG9A 1TJRA 4RKAA 5KSWA 3HJZA 1PVNA 1L9WA 3M5VA 3QQ0A 4BI5A 4GUHA 3TK7A 1DJQA 1KM1A 1W3NA 2ZRZA 4NZJA 4HHPA 2E6DA 3LTSA 2B4GA 1IXPA 2JGQA 4LVFA 5E1QA 1L6WA 3G0UA 1ALDA 3NQDA 3ZWSA 3G22A 3GDKA 2HS6A 3FKKA 4M7SA 2NWRA 4FO4A 4LUJA 1G7VA 3QEZA 3LX9A 3MP3A 4UTHA 3C52A 1LLWA 2VFDA 1LBLA 3GNNA 1FWTA 2DZTA 3DH7A 1PHWA 3DKLA 3QF0A 3W7QA 3MBDA 4KFPA 3B4UA 4K6AA 2YGYA 3UD6A 4JXCA 3QJAA 1RQEA 1MSSA 2VEKA 3K30A 5C2XA 2RKXA 4QM1A 1A53A 1M7PA 4LTSA 3HG3A 2Y89A 1LRNA 5FF0A 3GB6A 2GQ9A 2WNZA 1Z42A 4MLJA 1P1XA 5BRBA 3MYOA 5HINA 1S5TA 4RR4A 1TCDA 3W3OA 1GVQA 3E0IA 3L0GA 4QAIA 2XFWA 2OCZA 4GUJA 2G5WA 5ABTA 3NPVA 1EB3A 3L2IA 3BW2A 4O17A 3O63A 3TJLA 1DKWA 3L68A 1XDLA 3Q58A 4N9DA 5FESA 4O1CA 3G0XA 3M43A 3W2LA 4UMAA 2A7NA 1XKYA 3OA3A 3ZWTA 4UUIA 4BWLA 3BVJA 1OFAA 2A5HA 3THAA 3G1AA 5AHNA 3IVUA 1GYLA 3BK0A 1Z41A 1ICSA 3DFNA 4X3ZA 5C54A 4Y6GA 3W1UA 3ZFHA 1LDCA 4XKYB 4RK8A 2O7QA 2BZNA 1OFOA 7TIMA 2I14A 1OX4A 3CTLA 3FFSA 5K7JA 2QCMA 1CI1A 3TU9A 3INPA 4K7YA 3SI9A 3P74A 1GPWA 2ZYFA 4X9SA 2R94A 3C3NA 1BWLA 3BGGA 3HMJG 1ME9A 3W22A 3O6YX 4K38A 1T0OA 3O16A 2QCGA 2DZPA 4FNSA 2E6YA 1SUXA 2JBMA 4Q4KA 2F84A 2AAMA 3ATZA 5F2IA 3SY5A 3W76A 1H7PA 3M6YA 5D04C 3FKRA 4UTMA 2ZRWA 1OF8A 1W0MA 1SW3A 5BW6A 3UY7A 2V0TA 1SO4A 1J4EA 4JIPA 2GQAA 4POCA 3E02A 2J9XA 1EPXA 5J5RA 4Z1DA 3W6YA 1TJPA 4PL1A 3DBPA 3UWUA 3NM3A 4IXXA 3I65A 1RQHA 1VYPX 4HSOA 3M0ZA 2P10A 3OVRA 5CPNA 3FA5A 2PRLA 1OABA 1QPQA 3UWQA 3R13A 3UXDA 2CU0A 4AWUA 3EX4A 4JEQA 1PCWA 1SO3A 2A1YA 4AH7A 4MVAA 5TIMA 2PCQA 4NNBA 3FYOA 4PODA 1T96A 3A21A 4RXFA 3DENA 1GQNA 2E1DA 4N02A 1IGSA 4QNEA 1T8XA 3NZRA 5KITA 1PV8A 3GYEA 1ME7A 1ML1A 2DORA 3NZ1A 3KRZA 3G1VA 3O6DA 4CCCA 4BWLC 1JQVA 2GUUA 5TQLA 4O19A 2GVLA 2C16A 2NLIA 1JR1A 3TSMA 2DP3A 3EWYA 4JX4A 1QPOA 5FEZA 4LVDA 4HT3A 1YDVA 3QH2A 1IIGA 3TE9A 4AXKA 3FJ6A 1RZMA 2BSLA 4IMFA 2Z6IA 2G97A 4MZ8A 4YMZA 3W1XA 1X8FA 1MZHA 4GFSA 1VQTA 1UUMA 2GPTA 3AJXA 3MP5A 4E38A 3QMSA 1LORA 1IXOA 4KWVA 5G4WA 2FPTA 3PUOA 4DBDA 2EF9A 2PURA 5CPMA 5HR7A 2CLOA 5DCDA 3CB8A 3M5XA 2JGYA 4JTFA 4IMGA 4LVAA 4OGZA 4L4LA 4DO6A 4WQ6A 3W7JA 1YYAA 4O4VA 2DU2A 1HUVA 1VPXA 3P8IA 4HNTA 3WJYA 2C3ZA 3L9CA 4WZHA 1XDMA 4CNPA 3PBUA 1SR9A 1NFBA 4IXHA 5HUPA 5U7SA 4QIUA 4P2VA 1JJKA 4TR9A 1VCGA 2HS8A 3M1ZA 4XBKA 5FEWA 5F1UA 2A7PA 3FJLA 4UTKA 4JYFA 3M7WA 3N2XA 3S5ZA 5E0KA 1W54A 2VFIA 1H1ZA 2ZQ0A 1B9BA 1PL9A 1GWJA 3MI2A 1G67A 4XTDA 1KM0A 2EAWA 3P61A 2CW6A 4BI7A 3FYPA 1SU5A 1PCKA 2DZUA 1GJPA 3QMRA 1QOPA 5CZJA 1OFBA 3B04A 3B06A 3MI3A 4I7VA 4NJKA 4UMCA 5FEPA 3NL5A 5HULA 5D2VA 4LC6A 1TTJA 3VE9A 2NV1A 2V5BA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3OLD A;  3DFY A;  3EXR A;  4JTT A;  4OBR A;  2NQL A;  4AAJ A;  3RIL A;  3KHJ A;  6REQ A;  4H6E A;  2FH8 A;  5DY3 A;  4PUL A;  4EK7 A;  1VFO A;  1DED A;  3O6A A;  5HDR A;  1T8Q A;  4MWA D;  3H24 A;  4HCD A;  5HK4 A;  2ZKM X;  1E4N A;  1QW9 A;  4I7W A;  3KRS A;  1IT7 A;  3POH A;  2A2I A;  5AHF A;  3RU6 A;  1AW5 A;  4N9B A;  2HTM A;  3AAM A;  2Y88 A;  3V0S A;  1JVN A;  1GG1 A;  3RCM A;  1VJI A;  3FVM A;  3VVG A;  3ZT5 A;  1P0N A;  1GOX A;  5FF4 A;  3OVG A;  3ZLF A;  3OW1 A;  1HO4 A;  4DO4 A;  3MC5 A;  4GVH A;  3HG4 A;  1F8I A;  1XPG A;  3WG6 A;  1TB3 A;  4FAM A;  5CPT A;  4AFY A;  2OLH A;  1LBF A;  3SGU A;  4CCD A;  1Q7M A;  1JYN A;  4B5S A;  4HPX A;  2J6V A;  3EWU A;  4HMC A;  1EEX A;  2OPJ A;  2J7F A;  3CQI A;  1VAH A;  3VZY A;  3LOT A;  5G1M A;  1VP5 A;  2IPG A;  5REQ A;  1KO0 A;  1P0E A;  4WKF A;  4QJ5 B;  2PLK A;  4OBT A;  2PI6 A;  3QST A;  2CYG A;  5RUB A;  1QNQ A;  1R38 A;  5IBX C;  1J96 A;  2FGZ A;  2X8R A;  4Z1C A;  3WDP P;  3ARY A;  3R5E A;  4XBJ A;  3SCN A;  3GNX A;  2BNJ A;  4NU7 A; 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